1hr8

Yeast Mitochondrial Processing Peptidase beta-E73Q Mutant Complexed with Cytochrome C Oxidase IV Signal Peptide

Method: X-RAY DIFFRACTION

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE ALPHA SUBUNIT

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P11914

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE BETA SUBUNIT × 1 （P10507） CYTOCHROME C OXIDASE POLYPEPTIDE IV × 1 （P04037） 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE BETA SUBUNIT × 1 （P10507） CYTOCHROME C OXIDASE POLYPEPTIDE IV × 1 （P04037） ZINC ION × 1 water × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE BETA SUBUNIT × 1 （P10507） CYTOCHROME C OXIDASE POLYPEPTIDE IV × 1 （P04037） ZINC ION × 1 water × 1	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE BETA SUBUNIT × 1 （P10507） CYTOCHROME C OXIDASE POLYPEPTIDE IV × 1 （P04037） 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 water × 1	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE BETA SUBUNIT × 4 （P10507） CYTOCHROME C OXIDASE POLYPEPTIDE IV × 4 （P04037） 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 ZINC ION × 4 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MPPA_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–469； UniProt 14–482 作者链 C； PDB构建体 1–469； UniProt 14–482 作者链 E； PDB构建体 1–469； UniProt 14–482 作者链 G； PDB构建体 1–469； UniProt 14–482

MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE BETA SUBUNIT

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P10507

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE ALPHA SUBUNIT × 1 （P11914） CYTOCHROME C OXIDASE POLYPEPTIDE IV × 1 （P04037） 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE ALPHA SUBUNIT × 1 （P11914） CYTOCHROME C OXIDASE POLYPEPTIDE IV × 1 （P04037） ZINC ION × 1 water × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE ALPHA SUBUNIT × 1 （P11914） CYTOCHROME C OXIDASE POLYPEPTIDE IV × 1 （P04037） ZINC ION × 1 water × 1	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE ALPHA SUBUNIT × 1 （P11914） CYTOCHROME C OXIDASE POLYPEPTIDE IV × 1 （P04037） 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 water × 1	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE ALPHA SUBUNIT × 4 （P11914） CYTOCHROME C OXIDASE POLYPEPTIDE IV × 4 （P04037） 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 ZINC ION × 4 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MPPB_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 2–443； UniProt 21–462 作者链 D； PDB构建体 2–443； UniProt 21–462 作者链 F； PDB构建体 2–443； UniProt 21–462 作者链 H； PDB构建体 2–443； UniProt 21–462

CYTOCHROME C OXIDASE POLYPEPTIDE IV

物种未注明

UniProt P04037

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE ALPHA SUBUNIT × 1 （P11914） MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE BETA SUBUNIT × 1 （P10507） 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE ALPHA SUBUNIT × 1 （P11914） MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE BETA SUBUNIT × 1 （P10507） ZINC ION × 1 water × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE ALPHA SUBUNIT × 1 （P11914） MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE BETA SUBUNIT × 1 （P10507） ZINC ION × 1 water × 1	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE ALPHA SUBUNIT × 1 （P11914） MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE BETA SUBUNIT × 1 （P10507） 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 ZINC ION × 1 water × 1	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE ALPHA SUBUNIT × 4 （P11914） MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE BETA SUBUNIT × 4 （P10507） 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 ZINC ION × 4 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	COX4_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–24； UniProt 2–25 作者链 P； PDB构建体 1–24； UniProt 2–25 作者链 Q； PDB构建体 1–24； UniProt 2–25 作者链 R； PDB构建体 1–24； UniProt 2–25

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1hr8
沉积日期 deposition_date	2000-12-21
结构标题 title	Yeast Mitochondrial Processing Peptidase beta-E73Q Mutant Complexed with Cytochrome C Oxidase IV Signal Peptide
关键词 keywords	HxxEH zinc-binding motif, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1hr8__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1hr8__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1hr8__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	30.25 Å
Rg（电子密度）	29.09 Å
总 Rg	29.92 Å
原子数	7036
残基数	904
排除体积	125200 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1hr8__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1hr8__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`1hr8__assembly_3__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`1hr8__assembly_4__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
5	1	`1hr8__assembly_5__model_1`	dodecameric （12）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE ALPHA SUBUNIT
分子量 formula_weight	52532.4 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.24.64
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,G
原子数 atom_count	27990

ARTDNFKLSSLANGLKVATSNTPGHFSALGLYIDAGSRFEGRNLKGCTHILDRLAFKSTEHVEGRAMAETLELLGGNYQCTSSRENLMYQASVFNQDVGKMLQLMSETVRFPKITEQELQEQKLSAEYEIDEVWMKPELVLPELLHTAAYSGETLGSPLICPRGLIPSISKYYLLDYRNKFYTPENTVAAFVGVPHEKALELTGKYLGDWQSTHPPITKKVAQYTGGESCIPPAPVFGNLPELFHIQIGFEGLPIDHPDIYALATLQTLLGGGGSFSAGGPGKGMYSRLYTHVLNQYYFVENCVAFNHSYSDSGIFGISLSCIPQAAPQAVEVIAQQMYNTFANKDLRLTEDEVSRAKNQLKSSLLMNLESKLVELEDMGRQVLMHGRKIPVNEMISKIEDLKPDDISRVAEMIFTGNVNNAGNGKGRATVVMQGDRGSFGDVENVLKAYGLGNSSSSKNDSPKKKGWFHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE BETA SUBUNIT
分子量 formula_weight	48894.0 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.24.64
突变 mutation	E73Q
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F,H

ASQIPGTRTSKLPNGLTIATEYIPNTSSATVGIFVDAGSRAENVKNNGTAHFLQHLAFKGTQNRPQQGIELEIENIGSHLNAYTSRENTVYYAKSLQEDIPKAVDILSDILTKSVLDNSAIERERDVIIRESEEVDKMYDEVVFDHLHEITYKDQPLGRTILGPIKNIKSITRTDLKDYITKNYKGDRMVLAGAGAVDHEKLVQYAQKYFGHVPKSESPVPLGSPRGPLPVFCRGERFIKENTLPTTHIAIALEGVSWSAPDYFVALATQAIVGNWDRAIGTGTNSPSPLAVAASQNGSLANSYMSFSTSYADSGLWGMYIVTDSNEHNVRLIVNEILKEWKRIKSGKISDAEVNRAKAQLKAALLLSLDGSTAIVEDIGRQVVTTGKRLSPEEVFEQVDKITKDDIIMWANYRLQNKPVSMVALGNTSTVPNVSYIEEKLNQ

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	CYTOCHROME C OXIDASE POLYPEPTIDE IV
分子量 formula_weight	2862.4 kDa
EC 编号 ec_number	1.9.3.1
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O,P,Q,R

LSLRQSIRFFKPATRTLCSSRYLL

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID
分子量 formula_weight	238.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 34 domains

SCOP 2.08 (18 domains)

结构域编号 domain_id	d1hr8a1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.185 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
超家族 Superfamily superfamily	d.185.1 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
家族 Family family	d.185.1.1 — MPP-like

结构域编号 domain_id	d1hr8a2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.185 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
超家族 Superfamily superfamily	d.185.1 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
家族 Family family	d.185.1.1 — MPP-like

结构域编号 domain_id	d1hr8b1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.185 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
超家族 Superfamily superfamily	d.185.1 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
家族 Family family	d.185.1.1 — MPP-like

结构域编号 domain_id	d1hr8b2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.185 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
超家族 Superfamily superfamily	d.185.1 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
家族 Family family	d.185.1.1 — MPP-like

结构域编号 domain_id	d1hr8c1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.185 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
超家族 Superfamily superfamily	d.185.1 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
家族 Family family	d.185.1.1 — MPP-like

结构域编号 domain_id	d1hr8c2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.185 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
超家族 Superfamily superfamily	d.185.1 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
家族 Family family	d.185.1.1 — MPP-like

结构域编号 domain_id	d1hr8d1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.185 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
超家族 Superfamily superfamily	d.185.1 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
家族 Family family	d.185.1.1 — MPP-like

结构域编号 domain_id	d1hr8d2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.185 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
超家族 Superfamily superfamily	d.185.1 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
家族 Family family	d.185.1.1 — MPP-like

结构域编号 domain_id	d1hr8d3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d1hr8e1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.185 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
超家族 Superfamily superfamily	d.185.1 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
家族 Family family	d.185.1.1 — MPP-like

结构域编号 domain_id	d1hr8e2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.185 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
超家族 Superfamily superfamily	d.185.1 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
家族 Family family	d.185.1.1 — MPP-like

结构域编号 domain_id	d1hr8f1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.185 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
超家族 Superfamily superfamily	d.185.1 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
家族 Family family	d.185.1.1 — MPP-like

结构域编号 domain_id	d1hr8f2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.185 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
超家族 Superfamily superfamily	d.185.1 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
家族 Family family	d.185.1.1 — MPP-like

结构域编号 domain_id	d1hr8f3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d1hr8g1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.185 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
超家族 Superfamily superfamily	d.185.1 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
家族 Family family	d.185.1.1 — MPP-like

结构域编号 domain_id	d1hr8g2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.185 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
超家族 Superfamily superfamily	d.185.1 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
家族 Family family	d.185.1.1 — MPP-like

结构域编号 domain_id	d1hr8h1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.185 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
超家族 Superfamily superfamily	d.185.1 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
家族 Family family	d.185.1.1 — MPP-like

结构域编号 domain_id	d1hr8h2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.185 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
超家族 Superfamily superfamily	d.185.1 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
家族 Family family	d.185.1.1 — MPP-like

CATH v4.4 (16 domains)

结构域编号 domain_id	1hr8A01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	830 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like

结构域编号 domain_id	1hr8A02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	830 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like

结构域编号 domain_id	1hr8B01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	830 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like

结构域编号 domain_id	1hr8B02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	830 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like

结构域编号 domain_id	1hr8C01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	830 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like

结构域编号 domain_id	1hr8C02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	830 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like

结构域编号 domain_id	1hr8D01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	830 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like

结构域编号 domain_id	1hr8D02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	830 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like

结构域编号 domain_id	1hr8E01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	830 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like

结构域编号 domain_id	1hr8E02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	830 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like

结构域编号 domain_id	1hr8F01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	830 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like

结构域编号 domain_id	1hr8F02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	830 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like

结构域编号 domain_id	1hr8G01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	830 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like

结构域编号 domain_id	1hr8G02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	830 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like

结构域编号 domain_id	1hr8H01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	830 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like

结构域编号 domain_id	1hr8H02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	830 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like

▶

晶胞边长 a length_a	134.260 Å
晶胞边长 b length_b	178.120 Å
晶胞边长 c length_c	202.210 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.700 Å
最低分辨率 resolution_low	48.630 Å
R 因子 r_factor	0.2290
R_work r_work	0.2290
R_free r_free	0.2640

Yeast Mitochondrial Processing Peptidase beta-E73Q Mutant Complexed with Cytochrome C Oxidase IV Signal Peptide

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE ALPHA SUBUNIT

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE BETA SUBUNIT

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

CYTOCHROME C OXIDASE POLYPEPTIDE IV

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1hr8__assembly_1__model_1

1hr8__assembly_1__model_1 | I(q)

1hr8__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 34 domains

SCOP 2.08 (18 domains)

CATH v4.4 (16 domains)

7. 引用文献 (1)

Yeast Mitochondrial Processing Peptidase beta-E73Q Mutant Complexed with Cytochrome C Oxidase IV Signal Peptide

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE ALPHA SUBUNIT

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

MITOCHONDRIAL PROCESSING PEPTIDASE BETA SUBUNIT

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

CYTOCHROME C OXIDASE POLYPEPTIDE IV

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1hr8__assembly_1__model_1

1hr8__assembly_1__model_1 | I(q)

1hr8__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 34 domains

SCOP 2.08 (18 domains)

CATH v4.4 (16 domains)

7. 引用文献 (1)