1dum

NMR STRUCTURE OF [F5Y, F16W] MAGAININ 2 BOUND TO PHOSPHOLIPID VESICLES

Method: SOLUTION NMR

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MAGAININ 2

物种未注明

UniProt P11006

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MAGA_XENLA
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–23; UniProt 129–151 作者链 B; PDB构建体 1–23; UniProt 129–151

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1dum
沉积日期 deposition_date2000-01-18
结构标题 titleNMR STRUCTURE OF [F5Y, F16W] MAGAININ 2 BOUND TO PHOSPHOLIPID VESICLES
关键词 keywordsantibiotic, magainin, dimer, amphipathic helix, membrane, vesicle, bilayer, ANTIMICROBIAL PROTEIN; ANTIMICROBIAL PROTEIN
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1dum__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1dum__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1dum__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)11.69 Å
Rg(电子密度)10.14 Å
总 Rg11.91 Å
原子数724
残基数46
排除体积6452 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1dum__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 1dum__assembly_1__model_2 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 1dum__assembly_1__model_3 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 1dum__assembly_1__model_4 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 1dum__assembly_1__model_5 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 1dum__assembly_1__model_6 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 1dum__assembly_1__model_7 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 1dum__assembly_1__model_8 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 1dum__assembly_1__model_9 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 1dum__assembly_1__model_10 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1duma_
类 Class classj — Peptides
折叠类型 Fold foldj.4 — Antimicrobial helix
超家族 Superfamily superfamilyj.4.1 — Antimicrobial helix
家族 Family familyj.4.1.1 — Magainin
结构域编号 domain_idd1dumb_
类 Class classj — Peptides
折叠类型 Fold foldj.4 — Antimicrobial helix
超家族 Superfamily superfamilyj.4.1 — Antimicrobial helix
家族 Family familyj.4.1.1 — Magainin

7. 引用文献 (1)