当前蛋白身份：Q9WX76
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1EH1 RIBOSOME RECYCLING FACTOR FROM THERMUS THERMOPHILUS 提交 2000-02-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–185（185 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.9；293 K；ammonium sulphate, sodium acetate, MES, pH 4.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 20K
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分辨率 2.60 Å R-free 0.307 |
| 3J0D Models for the T. thermophilus ribosome recycling factor bound to the E. coli post-termination complex 提交 2011-06-29 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 J
1–185（185 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
BUFFER R；pH 7.5；BUFFER R
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；VITROBOT
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分辨率 11.10 Å |
| 3J0E Models for the T. thermophilus ribosome recycling factor and the E. coli elongation factor G bound to the E. coli post-termination complex 提交 2011-06-29 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 G
1–185（185 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
BUFFER R；pH 7.5；BUFFER R
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；VITROBOT
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分辨率 9.90 Å |
| 4V54 Crystal structure of the bacterial ribosome from Escherichia coli in complex with ribosome recycling factor (RRF). 提交 2007-06-16 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 B6
1–185（185 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 170 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
batch；pH 7.5；277 K；MPD, PEG 8000, MgCl2, NH4Cl, spermine, spermidine, TRIS, EDTA, pH 7.5, batch, temperature 277K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.304 |
| 4V54 Crystal structure of the bacterial ribosome from Escherichia coli in complex with ribosome recycling factor (RRF). 提交 2007-06-16 | Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 D6
1–185（185 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 173 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
batch；pH 7.5；277 K；MPD, PEG 8000, MgCl2, NH4Cl, spermine, spermidine, TRIS, EDTA, pH 7.5, batch, temperature 277K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.304 |
| 4V55 Crystal structure of the bacterial ribosome from Escherichia coli in complex with gentamicin and ribosome recycling factor (RRF). 提交 2007-06-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 B6
1–185（185 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 170 LLL (2R,3R,4R,5R)-2-((1S,2S,3R,4S,6R)-4,6-DIAMINO-3-((2R,3R,6S)-3-AMINO-6-(AMINOMETHYL)-TETRAHYDRO-2H-PYRAN-2-YLOXY)-2-HYDR OXYCYCLOHEXYLOXY)-5-METHYL-4-(METHYLAMINO)-TETRAHYDRO-2H-PYRAN-3,5-DIOL × 2 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
batch；pH 7.5；277 K；MPD, PEG 8000, MgCl2, NH4Cl, spermine, spermidine, TRIS, EDTA, pH 7.5, batch, temperature 277K
|
分辨率 4.00 Å R-free 0.305 |
| 4V55 Crystal structure of the bacterial ribosome from Escherichia coli in complex with gentamicin and ribosome recycling factor (RRF). 提交 2007-06-17 | Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 D6
1–185（185 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 173 LLL (2R,3R,4R,5R)-2-((1S,2S,3R,4S,6R)-4,6-DIAMINO-3-((2R,3R,6S)-3-AMINO-6-(AMINOMETHYL)-TETRAHYDRO-2H-PYRAN-2-YLOXY)-2-HYDR OXYCYCLOHEXYLOXY)-5-METHYL-4-(METHYLAMINO)-TETRAHYDRO-2H-PYRAN-3,5-DIOL × 2 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
batch；pH 7.5；277 K；MPD, PEG 8000, MgCl2, NH4Cl, spermine, spermidine, TRIS, EDTA, pH 7.5, batch, temperature 277K
|
分辨率 4.00 Å R-free 0.305 |
| 4V5A Structure of the Ribosome Recycling Factor bound to the Thermus thermophilus 70S ribosome with mRNA, ASL-Phe and tRNA-fMet 提交 2007-06-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 AY
1–185（185 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 741 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；COMPARE SELMER ET AL SCIENCE 2006, pH 7.0
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分辨率 3.50 Å R-free 0.326 |
| 4V5A Structure of the Ribosome Recycling Factor bound to the Thermus thermophilus 70S ribosome with mRNA, ASL-Phe and tRNA-fMet 提交 2007-06-28 | Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 CY
1–185（185 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 741 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；COMPARE SELMER ET AL SCIENCE 2006, pH 7.0
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.326 |
| 4V5Y Crystal structure of the bacterial ribosome from Escherichia coli in complex with paromomycin and ribosome recycling factor (RRF). 提交 2007-06-19 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 B6
1–185（185 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 170 PAR PAROMOMYCIN × 2 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
batch；pH 7.5；277 K；MPD, PEG 8000, MgCl2, NH4Cl, spermine, spermidine, TRIS, EDTA, pH 7.5, batch, temperature 277K
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分辨率 4.45 Å R-free 0.309 |
| 4V5Y Crystal structure of the bacterial ribosome from Escherichia coli in complex with paromomycin and ribosome recycling factor (RRF). 提交 2007-06-19 | Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 D6
1–185（185 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 173 PAR PAROMOMYCIN × 2 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
batch；pH 7.5；277 K；MPD, PEG 8000, MgCl2, NH4Cl, spermine, spermidine, TRIS, EDTA, pH 7.5, batch, temperature 277K
|
分辨率 4.45 Å R-free 0.309 |
| 6UCQ Crystal structure of the Thermus thermophilus 70S ribosome recycling complex 提交 2019-09-17 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 1w
1–185（185 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1523 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.3；292 K；0.15 M L-arginine-HCl, 0.1M Tris-HCl pH 7.3, 2.4-2.7% PEG-20K, 7-9% MPD, 0.5 mM BME
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分辨率 3.50 Å R-free 0.294 |
| 6UCQ Crystal structure of the Thermus thermophilus 70S ribosome recycling complex 提交 2019-09-17 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 2w
1–185（185 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1350 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.3；292 K；0.15 M L-arginine-HCl, 0.1M Tris-HCl pH 7.3, 2.4-2.7% PEG-20K, 7-9% MPD, 0.5 mM BME
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.294 |