SAXSdb — 1f3v

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TUMOR NECROSIS FACTOR RECEPTOR TYPE 1 ASSOCIATED DEATH DOMAIN PROTEIN

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–179	片段：N-TERMINAL DOMAIN	TUMOR NECROSIS FACTOR RECEPTOR-ASSOCIATED PROTEIN × 1 （Q12933）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；293 K；VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.261

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1F3V	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1F2H SOLUTION STRUCTURE OF THE N-TERMINAL DOMAIN OF THE TNFR1 ASSOCIATED PROTEIN, TRADD. 提交 2000-05-24	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–169（169 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）200mM NaCl；压力 1 NMR测量条件 pH 6.6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）200mM NaCl；压力 1 NMR测量条件 pH 6.6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）200mM NaCl；压力 1 NMR样品组成 1.0 mM 15N N-TRADD \| 20mM Imidazole pH 6.6 200 mMNaCL 20 mM DTT 0.05%NaN3 90%H2O 10% D2O NMR样品组成 1.1 mM 15N/13C N-TRADD \| 20mM Imidazole pH 6.6 200 mMNaCL 20 mM DTT 0.05%NaN3 90%H2O 10% D2O NMR样品组成 0.8 mM 15N/13C N-TRADD \| 20mM Imidazole pH 6.6 200 mMNaCL 220 mM DTT 0.05%NaN3 100% D2O	分辨率未提供
5XME Solution structure of C-terminal domain of TRADD 提交 2017-05-15	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 199–312（114 aa）片段：UNP RESIDUES 199-312	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；301 K；压力 1 NMR样品组成 0.6 mM U-99% 13C; U-99% 15N;U-98% 2H TRADD DD, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
6AC0 Crystal structure of TRADD death domain GlcNAcylated by EPEC effector NleB 提交 2018-07-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 195–312（118 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；1.6 M Na/KPO4, pH 6.0	分辨率 1.45 Å R-free 0.224
7CSQ Solution structure of the complex between p75NTR-DD and TRADD-DD 提交 2020-08-16	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 199–312（114 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；301 K；压力 1 NMR样品组成 0.2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] p75 neurotrophin receptor death domain, 2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] tumor necrosis factor receptor1-associated death domain protein, 50% H2O/50% D2O \| 50% H2O/50% D2O	分辨率未提供
9VGD Helical assembly of TRADD death domain 提交 2025-06-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric	链 A 199–312（114 aa）链 B 199–312（114 aa）链 C 199–312（114 aa）链 E 199–312（114 aa）链 F 199–312（114 aa）链 H 199–312（114 aa）链 I 199–312（114 aa）链 J 199–312（114 aa）链 K 199–312（114 aa）链 M 199–312（114 aa）链 N 199–312（114 aa）链 Q 199–312（114 aa）链 R 199–312（114 aa）链 S 199–312（114 aa）链 T 199–312（114 aa）链 V 199–312（114 aa）链 W 199–312（114 aa）链 Y 199–312（114 aa）链 Z 199–312（114 aa）链 b 199–312（114 aa）链 c 199–312（114 aa）链 e 199–312（114 aa）链 f 199–312（114 aa）链 g 199–312（114 aa）链 h 199–312（114 aa）链 j 199–312（114 aa）链 k 199–312（114 aa）链 l 199–312（114 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9VIN Ternary complex of TNFR1-DD, TRADD-DD and RIPK1-DD 提交 2025-06-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric	链 E 199–312（114 aa）链 F 199–312（114 aa）链 N 199–312（114 aa）链 V 199–312（114 aa）链 W 199–312（114 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；100 mM NaCl, 20 mM Tris-HCl pH7.5, 1mM EDTA, 1mM DTT. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.41 Å

共 6 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TRADD_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–179； UniProt 1–179

TUMOR NECROSIS FACTOR RECEPTOR-ASSOCIATED PROTEIN

Homo sapiens

UniProt Q12933

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 331–501	片段：TRAF DOMAIN 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	TUMOR NECROSIS FACTOR RECEPTOR TYPE 1 ASSOCIATED DEATH DOMAIN PROTEIN × 1 （Q15628）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；293 K；VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.261

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1F3V	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1CA4 STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 (TRAF2) 提交 1999-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 B 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 C 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0	分辨率 2.20 Å R-free 0.251
1CA4 STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 (TRAF2) 提交 1999-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 E 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 F 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0	分辨率 2.20 Å R-free 0.251
1CA9 STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 IN COMPLEX WITH A PEPTIDE FROM TNF-R2 提交 1999-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 310–501（192 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 B 310–501（192 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 C 310–501（192 aa）片段：TRAF DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；pH 5.6	分辨率 2.30 Å R-free 0.289
1CA9 STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 IN COMPLEX WITH A PEPTIDE FROM TNF-R2 提交 1999-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 310–501（192 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 E 310–501（192 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 F 310–501（192 aa）片段：TRAF DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；pH 5.6	分辨率 2.30 Å R-free 0.289
1CA9 STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 IN COMPLEX WITH A PEPTIDE FROM TNF-R2 提交 1999-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 310–501（192 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 B 310–501（192 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 C 310–501（192 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 D 310–501（192 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 E 310–501（192 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 F 310–501（192 aa）片段：TRAF DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；pH 5.6	分辨率 2.30 Å R-free 0.289
1CZY CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN THE TRAF DOMAIN OF HUMAN TRAF2 AND AN LMP1 BINDING PEPTIDE 提交 1999-09-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 B 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 C 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；PEG4K, MES BUFFER, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, temperature 20K	分辨率 2.00 Å R-free 0.245
1CZZ STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 IN COMPLEX WITH A 17-RESIDUE CD40 PEPTIDE 提交 1999-09-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 315–501（187 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 B 315–501（187 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 C 315–501（187 aa）片段：TRAF DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；293 K；PEG4K, MES, PH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.70 Å R-free 0.267
1D01 STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 IN COMPLEX WITH A HUMAN CD30 PEPTIDE 提交 1999-09-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 B 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 C 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；PEG4K, MES, PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 20K	分辨率 2.00 Å R-free 0.244
1D01 STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 IN COMPLEX WITH A HUMAN CD30 PEPTIDE 提交 1999-09-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 D 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 E 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 F 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；PEG4K, MES, PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 20K	分辨率 2.00 Å R-free 0.244
1D0A STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 (TRAF2) IN COMPLEX WITH A HUMAN OX40 PEPTIDE 提交 1999-09-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 B 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 C 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；PEG4K, MES, PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.251
1D0A STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 (TRAF2) IN COMPLEX WITH A HUMAN OX40 PEPTIDE 提交 1999-09-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 D 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 E 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 F 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；PEG4K, MES, PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.251
1D0A STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 (TRAF2) IN COMPLEX WITH A HUMAN OX40 PEPTIDE 提交 1999-09-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 B 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 C 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 D 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 E 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 F 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；PEG4K, MES, PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.251
1D0A STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 (TRAF2) IN COMPLEX WITH A HUMAN OX40 PEPTIDE 提交 1999-09-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 B 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 C 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 D 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 E 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 F 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；PEG4K, MES, PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.251
1D0J STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 IN COMPLEX WITH A M4-1BB PEPTIDE 提交 1999-09-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 B 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 C 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；PEG4K, MES PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.270
1D0J STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 IN COMPLEX WITH A M4-1BB PEPTIDE 提交 1999-09-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 D 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 E 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 F 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；PEG4K, MES PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.270
1D0J STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 IN COMPLEX WITH A M4-1BB PEPTIDE 提交 1999-09-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 A 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 B 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 C 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 D 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 E 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 F 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；PEG4K, MES PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.270
1D0J STRUCTURE OF TNF RECEPTOR ASSOCIATED FACTOR 2 IN COMPLEX WITH A M4-1BB PEPTIDE 提交 1999-09-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 A 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 B 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 C 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 D 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 E 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 F 334–501（168 aa）片段：TRAF DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；PEG4K, MES PH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.270
1QSC CRYSTAL STRUCTURE OF THE TRAF DOMAIN OF TRAF2 IN A COMPLEX WITH A PEPTIDE FROM THE CD40 RECEPTOR 提交 1999-06-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 311–501（191 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 B 311–501（191 aa）片段：TRAF DOMAIN 链 C 311–501（191 aa）片段：TRAF DOMAIN	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；MME-PEG 2000, MAGNESIUM CHLORIDE, BISTRIS PROPANE, pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.00K	分辨率 2.40 Å R-free 0.257
3KNV Crystal structure of the RING and first zinc finger domains of TRAF2 提交 2009-11-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–133（133 aa）片段：RING and the first zinc finger domains: UNP residues 1-133	未记录	ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 8000, 0.1 M HEPES pH 7.5, 8% Ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.239
3M06 Crystal Structure of TRAF2 提交 2010-03-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 266–329（64 aa）片段：Residues 266-329 链 B 266–329（64 aa）片段：Residues 266-329 链 C 266–329（64 aa）片段：Residues 266-329	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；8% PEG3350, 6% Tacsimate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.67 Å R-free 0.233
3M06 Crystal Structure of TRAF2 提交 2010-03-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 266–329（64 aa）片段：Residues 266-329 链 E 266–329（64 aa）片段：Residues 266-329 链 F 266–329（64 aa）片段：Residues 266-329	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；8% PEG3350, 6% Tacsimate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.67 Å R-free 0.233
3M0A Crystal structure of TRAF2:cIAP2 complex 提交 2010-03-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 266–329（64 aa）片段：Residues 266-329 链 B 266–329（64 aa）片段：Residues 266-329 链 C 266–329（64 aa）片段：Residues 266-329	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；8% PEG 3350, 6% Tacsimate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.61 Å R-free 0.268
3M0D Crystal structure of the TRAF1:TRAF2:cIAP2 complex 提交 2010-03-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 266–329（64 aa）片段：Residues 266-329 链 B 266–329（64 aa）片段：Residues 266-329	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；0.15M AmSO4, 0.1M MES, 15% PEG 4000, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.80 Å R-free 0.247
3M0D Crystal structure of the TRAF1:TRAF2:cIAP2 complex 提交 2010-03-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 266–329（64 aa）片段：Residues 266-329 链 B 266–329（64 aa）片段：Residues 266-329	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；0.15M AmSO4, 0.1M MES, 15% PEG 4000, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.80 Å R-free 0.247
8T5Q SARS-CoV-2 ORF3a peptide in complex with TRAF2 TRAF domain 提交 2023-06-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 315–501（187 aa）片段：TRAF domain (UNP residues 315-501) 链 B 315–501（187 aa）片段：TRAF domain (UNP residues 315-501) 链 C 315–501（187 aa）片段：TRAF domain (UNP residues 315-501)	未记录	PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；277.15 K；0.1 M sodium citrate, pH 5.0, 20% w/v PEG8000	分辨率 1.90 Å R-free 0.240
8T5Q SARS-CoV-2 ORF3a peptide in complex with TRAF2 TRAF domain 提交 2023-06-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 315–501（187 aa）片段：TRAF domain (UNP residues 315-501) 链 E 315–501（187 aa）片段：TRAF domain (UNP residues 315-501) 链 F 315–501（187 aa）片段：TRAF domain (UNP residues 315-501)	未记录	PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；277.15 K；0.1 M sodium citrate, pH 5.0, 20% w/v PEG8000	分辨率 1.90 Å R-free 0.240

共 13 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TRAF2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–171； UniProt 331–501

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1f3v
沉积日期 deposition_date	2000-06-06
结构标题 title	Crystal structure of the complex between the N-terminal domain of TRADD and the TRAF domain of TRAF2
关键词 keywords	a-b sandwich, APOPTOSIS; APOPTOSIS
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	22.16 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	21.08 Å
零角强度 I(0) i0	23801300.00
分子量 molecular_weight	36474.0 kDa
排除体积 excluded_volume	45310 Å³
包络体积 envelope_volume	54914 Å³
水化壳体积 shell_volume	21944 Å³
包络直径 envelope_diameter	81.0 Å
壳层 Rg shell_rg	27.41 Å
包络 Rg envelope_rg	21.44 Å
形状 Rg shape_rg	21.04 Å
总 Rg total_rg	22.05 Å
总原子数 total_atoms	2541
残基数 n_residues	322
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	75.3 Å
Rg (实空间) rg_real	22.11 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.62 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.3800e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.4780e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	22.12 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	23800000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7917
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	66.3 Å
偏度 Skewness skewness	0.329
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.135
角度范围 angular_range	— – 0.3600 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	3592000.0000
实空间数据点数 n_real_points	68
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.769; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.983; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	TUMOR NECROSIS FACTOR RECEPTOR TYPE 1 ASSOCIATED DEATH DOMAIN PROTEIN
分子量 formula_weight	19413.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2749

MAAGQNGHEEWVGSAYLFVESSLDKVVLSDAYAHPQQKVAVYRALQAALAESGGSPDVLQMLKIHRSDPQLIVQLRFCGRQPCGRFLRAYREGALRAALQRSLAAALAQHSVPLQLELRAGAERLDALLADEERCLSCILAQQPDRLRDEELAELEDALRNLKCGSGARGGDGEVASAP

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	TUMOR NECROSIS FACTOR RECEPTOR-ASSOCIATED PROTEIN
分子量 formula_weight	19718.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

KDLAMADLEQKVLEMEASTYDGVFIWKISDFPRKRQEAVAGRIPAIFSPAFYTSRYGYKMCLRIYLNGDGTGRGTHLSLFFVVMKGPNDALLRWPFNQKVTLMLLDQNNREHVIDAFRPDVTSSSFQRPVNDMNIASGCPLFCPVSKMEAKNSYVRDDAIFIKAIVDLTGL

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	208

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_id	d1f3va_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.22 — TRADD, N-terminal domain
家族 Family family	d.58.22.1 — TRADD, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d1f3vb1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.8 — TRAF domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.8.1 — TRAF domain-like
家族 Family family	b.8.1.1 — MATH domain

结构域编号 domain_id	d1f3vb2
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.1 — Parallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.1.2 — Trimerization domain of TRAF
家族 Family family	h.1.2.1 — Trimerization domain of TRAF

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	1f3vA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	680 — TRADD, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	1f3vB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	210 — Apoptosis, Tumor Necrosis Factor Receptor Associated Protein 2; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Apoptosis, Tumor Necrosis Factor Receptor Associated Protein 2; Chain A

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	132.400 Å
晶胞边长 b length_b	132.400 Å
晶胞边长 c length_c	62.800 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	9

空间群 space_group	H 3
空间群编号 int_tables_number	146
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.000 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2290
R_free r_free	0.2610

fit	/app/data/saxs_computation/f3/1f3v/1f3v.fit
pddf	/app/data/pr_computation/f3/1f3v/1f3v.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/f3/1f3v/1f3v.dat

Crystal structure of the complex between the N-terminal domain of TRADD and the TRAF domain of TRAF2

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TUMOR NECROSIS FACTOR RECEPTOR TYPE 1 ASSOCIATED DEATH DOMAIN PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

TUMOR NECROSIS FACTOR RECEPTOR-ASSOCIATED PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)