1orq

X-ray structure of a voltage-dependent potassium channel in complex with an Fab

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 110.0 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

6E1 Fab light chain

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–106	未记录	6E1 Fab heavy chain × 4 （P01865） potassium channel × 4 （Q9YDF8） CD CADMIUM ION × 28 K POTASSIUM ION × 24	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；PEG400, Cadmium chloride, Sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.298
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–106	未记录	6E1 Fab heavy chain × 8 （P01865） potassium channel × 8 （Q9YDF8） CD CADMIUM ION × 56 K POTASSIUM ION × 48	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；PEG400, Cadmium chloride, Sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.298

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1ORQ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
15C8 CATALYTIC ANTIBODY 5C8, FREE FAB 提交 1998-03-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 24–235（212 aa）片段：FAB	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.251
1AHW A COMPLEX OF EXTRACELLULAR DOMAIN OF TISSUE FACTOR WITH AN INHIBITORY FAB (5G9) 提交 1997-04-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–214（214 aa）片段：LIGHT CHAIN RESIDUES 1 - 214 链 D 1–214（214 aa）片段：LIGHT CHAIN RESIDUES 1 - 214	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；TF-5G9 CRYSTAL WERE GROWN IN 1.7-2.0M AMMONIUM SULFATE, 0.1M SODIUM CITRATE, PH 5.0-5.5, 0.2% 2-METHYL-2,4-PENTANE-DIOL (MPD), AND 2% PEG 600 AT AN EQUIMOLAR 5G9:TF RATIO. THE CRYSTALS GREW EXTREMELY SLOWLY, TAKING 6-9 MONTHS TO REACH A MAXIMAL SIZE OF 0.4 X 0.4 X 0.8 MM3., pH 7.0	分辨率 3.00 Å R-free 0.285
1AIF ANTI-IDIOTYPIC FAB 409.5.3 (IGG2A) FAB FROM MOUSE 提交 1994-11-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 1–213（213 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.90 Å
1AIF ANTI-IDIOTYPIC FAB 409.5.3 (IGG2A) FAB FROM MOUSE 提交 1994-11-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–213（213 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.90 Å
1F11 F124 FAB FRAGMENT FROM A MONOCLONAL ANTI-PRES2 ANTIBODY 提交 2000-05-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–106（106 aa）片段：FAB FRAGMENT (UNP P01665 residues 1-111, P01837 residues 1-106)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；290 K；PEG 400, sodium acetate, ammonium sulfate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 3.00 Å R-free 0.271
1F11 F124 FAB FRAGMENT FROM A MONOCLONAL ANTI-PRES2 ANTIBODY 提交 2000-05-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–106（106 aa）片段：FAB FRAGMENT (UNP P01665 residues 1-111, P01837 residues 1-106)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；290 K；PEG 400, sodium acetate, ammonium sulfate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 3.00 Å R-free 0.271
1FAI THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF TWO CRYSTAL FORMS OF FAB R19.9, FROM A MONOCLONAL ANTI-ARSONATE ANTIBODY 提交 1992-05-27	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 1–106（106 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.70 Å
1FSK COMPLEX FORMATION BETWEEN A FAB FRAGMENT OF A MONOCLONAL IGG ANTIBODY AND THE MAJOR ALLERGEN FROM BIRCH POLLEN BET V 1 提交 2000-09-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–106（106 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；300 K；12% peg 6000, 0.1M sodium citrate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 2.90 Å R-free 0.285
1FSK COMPLEX FORMATION BETWEEN A FAB FRAGMENT OF A MONOCLONAL IGG ANTIBODY AND THE MAJOR ALLERGEN FROM BIRCH POLLEN BET V 1 提交 2000-09-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 1–106（106 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；300 K；12% peg 6000, 0.1M sodium citrate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 2.90 Å R-free 0.285
1FSK COMPLEX FORMATION BETWEEN A FAB FRAGMENT OF A MONOCLONAL IGG ANTIBODY AND THE MAJOR ALLERGEN FROM BIRCH POLLEN BET V 1 提交 2000-09-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 1–106（106 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；300 K；12% peg 6000, 0.1M sodium citrate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 2.90 Å R-free 0.285
1FSK COMPLEX FORMATION BETWEEN A FAB FRAGMENT OF A MONOCLONAL IGG ANTIBODY AND THE MAJOR ALLERGEN FROM BIRCH POLLEN BET V 1 提交 2000-09-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 K 1–106（106 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；300 K；12% peg 6000, 0.1M sodium citrate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 2.90 Å R-free 0.285
1GPO CRYSTAL STRUCTURE OF THE RATIONALLY DESIGNED ANTIBODY M41 AS A FAB FRAGMENT 提交 1997-03-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 1–106（106 aa）片段：FAB FRAGMENT	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；2.0 M AMMONIUM SULFATE, 5 % DMSO, 0.1 M CACODYLATE PH 6.5	分辨率 1.95 Å R-free 0.283
1GPO CRYSTAL STRUCTURE OF THE RATIONALLY DESIGNED ANTIBODY M41 AS A FAB FRAGMENT 提交 1997-03-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 M 1–106（106 aa）片段：FAB FRAGMENT	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；2.0 M AMMONIUM SULFATE, 5 % DMSO, 0.1 M CACODYLATE PH 6.5	分辨率 1.95 Å R-free 0.283
1KB5 MURINE T-CELL RECEPTOR VARIABLE DOMAIN/FAB COMPLEX 提交 1997-04-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 L 1–106（106 aa）片段：FAB	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.2；15% PEG6000, 100MM HEPES PH 6.9-7.5, 200MM NACL, 0.1% NAN3, pH 7.2	分辨率 2.50 Å
1KCR CRYSTAL STRUCTURE OF ANTIBODY PC283 IN COMPLEX WITH PS1 PEPTIDE 提交 2001-11-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 L 1–106（106 aa）片段：light chain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；300 K；18% PEG 3K, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 2.90 Å R-free 0.277
1KCS CRYSTAL STRUCTURE OF ANTIBODY PC282 IN COMPLEX WITH PS1 PEPTIDE 提交 2001-11-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 L 1–106（106 aa）片段：light chain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；300 K；20% PEG 8K, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 2.50 Å R-free 0.277
1KCU CRYSTAL STRUCTURE OF ANTIBODY PC287 提交 2001-11-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 1–106（106 aa）片段：light chain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；300 K；15% PEG 8K, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 2.20 Å R-free 0.249
1KCV Crystal structure of antibody pc282 提交 2001-11-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 1–106（106 aa）片段：light chain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；300 K；10 % PEG 3K, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 1.80 Å R-free 0.233
1LO0 Catalytic Retro-Diels-Alderase Transition State Analogue Complex 提交 2002-05-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 X 1–106（106 aa）片段：Fab fragment	未记录	BC1 3-{[(9-CYANO-9,10-DIHYDRO-10-METHYLACRIDIN-9-YL)CARBONYL]AMINO}PROPANOIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；290 K；PEG, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 2.00 Å R-free 0.255
1LO0 Catalytic Retro-Diels-Alderase Transition State Analogue Complex 提交 2002-05-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 1–106（106 aa）片段：Fab fragment	未记录	BC1 3-{[(9-CYANO-9,10-DIHYDRO-10-METHYLACRIDIN-9-YL)CARBONYL]AMINO}PROPANOIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；290 K；PEG, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 2.00 Å R-free 0.255
1MLB MONOCLONAL ANTIBODY FAB D44.1 RAISED AGAINST CHICKEN EGG-WHITE LYSOZYME 提交 1995-03-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–106（106 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.10 Å R-free 0.274
1NBY Crystal Structure of HyHEL-63 complexed with HEL mutant K96A 提交 2002-12-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–106（106 aa）片段：light chain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；PEG 4000, AMMONIUM ACETATE, SODIUM ACETATE, pH 4.60, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 1.80 Å R-free 0.250
1NDG Crystal structure of Fab fragment of antibody HyHEL-8 complexed with its antigen lysozyme 提交 2002-12-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–106（106 aa）片段：light chain	未记录	ACY ACETIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 1.90 Å R-free 0.249
1NDM Crystal structure of Fab fragment of antibody HyHEL-26 complexed with lysozyme 提交 2002-12-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–106（106 aa）片段：light chain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.10 Å R-free 0.258
1ORS X-ray structure of the KvAP potassium channel voltage sensor in complex with an Fab 提交 2003-03-14	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–106（106 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；PEG4000, Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.251
1PSK THE CRYSTAL STRUCTURE OF AN FAB FRAGMENT THAT BINDS TO THE MELANOMA-ASSOCIATED GD2 GANGLIOSIDE 提交 1997-03-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 1–106（106 aa）片段：FAB	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；30% (W/V) PEG 4000, 1% MPD, TRIS BUFFER, PH 7.5	分辨率 2.80 Å R-free 0.326
25C8 CATALYTIC ANTIBODY 5C8, FAB-HAPTEN COMPLEX 提交 1998-03-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 24–234（211 aa）片段：FAB	未记录	GEP N-METHYL-N-(PARA-GLUTARAMIDOPHENYL-ETHYL)-PIPERIDINIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.5	分辨率 2.00 Å R-free 0.292
2F19 THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF TWO CRYSTAL FORMS OF FAB R19.9, FROM A MONOCLONAL ANTI-ARSONATE ANTIBODY 提交 1992-05-27	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 1–106（106 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.80 Å
2MPA BACTERICIDAL ANTIBODY AGAINST NEISSERIA MENINGITIDIS 提交 1999-06-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 L 8–106（99 aa）片段：FAB FRAGMENT	未记录	CD CADMIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；THE MN12H2 FAB PEPTIDE COMPLEX WAS CRYSTALLIZED FROM 15% W/V PEG 20000, 100 MM SODIUM ACETATE, PH 4.6, 20 MM CDCL2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.60 Å R-free 0.264
4ZXB Structure of the human insulin receptor ectodomain, IRDeltabeta construct, in complex with four Fab molecules 提交 2015-05-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 B 1–106（106 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Crystals were produced by vapour diffusion using 1 microlitre of the complex (2.6 mg/ml) in 10 mM HEPES (pH 7.5), 0.02% sodium azide and 10% D-trehalose solution and 1 microlitres of well solution containing 10% PEG 8000, 0.1 M MES (pH 6.5) and 0.1 M MgAc2.	分辨率 3.30 Å R-free 0.237
6FAB THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF MURINE ANTI-P-AZOPHENYLARSONATE FAB 36-71. 1. X-RAY CRYSTALLOGRAPHY, SITE-DIRECTED MUTAGENESIS, AND MODELING OF THE COMPLEX WITH HAPTEN 提交 1991-01-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 1–106（106 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å
8XKK Ckappa domain of mouse immunoglobulin 提交 2023-12-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–106（105 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）Not defined；压力 1 NMR样品组成 1.6 mM [U-13C; U-15N] Ckappa domain of mouse immunoglobulin, 5 mM NaPi, 50 mM sodium chloride, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1.6 mM [U-13C; U-15N] Ckappa domain of mouse immunoglobulin, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1.6 mM [U-13C; U-15N] Ckappa domain of mouse immunoglobulin, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供

共 25 个其他 PDB 条目、32 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KAC_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 110–215； UniProt 1–106

6E1 Fab heavy chain

物种未注明

UniProt P01865

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–99	未记录	6E1 Fab light chain × 4 （P01837） potassium channel × 4 （Q9YDF8） CD CADMIUM ION × 28 K POTASSIUM ION × 24	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；PEG400, Cadmium chloride, Sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.298
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–99	未记录	6E1 Fab light chain × 8 （P01837） potassium channel × 8 （Q9YDF8） CD CADMIUM ION × 56 K POTASSIUM ION × 48	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；PEG400, Cadmium chloride, Sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.298

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 1ORQ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AXT IMMUNE VERSUS NATURAL SELECTION: ANTIBODY ALDOLASES WITH THE RATES OF NATURAL ENZYMES 提交 1997-10-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–100（100 aa）片段：;FAB' FRAGMENT 33F12 ;	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 18% PEG 4000, 10% ISOPROPANOL, 100 MM HEPES, PH 7.4.	分辨率 2.15 Å R-free 0.317
1EGJ DOMAIN 4 OF THE BETA COMMON CHAIN IN COMPLEX WITH AN ANTIBODY 提交 2000-02-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 1–220（220 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；12% peg 4000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 22K	分辨率 2.80 Å R-free 0.288
1FLR 4-4-20 FAB FRAGMENT 提交 1995-01-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–101（101 aa）	未记录	FLU 2-(6-HYDROXY-3-OXO-3H-XANTHEN-9-YL)-BENZOIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.85 Å
1FPT THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN THE FAB FRAGMENT OF AN NEUTRALIZING ANTIBODY FOR TYPE 1 POLIOVIRUS AND ITS VIRAL EPITOPE 提交 1995-01-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 1–100（100 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å
1GGB MAJOR ANTIGEN-INDUCED DOMAIN REARRANGEMENTS IN AN ANTIBODY 提交 1993-07-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–100（100 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.80 Å
1GGC MAJOR ANTIGEN-INDUCED DOMAIN REARRANGEMENTS IN AN ANTIBODY 提交 1993-07-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–100（100 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.80 Å
1KB5 MURINE T-CELL RECEPTOR VARIABLE DOMAIN/FAB COMPLEX 提交 1997-04-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 1–99（99 aa）片段：FAB	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.2；15% PEG6000, 100MM HEPES PH 6.9-7.5, 200MM NACL, 0.1% NAN3, pH 7.2	分辨率 2.50 Å
1LO0 Catalytic Retro-Diels-Alderase Transition State Analogue Complex 提交 2002-05-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Y 1–101（101 aa）	未记录	BC1 3-{[(9-CYANO-9,10-DIHYDRO-10-METHYLACRIDIN-9-YL)CARBONYL]AMINO}PROPANOIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；290 K；PEG, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 2.00 Å R-free 0.255
1LO0 Catalytic Retro-Diels-Alderase Transition State Analogue Complex 提交 2002-05-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–101（101 aa）	未记录	BC1 3-{[(9-CYANO-9,10-DIHYDRO-10-METHYLACRIDIN-9-YL)CARBONYL]AMINO}PROPANOIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；290 K；PEG, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 2.00 Å R-free 0.255
1NBY Crystal Structure of HyHEL-63 complexed with HEL mutant K96A 提交 2002-12-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–96（96 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；PEG 4000, AMMONIUM ACETATE, SODIUM ACETATE, pH 4.60, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 1.80 Å R-free 0.250
1NBZ Crystal Structure of HyHEL-63 complexed with HEL mutant K97A 提交 2002-12-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–96（96 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；PEG 4000, AMMONIUM ACETATE, SODIUM ACETATE, pH 4.60, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 1.85 Å R-free 0.229
1NCA REFINED CRYSTAL STRUCTURE OF THE INFLUENZA VIRUS N9 NEURAMINIDASE-NC41 FAB COMPLEX 提交 1992-01-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 H 1–101（101 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å
1NCA REFINED CRYSTAL STRUCTURE OF THE INFLUENZA VIRUS N9 NEURAMINIDASE-NC41 FAB COMPLEX 提交 1992-01-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 H 1–101（101 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 16 CA CALCIUM ION × 8	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å
1NCB CRYSTAL STRUCTURES OF TWO MUTANT NEURAMINIDASE-ANTIBODY COMPLEXES WITH AMINO ACID SUBSTITUTIONS IN THE INTERFACE 提交 1992-01-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 H 1–101（101 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å
1NCB CRYSTAL STRUCTURES OF TWO MUTANT NEURAMINIDASE-ANTIBODY COMPLEXES WITH AMINO ACID SUBSTITUTIONS IN THE INTERFACE 提交 1992-01-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 H 1–101（101 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CA CALCIUM ION × 8	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å
1NCC CRYSTAL STRUCTURES OF TWO MUTANT NEURAMINIDASE-ANTIBODY COMPLEXES WITH AMINO ACID SUBSTITUTIONS IN THE INTERFACE 提交 1992-01-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 H 1–101（101 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å
1NCD REFINED CRYSTAL STRUCTURE OF THE INFLUENZA VIRUS N9 NEURAMINIDASE-NC41 FAB COMPLEX 提交 1992-01-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 H 1–101（101 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.90 Å
1ND0 CATIONIC CYCLIZATION ANTIBODY 4C6 COMPLEX WITH TRANSITION STATE ANALOG 提交 2002-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–102（102 aa）片段：IMMUNOGLOBULIN FAB FRAGMENT, heavy chain 链 D 1–102（102 aa）片段：IMMUNOGLOBULIN FAB FRAGMENT, heavy chain	未记录	DP4 (1s,4s)-4-[dimethyl(phenyl)silyl]-1-methylpiperidine 1-oxide × 2 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；295 K；ammonium sulfate, dioxane, tri-sodium citrate dihydrate, pH 5.5, evaporation, temperature 295K	分辨率 2.45 Å R-free 0.286
1ND0 CATIONIC CYCLIZATION ANTIBODY 4C6 COMPLEX WITH TRANSITION STATE ANALOG 提交 2002-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 1–102（102 aa）片段：IMMUNOGLOBULIN FAB FRAGMENT, heavy chain 链 H 1–102（102 aa）片段：IMMUNOGLOBULIN FAB FRAGMENT, heavy chain	未记录	DP4 (1s,4s)-4-[dimethyl(phenyl)silyl]-1-methylpiperidine 1-oxide × 2 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；295 K；ammonium sulfate, dioxane, tri-sodium citrate dihydrate, pH 5.5, evaporation, temperature 295K	分辨率 2.45 Å R-free 0.286
1ND0 CATIONIC CYCLIZATION ANTIBODY 4C6 COMPLEX WITH TRANSITION STATE ANALOG 提交 2002-12-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–102（102 aa）片段：IMMUNOGLOBULIN FAB FRAGMENT, heavy chain	未记录	DP4 (1s,4s)-4-[dimethyl(phenyl)silyl]-1-methylpiperidine 1-oxide × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；295 K；ammonium sulfate, dioxane, tri-sodium citrate dihydrate, pH 5.5, evaporation, temperature 295K	分辨率 2.45 Å R-free 0.286
1ND0 CATIONIC CYCLIZATION ANTIBODY 4C6 COMPLEX WITH TRANSITION STATE ANALOG 提交 2002-12-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–102（102 aa）片段：IMMUNOGLOBULIN FAB FRAGMENT, heavy chain	未记录	DP4 (1s,4s)-4-[dimethyl(phenyl)silyl]-1-methylpiperidine 1-oxide × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；295 K；ammonium sulfate, dioxane, tri-sodium citrate dihydrate, pH 5.5, evaporation, temperature 295K	分辨率 2.45 Å R-free 0.286
1ND0 CATIONIC CYCLIZATION ANTIBODY 4C6 COMPLEX WITH TRANSITION STATE ANALOG 提交 2002-12-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–102（102 aa）片段：IMMUNOGLOBULIN FAB FRAGMENT, heavy chain	未记录	DP4 (1s,4s)-4-[dimethyl(phenyl)silyl]-1-methylpiperidine 1-oxide × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；295 K；ammonium sulfate, dioxane, tri-sodium citrate dihydrate, pH 5.5, evaporation, temperature 295K	分辨率 2.45 Å R-free 0.286
1ND0 CATIONIC CYCLIZATION ANTIBODY 4C6 COMPLEX WITH TRANSITION STATE ANALOG 提交 2002-12-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–102（102 aa）片段：IMMUNOGLOBULIN FAB FRAGMENT, heavy chain	未记录	DP4 (1s,4s)-4-[dimethyl(phenyl)silyl]-1-methylpiperidine 1-oxide × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；295 K；ammonium sulfate, dioxane, tri-sodium citrate dihydrate, pH 5.5, evaporation, temperature 295K	分辨率 2.45 Å R-free 0.286
1NDG Crystal structure of Fab fragment of antibody HyHEL-8 complexed with its antigen lysozyme 提交 2002-12-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–96（96 aa）	未记录	ACY ACETIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 1.90 Å R-free 0.249
1NDM Crystal structure of Fab fragment of antibody HyHEL-26 complexed with lysozyme 提交 2002-12-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–96（96 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.10 Å R-free 0.258
1PLG EVIDENCE FOR THE EXTENDED HELICAL NATURE OF POLYSACCHARIDE EPITOPES. THE 2.8 ANGSTROMS RESOLUTION STRUCTURE AND THERMODYNAMICS OF LIGAND BINDING OF AN ANTIGEN BINDING FRAGMENT SPECIFIC FOR ALPHA-(2->8)-POLYSIALIC ACID 提交 1995-04-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–98（98 aa）片段：FAB FRAGMENT THAT BINDS POLYSIALIC ACID	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.80 Å
1RU9 Crystal Structure (A) of u.v.-irradiated cationic cyclization antibody 4C6 Fab at pH 4.6 with a data set collected in-house. 提交 2003-12-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–102（102 aa）片段：fab	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 5 ACT ACETATE ION × 1 BEZ BENZOIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；295 K；0.1M sodium acetate, pH 4.6, 0.2 M ammonium acetate, 15% (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.50 Å R-free 0.247
1RUA Crystal structure (B) of u.v.-irradiated cationic cyclization antibody 4C6 fab at pH 4.6 with a data set collected at SSRL beamline 11-1. 提交 2003-12-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–102（102 aa）片段：fab	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ACT ACETATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 BEZ BENZOIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；295 K；0.1M sodium acetate, 0.2 M ammonium acetate, 15% (w/v) PEG 4000, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.75 Å R-free 0.251
1RUK Crystal structure (C) of native cationic cyclization antibody 4C6 fab at pH 4.6 with a data set collected at SSRL beamline 9-1 提交 2003-12-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–102（102 aa）片段：fab	未记录	ACT ACETATE ION × 1 BEZ BENZOIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；295 K；0.1M sodium acetate, 0.2 M ammonium acetate, 15% (w/v) PEG 4000, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.40 Å R-free 0.210
1RUL Crystal Structure (D) of u.v.-irradiated cationic cyclization antibody 4C6 Fab at pH 5.6 with a data set collected at SSRL beamline 11-1. 提交 2003-12-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–102（102 aa）片段：fab	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ACT ACETATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 4 BEZ BENZOIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；295 K；0.1 M tri-sodium citrate, 0.2M ammonium acetate, 15% (w/v) PEG 4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.88 Å R-free 0.283
1RUM Crystal structure (F) of H2O2-soaked cationic cyclization antibody 4C6 fab at pH 8.5 with a data set collected at SSRL beamline 9-1. 提交 2003-12-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–102（102 aa）片段：fab	未记录	BEZ BENZOIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；0.1 M tris hydrochloride, pH 8.5, 0.2 M sodium acetate, 15% (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.48 Å R-free 0.245
1RUP Crystal structure (G) of native cationic cyclization antibody 4C6 fab at pH 8.5 with a data set collected at APS beamline 19-ID 提交 2003-12-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–102（102 aa）片段：fab	未记录	BEZ BENZOIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；0.1 M tris hydrochloride, 0.2 M sodium acetate, 15% (w/v) PEG 4000 , pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.40 Å R-free 0.212
1YEE STRUCTURE OF A CATALYTIC ANTIBODY, IGG2A FAB FRAGMENT (D2.5) 提交 1997-04-15	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–99（99 aa）	未记录	PNB 4-NITRO-BENZYLPHOSPHONOBUTANOYL-GLYCINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；pH 5.6	分辨率 2.20 Å R-free 0.260
4FAB THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF A FLUORESCEIN-FAB COMPLEX CRYSTALLIZED IN 2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL 提交 1989-04-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–98（98 aa）	未记录	FLU 2-(6-HYDROXY-3-OXO-3H-XANTHEN-9-YL)-BENZOIC ACID × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.70 Å
4ZXB Structure of the human insulin receptor ectodomain, IRDeltabeta construct, in complex with four Fab molecules 提交 2015-05-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 C 7–106（100 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Crystals were produced by vapour diffusion using 1 microlitre of the complex (2.6 mg/ml) in 10 mM HEPES (pH 7.5), 0.02% sodium azide and 10% D-trehalose solution and 1 microlitres of well solution containing 10% PEG 8000, 0.1 M MES (pH 6.5) and 0.1 M MgAc2.	分辨率 3.30 Å R-free 0.237
6UQC Mouse IgG2a Bispecific Fc 提交 2019-10-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 119–325（207 aa）链 E 119–325（207 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.9；295.15 K；21% PEG10000 and 0.1M bicine pH 7.9	分辨率 1.87 Å R-free 0.229
6UQC Mouse IgG2a Bispecific Fc 提交 2019-10-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 119–325（207 aa）链 F 119–325（207 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.9；295.15 K；21% PEG10000 and 0.1M bicine pH 7.9	分辨率 1.87 Å R-free 0.229
8AQT Beta SARS-CoV-2 Spike bound to mouse ACE2 (local) 提交 2022-08-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 97–328（232 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8AQU BA.1 SARS-CoV-2 Spike bound to mouse ACE2 (local) 提交 2022-08-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 97–328（232 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.22 Å
8AQV BA.2.12.1 SARS-CoV-2 Spike bound to mouse ACE2 (local) 提交 2022-08-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 97–328（232 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.96 Å

共 31 个其他 PDB 条目、40 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GCAM_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 120–218； UniProt 1–99

potassium channel

Aeropyrum pernix

UniProt Q9YDF8

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 31–253	片段：KvAP 突变：Y46C	6E1 Fab light chain × 4 （P01837） 6E1 Fab heavy chain × 4 （P01865） CD CADMIUM ION × 28 K POTASSIUM ION × 24	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；PEG400, Cadmium chloride, Sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.298
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 31–253	片段：KvAP 突变：Y46C	6E1 Fab light chain × 8 （P01837） 6E1 Fab heavy chain × 8 （P01865） CD CADMIUM ION × 56 K POTASSIUM ION × 48	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；PEG400, Cadmium chloride, Sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.298

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 1ORQ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1ORS X-ray structure of the KvAP potassium channel voltage sensor in complex with an Fab 提交 2003-03-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 33–160（128 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；PEG4000, Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.251
2A0L Crystal structure of KvAP-33H1 Fv complex 提交 2005-06-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 20–259（240 aa）片段：KvAP K+ channel 链 B 20–259（240 aa）片段：KvAP K+ channel	未记录	K POTASSIUM ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；sodium citrate, Tric-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.90 Å R-free 0.392
2KYH Solution structure of the voltage-sensing domain of KvAP 提交 2010-05-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–160（143 aa）片段：UNP Residues 18-160	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；318 K；离子强度（mmCIF原始值）40；压力 AMBIENT NMR样品组成 0.1-0.5 MM [U-98% 15N] ENTITY, 20 MM HEPES, 20 MM POTASSIUM CHLORIDE, 5 MM DIHEPTANOYL PHOSPHATIDYLCHOLINE, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.1-0.5 MM [U-100% 13C U- 100% 15N U-80% 2H] ENTITY, 20 MM HEPES, 20 MM POTASSIUM CHLORIDE, 5 MM DIHEPTANOYL PHOSPHATIDYLCHOLINE, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.1-0.5 MM [U-98% 13C U-98% 15N] ENTITY, 20 MM HEPES, 20 MM POTASSIUM CHLORIDE, 5 MM DIHEPTANOYL PHOSPHATIDYLCHOLINE, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.1-0.5 MM [13CH3/12CD2]-LEU,VAL,[13CH3]-ILE ENTITY, 20 MM HEPES, 20 MM POTASSIUM CHLORIDE, 5 MM DIHEPTANOYL PHOSPHATIDYLCHOLINE, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
6UWM Single particle cryo-EM structure of KvAP 提交 2019-11-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 25–295（271 aa）片段：UNP residues 25-295 链 B 25–295（271 aa）片段：UNP residues 25-295 链 C 25–295（271 aa）片段：UNP residues 25-295 链 D 25–295（271 aa）片段：UNP residues 25-295	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging.	分辨率 5.90 Å

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KVAP_AERPE
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–223； UniProt 31–253

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1orq
沉积日期 deposition_date	2003-03-14
结构标题 title	X-ray structure of a voltage-dependent potassium channel in complex with an Fab
关键词 keywords	potassium channel, voltage-dependent, KvAP, Fab complex, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	33.13 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	33.15 Å
零角强度 I(0) i0	80189900.00
分子量 molecular_weight	72546.0 kDa
排除体积 excluded_volume	91173 Å³
包络体积 envelope_volume	128750 Å³
水化壳体积 shell_volume	33705 Å³
包络直径 envelope_diameter	107.4 Å
壳层 Rg shell_rg	38.34 Å
包络 Rg envelope_rg	33.27 Å
形状 Rg shape_rg	33.06 Å
总 Rg total_rg	33.91 Å
总原子数 total_atoms	5053
残基数 n_residues	657
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	110.0 Å
Rg (实空间) rg_real	33.27 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.81 Å
I(0) (实空间) i0_real	8.0190e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.3090e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	33.22 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	80190000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8868
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	34.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.353
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.553
角度范围 angular_range	— – 0.2400 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	7143000.0000
实空间数据点数 n_real_points	49
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.909; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.898; Smooth: 0.899

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	6E1 Fab light chain
分子量 formula_weight	23527.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	5059

ENVLTQSPAIMSPSPGEKVTMTCRARSSVSSSYLHWYQQKSGASPKLWIYSTSNLASGVPARFSGSGSGTSYSLTISSVEAEDTATYYCQQYSGNPWTFGGGTKLEIKRADAAPTVSIFPPSSEQLTSGGASVVCFLNNFYPKDINVKWKIDGSERQNGVLNSWTDQDSKDSTYSMSSTLTLTKDEYERHNSYTCEATHKTSTSPIVKSFNRNEC

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	6E1 Fab heavy chain
分子量 formula_weight	23781.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

DVQLQESGPGLVKPSQSLSLTCTVTGYSITSLYAWNWIRQFPGNKLEWMGYINYSGYTSYNPSLKSRISITRDTSKNQFFLQLHSVTTEDTATYSCTRGVDYFAMDYWGQGASVTVSSAKTTAPSVYPLAPVCGDTTGSSVTLGCLVKGYFPEPVTLTWNSGSLSSGVHTFPALLQSDLYTLSSSVTVTSNTWPSQSITCNVAHPASSTKVDKKIVPRD

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	potassium channel
分子量 formula_weight	24271.9 kDa
突变 mutation	Y46C
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

IGDVMEHPLVELGVSYAALLSVIVVVVECTMQLSGEYLVRLYLVDLILVIILWADYAYRAYKSGDPAGYVKKTLYEIPALVPAGLLALIEGHLAGLGLFRLVRLLRFLRILLIISRGSKFLSAIADAADKIRFYHLFGAVMLTVLYGAFAIYIVEYPDPNSSIKSVFDALWWAVVTATTVGYGDVVPATPIGKVIGIAVMLTGISALTLLIGTVSNMFQKILV

来源 Source

来源生物 organism	Aeropyrum pernix
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	56636
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	CADMIUM ION
分子量 formula_weight	112.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	POTASSIUM ION
分子量 formula_weight	39.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

结构域编号 domain_id	d1orqa1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

结构域编号 domain_id	d1orqa2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

结构域编号 domain_id	d1orqb1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

结构域编号 domain_id	d1orqb2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

结构域编号 domain_id	d1orqc_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.14 — Gated ion channels
超家族 Superfamily superfamily	f.14.1 — Voltage-gated ion channels
家族 Family family	f.14.1.1 — Voltage-gated potassium channels

CATH v4.4 (5 domains)

结构域编号 domain_id	1orqA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1orqA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1orqB01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1orqB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1orqC01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 —

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	189.439 Å
晶胞边长 b length_b	189.439 Å
晶胞边长 c length_c	150.479 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	I 4 2 2
空间群编号 int_tables_number	97
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.200 Å
最低分辨率 resolution_low	29.950 Å
R 因子 r_factor	0.2530
R_work r_work	0.2530
R_free r_free	0.2980

fit	/app/data/saxs_computation/or/1orq/1orq.fit
pddf	/app/data/pr_computation/or/1orq/1orq.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/or/1orq/1orq.dat

X-ray structure of a voltage-dependent potassium channel in complex with an Fab

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

6E1 Fab light chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

6E1 Fab heavy chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

potassium channel

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

CATH v4.4 (5 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)