SAXSdb — 1e1y

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

GLYCOGEN PHOSPHORYLASE, MUSCLE FORM

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	2-(2-CHLORO-PHENYL)-5,7-DIHYDROXY-8-(3-HYDROXY-1-METHYL-PIPERIDIN-4-YL)-4H-BENZOPYRAN-4-ONE × 2 PHOSPHITE ION × 2 alpha-D-glucopyranose × 2 PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 2 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PHS2_RABIT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–842； UniProt 2–843

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1e1y
沉积日期 deposition_date	2000-05-11
结构标题 title	Flavopiridol inhibits glycogen phosphorylase by binding at the inhibitor site
关键词 keywords	ALLOSTERIC INHIBITION, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1e1y__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1e1y__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1e1y__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	38.76 Å
Rg（电子密度）	38.23 Å
总 Rg	38.66 Å
原子数	13352
残基数	1626
排除体积	237430 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1e1y__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	GLYCOGEN PHOSPHORYLASE, MUSCLE FORM
分子量 formula_weight	97291.2 kDa
EC 编号 ec_number	2.4.1.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	7320

SRPLSDQEKRKQISVRGLAGVENVTELKKNFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYYFALAHTVRDHLVGRWIRTQQHYYEKDPKRIYYLSLEFYMGRTLQNTMVNLALENACDEATYQLGLDMEELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEFGIFNQKICGGWQMEEADDWLRYGNPWEKARPEFTLPVHFYGRVEHTSQGAKWVDTQVVLAMPYDTPVPGYRNNVVNTMRLWSAKAPNDFNLKDFNVGGYIQAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDIIRRFKSSKFGCRDPVRTNFDAFPDKVAIQLNDTHPSLAIPELMRVLVDLERLDWDKAWEVTVKTCAYTNHTVLPEALERWPVHLLETLLPRHLQIIYEINQRFLNRVAAAFPGDVDRLRRMSLVEEGAVKRINMAHLCIAGSHAVNGVARIHSEILKKTIFKDFYELEPHKFQNKTNGITPRRWLVLCNPGLAEIIAERIGEEYISDLDQLRKLLSYVDDEAFIRDVAKVKQENKLKFAAYLEREYKVHINPNSLFDVQVKRIHEYKRQLLNCLHVITLYNRIKKEPNKFVVPRTVMIGGKAAPGYHMAKMIIKLITAIGDVVNHDPVVGDRLRVIFLENYRVSLAEKVIPAADLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENFFIFGMRVEDVDRLDQRGYNAQEYYDRIPELRQIIEQLSSGFFSPKQPDLFKDIVNMLMHHDRFKVFADYEEYVKCQERVSALYKNPREWTRMVIRNIATSGKFSSDRTIAQYAREIWGVEPSRQRLPAPDEKIP

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	2-(2-CHLORO-PHENYL)-5,7-DIHYDROXY-8-(3-HYDROXY-1-METHYL-PIPERIDIN-4-YL)-4H-BENZOPYRAN-4-ONE
分子量 formula_weight	401.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	PHOSPHITE ION
分子量 formula_weight	79.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	alpha-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	180.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE
分子量 formula_weight	247.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	644

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d1e1ya_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.87 — UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase
超家族 Superfamily superfamily	c.87.1 — UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase
家族 Family family	c.87.1.4 — Oligosaccharide phosphorylase

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	1e1yA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2000 — Glycogen Phosphorylase B;

结构域编号 domain_id	1e1yA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2000 — Glycogen Phosphorylase B;

▶

晶胞边长 a length_a	126.759 Å
晶胞边长 b length_b	126.759 Å
晶胞边长 c length_c	116.018 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 43 21 2
空间群编号 int_tables_number	96
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.230 Å
最低分辨率 resolution_low	29.900 Å
R 因子 r_factor	0.1950
R_work r_work	0.1950
R_free r_free	0.2520

Flavopiridol inhibits glycogen phosphorylase by binding at the inhibitor site

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

GLYCOGEN PHOSPHORYLASE, MUSCLE FORM

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1e1y__assembly_1__model_1

1e1y__assembly_1__model_1 | I(q)

1e1y__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (3)

Flavopiridol inhibits glycogen phosphorylase by binding at the inhibitor site

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

GLYCOGEN PHOSPHORYLASE, MUSCLE FORM

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1e1y__assembly_1__model_1

1e1y__assembly_1__model_1 | I(q)

1e1y__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (3)