1tnm

TERTIARY STRUCTURE OF AN IMMUNOGLOBULIN-LIKE DOMAIN FROM THE GIANT MUSCLE PROTEIN TITIN: A NEW MEMBER OF THE I SET

Method: SOLUTION NMR Dmax: 51.2 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TITIN MODULE M5

Homo sapiens

UniProt Q8WZ42

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 33489–33579 未记录 无其他共同聚合物 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取环境条件 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 54 个其他 PDB 条目、123 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q8WZ42_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 10–100; UniProt 33489–33579

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1tnm

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1tnm
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1tnm
沉积日期 deposition_date1995-01-17
结构标题 titleTERTIARY STRUCTURE OF AN IMMUNOGLOBULIN-LIKE DOMAIN FROM THE GIANT MUSCLE PROTEIN TITIN: A NEW MEMBER OF THE I SET
关键词 keywordsMUSCLE PROTEIN; MUSCLE PROTEIN
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier14.34
回转半径 Rg (电子) rg_electron13.23
零角强度 I(0) i02302720.00
分子量 molecular_weight10148.0 kDa
排除体积 excluded_volume12555 ų
包络体积 envelope_volume13820 ų
水化壳体积 shell_volume9435 ų
包络直径 envelope_diameter50.7
壳层 Rg shell_rg18.23
包络 Rg envelope_rg13.76
形状 Rg shape_rg13.20
总 Rg total_rg14.40
总原子数 total_atoms1411
残基数 n_residues91
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax51.2
Rg (实空间) rg_real14.39
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.37
I(0) (实空间) i0_real2.3030e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.7490e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal14.38
I(0) (倒空间) i0_reciprocal2303000.0000
解质量估计 total_estimate0.8325
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary15.6
偏度 Skewness skewness0.498
峰度 Kurtosis kurtosis0.016
角度范围 angular_range— – 0.5000 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha670700.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.657; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.874; Smooth: 0.973

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1tnma_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family familyb.1.1.4 — I set domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id1tnmA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins

8. 引用文献 (2)

9. 文件与曲线 (10)