2cly

Subcomplex of the stator of bovine mitochondrial ATP synthase

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 181.3 Å Quality: REASONABLE

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP SYNTHASE B CHAIN, MITOCHONDRIAL

BOS TAURUS

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–214	片段：STATOR SUBCOMPLEX	ATP SYNTHASE D CHAIN, MITOCHONDRIAL × 1 （P13620） ATP SYNTHASE COUPLING FACTOR 6, MITOCHONDRIAL × 1 （P02721）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 8；100 MM TRIS, 150 MM NACL, 17% PEG 5K MME, 7.5% GLYCEROL, 1% PICOLINE, pH 8.00	分辨率 2.80 Å R-free 0.295
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 1–214	片段：STATOR SUBCOMPLEX	ATP SYNTHASE D CHAIN, MITOCHONDRIAL × 1 （P13620） ATP SYNTHASE COUPLING FACTOR 6, MITOCHONDRIAL × 1 （P02721）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 8；100 MM TRIS, 150 MM NACL, 17% PEG 5K MME, 7.5% GLYCEROL, 1% PICOLINE, pH 8.00	分辨率 2.80 Å R-free 0.295

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2CLY	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2WSS The structure of the membrane extrinsic region of bovine ATP synthase 提交 2009-09-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 T 141–256（116 aa）片段：RESIDUES 141-256	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；MICROBATCH UNDER OIL	分辨率 3.20 Å R-free 0.271
2WSS The structure of the membrane extrinsic region of bovine ATP synthase 提交 2009-09-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 X 141–256（116 aa）片段：RESIDUES 141-256	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；MICROBATCH UNDER OIL	分辨率 3.20 Å R-free 0.271
4B2Q Model of the yeast F1Fo-ATP synthase dimer based on subtomogram average 提交 2012-07-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric	链 T 121–249（129 aa）片段：RESIDUES 121-249 链 t 121–249（129 aa）片段：RESIDUES 121-249	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 250MM TREHALOSE 10NM TRIS- HCL PH7.4；pH 7.4；250MM TREHALOSE 10NM TRIS- HCL PH7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, TEMPERATURE- 100, INSTRUMENT- HOMEMADE PLUNGER, METHOD- SINGLE SIDE MANUAL BLOTTING FOR 5 SECONDS.,	分辨率 37.00 Å
5ARA Bovine mitochondrial ATP synthase state 1a 提交 2015-09-24	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 T 76–249（174 aa）片段：UNP RESIDUES 76-249	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3；pH 7.2；20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,	分辨率 7.40 Å
5ARE Bovine mitochondrial ATP synthase state 1b 提交 2015-09-24	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 T 76–249（174 aa）片段：UNP RESIDUES 76-249	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3；pH 7.2；20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,	分辨率 6.70 Å
5ARH Bovine mitochondrial ATP synthase state 2a 提交 2015-09-24	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 T 76–249（174 aa）片段：UNP RESIDUES 76-249	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3；pH 7.2；20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,	分辨率 7.20 Å
5ARI Bovine mitochondrial ATP synthase state 2b 提交 2015-09-24	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 T 76–249（174 aa）片段：UNP RESIDUES 76-249	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3；pH 7.2；20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,	分辨率 7.40 Å
5FIJ Bovine mitochondrial ATP synthase state 2c 提交 2015-09-28	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 T 76–249（174 aa）片段：UNP RESIDUES 76-249	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3；pH 7.2；20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,	分辨率 7.40 Å
5FIK Bovine mitochondrial ATP synthase state 3a 提交 2015-09-28	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 T 76–249（174 aa）片段：UNP RESIDUES 76-249	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3；pH 7.2；20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,	分辨率 6.40 Å
5FIL Bovine mitochondrial ATP synthase state 3b 提交 2015-09-28	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 T 76–249（174 aa）片段：UNP RESIDUES 76-249	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) GLYCEROL, 0.05% (WT/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3；pH 7.2；20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) GLYCEROL, 0.05% (WT/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,	分辨率 7.10 Å
6YY0 bovine ATP synthase F1-peripheral stalk domain, state 1 提交 2020-05-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 b 43–256（214 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 3.23 Å
6Z1R bovine ATP synthase F1-peripheral stalk domain, state 2 提交 2020-05-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 b 43–256（214 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 3.29 Å
6Z1U bovine ATP synthase F1c8-peripheral stalk domain, state 3 提交 2020-05-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 b 43–256（214 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 3.47 Å
6ZBB bovine ATP synthase Fo domain 提交 2020-06-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric	链 b 43–256（214 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 3 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 3.61 Å
6ZIQ bovine ATP synthase stator domain, state 1 提交 2020-06-26	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 b 43–256（214 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 4.33 Å
6ZIT bovine ATP synthase Stator domain, state 2 提交 2020-06-26	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 b 43–256（214 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 3.49 Å
6ZIU bovine ATP synthase stator domain, state 3 提交 2020-06-26	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 b 43–256（214 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Th sample was allowed to penetrate through the holey grid support and to distribute to both sides of the grid surface for ~15sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 6.02 Å
6ZPO bovine ATP synthase monomer state 1 (combined) 提交 2020-07-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric	链 b 43–256（214 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 CDL CARDIOLIPIN × 3 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 4.00 Å
6ZQM bovine ATP synthase monomer state 2 (combined) 提交 2020-07-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric	链 b 43–256（214 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 CDL CARDIOLIPIN × 3 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 3.29 Å
6ZQN bovine ATP synthase monomer state 3 (combined) 提交 2020-07-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric	链 b 43–256（214 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 CDL CARDIOLIPIN × 3 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 4.00 Å
7AJB bovine ATP synthase dimer state1:state1 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 Ab 43–256（214 aa）链 b 43–256（214 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.20 Å
7AJC bovine ATP synthase dimer state1:state2 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 Ab 43–256（214 aa）链 b 43–256（214 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.90 Å
7AJD bovine ATP synthase dimer state1:state3 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 Ab 43–256（214 aa）链 b 43–256（214 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.00 Å
7AJE bovine ATP synthase dimer state2:state1 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 Ab 43–256（214 aa）链 b 43–256（214 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.40 Å
7AJF bovine ATP synthase dimer state2:state2 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 Ab 43–256（214 aa）链 b 43–256（214 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.45 Å
7AJG bovine ATP synthase dimer state2:state3 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 Ab 43–256（214 aa）链 b 43–256（214 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.70 Å
7AJH bovine ATP synthase dimer state3:state1 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 Ab 43–256（214 aa）链 b 43–256（214 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.70 Å
7AJI bovine ATP synthase dimer state3:state2 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 Ab 43–256（214 aa）链 b 43–256（214 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.40 Å
7AJJ bovine ATP synthase dimer state3:state3 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 Ab 43–256（214 aa）链 b 43–256（214 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 13.10 Å
9W2R Cryo-EM structure of FoF1-ATPase monomer state 1 on the bovine heart submitochondrial particles (FoF1-1) 提交 2025-07-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric	链 b 43–256（214 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9W2S Cryo-EM structure of FoF1-ATPase monomer state 3 on the bovine heart submitochondrial particles (FoF1-2) 提交 2025-07-28	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric	链 b 43–256（214 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
9W2T Cryo-EM structure of Fo domain of FoF1-ATPase monomer state on the bovine heart submitochondrial particles 提交 2025-07-28	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric	链 b 43–154（112 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å

共 31 个其他 PDB 条目、32 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AT5F1_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–214； UniProt 1–214 作者链 D； PDB构建体 1–214； UniProt 1–214

ATP SYNTHASE D CHAIN, MITOCHONDRIAL

BOS TAURUS

UniProt P13620

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–160	片段：STATOR SUBCOMPLEX	ATP SYNTHASE B CHAIN, MITOCHONDRIAL × 1 （P13619） ATP SYNTHASE COUPLING FACTOR 6, MITOCHONDRIAL × 1 （P02721）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 8；100 MM TRIS, 150 MM NACL, 17% PEG 5K MME, 7.5% GLYCEROL, 1% PICOLINE, pH 8.00	分辨率 2.80 Å R-free 0.295
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 1–160	片段：STATOR SUBCOMPLEX	ATP SYNTHASE B CHAIN, MITOCHONDRIAL × 1 （P13619） ATP SYNTHASE COUPLING FACTOR 6, MITOCHONDRIAL × 1 （P02721）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 8；100 MM TRIS, 150 MM NACL, 17% PEG 5K MME, 7.5% GLYCEROL, 1% PICOLINE, pH 8.00	分辨率 2.80 Å R-free 0.295

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 2CLY	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2WSS The structure of the membrane extrinsic region of bovine ATP synthase 提交 2009-09-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 U 2–119（118 aa）片段：RESIDUES 2-119	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；MICROBATCH UNDER OIL	分辨率 3.20 Å R-free 0.271
4B2Q Model of the yeast F1Fo-ATP synthase dimer based on subtomogram average 提交 2012-07-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric	链 U 5–124（120 aa）片段：RESIDUES 5-124 链 u 5–124（120 aa）片段：RESIDUES 5-124	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 250MM TREHALOSE 10NM TRIS- HCL PH7.4；pH 7.4；250MM TREHALOSE 10NM TRIS- HCL PH7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, TEMPERATURE- 100, INSTRUMENT- HOMEMADE PLUNGER, METHOD- SINGLE SIDE MANUAL BLOTTING FOR 5 SECONDS.,	分辨率 37.00 Å
5ARA Bovine mitochondrial ATP synthase state 1a 提交 2015-09-24	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 U 2–125（124 aa）片段：UNP RESIDUES 2-125	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3；pH 7.2；20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,	分辨率 7.40 Å
5ARE Bovine mitochondrial ATP synthase state 1b 提交 2015-09-24	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 U 2–125（124 aa）片段：UNP RESIDUES 2-125	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3；pH 7.2；20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,	分辨率 6.70 Å
5ARH Bovine mitochondrial ATP synthase state 2a 提交 2015-09-24	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 U 2–125（124 aa）片段：UNP RESIDUES 2-125	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3；pH 7.2；20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,	分辨率 7.20 Å
5ARI Bovine mitochondrial ATP synthase state 2b 提交 2015-09-24	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 U 2–125（124 aa）片段：UNP RESIDUES 2-125	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3；pH 7.2；20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,	分辨率 7.40 Å
5FIJ Bovine mitochondrial ATP synthase state 2c 提交 2015-09-28	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 U 2–125（124 aa）片段：UNP RESIDUES 2-125	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3；pH 7.2；20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,	分辨率 7.40 Å
5FIK Bovine mitochondrial ATP synthase state 3a 提交 2015-09-28	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 U 2–125（124 aa）片段：UNP RESIDUES 2-125	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3；pH 7.2；20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,	分辨率 6.40 Å
5FIL Bovine mitochondrial ATP synthase state 3b 提交 2015-09-28	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 U 2–125（124 aa）片段：UNP RESIDUES 2-125	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) GLYCEROL, 0.05% (WT/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3；pH 7.2；20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) GLYCEROL, 0.05% (WT/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,	分辨率 7.10 Å
6YY0 bovine ATP synthase F1-peripheral stalk domain, state 1 提交 2020-05-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 d 2–161（160 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 3.23 Å
6ZBB bovine ATP synthase Fo domain 提交 2020-06-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric	链 d 2–161（160 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 3 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 3.61 Å
6ZIQ bovine ATP synthase stator domain, state 1 提交 2020-06-26	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 d 2–161（160 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 4.33 Å
6ZIT bovine ATP synthase Stator domain, state 2 提交 2020-06-26	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 d 2–161（160 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 3.49 Å
6ZIU bovine ATP synthase stator domain, state 3 提交 2020-06-26	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 d 2–161（160 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Th sample was allowed to penetrate through the holey grid support and to distribute to both sides of the grid surface for ~15sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 6.02 Å
6ZPO bovine ATP synthase monomer state 1 (combined) 提交 2020-07-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric	链 d 2–161（160 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 CDL CARDIOLIPIN × 3 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 4.00 Å
6ZQM bovine ATP synthase monomer state 2 (combined) 提交 2020-07-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric	链 d 2–161（160 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 CDL CARDIOLIPIN × 3 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 3.29 Å
6ZQN bovine ATP synthase monomer state 3 (combined) 提交 2020-07-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric	链 d 2–161（160 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 CDL CARDIOLIPIN × 3 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 4.00 Å
7AJB bovine ATP synthase dimer state1:state1 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 Ad 2–161（160 aa）链 d 2–161（160 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.20 Å
7AJC bovine ATP synthase dimer state1:state2 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 Ad 2–161（160 aa）链 d 2–161（160 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.90 Å
7AJD bovine ATP synthase dimer state1:state3 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 Ad 2–161（160 aa）链 d 2–161（160 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.00 Å
7AJE bovine ATP synthase dimer state2:state1 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 Ad 2–161（160 aa）链 d 2–161（160 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.40 Å
7AJF bovine ATP synthase dimer state2:state2 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 Ad 2–161（160 aa）链 d 2–161（160 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.45 Å
7AJG bovine ATP synthase dimer state2:state3 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 Ad 2–161（160 aa）链 d 2–161（160 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.70 Å
7AJH bovine ATP synthase dimer state3:state1 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 Ad 2–161（160 aa）链 d 2–161（160 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.70 Å
7AJI bovine ATP synthase dimer state3:state2 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 Ad 2–161（160 aa）链 d 2–161（160 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.40 Å
7AJJ bovine ATP synthase dimer state3:state3 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 Ad 2–161（160 aa）链 d 2–161（160 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 13.10 Å
9W2R Cryo-EM structure of FoF1-ATPase monomer state 1 on the bovine heart submitochondrial particles (FoF1-1) 提交 2025-07-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric	链 d 2–161（160 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9W2S Cryo-EM structure of FoF1-ATPase monomer state 3 on the bovine heart submitochondrial particles (FoF1-2) 提交 2025-07-28	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric	链 d 2–161（160 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
9W2T Cryo-EM structure of Fo domain of FoF1-ATPase monomer state on the bovine heart submitochondrial particles 提交 2025-07-28	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric	链 d 110–160（51 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å

共 29 个其他 PDB 条目、29 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	ATP5H_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160 作者链 E； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160

ATP SYNTHASE COUPLING FACTOR 6, MITOCHONDRIAL

BOS TAURUS

UniProt P02721

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 32–108	片段：STATOR SUBCOMPLEX	ATP SYNTHASE B CHAIN, MITOCHONDRIAL × 1 （P13619） ATP SYNTHASE D CHAIN, MITOCHONDRIAL × 1 （P13620）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 8；100 MM TRIS, 150 MM NACL, 17% PEG 5K MME, 7.5% GLYCEROL, 1% PICOLINE, pH 8.00	分辨率 2.80 Å R-free 0.295
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 32–108	片段：STATOR SUBCOMPLEX	ATP SYNTHASE B CHAIN, MITOCHONDRIAL × 1 （P13619） ATP SYNTHASE D CHAIN, MITOCHONDRIAL × 1 （P13620）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 8；100 MM TRIS, 150 MM NACL, 17% PEG 5K MME, 7.5% GLYCEROL, 1% PICOLINE, pH 8.00	分辨率 2.80 Å R-free 0.295

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 2CLY	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1VZS Solution structure of subunit F6 from the peripheral stalk region of ATP synthase from bovine heart mitochondria 提交 2004-05-25	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 33–108（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；300 K；压力 1 NMR样品组成 95% H2O, 5% D2O, 50MM NACL, 20 MM PHOSPHATE	分辨率未提供
2WSS The structure of the membrane extrinsic region of bovine ATP synthase 提交 2009-09-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 V 33–108（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；MICROBATCH UNDER OIL	分辨率 3.20 Å R-free 0.271
2WSS The structure of the membrane extrinsic region of bovine ATP synthase 提交 2009-09-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 Z 33–108（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；MICROBATCH UNDER OIL	分辨率 3.20 Å R-free 0.271
4B2Q Model of the yeast F1Fo-ATP synthase dimer based on subtomogram average 提交 2012-07-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric	链 V 36–101（66 aa）片段：RESIDUES 36-101 链 v 36–101（66 aa）片段：RESIDUES 36-101	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 250MM TREHALOSE 10NM TRIS- HCL PH7.4；pH 7.4；250MM TREHALOSE 10NM TRIS- HCL PH7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, TEMPERATURE- 100, INSTRUMENT- HOMEMADE PLUNGER, METHOD- SINGLE SIDE MANUAL BLOTTING FOR 5 SECONDS.,	分辨率 37.00 Å
5ARA Bovine mitochondrial ATP synthase state 1a 提交 2015-09-24	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 V 32–108（77 aa）片段：UNP RESIDUES 32-108	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3；pH 7.2；20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,	分辨率 7.40 Å
5ARE Bovine mitochondrial ATP synthase state 1b 提交 2015-09-24	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 V 32–108（77 aa）片段：UNP RESIDUES 32-108	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3；pH 7.2；20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,	分辨率 6.70 Å
5ARH Bovine mitochondrial ATP synthase state 2a 提交 2015-09-24	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 V 32–108（77 aa）片段：UNP RESIDUES 32-108	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3；pH 7.2；20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,	分辨率 7.20 Å
5ARI Bovine mitochondrial ATP synthase state 2b 提交 2015-09-24	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 V 32–108（77 aa）片段：UNP RESIDUES 32-108	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3；pH 7.2；20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,	分辨率 7.40 Å
5FIJ Bovine mitochondrial ATP synthase state 2c 提交 2015-09-28	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 V 32–108（77 aa）片段：UNP RESIDUES 32-108	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3；pH 7.2；20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,	分辨率 7.40 Å
5FIK Bovine mitochondrial ATP synthase state 3a 提交 2015-09-28	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 V 32–108（77 aa）片段：UNP RESIDUES 32-108	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3；pH 7.2；20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,	分辨率 6.40 Å
5FIL Bovine mitochondrial ATP synthase state 3b 提交 2015-09-28	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 V 32–108（77 aa）片段：UNP RESIDUES 32-108	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) GLYCEROL, 0.05% (WT/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3；pH 7.2；20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) GLYCEROL, 0.05% (WT/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING,	分辨率 7.10 Å
6YY0 bovine ATP synthase F1-peripheral stalk domain, state 1 提交 2020-05-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 h 33–108（76 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 3.23 Å
6Z1R bovine ATP synthase F1-peripheral stalk domain, state 2 提交 2020-05-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 h 33–108（76 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 3.29 Å
6Z1U bovine ATP synthase F1c8-peripheral stalk domain, state 3 提交 2020-05-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 h 33–108（76 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 3.47 Å
6ZIQ bovine ATP synthase stator domain, state 1 提交 2020-06-26	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 h 33–108（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 4.33 Å
6ZIT bovine ATP synthase Stator domain, state 2 提交 2020-06-26	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 h 33–108（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 3.49 Å
6ZIU bovine ATP synthase stator domain, state 3 提交 2020-06-26	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 h 33–108（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Th sample was allowed to penetrate through the holey grid support and to distribute to both sides of the grid surface for ~15sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 6.02 Å
6ZPO bovine ATP synthase monomer state 1 (combined) 提交 2020-07-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric	链 h 33–108（76 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 CDL CARDIOLIPIN × 3 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 4.00 Å
6ZQM bovine ATP synthase monomer state 2 (combined) 提交 2020-07-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric	链 h 33–108（76 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 CDL CARDIOLIPIN × 3 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 3.29 Å
6ZQN bovine ATP synthase monomer state 3 (combined) 提交 2020-07-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric	链 h 33–108（76 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 CDL CARDIOLIPIN × 3 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was allowed to penetrate through the holey support and to distribute to both sides of the grid surface for ca. 15 sec. Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting.	分辨率 4.00 Å
7AJB bovine ATP synthase dimer state1:state1 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 Ah 33–108（76 aa）链 h 33–108（76 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.20 Å
7AJC bovine ATP synthase dimer state1:state2 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 Ah 33–108（76 aa）链 h 33–108（76 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.90 Å
7AJD bovine ATP synthase dimer state1:state3 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 Ah 33–108（76 aa）链 h 33–108（76 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.00 Å
7AJE bovine ATP synthase dimer state2:state1 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 Ah 33–108（76 aa）链 h 33–108（76 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.40 Å
7AJF bovine ATP synthase dimer state2:state2 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 Ah 33–108（76 aa）链 h 33–108（76 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.45 Å
7AJG bovine ATP synthase dimer state2:state3 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 Ah 33–108（76 aa）链 h 33–108（76 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.70 Å
7AJH bovine ATP synthase dimer state3:state1 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 Ah 33–108（76 aa）链 h 33–108（76 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.70 Å
7AJI bovine ATP synthase dimer state3:state2 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 Ah 33–108（76 aa）链 h 33–108（76 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.40 Å
7AJJ bovine ATP synthase dimer state3:state3 提交 2020-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：58-meric	链 Ah 33–108（76 aa）链 h 33–108（76 aa）	未记录	CDL CARDIOLIPIN × 6 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 13.10 Å
9W2R Cryo-EM structure of FoF1-ATPase monomer state 1 on the bovine heart submitochondrial particles (FoF1-1) 提交 2025-07-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric	链 h 33–108（76 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9W2S Cryo-EM structure of FoF1-ATPase monomer state 3 on the bovine heart submitochondrial particles (FoF1-2) 提交 2025-07-28	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric	链 h 33–108（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å

共 30 个其他 PDB 条目、31 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ATP5J_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–77； UniProt 32–108 作者链 F； PDB构建体 1–77； UniProt 32–108

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2cly
沉积日期 deposition_date	2006-05-03
结构标题 title	Subcomplex of the stator of bovine mitochondrial ATP synthase
关键词 keywords	;MITOCHONDRIA, MITOCHONDRION, ION TRANSPORT, CF(0), STATOR, TRANSPORT, ACETYLATION, ATP SYNTHASE, HYDROGEN ION TRANSPORT, TRANSIT PEPTIDE, PERIPHERAL STALK, HYDROLASE ;; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	43.08 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	43.95 Å
零角强度 I(0) i0	73852900.00
分子量 molecular_weight	68700.0 kDa
排除体积 excluded_volume	86153 Å³
包络体积 envelope_volume	138790 Å³
水化壳体积 shell_volume	30702 Å³
包络直径 envelope_diameter	184.3 Å
壳层 Rg shell_rg	38.83 Å
包络 Rg envelope_rg	46.37 Å
形状 Rg shape_rg	43.89 Å
总 Rg total_rg	43.78 Å
总原子数 total_atoms	4839
残基数 n_residues	583
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	181.3 Å
Rg (实空间) rg_real	43.79 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	3.42 Å
I(0) (实空间) i0_real	7.3850e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.6750e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	43.08 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	73790000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6446
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	3
主峰位置 r_peak_primary	39.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.682
峰度 Kurtosis kurtosis	0.043
角度范围 angular_range	— – 0.1850 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	4385000.0000
实空间数据点数 n_real_points	38
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.371; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.262; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ATP SYNTHASE B CHAIN, MITOCHONDRIAL
分子量 formula_weight	24702.7 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.3.14
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,D
原子数 atom_count	4845

PVPPLPEHGGKVRFGLIPEEFFQFLYPKTGVTGPYVLGTGLILYLLSKEIYVITPETFSAISTIGFLVYIVKKYGASVGEFADKLNEQKIAQLEEVKQASIKQIQDAIDMEKSQQALVQKRHYLFDVQRNNIAMALEVTYRERLHRVYREVKNRLDYHISVQNMMRQKEQEHMINWVEKRVVQSISAQQEKETIAKCIADLKLLSKKAQAQPVM

来源 Source

来源生物 organism	BOS TAURUS
通用名 common_name	BOVINE
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9913
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	ATP SYNTHASE D CHAIN, MITOCHONDRIAL
分子量 formula_weight	18588.3 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.3.14
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,E

AGRKLALKTIDWVAFGEIIPRNQKAVANSLKSWNETLTSRLATLPEKPPAIDWAYYKANVAKAGLVDDFEKKFNALKVPIPEDKYTAQVDAEEKEDVKSCAEFLTQSKTRIQEYEKELEKMRNIIPFDQMTIEDLNEVFPETKLDKKKYPYWPHRPIETL

来源 Source

来源生物 organism	BOS TAURUS
通用名 common_name	BOVINE
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9913
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	ATP SYNTHASE COUPLING FACTOR 6, MITOCHONDRIAL
分子量 formula_weight	9118.3 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.3.14
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,F

FNKELDPVQKLFVDKIREYRTKRQTSGGPVDAGPEYQQDLDRELFKLKQMYGKADMNTFPNFTFEDPKFEVVEKPQS

来源 Source

来源生物 organism	BOS TAURUS
通用名 common_name	BOVINE
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9913
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI BL21(DE3)

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_id	d2clya1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.52 — ATP synthase B chain-like
超家族 Superfamily superfamily	f.52.1 — ATP synthase B chain-like
家族 Family family	f.52.1.1 — ATP synthase B chain-like

结构域编号 domain_id	d2clyb1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.53 — ATP synthase D chain-like
超家族 Superfamily superfamily	f.53.1 — ATP synthase D chain-like
家族 Family family	f.53.1.1 — ATP synthase D chain-like

结构域编号 domain_id	d2clyc_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.45 — Mitochondrial ATP synthase coupling factor 6
超家族 Superfamily superfamily	f.45.1 — Mitochondrial ATP synthase coupling factor 6
家族 Family family	f.45.1.1 — Mitochondrial ATP synthase coupling factor 6

结构域编号 domain_id	d2clyd_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.52 — ATP synthase B chain-like
超家族 Superfamily superfamily	f.52.1 — ATP synthase B chain-like
家族 Family family	f.52.1.1 — ATP synthase B chain-like

结构域编号 domain_id	d2clye_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.53 — ATP synthase D chain-like
超家族 Superfamily superfamily	f.53.1 — ATP synthase D chain-like
家族 Family family	f.53.1.1 — ATP synthase D chain-like

结构域编号 domain_id	d2clyf_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.45 — Mitochondrial ATP synthase coupling factor 6
超家族 Superfamily superfamily	f.45.1 — Mitochondrial ATP synthase coupling factor 6
家族 Family family	f.45.1.1 — Mitochondrial ATP synthase coupling factor 6

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	2clyA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2210 —

结构域编号 domain_id	2clyB00
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	280 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 —

结构域编号 domain_id	2clyC01
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	280 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	200 —

结构域编号 domain_id	2clyD00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2210 —

结构域编号 domain_id	2clyE00
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	280 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 —

结构域编号 domain_id	2clyF01
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	280 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	200 —

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8. 引用文献 (2)

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晶胞边长 a length_a	50.499 Å
晶胞边长 b length_b	79.354 Å
晶胞边长 c length_c	115.665 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	93.08 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.800 Å
最低分辨率 resolution_low	115.470 Å
R 因子 r_factor	0.2340
R_work r_work	0.2310
R_free r_free	0.2950

fit	/app/data/saxs_computation/cl/2cly/2cly.fit
pddf	/app/data/pr_computation/cl/2cly/2cly.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/cl/2cly/2cly.dat

Subcomplex of the stator of bovine mitochondrial ATP synthase

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP SYNTHASE B CHAIN, MITOCHONDRIAL

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ATP SYNTHASE D CHAIN, MITOCHONDRIAL

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ATP SYNTHASE COUPLING FACTOR 6, MITOCHONDRIAL

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

8. 引用文献 (2)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)