SAXSdb — 1aro

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

T7 RNA POLYMERASE

Enterobacteria phage T7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	T7 LYSOZYME × 1 （P00806） MERCURY (II) ION × 7	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RPOL_BPT7
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–883； UniProt 1–883

T7 LYSOZYME

Enterobacteria phage T7

UniProt P00806

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	T7 RNA POLYMERASE × 1 （P00573） MERCURY (II) ION × 7	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NAAA_BPT7
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 2–151； UniProt 1–150

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1aro
沉积日期 deposition_date	1997-08-08
结构标题 title	T7 RNA POLYMERASE COMPLEXED WITH T7 LYSOZYME
关键词 keywords	;TRANSCRIPTION, DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE, HYDROLASE, GLYCOSIDASE, COMPLEX (POLYMERASE-HYDROLASE), COMPLEX (POLYMERASE-HYDROLASE) complex ;; COMPLEX (POLYMERASE/HYDROLASE)
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1aro__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1aro__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1aro__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	32.13 Å
Rg（电子密度）	31.48 Å
总 Rg	32.01 Å
原子数	7314
残基数	923
排除体积	130420 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1aro__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	T7 RNA POLYMERASE
分子量 formula_weight	98936.0 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
突变 mutation	C347S, C723S, C839S
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P
原子数 atom_count	7314

MNTINIAKNDFSDIELAAIPFNTLADHYGERLAREQLALEHESYEMGEARFRKMFERQLKAGEVADNAAAKPLITTLLPKMIARINDWFEEVKAKRGKRPTAFQFLQEIKPEAVAYITIKTTLACLTSADNTTVQAVASAIGRAIEDEARFGRIRDLEAKHFKKNVEEQLNKRVGHVYKKAFMQVVEADMLSKGLLGGEAWSSWHKEDSIHVGVRCIEMLIESTGMVSLHRQNAGVVGQDSETIELAPEYAEAIATRAGALAGISPMFQPCVVPPKPWTGITGGGYWANGRRPLALVRTHSKKALMRYEDVYMPEVYKAINIAQNTAWKINKKVLAVANVITKWKHSPVEDIPAIEREELPMKPEDIDMNPEALTAWKRAAAAVYRKDKARKSRRISLEFMLEQANKFANHKAIWFPYNMDWRGRVYAVSMFNPQGNDMTKGLLTLAKGKPIGKEGYYWLKIHGANCAGVDKVPFPERIKFIEENHENIMACAKSPLENTWWAEQDSPFCFLAFCFEYAGVQHHGLSYNCSLPLAFDGSCSGIQHFSAMLRDEVGGRAVNLLPSETVQDIYGIVAKKVNEILQADAINGTDNEVVTVTDENTGEISEKVKLGTKALAGQWLAYGVTRSVTKRSVMTLAYGSKEFGFRQQVLEDTIQPAIDSGKGLMFTQPNQAAGYMAKLIWESVSVTVVAAVEAMNWLKSAAKLLAAEVKDKKTGEILRKRSAVHWVTPDGFPVWQEYKKPIQTRLNLMFLGQFRLQPTINTNKDSEIDAHKQESGIAPNFVHSQDGSHLRKTVVWAHEKYGIESFALIHDSFGTIPADAANLFKAVRETMVDTYESSDVLADFYDQFADQLHESQLDKMPALPAKGNLNLRDILESDFAFA

来源 Source

来源生物 organism	Enterobacteria phage T7
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10760
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	T7 LYSOZYME
分子量 formula_weight	17007.3 kDa
EC 编号 ec_number	3.5.1.28
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MARVQFKQRESTDAIFVHCSATKPSQNVGVREIRQWHKEQGWLDVGYHFIIKRDGTVEAGRDEMAVGSHAKGYNHNSIGVCLVGGIDDKGKFDANFTPAQMQSLRSLLVTLLAKYEGAVLRAHHEVAPKACPSFDLKRWWEKNELVTSDRG

来源 Source

来源生物 organism	Enterobacteria phage T7
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10760
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	MERCURY (II) ION
分子量 formula_weight	200.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d1arol_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.118 — N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.118.1 — N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase-like
家族 Family family	d.118.1.1 — N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase-like

结构域编号 domain_id	d1arop_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.8 — DNA/RNA polymerases
超家族 Superfamily superfamily	e.8.1 — DNA/RNA polymerases
家族 Family family	e.8.1.3 — T7 RNA polymerase

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	1aroL00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	80 — Lysozyme-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Peptidoglycan recognition protein-like

结构域编号 domain_id	1aroP01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1320 — T7 RNA polymerase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — DNA-directed RNA polymerase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	1aroP02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	260 —

结构域编号 domain_id	1aroP03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	370 —

结构域编号 domain_id	1aroP04
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	280 —

结构域编号 domain_id	1aroP05
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	150 — DNA polymerase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — 5' to 3' exonuclease, C-terminal subdomain

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晶胞边长 a length_a	273.385 Å
晶胞边长 b length_b	95.612 Å
晶胞边长 c length_c	63.582 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	101.40 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.800 Å
最低分辨率 resolution_low	30.000 Å
R 因子 r_factor	0.2620
R_work r_work	0.2620
R_free r_free	0.3090

T7 RNA POLYMERASE COMPLEXED WITH T7 LYSOZYME

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

T7 RNA POLYMERASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

T7 LYSOZYME

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1aro__assembly_1__model_1

1aro__assembly_1__model_1 | I(q)

1aro__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)

T7 RNA POLYMERASE COMPLEXED WITH T7 LYSOZYME

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

T7 RNA POLYMERASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

T7 LYSOZYME

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1aro__assembly_1__model_1

1aro__assembly_1__model_1 | I(q)

1aro__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)