1ors

X-ray structure of the KvAP potassium channel voltage sensor in complex with an Fab

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 122.1 Å Quality: REASONABLE

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

33H1 Fab light chain

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–106	未记录	33H1 Fab heavy chain × 1 （P01869） potassium channel × 1 （Q9YDF8）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；PEG4000, Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.251

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1ORS	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
15C8 CATALYTIC ANTIBODY 5C8, FREE FAB 提交 1998-03-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 24–235（212 aa）片段：FAB	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.251
1AHW A COMPLEX OF EXTRACELLULAR DOMAIN OF TISSUE FACTOR WITH AN INHIBITORY FAB (5G9) 提交 1997-04-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–214（214 aa）片段：LIGHT CHAIN RESIDUES 1 - 214 链 D 1–214（214 aa）片段：LIGHT CHAIN RESIDUES 1 - 214	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；TF-5G9 CRYSTAL WERE GROWN IN 1.7-2.0M AMMONIUM SULFATE, 0.1M SODIUM CITRATE, PH 5.0-5.5, 0.2% 2-METHYL-2,4-PENTANE-DIOL (MPD), AND 2% PEG 600 AT AN EQUIMOLAR 5G9:TF RATIO. THE CRYSTALS GREW EXTREMELY SLOWLY, TAKING 6-9 MONTHS TO REACH A MAXIMAL SIZE OF 0.4 X 0.4 X 0.8 MM3., pH 7.0	分辨率 3.00 Å R-free 0.285
1AIF ANTI-IDIOTYPIC FAB 409.5.3 (IGG2A) FAB FROM MOUSE 提交 1994-11-14	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 1–213（213 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.90 Å
1AIF ANTI-IDIOTYPIC FAB 409.5.3 (IGG2A) FAB FROM MOUSE 提交 1994-11-14	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–213（213 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.90 Å
1F11 F124 FAB FRAGMENT FROM A MONOCLONAL ANTI-PRES2 ANTIBODY 提交 2000-05-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–106（106 aa）片段：FAB FRAGMENT (UNP P01665 residues 1-111, P01837 residues 1-106)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；290 K；PEG 400, sodium acetate, ammonium sulfate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 3.00 Å R-free 0.271
1F11 F124 FAB FRAGMENT FROM A MONOCLONAL ANTI-PRES2 ANTIBODY 提交 2000-05-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–106（106 aa）片段：FAB FRAGMENT (UNP P01665 residues 1-111, P01837 residues 1-106)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；290 K；PEG 400, sodium acetate, ammonium sulfate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 3.00 Å R-free 0.271
1FAI THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF TWO CRYSTAL FORMS OF FAB R19.9, FROM A MONOCLONAL ANTI-ARSONATE ANTIBODY 提交 1992-05-27	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 1–106（106 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.70 Å
1FSK COMPLEX FORMATION BETWEEN A FAB FRAGMENT OF A MONOCLONAL IGG ANTIBODY AND THE MAJOR ALLERGEN FROM BIRCH POLLEN BET V 1 提交 2000-09-11	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–106（106 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；300 K；12% peg 6000, 0.1M sodium citrate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 2.90 Å R-free 0.285
1FSK COMPLEX FORMATION BETWEEN A FAB FRAGMENT OF A MONOCLONAL IGG ANTIBODY AND THE MAJOR ALLERGEN FROM BIRCH POLLEN BET V 1 提交 2000-09-11	实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 1–106（106 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；300 K；12% peg 6000, 0.1M sodium citrate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 2.90 Å R-free 0.285
1FSK COMPLEX FORMATION BETWEEN A FAB FRAGMENT OF A MONOCLONAL IGG ANTIBODY AND THE MAJOR ALLERGEN FROM BIRCH POLLEN BET V 1 提交 2000-09-11	实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 1–106（106 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；300 K；12% peg 6000, 0.1M sodium citrate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 2.90 Å R-free 0.285
1FSK COMPLEX FORMATION BETWEEN A FAB FRAGMENT OF A MONOCLONAL IGG ANTIBODY AND THE MAJOR ALLERGEN FROM BIRCH POLLEN BET V 1 提交 2000-09-11	实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 K 1–106（106 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；300 K；12% peg 6000, 0.1M sodium citrate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 2.90 Å R-free 0.285
1GPO CRYSTAL STRUCTURE OF THE RATIONALLY DESIGNED ANTIBODY M41 AS A FAB FRAGMENT 提交 1997-03-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 1–106（106 aa）片段：FAB FRAGMENT	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；2.0 M AMMONIUM SULFATE, 5 % DMSO, 0.1 M CACODYLATE PH 6.5	分辨率 1.95 Å R-free 0.283
1GPO CRYSTAL STRUCTURE OF THE RATIONALLY DESIGNED ANTIBODY M41 AS A FAB FRAGMENT 提交 1997-03-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 M 1–106（106 aa）片段：FAB FRAGMENT	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；2.0 M AMMONIUM SULFATE, 5 % DMSO, 0.1 M CACODYLATE PH 6.5	分辨率 1.95 Å R-free 0.283
1KB5 MURINE T-CELL RECEPTOR VARIABLE DOMAIN/FAB COMPLEX 提交 1997-04-06	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 L 1–106（106 aa）片段：FAB	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.2；15% PEG6000, 100MM HEPES PH 6.9-7.5, 200MM NACL, 0.1% NAN3, pH 7.2	分辨率 2.50 Å
1KCR CRYSTAL STRUCTURE OF ANTIBODY PC283 IN COMPLEX WITH PS1 PEPTIDE 提交 2001-11-11	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 L 1–106（106 aa）片段：light chain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；300 K；18% PEG 3K, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 2.90 Å R-free 0.277
1KCS CRYSTAL STRUCTURE OF ANTIBODY PC282 IN COMPLEX WITH PS1 PEPTIDE 提交 2001-11-11	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 L 1–106（106 aa）片段：light chain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；300 K；20% PEG 8K, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 2.50 Å R-free 0.277
1KCU CRYSTAL STRUCTURE OF ANTIBODY PC287 提交 2001-11-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 1–106（106 aa）片段：light chain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；300 K；15% PEG 8K, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 2.20 Å R-free 0.249
1KCV Crystal structure of antibody pc282 提交 2001-11-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 1–106（106 aa）片段：light chain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；300 K；10 % PEG 3K, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 1.80 Å R-free 0.233
1LO0 Catalytic Retro-Diels-Alderase Transition State Analogue Complex 提交 2002-05-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 X 1–106（106 aa）片段：Fab fragment	未记录	BC1 3-{[(9-CYANO-9,10-DIHYDRO-10-METHYLACRIDIN-9-YL)CARBONYL]AMINO}PROPANOIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；290 K；PEG, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 2.00 Å R-free 0.255
1LO0 Catalytic Retro-Diels-Alderase Transition State Analogue Complex 提交 2002-05-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 1–106（106 aa）片段：Fab fragment	未记录	BC1 3-{[(9-CYANO-9,10-DIHYDRO-10-METHYLACRIDIN-9-YL)CARBONYL]AMINO}PROPANOIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；290 K；PEG, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 2.00 Å R-free 0.255
1MLB MONOCLONAL ANTIBODY FAB D44.1 RAISED AGAINST CHICKEN EGG-WHITE LYSOZYME 提交 1995-03-08	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–106（106 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.10 Å R-free 0.274
1NBY Crystal Structure of HyHEL-63 complexed with HEL mutant K96A 提交 2002-12-04	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–106（106 aa）片段：light chain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；PEG 4000, AMMONIUM ACETATE, SODIUM ACETATE, pH 4.60, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 1.80 Å R-free 0.250
1NDG Crystal structure of Fab fragment of antibody HyHEL-8 complexed with its antigen lysozyme 提交 2002-12-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–106（106 aa）片段：light chain	未记录	ACY ACETIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 1.90 Å R-free 0.249
1NDM Crystal structure of Fab fragment of antibody HyHEL-26 complexed with lysozyme 提交 2002-12-09	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–106（106 aa）片段：light chain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.10 Å R-free 0.258
1ORQ X-ray structure of a voltage-dependent potassium channel in complex with an Fab 提交 2003-03-14	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–106（106 aa）	未记录	CD CADMIUM ION × 28 K POTASSIUM ION × 24	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；PEG400, Cadmium chloride, Sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.298
1ORQ X-ray structure of a voltage-dependent potassium channel in complex with an Fab 提交 2003-03-14	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–106（106 aa）	未记录	CD CADMIUM ION × 56 K POTASSIUM ION × 48	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；PEG400, Cadmium chloride, Sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.298
1PSK THE CRYSTAL STRUCTURE OF AN FAB FRAGMENT THAT BINDS TO THE MELANOMA-ASSOCIATED GD2 GANGLIOSIDE 提交 1997-03-03	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 1–106（106 aa）片段：FAB	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；30% (W/V) PEG 4000, 1% MPD, TRIS BUFFER, PH 7.5	分辨率 2.80 Å R-free 0.326
25C8 CATALYTIC ANTIBODY 5C8, FAB-HAPTEN COMPLEX 提交 1998-03-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 24–234（211 aa）片段：FAB	未记录	GEP N-METHYL-N-(PARA-GLUTARAMIDOPHENYL-ETHYL)-PIPERIDINIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.5	分辨率 2.00 Å R-free 0.292
2F19 THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF TWO CRYSTAL FORMS OF FAB R19.9, FROM A MONOCLONAL ANTI-ARSONATE ANTIBODY 提交 1992-05-27	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 1–106（106 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.80 Å
2MPA BACTERICIDAL ANTIBODY AGAINST NEISSERIA MENINGITIDIS 提交 1999-06-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 L 8–106（99 aa）片段：FAB FRAGMENT	未记录	CD CADMIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；THE MN12H2 FAB PEPTIDE COMPLEX WAS CRYSTALLIZED FROM 15% W/V PEG 20000, 100 MM SODIUM ACETATE, PH 4.6, 20 MM CDCL2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.60 Å R-free 0.264
4ZXB Structure of the human insulin receptor ectodomain, IRDeltabeta construct, in complex with four Fab molecules 提交 2015-05-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 B 1–106（106 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Crystals were produced by vapour diffusion using 1 microlitre of the complex (2.6 mg/ml) in 10 mM HEPES (pH 7.5), 0.02% sodium azide and 10% D-trehalose solution and 1 microlitres of well solution containing 10% PEG 8000, 0.1 M MES (pH 6.5) and 0.1 M MgAc2.	分辨率 3.30 Å R-free 0.237
6FAB THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF MURINE ANTI-P-AZOPHENYLARSONATE FAB 36-71. 1. X-RAY CRYSTALLOGRAPHY, SITE-DIRECTED MUTAGENESIS, AND MODELING OF THE COMPLEX WITH HAPTEN 提交 1991-01-17	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 1–106（106 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å
8XKK Ckappa domain of mouse immunoglobulin 提交 2023-12-23	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–106（105 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）Not defined；压力 1 NMR样品组成 1.6 mM [U-13C; U-15N] Ckappa domain of mouse immunoglobulin, 5 mM NaPi, 50 mM sodium chloride, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1.6 mM [U-13C; U-15N] Ckappa domain of mouse immunoglobulin, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1.6 mM [U-13C; U-15N] Ckappa domain of mouse immunoglobulin, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供

共 25 个其他 PDB 条目、33 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KAC_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 109–214； UniProt 1–106

33H1 Fab heavy chain

物种未注明

UniProt P01869

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–103	未记录	33H1 Fab light chain × 1 （P01837） potassium channel × 1 （Q9YDF8）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；PEG4000, Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.251

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 1ORS	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
15C8 CATALYTIC ANTIBODY 5C8, FREE FAB 提交 1998-03-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 2–217（216 aa）片段：FAB	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.251
1ACY CRYSTAL STRUCTURE OF THE PRINCIPAL NEUTRALIZING SITE OF HIV-1 提交 1994-02-10	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 1–100（100 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å
1AE6 IGG-FAB FRAGMENT OF MOUSE MONOCLONAL ANTIBODY CTM01 提交 1997-03-06	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–98（98 aa）片段：FAB FRAGMENT	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；20-25% PEG4000, BUFFERED AT PH 5.6 WITH 20MM BIS-TRIS.	分辨率 3.00 Å R-free 0.311
1CIC IDIOTOPE-ANTI-IDIOTOPE FAB-FAB COMPLEX; D1.3-E225 提交 1999-03-31	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–218（218 aa）片段：FAB IMMUNOGLOBULIN FRAGMENT	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.9；12% PEG 800, 75 MILLIMOLAR SODIUM ACETATE PH 4.85 10MGM/ML PROTEIN CONCENTRATION , pH 4.9	分辨率 2.50 Å
1CL7 ANTI HIV1 PROTEASE FAB 提交 1999-05-06	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 133–214（82 aa）片段：FAB	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0	分辨率 3.00 Å R-free 0.280
1F11 F124 FAB FRAGMENT FROM A MONOCLONAL ANTI-PRES2 ANTIBODY 提交 2000-05-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–102（101 aa）片段：FAB FRAGMENT (UNP Q65ZR6 residues 18-134, P01869 residues 2-102)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；290 K；PEG 400, sodium acetate, ammonium sulfate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 3.00 Å R-free 0.271
1F11 F124 FAB FRAGMENT FROM A MONOCLONAL ANTI-PRES2 ANTIBODY 提交 2000-05-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2–102（101 aa）片段：FAB FRAGMENT (UNP Q65ZR6 residues 18-134, P01869 residues 2-102)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；290 K；PEG 400, sodium acetate, ammonium sulfate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 3.00 Å R-free 0.271
1JHK Crystal structure of the anti-estradiol antibody 57-2 提交 2001-06-28	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 12–229（218 aa）片段：residues 1-215	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.1；277 K；PEG4000, PEG8000, Tris-HCl, pH 9.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.51 Å R-free 0.262
1KC5 CRYSTAL STRUCTURE OF ANTIBODY PC287 IN COMPLEX WITH PS1 PEPTIDE 提交 2001-11-07	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 1–101（101 aa）片段：heavy chain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；300 K；20% PEG 8K, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 2.50 Å R-free 0.270
1KCR CRYSTAL STRUCTURE OF ANTIBODY PC283 IN COMPLEX WITH PS1 PEPTIDE 提交 2001-11-11	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 1–102（102 aa）片段：heavy chain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；300 K；18% PEG 3K, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 2.90 Å R-free 0.277
1L7T Crystal Structure Analysis of the anti-testosterone Fab fragment 提交 2002-03-17	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–103（103 aa）片段：fab77 fragment	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；298 K；peg3350, MES, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.275
1RUQ Crystal Structure (H) of u.v.-irradiated Diels-Alder antibody 13G5 Fab at pH 8.0 with a data set collected in house. 提交 2003-12-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–99（99 aa）片段：fab	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1 M imidazole, pH 8.0, 0.2 M zinc acetate, 5-7% (v/v) isopropanol, 20% (w/v) PEG 3000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.86 Å R-free 0.256
1RUR Crystal Structure (I) of native Diels-Alder antibody 13G5 Fab at pH 8.0 with a data set collected at SSRL beamline 9-1. 提交 2003-12-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–99（99 aa）片段：fab	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1 M imidazole, pH 8.0, 0.2 M zinc acetate, 5-7% (v/v) isopropanol, 20% (w/v) PEG 3000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.50 Å R-free 0.238
1S5I Fab (LNKB-2) of monoclonal antibody to Human Interleukin-2, crystal structure 提交 2004-01-21	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–102（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；300 K；PEG-8000, ZnAc, NaN3, Na(CH3)2AsO4, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 2.70 Å R-free 0.275
25C8 CATALYTIC ANTIBODY 5C8, FAB-HAPTEN COMPLEX 提交 1998-03-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 2–217（216 aa）片段：FAB	未记录	GEP N-METHYL-N-(PARA-GLUTARAMIDOPHENYL-ETHYL)-PIPERIDINIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.5	分辨率 2.00 Å R-free 0.292

共 14 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IGH1M_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 119–221； UniProt 1–103

potassium channel

Aeropyrum pernix

UniProt Q9YDF8

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 33–160	未记录	33H1 Fab light chain × 1 （P01837） 33H1 Fab heavy chain × 1 （P01869）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；PEG4000, Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.251

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 1ORS	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1ORQ X-ray structure of a voltage-dependent potassium channel in complex with an Fab 提交 2003-03-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 C 31–253（223 aa）片段：KvAP	突变：Y46C	CD CADMIUM ION × 28 K POTASSIUM ION × 24	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；PEG400, Cadmium chloride, Sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.298
1ORQ X-ray structure of a voltage-dependent potassium channel in complex with an Fab 提交 2003-03-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 C 31–253（223 aa）片段：KvAP	突变：Y46C	CD CADMIUM ION × 56 K POTASSIUM ION × 48	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；PEG400, Cadmium chloride, Sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.298
2A0L Crystal structure of KvAP-33H1 Fv complex 提交 2005-06-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 20–259（240 aa）片段：KvAP K+ channel 链 B 20–259（240 aa）片段：KvAP K+ channel	未记录	K POTASSIUM ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；sodium citrate, Tric-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.90 Å R-free 0.392
2KYH Solution structure of the voltage-sensing domain of KvAP 提交 2010-05-26	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–160（143 aa）片段：UNP Residues 18-160	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；318 K；离子强度（mmCIF原始值）40；压力 AMBIENT NMR样品组成 0.1-0.5 MM [U-98% 15N] ENTITY, 20 MM HEPES, 20 MM POTASSIUM CHLORIDE, 5 MM DIHEPTANOYL PHOSPHATIDYLCHOLINE, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.1-0.5 MM [U-100% 13C U- 100% 15N U-80% 2H] ENTITY, 20 MM HEPES, 20 MM POTASSIUM CHLORIDE, 5 MM DIHEPTANOYL PHOSPHATIDYLCHOLINE, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.1-0.5 MM [U-98% 13C U-98% 15N] ENTITY, 20 MM HEPES, 20 MM POTASSIUM CHLORIDE, 5 MM DIHEPTANOYL PHOSPHATIDYLCHOLINE, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.1-0.5 MM [13CH3/12CD2]-LEU,VAL,[13CH3]-ILE ENTITY, 20 MM HEPES, 20 MM POTASSIUM CHLORIDE, 5 MM DIHEPTANOYL PHOSPHATIDYLCHOLINE, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
6UWM Single particle cryo-EM structure of KvAP 提交 2019-11-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 25–295（271 aa）片段：UNP residues 25-295 链 B 25–295（271 aa）片段：UNP residues 25-295 链 C 25–295（271 aa）片段：UNP residues 25-295 链 D 25–295（271 aa）片段：UNP residues 25-295	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging.	分辨率 5.90 Å

共 4 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KVAP_AERPE
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–129； UniProt 33–160

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1ors
沉积日期 deposition_date	2003-03-14
结构标题 title	X-ray structure of the KvAP potassium channel voltage sensor in complex with an Fab
关键词 keywords	potassium channel, voltage-dependent, voltage sensor, KvAP, Fab complex, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	33.04 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	34.03 Å
零角强度 I(0) i0	59965500.00
分子量 molecular_weight	62031.0 kDa
排除体积 excluded_volume	77926 Å³
包络体积 envelope_volume	105860 Å³
水化壳体积 shell_volume	29522 Å³
包络直径 envelope_diameter	128.3 Å
壳层 Rg shell_rg	35.52 Å
包络 Rg envelope_rg	35.04 Å
形状 Rg shape_rg	33.99 Å
总 Rg total_rg	34.30 Å
总原子数 total_atoms	4368
残基数 n_residues	567
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	122.1 Å
Rg (实空间) rg_real	33.88 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.57 Å
I(0) (实空间) i0_real	5.9970e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.0860e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	33.52 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	59950000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7314
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	30.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.819
峰度 Kurtosis kurtosis	0.283
角度范围 angular_range	— – 0.2400 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	7378000.0000
实空间数据点数 n_real_points	49
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.534; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.391; Smooth: 0.511

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	33H1 Fab light chain
分子量 formula_weight	23409.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	4771

QIVLTQSPAIMSASLGDRVTMTCTASSSVSSSYLHWYQQKPGSSPKLWIYSTSNLASGVPARFSGSGSGTSYSLTISSMEAEDAATYYCHQFHRSLTFGSGTKLEIKRADAAPTVSIFPPSSEQLTSGGASVVCFLNNFYPKDINVKWKIDGSERQNGVLNSWTDQDSKDSTYSMSSTLTLTKDEYERHNSYTCEATHKTSTSPIVKSFNRNEC

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	33H1 Fab heavy chain
分子量 formula_weight	24043.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

DVQLQESGPGLVKPSQSLSLTCTVTGYSITNNYAWNWIRQFPGNKLEWMGYINYSGTTSYNPSLKSRISITRDTSKNQFFLQLNSVTTEDTATYFCVRGYDYFAMDYWGQGTSVTVSSAKTTPPSVYPLAPGSAAQTNSMVTLGCLVKGYFPEPVTVTWNSGSLSSGVHTFPAVLQSDLYTLSSSVTVPSSTWPSETVTCNVAHPASSTKVDKKIVPRDCG

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	potassium channel
分子量 formula_weight	14629.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

DVMEHPLVELGVSYAALLSVIVVVVEYTMQLSGEYLVRLYLVDLILVIILWADYAYRAYKSGDPAGYVKKTLYEIPALVPAGLLALIEGHLAGLGLFRLVRLLRFLRILLIISRGSKFLSAIADAADKLVPR

来源 Source

来源生物 organism	Aeropyrum pernix
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	56636
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	403

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 11 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_id	d1orsa1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

结构域编号 domain_id	d1orsa2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

结构域编号 domain_id	d1orsb1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

结构域编号 domain_id	d1orsb2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

结构域编号 domain_id	d1orsc1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.14 — Gated ion channels
超家族 Superfamily superfamily	f.14.1 — Voltage-gated ion channels
家族 Family family	f.14.1.1 — Voltage-gated potassium channels

结构域编号 domain_id	d1orsc2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (5 domains)

结构域编号 domain_id	1orsA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1orsA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1orsB01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1orsB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	1orsC00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	350 — Voltage-gated potassium channels. Chain C

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	264.710 Å
晶胞边长 b length_b	61.600 Å
晶胞边长 c length_c	46.060 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.35 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.900 Å
最低分辨率 resolution_low	30.000 Å
R 因子 r_factor	0.2310
R_work r_work	0.2310
R_free r_free	0.2510

fit	/app/data/saxs_computation/or/1ors/1ors.fit
pddf	/app/data/pr_computation/or/1ors/1ors.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/or/1ors/1ors.dat

X-ray structure of the KvAP potassium channel voltage sensor in complex with an Fab

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

33H1 Fab light chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

33H1 Fab heavy chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

potassium channel

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 11 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (5 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)