2drn

Docking and dimerization domain (D/D) of the Type II-alpha regulatory subunity of protein kinase A (PKA) in complex with a peptide from an A-kinase anchoring protein

Method: SOLUTION NMR
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit

Rattus norvegicus

UniProt P12368

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 24-residues peptide from an a-kinase anchoring protein × 1 (Q14572) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 KAP2_RAT
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 4–46; UniProt 2–44 作者链 B; PDB构建体 4–46; UniProt 2–44

24-residues peptide from an a-kinase anchoring protein

物种未注明

UniProt Q14572

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit × 2 (P12368) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q14572_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–23; UniProt 493–515

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2drn
沉积日期 deposition_date2006-06-11
结构标题 titleDocking and dimerization domain (D/D) of the Type II-alpha regulatory subunity of protein kinase A (PKA) in complex with a peptide from an A-kinase anchoring protein
关键词 keywordsAKAP, PKA, signal transduction, 4-helix bundle, helix-loop-helix, protein-peptide complex, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2drn__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2drn__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2drn__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)17.84 Å
Rg(电子密度)16.11 Å
总 Rg17.42 Å
原子数1648
残基数116
排除体积16736 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2drn__assembly_1__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 2drn__assembly_1__model_2 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 2drn__assembly_1__model_3 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 2drn__assembly_1__model_4 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 2drn__assembly_1__model_5 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 2drn__assembly_1__model_6 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 2drn__assembly_1__model_7 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 2drn__assembly_1__model_8 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 2drn__assembly_1__model_9 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 2drn__assembly_1__model_10 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 2drn__assembly_1__model_11 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 2drn__assembly_1__model_12 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 2drn__assembly_1__model_13 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd2drna1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.31 — Dimerization-anchoring domain of cAMP-dependent PK regulatory subunit
超家族 Superfamily superfamilya.31.1 — Dimerization-anchoring domain of cAMP-dependent PK regulatory subunit
家族 Family familya.31.1.1 — Dimerization-anchoring domain of cAMP-dependent PK regulatory subunit
结构域编号 domain_idd2drna2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd2drnb1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.31 — Dimerization-anchoring domain of cAMP-dependent PK regulatory subunit
超家族 Superfamily superfamilya.31.1 — Dimerization-anchoring domain of cAMP-dependent PK regulatory subunit
家族 Family familya.31.1.1 — Dimerization-anchoring domain of cAMP-dependent PK regulatory subunit
结构域编号 domain_idd2drnb2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id2drnA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology890 — cAMP-dependent Protein Kinase, Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit, dimerization-anchoring domain
结构域编号 domain_id2drnB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology890 — cAMP-dependent Protein Kinase, Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit, dimerization-anchoring domain
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7. 引用文献 (1)