1jaa

Solution structure of lactam analogue (DapE) of HIV gp41 600-612 loop.

Method: SOLUTION NMR

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DapE : (Ace)IWG(Dap)SGKLIETTA ANALOGUE OF HIV GP41

物种未注明

UniProt P12488

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ENV_HV1BN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 2–14; UniProt 591–603

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1jaa
沉积日期 deposition_date2001-05-30
结构标题 titleSolution structure of lactam analogue (DapE) of HIV gp41 600-612 loop.
关键词 keywordslactam bond, cyclic peptide, peptidomimetics, gp41, HIV, Viral protein; VIRAL PROTEIN
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1jaa__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1jaa__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 104 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1jaa__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)7.66 Å
Rg(电子密度)6.37 Å
总 Rg8.45 Å
原子数199
残基数12
排除体积1791 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1jaa__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 1jaa__assembly_1__model_2 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 1jaa__assembly_1__model_3 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 1jaa__assembly_1__model_4 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 1jaa__assembly_1__model_5 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 1jaa__assembly_1__model_6 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 1jaa__assembly_1__model_7 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 1jaa__assembly_1__model_8 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 1jaa__assembly_1__model_9 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 1jaa__assembly_1__model_10 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 1jaa__assembly_1__model_11 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 1jaa__assembly_1__model_12 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 1jaa__assembly_1__model_13 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 14 1jaa__assembly_1__model_14 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 15 1jaa__assembly_1__model_15 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 16 1jaa__assembly_1__model_16 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 17 1jaa__assembly_1__model_17 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 18 1jaa__assembly_1__model_18 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 19 1jaa__assembly_1__model_19 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 20 1jaa__assembly_1__model_20 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 21 1jaa__assembly_1__model_21 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 22 1jaa__assembly_1__model_22 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 23 1jaa__assembly_1__model_23 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 24 1jaa__assembly_1__model_24 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 25 1jaa__assembly_1__model_25 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 26 1jaa__assembly_1__model_26 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 27 1jaa__assembly_1__model_27 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 28 1jaa__assembly_1__model_28 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 29 1jaa__assembly_1__model_29 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 30 1jaa__assembly_1__model_30 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 31 1jaa__assembly_1__model_31 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 32 1jaa__assembly_1__model_32 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 33 1jaa__assembly_1__model_33 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 34 1jaa__assembly_1__model_34 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 35 1jaa__assembly_1__model_35 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 36 1jaa__assembly_1__model_36 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 37 1jaa__assembly_1__model_37 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 38 1jaa__assembly_1__model_38 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 39 1jaa__assembly_1__model_39 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 40 1jaa__assembly_1__model_40 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 41 1jaa__assembly_1__model_41 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 42 1jaa__assembly_1__model_42 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 43 1jaa__assembly_1__model_43 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 44 1jaa__assembly_1__model_44 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 45 1jaa__assembly_1__model_45 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 46 1jaa__assembly_1__model_46 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 47 1jaa__assembly_1__model_47 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 48 1jaa__assembly_1__model_48 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 49 1jaa__assembly_1__model_49 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 50 1jaa__assembly_1__model_50 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1jaaa_
类 Class classj — Peptides
折叠类型 Fold foldj.85 — HIV-1 gp41 fragments
超家族 Superfamily superfamilyj.85.1 — HIV-1 gp41 fragments
家族 Family familyj.85.1.1 — HIV-1 gp41 fragments

7. 引用文献 (1)