当前蛋白身份:Q9Y275 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1JH5 Crystal Structure of sTALL-1 of TNF family ligand 提交 2001-06-27 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致
链 A 142–285(144 aa) 片段:sTALL-1, soluble part of TALL-1
链 B 142–285(144 aa) 片段:sTALL-1, soluble part of TALL-1
链 C 142–285(144 aa) 片段:sTALL-1, soluble part of TALL-1
链 D 142–285(144 aa) 片段:sTALL-1, soluble part of TALL-1
链 E 142–285(144 aa) 片段:sTALL-1, soluble part of TALL-1
链 F 142–285(144 aa) 片段:sTALL-1, soluble part of TALL-1
链 G 142–285(144 aa) 片段:sTALL-1, soluble part of TALL-1
链 H 142–285(144 aa) 片段:sTALL-1, soluble part of TALL-1
链 I 142–285(144 aa) 片段:sTALL-1, soluble part of TALL-1
链 J 142–285(144 aa) 片段:sTALL-1, soluble part of TALL-1
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;277 K;35% dioxane, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 277K
分辨率 3.00 Å R-free 0.252
1KD7 Crystal structure of an extracellular domain fragment of human BAFF 提交 2001-11-12 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 122–285(164 aa) 片段:Extracellular domain fragment
链 B 122–285(164 aa) 片段:Extracellular domain fragment
链 C 122–285(164 aa) 片段:Extracellular domain fragment
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;277 K;8% PEG 4000, 0.1 M sodium acetatesolution of 8% PEG 4000, 0.1 M sodium acetate pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.250
1KD7 Crystal structure of an extracellular domain fragment of human BAFF 提交 2001-11-12 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 K 122–285(164 aa) 片段:Extracellular domain fragment
链 L 122–285(164 aa) 片段:Extracellular domain fragment
链 M 122–285(164 aa) 片段:Extracellular domain fragment
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;277 K;8% PEG 4000, 0.1 M sodium acetatesolution of 8% PEG 4000, 0.1 M sodium acetate pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.250
1KXG The 2.0 Ang Resolution Structure of BLyS, B Lymphocyte Stimulator. 提交 2002-01-31 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 134–285(152 aa) 片段:soluble portion (residues 134-285)
链 B 134–285(152 aa) 片段:soluble portion (residues 134-285)
链 C 134–285(152 aa) 片段:soluble portion (residues 134-285)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 CIT CITRIC ACID × 1 DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;279 K;25% dioxane, 25 mM MgCl2, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279.0K
分辨率 2.00 Å R-free 0.209
1KXG The 2.0 Ang Resolution Structure of BLyS, B Lymphocyte Stimulator. 提交 2002-01-31 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 D 134–285(152 aa) 片段:soluble portion (residues 134-285)
链 E 134–285(152 aa) 片段:soluble portion (residues 134-285)
链 F 134–285(152 aa) 片段:soluble portion (residues 134-285)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 CIT CITRIC ACID × 1 DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;279 K;25% dioxane, 25 mM MgCl2, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279.0K
分辨率 2.00 Å R-free 0.209
1OQD Crystal structure of sTALL-1 and BCMA 提交 2003-03-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 108 PDB 声明:108-meric(108) 与蛋白数一致
链 A 142–285(144 aa) 片段:extracellular domain
链 B 142–285(144 aa) 片段:extracellular domain
链 C 142–285(144 aa) 片段:extracellular domain
链 D 142–285(144 aa) 片段:extracellular domain
链 E 142–285(144 aa) 片段:extracellular domain
链 F 142–285(144 aa) 片段:extracellular domain
链 G 142–285(144 aa) 片段:extracellular domain
链 H 142–285(144 aa) 片段:extracellular domain
链 I 142–285(144 aa) 片段:extracellular domain
链 J 142–285(144 aa) 片段:extracellular domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;277 K;dioxane, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.260
1OQE Crystal structure of sTALL-1 with BAFF-R 提交 2003-03-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 108 PDB 声明:108-meric(108) 与蛋白数一致
链 A 142–285(144 aa) 片段:extracellular domain
链 B 142–285(144 aa) 片段:extracellular domain
链 C 142–285(144 aa) 片段:extracellular domain
链 D 142–285(144 aa) 片段:extracellular domain
链 E 142–285(144 aa) 片段:extracellular domain
链 F 142–285(144 aa) 片段:extracellular domain
链 G 142–285(144 aa) 片段:extracellular domain
链 H 142–285(144 aa) 片段:extracellular domain
链 I 142–285(144 aa) 片段:extracellular domain
链 J 142–285(144 aa) 片段:extracellular domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;dioxane, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100K
分辨率 2.50 Å R-free 0.259
1OSG Complex between BAFF and a BR3 derived peptide presented in a beta-hairpin scaffold 提交 2003-03-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 82–285(204 aa) 片段:TNF domain
链 B 82–285(204 aa) 片段:TNF domain
链 C 82–285(204 aa) 片段:TNF domain
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;292 K;20% PEG 3350, 1.0 M LiCl, 0.1M sodium cacodylate, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 3.00 Å R-free 0.286
1OSG Complex between BAFF and a BR3 derived peptide presented in a beta-hairpin scaffold 提交 2003-03-19 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 D 82–285(204 aa) 片段:TNF domain
链 E 82–285(204 aa) 片段:TNF domain
链 F 82–285(204 aa) 片段:TNF domain
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;292 K;20% PEG 3350, 1.0 M LiCl, 0.1M sodium cacodylate, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 3.00 Å R-free 0.286
3V56 Re-refinement of PDB entry 1OSG - Complex between BAFF and a BR3 derived peptide presented in a beta-hairpin scaffold - reveals an additonal copy of the peptide. 提交 2011-12-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 82–285(204 aa)
链 B 82–285(204 aa)
链 C 82–285(204 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å R-free 0.200
3V56 Re-refinement of PDB entry 1OSG - Complex between BAFF and a BR3 derived peptide presented in a beta-hairpin scaffold - reveals an additonal copy of the peptide. 提交 2011-12-16 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 D 82–285(204 aa)
链 E 82–285(204 aa)
链 F 82–285(204 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å R-free 0.200
4V46 Crystal structure of the BAFF-BAFF-R complex 提交 2003-03-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 120 PDB 声明:120-meric(120) 与蛋白数一致
链 A0 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 A1 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 A2 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 A3 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 A4 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 A5 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 A6 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 A7 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 A8 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 A9 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 AA 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 AB 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 AC 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 AD 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 AE 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 AF 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 AG 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 AH 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 AI 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 AJ 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 AK 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 AL 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 AM 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 AN 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 AO 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 AP 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 AQ 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 AR 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 AS 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 AT 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 AU 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 AV 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 AW 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 AX 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 AY 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 AZ 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 Aa 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 Ab 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 Ac 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 Ad 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 Ae 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 Af 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 Ag 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 Ah 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 Ai 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 Aj 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 Ak 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 Al 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 Am 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 An 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 Ao 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 Ap 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 Aq 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 Ar 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 As 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 At 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 Au 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 Av 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 Aw 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
链 Ax 138–285(148 aa) 片段:residues 138-285
未记录 MG MAGNESIUM ION × 40 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;277 K;sodium formate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.30 Å R-free 0.226
4ZCH Single-chain human APRIL-BAFF-BAFF Heterotrimer 提交 2015-04-16 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 140–285(146 aa)
未记录 144 TRIS-HYDROXYMETHYL-METHYL-AMMONIUM × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;RESERVOIR SOLUTION : 14% PEG6000 , 1M LiCL , TRIS-HCL pH 8.50
分辨率 2.43 Å R-free 0.234
4ZCH Single-chain human APRIL-BAFF-BAFF Heterotrimer 提交 2015-04-16 Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 140–285(146 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;RESERVOIR SOLUTION : 14% PEG6000 , 1M LiCL , TRIS-HCL pH 8.50
分辨率 2.43 Å R-free 0.234
5Y9J BAFF in complex with belimumab 提交 2017-08-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 134–285(152 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 8.5;293 K;0.1 M Tris(hydroxymethyl)aminomethane pH 8.5, 20% (w/v)polyethylene glycol 1,000
分辨率 2.05 Å R-free 0.217
6FXN Crystal structure of human BAFF in complex with Fab fragment of anti-BAFF antibody belimumab 提交 2018-03-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 A 134–285(152 aa)
链 B 134–285(152 aa)
链 C 134–285(152 aa)
突变:H218A 突变:H218A 突变:H218A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;293 K;9% (w/v) PEG4000, 0.1 M MgCl2, 0.1 M HEPES pH 7.5
分辨率 2.90 Å R-free 0.231
6FXN Crystal structure of human BAFF in complex with Fab fragment of anti-BAFF antibody belimumab 提交 2018-03-09 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 J 134–285(152 aa)
链 K 134–285(152 aa)
链 L 134–285(152 aa)
突变:H218A 突变:H218A 突变:H218A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;293 K;9% (w/v) PEG4000, 0.1 M MgCl2, 0.1 M HEPES pH 7.5
分辨率 2.90 Å R-free 0.231
8ZUJ Pentagonal cluster of BAFF-BAFFR ectodomain complex 提交 2024-06-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 30 PDB 声明:30-meric(30) 与蛋白数一致
链 D 134–285(152 aa)
链 E 134–285(152 aa)
链 F 134–285(152 aa)
链 J 134–285(152 aa)
链 K 134–285(152 aa)
链 L 134–285(152 aa)
链 P 134–285(152 aa)
链 Q 134–285(152 aa)
链 R 134–285(152 aa)
链 V 134–285(152 aa)
链 W 134–285(152 aa)
链 X 134–285(152 aa)
链 b 134–285(152 aa)
链 c 134–285(152 aa)
链 d 134–285(152 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.58 Å