SAXSdb — 1kmi

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chemotaxis protein cheY

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Chemotaxis protein cheZ × 2 （P0A9H9） MAGNESIUM ION × 2 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 BICINE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CHEY_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 Y； PDB构建体 1–129； UniProt 0–128

Chemotaxis protein cheZ

物种未注明

UniProt P0A9H9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Chemotaxis protein cheY × 2 （P06143） MAGNESIUM ION × 2 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 BICINE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CHEZ_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 Z； PDB构建体 1–214； UniProt 1–214

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1kmi
沉积日期 deposition_date	2001-12-16
结构标题 title	CRYSTAL STRUCTURE OF AN E.COLI CHEMOTAXIS PROTEIN, CHEZ
关键词 keywords	four-helix bundle, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1kmi__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1kmi__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1kmi__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	33.62 Å
Rg（电子密度）	33.50 Å
总 Rg	33.68 Å
原子数	4770
残基数	610
排除体积	85003 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1kmi__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Chemotaxis protein cheY
分子量 formula_weight	14112.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y
原子数 atom_count	2385

MADKELKFLVVDDFSTMRRIVRNLLKELGFNNVEEAEDGVDALNKLQAGGYGFVISDWNMPNMDGLELLKTIRADGAMSALPVLMVTAEAKKENIIAAAQAGASGYVVKPFTAATLEEKLNKIFEKLGM

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Chemotaxis protein cheZ
分子量 formula_weight	23999.0 kDa
突变 mutation	E134K
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z

MMQPSIKPADEHSAGDIIARIGSLTRMLRDSLRELGLDQAIAEAAEAIPDARDRLYYVVQMTAQAAERALNSVEASQPHQDQMEKSAKALTQRWDDWFADPIDLADARELVTDTRQFLADVPAHTSFTNAQLLKIMMAQDFQDLTGQVIKRMMDVIQEIERQLLMVLLENIPEQESRPKRENQSLLNGPQVDTSKAGVVASQDQVDDLLDSLGF

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION
分子量 formula_weight	66.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	BICINE
分子量 formula_weight	163.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d1kmiy_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	c.23.1 — CheY-like
家族 Family family	c.23.1.1 — CheY-related

结构域编号 domain_id	d1kmiz_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.4 — Antiparallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.4.11 — Chemotaxis phosphatase CheZ
家族 Family family	h.4.11.1 — Chemotaxis phosphatase CheZ

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	1kmiY00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2300 — Response regulator

结构域编号 domain_id	1kmiZ01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	590 — Single helix bin

结构域编号 domain_id	1kmiZ02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	500 — Helix hairpin bin

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晶胞边长 a length_a	163.280 Å
晶胞边长 b length_b	163.280 Å
晶胞边长 c length_c	54.133 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 43 21 2
空间群编号 int_tables_number	96
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.900 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2790
R_free r_free	0.2980

CRYSTAL STRUCTURE OF AN E.COLI CHEMOTAXIS PROTEIN, CHEZ

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chemotaxis protein cheY

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Chemotaxis protein cheZ

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1kmi__assembly_1__model_1

1kmi__assembly_1__model_1 | I(q)

1kmi__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)

CRYSTAL STRUCTURE OF AN E.COLI CHEMOTAXIS PROTEIN, CHEZ

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chemotaxis protein cheY

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Chemotaxis protein cheZ

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1kmi__assembly_1__model_1

1kmi__assembly_1__model_1 | I(q)

1kmi__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)