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1f3g

THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE ESCHERICHIA COLI PHOSPHOCARRIER PROTEIN III GLC

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 51.6 Å Quality: REASONABLE
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

GLUCOSE-SPECIFIC PHOSPHOCARRIER PROTEIN IIAGLC

Escherichia coli

UniProt P69783

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 8–168 未记录 无其他共同聚合物 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件 分辨率 2.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 1F3G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1F3Z IIAGLC-ZN COMPLEX 提交 1997-10-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 8–168（161 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；0.1-0.3 M SODIUM ACETATE, 1MM ZINC ACETATE, 0.1 M TRIS BUFFER PH 8.5
分辨率 1.98 Å
1GGR COMPLEX OF ENZYME IIAGLC AND THE HISTIDINE-CONTAINING PHOSPHOCARRIER PROTEIN HPR FROM ESCHERICHIA COLI NMR, RESTRAINED REGULARIZED MEAN STRUCTURE 提交 2000-09-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–168（168 aa）
未记录 PO3 PHOSPHITE ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.1；308 K；离子强度（mmCIF原始值）10 mM SODIUM PHOSPHATE
分辨率未提供
1GLA STRUCTURE OF THE REGULATORY COMPLEX OF ESCHERICHIA COLI IIIGLC WITH GLYCEROL KINASE 提交 1992-10-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.60 Å
1GLB STRUCTURE OF THE REGULATORY COMPLEX OF ESCHERICHIA COLI IIIGLC WITH GLYCEROL KINASE 提交 1992-10-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.60 Å
1GLC CATION PROMOTED ASSOCIATION (CPA) OF A REGULATORY AND TARGET PROTEIN IS CONTROLLED BY PHOSPHORYLATION 提交 1994-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 G3H GLYCERALDEHYDE-3-PHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.65 Å
1GLC CATION PROMOTED ASSOCIATION (CPA) OF A REGULATORY AND TARGET PROTEIN IS CONTROLLED BY PHOSPHORYLATION 提交 1994-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 G3H GLYCERALDEHYDE-3-PHOSPHATE × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.65 Å
1GLC CATION PROMOTED ASSOCIATION (CPA) OF A REGULATORY AND TARGET PROTEIN IS CONTROLLED BY PHOSPHORYLATION 提交 1994-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 G3H GLYCERALDEHYDE-3-PHOSPHATE × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.65 Å
1GLD CATION PROMOTED ASSOCIATION (CPA) OF A REGULATORY AND TARGET PROTEIN IS CONTROLLED BY PHOSPHORYLATION 提交 1994-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 4 G3H GLYCERALDEHYDE-3-PHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.93 Å
1GLE CATION PROMOTED ASSOCIATION (CPA) OF A REGULATORY AND TARGET PROTEIN IS CONTROLLED BY PHOSPHORYLATION 提交 1994-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 G3H GLYCERALDEHYDE-3-PHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.94 Å
1GLE CATION PROMOTED ASSOCIATION (CPA) OF A REGULATORY AND TARGET PROTEIN IS CONTROLLED BY PHOSPHORYLATION 提交 1994-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 G3H GLYCERALDEHYDE-3-PHOSPHATE × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.94 Å
1GLE CATION PROMOTED ASSOCIATION (CPA) OF A REGULATORY AND TARGET PROTEIN IS CONTROLLED BY PHOSPHORYLATION 提交 1994-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–168（168 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 G3H GLYCERALDEHYDE-3-PHOSPHATE × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.94 Å
1O2F COMPLEX OF ENZYME IIAGLC AND IIBGLC PHOSPHOCARRIER PROTEIN HPR FROM ESCHERICHIA COLI NMR, RESTRAINED REGULARIZED MEAN STRUCTURE 提交 2003-03-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–168（168 aa）
未记录 PO3 PHOSPHITE ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；308 K；离子强度（mmCIF原始值）10 mM SODIUM PHOSPHATE
分辨率未提供
2F3G IIAGLC CRYSTAL FORM III 提交 1997-10-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–168（168 aa）
链 B 1–168（168 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；30% PEG 4000, 0.2M MGCL2, 0.1M TRIS, PH 8.5 4 DEGREES
分辨率 2.13 Å
2MP0 Protein Phosphorylation upon a Fleeting Encounter 提交 2014-05-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2–169（168 aa）
未记录 PO3 PHOSPHITE ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；313.4 K
NMR样品组成 0.5 mM [U-99% 15N] N-terminal Domain of Enzyme I-1, 0.5 mM [U-99% 15N] Enzyme II of Glucose-2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1-14 mM [U-100% 1H; U-100% 12C; U-99%1 5N] N-terminal Domain of Enzyme I-3, 1-14 mM [U-99% 15N] EIN EIIAGlc-4, 1-14 mM EIN-5, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.4-1.5 mM [U-100% 2H; U-100% 12C; U-99% 15N] N-terminal Domain of Enzyme I-6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
4JBW Crystal structure of E. coli maltose transporter MalFGK2 in complex with its regulatory protein EIIAglc 提交 2013-02-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 M 1–169（169 aa）
链 N 1–169（169 aa）
未记录 PGV (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；295 K；13% PEG monomethylether 2000, 100mM Sodium cacodylate pH 5.6, 100mM Non Detergent Sulfobetaine (NDSB-256), VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.91 Å R-free 0.281
4JBW Crystal structure of E. coli maltose transporter MalFGK2 in complex with its regulatory protein EIIAglc 提交 2013-02-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 O 1–169（169 aa）
链 P 1–169（169 aa）
未记录 PGV (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；295 K；13% PEG monomethylether 2000, 100mM Sodium cacodylate pH 5.6, 100mM Non Detergent Sulfobetaine (NDSB-256), VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.91 Å R-free 0.281

共 11 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PTGA_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–161； UniProt 8–168

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1f3g

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1f3g
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1f3g
沉积日期 deposition_date1991-08-28
结构标题 titleTHREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE ESCHERICHIA COLI PHOSPHOCARRIER PROTEIN III GLC
关键词 keywordsPHOSPHOTRANSFERASE; PHOSPHOTRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier15.53 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron14.10 Å
零角强度 I(0) i04456200.00
分子量 molecular_weight15826.0 kDa
排除体积 excluded_volume20190 ų
包络体积 envelope_volume21777 ų
水化壳体积 shell_volume12993 ų
包络直径 envelope_diameter49.9 Å
壳层 Rg shell_rg20.05 Å
包络 Rg envelope_rg14.38 Å
形状 Rg shape_rg14.07 Å
总 Rg total_rg15.43 Å
总原子数 total_atoms1115
残基数 n_residues150
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax51.6 Å
Rg (实空间) rg_real15.41 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.21 Å
I(0) (实空间) i0_real4.4560e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error4.2280e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal15.43 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal4456000.0000
解质量估计 total_estimate0.7183
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary21.6 Å
偏度 Skewness skewness0.088
峰度 Kurtosis kurtosis-0.348
角度范围 angular_range— – 0.5000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha1530000.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.745; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.368; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.996
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1f3ga_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.84 — Barrel-sandwich hybrid
超家族 Superfamily superfamilyb.84.3 — Duplicated hybrid motif
家族 Family familyb.84.3.1 — Glucose permease-like

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id1f3gA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Glucose Permease (Domain IIA)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Glucose Permease (Domain IIA)
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8. 引用文献 (2)

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9. 文件与曲线 (10)