SAXSdb — 1gmj

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATPASE INHIBITOR

BOS TAURUS

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 26–109 链 B； UniProt 26–109	突变：YES	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；296 K；CRYSTALS WERE GROWN BY EQUILIBRATING A IF1-H49K SOLUTION, AT 6 MG/ML IN BUFFER 10 MM TRIS-HCL PH 8.0, RESERVOIR CONTAINING 0.8 M MONO-SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHAT AGAINST A 0.8 M MONO-POTASSIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE AND 0.1 M HEPES-NA BUFFER PH 8, AT 23C, IN SITTING-DROP VAPOR-DIFFUSION TRAYS.	分辨率 2.20 Å R-free 0.280
2	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 26–109 链 D； UniProt 26–109	突变：YES	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；296 K；CRYSTALS WERE GROWN BY EQUILIBRATING A IF1-H49K SOLUTION, AT 6 MG/ML IN BUFFER 10 MM TRIS-HCL PH 8.0, RESERVOIR CONTAINING 0.8 M MONO-SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHAT AGAINST A 0.8 M MONO-POTASSIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE AND 0.1 M HEPES-NA BUFFER PH 8, AT 23C, IN SITTING-DROP VAPOR-DIFFUSION TRAYS.	分辨率 2.20 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1GMJ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1HF9 C-Terminal Coiled-Coil Domain from Bovine IF1 提交 2000-11-30	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 69–109（41 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN (44-84) 链 B 69–109（41 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN (44-84)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；300 K；压力 1	分辨率未提供
1OHH BOVINE MITOCHONDRIAL F1-ATPASE complexed with the inhibitor protein IF1 提交 2003-05-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 H 26–109（84 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.6；PROTEIN 20MG/ML IN 100MM PIPES-NAOH PH6.6, 40MM MGSO4, 0.04% NA AZIDE, 10% GLYCEROL, 0.002% PMSF. DROPS EQUAL VOLUME OF PROTEIN AND 10MM AMP-PNP, 300MM NACL, 16% PEG 4000, 5MM SPERMIDINE. BATCH METHOD., pH 6.60	分辨率 2.80 Å R-free 0.280
2V7Q The structure of F1-ATPase inhibited by I1-60HIS, a monomeric form of the inhibitor protein, IF1. 提交 2007-07-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 J 26–85（60 aa）片段：RESIDUES 26-85	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.2；pH 8.2	分辨率 2.10 Å R-free 0.245
4TSF The Pathway of Binding of the Intrinsically Disordered Mitochondrial Inhibitor Protein to F1-ATPase 提交 2014-06-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：Nonameric	链 H 26–85（60 aa）片段：UNP residues 26-85 链 I 26–85（60 aa）片段：UNP residues 26-85	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 8.2；295 K；Tris-HCl, PEG 4000, magnesium chloride, EDTA, NaCl, spermidine	分辨率 3.20 Å R-free 0.272
4TT3 The Pathway of Binding of the Intrinsically Disordered Mitochondrial Inhibitor Protein to F1-ATPase 提交 2014-06-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：Decameric	链 H 26–85（60 aa）片段：UNP residues 36-85 链 I 26–85（60 aa）片段：UNP residues 36-85 链 J 26–85（60 aa）片段：UNP residues 36-85	突变：K39A 突变：K39A 突变：K39A	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 GOL GLYCEROL × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 8.2；295 K；PEG 4000, Tris-HCl, magnesium chloride, EDTA, ATP, NaCl, spermidine	分辨率 3.21 Å R-free 0.283
4Z1M Bovine F1-ATPase inhibited by three copies of the inhibitor protein IF1 crystallised in the presence of thiophosphate. 提交 2015-03-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 H 26–85（60 aa）链 I 26–85（60 aa）链 J 26–85（60 aa）	突变：K39A 突变：K39A 突变：K39A	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 11 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；295 K；Tris.HCl, MgCl2, EDTA, sodium monothiophosphate, ATP NaCl, spermidine, PEG 4000	分辨率 3.30 Å R-free 0.275
6YY0 bovine ATP synthase F1-peripheral stalk domain, state 1 提交 2020-05-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 J 26–85（60 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 3.23 Å
6Z1R bovine ATP synthase F1-peripheral stalk domain, state 2 提交 2020-05-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 J 26–85（60 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 3.29 Å
6Z1U bovine ATP synthase F1c8-peripheral stalk domain, state 3 提交 2020-05-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 J 26–85（60 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 3.47 Å
6ZPO bovine ATP synthase monomer state 1 (combined) 提交 2020-07-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric	链 J 26–85（60 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 CDL CARDIOLIPIN × 3 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 4.00 Å
6ZQM bovine ATP synthase monomer state 2 (combined) 提交 2020-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric	链 J 26–85（60 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 CDL CARDIOLIPIN × 3 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 3.29 Å
6ZQN bovine ATP synthase monomer state 3 (combined) 提交 2020-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric	链 J 26–85（60 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 CDL CARDIOLIPIN × 3 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 4.00 Å
7AJB bovine ATP synthase dimer state1:state1 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 AJ 26–85（60 aa）链 J 26–85（60 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.20 Å
7AJC bovine ATP synthase dimer state1:state2 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 AJ 26–85（60 aa）链 J 26–85（60 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.90 Å
7AJD bovine ATP synthase dimer state1:state3 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 AJ 26–85（60 aa）链 J 26–85（60 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.00 Å
7AJE bovine ATP synthase dimer state2:state1 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 AJ 26–85（60 aa）链 J 26–85（60 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.40 Å
7AJF bovine ATP synthase dimer state2:state2 提交 2020-09-29	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 AJ 26–109（84 aa）链 J 26–109（84 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.45 Å
7AJG bovine ATP synthase dimer state2:state3 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 AJ 26–85（60 aa）链 J 26–85（60 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.70 Å
7AJH bovine ATP synthase dimer state3:state1 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 AJ 26–85（60 aa）链 J 26–85（60 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.70 Å
7AJI bovine ATP synthase dimer state3:state2 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 AJ 26–85（60 aa）链 J 26–85（60 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.40 Å
7AJJ bovine ATP synthase dimer state3:state3 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 AJ 26–85（60 aa）链 J 26–85（60 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 13.10 Å
9W2R Cryo-EM structure of FoF1-ATPase monomer state 1 on the bovine heart submitochondrial particles (FoF1-1) 提交 2025-07-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric	链 J 26–85（60 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9W2S Cryo-EM structure of FoF1-ATPase monomer state 3 on the bovine heart submitochondrial particles (FoF1-2) 提交 2025-07-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric	链 J 26–85（60 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IATP_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–84； UniProt 26–109 作者链 B； PDB构建体 1–84； UniProt 26–109 作者链 C； PDB构建体 1–84； UniProt 26–109 作者链 D； PDB构建体 1–84； UniProt 26–109

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1gmj
沉积日期 deposition_date	2001-09-14
结构标题 title	The structure of bovine IF1, the regulatory subunit of mitochondrial F-ATPase
关键词 keywords	ATPASE INHIBITOR, BOVINE F1-ATPASE INHIBITOR PROTEIN, COILED-COIL STRUCTURE, P DEPENDENT OLIGOMERIZATION, ATP HYDROLYSIS; ATPASE INHIBITOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	48.98 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	52.65 Å
零角强度 I(0) i0	14480900.00
分子量 molecular_weight	28874.0 kDa
排除体积 excluded_volume	35876 Å³
包络体积 envelope_volume	63346 Å³
水化壳体积 shell_volume	14327 Å³
包络直径 envelope_diameter	218.2 Å
壳层 Rg shell_rg	34.17 Å
包络 Rg envelope_rg	57.62 Å
形状 Rg shape_rg	52.66 Å
总 Rg total_rg	51.34 Å
总原子数 total_atoms	2037
残基数 n_residues	240
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	222.3 Å
Rg (实空间) rg_real	51.55 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	5.32 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.4480e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.2720e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	48.99 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	14430000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6001
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	20.8 Å
偏度 Skewness skewness	0.826
峰度 Kurtosis kurtosis	0.116
角度范围 angular_range	— – 0.1600 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	798300.0000
实空间数据点数 n_real_points	33
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.000; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.001; Smooth: 0.795

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d1gmja_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.4 — Antiparallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.4.8 — F1 ATPase inhibitor, IF1, C-terminal domain
家族 Family family	h.4.8.1 — F1 ATPase inhibitor, IF1, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d1gmjb_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.4 — Antiparallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.4.8 — F1 ATPase inhibitor, IF1, C-terminal domain
家族 Family family	h.4.8.1 — F1 ATPase inhibitor, IF1, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d1gmjc_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.4 — Antiparallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.4.8 — F1 ATPase inhibitor, IF1, C-terminal domain
家族 Family family	h.4.8.1 — F1 ATPase inhibitor, IF1, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d1gmjd_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.4 — Antiparallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.4.8 — F1 ATPase inhibitor, IF1, C-terminal domain
家族 Family family	h.4.8.1 — F1 ATPase inhibitor, IF1, C-terminal domain

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	1gmjA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	500 — Single helix bin

结构域编号 domain_id	1gmjB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	500 — Single helix bin

结构域编号 domain_id	1gmjC00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	500 — Single helix bin

结构域编号 domain_id	1gmjD00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	500 — Single helix bin

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8. 引用文献 (3)

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晶胞边长 a length_a	32.010 Å
晶胞边长 b length_b	53.290 Å
晶胞边长 c length_c	156.940 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	95.89 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.200 Å
最低分辨率 resolution_low	26.000 Å
R 因子 r_factor	0.2580
R_work r_work	0.2580
R_free r_free	0.2800

描述 description	ATPASE INHIBITOR
分子量 formula_weight	9595.6 kDa
突变 mutation	YES
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	2037

The structure of bovine IF1, the regulatory subunit of mitochondrial F-ATPase

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATPASE INHIBITOR

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

8. 引用文献 (3)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

来源生物 organism	BOS TAURUS
通用名 common_name	BOVINE
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9913
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI BL21(DE3)

fit	/app/data/saxs_computation/gm/1gmj/1gmj.fit
pddf	/app/data/pr_computation/gm/1gmj/1gmj.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/gm/1gmj/1gmj.dat