1t6b

Crystal structure of B. anthracis Protective Antigen complexed with human Anthrax toxin receptor

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 132.8 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protective Antigen

Bacillus anthracis

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 X； UniProt 30–764	未记录	Anthrax toxin receptor 2 × 1 （P58335） CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；300 K；CHES buffer, PEG400, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 300K	分辨率 2.50 Å R-free 0.266

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1T6B	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1ACC ANTHRAX PROTECTIVE ANTIGEN 提交 1997-02-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–764（735 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；277 K；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 12-18% PEG 8K AND 50 MM CITRATE, PH 6.0 AT 4 DEGREES C. CRYSTAL FORM ""2"" (NEEDLE-LIKE CRYSTALS)., temperature 277K	分辨率 2.10 Å R-free 0.296
1TZN Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor 提交 2004-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 B 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 C 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 D 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 E 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 F 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 O 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain	未记录	CA CALCIUM ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, sodium chloride, Tris, magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 4.30 Å R-free 0.330
1TZN Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor 提交 2004-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 G 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 H 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 I 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 J 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 K 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 L 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 M 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain	未记录	CA CALCIUM ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, sodium chloride, Tris, magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 4.30 Å R-free 0.330
1TZN Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor 提交 2004-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric	链 A 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 B 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 C 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 D 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 E 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 F 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 G 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 H 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 I 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 J 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 K 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 L 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 M 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 O 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain	未记录	CA CALCIUM ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, sodium chloride, Tris, magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 4.30 Å R-free 0.330
1TZN Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor 提交 2004-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric	链 A 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 B 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 C 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 D 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 E 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 F 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 G 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 H 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 I 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 J 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 K 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 L 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 M 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 O 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain	未记录	CA CALCIUM ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, sodium chloride, Tris, magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 4.30 Å R-free 0.330
1TZN Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor 提交 2004-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric	链 A 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 B 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 C 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 D 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 E 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 F 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 G 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 H 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 I 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 J 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 K 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 L 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 M 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 O 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain	未记录	CA CALCIUM ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, sodium chloride, Tris, magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 4.30 Å R-free 0.330
1TZO Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore 提交 2004-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 B 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 C 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 D 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 E 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 F 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 O 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain	未记录	CA CALCIUM ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.25；298 K；HEPES, sodium chloride, b-octylglucoside, spermine, pH 8.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.60 Å R-free 0.317
1TZO Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore 提交 2004-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 G 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 H 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 I 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 J 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 K 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 L 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 M 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain	未记录	CA CALCIUM ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.25；298 K；HEPES, sodium chloride, b-octylglucoside, spermine, pH 8.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.60 Å R-free 0.317
25PV Structure of the anthrax protective antigen in complex with a potent neutralizing antibody 提交 2026-04-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 200–626（427 aa）	突变：F231S	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.03 Å
3ETB Crystal structure of the engineered neutralizing antibody M18 complexed with anthrax protective antigen domain 4 提交 2008-10-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 621–764（144 aa）片段：Domain 4 of protective antigen PA-63: UNP residues 621-764	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；10% PEG 20000, 0.05 M Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 3.80 Å R-free 0.276
3ETB Crystal structure of the engineered neutralizing antibody M18 complexed with anthrax protective antigen domain 4 提交 2008-10-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 K 621–764（144 aa）片段：Domain 4 of protective antigen PA-63: UNP residues 621-764	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；10% PEG 20000, 0.05 M Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 3.80 Å R-free 0.276
3ETB Crystal structure of the engineered neutralizing antibody M18 complexed with anthrax protective antigen domain 4 提交 2008-10-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 621–764（144 aa）片段：Domain 4 of protective antigen PA-63: UNP residues 621-764	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；10% PEG 20000, 0.05 M Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 3.80 Å R-free 0.276
3ETB Crystal structure of the engineered neutralizing antibody M18 complexed with anthrax protective antigen domain 4 提交 2008-10-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 M 621–764（144 aa）片段：Domain 4 of protective antigen PA-63: UNP residues 621-764	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；10% PEG 20000, 0.05 M Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 3.80 Å R-free 0.276
3INO 1.95A Resolution Structure of Protective Antigen Domain 4 提交 2009-08-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 624–764（141 aa）片段：Domain 4 链 B 624–764（141 aa）片段：Domain 4	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；20% PEG 8000, 100mM imidazole, 3% MPD, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 277K	分辨率 1.95 Å R-free 0.258
3INO 1.95A Resolution Structure of Protective Antigen Domain 4 提交 2009-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 624–764（141 aa）片段：Domain 4	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；20% PEG 8000, 100mM imidazole, 3% MPD, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 277K	分辨率 1.95 Å R-free 0.258
3INO 1.95A Resolution Structure of Protective Antigen Domain 4 提交 2009-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 624–764（141 aa）片段：Domain 4	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；20% PEG 8000, 100mM imidazole, 3% MPD, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 277K	分辨率 1.95 Å R-free 0.258
3J9C CryoEM single particle reconstruction of anthrax toxin protective antigen pore at 2.9 Angstrom resolution 提交 2014-12-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：7-MERIC	链 A 203–764（562 aa）片段：C-terminal 63-kDa fragment (UNP residues 203-764)	未记录	CA CALCIUM ION × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 50 mM NaOAc, pH 5.0, 0.05% Igepal CA-630；pH 5；50 mM NaOAc, pH 5.0, 0.05% Igepal CA-630 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Plunged into liguid nitrogen (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 2.90 Å
3J9C CryoEM single particle reconstruction of anthrax toxin protective antigen pore at 2.9 Angstrom resolution 提交 2014-12-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 203–764（562 aa）片段：C-terminal 63-kDa fragment (UNP residues 203-764)	未记录	CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 50 mM NaOAc, pH 5.0, 0.05% Igepal CA-630；pH 5；50 mM NaOAc, pH 5.0, 0.05% Igepal CA-630 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Plunged into liguid nitrogen (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 2.90 Å
3J9C CryoEM single particle reconstruction of anthrax toxin protective antigen pore at 2.9 Angstrom resolution 提交 2014-12-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 203–764（562 aa）片段：C-terminal 63-kDa fragment (UNP residues 203-764)	未记录	CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 50 mM NaOAc, pH 5.0, 0.05% Igepal CA-630；pH 5；50 mM NaOAc, pH 5.0, 0.05% Igepal CA-630 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Plunged into liguid nitrogen (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 2.90 Å
3KWV Structural basis for the unfolding of anthrax lethal factor by protective antigen oligomers 提交 2009-12-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 197–764（568 aa）片段：UNP residues 197-764 链 B 197–764（568 aa）片段：UNP residues 197-764	突变：V303P, H304G 突变：V303P, H304G	CA CALCIUM ION × 16	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；291 K；16% PEG 3000, 0.1M cacodylic acid, 0.2M magnesium chloride, 10 mM Tris-Cl, 75 mM sodium chloride, 10 mM adenosine-5'-triphosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.10 Å R-free 0.281
3KWV Structural basis for the unfolding of anthrax lethal factor by protective antigen oligomers 提交 2009-12-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 D 197–764（568 aa）片段：UNP residues 197-764 链 E 197–764（568 aa）片段：UNP residues 197-764	突变：V303P, H304G 突变：V303P, H304G	CA CALCIUM ION × 16	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；291 K；16% PEG 3000, 0.1M cacodylic acid, 0.2M magnesium chloride, 10 mM Tris-Cl, 75 mM sodium chloride, 10 mM adenosine-5'-triphosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.10 Å R-free 0.281
3MHZ 1.7A structure of 2-fluorohistidine labeled Protective Antigen 提交 2010-04-09	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–764（735 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.2；293 K；30% PEG 400, 0.1M Tris, pH 8.2, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 1.70 Å R-free 0.222
3Q8A Crystal structure of WT Protective Antigen (pH 5.5) 提交 2011-01-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–764（735 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；25 %(w/v) PEG 1500, 100 mM SPG Buffer, pH 5.5, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 3.13 Å R-free 0.279
3Q8B Crystal structure of WT Protective Antigen (pH 9.0) 提交 2011-01-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–764（735 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 9；293 K；25 %(w/v) PEG 1500, 100 mM MMT Buffer, pH 9.0, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.258
3Q8C Crystal structure of Protective Antigen W346F (pH 5.5) 提交 2011-01-06	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–764（735 aa）	突变：W346F	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；25%(w/v) PEG 1500, 100mM SPG Buffer, pH 5.5, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 2.85 Å R-free 0.271
3Q8E Crystal structure of Protective Antigen W346F (pH 8.5) 提交 2011-01-06	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–764（735 aa）	突变：W346F	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；25%(w/v) PEG 1500, 100mM SPG Buffer, pH 8.5, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.248
3Q8F Crystal structure of 2-Fluorohistine labeled Protective Antigen (pH 5.8) 提交 2011-01-06	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–764（735 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；30% PEG 400, 100mM MES, pH 7.0, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.267
3TEZ Crystal Structure of Anthrax Protective Antigen Mutant S337C N664C and dithiolacetone modified to 1.8-A resolution 提交 2011-08-15	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–764（735 aa）	突变：S337C,N664C	CA CALCIUM ION × 2 MXE 2-METHOXYETHANOL × 2 ACN ACETONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；20% PEG-ME 2000, 0.1M Tris-Cl, 0.2M Trimethylamine-N-oxide, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.83 Å R-free 0.226
4EE2 Crystal Structure of Anthrax Protective Antigen K446M Mutant to 1.91-A Resolution 提交 2012-03-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–764（735 aa）片段：Protective antigen	突变：K446M	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；0.1M tris, 20% peg2k-MME, 0.2M TMAO, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.91 Å R-free 0.265
4H2A Crystal structure of wild type protective antigen to 1.62 A (pH 7.5) 提交 2012-09-12	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–764（735 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；280 K；protein crystallised from 0.1 M HEPES pH 7.5, 10 % PEG 8000, 8 % ethylene glycol by sitting drop vapour diffusion at temperature 280 K., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 1.62 Å R-free 0.219
4NAM 1.7A structure of 5-Fluoro Tryptophan Labeled Protective Antigen (W206Y) 提交 2013-10-22	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–764（735 aa）	突变：W206Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；35% (v/v) Pentaerythritol propoxylate (5/4 PO/OH), 0.05 M HEPES, 0.2 M Potassium chloride, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 1.70 Å R-free 0.208
5FR3 X-ray crystal structure of aggregation-resistant protective antigen of Bacillus anthracis (mutant S559L T576E) 提交 2015-12-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 43–764（722 aa）	突变：YES	CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 20 MM MGCL2, 100 MM HEPES PH 7.5, 22% POLY(ACRYLIC ACID SODIUM SALT) 5100	分辨率 1.94 Å R-free 0.227
6PSN Anthrax toxin protective antigen channels bound to lethal factor 提交 2019-07-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 197–764（568 aa）链 B 197–764（568 aa）链 C 197–764（568 aa）链 D 197–764（568 aa）链 E 197–764（568 aa）链 F 197–764（568 aa）链 G 197–764（568 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å
6UJI Low resolution crystal structure (5.5 A) of the anthrax toxin protective antigen heptamer prepore D425A mutant 提交 2019-10-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 197–764（568 aa）链 B 197–764（568 aa）链 C 197–764（568 aa）链 D 197–764（568 aa）链 E 197–764（568 aa）链 F 197–764（568 aa）链 G 197–764（568 aa）	突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；10% (v/v) ethanol, 0.1 M Tris	分辨率 5.50 Å R-free 0.278
6UJI Low resolution crystal structure (5.5 A) of the anthrax toxin protective antigen heptamer prepore D425A mutant 提交 2019-10-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 H 197–764（568 aa）链 I 197–764（568 aa）链 J 197–764（568 aa）链 K 197–764（568 aa）链 L 197–764（568 aa）链 M 197–764（568 aa）链 N 197–764（568 aa）	突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；10% (v/v) ethanol, 0.1 M Tris	分辨率 5.50 Å R-free 0.278
6UZB Anthrax toxin protective antigen channels bound to edema factor 提交 2019-11-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 30–764（735 aa）链 B 30–764（735 aa）链 C 30–764（735 aa）链 D 30–764（735 aa）链 E 30–764（735 aa）链 F 30–764（735 aa）链 G 30–764（735 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6UZD Anthrax toxin protective antigen channels bound to edema factor 提交 2019-11-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 A 30–764（735 aa）链 B 30–764（735 aa）链 C 30–764（735 aa）链 D 30–764（735 aa）链 E 30–764（735 aa）链 F 30–764（735 aa）链 G 30–764（735 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
6UZE Anthrax toxin protective antigen channels bound to edema factor 提交 2019-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 A 30–764（735 aa）链 B 30–764（735 aa）链 C 30–764（735 aa）链 D 30–764（735 aa）链 E 30–764（735 aa）链 F 30–764（735 aa）链 G 30–764（735 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
6VRA Anthrax octamer prechannel bound to full-length edema factor 提交 2020-02-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 33–764（732 aa）链 B 33–764（732 aa）链 C 33–764（732 aa）链 D 33–764（732 aa）链 E 33–764（732 aa）链 F 33–764（732 aa）链 G 33–764（732 aa）链 H 33–764（732 aa）	突变：K245G, R252N 突变：D512K 突变：K245G, R252N 突变：D512K 突变：K245G, R252N 突变：D512K 突变：K245G, R252N 突变：D512K	CA CALCIUM ION × 16	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
6WJJ Anthrax octamer prechannel bound to full-length lethal factor 提交 2020-04-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 33–764（732 aa）链 B 33–764（732 aa）链 C 33–764（732 aa）链 D 33–764（732 aa）链 E 33–764（732 aa）链 F 33–764（732 aa）链 G 33–764（732 aa）链 H 33–764（732 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 16 SO4 SULFATE ION × 4 ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
7KXR Protective antigen pore translocating lethal factor N-terminal domain 提交 2020-12-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 203–764（562 aa）片段：UNP Residues 203-764 链 B 203–764（562 aa）片段：UNP Residues 203-764 链 C 203–764（562 aa）片段：UNP Residues 203-764 链 D 203–764（562 aa）片段：UNP Residues 203-764 链 E 203–764（562 aa）片段：UNP Residues 203-764 链 F 203–764（562 aa）片段：UNP Residues 203-764 链 G 203–764（562 aa）片段：UNP Residues 203-764	未记录	CA CALCIUM ION × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 5.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7O85 Anthrax toxin prepore in complex with the neutralizing Fab cAb29 提交 2021-04-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 A 203–643（441 aa）链 D 203–643（441 aa）链 G 203–643（441 aa）链 J 203–643（441 aa）链 M 203–643（441 aa）链 P 203–643（441 aa）链 S 203–643（441 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å

共 28 个其他 PDB 条目、42 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PAG_BACAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 X； PDB构建体 1–735； UniProt 30–764

Anthrax toxin receptor 2

Homo sapiens

UniProt P58335

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 Y； UniProt 35–212	片段：A/I domain	Protective Antigen × 1 （P13423） CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；300 K；CHES buffer, PEG400, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 300K	分辨率 2.50 Å R-free 0.266

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 1T6B	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1SHT Crystal Structure of the von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis protein 2: an anthrax toxin receptor 提交 2004-02-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 X 38–217（180 aa）片段：VWA domain	未记录	ACT ACETATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8K, magnesium acetate, sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.81 Å R-free 0.186
1SHU Crystal Structure of the von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis protein 2: an anthrax toxin receptor 提交 2004-02-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 X 38–218（181 aa）片段：VWA domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；PEG3350, magnesium chloride, bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.50 Å R-free 0.215
1TZN Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor 提交 2004-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 a 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 b 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 c 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 d 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 e 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 f 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 o 38–218（181 aa）片段：VWA domain	未记录	CA CALCIUM ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, sodium chloride, Tris, magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 4.30 Å R-free 0.330
1TZN Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor 提交 2004-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 g 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 h 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 i 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 j 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 k 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 l 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 m 38–218（181 aa）片段：VWA domain	未记录	CA CALCIUM ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, sodium chloride, Tris, magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 4.30 Å R-free 0.330
1TZN Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor 提交 2004-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric	链 a 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 b 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 c 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 d 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 e 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 f 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 g 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 h 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 i 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 j 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 k 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 l 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 m 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 o 38–218（181 aa）片段：VWA domain	未记录	CA CALCIUM ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, sodium chloride, Tris, magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 4.30 Å R-free 0.330
1TZN Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor 提交 2004-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric	链 a 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 b 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 c 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 d 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 e 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 f 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 g 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 h 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 i 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 j 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 k 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 l 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 m 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 o 38–218（181 aa）片段：VWA domain	未记录	CA CALCIUM ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, sodium chloride, Tris, magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 4.30 Å R-free 0.330
1TZN Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor 提交 2004-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric	链 a 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 b 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 c 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 d 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 e 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 f 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 g 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 h 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 i 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 j 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 k 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 l 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 m 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 o 38–218（181 aa）片段：VWA domain	未记录	CA CALCIUM ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, sodium chloride, Tris, magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 4.30 Å R-free 0.330
7N1O The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone 提交 2021-05-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 40–217（178 aa）	突变：1TEL: R41A,D46G,V112E,K122A,vWa: R49A,C175A,V112A,K112A	MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；298 K；100 mM BisTris, 3.0 M NaCl	分辨率 2.77 Å R-free 0.228
8FT6 The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Ala-Ala linker variant, SUMO tag-free preparation. 提交 2023-01-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 40–217（178 aa）	突变：R14A,V77E,K87A,R89A,R91A,A225V	CIT CITRIC ACID × 1 IOD IODIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.2M Ammonium citrate tribasic, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.62 Å R-free 0.234
8FT8 The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Thr-Val linker variant, SUMO tag-free preparation 提交 2023-01-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 40–217（178 aa）	突变：R14A,V77E,K87A,R89A,R91T,A92V,A225V	GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 3 K POTASSIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1M HEPES, 2.0M ammonium sulfate	分辨率 1.60 Å R-free 0.204
8FZ4 The von Willebrand factor A domain of Anthrax toxin receptor 2 提交 2023-01-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 37–217（181 aa）	突变：P37G, C39A, C175A	MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；298 K；1.2 uL of 20 mg/mL protein in 12.5 mM Tris pH 8.8, 200mM KCl, 10mM MgCl2 combined with 1.2 uL of 0.1 M Glycine pH 9.5, 24% PEG 3350	分辨率 2.19 Å R-free 0.256
8FZ4 The von Willebrand factor A domain of Anthrax toxin receptor 2 提交 2023-01-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 37–217（181 aa）	突变：P37G, C39A, C175A	MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；298 K；1.2 uL of 20 mg/mL protein in 12.5 mM Tris pH 8.8, 200mM KCl, 10mM MgCl2 combined with 1.2 uL of 0.1 M Glycine pH 9.5, 24% PEG 3350	分辨率 2.19 Å R-free 0.256
8FZU The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Thr-Val linker variant, Expressed with SUMO tag 提交 2023-01-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 39–217（179 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1M HEPES 2.0M ammonium sulfate	分辨率 1.90 Å R-free 0.266
8FZU The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Thr-Val linker variant, Expressed with SUMO tag 提交 2023-01-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 39–217（179 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1M HEPES 2.0M ammonium sulfate	分辨率 1.90 Å R-free 0.266
8FZU The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Thr-Val linker variant, Expressed with SUMO tag 提交 2023-01-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 39–217（179 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1M HEPES 2.0M ammonium sulfate	分辨率 1.90 Å R-free 0.266
8FZV The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Ala-Ala linker variant, expressed with SUMO tag 提交 2023-01-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 40–217（178 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；298 K；100 mM sodium acetate, pH 4.6, 2.0 M sodium formate	分辨率 3.29 Å R-free 0.314
8FZV The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Ala-Ala linker variant, expressed with SUMO tag 提交 2023-01-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 40–217（178 aa）	未记录	UNX UNKNOWN LIGAND × 32	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；298 K；100 mM sodium acetate, pH 4.6, 2.0 M sodium formate	分辨率 3.29 Å R-free 0.314
8FZV The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Ala-Ala linker variant, expressed with SUMO tag 提交 2023-01-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 40–217（178 aa）	未记录	UNX UNKNOWN LIGAND × 58	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；298 K；100 mM sodium acetate, pH 4.6, 2.0 M sodium formate	分辨率 3.29 Å R-free 0.314
9DOC The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Thr-Val linker variant, at 1.2 Angstrom resolution 提交 2024-09-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 43–217（175 aa）片段：von Willebrand factor A domain of CMG2	突变：TELSAM: R80S,V112E (Uniprot numbering),vWA: C175A (Uniprot numbering)	GOL GLYCEROL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 7 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.25；298 K；100 mM Bis-Tris, pH 7.25, 1350 mM Sodium Potassium Phosphate	分辨率 1.19 Å R-free 0.197
9RT2 NetF - ANTXR2 structure (C4) 提交 2025-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 C1 34–318（285 aa）链 C2 34–318（285 aa）链 C3 34–318（285 aa）链 C4 34–318（285 aa）	突变：deleted TM and cytoplasmic domains 突变：deleted TM and cytoplasmic domains 突变：deleted TM and cytoplasmic domains 突变：deleted TM and cytoplasmic domains	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9RT4 NetF - ANTXR2 local refinement focused 提交 2025-07-02	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C1 34–318（285 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9YKB The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, fused to the 1TEL crystallization chaperone, Ala-Val linker variant, expressed with SUMO tag. 提交 2025-10-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 40–217（178 aa）	突变：R4A,V67E,K77A,R81A,A82V,C215A	MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M BisTrisPropane, 1.5M Ammonium Sulfate	分辨率 2.50 Å R-free 0.194
9YKB The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, fused to the 1TEL crystallization chaperone, Ala-Val linker variant, expressed with SUMO tag. 提交 2025-10-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 40–217（178 aa）	突变：R4A,V67E,K77A,R81A,A82V,C215A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M BisTrisPropane, 1.5M Ammonium Sulfate	分辨率 2.50 Å R-free 0.194
9YKB The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, fused to the 1TEL crystallization chaperone, Ala-Val linker variant, expressed with SUMO tag. 提交 2025-10-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 40–217（178 aa）	突变：R4A,V67E,K77A,R81A,A82V,C215A	MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M BisTrisPropane, 1.5M Ammonium Sulfate	分辨率 2.50 Å R-free 0.194

共 13 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ANTR2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 Y； PDB构建体 6–183； UniProt 35–212

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1t6b
沉积日期 deposition_date	2004-05-05
结构标题 title	Crystal structure of B. anthracis Protective Antigen complexed with human Anthrax toxin receptor
关键词 keywords	Bacillus Anthracis; Anthrax toxin; X-ray crystallography, MEMBRANE PROTEIN-TOXIN COMPLEX; MEMBRANE PROTEIN/TOXIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	38.04 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	38.63 Å
零角强度 I(0) i0	137717000.00
分子量 molecular_weight	95270.0 kDa
排除体积 excluded_volume	119530 Å³
包络体积 envelope_volume	157730 Å³
水化壳体积 shell_volume	37492 Å³
包络直径 envelope_diameter	139.2 Å
壳层 Rg shell_rg	39.82 Å
包络 Rg envelope_rg	38.50 Å
形状 Rg shape_rg	38.64 Å
总 Rg total_rg	38.68 Å
总原子数 total_atoms	6713
残基数 n_residues	846
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	132.8 Å
Rg (实空间) rg_real	38.65 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.49 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.3770e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.6240e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	38.28 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	137700000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7815
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	31.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.632
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.178
角度范围 angular_range	— – 0.2100 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	26110000.0000
实空间数据点数 n_real_points	43
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.679; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.697; Smooth: 0.423

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Protective Antigen
分子量 formula_weight	82768.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X
原子数 atom_count	6852

EVKQENRLLNESESSSQGLLGYYFSDLNFQAPMVVTSSTTGDLSIPSSELENIPSENQYFQSAIWSGFIKVKKSDEYTFATSADNHVTMWVDDQEVINKASNSNKIRLEKGRLYQIKIQYQRENPTEKGLDFKLYWTDSQNKKEVISSDNLQLPELKQKSSNSRKKRSTSAGPTVPDRDNDGIPDSLEVEGYTVDVKNKRTFLSPWISNIHEKKGLTKYKSSPEKWSTASDPYSDFEKVTGRIDKNVSPEARHPLVAAYPIVHVDMENIILSKNEDQSTQNTDSQTRTISKNTSTSRTHTSEVHGNAEVHASFFDIGGSVSAGFSNSNSSTVAIDHSLSLAGERTWAETMGLNTADTARLNANIRYVNTGTAPIYNVLPTTSLVLGKNQTLATIKAKENQLSQILAPNNYYPSKNLAPIALNAQDDFSSTPITMNYNQFLELEKTKQLRLDTDQVYGNIATYNFENGRVRVDTGSNWSEVLPQIQETTARIIFNGKDLNLVERRIAAVNPSDPLETTKPDMTLKEALKIAFGFNEPNGNLQYQGKDITEFDFNFDQQTSQNIKNQLAELNATNIYTVLDKIKLNAKMNILIRDKRFHYDRNNIAVGADESVVKEAHREVINSSTEGLLLNIDKDIRKILSGYIVEIEDTEGLKEVINDRYDMLNISSLRQDGKTFIDFKKYNDKLPLYISNPNYKVNVYAVTKENTIINPSENGDTSTNGIKKILIFSKKGYEIG

来源 Source

来源生物 organism	Bacillus anthracis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1392
宿主生物 host_organism	Bacillus anthracis

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Anthrax toxin receptor 2
分子量 formula_weight	20630.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y

GSHMLEDPRGRRAFDLYFVLDKSGSVANNWIEIYNFVQQLAERFVSPEMRLSFIVFSSQATIILPLTGDRGKISKGLEDLKRVSPVGETYIHEGLKLANEQIQKAGGLKTSSIIIALTDGKLDGLVPSYAEKEAKISRSLGASVYCVGVLDFEQAQLERIADSKEQVFPVKGGFQALKGIINSSNGIAA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	TETRAETHYLENE GLYCOL
分子量 formula_weight	194.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	MANGANESE (II) ION
分子量 formula_weight	54.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	139

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_id	d1t6bx1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.60 — Anthrax protective antigen C-terminal-like
超家族 Superfamily superfamily	f.60.1 — Anthrax protective antigen C-terminal-like
家族 Family family	f.60.1.1 — Anthrax protective antigen C-terminal-like

结构域编号 domain_id	d1t6bx2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.179 — Anthrax protective antigen N-terminal-like
超家族 Superfamily superfamily	b.179.1 — PA14-like
家族 Family family	b.179.1.1 — PA14

结构域编号 domain_id	d1t6by_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.62 — vWA-like
超家族 Superfamily superfamily	c.62.1 — vWA-like
家族 Family family	c.62.1.1 — Integrin A (or I) domain

CATH v4.4 (5 domains)

结构域编号 domain_id	1t6bX01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	182 — Toxin - Anthrax Protective Antigen; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Toxin - Anthrax Protective Antigen;domain 1

结构域编号 domain_id	1t6bX02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	240 — Protective antigen, heptamerisation domain

结构域编号 domain_id	1t6bX03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	110 —

结构域编号 domain_id	1t6bX04
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	810 —

结构域编号 domain_id	1t6bY00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	410 — von Willebrand factor, type A domain

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	88.160 Å
晶胞边长 b length_b	94.118 Å
晶胞边长 c length_c	135.597 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.500 Å
最低分辨率 resolution_low	30.000 Å
R 因子 r_factor	0.2101
R_work r_work	0.2072
R_free r_free	0.2657

fit	/app/data/saxs_computation/t6/1t6b/1t6b.fit
pddf	/app/data/pr_computation/t6/1t6b/1t6b.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/t6/1t6b/1t6b.dat

Crystal structure of B. anthracis Protective Antigen complexed with human Anthrax toxin receptor

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protective Antigen

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Anthrax toxin receptor 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

CATH v4.4 (5 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)