1ezs

CRYSTAL STRUCTURE OF ECOTIN MUTANT M84R, W67A, G68A, Y69A, D70A BOUND TO RAT ANIONIC TRYPSIN II

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 109.8 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ECOTIN

Escherichia coli

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 21–162 链 B； UniProt 21–162	突变：M84R, W67A, G68A, Y69A, D70A	TRYPSIN II, ANIONIC × 2 （P00763） CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；protein: 15mg/ml complex in 10mM Tris pH 8.0 well: 0.15M Sodium Cacodylate, 0.3M Sodium Acetate, 14% Peg 4K, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.30 Å R-free 0.235

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1EZS	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AZZ FIDDLER CRAB COLLAGENASE COMPLEXED TO ECOTIN 提交 1997-11-24	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 21–162（142 aa）链 D 21–162（142 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.30 Å R-free 0.238
1ECY PROTEASE INHIBITOR ECOTIN 提交 1996-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 21–162（142 aa）	未记录	GLC alpha-D-glucopyranose × 8 BGC beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.19 Å R-free 0.319
1ECZ PROTEASE INHIBITOR ECOTIN 提交 1996-08-06	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 21–162（142 aa）链 B 21–162（142 aa）	未记录	BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 21	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.68 Å R-free 0.309
1EZU ECOTIN Y69F, D70P BOUND TO D102N TRYPSIN 提交 2000-05-11	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 21–162（142 aa）链 B 21–162（142 aa）	突变：Y69F, D70P 突变：Y69F, D70P	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；295 K；protein: 15mg/ml in 10mM Tris pH 8.0 well: 16.5% Peg 4k, 0.15 M Sodium Cacodylate, 0.3M Sodium Acetate, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.40 Å R-free 0.265
1FI8 RAT GRANZYME B [N66Q] COMPLEXED TO ECOTIN [81-84 IEPD] 提交 2000-08-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 21–100（80 aa）片段：RESIDUES 28 - 111 链 D 105–162（58 aa）片段：RESIDUES 112 - 169 链 E 21–100（80 aa）片段：RESIDUES 28 - 111 链 F 105–162（58 aa）片段：RESIDUES 112 - 169	突变：V81I, S82E, T83P, M84D 突变：V81I, S82E, T83P, M84D	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；298 K；sodium acetate, PEGmme 2000, ammonium acetate,, pH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.20 Å R-free 0.252
1ID5 CRYSTAL STRUCTURE OF BOVINE THROMBIN COMPLEX WITH PROTEASE INHIBITOR ECOTIN 提交 2001-04-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 I 21–162（142 aa）	突变：M84R	CA CALCIUM ION × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；PEG6K, Citric Acid, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.264
1IFG CRYSTAL STRUCTURE OF A MONOMERIC FORM OF GENERAL PROTEASE INHIBITOR, ECOTIN IN ABSENCE OF A PROTEASE 提交 2001-04-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 26–162（137 aa）片段：RESIDUES 26-162 OF ECOTIN PRECURSOR	突变：INSERTION AFTER TRP130 THE SEQUENCE OF ALA-ASP-GLY	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；PEG 4000, glycerol, Tris, Sodium Acetate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.267
1N8O Crystal structure of a complex between bovine chymotrypsin and ecotin 提交 2002-11-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 E 21–162（142 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；293 K；Ammonium sulfate 1.3M, Sodium Acetate 0.1M, 1% PEG 200, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å
1P0S Crystal Structure of Blood Coagulation Factor Xa in Complex with Ecotin M84R 提交 2003-04-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 21–162（142 aa）片段：Ecotin	突变：M84R	MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.1；298 K；PEG 3350, sodium potassium tartrate, sodium chloride, magnesium chloride, glycerol, MPD , pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.80 Å R-free 0.234
1SLU RAT ANIONIC N143H, E151H TRYPSIN COMPLEXED TO A86H ECOTIN 提交 1996-02-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 21–162（142 aa）	突变：CHAIN A, A86H	CA CALCIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.80 Å R-free 0.285
1SLV RAT ANIONIC N143H, E151H TRYPSIN COMPLEXED TO A86H ECOTIN; COPPER-BOUND 提交 1996-02-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 21–162（142 aa）	突变：CHAIN A, A86H	CA CALCIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 2 CU COPPER (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.30 Å R-free 0.278
1SLW RAT ANIONIC N143H, E151H TRYPSIN COMPLEXED TO A86H ECOTIN; NICKEL-BOUND 提交 1996-02-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 21–162（142 aa）	突变：CHAIN A, A86H	CA CALCIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 2 NI NICKEL (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.253
1SLX RAT ANIONIC N143H, E151H TRYPSIN COMPLEXED TO A86H ECOTIN; ZINC-BOUND 提交 1996-02-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 21–162（142 aa）	突变：CHAIN A, A86H	CA CALCIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 2 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.20 Å R-free 0.267
1XX9 Crystal Structure of the FXIa Catalytic Domain in Complex with EcotinM84R 提交 2004-11-04	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 21–162（142 aa）链 D 21–162（142 aa）	突变：M84R 突变：M84R	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；PEG 1000, NaCl, Na/K phosphate, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.20 Å R-free 0.285
1XXD Crystal Structure of the FXIa Catalytic Domain in Complex with mutated Ecotin 提交 2004-11-04	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 21–162（142 aa）链 D 21–162（142 aa）	突变：P80N, V81D, S82F, M84R, M85V, A86V 突变：P80N, V81D, S82F, M84R, M85V, A86V	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293 K；PEG-MME 2000, Ammonium Sulfate, Sodium Cacodylate, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.91 Å R-free 0.282
1XXF Crystal Structure of the FXIa Catalytic Domain in Complex with Ecotin Mutant (EcotinP) 提交 2004-11-04	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 21–162（142 aa）链 D 21–162（142 aa）	突变：V81D, S82F, M84R, M85V, A86V 突变：V81D, S82F, M84R, M85V, A86V	NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；PEG-MME 2000, Ammonium Sulfate, Sodium Cacodylate, methanol, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.284
4IW4 Crystal structure of the serine protease domain of MASP-3 in complex with ecotin 提交 2013-01-23	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 21–162（142 aa）链 D 21–162（142 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.7；298 K；20% PEG2000MME, 0.2M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate pH 4.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 3.20 Å R-free 0.269
4IW4 Crystal structure of the serine protease domain of MASP-3 in complex with ecotin 提交 2013-01-23	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 21–162（142 aa）链 D 21–162（142 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.7；298 K；20% PEG2000MME, 0.2M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate pH 4.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 3.20 Å R-free 0.269
4NIY Crystal structure of trypsiligase (K60E/N143H/Y151H/D189K trypsin) complexed to YRH-ecotin (M84Y/M85R/A86H ecotin) 提交 2013-11-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 21–162（142 aa）片段：UNP residues 21-162	突变：M84Y, M85R, A86H	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.3 M sodium acetate, 0.1 M Tris/HCl, 10 mM CaCl2, 20% (w/v) polyethyleneglycol 4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.84 Å R-free 0.252
4NIY Crystal structure of trypsiligase (K60E/N143H/Y151H/D189K trypsin) complexed to YRH-ecotin (M84Y/M85R/A86H ecotin) 提交 2013-11-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 21–162（142 aa）片段：UNP residues 21-162	突变：M84Y, M85R, A86H	CA CALCIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.3 M sodium acetate, 0.1 M Tris/HCl, 10 mM CaCl2, 20% (w/v) polyethyleneglycol 4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.84 Å R-free 0.252
4NIY Crystal structure of trypsiligase (K60E/N143H/Y151H/D189K trypsin) complexed to YRH-ecotin (M84Y/M85R/A86H ecotin) 提交 2013-11-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 21–162（142 aa）片段：UNP residues 21-162	突变：M84Y, M85R, A86H	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.3 M sodium acetate, 0.1 M Tris/HCl, 10 mM CaCl2, 20% (w/v) polyethyleneglycol 4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.84 Å R-free 0.252
4NIY Crystal structure of trypsiligase (K60E/N143H/Y151H/D189K trypsin) complexed to YRH-ecotin (M84Y/M85R/A86H ecotin) 提交 2013-11-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 21–162（142 aa）片段：UNP residues 21-162	突变：M84Y, M85R, A86H	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.3 M sodium acetate, 0.1 M Tris/HCl, 10 mM CaCl2, 20% (w/v) polyethyleneglycol 4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.84 Å R-free 0.252
7CBK Structure of Human Neutrophil Elastase Ecotin complex 提交 2020-06-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–162（162 aa）链 C 1–162（162 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5 and 25% w/v Polyethylene glycol 3,350	分辨率 2.70 Å R-free 0.266
7PQN Catalytic fragment of MASP-2 in complex with ecotin 提交 2021-09-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 1–162（162 aa）链 D 1–162（162 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；17% (w/v) PEG 3350, 0.3M LiCl	分辨率 2.40 Å R-free 0.233
7PQO Catalytic fragment of MASP-1 in complex with P1 site mutant ecotin 提交 2021-09-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 K 1–162（162 aa）	突变：M84R	GOL GLYCEROL × 4 NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；3.7M NaCl, 0.1M HEPES, pH 7.0	分辨率 3.39 Å R-free 0.297
7PQO Catalytic fragment of MASP-1 in complex with P1 site mutant ecotin 提交 2021-09-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 I 1–162（162 aa）链 J 1–162（162 aa）	突变：M84R 突变：M84R	GOL GLYCEROL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；3.7M NaCl, 0.1M HEPES, pH 7.0	分辨率 3.39 Å R-free 0.297

共 21 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ECOT_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–142； UniProt 21–162 作者链 B； PDB构建体 1–142； UniProt 21–162

TRYPSIN II, ANIONIC

Rattus norvegicus

UniProt P00763

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 24–246 链 D； UniProt 24–246	突变：D102N	ECOTIN × 2 （P23827） CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；protein: 15mg/ml complex in 10mM Tris pH 8.0 well: 0.15M Sodium Cacodylate, 0.3M Sodium Acetate, 14% Peg 4K, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.30 Å R-free 0.235

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 1EZS	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AMH UNCOMPLEXED RAT TRYPSIN MUTANT WITH ASP 189 REPLACED WITH SER (D189S) 提交 1997-06-17	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–246（223 aa）链 B 24–246（223 aa）	突变：D189S 突变：D189S	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；277 K；CRYSTALLIZED AT 277 K FROM 10 MG/ML PROTEIN SOLUTION USING 22% PEG 3350, 10 MM CACL2 AND 0.15M NH4CL AS PRECIPITANT AT PH=5.6 (0.1 M SODIUM CITRATE).	分辨率 2.50 Å R-free 0.242
1ANB ANIONIC TRYPSIN MUTANT WITH SER 214 REPLACED BY GLU 提交 1994-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–246（223 aa）	突变：S214E	CA CALCIUM ION × 2 BEN BENZAMIDINE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；pH 8.0	分辨率 2.80 Å
1ANC ANIONIC TRYPSIN MUTANT WITH SER 214 REPLACED BY LYS 提交 1994-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–246（223 aa）	突变：S214K	CA CALCIUM ION × 2 BEN BENZAMIDINE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；pH 8.0	分辨率 2.20 Å
1AND ANIONIC TRYPSIN MUTANT WITH ARG 96 REPLACED BY HIS 提交 1994-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–246（223 aa）	突变：R96H	CU COPPER (II) ION × 2 BEN BENZAMIDINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；pH 8.0	分辨率 2.30 Å
1ANE ANIONIC TRYPSIN WILD TYPE 提交 1994-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–246（223 aa）	未记录	BEN BENZAMIDINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；pH 8.0	分辨率 2.20 Å
1BRA RELOCATING A NEGATIVE CHARGE IN THE BINDING POCKET OF TRYPSIN 提交 1992-12-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–246（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 BEN BENZAMIDINE × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.20 Å
1BRB CRYSTAL STRUCTURES OF RAT ANIONIC TRYPSIN COMPLEXED WITH THE PROTEIN INHIBITORS APPI AND BPTI 提交 1992-12-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 24–246（223 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.10 Å
1BRC RELOCATING A NEGATIVE CHARGE IN THE BINDING POCKET OF TRYPSIN 提交 1992-12-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 24–246（223 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å
1CO7 R117H mutant rat anionic trypsin complexed with bovine pancreatic trypsin inhibitor (BPTI) 提交 1999-06-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 2–246（245 aa）	突变：R117H	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；pH 8.5	分辨率 1.90 Å R-free 0.210
1DPO STRUCTURE OF RAT TRYPSIN 提交 1997-03-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 24–246（223 aa）	突变：S195C	CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 BEN BENZAMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；pH 8.0	分辨率 1.59 Å
1EZU ECOTIN Y69F, D70P BOUND TO D102N TRYPSIN 提交 2000-05-11	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 24–246（223 aa）链 D 24–246（223 aa）	突变：D102N 突变：D102N	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；295 K；protein: 15mg/ml in 10mM Tris pH 8.0 well: 16.5% Peg 4k, 0.15 M Sodium Cacodylate, 0.3M Sodium Acetate, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.40 Å R-free 0.265
1F5R RAT TRYPSINOGEN MUTANT COMPLEXED WITH BOVINE PANCREATIC TRYPSIN INHIBITOR 提交 2000-06-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 15–246（232 aa）	突变：DELTA-I16-V17, Q156K	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；22% PEG 3380, 300 mM Ammonium acetate, 100 mM Sodium acetate, , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 1.65 Å R-free 0.220
1F7Z RAT TRYPSINOGEN K15A COMPLEXED WITH BOVINE PANCREATIC TRYPSIN INHIBITOR 提交 2000-06-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 15–246（232 aa）	突变：K15A	CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.55 Å R-free 0.209
1FY8 CRYSTAL STRUCTURE OF THE DELTAILE16VAL17 RAT ANIONIC TRYPSINOGEN-BPTI COMPLEX 提交 2000-09-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 14–246（233 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 4000, lithium sulfate, tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.70 Å R-free 0.214
1J14 BENZAMIDINE IN COMPLEX WITH RAT TRYPSIN MUTANT X99RT 提交 2002-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 24–246（223 aa）	突变：K97E, L99Y	CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 BEN BENZAMIDINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0	分辨率 2.40 Å
1J15 BENZAMIDINE IN COMPLEX WITH RAT TRYPSIN MUTANT X99/175/190RT 提交 2002-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 24–246（223 aa）	突变：K97E, L99Y, S190A, Y172S, P173S, G174F, K175I	CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 BEN BENZAMIDINE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0	分辨率 2.00 Å
1J16 BENZAMIDINE IN COMPLEX WITH RAT TRYPSIN MUTANT X99/175/190RT 提交 2002-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 24–246（223 aa）	突变：K97E, L99Y, S190A, Y172S, P173S, G174F, K175I	CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4 BEN BENZAMIDINE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0	分辨率 1.60 Å
1J17 FACTOR XA SPECIFIC INHIBITOR IN COMPLEX WITH RAT TRYPSIN MUTANT X99/175/190RT 提交 2002-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 T 24–246（223 aa）	突变：K97E, L99Y, S190A, Y172S, P173S, G174F, K175I	CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ZEN [4-(6-CHLORO-NAPHTHALENE-2-SULFONYL)-PIPERAZIN-1-YL]- (3,4,5,6-TETRAHYDRO-2H-[1,4']BIPYRIDINYL-4-YL)- METHANONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0	分辨率 2.00 Å
1K9O CRYSTAL STRUCTURE OF MICHAELIS SERPIN-TRYPSIN COMPLEX 提交 2001-10-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 24–246（223 aa）	突变：S195A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；PEG 3350, DTT, POTASSIUM PHOSPHATE, SODIUM PHOSPHATE, 2-PROPANOL, AMMONIUM CHLORIDE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.231
1QL9 FACTOR XA SPECIFIC INHIBITOR IN COMPLEX WITH RAT TRYPSIN MUTANT X99RT 提交 1999-08-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 24–246（223 aa）	突变：YES	CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ZEN [4-(6-CHLORO-NAPHTHALENE-2-SULFONYL)-PIPERAZIN-1-YL]- (3,4,5,6-TETRAHYDRO-2H-[1,4']BIPYRIDINYL-4-YL)- METHANONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；25MM TRIS PH7, 10MM CACL2, 40% MGSO4, pH 7.00	分辨率 2.30 Å
1SLU RAT ANIONIC N143H, E151H TRYPSIN COMPLEXED TO A86H ECOTIN 提交 1996-02-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 24–246（223 aa）	突变：CHAIN B, N143H, E151H	CA CALCIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.80 Å R-free 0.285
1SLV RAT ANIONIC N143H, E151H TRYPSIN COMPLEXED TO A86H ECOTIN; COPPER-BOUND 提交 1996-02-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 24–246（223 aa）	突变：CHAIN B, N143H, E151H	CA CALCIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 2 CU COPPER (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.30 Å R-free 0.278
1SLW RAT ANIONIC N143H, E151H TRYPSIN COMPLEXED TO A86H ECOTIN; NICKEL-BOUND 提交 1996-02-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 24–246（223 aa）	突变：CHAIN B, V121I, N143H, E151H	CA CALCIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 2 NI NICKEL (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.253
1SLX RAT ANIONIC N143H, E151H TRYPSIN COMPLEXED TO A86H ECOTIN; ZINC-BOUND 提交 1996-02-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 24–246（223 aa）	突变：CHAIN B, N143H, E151H	CA CALCIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 2 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.20 Å R-free 0.267
1TRM THE THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF ASN102 MUTANT OF TRYPSIN. ROLE OF ASP102 IN SERINE PROTEASE CATALYSIS 提交 1987-10-21	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–246（223 aa）链 B 24–246（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 BEN BENZAMIDINE × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.30 Å
1YKT Trypsin/Bpti complex mutant 提交 2005-01-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–246（223 aa）	突变：S195A	CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.70 Å R-free 0.212
1YLC Trypsin/BPTI complex mutant 提交 2005-01-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–246（223 aa）	突变：S195A	CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.70 Å R-free 0.224
1YLD Trypsin/BPTI complex mutant 提交 2005-01-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–246（223 aa）	突变：S195A	CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.70 Å R-free 0.217
2TRM THE THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF ASN102 MUTANT OF TRYPSIN. ROLE OF ASP102 IN SERINE PROTEASE CATALYSIS 提交 1988-04-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 24–246（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 BEN BENZAMIDINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 THE CRYSTALS WERE GROWN AT PH 8 WHICH IS WITHIN THE PH RANGE (7 - 9) WHERE NATIVE TRYPSIN IS OPTIMALLY ACTIVE.	分辨率 2.80 Å
3FP6 Anionic trypsin in complex with bovine pancreatic trypsin inhibitor (BPTI) determined to the 1.49 A resolution limit 提交 2009-01-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 24–246（223 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；295 K；0.2M lithium sulfate, 0.1M tris, 16% (w/v) PEG 4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.49 Å R-free 0.205
3FP7 Anionic trypsin variant S195A in complex with bovine pancreatic trypsin inhibitor (BPTI) cleaved at the scissile bond (LYS15-ALA16) determined to the 1.46 A resolution limit 提交 2009-01-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 24–246（223 aa）	突变：S195A	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；295 K；0.2M lithium sulfate, 0.1M tris, 34% (w/v) PEG 4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.46 Å R-free 0.186
3FP8 Anionic trypsin variant S195A in complex with bovine pancreatic trypsin inhibitor (BPTI) determined to the 1.46 A resolution limit 提交 2009-01-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 24–246（223 aa）	突变：S195A	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；295 K；0.2M lithium sulfate, 0.1M tris, 34% (w/v) PEG 4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.46 Å R-free 0.189
3TGI WILD-TYPE RAT ANIONIC TRYPSIN COMPLEXED WITH BOVINE PANCREATIC TRYPSIN INHIBITOR (BPTI) 提交 1998-07-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 24–246（223 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；30% PEG 4000 0.2 M LISO4 0.1 M TRIS PH 8.5	分辨率 1.80 Å R-free 0.210
3TGJ S195A TRYPSINOGEN COMPLEXED WITH BOVINE PANCREATIC TRYPSIN INHIBITOR (BPTI) 提交 1998-07-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 15–246（232 aa）	突变：S195A	CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；24% PEG 4000 0.2 M LISO4 0.1 M TRIS PH 8.5	分辨率 2.20 Å R-free 0.240
3TGK TRYPSINOGEN MUTANT D194N AND DELETION OF ILE 16-VAL 17 COMPLEXED WITH BOVINE PANCREATIC TRYPSIN INHIBITOR (BPTI) 提交 1998-07-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 15–246（232 aa）	突变：DEL(I16,V17), D194N	CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；0.2 M LISO4, 0.1 M TRIS, pH 8.5	分辨率 1.70 Å R-free 0.218

共 35 个其他 PDB 条目、35 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TRY2_RAT
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–223； UniProt 24–246 作者链 D； PDB构建体 1–223； UniProt 24–246

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1ezs
沉积日期 deposition_date	2000-05-11
结构标题 title	CRYSTAL STRUCTURE OF ECOTIN MUTANT M84R, W67A, G68A, Y69A, D70A BOUND TO RAT ANIONIC TRYPSIN II
关键词 keywords	protein-protein interactions, macromolecular complex, protease inhibitor, HYDROLASE-INHIBITOR COMPLEX; HYDROLASE/INHIBITOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	32.81 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	32.56 Å
零角强度 I(0) i0	92733600.00
分子量 molecular_weight	74845.0 kDa
排除体积 excluded_volume	92905 Å³
包络体积 envelope_volume	120350 Å³
水化壳体积 shell_volume	33056 Å³
包络直径 envelope_diameter	113.8 Å
壳层 Rg shell_rg	37.07 Å
包络 Rg envelope_rg	31.75 Å
形状 Rg shape_rg	32.54 Å
总 Rg total_rg	33.01 Å
总原子数 total_atoms	5246
残基数 n_residues	696
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	109.8 Å
Rg (实空间) rg_real	33.16 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.83 Å
I(0) (实空间) i0_real	9.2730e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.5330e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	33.02 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	92720000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8374
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	29.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.503
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.423
角度范围 angular_range	— – 0.2400 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	26160000.0000
实空间数据点数 n_real_points	49
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.803; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.748; Smooth: 0.726

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ECOTIN
分子量 formula_weight	15909.3 kDa
突变 mutation	M84R, W67A, G68A, Y69A, D70A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	5332

AESVQPLEKIAPYPQAEKGMKRQVIQLTPQEDESTLKVELLIGQTLEVDCNLHRLGGKLENKTLEGAAAAYYVFDKVSSPVSTRMACPDGKKEKKFVTAYLGDAGMLRYNSKLPIVVYTPDNVDVKYRVWKAEEKIDNAVVR

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	TRYPSIN II, ANIONIC
分子量 formula_weight	23814.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.21.4
突变 mutation	D102N
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

IVGGYTCQENSVPYQVSLNSGYHFCGGSLINDQWVVSAAHCYKSRIQVRLGEHNINVLEGDEQFVNAAKIIKHPNFDRKTLNNNIMLIKLSSPVKLNARVATVALPSSCAPAGTQCLISGWGNTLSSGVNEPDLLQCLDAPLLPQADCEASYPGKITDNMVCVGFLEGGKDSCQGDSGGPVVCNGELQGIVSWGYGCALPDNPGVYTKVCNYVDWIQDTIAAN

来源 Source

来源生物 organism	Rattus norvegicus
通用名 common_name	Norway rat
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	86

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d1ezsa_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.16 — Ecotin, trypsin inhibitor
超家族 Superfamily superfamily	b.16.1 — Ecotin, trypsin inhibitor
家族 Family family	b.16.1.1 — Ecotin, trypsin inhibitor

结构域编号 domain_id	d1ezsb_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.16 — Ecotin, trypsin inhibitor
超家族 Superfamily superfamily	b.16.1 — Ecotin, trypsin inhibitor
家族 Family family	b.16.1.1 — Ecotin, trypsin inhibitor

结构域编号 domain_id	d1ezsc_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.47 — Trypsin-like serine proteases
超家族 Superfamily superfamily	b.47.1 — Trypsin-like serine proteases
家族 Family family	b.47.1.2 — Eukaryotic proteases

结构域编号 domain_id	d1ezsd_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.47 — Trypsin-like serine proteases
超家族 Superfamily superfamily	b.47.1 — Trypsin-like serine proteases
家族 Family family	b.47.1.2 — Eukaryotic proteases

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	1ezsA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	550 — Ecotin

结构域编号 domain_id	1ezsB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	550 — Ecotin

结构域编号 domain_id	1ezsC01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Trypsin-like serine proteases

结构域编号 domain_id	1ezsC02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Trypsin-like serine proteases

结构域编号 domain_id	1ezsD01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Trypsin-like serine proteases

结构域编号 domain_id	1ezsD02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Trypsin-like serine proteases

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	45.828 Å
晶胞边长 b length_b	59.682 Å
晶胞边长 c length_c	71.044 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	103.57 °
晶胞夹角 β angle_beta	93.27 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	94.62 °
晶胞分子数 Z z_pdb	2

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.300 Å
最低分辨率 resolution_low	25.000 Å
R 因子 r_factor	0.1880
R_work r_work	0.1880
R_free r_free	0.2350

fit	/app/data/saxs_computation/ez/1ezs/1ezs.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ez/1ezs/1ezs.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ez/1ezs/1ezs.dat

CRYSTAL STRUCTURE OF ECOTIN MUTANT M84R, W67A, G68A, Y69A, D70A BOUND TO RAT ANIONIC TRYPSIN II

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ECOTIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

TRYPSIN II, ANIONIC

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)