1dkd

CRYSTAL STRUCTURE OF A GROEL (APICAL DOMAIN) AND A DODECAMERIC PEPTIDE COMPLEX

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 100.6 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

GROEL

Escherichia coli

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 191–336	片段：APICAL DOMAIN	12-MER PEPTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；PEG4K, MgCl2, TrisCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 18K	分辨率 2.10 Å R-free 0.264
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 191–336	片段：APICAL DOMAIN	12-MER PEPTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；PEG4K, MgCl2, TrisCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 18K	分辨率 2.10 Å R-free 0.264
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 191–336	片段：APICAL DOMAIN	12-MER PEPTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；PEG4K, MgCl2, TrisCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 18K	分辨率 2.10 Å R-free 0.264
4	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 191–336	片段：APICAL DOMAIN	12-MER PEPTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；PEG4K, MgCl2, TrisCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 18K	分辨率 2.10 Å R-free 0.264
5	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 191–336 链 C； UniProt 191–336	片段：APICAL DOMAIN	12-MER PEPTIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；PEG4K, MgCl2, TrisCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 18K	分辨率 2.10 Å R-free 0.264
6	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 191–336 链 D； UniProt 191–336	片段：APICAL DOMAIN	12-MER PEPTIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；PEG4K, MgCl2, TrisCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 18K	分辨率 2.10 Å R-free 0.264

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1DKD	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AON CRYSTAL STRUCTURE OF THE ASYMMETRIC CHAPERONIN COMPLEX GROEL/GROES/(ADP)7 提交 1997-07-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 A 2–548（547 aa）链 B 2–548（547 aa）链 C 2–548（547 aa）链 D 2–548（547 aa）链 E 2–548（547 aa）链 F 2–548（547 aa）链 G 2–548（547 aa）链 H 2–548（547 aa）链 I 2–548（547 aa）链 J 2–548（547 aa）链 K 2–548（547 aa）链 L 2–548（547 aa）链 M 2–548（547 aa）链 N 2–548（547 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 12% PEG3000, 0.25M SODIUM GLUTAMATE, 100MM CACODYLIC ACID, PH 5.5	分辨率 3.00 Å R-free 0.291
1DK7 CRYSTAL STRUCTURE OF AN ISOLATED APICAL DOMAIN OF GROEL 提交 1999-12-06	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 191–336（146 aa）片段：APICAL DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292.3 K；PEG4K, LI2SO4, TRISHCL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 19.3K	分辨率 2.02 Å R-free 0.241
1DK7 CRYSTAL STRUCTURE OF AN ISOLATED APICAL DOMAIN OF GROEL 提交 1999-12-06	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 191–336（146 aa）片段：APICAL DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292.3 K；PEG4K, LI2SO4, TRISHCL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 19.3K	分辨率 2.02 Å R-free 0.241
1FY9 CRYSTAL STRUCTURE OF THE HEXA-SUBSTITUTED MUTANT OF THE MOLECULAR CHAPERONIN GROEL APICAL DOMAIN 提交 2000-09-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 184–376（193 aa）片段：APICAL DOMAIN (RESIDUES 191-376)	突变：A212E/A223V/M233L/I305L/E308K/N326T	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；290 K；0.75-0.9M POTASSIUM TARTRATE, 50MM MES SODIUM, pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 2.20 Å R-free 0.292
1FYA CRYSTAL STRUCTURE OF THE HEXA-SUBSTITUTED MUTANT OF THE MOLECULAR CHAPERONIN GROEL APICAL DOMAIN 提交 2000-09-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 184–376（193 aa）片段：APICAL DOMAIN (RESIDUES 191-376)	突变：A212E/A223T/M233L/I305L/E308K/N326T	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；290 K；0.75-0.9 M SODIUM POTASSIUM TARTRATE, 50 MM MES SODIUM, pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 2.20 Å R-free 0.279
1JON GROEL (HSP60 CLASS) FRAGMENT COMPRISING RESIDUES 191-345 提交 1996-05-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 190–344（155 aa）片段：POLYPEPTIDE BINDING (APICAL) DOMAIN, RESIDUES 191 - 345	突变：A262L, I267M	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；290 K；11% PEG 4000, 50 MM TRIS-HCL, PH 8.5, 200 MM LISO4, 23 MG/ML PROTEIN, 17 DEG. C., temperature 290K	分辨率 2.50 Å R-free 0.287
1KID GROEL (HSP60 CLASS) FRAGMENT (APICAL DOMAIN) COMPRISING RESIDUES 191-376, MUTANT WITH ALA 262 REPLACED WITH LEU AND ILE 267 REPLACED WITH MET 提交 1996-12-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 181–375（195 aa）片段：APICAL DOMAIN, RESIDUES 191 - 376	突变：A262L, I267M	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；pH 8.5	分辨率 1.70 Å R-free 0.224
1KP8 Structural Basis for GroEL-assisted Protein Folding from the Crystal Structure of (GroEL-KMgATP)14 at 2.0 A Resolution 提交 2001-12-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–547（547 aa）链 B 1–547（547 aa）链 C 1–547（547 aa）链 D 1–547（547 aa）链 E 1–547（547 aa）链 F 1–547（547 aa）链 G 1–547（547 aa）链 H 1–547（547 aa）链 I 1–547（547 aa）链 J 1–547（547 aa）链 K 1–547（547 aa）链 L 1–547（547 aa）链 M 1–547（547 aa）链 N 1–547（547 aa）	突变：R13G, A126V 突变：R13G, A126V 突变：R13G, A126V 突变：R13G, A126V 突变：R13G, A126V 突变：R13G, A126V 突变：R13G, A126V 突变：R13G, A126V 突变：R13G, A126V 突变：R13G, A126V 突变：R13G, A126V 突变：R13G, A126V 突变：R13G, A126V 突变：R13G, A126V	SO4 SULFATE ION × 22 MG MAGNESIUM ION × 14 K POTASSIUM ION × 16 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 14	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.258
1LA1 Gro-EL Fragment (Apical Domain) Comprising Residues 188-379 提交 2002-03-27	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 188–379（192 aa）片段：Apical Domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.6 M NaCl, 14 % (w/v) PEG 6000, 100 mM Tris/HCl pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.06 Å R-free 0.257
1MNF Domain motions in GroEL upon binding of an oligopeptide 提交 2002-09-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric	链 A 1–547（547 aa）链 B 1–547（547 aa）链 C 1–547（547 aa）链 D 1–547（547 aa）链 E 1–547（547 aa）链 F 1–547（547 aa）链 G 1–547（547 aa）链 H 1–547（547 aa）链 I 1–547（547 aa）链 J 1–547（547 aa）链 K 1–547（547 aa）链 L 1–547（547 aa）链 M 1–547（547 aa）链 N 1–547（547 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；300 K；PEG, pH 7, VAPOR DIFFUSION, temperature 300K	分辨率 3.00 Å R-free 0.259
1OEL CONFORMATIONAL VARIABILITY IN THE REFINED STRUCTURE OF THE CHAPERONIN GROEL AT 2.8 ANGSTROM RESOLUTION 提交 1995-11-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–547（547 aa）链 B 1–547（547 aa）链 C 1–547（547 aa）链 D 1–547（547 aa）链 E 1–547（547 aa）链 F 1–547（547 aa）链 G 1–547（547 aa）	突变：R13G, A126V 突变：R13G, A126V 突变：R13G, A126V 突变：R13G, A126V 突变：R13G, A126V 突变：R13G, A126V 突变：R13G, A126V	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.80 Å R-free 0.270
1PCQ Crystal structure of groEL-groES 提交 2003-05-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 A 1–524（524 aa）链 B 1–524（524 aa）链 C 1–524（524 aa）链 D 1–524（524 aa）链 E 1–524（524 aa）链 F 1–524（524 aa）链 G 1–524（524 aa）链 H 1–524（524 aa）链 I 1–524（524 aa）链 J 1–524（524 aa）链 K 1–524（524 aa）链 L 1–524（524 aa）链 M 1–524（524 aa）链 N 1–524（524 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 7 K POTASSIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 7	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.81 Å R-free 0.278
1SS8 GroEL 提交 2004-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–524（524 aa）链 B 1–524（524 aa）链 C 1–524（524 aa）链 D 1–524（524 aa）链 E 1–524（524 aa）链 F 1–524（524 aa）链 G 1–524（524 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION, RECRYSTALLIZATION；pH 8；298 K；PEG 8000, 1.72 M ammonium slufate, 4 mM CaCl2, 100mM Tris-acetate , pH 8.0, EVAPORATION, RECRYSTALLIZATION, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.249
1SS8 GroEL 提交 2004-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–524（524 aa）链 B 1–524（524 aa）链 C 1–524（524 aa）链 D 1–524（524 aa）链 E 1–524（524 aa）链 F 1–524（524 aa）链 G 1–524（524 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION, RECRYSTALLIZATION；pH 8；298 K；PEG 8000, 1.72 M ammonium slufate, 4 mM CaCl2, 100mM Tris-acetate , pH 8.0, EVAPORATION, RECRYSTALLIZATION, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.249
1SVT Crystal structure of GroEL14-GroES7-(ADP-AlFx)7 提交 2004-03-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 A 1–524（524 aa）链 B 1–524（524 aa）链 C 1–524（524 aa）链 D 1–524（524 aa）链 E 1–524（524 aa）链 F 1–524（524 aa）链 G 1–524（524 aa）链 H 1–524（524 aa）链 I 1–524（524 aa）链 J 1–524（524 aa）链 K 1–524（524 aa）链 L 1–524（524 aa）链 M 1–524（524 aa）链 N 1–524（524 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 7 K POTASSIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；PEG3000, cacodylic acid, potassium chloride, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.81 Å R-free 0.274
1SX3 GroEL14-(ATPgammaS)14 提交 2004-03-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–525（525 aa）链 B 1–525（525 aa）链 C 1–525（525 aa）链 D 1–525（525 aa）链 E 1–525（525 aa）链 F 1–525（525 aa）链 G 1–525（525 aa）链 H 1–525（525 aa）链 I 1–525（525 aa）链 J 1–525（525 aa）链 K 1–525（525 aa）链 L 1–525（525 aa）链 M 1–525（525 aa）链 N 1–525（525 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 14 K POTASSIUM ION × 16 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, bis-tris propane, ethylene glycol, glycerol, potassium chloride, calcium chloride, ATPgammaS, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.265
1SX4 GroEL-GroES-ADP7 提交 2004-03-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 A 1–524（524 aa）链 B 1–524（524 aa）链 C 1–524（524 aa）链 D 1–524（524 aa）链 E 1–524（524 aa）链 F 1–524（524 aa）链 G 1–524（524 aa）链 H 1–524（524 aa）链 I 1–524（524 aa）链 J 1–524（524 aa）链 K 1–524（524 aa）链 L 1–524（524 aa）链 M 1–524（524 aa）链 N 1–524（524 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；PEG 3000, cacodylic acid, sodium glutamate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.287
2C7C FITTED COORDINATES FOR GROEL-ATP7-GROES CRYO-EM COMPLEX (EMD-1180) 提交 2005-11-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 A 1–547（547 aa）链 B 1–547（547 aa）链 C 1–547（547 aa）链 D 1–547（547 aa）链 E 1–547（547 aa）链 F 1–547（547 aa）链 G 1–547（547 aa）链 H 1–547（547 aa）链 I 1–547（547 aa）链 J 1–547（547 aa）链 K 1–547（547 aa）链 L 1–547（547 aa）链 M 1–547（547 aa）链 N 1–547（547 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 12.5MM HEPES, 5MM KCL, 5MM MGCL2；pH 7.5；12.5MM HEPES, 5MM KCL, 5MM MGCL2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE	分辨率 7.70 Å
2C7D Fitted coordinates for GroEL-ADP7-GroES Cryo-EM complex (EMD-1181) 提交 2005-11-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 A 1–547（547 aa）链 B 1–547（547 aa）链 C 1–547（547 aa）链 D 1–547（547 aa）链 E 1–547（547 aa）链 F 1–547（547 aa）链 G 1–547（547 aa）链 H 1–547（547 aa）链 I 1–547（547 aa）链 J 1–547（547 aa）链 K 1–547（547 aa）链 L 1–547（547 aa）链 M 1–547（547 aa）链 N 1–547（547 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 12.5MM HEPES, 5MM KCL, 5MM MGCL2；pH 7.5；12.5MM HEPES, 5MM KCL, 5MM MGCL2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE	分辨率 8.70 Å
2CGT GROEL-ADP-gp31 COMPLEX 提交 2006-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 A 1–547（547 aa）链 B 1–547（547 aa）链 C 1–547（547 aa）链 D 1–547（547 aa）链 E 1–547（547 aa）链 F 1–547（547 aa）链 G 1–547（547 aa）链 H 1–547（547 aa）链 I 1–547（547 aa）链 J 1–547（547 aa）链 K 1–547（547 aa）链 L 1–547（547 aa）链 M 1–547（547 aa）链 N 1–547（547 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20MM TRIS-HCL, 10MM MGCL, 10MM KCL；pH 7.4；20MM TRIS-HCL, 10MM MGCL, 10MM KCL cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；GRIDS WERE BLOTED FOR 2-3 SECONDS AND THEN LEFT TO EQUILIBRATE FOR 2-3 SECONDS AND THEN PLUNGED INTO LIQUID ETHANE	分辨率 8.20 Å
2EU1 Crystal structure of the chaperonin GroEL-E461K 提交 2005-10-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–548（548 aa）链 B 1–548（548 aa）链 C 1–548（548 aa）链 D 1–548（548 aa）链 E 1–548（548 aa）链 F 1–548（548 aa）链 G 1–548（548 aa）	突变：E461K 突变：E461K 突变：E461K 突变：E461K 突变：E461K 突变：E461K 突变：E461K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；277 K；Reservoir solution: 43% (v/v) MPD, 100mM Imidazole, 170mM MgCl2.6H2O, dissolved in the ratio 1:1.5 with 22.5mg/ml protein, 50mM TRIS-HCL, 10mM MgCl2, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 3.29 Å R-free 0.296
2EU1 Crystal structure of the chaperonin GroEL-E461K 提交 2005-10-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 H 1–548（548 aa）链 I 1–548（548 aa）链 J 1–548（548 aa）链 K 1–548（548 aa）链 L 1–548（548 aa）链 M 1–548（548 aa）链 N 1–548（548 aa）	突变：E461K 突变：E461K 突变：E461K 突变：E461K 突变：E461K 突变：E461K 突变：E461K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；277 K；Reservoir solution: 43% (v/v) MPD, 100mM Imidazole, 170mM MgCl2.6H2O, dissolved in the ratio 1:1.5 with 22.5mg/ml protein, 50mM TRIS-HCL, 10mM MgCl2, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 3.29 Å R-free 0.296
2EU1 Crystal structure of the chaperonin GroEL-E461K 提交 2005-10-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 H 1–548（548 aa）链 I 1–548（548 aa）链 J 1–548（548 aa）链 K 1–548（548 aa）链 L 1–548（548 aa）链 M 1–548（548 aa）链 N 1–548（548 aa）	突变：E461K 突变：E461K 突变：E461K 突变：E461K 突变：E461K 突变：E461K 突变：E461K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；277 K；Reservoir solution: 43% (v/v) MPD, 100mM Imidazole, 170mM MgCl2.6H2O, dissolved in the ratio 1:1.5 with 22.5mg/ml protein, 50mM TRIS-HCL, 10mM MgCl2, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 3.29 Å R-free 0.296
2EU1 Crystal structure of the chaperonin GroEL-E461K 提交 2005-10-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–548（548 aa）链 B 1–548（548 aa）链 C 1–548（548 aa）链 D 1–548（548 aa）链 E 1–548（548 aa）链 F 1–548（548 aa）链 G 1–548（548 aa）	突变：E461K 突变：E461K 突变：E461K 突变：E461K 突变：E461K 突变：E461K 突变：E461K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；277 K；Reservoir solution: 43% (v/v) MPD, 100mM Imidazole, 170mM MgCl2.6H2O, dissolved in the ratio 1:1.5 with 22.5mg/ml protein, 50mM TRIS-HCL, 10mM MgCl2, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 3.29 Å R-free 0.296
2YEY Crystal structure of the allosteric-defective chaperonin GroEL E434K mutant 提交 2011-03-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 2–525（524 aa）链 B 2–525（524 aa）链 C 2–525（524 aa）链 D 2–525（524 aa）链 E 2–525（524 aa）链 F 2–525（524 aa）链 G 2–525（524 aa）链 H 2–525（524 aa）链 I 2–525（524 aa）链 J 2–525（524 aa）链 K 2–525（524 aa）链 L 2–525（524 aa）链 M 2–525（524 aa）链 N 2–525（524 aa）	突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 4.50 Å R-free 0.240
3C9V C7 Symmetrized Structure of Unliganded GroEL at 4.7 Angstrom Resolution from CryoEM 提交 2008-02-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 2–527（526 aa）片段：residues 2-527 链 B 2–527（526 aa）片段：residues 2-527 链 C 2–527（526 aa）片段：residues 2-527 链 D 2–527（526 aa）片段：residues 2-527 链 E 2–527（526 aa）片段：residues 2-527 链 F 2–527（526 aa）片段：residues 2-527 链 G 2–527（526 aa）片段：residues 2-527 链 H 2–527（526 aa）片段：residues 2-527 链 I 2–527（526 aa）片段：residues 2-527 链 J 2–527（526 aa）片段：residues 2-527 链 K 2–527（526 aa）片段：residues 2-527 链 L 2–527（526 aa）片段：residues 2-527 链 M 2–527（526 aa）片段：residues 2-527 链 N 2–527（526 aa）片段：residues 2-527	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 mM Tris.HCl, pH 7.5, 50 mM MgCl2；pH 7.5；20 mM Tris.HCl, pH 7.5, 50 mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；ETHANE. Vitrobot, blot for 2 sec.	分辨率 4.70 Å
3CAU D7 symmetrized structure of unliganded GroEL at 4.2 Angstrom resolution by cryoEM 提交 2008-02-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 2–527（526 aa）片段：residues 2-527 链 B 2–527（526 aa）片段：residues 2-527 链 C 2–527（526 aa）片段：residues 2-527 链 D 2–527（526 aa）片段：residues 2-527 链 E 2–527（526 aa）片段：residues 2-527 链 F 2–527（526 aa）片段：residues 2-527 链 G 2–527（526 aa）片段：residues 2-527 链 H 2–527（526 aa）片段：residues 2-527 链 I 2–527（526 aa）片段：residues 2-527 链 J 2–527（526 aa）片段：residues 2-527 链 K 2–527（526 aa）片段：residues 2-527 链 L 2–527（526 aa）片段：residues 2-527 链 M 2–527（526 aa）片段：residues 2-527 链 N 2–527（526 aa）片段：residues 2-527	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 mM Tris.HCl, pH 7.5, 50 mM MgCl2；pH 7.5；20 mM Tris.HCl, pH 7.5, 50 mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；ETHANE. Vitrobot, 2sec blot	分辨率 4.20 Å
3VZ6 Crystal Structure Analysis of the Mini-chaperonines, variant with Gly 184 replaced with Ile and Leu 185 replaced Val and Val 186 replaced with Leu. 提交 2012-10-09	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 191–376（186 aa）片段：Apical domain, UNP residues 191-376	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.7；288 K；0.1M Tris-HCl,1M NaCl, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K	分辨率 1.50 Å R-free 0.288
3VZ7 Crystal Structure Analysis of the mini-chaperonin variant with Pro 187 Gly 提交 2012-10-09	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 191–376（186 aa）片段：Apical domain, UNP residues 191-376	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.7；288 K；0.1M Tris-HCl, 1M NaCl, 3.75% Glycerol, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K	分辨率 1.80 Å R-free 0.249
3VZ8 Crystal Structure Analysis of the Mini-chaperonin variant with Leu 185, Val 186, Pro 187, Arg 188 and Ser 190 replaced with all Gly 提交 2012-10-09	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 191–376（186 aa）片段：Apical domain, UNP residues 192-376	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；288 K；0.1M Tris-HCl, 1.61M NaCl, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K	分辨率 1.90 Å R-free 0.272
3VZ8 Crystal Structure Analysis of the Mini-chaperonin variant with Leu 185, Val 186, Pro 187, Arg 188 and Ser 190 replaced with all Gly 提交 2012-10-09	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 191–376（186 aa）片段：Apical domain, UNP residues 192-376	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；288 K；0.1M Tris-HCl, 1.61M NaCl, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K	分辨率 1.90 Å R-free 0.272
3VZ8 Crystal Structure Analysis of the Mini-chaperonin variant with Leu 185, Val 186, Pro 187, Arg 188 and Ser 190 replaced with all Gly 提交 2012-10-09	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 191–376（186 aa）片段：Apical domain, UNP residues 192-376	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；288 K；0.1M Tris-HCl, 1.61M NaCl, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K	分辨率 1.90 Å R-free 0.272
3WVL Crystal structure of the football-shaped GroEL-GroES complex (GroEL: GroES2:ATP14) from Escherichia coli 提交 2014-05-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–548（548 aa）链 B 1–548（548 aa）链 C 1–548（548 aa）链 D 1–548（548 aa）链 E 1–548（548 aa）链 F 1–548（548 aa）链 G 1–548（548 aa）	突变：D52A, D398A 突变：D52A, D398A 突变：D52A, D398A 突变：D52A, D398A 突变：D52A, D398A 突变：D52A, D398A 突变：D52A, D398A	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 K POTASSIUM ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；35% PEG 550 MME, 0.1M HEPES, 1mM ATP, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.79 Å R-free 0.250
3WVL Crystal structure of the football-shaped GroEL-GroES complex (GroEL: GroES2:ATP14) from Escherichia coli 提交 2014-05-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 H 1–548（548 aa）链 I 1–548（548 aa）链 J 1–548（548 aa）链 K 1–548（548 aa）链 L 1–548（548 aa）链 M 1–548（548 aa）链 N 1–548（548 aa）	突变：D52A, D398A 突变：D52A, D398A 突变：D52A, D398A 突变：D52A, D398A 突变：D52A, D398A 突变：D52A, D398A 突变：D52A, D398A	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 K POTASSIUM ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；35% PEG 550 MME, 0.1M HEPES, 1mM ATP, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.79 Å R-free 0.250
3ZPZ Visualizing GroEL-ES in the Act of Encapsulating a Non-Native Substrate Protein 提交 2013-03-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 A 2–527（526 aa）链 B 2–527（526 aa）链 C 2–527（526 aa）链 D 2–527（526 aa）链 E 2–527（526 aa）链 F 2–527（526 aa）链 G 2–527（526 aa）链 H 2–527（526 aa）链 I 2–527（526 aa）链 J 2–527（526 aa）链 K 2–527（526 aa）链 L 2–527（526 aa）链 M 2–527（526 aa）链 N 2–527（526 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 50 MM HEPES, 5 MM KOAC, 10 MM MG(OAC)2, 2 MM DTT；pH 7.6；50 MM HEPES, 5 MM KOAC, 10 MM MG(OAC)2, 2 MM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, TEMPERATURE- 98, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 1 SECOND BEFORE PLUNGING,	分辨率 8.90 Å
3ZQ0 Visualizing GroEL-ES in the Act of Encapsulating a Non-Native Substrate Protein 提交 2013-03-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 A 2–525（524 aa）链 B 2–525（524 aa）链 C 2–525（524 aa）链 D 2–525（524 aa）链 E 2–525（524 aa）链 F 2–525（524 aa）链 G 2–525（524 aa）链 H 2–525（524 aa）链 I 2–525（524 aa）链 J 2–525（524 aa）链 K 2–525（524 aa）链 L 2–525（524 aa）链 M 2–525（524 aa）链 N 2–525（524 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 50 MM HEPES, 50 MM KOAC, 10 MM MG(OAC)2, 2 MM DTT；pH 7.6；50 MM HEPES, 50 MM KOAC, 10 MM MG(OAC)2, 2 MM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, TEMPERATURE- 98, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD BLOT FOR 1 SECOND BEFORE PLUNGIN	分辨率 9.20 Å
3ZQ1 Visualizing GroEL-ES in the Act of Encapsulating a Non-Native Substrate Protein 提交 2013-03-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 A 2–527（526 aa）链 B 2–527（526 aa）链 C 2–527（526 aa）链 D 2–527（526 aa）链 E 2–527（526 aa）链 F 2–527（526 aa）链 G 2–527（526 aa）链 H 2–527（526 aa）链 I 2–527（526 aa）链 J 2–527（526 aa）链 K 2–527（526 aa）链 L 2–527（526 aa）链 M 2–527（526 aa）链 N 2–527（526 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 50 MM HEPES, 50 MM KOAC, 10 MM MG(OAC)2, 2 MM DTT；pH 7.6；50 MM HEPES, 50 MM KOAC, 10 MM MG(OAC)2, 2 MM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, TEMPERATURE- 98, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 1 SECOND BEFORE PLUNGING,	分辨率 15.90 Å
4AAQ ATP-triggered molecular mechanics of the chaperonin GroEL 提交 2011-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–548（548 aa）链 B 1–548（548 aa）链 C 1–548（548 aa）链 D 1–548（548 aa）链 E 1–548（548 aa）链 F 1–548（548 aa）链 G 1–548（548 aa）链 H 1–548（548 aa）链 I 1–548（548 aa）链 J 1–548（548 aa）链 K 1–548（548 aa）链 L 1–548（548 aa）链 M 1–548（548 aa）链 N 1–548（548 aa）	突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 PO4 PHOSPHATE ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 50 MM TRIS-HCL PH 7.4, 50 MM KCL, 10 MM MGCL2 AND 200UM ATP；pH 7.4；50 MM TRIS-HCL PH 7.4, 50 MM KCL, 10 MM MGCL2 AND 200UM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；VITRIFIED WITH A VITROBOT AT 100 PERCENT HUMIDITY WITH 2-3 SECONDS BLOTTING TIME	分辨率 8.00 Å
4AAR ATP-triggered molecular mechanics of the chaperonin GroEL 提交 2011-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–548（548 aa）链 B 1–548（548 aa）链 C 1–548（548 aa）链 D 1–548（548 aa）链 E 1–548（548 aa）链 F 1–548（548 aa）链 G 1–548（548 aa）链 H 1–548（548 aa）链 I 1–548（548 aa）链 J 1–548（548 aa）链 K 1–548（548 aa）链 L 1–548（548 aa）链 M 1–548（548 aa）链 N 1–548（548 aa）	突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 PO4 PHOSPHATE ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 50 MM TRIS-HCL PH 7.4, 50 MM KCL AND 10 MM MGCL2, 200 UM ATP；pH 7.4；50 MM TRIS-HCL PH 7.4, 50 MM KCL AND 10 MM MGCL2, 200 UM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；VITRIFIED WITH A VITROBOT AT 100 PERCENT HUMIDITY WITH 2-3 SECONDS BLOTTING TIME	分辨率 8.00 Å
4AAS ATP-triggered molecular mechanics of the chaperonin GroEL 提交 2011-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–548（548 aa）链 B 1–548（548 aa）链 C 1–548（548 aa）链 D 1–548（548 aa）链 E 1–548（548 aa）链 F 1–548（548 aa）链 G 1–548（548 aa）链 H 1–548（548 aa）链 I 1–548（548 aa）链 J 1–548（548 aa）链 K 1–548（548 aa）链 L 1–548（548 aa）链 M 1–548（548 aa）链 N 1–548（548 aa）	突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES	PO4 PHOSPHATE ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 50 MM TRIS-HCL PH 7.4, 50 MM KCL AND 10 MM MGCL2, 200 UM ATP；pH 7.4；50 MM TRIS-HCL PH 7.4, 50 MM KCL AND 10 MM MGCL2, 200 UM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；VITRIFIED WITH A VITROBOT AT 100 PERCENT HUMIDITY WITH 2-3 SECONDS BLOTTING TIME	分辨率 8.50 Å
4AAU ATP-triggered molecular mechanics of the chaperonin GroEL 提交 2011-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–548（548 aa）链 B 1–548（548 aa）链 C 1–548（548 aa）链 D 1–548（548 aa）链 E 1–548（548 aa）链 F 1–548（548 aa）链 G 1–548（548 aa）链 H 1–548（548 aa）链 I 1–548（548 aa）链 J 1–548（548 aa）链 K 1–548（548 aa）链 L 1–548（548 aa）链 M 1–548（548 aa）链 N 1–548（548 aa）	突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES	MG MAGNESIUM ION × 14 PO4 PHOSPHATE ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 50 MM TRIS-HCL PH 7.4, 50 MM KCL AND 10 MM MGCL2, 200 UM ATP；pH 7.4；50 MM TRIS-HCL PH 7.4, 50 MM KCL AND 10 MM MGCL2, 200 UM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；VITRIFIED WITH A VITROBOT AT 100 PERCENT HUMIDITY WITH 2-3 SECONDS BLOTTING TIME	分辨率 8.50 Å
4AB2 ATP-triggered molecular mechanics of the chaperonin GroEL 提交 2011-12-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–548（548 aa）链 B 1–548（548 aa）链 C 1–548（548 aa）链 D 1–548（548 aa）链 E 1–548（548 aa）链 F 1–548（548 aa）链 G 1–548（548 aa）链 H 1–548（548 aa）链 I 1–548（548 aa）链 J 1–548（548 aa）链 K 1–548（548 aa）链 L 1–548（548 aa）链 M 1–548（548 aa）链 N 1–548（548 aa）	突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 MG MAGNESIUM ION × 14 PO4 PHOSPHATE ION × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 50 MM TRIS-HCL PH 7.4, 50 MM KCL AND 10 MM MGCL2, 200 UM ATP；pH 7.4；50 MM TRIS-HCL PH 7.4, 50 MM KCL AND 10 MM MGCL2, 200 UM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；VITRIFIED WITH A VITROBOT AT 100 PERCENT HUMIDITY WITH 2-3 SECONDS BLOTTING TIME	分辨率 8.50 Å
4AB3 ATP-triggered molecular mechanics of the chaperonin GroEL 提交 2011-12-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–548（548 aa）链 B 1–548（548 aa）链 C 1–548（548 aa）链 D 1–548（548 aa）链 E 1–548（548 aa）链 F 1–548（548 aa）链 G 1–548（548 aa）链 H 1–548（548 aa）链 I 1–548（548 aa）链 J 1–548（548 aa）链 K 1–548（548 aa）链 L 1–548（548 aa）链 M 1–548（548 aa）链 N 1–548（548 aa）	突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES	PO4 PHOSPHATE ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 50 MM TRIS-HCL PH 7.4, 50 MM KCL AND 10 MM MGCL2, 200 UM ATP；pH 7.4；50 MM TRIS-HCL PH 7.4, 50 MM KCL AND 10 MM MGCL2, 200 UM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；VITRIFIED WITH A VITROBOT AT 100 PERCENT HUMIDITY WITH 2-3 SECONDS BLOTTING TIME	分辨率 8.50 Å
4V43 Structural and mechanistic basis for allostery in the bacterial chaperonin GroEL 提交 2002-01-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–547（547 aa）链 B 1–547（547 aa）链 C 1–547（547 aa）链 D 1–547（547 aa）链 E 1–547（547 aa）链 F 1–547（547 aa）链 G 1–547（547 aa）链 H 1–547（547 aa）链 I 1–547（547 aa）链 J 1–547（547 aa）链 K 1–547（547 aa）链 L 1–547（547 aa）链 M 1–547（547 aa）链 N 1–547（547 aa）	突变：D398A 突变：D398A 突变：D398A 突变：D398A 突变：D398A 突变：D398A 突变：D398A 突变：D398A 突变：D398A 突变：D398A 突变：D398A 突变：D398A 突变：D398A 突变：D398A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0	分辨率 3.52 Å R-free 0.298
4V43 Structural and mechanistic basis for allostery in the bacterial chaperonin GroEL 提交 2002-01-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 1 1–547（547 aa）链 2 1–547（547 aa）链 O 1–547（547 aa）链 P 1–547（547 aa）链 Q 1–547（547 aa）链 R 1–547（547 aa）链 S 1–547（547 aa）链 T 1–547（547 aa）链 U 1–547（547 aa）链 V 1–547（547 aa）链 W 1–547（547 aa）链 X 1–547（547 aa）链 Y 1–547（547 aa）链 Z 1–547（547 aa）	突变：D398A 突变：D398A 突变：D398A 突变：D398A 突变：D398A 突变：D398A 突变：D398A 突变：D398A 突变：D398A 突变：D398A 突变：D398A 突变：D398A 突变：D398A 突变：D398A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0	分辨率 3.52 Å R-free 0.298
4WGL Crystal structure of a GroEL D83A/R197A double mutant 提交 2014-09-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–548（548 aa）链 B 1–548（548 aa）链 C 1–548（548 aa）链 D 1–548（548 aa）链 E 1–548（548 aa）链 F 1–548（548 aa）链 G 1–548（548 aa）链 H 1–548（548 aa）链 I 1–548（548 aa）链 J 1–548（548 aa）链 K 1–548（548 aa）链 L 1–548（548 aa）链 M 1–548（548 aa）链 N 1–548（548 aa）	突变：D83A, R197A 突变：D83A, R197A 突变：D83A, R197A 突变：D83A, R197A 突变：D83A, R197A 突变：D83A, R197A 突变：D83A, R197A 突变：D83A, R197A 突变：D83A, R197A 突变：D83A, R197A 突变：D83A, R197A 突变：D83A, R197A 突变：D83A, R197A 突变：D83A, R197A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；25% PEG 3000, 0.1M acetic acid	分辨率 3.13 Å R-free 0.233
4WSC Crystal structure of a GroELK105A mutant 提交 2014-10-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–548（548 aa）链 B 1–548（548 aa）链 C 1–548（548 aa）链 D 1–548（548 aa）链 E 1–548（548 aa）链 F 1–548（548 aa）链 G 1–548（548 aa）链 H 1–548（548 aa）链 I 1–548（548 aa）链 J 1–548（548 aa）链 K 1–548（548 aa）链 L 1–548（548 aa）链 M 1–548（548 aa）链 N 1–548（548 aa）	突变：K105A 突变：K105A 突变：K105A 突变：K105A 突变：K105A 突变：K105A 突变：K105A 突变：K105A 突变：K105A 突变：K105A 突变：K105A 突变：K105A 突变：K105A 突变：K105A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG 4000, HEPES	分辨率 3.04 Å R-free 0.256
5OPW Crystal structure of the GroEL mutant A109C 提交 2017-08-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 2–548（547 aa）片段：GroEL 链 B 2–548（547 aa）片段：GroEL 链 C 2–548（547 aa）片段：GroEL 链 D 2–548（547 aa）片段：GroEL 链 E 2–548（547 aa）片段：GroEL 链 F 2–548（547 aa）片段：GroEL 链 G 2–548（547 aa）片段：GroEL 链 H 2–548（547 aa）片段：GroEL 链 I 2–548（547 aa）片段：GroEL 链 J 2–548（547 aa）片段：GroEL 链 K 2–548（547 aa）片段：GroEL 链 L 2–548（547 aa）片段：GroEL 链 M 2–548（547 aa）片段：GroEL 链 N 2–548（547 aa）片段：GroEL	突变：A109C 突变：A109C 突变：A109C 突变：A109C 突变：A109C 突变：A109C 突变：A109C 突变：A109C 突变：A109C 突变：A109C 突变：A109C 突变：A109C 突变：A109C 突变：A109C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；0.1 M sodium citrate, pH 5.5, and 15 % PEG 6000	分辨率 3.19 Å R-free 0.252
5OPX Crystal structure of the GroEL mutant A109C in complex with GroES and ADP BeF2 提交 2017-08-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric	链 A 1–548（548 aa）片段：GroEL 链 B 1–548（548 aa）片段：GroEL 链 C 1–548（548 aa）片段：GroEL 链 D 1–548（548 aa）片段：GroEL 链 E 1–548（548 aa）片段：GroEL 链 F 1–548（548 aa）片段：GroEL 链 G 1–548（548 aa）片段：GroEL 链 H 1–548（548 aa）片段：GroEL 链 I 1–548（548 aa）片段：GroEL 链 J 1–548（548 aa）片段：GroEL 链 K 1–548（548 aa）片段：GroEL 链 L 1–548（548 aa）片段：GroEL 链 M 1–548（548 aa）片段：GroEL 链 N 1–548（548 aa）片段：GroEL	突变：A109C 突变：A109C 突变：A109C 突变：A109C 突变：A109C 突变：A109C 突变：A109C 突变：A109C 突变：A109C 突变：A109C 突变：A109C 突变：A109C 突变：A109C 突变：A109C	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 MG MAGNESIUM ION × 14 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 14 K POTASSIUM ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；10 mM ATP, 3 mM BeF2, 0.1 M Tris, pH 8.0, 0.2 M NaCl and 20 % PEG 4000	分辨率 3.64 Å R-free 0.256
7PBJ Cryo-EM structure of the GroEL-GroES complex with ADP bound to both rings ("wide" conformation). 提交 2021-08-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 Ad 2–525（524 aa）链 Ae 2–525（524 aa）链 Ak 2–525（524 aa）链 Al 2–525（524 aa）链 Ar 2–525（524 aa）链 As 2–525（524 aa）链 Ay 2–525（524 aa）链 Az 2–525（524 aa）链 Bf 2–525（524 aa）链 Bg 2–525（524 aa）链 Bm 2–525（524 aa）链 Bn 2–525（524 aa）链 Bt 2–525（524 aa）链 Bu 2–525（524 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 MG MAGNESIUM ION × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7PBX Cryo-EM structure of the GroEL-GroES complex with ADP bound to both rings ("tight" conformation). 提交 2021-08-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 Ac 2–525（524 aa）链 Ad 2–525（524 aa）链 Ai 2–525（524 aa）链 Aj 2–525（524 aa）链 Ao 2–525（524 aa）链 Ap 2–525（524 aa）链 Au 2–525（524 aa）链 Av 2–525（524 aa）链 Ba 2–525（524 aa）链 Bb 2–525（524 aa）链 Bg 2–525（524 aa）链 Bh 2–525（524 aa）链 Bm 2–525（524 aa）链 Bn 2–525（524 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 MG MAGNESIUM ION × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.43 Å
7VWX CryoEM structure of football-shaped GroEL:ES2 with RuBisCO 提交 2021-11-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric	链 A 1–548（548 aa）链 B 1–548（548 aa）链 C 1–548（548 aa）链 D 1–548（548 aa）链 E 1–548（548 aa）链 F 1–548（548 aa）链 G 1–548（548 aa）链 H 1–548（548 aa）链 I 1–548（548 aa）链 J 1–548（548 aa）链 K 1–548（548 aa）链 L 1–548（548 aa）链 M 1–548（548 aa）链 N 1–548（548 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.60 Å
7XOJ Cryo-EM structure of GroEL bound to unfolded substrate (UGT1A) at 2.8 Ang. resolution (Consensus Refinement) 提交 2022-05-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 2–548（547 aa）链 B 2–548（547 aa）链 C 2–548（547 aa）链 D 2–548（547 aa）链 E 2–548（547 aa）链 F 2–548（547 aa）链 G 2–548（547 aa）链 H 2–548（547 aa）链 I 2–548（547 aa）链 J 2–548（547 aa）链 K 2–548（547 aa）链 L 2–548（547 aa）链 M 2–548（547 aa）链 N 2–548（547 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Sample containing GorEL-UGT1A was made fresh and used without undergoing any freeze-thaw cycles to avoid degradation in the solution. The sample was in a buffer solution of 150mM NaCl, 20mM Tris-HCl at pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 ul of 33 mg/ml GroEL-UGT1A was placed on Holey carbon Quanitifoil copper grids (300 mesh size R1.2/1.3) and blotted for 3 seconds (blot force =1)	分辨率 2.80 Å
7XOK Cryo-EM structure of double occupied ring (DOR) of GroEL-UGT1A complex at 2.7 Ang. resolution 提交 2022-05-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 2–548（547 aa）链 B 2–548（547 aa）链 C 2–548（547 aa）链 D 2–548（547 aa）链 E 2–548（547 aa）链 F 2–548（547 aa）链 G 2–548（547 aa）链 H 2–548（547 aa）链 I 2–548（547 aa）链 J 2–548（547 aa）链 K 2–548（547 aa）链 L 2–548（547 aa）链 M 2–548（547 aa）链 N 2–548（547 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Sample containing GorEL-UGT1A was made fresh and used without undergoing any freeze-thaw cycles to avoid degradation in the solution. The sample was in a buffer solution of 150mM NaCl, 20mM Tris-HCl at pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 ul of 33 mg/ml GroEL-UGT1A was placed on Holey carbon Quanitifoil copper grids (300 mesh size R1.2/1.3) and blotted for 3 seconds (blot force =1)	分辨率 2.70 Å
7XOL Cryo-EM structure of single empty ring 2 (SER2) of GroEL-UGT1A complex at 3.2 Ang. resolution 提交 2022-05-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 2–548（547 aa）链 B 2–548（547 aa）链 C 2–548（547 aa）链 D 2–548（547 aa）链 E 2–548（547 aa）链 F 2–548（547 aa）链 G 2–548（547 aa）链 H 2–548（547 aa）链 I 2–548（547 aa）链 J 2–548（547 aa）链 K 2–548（547 aa）链 L 2–548（547 aa）链 M 2–548（547 aa）链 N 2–548（547 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Sample containing GorEL-UGT1A was made fresh and used without undergoing any freeze-thaw cycles to avoid degradation in the solution. The sample was in a buffer solution of 150mM NaCl, 20mM Tris-HCl at pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 ul of 33 mg/ml GroEL-UGT1A was placed on Holey carbon Quanitifoil copper grids (300 mesh size R1.2/1.3) and blotted for 3 seconds (blot force =1)	分辨率 3.26 Å
7XOM Cryo-EM structure of occupied ring subunit 4 (OR4) of GroEL complexed with polyalanine model of UGT1A from GroEL-UGT1A double occupied ring complex 提交 2022-05-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 A 2–548（547 aa）链 B 2–548（547 aa）链 C 2–548（547 aa）链 D 2–548（547 aa）链 E 2–548（547 aa）链 F 2–548（547 aa）链 G 2–548（547 aa）链 H 2–548（547 aa）链 I 2–548（547 aa）链 J 2–548（547 aa）链 K 2–548（547 aa）链 L 2–548（547 aa）链 M 2–548（547 aa）链 N 2–548（547 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Sample containing GorEL-UGT1A was made fresh and used without undergoing any freeze-thaw cycles to avoid degradation in the solution. The sample was in a buffer solution of 150mM NaCl, 20mM Tris-HCl at pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 ul of 33 mg/ml GroEL-UGT1A was placed on Holey carbon Quanitifoil copper grids (300 mesh size R1.2/1.3) and blotted for 3 seconds (blot force =1)	分辨率 3.20 Å
7XON Cryo-EM structure of empty ring subunit 1 (ER1) from single empty ring of GroEL-UGT1A complex 提交 2022-05-01	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2–548（547 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Sample containing GorEL-UGT1A was made fresh and used without undergoing any freeze-thaw cycles to avoid degradation in the solution. The sample was in a buffer solution of 150mM NaCl, 20mM Tris-HCl at pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 ul of 33 mg/ml GroEL-UGT1A was placed on Holey carbon Quanitifoil copper grids (300 mesh size R1.2/1.3) and blotted for 3 seconds (blot force =1)	分辨率 3.10 Å
7XOO Cryo-EM structure of empty ring subunit 2 (ER2) from GroEL-UGT1A single empty ring complex 提交 2022-05-01	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2–548（547 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Sample containing GorEL-UGT1A was made fresh and used without undergoing any freeze-thaw cycles to avoid degradation in the solution. The sample was in a buffer solution of 150mM NaCl, 20mM Tris-HCl at pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 ul of 33 mg/ml GroEL-UGT1A was placed on Holey carbon Quanitifoil copper grids (300 mesh size R1.2/1.3) and blotted for 3 seconds (blot force =1)	分辨率 3.00 Å
7XOP Cryo-EM structure of occupied ring subunit 1 (OR1) of GroEL from GroEL-UGT1A double occupied ring complex 提交 2022-05-01	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 K 2–548（547 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Sample containing GorEL-UGT1A was made fresh and used without undergoing any freeze-thaw cycles to avoid degradation in the solution. The sample was in a buffer solution of 150mM NaCl, 20mM Tris-HCl, 150mM NaCl at pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 ul of 33 mg/ml GroEL-UGT1A was placed on Holey carbon Quanitifoil copper grids (300 mesh size R1.2/1.3) and blotted for 3 seconds (blot force =1)	分辨率 3.20 Å
7XOQ Cryo-EM structure of occupied ring subunit 2 (OR2) of GroEL from GroEL-UGT1A double occupied ring complex 提交 2022-05-01	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 K 2–548（547 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Sample containing GorEL-UGT1A was made fresh and used without undergoing any freeze-thaw cycles to avoid degradation in the solution. The sample was in a buffer solution of 150mM NaCl, 20mM Tris-HCl at pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 ul of 33 mg/ml GroEL-UGT1A was placed on Holey carbon Quanitifoil copper grids (300 mesh size R1.2/1.3) and blotted for 3 seconds (blot force =1)	分辨率 3.30 Å
7XOR Cryo-EM structure of occupied ring subunit 3 (OR3) of GroEL from GroEL-UGT1A double occupied ring complex 提交 2022-05-01	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 K 2–548（547 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Sample containing GorEL-UGT1A was made fresh and used without undergoing any freeze-thaw cycles to avoid degradation in the solution. The sample was in a buffer solution of 150mM NaCl, 20mM Tris-HCl at pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 ul of 33 mg/ml GroEL-UGT1A was placed on Holey carbon Quanitifoil copper grids (300 mesh size R1.2/1.3) and blotted for 3 seconds (blot force =1)	分辨率 3.30 Å
7XOS Cryo-EM structure of occupied ring subunit 4 (OR4) of GroEL from GroEL-UGT1A double occupied ring complex 提交 2022-05-01	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 K 2–548（547 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Sample containing GorEL-UGT1A was made fresh and used without undergoing any freeze-thaw cycles to avoid degradation in the solution. The sample was in a buffer solution of 150mM NaCl, 20mM Tris-HCl at pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 ul of 33 mg/ml GroEL-UGT1A was placed on Holey carbon Quanitifoil copper grids (300 mesh size R1.2/1.3) and blotted for 3 seconds (blot force =1)	分辨率 3.20 Å
8BA7 CryoEM structure of nucleotide-free GroEL-Rubisco. 提交 2022-10-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 2–548（547 aa）链 B 2–548（547 aa）链 C 2–548（547 aa）链 D 2–548（547 aa）链 E 2–548（547 aa）链 F 2–548（547 aa）链 G 2–548（547 aa）链 H 2–548（547 aa）链 I 2–548（547 aa）链 J 2–548（547 aa）链 K 2–548（547 aa）链 L 2–548（547 aa）链 M 2–548（547 aa）链 N 2–548（547 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The grid was prepared using a chameleon (SPT Labtech).	分辨率 4.40 Å
8BA8 CryoEM structure of GroEL-ADP.BeF3-Rubisco. 提交 2022-10-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric	链 A 1–548（548 aa）链 B 1–548（548 aa）链 C 1–548（548 aa）链 D 1–548（548 aa）链 E 1–548（548 aa）链 F 1–548（548 aa）链 G 1–548（548 aa）链 H 1–548（548 aa）链 I 1–548（548 aa）链 J 1–548（548 aa）链 K 1–548（548 aa）链 L 1–548（548 aa）链 M 1–548（548 aa）链 N 1–548（548 aa）	未记录	BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 MG MAGNESIUM ION × 14 K POTASSIUM ION × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The grid was prepared using a chameleon (SPT Labtech).	分辨率 3.40 Å
8BA9 CryoEM structure of GroEL-GroES-ADP.AlF3-Rubisco. 提交 2022-10-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 A 2–525（524 aa）链 B 2–525（524 aa）链 C 2–525（524 aa）链 D 2–525（524 aa）链 E 2–525（524 aa）链 F 2–525（524 aa）链 G 2–525（524 aa）链 H 2–525（524 aa）链 I 2–525（524 aa）链 J 2–525（524 aa）链 K 2–525（524 aa）链 L 2–525（524 aa）链 M 2–525（524 aa）链 N 2–525（524 aa）	未记录	AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 MG MAGNESIUM ION × 14 K POTASSIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The grid was prepared using a chameleon (SPT Labtech).	分辨率 3.70 Å
8BAA CryoEM structure of GroEL-GroES-ADP.AlF3-Rubisco, class II. 提交 2022-10-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 A 2–548（547 aa）链 B 2–548（547 aa）链 C 2–548（547 aa）链 D 2–548（547 aa）链 E 2–548（547 aa）链 F 2–548（547 aa）链 G 2–548（547 aa）链 H 2–548（547 aa）链 I 2–548（547 aa）链 J 2–548（547 aa）链 K 2–548（547 aa）链 L 2–548（547 aa）链 M 2–548（547 aa）链 N 2–548（547 aa）	未记录	AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 7 MG MAGNESIUM ION × 14 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 K POTASSIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The grid was prepared using a chameleon (SPT Labtech).	分辨率 4.20 Å
8BKZ GroEL:GroES-ATP complex under continuous turnover conditions 提交 2022-11-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric	链 A 1–548（548 aa）链 BA 1–548（548 aa）链 C 1–548（548 aa）链 E 1–548（548 aa）链 G 1–548（548 aa）链 I 1–548（548 aa）链 K 1–548（548 aa）链 M 1–548（548 aa）链 O 1–548（548 aa）链 Q 1–548（548 aa）链 S 1–548（548 aa）链 V 1–548（548 aa）链 X 1–548（548 aa）链 Z 1–548（548 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 14 K POTASSIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.30 Å
8BL2 Structure of GroEL-ATP complex plunge frozen 200 ms after reaction initiation 提交 2022-11-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–548（548 aa）链 B 1–548（548 aa）链 C 1–548（548 aa）链 D 1–548（548 aa）链 E 1–548（548 aa）链 F 1–548（548 aa）链 G 1–548（548 aa）链 H 1–548（548 aa）链 I 1–548（548 aa）链 J 1–548（548 aa）链 K 1–548（548 aa）链 L 1–548（548 aa）链 M 1–548（548 aa）链 N 1–548（548 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 K POTASSIUM ION × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.30 Å
8BL7 Structure of GroEL-nucleotide complex in ADP-like conformation plunged 13 ms after mixing with ATP 提交 2022-11-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–548（548 aa）链 B 1–548（548 aa）链 C 1–548（548 aa）链 D 1–548（548 aa）链 E 1–548（548 aa）链 F 1–548（548 aa）链 G 1–548（548 aa）链 H 1–548（548 aa）链 I 1–548（548 aa）链 J 1–548（548 aa）链 K 1–548（548 aa）链 L 1–548（548 aa）链 M 1–548（548 aa）链 N 1–548（548 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8BLC Structure of the GroEL-ATP complex plunge-frozen 50 ms after mixing with ATP 提交 2022-11-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–548（548 aa）链 B 1–548（548 aa）链 C 1–548（548 aa）链 D 1–548（548 aa）链 E 1–548（548 aa）链 F 1–548（548 aa）链 G 1–548（548 aa）链 H 1–548（548 aa）链 I 1–548（548 aa）链 J 1–548（548 aa）链 K 1–548（548 aa）链 L 1–548（548 aa）链 M 1–548（548 aa）链 N 1–548（548 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 K POTASSIUM ION × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8BLD Structure of the GroEL(ATP7/ADP7) complex plunged 13 ms after mixing with ATP 提交 2022-11-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–548（548 aa）链 B 1–548（548 aa）链 C 1–548（548 aa）链 D 1–548（548 aa）链 E 1–548（548 aa）链 F 1–548（548 aa）链 G 1–548（548 aa）链 H 1–548（548 aa）链 I 1–548（548 aa）链 J 1–548（548 aa）链 K 1–548（548 aa）链 L 1–548（548 aa）链 M 1–548（548 aa）链 N 1–548（548 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8BLE Structure of GroEL-nucleotide complex in ADP-like conformation plunged 50 ms after mixing with ATP 提交 2022-11-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–548（548 aa）链 B 1–548（548 aa）链 C 1–548（548 aa）链 D 1–548（548 aa）链 E 1–548（548 aa）链 F 1–548（548 aa）链 G 1–548（548 aa）链 H 1–548（548 aa）链 I 1–548（548 aa）链 J 1–548（548 aa）链 K 1–548（548 aa）链 L 1–548（548 aa）链 M 1–548（548 aa）链 N 1–548（548 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8BLF Structure of the GroEL(ATP7/ADP7) complex plunged 50 ms after mixing with ATP 提交 2022-11-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–548（548 aa）链 B 1–548（548 aa）链 C 1–548（548 aa）链 D 1–548（548 aa）链 E 1–548（548 aa）链 F 1–548（548 aa）链 G 1–548（548 aa）链 H 1–548（548 aa）链 I 1–548（548 aa）链 J 1–548（548 aa）链 K 1–548（548 aa）链 L 1–548（548 aa）链 M 1–548（548 aa）链 N 1–548（548 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8BLY Structure of the GroEL-ATP complex plunge-frozen 13 ms after mixing with ATP 提交 2022-11-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–548（548 aa）链 B 1–548（548 aa）链 C 1–548（548 aa）链 D 1–548（548 aa）链 E 1–548（548 aa）链 F 1–548（548 aa）链 G 1–548（548 aa）链 H 1–548（548 aa）链 I 1–548（548 aa）链 J 1–548（548 aa）链 K 1–548（548 aa）链 L 1–548（548 aa）链 M 1–548（548 aa）链 N 1–548（548 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8BM0 Structure of GroEL:GroES-ATP complex plunge frozen 200 ms after reaction initiation 提交 2022-11-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 A 1–548（548 aa）链 C 1–548（548 aa）链 D 1–548（548 aa）链 F 1–548（548 aa）链 G 1–548（548 aa）链 H 1–548（548 aa）链 I 1–548（548 aa）链 K 1–548（548 aa）链 L 1–548（548 aa）链 N 1–548（548 aa）链 O 1–548（548 aa）链 Q 1–548（548 aa）链 R 1–548（548 aa）链 T 1–548（548 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 14 K POTASSIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8BM1 Structure of GroEL:GroES-ATP complex under continuous turnover conditions 提交 2022-11-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 A 1–548（548 aa）链 C 1–548（548 aa）链 D 1–548（548 aa）链 F 1–548（548 aa）链 G 1–548（548 aa）链 H 1–548（548 aa）链 I 1–548（548 aa）链 K 1–548（548 aa）链 L 1–548（548 aa）链 N 1–548（548 aa）链 O 1–548（548 aa）链 Q 1–548（548 aa）链 R 1–548（548 aa）链 T 1–548（548 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 14 K POTASSIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8BMD Structure of GroEL-ATP complex under continuous turnover conditions 提交 2022-11-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–548（548 aa）链 B 1–548（548 aa）链 C 1–548（548 aa）链 D 1–548（548 aa）链 E 1–548（548 aa）链 F 1–548（548 aa）链 G 1–548（548 aa）链 H 1–548（548 aa）链 I 1–548（548 aa）链 J 1–548（548 aa）链 K 1–548（548 aa）链 L 1–548（548 aa）链 M 1–548（548 aa）链 N 1–548（548 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 K POTASSIUM ION × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8BMO Structure of GroEL:GroES complex exhibiting ADP-conformation in trans ring obtained under the continuous turnover conditions 提交 2022-11-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 A 1–548（548 aa）链 B 1–548（548 aa）链 C 1–548（548 aa）链 E 1–548（548 aa）链 F 1–548（548 aa）链 H 1–548（548 aa）链 I 1–548（548 aa）链 J 1–548（548 aa）链 L 1–548（548 aa）链 M 1–548（548 aa）链 O 1–548（548 aa）链 P 1–548（548 aa）链 R 1–548（548 aa）链 S 1–548（548 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8BMT Structure of GroEL:GroES-ATP complex plunge frozen 200 ms after reaction initiation 提交 2022-11-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric	链 A 1–548（548 aa）链 BA 1–548（548 aa）链 C 1–548（548 aa）链 E 1–548（548 aa）链 G 1–548（548 aa）链 I 1–548（548 aa）链 J 1–548（548 aa）链 L 1–548（548 aa）链 N 1–548（548 aa）链 P 1–548（548 aa）链 R 1–548（548 aa）链 T 1–548（548 aa）链 X 1–548（548 aa）链 Z 1–548（548 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 14 K POTASSIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
8P4M CryoEM structure of a C7-symmetrical GroEL7-GroES7 cage in presence of ADP-BeFx 提交 2023-05-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–548（548 aa）链 B 1–548（548 aa）链 C 1–548（548 aa）链 D 1–548（548 aa）链 E 1–548（548 aa）链 F 1–548（548 aa）链 G 1–548（548 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 7 K POTASSIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；5.9 mM n-octyl-beta-D-glucopyranoside were added before vitrification	分辨率 2.50 Å
8P4N CryoEM structure of a GroEL7-GroES7 cage with encapsulated disordered substrate MetK in the presence of ADP-BeFx 提交 2023-05-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 2–548（547 aa）链 B 2–548（547 aa）链 C 2–548（547 aa）链 D 2–548（547 aa）链 E 2–548（547 aa）链 F 2–548（547 aa）链 G 2–548（547 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 7 K POTASSIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；5.9 mM n-octyl-beta-D-glucopyranoside were added before vitrification	分辨率 2.90 Å
8P4O CryoEM structure of a GroEL7-GroES7 cage with encapsulated ordered substrate MetK in the presence of ADP-BeFx 提交 2023-05-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 A 2–548（547 aa）链 B 2–548（547 aa）链 C 2–548（547 aa）链 D 2–548（547 aa）链 E 2–548（547 aa）链 F 2–548（547 aa）链 G 2–548（547 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 7 K POTASSIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；5.9 mM n-octyl-beta-D-glucopyranoside were added before vitrification	分辨率 3.04 Å
8QXS CryoEM structure of a GroEL14-GroES7 complex in presence of ADP-BeFx with wide GroEL7 trans ring conformation 提交 2023-10-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 A 2–548（547 aa）链 B 2–548（547 aa）链 C 2–548（547 aa）链 D 2–548（547 aa）链 E 2–548（547 aa）链 F 2–548（547 aa）链 G 2–548（547 aa）链 H 2–548（547 aa）链 I 2–548（547 aa）链 J 2–548（547 aa）链 K 2–548（547 aa）链 L 2–548（547 aa）链 M 2–548（547 aa）链 N 2–548（547 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 MG MAGNESIUM ION × 14 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 7 K POTASSIUM ION × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；5.9 mM n-octyl-beta-D-glucopyranoside were added before vitrification	分辨率 3.12 Å
8QXT CryoEM structure of a GroEL14-GroES7 complex in presence of ADP-BeFx with narrow GroEL7 trans ring conformation 提交 2023-10-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 A 2–548（547 aa）链 B 2–548（547 aa）链 C 2–548（547 aa）链 D 2–548（547 aa）链 E 2–548（547 aa）链 F 2–548（547 aa）链 G 2–548（547 aa）链 H 2–548（547 aa）链 I 2–548（547 aa）链 J 2–548（547 aa）链 K 2–548（547 aa）链 L 2–548（547 aa）链 M 2–548（547 aa）链 N 2–548（547 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 MG MAGNESIUM ION × 14 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 7 K POTASSIUM ION × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；5.9 mM n-octyl-beta-D-glucopyranoside were added before vitrification	分辨率 2.90 Å
8QXU In situ structure average of GroEL14-GroES7 complexes with wide GroEL7 trans ring conformation in Escherichia coli cytosol obtained by cryo electron tomography 提交 2023-10-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 A 2–548（547 aa）链 B 2–548（547 aa）链 C 2–548（547 aa）链 D 2–548（547 aa）链 E 2–548（547 aa）链 F 2–548（547 aa）链 G 2–548（547 aa）链 H 2–548（547 aa）链 I 2–548（547 aa）链 J 2–548（547 aa）链 K 2–548（547 aa）链 L 2–548（547 aa）链 M 2–548（547 aa）链 N 2–548（547 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 14 K POTASSIUM ION × 14 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 12.00 Å
8QXV In situ structure average of GroEL14-GroES7 complexes with narrow GroEL7 trans ring conformation in Escherichia coli cytosol obtained by cryo electron tomography 提交 2023-10-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 A 2–548（547 aa）链 B 2–548（547 aa）链 C 2–548（547 aa）链 D 2–548（547 aa）链 E 2–548（547 aa）链 F 2–548（547 aa）链 G 2–548（547 aa）链 H 2–548（547 aa）链 I 2–548（547 aa）链 J 2–548（547 aa）链 K 2–548（547 aa）链 L 2–548（547 aa）链 M 2–548（547 aa）链 N 2–548（547 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 14 K POTASSIUM ION × 14 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 13.60 Å
8S32 GroEL with bound GroTAC peptide 提交 2024-02-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric	链 A 1–548（548 aa）链 B 1–548（548 aa）链 C 1–548（548 aa）链 D 1–548（548 aa）链 E 1–548（548 aa）链 F 1–548（548 aa）链 G 1–548（548 aa）链 H 1–548（548 aa）链 I 1–548（548 aa）链 J 1–548（548 aa）链 K 1–548（548 aa）链 L 1–548（548 aa）链 M 1–548（548 aa）链 N 1–548（548 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；ATP was added to the sample immediately before disposing on a grid cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.45 Å
9YKC Cryo-EM structure of GroEL-gammaATP 提交 2025-10-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 2–526（525 aa）链 B 2–526（525 aa）链 C 2–526（525 aa）链 D 2–526（525 aa）链 E 2–526（525 aa）链 F 2–526（525 aa）链 G 2–526（525 aa）链 H 2–526（525 aa）链 I 2–526（525 aa）链 J 2–526（525 aa）链 K 2–526（525 aa）链 L 2–526（525 aa）链 M 2–526（525 aa）链 N 2–526（525 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9YKE GroEL Apoenzyme 提交 2025-10-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 2–526（525 aa）链 B 2–526（525 aa）链 C 2–526（525 aa）链 D 2–526（525 aa）链 E 2–526（525 aa）链 F 2–526（525 aa）链 G 2–526（525 aa）链 H 2–526（525 aa）链 I 2–526（525 aa）链 J 2–526（525 aa）链 K 2–526（525 aa）链 L 2–526（525 aa）链 M 2–526（525 aa）链 N 2–526（525 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
9YNJ Cryo-EM structure of GroEL-ADP 提交 2025-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric	链 A 2–526（525 aa）链 B 2–526（525 aa）链 C 2–526（525 aa）链 D 2–526（525 aa）链 E 2–526（525 aa）链 F 2–526（525 aa）链 G 2–526（525 aa）链 H 2–526（525 aa）链 I 2–526（525 aa）链 J 2–526（525 aa）链 K 2–526（525 aa）链 L 2–526（525 aa）链 M 2–526（525 aa）链 N 2–526（525 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å

共 81 个其他 PDB 条目、90 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CH60_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–146； UniProt 191–336 作者链 B； PDB构建体 1–146； UniProt 191–336 作者链 C； PDB构建体 1–146； UniProt 191–336 作者链 D； PDB构建体 1–146； UniProt 191–336

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1dkd
沉积日期 deposition_date	1999-12-07
结构标题 title	CRYSTAL STRUCTURE OF A GROEL (APICAL DOMAIN) AND A DODECAMERIC PEPTIDE COMPLEX
关键词 keywords	;MOLECULAR CHAPERON, HSP60, PROTEIN FOLDING, PEPTIDE SELECTION, PHAGE DISPLAY, PEPTIDE BINDING GROOVE FORMED BY PAIRED HELICES SUBSTRATE PEPTIDE IN BETA-SHEET, CHAPERONE ;; CHAPERONE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	33.26 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	32.22 Å
零角强度 I(0) i0	65769500.00
分子量 molecular_weight	67236.0 kDa
排除体积 excluded_volume	85551 Å³
包络体积 envelope_volume	114250 Å³
水化壳体积 shell_volume	29147 Å³
包络直径 envelope_diameter	102.9 Å
壳层 Rg shell_rg	39.86 Å
包络 Rg envelope_rg	31.12 Å
形状 Rg shape_rg	32.21 Å
总 Rg total_rg	32.95 Å
总原子数 total_atoms	4722
残基数 n_residues	629
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	100.6 Å
Rg (实空间) rg_real	33.12 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.80 Å
I(0) (实空间) i0_real	6.5770e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.0510e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	33.18 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	65770000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8928
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	50.3 Å
偏度 Skewness skewness	0.023
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.813
角度范围 angular_range	— – 0.2400 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	22080000.0000
实空间数据点数 n_real_points	49
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.904; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.978; Smooth: 0.913

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	GROEL
分子量 formula_weight	15729.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	4818

EGMQFDRGYLSPYFINKPETGAVELESPFILLADKKISNIREMLPVLEAVAKAGKPLLIIAEDVEGEALATLVVNTMRGIVKVAAVKAPGFGDRRKAMLQDIATLTGGTVISEEIGMELEKATLEDLGQAKRVVINKDTTTIIDGV

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	12-MER PEPTIDE
分子量 formula_weight	1460.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F,G,H

SWMTTPWGFLHP

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	96

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d1dkda_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.8 — The 'swivelling' beta/beta/alpha domain
超家族 Superfamily superfamily	c.8.5 — GroEL apical domain-like
家族 Family family	c.8.5.1 — GroEL-like chaperone, apical domain

结构域编号 domain_id	d1dkdb_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.8 — The 'swivelling' beta/beta/alpha domain
超家族 Superfamily superfamily	c.8.5 — GroEL apical domain-like
家族 Family family	c.8.5.1 — GroEL-like chaperone, apical domain

结构域编号 domain_id	d1dkdc_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.8 — The 'swivelling' beta/beta/alpha domain
超家族 Superfamily superfamily	c.8.5 — GroEL apical domain-like
家族 Family family	c.8.5.1 — GroEL-like chaperone, apical domain

结构域编号 domain_id	d1dkdd_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.8 — The 'swivelling' beta/beta/alpha domain
超家族 Superfamily superfamily	c.8.5 — GroEL apical domain-like
家族 Family family	c.8.5.1 — GroEL-like chaperone, apical domain

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	1dkdA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology	7 — GroEL
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — GroEL

结构域编号 domain_id	1dkdB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology	7 — GroEL
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — GroEL

结构域编号 domain_id	1dkdC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology	7 — GroEL
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — GroEL

结构域编号 domain_id	1dkdD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology	7 — GroEL
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — GroEL

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	42.042 Å
晶胞边长 b length_b	134.668 Å
晶胞边长 c length_c	59.734 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	94.38 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.100 Å
最低分辨率 resolution_low	25.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2150
R_free r_free	0.2640

fit	/app/data/saxs_computation/dk/1dkd/1dkd.fit
pddf	/app/data/pr_computation/dk/1dkd/1dkd.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/dk/1dkd/1dkd.dat

CRYSTAL STRUCTURE OF A GROEL (APICAL DOMAIN) AND A DODECAMERIC PEPTIDE COMPLEX

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

GROEL

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)