SAXSdb — 1igc

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

IGG1-KAPPA MOPC21 FAB (LIGHT CHAIN)

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	IGG1-KAPPA MOPC21 FAB (HEAVY CHAIN) × 1 （P01783） STREPTOCOCCAL PROTEIN G (DOMAIN III) × 1 （P06654） water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KV5B_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–213； UniProt 30–136

IGG1-KAPPA MOPC21 FAB (HEAVY CHAIN)

Mus musculus

UniProt P01783

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	IGG1-KAPPA MOPC21 FAB (LIGHT CHAIN) × 1 （P01634） STREPTOCOCCAL PROTEIN G (DOMAIN III) × 1 （P06654） water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HV16_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 4–220； UniProt 17–136

STREPTOCOCCAL PROTEIN G (DOMAIN III)

Streptococcus sp. G148

UniProt P06654

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	IGG1-KAPPA MOPC21 FAB (LIGHT CHAIN) × 1 （P01634） IGG1-KAPPA MOPC21 FAB (HEAVY CHAIN) × 1 （P01783） water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SPG1_STRSG
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–61； UniProt 293–352

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1igc
沉积日期 deposition_date	1994-08-05
结构标题 title	IGG1 FAB FRAGMENT (MOPC21) COMPLEX WITH DOMAIN III OF PROTEIN G FROM STREPTOCOCCUS
关键词 keywords	PROTEIN G, STREPTOCOCCUS, COMPLEX (ANTIBODY-BINDING PROTEIN) COMPLEX; COMPLEX (ANTIBODY/BINDING PROTEIN)
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1igc__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1igc__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1igc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	25.98 Å
Rg（电子密度）	24.97 Å
总 Rg	25.80 Å
原子数	3772
残基数	493
排除体积	66547 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1igc__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	IGG1-KAPPA MOPC21 FAB (LIGHT CHAIN)
分子量 formula_weight	23556.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L
原子数 atom_count	4117

NIVMTQSPKSMSMSVGERVTLTCKASENVVTYVSWYQQKPEQSPKLLIYGASNRYTGVPDRFTGSGSATDFTLTISSVQAEDLADYHCGQGNSYPYTFGGGTKLEIKRADAAPTVSIFPPSSEQLTSGGASVVCFLNNFYPKDINVKWKIDSERQNGVLNSWTDQDSKDSTYSMSSTLTLTKDEYERHNSYTCEATHKTSTSPIVKSFNRNEC

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	house mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	IGG1-KAPPA MOPC21 FAB (HEAVY CHAIN)
分子量 formula_weight	23856.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

DVQLVESGGGLVQPGGSRKLSCAASGFTFSSFGMHWVRQAPEKGLEWVAYISSGSSTLHYADTVKGRFTISRDNPKNTLFLQMTSLRSEDTGMYYCARWGNYPYYAMDYWGQGTSVTVSSAKTTPPSVYPLAPGSAAQTNSMVTLGCLVKGYFPEPVTVTWNSGSLSSGVHTFPAVLQSDLYTLSSSVTVPSSPRPSETVTCNVAHPASSTKVDKKIVPRDC

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	house mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	STREPTOCOCCAL PROTEIN G (DOMAIN III)
分子量 formula_weight	6657.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

MTPAVTTYKLVINGKTLKGETTTKAVDAETAEKAFKQYANDNGVDGVWTYDDATKTFTVTE

来源 Source

来源生物 organism	Streptococcus sp. G148
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1324
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	345

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

结构域编号 domain_id	d1igca_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.7 — Immunoglobulin-binding domains
家族 Family family	d.15.7.1 — Immunoglobulin-binding domains

结构域编号 domain_id	d1igch1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

结构域编号 domain_id	d1igch2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

结构域编号 domain_id	d1igcl1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

结构域编号 domain_id	d1igcl2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

CATH v4.4 (5 domains)

结构域编号 domain_id	1igcA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	1igcH01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1igcH02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1igcL01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1igcL02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

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7. 引用文献 (7)

;The third IgG-binding domain from streptococcal protein G. An analysis by X-ray crystallography of the structure alone and in a complex with Fab. ;

J.Mol.Biol. (1994)

PMID: 7966308 · DOI: 10.1006/jmbi.1994.1691 PRIMARY

Two Crystal Structures of the B1 Immunoglobulin-Binding Domain of Streptococcal Protein G and Comparison with NMR

Biochemistry (1994)

Crystal Structure of a Streptococcal Protein G Domain Bound to an Fab Fragment

Nature (1992)

;Crystallization and Preliminary Analysis of the Complex between a Mouse Fab Fragment and a Single Igg-Binding Domain from Streptococcal Protein G ;

J.Mol.Biol. (1992)

Determination of the Solution Structures of Domains II and III of Protein G from Streptococcus by 1H Nuclear Magnetic Resonance

J.Mol.Biol. (1992)

;1.67 Angstroms X-Ray Structure of the B2 Immunoglobulin-Binding Domain of Streptococcal Protein G and Comparison to the NMR Structure of the B1 Domain ;

Biochemistry (1992)

A Novel, Highly Stable Fold of the Immunoglobulin Binding Domain of Streptococcal Protein G

Science (1991)

晶胞边长 a length_a	64.500 Å
晶胞边长 b length_b	70.500 Å
晶胞边长 c length_c	120.100 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.600 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	0.1680
R_work r_work	—
R_free r_free	—

IGG1 FAB FRAGMENT (MOPC21) COMPLEX WITH DOMAIN III OF PROTEIN G FROM STREPTOCOCCUS

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

IGG1-KAPPA MOPC21 FAB (LIGHT CHAIN)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

IGG1-KAPPA MOPC21 FAB (HEAVY CHAIN)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

STREPTOCOCCAL PROTEIN G (DOMAIN III)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1igc__assembly_1__model_1

1igc__assembly_1__model_1 | I(q)

1igc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

CATH v4.4 (5 domains)

7. 引用文献 (7)

IGG1 FAB FRAGMENT (MOPC21) COMPLEX WITH DOMAIN III OF PROTEIN G FROM STREPTOCOCCUS

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

IGG1-KAPPA MOPC21 FAB (LIGHT CHAIN)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

IGG1-KAPPA MOPC21 FAB (HEAVY CHAIN)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

STREPTOCOCCAL PROTEIN G (DOMAIN III)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1igc__assembly_1__model_1

1igc__assembly_1__model_1 | I(q)

1igc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

CATH v4.4 (5 domains)

7. 引用文献 (7)