当前蛋白身份：Q9Y3B2
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2NN6 Structure of the human RNA exosome composed of Rrp41, Rrp45, Rrp46, Rrp43, Mtr3, Rrp42, Csl4, Rrp4, and Rrp40 提交 2006-10-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 I
1–195（195 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；4.5-8% w/v PEG4000, 0.1M Sodium citrate, 1 mM TCEP, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.35 Å R-free 0.344 |
| 6D6Q Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - overall reconstruction 提交 2018-04-22 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物一致 |
链 I
1–195（195 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time
|
分辨率 3.45 Å |
| 6D6R Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - composite map after focused reconstruction 提交 2018-04-22 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物一致 |
链 I
1–195（195 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time
|
分辨率 3.45 Å |
| 6H25 Human nuclear RNA exosome EXO-10-MPP6 complex 提交 2018-07-13 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 I
1–195（195 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 3.80 Å |
| 9G8M human 80S ribosome bound by a SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：92-meric（92） 与全部聚合物一致 |
链 J
1–195（195 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 232 ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 3.30 Å |
| 9G8N 80S-bound human Ski2-exosome complex 提交 2024-07-23 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric（13） 与全部聚合物一致 |
链 J
1–195（195 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 3.70 Å |
| 9G8O human 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex 提交 2024-07-23 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物一致 |
链 J
1–195（195 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9G8P 40S-bound human SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric（13） 与全部聚合物一致 |
链 J
1–195（195 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 7.00 Å |