1tzn

Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protective antigen

Bacillus anthracis str.

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	Anthrax toxin receptor 2 × 7 （P58335） CALCIUM ION × 14 MAGNESIUM ION × 7	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	Anthrax toxin receptor 2 × 7 （P58335） CALCIUM ION × 14 MAGNESIUM ION × 7	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Anthrax toxin receptor 2 × 14 （P58335） CALCIUM ION × 28 MAGNESIUM ION × 14	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Anthrax toxin receptor 2 × 14 （P58335） CALCIUM ION × 28 MAGNESIUM ION × 14	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Anthrax toxin receptor 2 × 14 （P58335） CALCIUM ION × 28 MAGNESIUM ION × 14	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PAG_BACAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–562； UniProt 203–764 作者链 B； PDB构建体 1–562； UniProt 203–764 作者链 C； PDB构建体 1–562； UniProt 203–764 作者链 D； PDB构建体 1–562； UniProt 203–764 作者链 E； PDB构建体 1–562； UniProt 203–764 作者链 F； PDB构建体 1–562； UniProt 203–764 作者链 G； PDB构建体 1–562； UniProt 203–764 作者链 H； PDB构建体 1–562； UniProt 203–764 作者链 I； PDB构建体 1–562； UniProt 203–764 作者链 J； PDB构建体 1–562； UniProt 203–764 作者链 K； PDB构建体 1–562； UniProt 203–764 作者链 L； PDB构建体 1–562； UniProt 203–764 作者链 M； PDB构建体 1–562； UniProt 203–764 作者链 O； PDB构建体 1–562； UniProt 203–764

Anthrax toxin receptor 2

Homo sapiens

UniProt P58335

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	Protective antigen × 7 （P13423） CALCIUM ION × 14 MAGNESIUM ION × 7	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	Protective antigen × 7 （P13423） CALCIUM ION × 14 MAGNESIUM ION × 7	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Protective antigen × 14 （P13423） CALCIUM ION × 28 MAGNESIUM ION × 14	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Protective antigen × 14 （P13423） CALCIUM ION × 28 MAGNESIUM ION × 14	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Protective antigen × 14 （P13423） CALCIUM ION × 28 MAGNESIUM ION × 14	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ANTR2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 a； PDB构建体 1–181； UniProt 38–218 作者链 b； PDB构建体 1–181； UniProt 38–218 作者链 c； PDB构建体 1–181； UniProt 38–218 作者链 d； PDB构建体 1–181； UniProt 38–218 作者链 e； PDB构建体 1–181； UniProt 38–218 作者链 f； PDB构建体 1–181； UniProt 38–218 作者链 g； PDB构建体 1–181； UniProt 38–218 作者链 h； PDB构建体 1–181； UniProt 38–218 作者链 i； PDB构建体 1–181； UniProt 38–218 作者链 j； PDB构建体 1–181； UniProt 38–218 作者链 k； PDB构建体 1–181； UniProt 38–218 作者链 l； PDB构建体 1–181； UniProt 38–218 作者链 m； PDB构建体 1–181； UniProt 38–218 作者链 o； PDB构建体 1–181； UniProt 38–218

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1tzn
沉积日期 deposition_date	2004-07-10
结构标题 title	Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor
关键词 keywords	heptamer, TOXIN RECEPTOR-TOXIN COMPLEX; TOXIN RECEPTOR/TOXIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1tzn__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1tzn__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1tzn__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	60.65 Å
Rg（电子密度）	60.54 Å
总 Rg	60.77 Å
原子数	40285
残基数	5131
排除体积	716220 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1tzn__assembly_1__model_1`	tetradecameric （14）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1tzn__assembly_2__model_1`	tetradecameric （14）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`1tzn__assembly_3__model_1`	28-meric （28）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`1tzn__assembly_4__model_1`	28-meric （28）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
5	1	`1tzn__assembly_5__model_1`	28-meric （28）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Protective antigen
分子量 formula_weight	63019.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	14

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,O
原子数 atom_count	80570

TVPDRDNDGIPDSLEVEGYTVDVKNKRTFLSPWISNIHEKKGLTKYKSSPEKWSTASDPYSDFEKVTGRIDKNVSPEARHPLVAAYPIVHVDMENIILSKNEDQSTQNTDSQTRTISKNTSTSRTHTSEVHGNAEVHASFFDIGGSVSAGFSNSNSSTVAIDHSLSLAGERTWAETMGLNTADTARLNANIRYVNTGTAPIYNVLPTTSLVLGKNQTLATIKAKENQLSQILAPNNYYPSKNLAPIALNAQDDFSSTPITMNYNQFLELEKTKQLRLDTDQVYGNIATYNFENGRVRVDTGSNWSEVLPQIQETTARIIFNGKDLNLVERRIAAVNPSDPLETTKPDMTLKEALKIAFGFNEPNGNLQYQGKDITEFDFNFDQQTSQNIKNQLAELNATNIYTVLDKIKLNAKMNILIRDKRFHYDRNNIAVGADESVVKEAHREVINSSTEGLLLNIDKDIRKILSGYIVEIEDTEGLKEVINDRYDMLNISSLRQDGKTFIDFKKYNDKLPLYISNPNYKVNVYAVTKENTIINPSENGDTSTNGIKKILIFSKKGYEIG

来源 Source

来源生物 organism	Bacillus anthracis str.
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	191218
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Anthrax toxin receptor 2
分子量 formula_weight	19840.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	14

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a,b,c,d,e,f,g,h,i,j,k,l,m,o

SCRRAFDLYFVLDKSGSVANNWIEIYNFVQQLAERFVSPEMRLSFIVFSSQATIILPLTGDRGKISKGLEDLKRVSPVGETYIHEGLKLANEQIQKAGGLKTSSIIIALTDGKLDGLVPSYAEKEAKISRSLGASVYCVGVLDFEQAQLERIADSKEQVFPVKGGFQALKGIINSILAQSC

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	28

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	14

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 14 domains

SCOP 2.08 (14 domains)

结构域编号 domain_id	d1tzna_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.24 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex
超家族 Superfamily superfamily	i.24.1 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex
家族 Family family	i.24.1.1 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex

结构域编号 domain_id	d1tznb_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.24 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex
超家族 Superfamily superfamily	i.24.1 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex
家族 Family family	i.24.1.1 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex

结构域编号 domain_id	d1tznc_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.24 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex
超家族 Superfamily superfamily	i.24.1 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex
家族 Family family	i.24.1.1 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex

结构域编号 domain_id	d1tznd_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.24 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex
超家族 Superfamily superfamily	i.24.1 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex
家族 Family family	i.24.1.1 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex

结构域编号 domain_id	d1tzne_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.24 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex
超家族 Superfamily superfamily	i.24.1 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex
家族 Family family	i.24.1.1 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex

结构域编号 domain_id	d1tznf_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.24 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex
超家族 Superfamily superfamily	i.24.1 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex
家族 Family family	i.24.1.1 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex

结构域编号 domain_id	d1tzng_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.24 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex
超家族 Superfamily superfamily	i.24.1 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex
家族 Family family	i.24.1.1 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex

结构域编号 domain_id	d1tznh_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.24 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex
超家族 Superfamily superfamily	i.24.1 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex
家族 Family family	i.24.1.1 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex

结构域编号 domain_id	d1tzni_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.24 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex
超家族 Superfamily superfamily	i.24.1 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex
家族 Family family	i.24.1.1 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex

结构域编号 domain_id	d1tznj_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.24 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex
超家族 Superfamily superfamily	i.24.1 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex
家族 Family family	i.24.1.1 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex

结构域编号 domain_id	d1tznk_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.24 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex
超家族 Superfamily superfamily	i.24.1 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex
家族 Family family	i.24.1.1 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex

结构域编号 domain_id	d1tznl_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.24 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex
超家族 Superfamily superfamily	i.24.1 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex
家族 Family family	i.24.1.1 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex

结构域编号 domain_id	d1tznm_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.24 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex
超家族 Superfamily superfamily	i.24.1 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex
家族 Family family	i.24.1.1 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex

结构域编号 domain_id	d1tzno_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.24 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex
超家族 Superfamily superfamily	i.24.1 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex
家族 Family family	i.24.1.1 — anthrax toxin protective antigen-receptor complex

▶

晶胞边长 a length_a	158.800 Å
晶胞边长 b length_b	158.846 Å
晶胞边长 c length_c	214.084 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	69.58 °
晶胞夹角 β angle_beta	69.07 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	65.58 °
晶胞分子数 Z z_pdb	14

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.300 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	0.3250
R_work r_work	0.3220
R_free r_free	0.3300

Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protective antigen

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Anthrax toxin receptor 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1tzn__assembly_1__model_1

1tzn__assembly_1__model_1 | I(q)

1tzn__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 14 domains

SCOP 2.08 (14 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protective antigen

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Anthrax toxin receptor 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1tzn__assembly_1__model_1

1tzn__assembly_1__model_1 | I(q)

1tzn__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 14 domains

SCOP 2.08 (14 domains)

7. 引用文献 (1)