Bacillus halodurans
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 其他组合 | 单体 | 蛋白 1 DNA 1 RNA 1 | 5'-R(*UP*CP*GP*AP*CP*A)-3' × 1 5'-D(*AP*TP*GP*TP*CP*G)-3' × 1 CALCIUM ION × 4 water × 3 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | RNH1_BACHD |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 3 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 5–142； UniProt 59–196 |
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| 条目编号 entry_id | 2g8k |
| 沉积日期 deposition_date | 2006-03-02 |
| 结构标题 title | B. halodurans RNase H catalytic domain D192N mutant in complex with Ca2+ and RNA/DNA hybrid (non-P nick at the active site) |
| 关键词 keywords | RNase H, Ribonuclease H, RNA/DNA hybrid, HYDROLASE-RNA-DNA COMPLEX; HYDROLASE/RNA/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 16.78 Å |
| Rg（电子密度） | 15.56 Å |
| 总 Rg | 16.62 Å |
| 原子数 | 1355 |
| 残基数 | 148 |
| 排除体积 | 23478 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d2g8ka_ |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.55 — Ribonuclease H-like motif |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.55.3 — Ribonuclease H-like |
| 家族 Family family | c.55.3.1 — Ribonuclease H |
| 结构域编号 domain_id | 2g8kA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 420 — Nucleotidyltransferase; domain 5 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H |