当前蛋白身份：Q9V2J8
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2BFW Structure of the C domain of glycogen synthase from Pyrococcus abyssi 提交 2004-12-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
218–413（196 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 218-413
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.6；30% PEG8K, 0.1 M NAAC PH 4.5, 0.2M LITHIUM SULPHATE
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.235 |
| 2BIS Structure of glycogen synthase from Pyrococcus abyssi 提交 2005-01-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–437（437 aa）
|
未记录 | GLC alpha-D-glucopyranose × 1 DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 4 GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；pH 5.60
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.266 |
| 2BIS Structure of glycogen synthase from Pyrococcus abyssi 提交 2005-01-25 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–437（437 aa）
|
未记录 | DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 3 GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；pH 5.60
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.266 |
| 2BIS Structure of glycogen synthase from Pyrococcus abyssi 提交 2005-01-25 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–437（437 aa）
|
未记录 | GLC alpha-D-glucopyranose × 1 DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 3 GOL GLYCEROL × 1 UDP URIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；pH 5.60
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.266 |
| 3FRO Crystal structure of Pyrococcus abyssi glycogen synthase with open and closed conformations 提交 2009-01-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–437（437 aa）
链 B
1–437（437 aa）
链 C
1–437（437 aa）
|
未记录 | TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 3 NHF 1,5-anhydro-D-fructose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；293 K；26-30% MPD, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.255 |
| 3L01 Crystal structure of monomeric glycogen synthase from Pyrococcus abyssi 提交 2009-12-09 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–426（426 aa）
片段：UNP residues 1-426
|
突变：T426A | K POTASSIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；ammonium sulfate, potassium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.228 |
| 3L01 Crystal structure of monomeric glycogen synthase from Pyrococcus abyssi 提交 2009-12-09 | Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–426（426 aa）
片段：UNP residues 1-426
|
突变：T426A | K POTASSIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；ammonium sulfate, potassium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.228 |
| 4S0V Crystal structure of the human OX2 orexin receptor bound to the insomnia drug Suvorexant 提交 2015-01-06 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
218–413（196 aa）
片段：UNP O43614 residues 3-254, 294-388, and UNP Q9V2J8 residues 218-413
|
未记录 | SUV [(7R)-4-(5-chloro-1,3-benzoxazol-2-yl)-7-methyl-1,4-diazepan-1-yl][5-methyl-2-(2H-1,2,3-triazol-2-yl)phenyl]methanone × 1 OLA OLEIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
Lipidic Cubic Phase (LCP)；pH 5.9；293 K；31% PEG 400, 0.1 M sodium citrate, 0.2 M sodium formate, 3%(w/v) hexanediol, pH 5.9, Lipidic Cubic Phase (LCP), temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.242 |
| 4ZJ8 Structures of the human OX1 orexin receptor bound to selective and dual antagonists 提交 2015-04-29 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
218–413（196 aa）
片段：UNP O43613 residues 1-245,UNP Q9V2J8 residues 218-413,UNP O43613 residues 288-380
|
未记录 | SUV [(7R)-4-(5-chloro-1,3-benzoxazol-2-yl)-7-methyl-1,4-diazepan-1-yl][5-methyl-2-(2H-1,2,3-triazol-2-yl)phenyl]methanone × 1 OLA OLEIC ACID × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.4；293 K；100mM Sodium Citrate pH 5.4, 31% PEG 400, 200 mM Sodium Formate
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.273 |
| 4ZJC Structures of the human OX1 orexin receptor bound to selective and dual antagonists 提交 2015-04-29 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
218–413（196 aa）
片段：UNP O43613 residues 1-245,UNP Q9V2J8 residues 218-413,UNP O43613 residues 288-380
|
未记录 | 4OT [5-(2-fluorophenyl)-2-methyl-1,3-thiazol-4-yl]{(2S)-2-[(5-phenyl-1,3,4-oxadiazol-2-yl)methyl]pyrrolidin-1-yl}methanone × 1 OLA OLEIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.6；293 K；100 mM Sodium Citrate pH 5.6, 32% PEG 400, 200 mM Potossium
|
分辨率 2.83 Å R-free 0.262 |
| 5U09 High-resolution crystal structure of the human CB1 cannabinoid receptor 提交 2016-11-23 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
218–413（196 aa）
片段：P21554 residues 90-301, 333-421 and Q9V2J8 residues 218-413
|
突变：T210A | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 9 SO4 SULFATE ION × 4 7DY N-[(2S,3S)-4-(4-chlorophenyl)-3-(3-cyanophenyl)butan-2-yl]-2-methyl-2-{[5-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]oxy}propanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；31% PEG400, 100mM Sodium Citrate pH5.5, 100mM magnesium sulfate
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.238 |
| 5WQC Crystal structure of human orexin 2 receptor bound to the selective antagonist EMPA determined by the synchrotron light source at SPring-8. 提交 2016-11-25 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
218–413（196 aa）
片段：UNP residues 3-254,UNP residues 218-413,UNP residues 294-386
|
未记录 | 7MA N-ethyl-2-[(6-methoxypyridin-3-yl)-(2-methylphenyl)sulfonyl-amino]-N-(pyridin-3-ylmethyl)ethanamide × 1 OLA OLEIC ACID × 5 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；50 mM MES-NaOH (pH 5.8-6.2), 26-29% PEG300, 100 mM sodium malonate, 0.5 mM EMPA, 5% DMSO
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.215 |
| 5WS3 Crystal structures of human orexin 2 receptor bound to the selective antagonist EMPA determined by serial femtosecond crystallography at SACLA 提交 2016-12-05 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
218–413（196 aa）
片段：UNP residues 3-254,UNP residues 218-413,UNP residues 294-388
|
未记录 | 7MA N-ethyl-2-[(6-methoxypyridin-3-yl)-(2-methylphenyl)sulfonyl-amino]-N-(pyridin-3-ylmethyl)ethanamide × 1 OLA OLEIC ACID × 4 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；0.1M MES, 0.1M sodium malonate, 27-30% PEG 300, pH 6.0
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.219 |
| 6E59 Crystal structure of the human NK1 tachykinin receptor 提交 2018-07-19 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
218–413（196 aa）
片段：receptor (UNP residues 1-227, 238-346) with intervening glycogen synthase (UNP residues 218-413)
|
未记录 | L76 1-(4-{[(2R,3S)-2-{(1R)-1-[3,5-bis(trifluoromethyl)phenyl]ethoxy}-3-(4-fluorophenyl)morpholin-4-yl]methyl}-1H-1,2,3-triazol-5-yl)-N,N-dimethylmethanamine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100 mM sodium citrate, pH 5.4, 30% PEG300, 200 mM potassium nitrate, 2% 2,5-hexanediol
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.305 |
| 6FJ3 High resolution crystal structure of parathyroid hormone 1 receptor in complex with a peptide agonist. 提交 2018-01-19 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
218–413（196 aa）
|
突变：;Y191C, K240M, L300A, M312K, V334I, K359N, L407A, A426L, Q440R, I458A,Y191C, K240M, L300A, M312K, V334I, K359N, L407A, A426L, Q440R, I458A,Y191C, K240M, L300A, M312K, V334I, K359N, L407A, A426L, Q440R, I458A,Y191C, K240M, L300A, M312K, V334I, K359N, L407A, A426L, Q440R, I458A ; 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MAN alpha-D-mannopyranose × 3 OLA OLEIC ACID × 9 ACY ACETIC ACID × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；0.1 M sodium citrate pH 6.0, 0.3 M sodium acetate, 31% PEG400, 20 uM E-PTH(1-34)
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.248 |
| 6HLL Crystal structure of the Neurokinin 1 receptor in complex with the small molecule antagonist CP-99,994 提交 2018-09-11 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
220–413（194 aa）
|
突变：;L74A; V116I; A144L; M181K; A215L; W224R; K243A,L74A; V116I; A144L; M181K; A215L; W224R; K243A,L74A; V116I; A144L; M181K; A215L; W224R; K243A ; | GBK (2~{S},3~{S})-~{N}-[(2-methoxyphenyl)methyl]-2-phenyl-piperidin-3-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；100 mM MES pH 6.0, 31% (v/v) PEG400, 190-210 mM potassium acetate, 2.4% (v/v) 2,5-hexanediol and 50 uM CP-99,994
|
分辨率 3.27 Å R-free 0.275 |
| 6HLO Crystal structure of the Neurokinin 1 receptor in complex with the small molecule antagonist Aprepitant 提交 2018-09-11 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
220–413（194 aa）
|
突变：;L74A; V116I; A144L; M181K; A215L; W224R; K243A,L74A; V116I; A144L; M181K; A215L; W224R; K243A,L74A; V116I; A144L; M181K; A215L; W224R; K243A ; 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GBQ 5-[[(2~{R},3~{S})-2-[(1~{R})-1-[3,5-bis(trifluoromethyl)phenyl]ethoxy]-3-(4-fluorophenyl)morpholin-4-yl]methyl]-1,2-dihydro-1,2,4-triazol-3-one × 1 CIT CITRIC ACID × 1 OLA OLEIC ACID × 17 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；100 mM sodium citrate pH 6.0, 31% (v/v) PEG400, 50-70 mM MgCl2 and 50 uM aprepitant
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.229 |
| 6HLP Crystal structure of the Neurokinin 1 receptor in complex with the small molecule antagonist Netupitant 提交 2018-09-11 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
220–413（194 aa）
|
突变：;L74A; V116I; A144L; M181K; A215L; W224R; K243A,L74A; V116I; A144L; M181K; A215L; W224R; K243A,L74A; V116I; A144L; M181K; A215L; W224R; K243A ; 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GAW 2-[3,5-bis(trifluoromethyl)phenyl]-~{N},2-dimethyl-~{N}-[4-(2-methylphenyl)-6-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl]propanamide × 1 CIT CITRIC ACID × 1 OLA OLEIC ACID × 9 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；100 mM sodium citrate pH 6.0, 31% (v/v) PEG400, 40-50 mM Mg(HCO2)2 and 50 uM netupitant
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.225 |
| 6KP6 The structural study of mutation induced inactivation of Human muscarinic receptor M4 提交 2019-08-14 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
218–413（196 aa）
|
突变：I93T G150A I187A S219Y N449R T459E | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7.8；293.15 K；300 mM diammonium hydrogen phosphate, 22-26% PEG 300, 0.1M HEPES sodium pH 7.6-8.2
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.264 |
| 6KQI Structure of an allosteric modulator bound to the CB1 cannabinoid receptor 提交 2019-08-17 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
218–413（196 aa）
片段：C1
|
突变：S203K,T210A,E273K,T283V,R340E | 9GF 2-[(1R,2R,5R)-5-hydroxy-2-(3-hydroxypropyl)cyclohexyl]-5-(2-methyloctan-2-yl)phenol × 1 9GL 5-chloro-3-ethyl-N-{2-[4-(piperidin-1-yl)phenyl]ethyl}-1H-indole-2-carboxamide × 1 OLA OLEIC ACID × 4 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；33% PEG 400, 100mM Sodium Cacodylate pH 6.0, 100mM Sodium Malonate
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.312 |
| 6LFL Crystal structure of a class A GPCR 提交 2019-12-03 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
218–413（196 aa）
|
突变：L135W, A249E, G303A | EBX 4-[[3,4-bis(oxidanylidene)-2-[[(1~{R})-1-(4-propan-2-ylfuran-2-yl)propyl]amino]cyclobuten-1-yl]amino]-~{N},~{N}-dimethyl-3-oxidanyl-pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100mM HEPES pH7.0, 32% PEG 400, 50-150 mM Sodium tartrate dibasic dihydrate salt
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.264 |
| 6ME2 XFEL crystal structure of human melatonin receptor MT1 in complex with ramelteon 提交 2018-09-05 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
218–413（196 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | JEV N-{2-[(8S)-1,6,7,8-tetrahydro-2H-indeno[5,4-b]furan-8-yl]ethyl}propanamide × 1 OLA OLEIC ACID × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；60-100 mM potassium phosphate monobasic, 32-35% (vol/vol) PEG 400, 100 mM HEPES pH 7.0, 1 mM ligand, 2.5% (vol/vol) DMSO, 1.5% (vol/vol) propan-2-ol
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.228 |
| 6ME3 XFEL crystal structure of human melatonin receptor MT1 in complex with 2-phenylmelatonin 提交 2018-09-05 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
218–413（196 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | JEY N-[2-(5-methoxy-2-phenyl-1H-indol-3-yl)ethyl]acetamide × 1 OLA OLEIC ACID × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；60-100 mM potassium phosphate monobasic, 32-35% (vol/vol) PEG 400, 100 mM HEPES pH 7.0, 1 mM ligand, 2.5% (vol/vol) DMSO, 1.5% (vol/vol) propan-2-ol
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.229 |
| 6ME4 XFEL crystal structure of human melatonin receptor MT1 in complex with 2-iodomelatonin 提交 2018-09-05 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
218–413（196 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ML2 N-[2-(2-iodo-5-methoxy-1H-indol-3-yl)ethyl]acetamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；60-100 mM potassium phosphate monobasic, 32-35% (vol/vol) PEG 400, 100 mM HEPES pH 7.0, 1 mM ligand, 2.5% (vol/vol) DMSO, 1.5% (vol/vol) propan-2-ol
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.249 |
| 6ME5 XFEL crystal structure of human melatonin receptor MT1 in complex with agomelatine 提交 2018-09-05 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
218–413（196 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | AWY ~{N}-[2-(7-methoxynaphthalen-1-yl)ethyl]ethanamide × 1 OLA OLEIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；60-100 mM potassium phosphate monobasic, 32-35% (vol/vol) PEG 400, 100 mM HEPES pH 7.0, 1 mM ligand, 2.5% (vol/vol) DMSO, 1.5% (vol/vol) propan-2-ol
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.257 |
| 6PS8 XFEL MT1R structure by ligand exchange from agomelatine to 2-phenylmelatonin. 提交 2019-07-12 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
218–413（196 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | JEY N-[2-(5-methoxy-2-phenyl-1H-indol-3-yl)ethyl]acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；60-100 mM potassium phosphate monobasic, 100 mM HEPES pH 7.0, 32-35% PEG 400, 1 mM of target ligand 2-phenylmelatonin, 2.5% DMSO, 1.5% propan-2-ol.
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.307 |
| 6TPG Crystal structure of the Orexin-2 receptor in complex with EMPA at 2.74 A resolution 提交 2019-12-13 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
218–413（196 aa）
|
突变：E54A Y91L D100A V142A R170L L206A Y219A M233A A242L L310V L318A T347A N14D N22D N202D C381W C382W C383W 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 7MA N-ethyl-2-[(6-methoxypyridin-3-yl)-(2-methylphenyl)sulfonyl-amino]-N-(pyridin-3-ylmethyl)ethanamide × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 OLA OLEIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100 mM trisodium citrate buffer
150-300 mM sodium chloride
28-43 % (v/v) polyethylene glycol 400
|
分辨率 2.74 Å R-free 0.275 |
| 6TPJ Crystal structure of the Orexin-2 receptor in complex with suvorexant at 2.76 A resolution 提交 2019-12-13 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
218–413（196 aa）
|
突变：E54A Y91L D100A V142A R170L L206A Y219A M233A A242L L310V L318A T347A N14D N22D N202D C381W C382W C383W 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | OLA OLEIC ACID × 13 SUV [(7R)-4-(5-chloro-1,3-benzoxazol-2-yl)-7-methyl-1,4-diazepan-1-yl][5-methyl-2-(2H-1,2,3-triazol-2-yl)phenyl]methanone × 1 NH4 AMMONIUM ION × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100 mM N-(2-Acetamido)iminodiacetic acid (ADA)
150-300 mM ammonium nitrate
28-43 % (v/v) polyethylene glycol 400
|
分辨率 2.74 Å R-free 0.254 |
| 6TPJ Crystal structure of the Orexin-2 receptor in complex with suvorexant at 2.76 A resolution 提交 2019-12-13 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
218–413（196 aa）
|
突变：E54A Y91L D100A V142A R170L L206A Y219A M233A A242L L310V L318A T347A N14D N22D N202D C381W C382W C383W 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | OLA OLEIC ACID × 21 SUV [(7R)-4-(5-chloro-1,3-benzoxazol-2-yl)-7-methyl-1,4-diazepan-1-yl][5-methyl-2-(2H-1,2,3-triazol-2-yl)phenyl]methanone × 1 NH4 AMMONIUM ION × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100 mM N-(2-Acetamido)iminodiacetic acid (ADA)
150-300 mM ammonium nitrate
28-43 % (v/v) polyethylene glycol 400
|
分辨率 2.74 Å R-free 0.254 |
| 6TPN Crystal structure of the Orexin-2 receptor in complex with HTL6641 at 2.61 A resolution 提交 2019-12-13 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
218–413（196 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NU8 2-(5,6-dimethoxypyridin-3-yl)-1,1-bis(oxidanylidene)-4-[[2,4,6-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]pyrido[2,3-e][1,2,4]thiadiazin-3-one × 1 NO3 NITRATE ION × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 OLA OLEIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100 mM trisodium citrate buffer
150-300 mM lithium nitrate or 150-300 mM potassium nitrate
28-43 % (v/v) polyethylene glycol 400
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.251 |
| 6V9S Structure-based development of subtype-selective orexin 1 receptor antagonists 提交 2019-12-16 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
218–413（196 aa）
|
未记录 | JHC [(2S)-2-[(2S)-butan-2-yl]-4-(5-chloro-1,3-benzoxazol-2-yl)-1,4-diazepan-1-yl][5-methyl-2-(2H-1,2,3-triazol-2-yl)phenyl]methanone × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 OLA OLEIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100mM Sodium Citrate pH 5.3, 31% PEG 400, 200 mM Ammonium Formate
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.273 |
| 6W25 Crystal structure of the Melanocortin-4 Receptor (MC4R) in complex with SHU9119 提交 2020-03-04 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
218–413（196 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 1 OLA OLEIC ACID × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7.9；293 K；19% PEG 400, 100 mM Bis-tris propane buffer, and 50 mM CaCl2 2H2O
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.259 |
| 7BR3 Crystal structure of the protein 1 提交 2020-03-26 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
218–413（196 aa）
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突变：P128K | 1QW (2R)-2,3-dihydroxypropyl dodecanoate × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 6 FMT FORMIC ACID × 1 F5O 4-[[(1R)-2-[5-(2-fluoranyl-3-methoxy-phenyl)-3-[[2-fluoranyl-6-(trifluoromethyl)phenyl]methyl]-4-methyl-2,6-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-1-phenyl-ethyl]amino]butanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293.15 K；100 mM Na cacodyalte pH 6.0-6.5, 30%-38% PEG400, 150-350 mM NH4NO3
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.284 |
| 7FEE Crystal structure of the allosteric modulator ZCZ011 binding to CP55940-bound cannabinoid receptor 1 提交 2021-07-19 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
218–413（196 aa）
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突变：S203K,T210A,E273K,T283V,R340E,N393D | CLR CHOLESTEROL × 2 9GF 2-[(1R,2R,5R)-5-hydroxy-2-(3-hydroxypropyl)cyclohexyl]-5-(2-methyloctan-2-yl)phenol × 1 7IC 6-methyl-3-[(1S)-2-nitro-1-thiophen-2-yl-ethyl]-2-phenyl-1H-indole × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 GOL GLYCEROL × 4 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 OLA OLEIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；25-36% PEG 300, 100Mm MES pH 6.0, 120-190mM Magnesium Sulfate
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分辨率 2.70 Å R-free 0.319 |
| 7W41 Crystal Structure of Human Gastrin Releasing Peptide Receptor in complex with the antagonist PD176252 提交 2021-11-26 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
218–413（196 aa）
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突变：S127K,I157A,R259E | 8B8 (2S)-3-(1H-indol-3-yl)-N-[[1-(5-methoxypyridin-2-yl)cyclohexyl]methyl]-2-methyl-2-[(4-nitrophenyl)carbamoylamino]propanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.8；294 K；100mM MES, pH 6.8, 300mM Ammonium dihydrogen phosphate, 28% PEG 400, 5% polypropylene glycol P 400
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分辨率 2.95 Å R-free 0.321 |
| 8CXO Cryo-EM structure of the unliganded mSMO-PGS2 in a lipidic environment 提交 2022-05-22 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
218–413（196 aa）
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未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.70 Å |
| 8JHQ Cryo-EM structure of human S1P transporter SPNS2 bound with S1P 提交 2023-05-25 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
218–413（196 aa）
|
未记录 | S1P (2S,3R,4E)-2-amino-3-hydroxyoctadec-4-en-1-yl dihydrogen phosphate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8KIG Cryo-EM structure of MC3R in complex with SHU9119 提交 2023-08-23 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
218–413（196 aa）
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未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.10 Å |
| 9B9Y Structural mechanism of CB1R binding to peripheral and biased inverse agonists 提交 2024-04-03 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
218–413（196 aa）
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未记录 | 7DY N-[(2S,3S)-4-(4-chlorophenyl)-3-(3-cyanophenyl)butan-2-yl]-2-methyl-2-{[5-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]oxy}propanamide × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9B9Z Structural mechanism of CB1R binding to peripheral and biased inverse agonists 提交 2024-04-03 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
218–413（196 aa）
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未记录 | A1AKO (4S)-3-(4-chlorophenyl)-N'-[(1E)-ethanimidoyl]-4-phenyl-N-[4-(trifluoromethyl)benzene-1-sulfonyl]-4,5-dihydro-1H-pyrazole-1-carboximidamide × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9BA0 Structural mechanism of CB1R binding to peripheral and biased inverse agonists 提交 2024-04-03 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
218–413（196 aa）
|
未记录 | A1AKN N-(N-{(E)-[(4S)-3-(4-chlorophenyl)-4-phenyl-4,5-dihydro-1H-pyrazol-1-yl][4-(trifluoromethyl)benzene-1-sulfonamido]methylidene}carbamimidoyl)acetamide × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.13 Å |
| 9M88 PGS fused GPR3 dimer with antagonist AF64394 提交 2025-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
218–413（196 aa）
链 D
218–413（196 aa）
|
未记录 | 5YM (Z)-N-(2-hydroxyethyl)octadec-9-enamide × 2 A1EM1 tetracosan-1-ol × 2 1DO 1-DODECANOL × 8 A1EM3 [(2R)-3-[2-azanylethoxy(oxidanyl)phosphoryl]oxy-2-decanoyloxy-propyl] dodecanoate × 4 A1EQ8 icosan-1-ol × 4 A1EM2 N-[(4-chloranyl-2-propan-2-yloxy-phenyl)methyl]-5-phenyl-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-amine × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20mM NaCl, 100mM Hepes, 0.003% LMNG, 0.001% GDN
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |