RETINOIC ACID RECEPTOR RXR-ALPHA
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 225–462 | 片段:LIGAND BINDING DOMAIN - RESIDUES 225 - 462 | PEROXISOME PROLIFERATOR ACTIVATED RECEPTOR GAMMA × 1 (P37231) STEROID RECEPTOR COACTIVATOR × 2 (O43793) 9CR (9cis)-retinoic acid × 1 570 2-(2-BENZOYL-PHENYLAMINO)-3-{4-[2-(5-METHYL-2-PHENYL-OXAZOL-4-YL)-ETHOXY]-PHENYL}-PROPIONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;295 K;17% PEG 4K, 200mM NaSCN, 8% Ethylene Glycol , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 22K | 分辨率 2.10 Å R-free 0.268 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 1FM9 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BY4 STRUCTURE AND MECHANISM OF THE HOMODIMERIC ASSEMBLY OF THE RXR ON DNA 提交 1998-10-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 A
128–209(82 aa)
链 B
128–209(82 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;25 MM TRIS BUFFER (PH 7.5),20% PEG3350, 5 MM MGCL2, 400MM NH4CL
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.284 |
| 1BY4 STRUCTURE AND MECHANISM OF THE HOMODIMERIC ASSEMBLY OF THE RXR ON DNA 提交 1998-10-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 C
128–209(82 aa)
链 D
128–209(82 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;25 MM TRIS BUFFER (PH 7.5),20% PEG3350, 5 MM MGCL2, 400MM NH4CL
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.284 |
| 1DSZ STRUCTURE OF THE RXR/RAR DNA-BINDING DOMAIN HETERODIMER IN COMPLEX WITH THE RETINOIC ACID RESPONSE ELEMENT DR1 提交 2000-01-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 B
129–212(84 aa)
片段:RESIDUES 129-212
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;281 K;18-23% PEG 3350, 25 mM Tris buffer, 5 mM MgCl2, 0.4 M NH4CL,
RXR and RAR proteins each at 0.45 mM, DNA duplex at 0.45 mM, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.267 |
| 1FBY CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN RXR ALPHA LIGAND BINDING DOMAIN BOUND TO 9-CIS RETINOIC ACID 提交 2000-07-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
224–462(239 aa)
片段:LIGAND BINDING DOMAIN
链 B
224–462(239 aa)
片段:LIGAND BINDING DOMAIN
|
未记录 | 9CR (9cis)-retinoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOUR DIFFUSION, HANGING DROP and SITTING DROP with SEEDING;pH 7;295 K;Sodium Formate,
Propane 1,2 Diol,
Glycerol,
Tris, pH 7, VAPOUR DIFFUSION, HANGING DROP and SITTING DROP with SEEDING, temperature 295K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.263 |
| 1FM6 THE 2.1 ANGSTROM RESOLUTION CRYSTAL STRUCTURE OF THE HETERODIMER OF THE HUMAN RXRALPHA AND PPARGAMMA LIGAND BINDING DOMAINS RESPECTIVELY BOUND WITH 9-CIS RETINOIC ACID AND ROSIGLITAZONE AND CO-ACTIVATOR PEPTIDES. 提交 2000-08-16 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
225–462(238 aa)
片段:LIGAND BINDING DOMAIN - RESIDUES 225 -462
|
未记录 | 9CR (9cis)-retinoic acid × 1 BRL 2,4-THIAZOLIDIINEDIONE, 5-[[4-[2-(METHYL-2-PYRIDINYLAMINO)ETHOXY]PHENYL]METHYL]-(9CL) × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;295 K;17% PEG 4K, 200mM NaSCN, 8% Ethylene Glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.292 |
| 1FM6 THE 2.1 ANGSTROM RESOLUTION CRYSTAL STRUCTURE OF THE HETERODIMER OF THE HUMAN RXRALPHA AND PPARGAMMA LIGAND BINDING DOMAINS RESPECTIVELY BOUND WITH 9-CIS RETINOIC ACID AND ROSIGLITAZONE AND CO-ACTIVATOR PEPTIDES. 提交 2000-08-16 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 U
225–462(238 aa)
片段:LIGAND BINDING DOMAIN - RESIDUES 225 -462
|
未记录 | 9CR (9cis)-retinoic acid × 1 BRL 2,4-THIAZOLIDIINEDIONE, 5-[[4-[2-(METHYL-2-PYRIDINYLAMINO)ETHOXY]PHENYL]METHYL]-(9CL) × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;295 K;17% PEG 4K, 200mM NaSCN, 8% Ethylene Glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.292 |
| 1G1U THE 2.5 ANGSTROM RESOLUTION CRYSTAL STRUCTURE OF THE RXRALPHA LIGAND BINDING DOMAIN IN TETRAMER IN THE ABSENCE OF LIGAND 提交 2000-10-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
225–462(238 aa)
片段:LIGAND BINDING DOMAIN (RESIDUES 225 - 462)
链 B
225–462(238 aa)
片段:LIGAND BINDING DOMAIN (RESIDUES 225 - 462)
链 C
225–462(238 aa)
片段:LIGAND BINDING DOMAIN (RESIDUES 225 - 462)
链 D
225–462(238 aa)
片段:LIGAND BINDING DOMAIN (RESIDUES 225 - 462)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;295 K;20mM HEPES pH 7.5,
1.5M LiSO4,
10mM DTT
, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.271 |
| 1G5Y THE 2.0 ANGSTROM RESOLUTION CRYSTAL STRUCTURE OF THE RXRALPHA LIGAND BINDING DOMAIN TETRAMER IN THE PRESENCE OF A NON-ACTIVATING RETINOIC ACID ISOMER. 提交 2000-11-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
225–462(238 aa)
片段:LIGAND BINDING DOMAIN (RESIDUES 225 - 462)
链 B
225–462(238 aa)
片段:LIGAND BINDING DOMAIN (RESIDUES 225 - 462)
链 C
225–462(238 aa)
片段:LIGAND BINDING DOMAIN (RESIDUES 225 - 462)
链 D
225–462(238 aa)
片段:LIGAND BINDING DOMAIN (RESIDUES 225 - 462)
|
未记录 | REA RETINOIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;295 K;20mM HEPES pH 7.5, 1.5M LiSO4, 10mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.254 |
| 1K74 The 2.3 Angstrom resolution crystal structure of the heterodimer of the human PPARgamma and RXRalpha ligand binding domains respectively bound with GW409544 and 9-cis retinoic acid and co-activator peptides. 提交 2001-10-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
225–462(238 aa)
片段:ligand binding domain - residues 225 - 462
|
未记录 | 9CR (9cis)-retinoic acid × 1 544 2-(1-METHYL-3-OXO-3-PHENYL-PROPYLAMINO)-3-{4-[2-(5-METHYL-2-PHENYL-OXAZOL-4-YL)-ETHOXY]-PHENYL}-PROPIONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;295 K;PEG4K, NaSCN, Ethylene Glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.279 |
| 1MV9 Crystal Structure of the human RXR alpha ligand binding domain bound to the eicosanoid DHA (Docosa Hexaenoic Acid) and a coactivator peptide 提交 2002-09-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
223–462(240 aa)
片段:ligand binding domain(residues 223-462)
|
未记录 | HXA DOCOSA-4,7,10,13,16,19-HEXAENOIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;PEG 4000, glycerol, NaCl, Pipes or BisTris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.249 |
| 1MVC Crystal structure of the human RXR alpha ligand binding domain bound to the synthetic agonist compound BMS 649 and a coactivator peptide 提交 2002-09-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
223–462(240 aa)
片段:ligand binding domain(residues 223-462)
|
未记录 | BM6 4-[2-(5,5,8,8-TETRAMETHYL-5,6,7,8-TETRAHYDRO-NAPHTHALEN-2-YL)-[1,3]DIOXOLAN-2-YL]-BENZOIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;PEG 4000, NaCl, Glycerol, BisTris, Pipes, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.228 |
| 1MZN CRYSTAL STRUCTURE at 1.9 ANGSTROEMS RESOLUTION OF THE HOMODIMER OF HUMAN RXR ALPHA LIGAND BINDING DOMAIN BOUND TO THE SYNTHETIC AGONIST COMPOUND BMS 649 AND A COACTIVATOR PEPTIDE 提交 2002-10-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
223–462(240 aa)
片段:ligand binding domain(residues 223-462)
链 C
223–462(240 aa)
片段:ligand binding domain(residues 223-462)
|
未记录 | BM6 4-[2-(5,5,8,8-TETRAMETHYL-5,6,7,8-TETRAHYDRO-NAPHTHALEN-2-YL)-[1,3]DIOXOLAN-2-YL]-BENZOIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;PEG 4000, NaCl, Pipes, BisTris, glycerol, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.232 |
| 1MZN CRYSTAL STRUCTURE at 1.9 ANGSTROEMS RESOLUTION OF THE HOMODIMER OF HUMAN RXR ALPHA LIGAND BINDING DOMAIN BOUND TO THE SYNTHETIC AGONIST COMPOUND BMS 649 AND A COACTIVATOR PEPTIDE 提交 2002-10-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 E
223–462(240 aa)
片段:ligand binding domain(residues 223-462)
链 G
223–462(240 aa)
片段:ligand binding domain(residues 223-462)
|
未记录 | BM6 4-[2-(5,5,8,8-TETRAMETHYL-5,6,7,8-TETRAHYDRO-NAPHTHALEN-2-YL)-[1,3]DIOXOLAN-2-YL]-BENZOIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;PEG 4000, NaCl, Pipes, BisTris, glycerol, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.232 |
| 1R0N Crystal Structure of Heterodimeric Ecdsyone receptor DNA binding complex 提交 2003-09-22 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 A
130–206(77 aa)
片段:Retinoid X Receptor DNA binding domain
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.6;282 K;PEG 3350, Lithium Sulfate, Magnesium Sulfate, DTT, Magnesium Chloride, MES, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 282K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.292 |
| 1RDT Crystal Structure of a new rexinoid bound to the RXRalpha ligand binding doamin in the RXRalpha/PPARgamma heterodimer 提交 2003-11-06 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
225–462(238 aa)
片段:ligand binding doamin
|
未记录 | L79 (S)-(2E)-3[4-(5,5,8,8-TETRAMETHYL-5,6,7,8-TETRAHYDRO-2-NAPHTHALENYL)TETRAHYDRO-1-BENZOFURAN-2-YL]-2-PROPENOIC ACID × 1 570 2-(2-BENZOYL-PHENYLAMINO)-3-{4-[2-(5-METHYL-2-PHENYL-OXAZOL-4-YL)-ETHOXY]-PHENYL}-PROPIONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;295 K;17% PEG 4K, 200mM NaSCN, 8% ethylene glycol, 8% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K, pH 7.50
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.259 |
| 1RXR HIGH RESOLUTION SOLUTION STRUCTURE OF THE RETINOID X RECEPTOR DNA BINDING DOMAIN, NMR, 20 STRUCTURE 提交 1998-06-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
130–212(83 aa)
片段:DNA-BINDING DOMAIN, 130-212
|
突变:C195A | ZN ZINC ION × 2 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.6;300 K;离子强度(mmCIF原始值)120;压力 AMBIENT
NMR样品组成
WATER
|
分辨率未提供 |
| 1XLS Crystal structure of the mouse CAR/RXR LBD heterodimer bound to TCPOBOP and 9cRA and a TIF2 peptide containg the third LXXLL motifs 提交 2004-09-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
227–458(232 aa)
片段:CAR LBD
|
突变:residues 116-238 | 9CR (9cis)-retinoic acid × 1 TCD 3,5-DICHLORO-2-{4-[(3,5-DICHLOROPYRIDIN-2-YL)OXY]PHENOXY}PYRIDINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;295 K;10% PEG2K, 3% 1,6 hexanediol, 0.1 M di-ammonium tartrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.96 Å R-free 0.303 |
| 1XLS Crystal structure of the mouse CAR/RXR LBD heterodimer bound to TCPOBOP and 9cRA and a TIF2 peptide containg the third LXXLL motifs 提交 2004-09-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 B
227–458(232 aa)
片段:CAR LBD
|
突变:residues 116-238 | 9CR (9cis)-retinoic acid × 1 TCD 3,5-DICHLORO-2-{4-[(3,5-DICHLOROPYRIDIN-2-YL)OXY]PHENOXY}PYRIDINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;295 K;10% PEG2K, 3% 1,6 hexanediol, 0.1 M di-ammonium tartrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.96 Å R-free 0.303 |
| 1XLS Crystal structure of the mouse CAR/RXR LBD heterodimer bound to TCPOBOP and 9cRA and a TIF2 peptide containg the third LXXLL motifs 提交 2004-09-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 C
227–458(232 aa)
片段:CAR LBD
|
突变:residues 116-238 | 9CR (9cis)-retinoic acid × 1 TCD 3,5-DICHLORO-2-{4-[(3,5-DICHLOROPYRIDIN-2-YL)OXY]PHENOXY}PYRIDINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;295 K;10% PEG2K, 3% 1,6 hexanediol, 0.1 M di-ammonium tartrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.96 Å R-free 0.303 |
| 1XLS Crystal structure of the mouse CAR/RXR LBD heterodimer bound to TCPOBOP and 9cRA and a TIF2 peptide containg the third LXXLL motifs 提交 2004-09-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 D
227–458(232 aa)
片段:CAR LBD
|
突变:residues 116-238 | 9CR (9cis)-retinoic acid × 1 TCD 3,5-DICHLORO-2-{4-[(3,5-DICHLOROPYRIDIN-2-YL)OXY]PHENOXY}PYRIDINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;295 K;10% PEG2K, 3% 1,6 hexanediol, 0.1 M di-ammonium tartrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.96 Å R-free 0.303 |
| 1XLS Crystal structure of the mouse CAR/RXR LBD heterodimer bound to TCPOBOP and 9cRA and a TIF2 peptide containg the third LXXLL motifs 提交 2004-09-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric |
链 A
227–458(232 aa)
片段:CAR LBD
链 B
227–458(232 aa)
片段:CAR LBD
链 C
227–458(232 aa)
片段:CAR LBD
链 D
227–458(232 aa)
片段:CAR LBD
|
突变:residues 116-238 突变:residues 116-238 突变:residues 116-238 突变:residues 116-238 | 9CR (9cis)-retinoic acid × 4 TCD 3,5-DICHLORO-2-{4-[(3,5-DICHLOROPYRIDIN-2-YL)OXY]PHENOXY}PYRIDINE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;295 K;10% PEG2K, 3% 1,6 hexanediol, 0.1 M di-ammonium tartrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.96 Å R-free 0.303 |
| 1XLS Crystal structure of the mouse CAR/RXR LBD heterodimer bound to TCPOBOP and 9cRA and a TIF2 peptide containg the third LXXLL motifs 提交 2004-09-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
227–458(232 aa)
片段:CAR LBD
链 C
227–458(232 aa)
片段:CAR LBD
|
突变:residues 116-238 突变:residues 116-238 | 9CR (9cis)-retinoic acid × 2 TCD 3,5-DICHLORO-2-{4-[(3,5-DICHLOROPYRIDIN-2-YL)OXY]PHENOXY}PYRIDINE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;295 K;10% PEG2K, 3% 1,6 hexanediol, 0.1 M di-ammonium tartrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.96 Å R-free 0.303 |
| 1XLS Crystal structure of the mouse CAR/RXR LBD heterodimer bound to TCPOBOP and 9cRA and a TIF2 peptide containg the third LXXLL motifs 提交 2004-09-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 B
227–458(232 aa)
片段:CAR LBD
链 D
227–458(232 aa)
片段:CAR LBD
|
突变:residues 116-238 突变:residues 116-238 | 9CR (9cis)-retinoic acid × 2 TCD 3,5-DICHLORO-2-{4-[(3,5-DICHLOROPYRIDIN-2-YL)OXY]PHENOXY}PYRIDINE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;295 K;10% PEG2K, 3% 1,6 hexanediol, 0.1 M di-ammonium tartrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.96 Å R-free 0.303 |
| 1XV9 crystal structure of CAR/RXR heterodimer bound with SRC1 peptide, fatty acid, and 5b-pregnane-3,20-dione. 提交 2004-10-27 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
227–462(236 aa)
片段:LBD domain
|
未记录 | F15 PENTADECANOIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.9;298 K;potassium sodium phosphate, pH 4.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.239 |
| 1XV9 crystal structure of CAR/RXR heterodimer bound with SRC1 peptide, fatty acid, and 5b-pregnane-3,20-dione. 提交 2004-10-27 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 C
227–462(236 aa)
片段:LBD domain
|
未记录 | F15 PENTADECANOIC ACID × 1 CI2 (5BETA)-PREGNANE-3,20-DIONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.9;298 K;potassium sodium phosphate, pH 4.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.239 |
| 1XVP crystal structure of CAR/RXR heterodimer bound with SRC1 peptide, fatty acid and CITCO 提交 2004-10-28 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
227–462(236 aa)
片段:LBD domain
|
未记录 | F15 PENTADECANOIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;277 K;Lisium sulphate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.234 |
| 1XVP crystal structure of CAR/RXR heterodimer bound with SRC1 peptide, fatty acid and CITCO 提交 2004-10-28 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 C
227–462(236 aa)
片段:LBD domain
|
未记录 | F15 PENTADECANOIC ACID × 1 CID 6-(4-CHLOROPHENYL)IMIDAZO[2,1-B][1,3]THIAZOLE-5-CARBALDEHYDE O-(3,4-DICHLOROBENZYL)OXIME × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;277 K;Lisium sulphate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.234 |
| 1XVP crystal structure of CAR/RXR heterodimer bound with SRC1 peptide, fatty acid and CITCO 提交 2004-10-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
227–462(236 aa)
片段:LBD domain
链 C
227–462(236 aa)
片段:LBD domain
|
未记录 | F15 PENTADECANOIC ACID × 2 CID 6-(4-CHLOROPHENYL)IMIDAZO[2,1-B][1,3]THIAZOLE-5-CARBALDEHYDE O-(3,4-DICHLOROBENZYL)OXIME × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;277 K;Lisium sulphate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.234 |
| 1XVP crystal structure of CAR/RXR heterodimer bound with SRC1 peptide, fatty acid and CITCO 提交 2004-10-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
227–462(236 aa)
片段:LBD domain
链 C
227–462(236 aa)
片段:LBD domain
|
未记录 | F15 PENTADECANOIC ACID × 2 CID 6-(4-CHLOROPHENYL)IMIDAZO[2,1-B][1,3]THIAZOLE-5-CARBALDEHYDE O-(3,4-DICHLOROBENZYL)OXIME × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;277 K;Lisium sulphate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.234 |
| 1XVP crystal structure of CAR/RXR heterodimer bound with SRC1 peptide, fatty acid and CITCO 提交 2004-10-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
227–462(236 aa)
片段:LBD domain
链 C
227–462(236 aa)
片段:LBD domain
|
未记录 | F15 PENTADECANOIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;277 K;Lisium sulphate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.234 |
| 1YNW Crystal Structure of Vitamin D Receptor and 9-cis Retinoic Acid Receptor DNA-Binding Domains Bound to a DR3 Response Element 提交 2005-01-25 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 B
130–228(99 aa)
片段:DNA-binding Domain (Residues 130-228)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;291 K;PEG 8000, ammonium citrate, Tris, glycerol, DTT, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.283 |
| 2ACL Liver X-Receptor alpha Ligand Binding Domain with SB313987 提交 2005-07-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
225–462(238 aa)
|
未记录 | REA RETINOIC ACID × 1 L05 1-BENZYL-3-(4-METHOXYPHENYLAMINO)-4-PHENYLPYRROLE-2,5-DIONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;PEG3350, Ammonium Acetate, BisTris, Dtt, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.280 |
| 2ACL Liver X-Receptor alpha Ligand Binding Domain with SB313987 提交 2005-07-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
225–462(238 aa)
|
未记录 | REA RETINOIC ACID × 1 L05 1-BENZYL-3-(4-METHOXYPHENYLAMINO)-4-PHENYLPYRROLE-2,5-DIONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;PEG3350, Ammonium Acetate, BisTris, Dtt, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.280 |
| 2ACL Liver X-Receptor alpha Ligand Binding Domain with SB313987 提交 2005-07-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
225–462(238 aa)
|
未记录 | REA RETINOIC ACID × 1 L05 1-BENZYL-3-(4-METHOXYPHENYLAMINO)-4-PHENYLPYRROLE-2,5-DIONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;PEG3350, Ammonium Acetate, BisTris, Dtt, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.280 |
| 2ACL Liver X-Receptor alpha Ligand Binding Domain with SB313987 提交 2005-07-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 G
225–462(238 aa)
|
未记录 | REA RETINOIC ACID × 1 L05 1-BENZYL-3-(4-METHOXYPHENYLAMINO)-4-PHENYLPYRROLE-2,5-DIONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;PEG3350, Ammonium Acetate, BisTris, Dtt, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.280 |
| 2ACL Liver X-Receptor alpha Ligand Binding Domain with SB313987 提交 2005-07-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 C
225–462(238 aa)
链 G
225–462(238 aa)
|
未记录 | REA RETINOIC ACID × 2 L05 1-BENZYL-3-(4-METHOXYPHENYLAMINO)-4-PHENYLPYRROLE-2,5-DIONE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;PEG3350, Ammonium Acetate, BisTris, Dtt, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.280 |
| 2ACL Liver X-Receptor alpha Ligand Binding Domain with SB313987 提交 2005-07-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
225–462(238 aa)
链 E
225–462(238 aa)
|
未记录 | REA RETINOIC ACID × 2 L05 1-BENZYL-3-(4-METHOXYPHENYLAMINO)-4-PHENYLPYRROLE-2,5-DIONE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;PEG3350, Ammonium Acetate, BisTris, Dtt, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.280 |
| 2NLL RETINOID X RECEPTOR-THYROID HORMONE RECEPTOR DNA-BINDING DOMAIN HETERODIMER BOUND TO THYROID RESPONSE ELEMENT DNA 提交 1996-11-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 A
135–200(66 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;CRYSTALLIZED FROM 40% PEG 3350 25 MM IMADAZOLE BUFFER, PH 7.0, 400 MM NH4CL, 10 MM DTT, AND 5 MM MGCL2
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.269 |
| 2P1T Crystal structure of the ligand binding domain of the retinoid X receptor alpha in complex with 3-(2'-methoxy)-tetrahydronaphtyl cinnamic acid and a fragment of the coactivator TIF-2 提交 2007-03-06 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
223–462(240 aa)
片段:ligand binding domain (residues 223-462)
|
未记录 | 3TN (2E)-3-[4-HYDROXY-3-(3-METHOXY-5,5,8,8-TETRAMETHYL-5,6,7,8-TETRAHYDRONAPHTHALEN-2-YL)PHENYL]ACRYLIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;298 K;16% PEG 3350, 0.1M Tris, 1M ammonium acetate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.218 |
| 2P1U Crystal structure of the ligand binding domain of the retinoid X receptor alpha in complex with 3-(2'-ethoxy)-tetrahydronaphtyl cinnamic acid and a fragment of the coactivator TIF-2 提交 2007-03-06 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
223–462(240 aa)
片段:ligand binding domain (residues 223-462)
|
未记录 | 4TN (2E)-3-[3-(3-ETHOXY-5,5,8,8-TETRAMETHYL-5,6,7,8-TETRAHYDRONAPHTHALEN-2-YL)-4-HYDROXYPHENYL]ACRYLIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;298 K;14% PEG 10000, 0.1M Tris, 1M ammonium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.251 |
| 2P1V Crystal structure of the ligand binding domain of the retinoid X receptor alpha in complex with 3-(2'-propoxy)-tetrahydronaphtyl cinnamic acid and a fragment of the coactivator TIF-2 提交 2007-03-06 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
223–462(240 aa)
片段:ligand binding domain (residues 223-462)
|
未记录 | 5TN (2E)-3-[4-HYDROXY-3-(5,5,8,8-TETRAMETHYL-3-PROPOXY-5,6,7,8-TETRAHYDRONAPHTHALEN-2-YL)PHENYL]ACRYLIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;24% PEG 4000, 0.1M Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.232 |
| 2ZXZ Crystal structure of the human RXR alpha ligand binding domain bound to a synthetic agonist compound and a coactivator peptide 提交 2009-01-09 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
223–462(240 aa)
片段:Ligand Binding Domain
|
未记录 | P26 4-[2-(1,1,3,3-tetramethyl-2,3-dihydro-1H-inden-5-yl)-1,3-dioxolan-2-yl]benzoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;290 K;10mM Tris-HCl, 250mM NaCl, 5mM DTT, 50mM calcium acetate, 18% PEG3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.278 |
| 2ZY0 Crystal structure of the human RXR alpha ligand binding domain bound to a synthetic agonist compound and a coactivator peptide 提交 2009-01-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
223–462(240 aa)
片段:Ligand Binding Domain
链 C
223–462(240 aa)
片段:Ligand Binding Domain
|
未记录 | 21P 4-[2-(1,1,3,3-tetramethyl-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodisilol-5-yl)-1,3-dioxolan-2-yl]benzoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;290 K;10mM Tris-HCl, 250mM NaCl, 5mM DTT, 50mM calcium acetate, 18% PEG3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.289 |
| 3DZU Intact PPAR gamma - RXR alpha Nuclear Receptor Complex on DNA bound with BVT.13, 9-cis Retinoic Acid and NCOA2 Peptide 提交 2008-07-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:hexameric |
链 A
11–462(452 aa)
片段:UNP residues 11-462
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 9CR (9cis)-retinoic acid × 1 PLB 2-[(2,4-DICHLOROBENZOYL)AMINO]-5-(PYRIMIDIN-2-YLOXY)BENZOIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;15-18% PEG 3350, 25mM MgCl2, 100mM NH4Cl, 5mM DTT and 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.272 |
| 3DZY Intact PPAR gamma - RXR alpha Nuclear Receptor Complex on DNA bound with Rosiglitazone, 9-cis Retinoic Acid and NCOA2 Peptide 提交 2008-07-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:hexameric |
链 A
11–462(452 aa)
片段:UNP residues 11-462
|
未记录 | 9CR (9cis)-retinoic acid × 1 ZN ZINC ION × 4 BRL 2,4-THIAZOLIDIINEDIONE, 5-[[4-[2-(METHYL-2-PYRIDINYLAMINO)ETHOXY]PHENYL]METHYL]-(9CL) × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;15-18% PEG 3350, 25mM MgCl2, 100mM NH4Cl, 5mM DTT and 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.268 |
| 3E00 Intact PPAR gamma - RXR alpha Nuclear Receptor Complex on DNA bound with GW9662, 9-cis Retinoic Acid and NCOA2 Peptide 提交 2008-07-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:hexameric |
链 A
11–462(452 aa)
片段:UNP residues 11-462
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 9CR (9cis)-retinoic acid × 1 GW9 2-chloro-5-nitro-N-phenylbenzamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;15-18% PEG 3350, 25mM MgCl2, 100mM NH4Cl, 5mM DTT and 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.276 |
| 3E94 Crystal structure of RXRalpha ligand binding domain in complex with tributyltin and a coactivator fragment 提交 2008-08-21 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
223–462(240 aa)
片段:ligand binding domain (UNP residues 223-462)
|
未记录 | TBY tributylstannanyl × 2 ACT ACETATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;293 K;PEG 4000, ammonium acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.225 |
| 3FAL humanRXR alpha & mouse LXR alpha complexed with Retenoic acid and GSK2186 提交 2008-11-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
225–462(238 aa)
片段:residues 225-462
链 C
225–462(238 aa)
片段:residues 225-462
|
未记录 | REA RETINOIC ACID × 2 LO2 2-{4-[butyl(3-chloro-4,5-dimethoxybenzyl)amino]phenyl}-1,1,1,3,3,3-hexafluoropropan-2-ol × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;3uL 6.6mgs/ml protein + 3 uL well containing 21 % - 23 % PEG 3550, 200mM Ammonium Acetate, 100 mM Bis Tris pH 6.5 and 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.278 |
| 3FAL humanRXR alpha & mouse LXR alpha complexed with Retenoic acid and GSK2186 提交 2008-11-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
225–462(238 aa)
片段:residues 225-462
|
未记录 | REA RETINOIC ACID × 1 LO2 2-{4-[butyl(3-chloro-4,5-dimethoxybenzyl)amino]phenyl}-1,1,1,3,3,3-hexafluoropropan-2-ol × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;3uL 6.6mgs/ml protein + 3 uL well containing 21 % - 23 % PEG 3550, 200mM Ammonium Acetate, 100 mM Bis Tris pH 6.5 and 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.278 |
| 3FAL humanRXR alpha & mouse LXR alpha complexed with Retenoic acid and GSK2186 提交 2008-11-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
225–462(238 aa)
片段:residues 225-462
|
未记录 | REA RETINOIC ACID × 1 LO2 2-{4-[butyl(3-chloro-4,5-dimethoxybenzyl)amino]phenyl}-1,1,1,3,3,3-hexafluoropropan-2-ol × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;3uL 6.6mgs/ml protein + 3 uL well containing 21 % - 23 % PEG 3550, 200mM Ammonium Acetate, 100 mM Bis Tris pH 6.5 and 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.278 |
| 3FC6 hRXRalpha & mLXRalpha with an indole Pharmacophore, SB786875 提交 2008-11-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
225–462(238 aa)
链 C
225–462(238 aa)
|
未记录 | REA RETINOIC ACID × 2 LX2 [4-(3-{[2-chloro-3-(trifluoromethyl)benzyl](2,2-diphenylethyl)amino}propoxy)-1H-indol-1-yl]acetic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.06 Å R-free 0.250 |
| 3FUG Crystal Structure of the Retinoid X Receptor Ligand Binding Domain Bound to the Synthetic Agonist 3-[4-Hydroxy-3-(3,5,5,8,8-pentamethyl-5,6,7,8-tetrahydronaphthalen-2-yl)-phenyl]acrylic Acid 提交 2009-01-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
223–462(240 aa)
片段:LIGAND BINDING DOMAIN (RESIDUES 223-462)
|
未记录 | 2E3 (2E)-3-[4-hydroxy-3-(3,5,5,8,8-pentamethyl-5,6,7,8-tetrahydronaphthalen-2-yl)phenyl]prop-2-enoic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;20% PEG 4000, 0.1M TRIS, 1M AMMONIUM ACETATE, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.241 |
| 3FUG Crystal Structure of the Retinoid X Receptor Ligand Binding Domain Bound to the Synthetic Agonist 3-[4-Hydroxy-3-(3,5,5,8,8-pentamethyl-5,6,7,8-tetrahydronaphthalen-2-yl)-phenyl]acrylic Acid 提交 2009-01-14 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
223–462(240 aa)
片段:LIGAND BINDING DOMAIN (RESIDUES 223-462)
|
未记录 | 2E3 (2E)-3-[4-hydroxy-3-(3,5,5,8,8-pentamethyl-5,6,7,8-tetrahydronaphthalen-2-yl)phenyl]prop-2-enoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;20% PEG 4000, 0.1M TRIS, 1M AMMONIUM ACETATE, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.241 |
| 3H0A Crystal Structure of Peroxisome Proliferator-Activated Receptor Gamma (PPARg) and Retinoic Acid Receptor Alpha (RXRa) in Complex with 9-cis Retinoic Acid, Co-activator Peptide, and a Partial Agonist 提交 2009-04-08 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
228–455(228 aa)
片段:UNP RESIDUES 228-455
|
未记录 | 9RA 4-[1-(3,5,5,8,8-pentamethyl-5,6,7,8-tetrahydronaphthalen-2-yl)ethenyl]benzoic acid × 1 D30 [(4-{[2-(pent-2-yn-1-yloxy)-4-{[4-(trifluoromethyl)phenoxy]methyl}phenyl]sulfanyl}-5,6,7,8-tetrahydronaphthalen-1-yl)oxy]acetic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;289 K;25% PEG 2000 monomethyl ether, 0.3 M sodium acetate, 0.1 M Hepes 7.5, vapor diffusion, temperature 289K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.342 |
| 3KWY Crystal structure of RXRalpha ligand binding domain in complex with triphenyltin and a coactivator fragment 提交 2009-12-02 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
223–462(240 aa)
片段:ligand binding domain
|
未记录 | T9T triphenylstannanyl × 2 ACT ACETATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;293 K;PEG 4000, acetate ammonium, Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.244 |
| 3OAP Crystal structure of human Retinoid X Receptor alpha-ligand binding domain complex with 9-cis retinoic acid and the coactivator peptide GRIP-1 提交 2010-08-05 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
228–458(231 aa)
片段:hRXRalpha-LBD, UNP residues 228-458
|
未记录 | 9CR (9cis)-retinoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;296 K;4-20% PEG4000, 4-16% glycerol, 0.1M Bis-Tris, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.244 |
| 3OZJ Crystal structure of human retinoic X receptor alpha complexed with bigelovin and coactivator SRC-1 提交 2010-09-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
225–462(238 aa)
片段:ligand-binding domain, UNP residues 225-462
链 C
225–462(238 aa)
片段:ligand-binding domain, UNP residues 225-462
|
未记录 | BGV (3aR,4S,4aR,7aR,8R,9aS)-4a,8-dimethyl-3-methylidene-2,5-dioxo-2,3,3a,4,4a,5,7a,8,9,9a-decahydroazuleno[6,5-b]furan-4-yl acetate × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;8% v/v Tacsimate pH7.5, 20% w/v PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.10 Å |
| 3PCU Crystal structure of human retinoic X receptor alpha ligand-binding domain complexed with LX0278 and SRC1 peptide 提交 2010-10-22 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
229–458(230 aa)
片段:UNP residues 229-458
|
未记录 | LX8 2-[(2S)-6-(2-methylbut-3-en-2-yl)-7-oxo-2,3-dihydro-7H-furo[3,2-g]chromen-2-yl]propan-2-yl acetate × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;277 K;8% v/v Tacsimate pH8.0, 20% w/v PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å |
| 3R29 Crystal structure of RXRalpha ligand-binding domain complexed with corepressor SMRT2 提交 2011-03-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
223–462(240 aa)
片段:ligand binding domain (UNP residues 223-462)
链 B
223–462(240 aa)
片段:ligand binding domain (UNP residues 223-462)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;100 mM sodium cacodylate, 15% PEG4000, 100 mM magnesium acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.326 |
| 3R2A Crystal structure of RXRalpha ligand-binding domain complexed with corepressor SMRT2 and antagonist rhein 提交 2011-03-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
223–462(240 aa)
片段:ligand binding domain (UNP residues 223-462)
链 B
223–462(240 aa)
片段:ligand binding domain (UNP residues 223-462)
链 C
223–462(240 aa)
片段:ligand binding domain (UNP residues 223-462)
链 D
223–462(240 aa)
片段:ligand binding domain (UNP residues 223-462)
|
未记录 | RHN 4,5-dihydroxy-9,10-dioxo-9,10-dihydroanthracene-2-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;100 mM sodium cacodylate, 20% PEG4000, 100 mM magnesium acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.335 |
| 3R5M Crystal structure of RXRalphaLBD complexed with the agonist magnolol 提交 2011-03-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
223–462(240 aa)
片段:ligand binding domain (UNP residues 223-462)
链 C
223–462(240 aa)
片段:ligand binding domain (UNP residues 223-462)
|
未记录 | MLO 5,5'-di(prop-2-en-1-yl)biphenyl-2,2'-diol × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;20% PEG3350, 100 mM Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.293 |
| 3UVV Crystal Structure of the ligand binding domains of the thyroid receptor:retinoid X receptor complexed with 3,3',5 triiodo-L-thyronine and 9-cis retinoic acid 提交 2011-11-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
225–462(238 aa)
片段:ligand binding domain (UNP Residues 225-462)
|
未记录 | T3 3,5,3'TRIIODOTHYRONINE × 1 9CR (9cis)-retinoic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.3;298 K;100 mM HEPES (pH 7.3), 200 mM Tri-Sodium citrate dihydrate, 15% Isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.250 |
| 4CN2 Crystal Structure of the Human Retinoid X Receptor DNA-Binding Domain Bound to the Human Ramp2 Response Element 提交 2014-01-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 C
130–212(83 aa)
片段:DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 130-212
链 D
130–212(83 aa)
片段:DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 130-212
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 4 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 CL CHLORIDE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6;20% PEG 3350, 0.2M NH4CL, 0.1M MGCL2, 0.1M MES PH 6
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.214 |
| 4CN3 Crystal Structure of the Human Retinoid X Receptor DNA-Binding Domain Bound to the Human Gde1SpA Response Element 提交 2014-01-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 B
130–212(83 aa)
片段:DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 130-212
链 C
130–212(83 aa)
片段:DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 130-212
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.11;20% PEG 3350, 0.2M NH4CL, pH 6.11
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.249 |
| 4CN3 Crystal Structure of the Human Retinoid X Receptor DNA-Binding Domain Bound to the Human Gde1SpA Response Element 提交 2014-01-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 A
130–212(83 aa)
片段:DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 130-212
链 D
130–212(83 aa)
片段:DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 130-212
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.11;20% PEG 3350, 0.2M NH4CL, pH 6.11
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.249 |
| 4CN5 Crystal Structure of the Human Retinoid X Receptor DNA-Binding Domain Bound to the Human Nr1d1 Response Element 提交 2014-01-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 A
130–212(83 aa)
片段:DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 126-212
链 B
130–212(83 aa)
片段:DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 126-212
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CL CHLORIDE ION × 5 K POTASSIUM ION × 4 NO3 NITRATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.6;20% PEG 3350, 0.2M KNO3, pH 6.6
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.227 |
| 4CN7 Crystal Structure of the Human Retinoid X Receptor DNA-Binding Domain Bound to an idealized DR1 Response Element 提交 2014-01-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 E
130–212(83 aa)
片段:DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 130-212
链 F
130–212(83 aa)
片段:DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 130-212
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;20% PEG 3350, 0.1M NH4CL, 0.1M MGCL2, 0.1M MOPS PH 7
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.209 |
| 4CN7 Crystal Structure of the Human Retinoid X Receptor DNA-Binding Domain Bound to an idealized DR1 Response Element 提交 2014-01-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 A
130–212(83 aa)
片段:DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 130-212
链 B
130–212(83 aa)
片段:DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 130-212
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CL CHLORIDE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;20% PEG 3350, 0.1M NH4CL, 0.1M MGCL2, 0.1M MOPS PH 7
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.209 |
| 4J5W Crystal Structure of the apo-PXR/RXRalpha LBD Heterotetramer Complex 提交 2013-02-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 C
227–462(236 aa)
链 D
227–462(236 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277.15 K;16-20% PEG 8000, 0.1-0.2 M MgCl, 0.1 M bis-tris proprane, 0.02% sodium azide, pH 7.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277.15K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.298 |
| 4J5X Crystal Structure of the SR12813-bound PXR/RXRalpha LBD Heterotetramer Complex 提交 2013-02-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 C
227–462(236 aa)
链 D
227–462(236 aa)
|
未记录 | SRL [2-(3,5-DI-TERT-BUTYL-4-HYDROXY-PHENYL)-1-(DIETHOXY-PHOSPHORYL)-VINYL]-PHOSPHONIC ACID DIETHLYL ESTER × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277.15 K;16-20% PEG 8000, 0.1-0.2 M MgCl, 0.1 M bis-tris proprane, 0.02% sodium azide, pH 7.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277.15K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.298 |
| 4K4J Crystal structure of human Retinoid X Receptor alpha-ligand binding domain complex with 9cUAB30 and the coactivator peptide GRIP-1 提交 2013-04-12 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
228–458(231 aa)
片段:ligand binding domain, UNP residues 228-458
|
未记录 | 1O8 (2E,4E,6Z,8E)-8-(3,4-dihydronaphthalen-1(2H)-ylidene)-3,7-dimethylocta-2,4,6-trienoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;5-10% PEG4000, 2-5% Glycerol, 0.1M Bis-Tris, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.283 |
| 4K6I Crystal structure of human retinoid X receptor alpha-ligand binding domain complex with Targretin and the coactivator peptide GRIP-1 提交 2013-04-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
228–458(231 aa)
片段:ligand binding domain, UNP residues 228-458
|
未记录 | 9RA 4-[1-(3,5,5,8,8-pentamethyl-5,6,7,8-tetrahydronaphthalen-2-yl)ethenyl]benzoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;5-15% PEG4000, 6-12% Glycerol, 0.1M Bis-Tris pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.288 |
| 4M8E CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN RETINOID X RECEPTOR ALPHA-LIGAND BINDING DOMAIN COMPLEX WITH (S) 4-Methyl 9cUAB30 COACTIVATOR PEPTIDE GRIP-1 提交 2013-08-13 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
228–458(231 aa)
片段:HRXRALPHA-LBD, UNP RESIDUES 228-458
|
未记录 | 29V (3E,6Z,8E)-3,7-dimethyl-8-[(4S)-4-methyl-3,4-dihydronaphthalen-1(2H)-ylidene]octa-3,6-dienoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;4-20% PEG4000, 4-16% GLYCEROL, 0.1M BIS-TRIS, PH7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 295K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.247 |
| 4M8H CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN RETINOID X RECEPTOR ALPHA-LIGAND BINDING DOMAIN COMPLEX WITH (R)4-METHYL 9cUAB30 AND COACTIVATOR PEPTIDE GRIP-1 提交 2013-08-13 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
228–458(231 aa)
片段:HRXRALPHA-LBD, UNP RESIDUES 228-458
|
未记录 | R4M (2E,6Z,8E)-3,7-dimethyl-8-[(4R)-4-methyl-3,4-dihydronaphthalen-1(2H)-ylidene]octa-2,6-dienoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;4-20% PEG4000, 4-16% GLYCEROL, 0.1M BIS-TRIS, PH7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 295K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.265 |
| 4N5G Crystal Structure of RXRa LBD complexed with a synthetic modulator K8012 提交 2013-10-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
223–462(240 aa)
片段:ligand binding domain (UNP residues 223-462)
链 B
223–462(240 aa)
片段:ligand binding domain (UNP residues 223-462)
链 C
223–462(240 aa)
片段:ligand binding domain (UNP residues 223-462)
链 D
223–462(240 aa)
片段:ligand binding domain (UNP residues 223-462)
|
未记录 | K09 5-(2-{(1Z)-5-fluoro-2-methyl-1-[4-(propan-2-yl)benzylidene]-1H-inden-3-yl}ethyl)-1H-tetrazole × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293 K;20% PEG3330, 0.2M Na Acetate, 100 mM NaCl, 20 mM Tris-Cl, 0.5 mM ligand K-8012, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.247 |
| 4N8R Crystal structure of RXRa LBD complexed with a synthetic modulator K-8008 提交 2013-10-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
223–462(240 aa)
片段:ligand binding domain (UNP residues 223-462)
链 B
223–462(240 aa)
片段:ligand binding domain (UNP residues 223-462)
链 C
223–462(240 aa)
片段:ligand binding domain (UNP residues 223-462)
链 D
223–462(240 aa)
片段:ligand binding domain (UNP residues 223-462)
|
未记录 | K08 5-(2-{(1Z)-2-methyl-1-[4-(propan-2-yl)benzylidene]-1H-inden-3-yl}ethyl)-1H-tetrazole × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293 K;20% PEG3330, 0.2M Mg Formate, 100 MM NACL, 20 MM TRIS-CL, 0.5 MM LIGAND K-8008, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.239 |
| 4NQA Crystal structure of liganded hRXR-alpha/hLXR-beta heterodimer on DNA 提交 2013-11-24 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:hexameric |
链 A
98–462(365 aa)
片段:UNP residues 98-462
|
未记录 | 9CR (9cis)-retinoic acid × 1 ZN ZINC ION × 4 965 [3-(3-{[2-chloro-3-(trifluoromethyl)benzyl](2,2-diphenylethyl)amino}propoxy)phenyl]acetic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;295 K;6% PEG8000, 18% isopropanol, 0.05 M Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.218 |
| 4NQA Crystal structure of liganded hRXR-alpha/hLXR-beta heterodimer on DNA 提交 2013-11-24 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:hexameric |
链 H
98–462(365 aa)
片段:UNP residues 98-462
|
未记录 | 9CR (9cis)-retinoic acid × 1 ZN ZINC ION × 4 965 [3-(3-{[2-chloro-3-(trifluoromethyl)benzyl](2,2-diphenylethyl)amino}propoxy)phenyl]acetic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;295 K;6% PEG8000, 18% isopropanol, 0.05 M Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.218 |
| 4OC7 Retinoic acid receptor alpha in complex with (E)-3-(3'-allyl-6-hydroxy-[1,1'-biphenyl]-3-yl)acrylic acid and a fragment of the coactivator TIF2 提交 2014-01-08 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
223–462(240 aa)
片段:ligand binding domain (UNP residues 223-462)
|
未记录 | 2QO (2E)-3-[6-hydroxy-3'-(prop-2-en-1-yl)biphenyl-3-yl]prop-2-enoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;0.1 M Na HEPES pH 7.5, 20% PEG 2000 MME, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.242 |
| 4POH Crystal structure of human Retinoid X Receptor alpha-ligand binding domain complex with 8-methyl UAB30 and the coactivator peptide GRIP-1 提交 2014-02-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
228–458(231 aa)
片段:Ligand Binding Domain, UNP residues 228-458
|
未记录 | 2VR (2E,4E,6Z,8E)-3,7-dimethyl-8-(8-methyl-3,4-dihydronaphthalen-1(2H)-ylidene)octa-2,4,6-trienoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;4-12% PEG4000, 3-12% Glycerol, 0.1M Bis-Tris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.265 |
| 4POJ Crystal structure of human Retinoid X Receptor alpha-ligand binding domain complex with 7-methyl UAB30 and the coactivator peptide GRIP-1 提交 2014-02-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
228–458(231 aa)
片段:Ligand Binding Domain, UNP residues 228-458
|
未记录 | 2VP (2E,4E,6Z,8E)-3,7-dimethyl-8-(7-methyl-3,4-dihydronaphthalen-1(2H)-ylidene)octa-2,4,6-trienoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;4-12% PEG4000, 3-12% Glycerol, 0.1M Bis-Tris, pH 7.0 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.261 |
| 4PP3 Crystal structure of human Retinoid X Receptor alpha-ligand binding domain complex with 6-methyl UAB30 and the coactivator peptide GRIP-1 提交 2014-02-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
228–458(231 aa)
片段:Ligand Binding Domain, UNP residues 228-458
|
未记录 | 2VZ (2E,4E,6Z,8E)-3,7-dimethyl-8-(6-methyl-3,4-dihydronaphthalen-1(2H)-ylidene)octa-2,4,6-trienoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;4-12% PEG4000, 3-12% Glycerol, 0.1M Bis-Tris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.275 |
| 4PP5 Crystal structure of human Retinoid X Receptor alpha-ligand binding domain complex with 5-methyl UAB30 and the coactivator peptide GRIP-1 提交 2014-02-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
228–458(231 aa)
片段:Ligand Binding Domain, UNP residues 228-458
|
未记录 | 2W0 (2E,4E,6Z,8E)-3,7-dimethyl-8-(5-methyl-3,4-dihydronaphthalen-1(2H)-ylidene)octa-2,4,6-trienoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;4-12% PEG4000, 3-12% Glycerol, 0.1M Bis-Tris, pH 7.0 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.250 |
| 4RFW Crystal structure of human retinoid X Receptor alpha-ligand binding domain complex with 9cUAB70 and the coactivator peptide GRIP-1 提交 2014-09-28 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
228–458(231 aa)
片段:ligand binding domain residues 228-458
|
未记录 | 3RB (2E,4E,6Z,8E)-3,7-dimethyl-8-(6,7,8,9-tetrahydro-5H-benzo[7]annulen-5-ylidene)octa-2,4,6-trienoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;5-12% PEG4000, 3-12 Glycerol, 0.1 Bis-Tris pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.261 |
| 4RMC Crystal Structure of human retinoid X receptor alpha-ligand binding domain complex with 9cUAB76 and the coactivator peptide GRIP-1 提交 2014-10-21 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
228–458(231 aa)
片段:ligand binding domain 228-458
|
未记录 | 3SV (3S,7S,8E)-8-[3-ethyl-2-(3-methylbutyl)cyclohex-2-en-1-ylidene]-3,7-dimethyloctanoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;5-15% PEG4000, 4-12% Glycerol, 0.1M Bis-Tris, pH=7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.265 |
| 4RMD Crystal structure of human Retinoid X receptor alpha ligand binding domain complex with 9cUAB110 and coactivator peptide GRIP-1 提交 2014-10-21 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
228–462(235 aa)
片段:ligand binding domain 228-458
|
未记录 | 3SW (2E,4E,6Z,8E)-8-[3-cyclopropyl-2-(3-methylbutyl)cyclohex-2-en-1-ylidene]-3,7-dimethylocta-2,4,6-trienoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;5-15% PEG4000, 4-12% Glycerol, 0.1M Bis-Tris pH=7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.239 |
| 4RME Crystal structure of human Retinoid X receptor alpha ligand binding domain complex with 9cUAB111 and coactivator peptide GRIP-1 提交 2014-10-21 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
228–462(235 aa)
片段:ligand binding domain 228-458
|
未记录 | 3T2 (2E,4E,6Z,8E)-3,7-dimethyl-8-[2-(3-methylbutyl)-3-(propan-2-yl)cyclohex-2-en-1-ylidene]octa-2,4,6-trienoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;5-15% PEG4000, 4-12% Glycerol, 0.1M Bis-Tris pH=7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.273 |
| 4ZO1 Crystal Structure of the T3-bound TR-beta Ligand-binding Domain in complex with RXR-alpha 提交 2015-05-05 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 B
231–455(225 aa)
片段:ligand binding domain, unp residues 231-455
|
未记录 | T3 3,5,3'TRIIODOTHYRONINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;294 K;20% PEG 3350, 100 mM Tris pH 8.0, 0.1 M ammonium acetate, and 1 mM Methoprene acid
|
分辨率 3.22 Å R-free 0.281 |
| 4ZSH RXR LBD in complex with 9-cis-13,14-dihydroretinoic acid 提交 2015-05-13 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
223–462(240 aa)
片段:residues 223 - 462
|
未记录 | 4XW (5S,6S,9R,13R)-2,3-didehydro-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14-decahydroretinoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;290 K;PEG3350 18%, calcium acetate 50 mM
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.218 |
| 5EC9 Retinoic acid receptor alpha in complex with chiral dihydrobenzofuran benzoic acid 9a and a fragment of the coactivator TIF2 提交 2015-10-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
229–456(228 aa)
|
未记录 | 5LO 4-[(11S,15R)-4,4,7,7-Tetramethyl-16-oxatetracyclo[8.6.0.03,8.011,15]hexadeca-1(10),2,8-trien-11-yl]benzoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277.15 K;20% w/v PEG200 MME, 0.1M Tris pH8.0, 0.2M magnesium chloride
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.214 |
| 5JI0 PPARgamma-RXRalpha(S427F) heterodimer in complex with SRC-1, rosiglitazone, and 9-cis-retanoic acid 提交 2016-04-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
223–462(240 aa)
|
突变:S427F | 9CR (9cis)-retinoic acid × 1 BRL 2,4-THIAZOLIDIINEDIONE, 5-[[4-[2-(METHYL-2-PYRIDINYLAMINO)ETHOXY]PHENYL]METHYL]-(9CL) × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;296 K;Crystals grew in the dark at room temperature from 0.5 + 0.5 uL sitting drops equilibrated over a reservoir containing 20-24% PEG3350 and 0.02M Na Citrate
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.246 |
| 5JI0 PPARgamma-RXRalpha(S427F) heterodimer in complex with SRC-1, rosiglitazone, and 9-cis-retanoic acid 提交 2016-04-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
223–462(240 aa)
|
突变:S427F | 9CR (9cis)-retinoic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;296 K;Crystals grew in the dark at room temperature from 0.5 + 0.5 uL sitting drops equilibrated over a reservoir containing 20-24% PEG3350 and 0.02M Na Citrate
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.246 |
| 5LYQ Crystal structure of the Retinoic Acid Receptor alpha in complex with a synthetic spiroketal agonist and a fragment of the TIF2 co-activator. 提交 2016-09-28 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
223–462(240 aa)
片段:UNP residues 223-462
|
未记录 | 7BE (2~{R})-6,6,9,9-tetramethylspiro[3,4,7,8-tetrahydrobenzo[g]chromene-2,2'-3,4-dihydrochromene]-6'-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;277 K;0.1 M MIB buffer pH 8, 25% (w/v) PEG 1500
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.253 |
| 5MJ5 Crystal structure of the Retinoid X Receptor alpha in complex with synthetichonokiol derivative 3 and a fragment of the TIF2 co-activator. 提交 2016-11-30 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
229–457(229 aa)
|
未记录 | 7O0 (~{E})-3-[4-oxidanyl-3-[3-(phenylmethyl)phenyl]phenyl]prop-2-enoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;0.1 M PIPES, pH 7.0, 0.1 M NaCl, 22% PEG 2K MME
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.243 |
| 5MK4 Crystal structure of the Retinoid X Receptor alpha in complex with synthetic honokiol derivative 7 and a fragment of the TIF2 co-activator. 提交 2016-12-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
229–457(229 aa)
片段:UNP residues 229-457
链 C
229–457(229 aa)
片段:UNP residues 229-457
|
未记录 | I5W (~{E})-3-[3-(2-methyl-5-phenyl-phenyl)-4-oxidanyl-phenyl]prop-2-enoic acid × 2 CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;0.1M PIPES, pH 7.0, 0.1M NaCl, 22% PEG 2K MME
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.229 |
| 5MKJ Crystal structure of the Retinoid X Receptor alpha in complex with synthetic honokiol derivative 9 and a fragment of the TIF2 co-activator. 提交 2016-12-05 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
229–458(230 aa)
|
未记录 | 4CU (~{E})-3-[4-oxidanyl-3-(5-prop-2-enyl-2-propoxy-phenyl)phenyl]prop-2-enoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;0.1M PIPES, pH 7.0, 0.1M NaCl, 22% PEG 2K MME
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.245 |
| 5MKU Crystal structure of the Retinoid X Receptor alpha in complex with synthetic honokiol derivative 4 and a fragment of the TIF2 co-activator. 提交 2016-12-05 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
229–456(228 aa)
|
未记录 | J57 (~{E})-3-[4-oxidanyl-3-(3-propan-2-ylphenyl)phenyl]prop-2-enoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;0.1M PIPES, pH 7.0, 0.1M NaCl, 22% PEG 2K MME
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.177 |
| 5MMW Crystal structure of the Retinoid X Receptor alpha in complex with synthetic honokiol derivative 6 and a fragment of the TIF2 co-activator. 提交 2016-12-12 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
229–457(229 aa)
|
未记录 | SJZ (~{E})-3-[3-(2-methyl-3-phenyl-phenyl)-4-oxidanyl-phenyl]prop-2-enoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;pH 7.0, 0.1M PIPES, 0.1M NaCl, 22% PEG 2K MME
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.253 |
| 5TBP Crystal Structure of RXR-alpha ligand binding domain complexed with synthetic modulator K8003 提交 2016-09-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
223–462(240 aa)
片段:UNP residues 223-462
链 B
223–462(240 aa)
片段:UNP residues 223-462
链 C
223–462(240 aa)
片段:UNP residues 223-462
链 D
223–462(240 aa)
片段:UNP residues 223-462
|
未记录 | 7A4 [(1Z)-5-fluoro-2-methyl-1-{[4-(propan-2-yl)phenyl]methylidene}-1H-inden-3-yl]acetic acid × 6 ACT ACETATE ION × 7 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.6;293.15 K;0.2 ul of 0.35 mM protein and 0.6 mM ligand in 100 mM NaCl, 20 mM Tris-Cl were mixed with 0.2 ul of the well solution (20% PEG3330 and 0.2M Na Acetate)
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.242 |
| 5TBP Crystal Structure of RXR-alpha ligand binding domain complexed with synthetic modulator K8003 提交 2016-09-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
223–462(240 aa)
片段:UNP residues 223-462
链 C
223–462(240 aa)
片段:UNP residues 223-462
|
未记录 | 7A4 [(1Z)-5-fluoro-2-methyl-1-{[4-(propan-2-yl)phenyl]methylidene}-1H-inden-3-yl]acetic acid × 3 ACT ACETATE ION × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.6;293.15 K;0.2 ul of 0.35 mM protein and 0.6 mM ligand in 100 mM NaCl, 20 mM Tris-Cl were mixed with 0.2 ul of the well solution (20% PEG3330 and 0.2M Na Acetate)
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.242 |
| 5TBP Crystal Structure of RXR-alpha ligand binding domain complexed with synthetic modulator K8003 提交 2016-09-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
223–462(240 aa)
片段:UNP residues 223-462
链 D
223–462(240 aa)
片段:UNP residues 223-462
|
未记录 | 7A4 [(1Z)-5-fluoro-2-methyl-1-{[4-(propan-2-yl)phenyl]methylidene}-1H-inden-3-yl]acetic acid × 3 ACT ACETATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.6;293.15 K;0.2 ul of 0.35 mM protein and 0.6 mM ligand in 100 mM NaCl, 20 mM Tris-Cl were mixed with 0.2 ul of the well solution (20% PEG3330 and 0.2M Na Acetate)
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.242 |
| 5UAN Crystal structure of multi-domain RAR-beta-RXR-alpha heterodimer on DNA 提交 2016-12-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:hexameric |
链 A
98–462(365 aa)
片段:UNP residues 98-462
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 9CR (9cis)-retinoic acid × 1 REA RETINOIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;MES, PEG300
|
分辨率 3.51 Å R-free 0.270 |
| 5Z12 A structure of FXR/RXR 提交 2017-12-23 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 B
228–458(231 aa)
片段:UNP residues 228-458
|
未记录 | 33Y 1-methylethyl 3-[(3,4-difluorophenyl)carbonyl]-1,1-dimethyl-1,2,3,6-tetrahydroazepino[4,5-b]indole-5-carboxylate × 1 9CR (9cis)-retinoic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;4% v/v Tacsimate pH 8.0, 12% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.290 |
| 5Z12 A structure of FXR/RXR 提交 2017-12-23 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 C
228–458(231 aa)
片段:UNP residues 228-458
|
未记录 | 33Y 1-methylethyl 3-[(3,4-difluorophenyl)carbonyl]-1,1-dimethyl-1,2,3,6-tetrahydroazepino[4,5-b]indole-5-carboxylate × 1 9CR (9cis)-retinoic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;4% v/v Tacsimate pH 8.0, 12% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.290 |
| 5ZQU Crystal structure of tetrameric RXRalpha-LBD complexed with partial agonist CBt-PMN 提交 2018-04-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
224–462(239 aa)
链 B
224–462(239 aa)
链 C
224–462(239 aa)
链 D
224–462(239 aa)
|
未记录 | 9HF 1-(3,5,5,8,8-pentamethyl-6,7-dihydronaphthalen-2-yl)benzotriazole-5-carboxylic acid × 6 BR BROMIDE ION × 11 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;200mM sodium bromide, 20% polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.270 |
| 6A5Y Crystal structure of human FXR/RXR-LBD heterodimer bound to HNC143 and 9cRA and SRC1 提交 2018-06-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 D
225–462(238 aa)
|
未记录 | 9R0 2-[2-[[3-[2,6-bis(chloranyl)phenyl]-5-cyclopropyl-1,2-oxazol-4-yl]methoxy]-6-azaspiro[3.4]octan-6-yl]-1,3-benzothiazole-6-carboxylic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 2 9CR (9cis)-retinoic acid × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.6;293 K;0.2M Ammonium sulfate , 0.1M tri-sodium citrate,25%PEG 4000
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.241 |
| 6A5Z Crystal structure of human FXR/RXR-LBD heterodimer bound to HNC180 and 9cRA and SRC1 提交 2018-06-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 D
225–462(238 aa)
片段:ligand binding domain
|
未记录 | 9R3 2-[(1R,5S)-9-[[3-[2,6-bis(chloranyl)phenyl]-5-cyclopropyl-1,2-oxazol-4-yl]methoxy]-3-azabicyclo[3.3.1]nonan-3-yl]-1,3-benzothiazole-6-carboxylic acid × 1 9CR (9cis)-retinoic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;277 K;0.2 M Ammonium iodide, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.282 |
| 6A5Z Crystal structure of human FXR/RXR-LBD heterodimer bound to HNC180 and 9cRA and SRC1 提交 2018-06-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 L
225–462(238 aa)
片段:ligand binding domain
|
未记录 | 9R3 2-[(1R,5S)-9-[[3-[2,6-bis(chloranyl)phenyl]-5-cyclopropyl-1,2-oxazol-4-yl]methoxy]-3-azabicyclo[3.3.1]nonan-3-yl]-1,3-benzothiazole-6-carboxylic acid × 1 9CR (9cis)-retinoic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;277 K;0.2 M Ammonium iodide, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.282 |
| 6A60 Crystal structure of human FXR/RXR-LBD heterodimer bound to GW4064 and 9cRA and SRC1 提交 2018-06-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 D
225–462(238 aa)
|
未记录 | 064 3-[(E)-2-(2-chloro-4-{[3-(2,6-dichlorophenyl)-5-(1-methylethyl)isoxazol-4-yl]methoxy}phenyl)ethenyl]benzoic acid × 1 9CR (9cis)-retinoic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;277 K;0.1 M Sodium acetate trihydrate, 12% PEG3350
|
分辨率 3.05 Å R-free 0.288 |
| 6FBQ Crystal Structure of the Human Retinoid X Receptor DNA-Binding Domain Bound to the Human MEp DR1 Response Element, pH 7.0 提交 2017-12-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 A
33–115(83 aa)
链 B
33–115(83 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 MPO 3[N-MORPHOLINO]PROPANE SULFONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;20% PEG 3350, 0.1M MOPS pH 7.0, 0.1M NH4Cl, 0.1M MgCl2
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.198 |
| 6FBR Crystal Structure of the Human Retinoid X Receptor DNA-Binding Domain Bound to the Human MEp DR1 Response Element, pH 4.2 提交 2017-12-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 A
33–115(83 aa)
链 B
33–115(83 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.2;293 K;40% PEG 300, 0.1M sodium phosphate citrate pH 4.2
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.232 |
| 6HN6 A revisited version of the apo structure of the ligand-binding domain of the human nuclear receptor RXR-ALPHA 提交 2018-09-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
201–462(262 aa)
|
未记录 | CPS 3-[(3-CHOLAMIDOPROPYL)DIMETHYLAMMONIO]-1-PROPANESULFONATE × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;289 K;0.45 M AMMONIUM CITRATE, 30 mM KCl, 4% GLYCEROL, 5 mM CHAPS, pH 7.0
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.231 |
| 6JNO RXRa structure complexed with CU-6PMN 提交 2019-03-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
224–462(239 aa)
链 B
224–462(239 aa)
链 C
224–462(239 aa)
链 D
224–462(239 aa)
|
未记录 | WY5 7-oxidanyl-2-oxidanylidene-6-(3,5,5,8,8-pentamethyl-6,7-dihydronaphthalen-2-yl)chromene-3-carboxylic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;295 K;20% (w/v) Polyethylene glycol 3350, 0.2M Mg(OAc)2
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.274 |
| 6JNR RXRa structure complexed with CU-6PMN and SRC1 peptide. 提交 2019-03-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
224–462(239 aa)
链 B
224–462(239 aa)
|
未记录 | WY5 7-oxidanyl-2-oxidanylidene-6-(3,5,5,8,8-pentamethyl-6,7-dihydronaphthalen-2-yl)chromene-3-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;295 K;30%(v/v) Polyethylene glycol monomethyl ether 550, 0.1M HEPES-NaOH (pH 7.5), 0.05M MgCl2
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.238 |
| 6L6K Crystal structure of dimeric RXRalpha-LBD complexed with partial agonist CBt-PMN and SRC1 提交 2019-10-29 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
224–462(239 aa)
|
未记录 | 9HF 1-(3,5,5,8,8-pentamethyl-6,7-dihydronaphthalen-2-yl)benzotriazole-5-carboxylic acid × 2 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;20mM Calcium acetate hydrate, 20% Polyethylene glycol 3.350, 10mM Praseodymium(III) acetate hydrate
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.211 |
| 6LB4 Crystal structure of dimeric RXR-LBD complexed with NEt-3ME and TIF2 co-activator 提交 2019-11-13 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
224–462(239 aa)
|
未记录 | E8L 6-[ethyl-[3-(2-methoxyethoxy)-4-propan-2-yl-phenyl]amino]pyridine-3-carboxylic acid × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M Sodium Acetate
18 % PEG3350
0.1 M Spermine tetrahydrochroride
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.201 |
| 6LB5 Crystal structure of dimeric RXR-LBD complexed with full agonist NEt-3IB and TIF2 co-activator 提交 2019-11-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
224–462(239 aa)
链 C
224–462(239 aa)
|
未记录 | E80 6-[ethyl-[3-(2-methylpropoxy)-4-propan-2-yl-phenyl]amino]pyridine-3-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;0.1 M Imidazole
20 % PEG 6000
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.240 |
| 6LB6 Crystal structure of dimeric RXR-LBD complexed with partial agonist NEt-4IB and TIF2 co-activator 提交 2019-11-13 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
224–462(239 aa)
|
未记录 | E8O 6-[ethyl-[4-(2-methylpropoxy)-3-propan-2-yl-phenyl]amino]pyridine-3-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;0.1 M Imidazole
20 % PEG6000
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.257 |
| 6SJM Crystal structure of the Retinoic Acid Receptor alpha in complex with compound 24 (JP175) 提交 2019-08-13 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
229–456(228 aa)
|
未记录 | LFZ 2-[4-[3,5-bis(trifluoromethyl)phenyl]phenyl]ethanoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293.15 K;21% PEG 4000, 0.2 M ammonium acetate and 0.1 M tris, pH 7.5
|
分辨率 2.52 Å R-free 0.247 |
| 6STI Crystal structure of RXRalpha LBD in complex with LG 100754 and a coactivator peptide 提交 2019-09-10 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
223–462(240 aa)
|
未记录 | 754 (2E,4E,6Z)-3-methyl-7-(5,5,8,8-tetramethyl-3-propoxy-5,6,7,8-tetrahydronaphthalen-2-yl)octa-2,4,6-trienoic acid × 2 ACT ACETATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;17.5% PEG3350, 0.7 M CH3COONH4, 30 mM CH3COONa pH4.6
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.172 |
| 6XWG Crystal Structure of the Human RXR/RAR DNA-Binding Domain Heterodimer Bound to the Human RARb2 DR5 Response Element 提交 2020-01-23 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 C
33–115(83 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;25% PEG 3350, 0.2 M Li2SO4, 0.1 M bis-tris pH 6.5
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.207 |
| 6XWH Crystal Structure of the Human RXR DNA-Binding Domain Homodimer Bound to the Human Hoxb13 DR0 Response Element 提交 2020-01-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 C
33–115(83 aa)
链 D
33–115(83 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;20% PEG 3350, 0.15 M di-sodium DL-malonate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.224 |
| 7A77 Crystal structure of RXR alpha LBD in complexes with palmitic acid and GRIP-1 peptide 提交 2020-08-27 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
223–462(240 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 PLM PALMITIC ACID × 2 CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293.15 K;17% PEG 3350, 0.2M ammonium actetate, 0.1M tris, pH 8.0
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.180 |
| 7B88 Crystal structure of Retinoic Acid Receptor alpha (RXRA) in complexed with S99 inhibitor 提交 2020-12-12 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
229–456(228 aa)
|
未记录 | T2K 3-[5-[3,5-bis(chloranyl)phenyl]-4-phenyl-1,3-oxazol-2-yl]propanoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293.15 K;21% PEG 3350, 0.1 M Ammomium Acetate, 0.1 M tris 7.5
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.259 |
| 7B9O Crystal structure of Retinoic Acid Receptor alpha (RXRA) in complexed with S169 inhibitor 提交 2020-12-14 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
229–456(228 aa)
|
未记录 | T72 3-(5-(3,5-bis(trifluoromethyl)phenyl)-4-phenyloxazol-2-yl)propanoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;24% PEG 4000
0.2M Ammonium acetate
0.1M Tris pH7.5
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.236 |
| 7BK4 Crystal structure of RXRalpha ligand binding domain in complex with a fragment of the TIF2 coactivator 提交 2021-01-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
223–462(240 aa)
链 C
223–462(240 aa)
|
未记录 | LG2 6-[1-(3,5,5,8,8-PENTAMETHYL-5,6,7,8-TETRAHYDRONAPHTHALEN-2-YL)CYCLOPROPYL]PYRIDINE-3-CARBOXYLIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M Na Hepes, 0.2 M sodium acetate pH 7.5, 27% PEG 3350
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.265 |
| 7CFO Crystal structure of human RXRalpha ligand binding domain complexed with CBTF-EE. 提交 2020-06-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
224–462(239 aa)
片段:ligand binding domain
链 B
224–462(239 aa)
片段:ligand binding domain
链 C
224–462(239 aa)
片段:ligand binding domain
链 D
224–462(239 aa)
片段:ligand binding domain
|
未记录 | WZ6 1-[3-(2-ethoxyethoxy)-5,5,8,8-tetramethyl-6,7-dihydronaphthalen-2-yl]-2-(trifluoromethyl)benzimidazole-5-carboxylic acid × 3 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;295 K;5% [v/v] tacsimateTM [pH 7.0], 0.1 M HEPES [pH 7.0], and 10% [w/v] PEGMME5000
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.266 |
| 7NKE Crystal structure of human RXRalpha ligand binding domain in complex with 2,4-di-tert-butylphenol and a coactivator fragment 提交 2021-02-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
223–462(240 aa)
链 C
223–462(240 aa)
|
未记录 | UGW 2,4-di~{tert}-butylphenol × 2 FMT FORMIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;20% PEG 3350
0.2 M sodium formate
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.246 |
| 7UW2 Crystal structure of human Retinoid X receptor alpha ligand binding domain complex with UAB116 and coactivator peptide GRIP-1 提交 2022-05-02 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
223–462(240 aa)
|
未记录 | OI2 (2E,4E,6Z,8E)-8-{3-[(2S)-butan-2-yl]-2-(3-methylbutyl)cyclohex-2-en-1-ylidene}-3,7-dimethylocta-2,4,6-trienoic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;100 mM Bis-Tris, pH 7.0, 8% PEG4000, 25% ethylene glycol. The drop contained 2 ul protein + 1 ul well solution
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.218 |
| 7UW4 Crystal structure of human Retinoid X receptor alpha ligand binding domain complex with UAB113 and coactivator peptide GRIP-1 提交 2022-05-02 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
223–462(240 aa)
|
未记录 | OI5 (2E,4E,6Z,8E)-3,7-dimethyl-8-[2-(3-methylbutyl)-3-propylcyclohex-2-en-1-ylidene]octa-2,4,6-trienoic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;100 mM Bis-Tris, pH 7.0, 7% PEG4000, 5% ethylene glycol
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.243 |
| 8HBM Structural basis of the farnesoid X receptor/retinoid X receptor heterodimer on inverted repeat DNA 提交 2022-10-29 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 A
130–212(83 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;100mM BTP pH 6.7, 10mM MgCl2, 50mM MgSO4, 50mM Li2SO4, 5mM DTT, 16% PEG 3350
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.301 |
| 8HBM Structural basis of the farnesoid X receptor/retinoid X receptor heterodimer on inverted repeat DNA 提交 2022-10-29 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 E
130–212(83 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;100mM BTP pH 6.7, 10mM MgCl2, 50mM MgSO4, 50mM Li2SO4, 5mM DTT, 16% PEG 3350
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.301 |
| 8PP0 Crystal structure of Retinoic Acid Receptor alpha (RXRA) in complexed with JP147 提交 2023-07-05 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
223–462(240 aa)
|
未记录 | 7QJ 3-[4-[2,3-dihydro-1H-inden-4-yl(methyl)amino]-6-(trifluoromethyl)pyrimidin-2-yl]oxypropanoic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;23% PEG 3350, 0.1 M Ammonium actetate, 0.1 M tris pH 7.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.223 |
| 9QJ9 Crystal Structure of the Human Retinoid X Receptor DNA-Binding Domain Bound to Trim16 IR1 Response Element 提交 2025-03-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 A
33–115(83 aa)
链 B
33–115(83 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;290 K;20% PEG 1000, 0.2M MgCl2 0.1M NaCl, 0.05M Na cacodylate pH6.5
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.335 |
| 9QX6 Crystal structure of RXR alpha LBD bound to a synthetic agonist FN537 and a coactivator fragment 提交 2025-04-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
229–462(234 aa)
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未记录 | A1JAT (6R,6aR,7S,10R,10aS)-6-(3,5-bis(trifluoromethyl)phenyl)-5,6,6a,7,8,9,10,10a-octahydro-7,10-methanophenanthridine-3-carboxylic acid × 1 A1JHO 6S,6aS,7R,10S,10aR)-6-(3,5-bis(trifluoromethyl)phenyl)-5,6,6a,7,8,9,10,10a-octahydro-7,10-methanophenanthridine-3-carboxylic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;20% PEG3350, 0.2M calcium acetate
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分辨率 1.46 Å R-free 0.213 |
| 9RMR Crystal structure of RXR alpha LBD bound to a synthetic agonist FN558 and a coactivator fragment 提交 2025-06-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
229–462(234 aa)
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未记录 | A1JH6 FN558 × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;20% PEG 3350, 0.1 M magnesium actetate
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分辨率 1.65 Å R-free 0.215 |
| 9S70 Crystal structure of RXR alpha LBD bound to a partial agonist 21 and a coactivator fragment SRC1 提交 2025-08-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
229–462(234 aa)
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未记录 | A1JL7 3-[[4-cyclobutyl-6-(3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)pyrimidin-2-yl]amino]propanoic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;20% PEG2000, 0.1M Mes pH 6.5
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分辨率 1.95 Å R-free 0.221 |
| 9S71 Crystal structure of RXR alpha LBD bound to a partial agonist 35 and a coactivator fragment SRC1 提交 2025-08-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
229–462(234 aa)
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未记录 | A1JL8 3-[[4-(4,4-dimethyl-2,3-dihydroquinolin-1-yl)-6-(trifluoromethyl)pyrimidin-2-yl]amino]propanoic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;18% PEG 4000 0.1 M MES pH 6.5
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分辨率 2.00 Å R-free 0.222 |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | RXRA_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–238; UniProt 225–462 |