HYBRID PROTEIN FORMED FROM CHYMOTRYPSIN INHIBITOR-2
Hordeum vulgare, Bacillus licheniformis
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 21–83 | 未记录 | 无其他共同聚合物 | SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取环境条件 | 分辨率未提供 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 1CIS | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1CIQ COMPLEX OF TWO FRAGMENTS OF CI2, RESIDUES 1-40 AND 41-64 提交 1995-10-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 A
21–59(39 aa)
片段:RESIDUES 1 - 40, 41 - 64
链 B
60–83(24 aa)
片段:RESIDUES 1 - 40, 41 - 64
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å |
| 1CIQ COMPLEX OF TWO FRAGMENTS OF CI2, RESIDUES 1-40 AND 41-64 提交 1995-10-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
21–59(39 aa)
片段:RESIDUES 1 - 40, 41 - 64
链 B
60–83(24 aa)
片段:RESIDUES 1 - 40, 41 - 64
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å |
| 1CIR COMPLEX OF TWO FRAGMENTS OF CI2 [(1-40)(DOT)(41-64)] 提交 1995-10-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
21–58(38 aa)
链 B
60–83(24 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1COA THE EFFECT OF CAVITY CREATING MUTATIONS IN THE HYDROPHOBIC CORE OF CHYMOTRYPSIN INHIBITOR 2 提交 1993-05-14 | 聚集状态不同 实验方法不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 I
21–83(63 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å |
| 1CQ4 CI2 MUTANT WITH TETRAGLUTAMINE (MGQQQQGM) REPLACING MET59 提交 1998-11-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
21–59(39 aa)
链 B
60–83(24 aa)
|
突变:YES 突变:YES | SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;DROPS WERE PREPARED BY MIXING 2 MICROLITERS OF PURIFIED DIMER AT 25MG/ML WITH AN EQUAL VOLUME OF BUFFER (30% W/V PEG-400, 1.0 M LITHIUM SULPHATE, AND 1 MM CALCIUM CHLORIDE, IN 0.1 M TRIS-HCL AT PH 7.5), WHICH WAS ALSO USED AS THE WELL BUFFER (1 ML).
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.300 |
| 1CQ4 CI2 MUTANT WITH TETRAGLUTAMINE (MGQQQQGM) REPLACING MET59 提交 1998-11-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 A
21–59(39 aa)
链 B
60–83(24 aa)
|
突变:YES 突变:YES | SO4 SULFATE ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;DROPS WERE PREPARED BY MIXING 2 MICROLITERS OF PURIFIED DIMER AT 25MG/ML WITH AN EQUAL VOLUME OF BUFFER (30% W/V PEG-400, 1.0 M LITHIUM SULPHATE, AND 1 MM CALCIUM CHLORIDE, IN 0.1 M TRIS-HCL AT PH 7.5), WHICH WAS ALSO USED AS THE WELL BUFFER (1 ML).
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.300 |
| 1CQ4 CI2 MUTANT WITH TETRAGLUTAMINE (MGQQQQGM) REPLACING MET59 提交 1998-11-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric |
链 A
21–59(39 aa)
链 B
60–83(24 aa)
|
突变:YES 突变:YES | SO4 SULFATE ION × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;DROPS WERE PREPARED BY MIXING 2 MICROLITERS OF PURIFIED DIMER AT 25MG/ML WITH AN EQUAL VOLUME OF BUFFER (30% W/V PEG-400, 1.0 M LITHIUM SULPHATE, AND 1 MM CALCIUM CHLORIDE, IN 0.1 M TRIS-HCL AT PH 7.5), WHICH WAS ALSO USED AS THE WELL BUFFER (1 ML).
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.300 |
| 1LW6 Crystal Structure of the Complex of Subtilisin BPN' with Chymotrypsin Inhibitor 2 at 1.5 Angstrom Resolution 提交 2002-05-30 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 I
21–83(63 aa)
|
突变:E45A | CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;PEG 8000, ammonium sulfate, sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.188 |
| 1YPA DIRECT OBSERVATION OF BETTER HYDRATION AT THE N-TERMINUS OF AN ALPHA-HELIX WITH GLYCINE RATHER THAN ALANINE AS N-CAP 提交 1993-01-10 | 实验方法不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 I
21–83(63 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å |
| 1YPB DIRECT OBSERVATION OF BETTER HYDRATION AT THE N-TERMINUS OF AN ALPHA-HELIX WITH GLYCINE RATHER THAN ALANINE AS N-CAP 提交 1993-01-10 | 实验方法不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 I
21–83(63 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å |
| 1YPC DIRECT OBSERVATION OF BETTER HYDRATION AT THE N-TERMINUS OF AN ALPHA-HELIX WITH GLYCINE RATHER THAN ALANINE AS N-CAP 提交 1993-01-10 | 实验方法不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 I
21–83(63 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.70 Å |
| 2CI2 CRYSTAL AND MOLECULAR STRUCTURE OF THE SERINE PROTEINASE INHIBITOR CI-2 FROM BARLEY SEEDS 提交 1988-09-05 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 I
5–83(79 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å |
| 2SNI STRUCTURAL COMPARISON OF TWO SERINE PROTEINASE-PROTEIN INHIBITOR COMPLEXES. EGLIN-C-SUBTILISIN CARLSBERG AND CI-2-SUBTILISIN NOVO 提交 1988-09-05 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 I
1–83(83 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.10 Å |
| 3CI2 REFINEMENT OF THE THREE-DIMENSIONAL SOLUTION STRUCTURE OF BARLEY SERINE PROTEINASE INHIBITOR 2 AND COMPARISON WITH THE STRUCTURES IN CRYSTALS 提交 1991-09-10 | 构建体不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
18–83(66 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 5FBZ Structure of subtilase SubHal from Bacillus halmapalus - complex with chymotrypsin inhibitor CI2A 提交 2015-12-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
13–84(72 aa)
片段:UNP residues 13-84
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;291 K;Plate-like crystals were grown by hanging drop vapour diffusion with the drop consisting of 2 microliters of 15-20 mg/mL concentration protein, 10 mM sodium cacodylate in HCl buffer, pH 6.5 and 1 microliter of reservoir solution: 20% w/v PEG 4000, 0.1 M HEPES buffer, pH 7.5, 10% v/v isopropanol.
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.181 |
| 5FBZ Structure of subtilase SubHal from Bacillus halmapalus - complex with chymotrypsin inhibitor CI2A 提交 2015-12-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
13–84(72 aa)
片段:UNP residues 13-84
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;291 K;Plate-like crystals were grown by hanging drop vapour diffusion with the drop consisting of 2 microliters of 15-20 mg/mL concentration protein, 10 mM sodium cacodylate in HCl buffer, pH 6.5 and 1 microliter of reservoir solution: 20% w/v PEG 4000, 0.1 M HEPES buffer, pH 7.5, 10% v/v isopropanol.
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.181 |
| 5FFN Complex of subtilase SubTY from Bacillus sp. TY145 with chymotrypsin inhibitor CI2A 提交 2015-12-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 I
13–84(72 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;Complex was concentrated to 45 mg/ml in 10 mM Tris, pH 7.0. 1 microliter of protein solution with 1 microliter of a reservoir solution containing 5.5 M sodium formate, 0.2 M imidazole-malate pH 6.5, and 200 mM NDSB 201.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.188 |
| 6QIY CI-2, conformation 1 提交 2019-01-21 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 A
20–84(65 aa)
片段:UNP RESIDUES 20-84
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;1.4 M AMMONIUM SULPHATE AND 100 MM
TRIS-HCL PH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 293K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.257 |
| 6QIZ CI-2, conformation 2 提交 2019-01-21 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 A
21–84(64 aa)
片段:UNP RESIDUES 21-84
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;25% PEG 3350, 100 MM TRIS-HCL PH 8.5
AND 200 MM LITHIUM SULPHATE, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP,
TEMPERATURE 293K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.220 |
| 7A1H Crystal structure of wild-type CI2 提交 2020-08-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 A
22–84(63 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 24 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;40 % (NH4)2SO4, 50 mM Tris-Hcl, pH 8.0. Protein concentration app 75 mg/mL.
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.254 |
| 7A3M Synergistic stabilization of a double mutant in CI2 from an in-cell library screen 提交 2020-08-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
22–84(63 aa)
|
突变:I57V | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;40 % (NH4)2SO4, 50 mM Tris-HCl, pH 8.0
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.181 |
| 7AOK Crystal structure of CI2 mutant L49I 提交 2020-10-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
21–84(64 aa)
|
突变:L49I | SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;40 % (NH4)2SO4, 50 mM Tris-HCl, pH 8.0
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.246 |
| 7AON Crystal structure of CI2 double mutant L49I,I57V 提交 2020-10-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 A
21–84(64 aa)
|
突变:L49I, I57V | SO4 SULFATE ION × 24 GOL GLYCEROL × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;40 % (NH4)2SO4, 50 mM Tris-HCl, pH 8.0
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.219 |
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| UniProt名称 | ICI2_HORVU |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 2–66; UniProt 21–83 |