1orq

X-ray structure of a voltage-dependent potassium channel in complex with an Fab

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

6E1 Fab light chain

物种未注明

UniProt P01837

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 12 6E1 Fab heavy chain × 4 (P01865) potassium channel × 4 (Q9YDF8) CADMIUM ION × 28 POTASSIUM ION × 24 water × 12 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 24 6E1 Fab heavy chain × 8 (P01865) potassium channel × 8 (Q9YDF8) CADMIUM ION × 56 POTASSIUM ION × 48 water × 24 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 KAC_MOUSE
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 110–215; UniProt 1–106

6E1 Fab heavy chain

物种未注明

UniProt P01865

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 12 6E1 Fab light chain × 4 (P01837) potassium channel × 4 (Q9YDF8) CADMIUM ION × 28 POTASSIUM ION × 24 water × 12 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 24 6E1 Fab light chain × 8 (P01837) potassium channel × 8 (Q9YDF8) CADMIUM ION × 56 POTASSIUM ION × 48 water × 24 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GCAM_MOUSE
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 120–218; UniProt 1–99

potassium channel

Aeropyrum pernix

UniProt Q9YDF8

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 12 6E1 Fab light chain × 4 (P01837) 6E1 Fab heavy chain × 4 (P01865) CADMIUM ION × 28 POTASSIUM ION × 24 water × 12 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 24 6E1 Fab light chain × 8 (P01837) 6E1 Fab heavy chain × 8 (P01865) CADMIUM ION × 56 POTASSIUM ION × 48 water × 24 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 KVAP_AERPE
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–223; UniProt 31–253

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1orq
沉积日期 deposition_date2003-03-14
结构标题 titleX-ray structure of a voltage-dependent potassium channel in complex with an Fab
关键词 keywordspotassium channel, voltage-dependent, KvAP, Fab complex, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1orq__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1orq__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1orq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)56.85 Å
Rg(电子密度)55.53 Å
总 Rg55.65 Å
原子数20194
残基数2628
排除体积363130 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1orq__assembly_1__model_1 dodecameric (12) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1orq__assembly_2__model_1 24-meric (24) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

结构域编号 domain_idd1orqa1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family familyb.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)
结构域编号 domain_idd1orqa2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family familyb.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)
结构域编号 domain_idd1orqb1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family familyb.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)
结构域编号 domain_idd1orqb2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family familyb.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)
结构域编号 domain_idd1orqc_
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.14 — Gated ion channels
超家族 Superfamily superfamilyf.14.1 — Voltage-gated ion channels
家族 Family familyf.14.1.1 — Voltage-gated potassium channels

CATH v4.4 (5 domains)

结构域编号 domain_id1orqA01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id1orqA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id1orqB01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id1orqB02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id1orqC01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily70 —
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7. 引用文献 (1)