2gc4

Structural comparison of the oxidized ternary electron transfer complex of methylamine dehydrogenase, amicyanin and cytochrome c551i from Paracoccus denitrificans with the substrate-reduced, copper free complex at 1.9 A resolution.

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 192.4 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Methylamine dehydrogenase heavy chain

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 32–417	未记录	Methylamine dehydrogenase light chain × 1 （P22619） Amicyanin × 1 （P22364） Cytochrome c-L × 1 （P29899） CU COPPER (II) ION × 1 NA SODIUM ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.3-2.6M Sodium/potassium phosphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.197
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 32–417	未记录	Methylamine dehydrogenase light chain × 1 （P22619） Amicyanin × 1 （P22364） Cytochrome c-L × 1 （P29899） CU COPPER (II) ION × 1 NA SODIUM ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.3-2.6M Sodium/potassium phosphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.197
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 I； UniProt 32–417	未记录	Methylamine dehydrogenase light chain × 1 （P22619） Amicyanin × 1 （P22364） Cytochrome c-L × 1 （P29899） CU COPPER (II) ION × 1 NA SODIUM ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.3-2.6M Sodium/potassium phosphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.197
4	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 M； UniProt 32–417	未记录	Methylamine dehydrogenase light chain × 1 （P22619） Amicyanin × 1 （P22364） Cytochrome c-L × 1 （P29899） CU COPPER (II) ION × 1 NA SODIUM ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.3-2.6M Sodium/potassium phosphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.197

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2GC4	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1MG2 MUTATION OF ALPHA PHE55 OF METHYLAMINE DEHYDROGENASE ALTERS THE REORGANIZATION ENERGY AND ELECTRONIC COUPLING FOR ITS ELECTRON TRANSFER REACTION WITH AMICYANIN 提交 2002-08-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 28–417（390 aa）链 E 28–417（390 aa）	突变：alpha F55A of methylamine dehydrogenase 突变：alpha F55A of methylamine dehydrogenase	PO4 PHOSPHATE ION × 4 CU COPPER (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 2 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；phosphate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.25 Å R-free 0.210
1MG2 MUTATION OF ALPHA PHE55 OF METHYLAMINE DEHYDROGENASE ALTERS THE REORGANIZATION ENERGY AND ELECTRONIC COUPLING FOR ITS ELECTRON TRANSFER REACTION WITH AMICYANIN 提交 2002-08-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 I 28–417（390 aa）链 M 28–417（390 aa）	突变：alpha F55A of methylamine dehydrogenase 突变：alpha F55A of methylamine dehydrogenase	PO4 PHOSPHATE ION × 4 CU COPPER (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 2 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；phosphate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.25 Å R-free 0.210
1MG3 MUTATION OF ALPHA PHE55 OF METHYLAMINE DEHYDROGENASE ALTERS THE REORGANIZATION ENERGY AND ELECTRONIC COUPLING FOR ITS ELECTRON TRANSFER REACTION WITH AMICYANIN 提交 2002-08-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 28–417（390 aa）链 E 28–417（390 aa）	突变：F55A 突变：F55A	PO4 PHOSPHATE ION × 4 CU COPPER (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 2 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；phosphate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.40 Å R-free 0.246
1MG3 MUTATION OF ALPHA PHE55 OF METHYLAMINE DEHYDROGENASE ALTERS THE REORGANIZATION ENERGY AND ELECTRONIC COUPLING FOR ITS ELECTRON TRANSFER REACTION WITH AMICYANIN 提交 2002-08-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 I 28–417（390 aa）链 M 28–417（390 aa）	突变：F55A 突变：F55A	PO4 PHOSPHATE ION × 4 CU COPPER (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 2 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；phosphate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.40 Å R-free 0.246
2BBK CRYSTAL STRUCTURE OF THE QUINOPROTEIN METHYLAMINE DEHYDROGENASE FROM PARACOCCUS DENITRIFICANS AT 1.75 ANGSTROMS 提交 1993-12-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 63–417（355 aa）链 J 63–417（355 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.75 Å
2J55 X-ray reduced Paraccocus denitrificans methylamine dehydrogenase O- quinone in complex with amicyanin. 提交 2006-09-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 H 32–417（386 aa）链 J 32–417（386 aa）	未记录	CU COPPER (II) ION × 2 GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；pH 5.60	分辨率 2.15 Å R-free 0.245
2J56 X-ray reduced Paraccocus denitrificans methylamine dehydrogenase N- semiquinone in complex with amicyanin. 提交 2006-09-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 H 32–417（386 aa）链 J 32–417（386 aa）	未记录	CU COPPER (II) ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9；pH 9.00	分辨率 2.10 Å R-free 0.207
2J57 X-ray reduced Paraccocus denitrificans methylamine dehydrogenase N- quinol in complex with amicyanin. 提交 2006-09-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 H 32–417（386 aa）片段：RESIDUES 32-417 链 J 32–417（386 aa）片段：RESIDUES 32-417	未记录	CU COPPER (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；pH 5.60	分辨率 2.25 Å R-free 0.241
2J57 X-ray reduced Paraccocus denitrificans methylamine dehydrogenase N- quinol in complex with amicyanin. 提交 2006-09-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 32–417（386 aa）片段：RESIDUES 32-417 链 I 32–417（386 aa）片段：RESIDUES 32-417	未记录	CU COPPER (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；pH 5.60	分辨率 2.25 Å R-free 0.241
2MTA CRYSTAL STRUCTURE OF A TERNARY ELECTRON TRANSFER COMPLEX BETWEEN METHYLAMINE DEHYDROGENASE, AMICYANIN AND A C-TYPE CYTOCHROME 提交 1993-10-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 H 45–417（373 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 2 CU COPPER (II) ION × 2 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.40 Å

共 7 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DHMH_PARDE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–386； UniProt 32–417 作者链 E； PDB构建体 1–386； UniProt 32–417 作者链 I； PDB构建体 1–386； UniProt 32–417 作者链 M； PDB构建体 1–386； UniProt 32–417

Methylamine dehydrogenase light chain

物种未注明

UniProt P22619

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 58–188	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Methylamine dehydrogenase heavy chain × 1 （P29894） Amicyanin × 1 （P22364） Cytochrome c-L × 1 （P29899） CU COPPER (II) ION × 1 NA SODIUM ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.3-2.6M Sodium/potassium phosphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.197
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 58–188	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Methylamine dehydrogenase heavy chain × 1 （P29894） Amicyanin × 1 （P22364） Cytochrome c-L × 1 （P29899） CU COPPER (II) ION × 1 NA SODIUM ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.3-2.6M Sodium/potassium phosphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.197
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 J； UniProt 58–188	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Methylamine dehydrogenase heavy chain × 1 （P29894） Amicyanin × 1 （P22364） Cytochrome c-L × 1 （P29899） CU COPPER (II) ION × 1 NA SODIUM ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.3-2.6M Sodium/potassium phosphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.197
4	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 N； UniProt 58–188	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Methylamine dehydrogenase heavy chain × 1 （P29894） Amicyanin × 1 （P22364） Cytochrome c-L × 1 （P29899） CU COPPER (II) ION × 1 NA SODIUM ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.3-2.6M Sodium/potassium phosphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.197

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 2GC4	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1MG2 MUTATION OF ALPHA PHE55 OF METHYLAMINE DEHYDROGENASE ALTERS THE REORGANIZATION ENERGY AND ELECTRONIC COUPLING FOR ITS ELECTRON TRANSFER REACTION WITH AMICYANIN 提交 2002-08-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 58–188（131 aa）链 F 58–188（131 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PO4 PHOSPHATE ION × 4 CU COPPER (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 2 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；phosphate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.25 Å R-free 0.210
1MG2 MUTATION OF ALPHA PHE55 OF METHYLAMINE DEHYDROGENASE ALTERS THE REORGANIZATION ENERGY AND ELECTRONIC COUPLING FOR ITS ELECTRON TRANSFER REACTION WITH AMICYANIN 提交 2002-08-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 J 58–188（131 aa）链 N 58–188（131 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PO4 PHOSPHATE ION × 4 CU COPPER (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 2 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；phosphate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.25 Å R-free 0.210
1MG3 MUTATION OF ALPHA PHE55 OF METHYLAMINE DEHYDROGENASE ALTERS THE REORGANIZATION ENERGY AND ELECTRONIC COUPLING FOR ITS ELECTRON TRANSFER REACTION WITH AMICYANIN 提交 2002-08-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 58–188（131 aa）链 F 58–188（131 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PO4 PHOSPHATE ION × 4 CU COPPER (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 2 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；phosphate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.40 Å R-free 0.246
1MG3 MUTATION OF ALPHA PHE55 OF METHYLAMINE DEHYDROGENASE ALTERS THE REORGANIZATION ENERGY AND ELECTRONIC COUPLING FOR ITS ELECTRON TRANSFER REACTION WITH AMICYANIN 提交 2002-08-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 J 58–188（131 aa）链 N 58–188（131 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PO4 PHOSPHATE ION × 4 CU COPPER (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 2 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；phosphate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.40 Å R-free 0.246
2BBK CRYSTAL STRUCTURE OF THE QUINOPROTEIN METHYLAMINE DEHYDROGENASE FROM PARACOCCUS DENITRIFICANS AT 1.75 ANGSTROMS 提交 1993-12-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 L 64–188（125 aa）链 M 64–188（125 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.75 Å
2GC7 Substrate reduced, copper free complex of methylamine dehydrogenase, amicyanin and cytochrome c551i from Paracoccus denitrificans. 提交 2006-03-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 58–188（131 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NA SODIUM ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.3-2.6M sodium/potassium phosphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.198
2GC7 Substrate reduced, copper free complex of methylamine dehydrogenase, amicyanin and cytochrome c551i from Paracoccus denitrificans. 提交 2006-03-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 58–188（131 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NA SODIUM ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.3-2.6M sodium/potassium phosphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.198
2GC7 Substrate reduced, copper free complex of methylamine dehydrogenase, amicyanin and cytochrome c551i from Paracoccus denitrificans. 提交 2006-03-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 J 58–188（131 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NA SODIUM ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.3-2.6M sodium/potassium phosphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.198
2GC7 Substrate reduced, copper free complex of methylamine dehydrogenase, amicyanin and cytochrome c551i from Paracoccus denitrificans. 提交 2006-03-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 N 58–188（131 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NA SODIUM ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.3-2.6M sodium/potassium phosphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.198
2J55 X-ray reduced Paraccocus denitrificans methylamine dehydrogenase O- quinone in complex with amicyanin. 提交 2006-09-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 L 58–188（131 aa）链 M 58–188（131 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CU COPPER (II) ION × 2 GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；pH 5.60	分辨率 2.15 Å R-free 0.245
2J56 X-ray reduced Paraccocus denitrificans methylamine dehydrogenase N- semiquinone in complex with amicyanin. 提交 2006-09-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 L 58–188（131 aa）链 M 58–188（131 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CU COPPER (II) ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9；pH 9.00	分辨率 2.10 Å R-free 0.207
2J57 X-ray reduced Paraccocus denitrificans methylamine dehydrogenase N- quinol in complex with amicyanin. 提交 2006-09-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 L 58–188（131 aa）链 M 58–188（131 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CU COPPER (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；pH 5.60	分辨率 2.25 Å R-free 0.241
2J57 X-ray reduced Paraccocus denitrificans methylamine dehydrogenase N- quinol in complex with amicyanin. 提交 2006-09-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 K 58–188（131 aa）链 N 58–188（131 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CU COPPER (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；pH 5.60	分辨率 2.25 Å R-free 0.241
2MTA CRYSTAL STRUCTURE OF A TERNARY ELECTRON TRANSFER COMPLEX BETWEEN METHYLAMINE DEHYDROGENASE, AMICYANIN AND A C-TYPE CYTOCHROME 提交 1993-10-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 L 64–188（125 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PO4 PHOSPHATE ION × 2 CU COPPER (II) ION × 2 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.40 Å
3L4M Crystal Structure of the MauG/pre-Methylamine Dehydrogenase Complex. 提交 2009-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 58–188（131 aa）片段：Beta chain of immature methylamine dehydrogenase (preMADH) 链 E 58–188（131 aa）片段：Beta chain of immature methylamine dehydrogenase (preMADH)	突变：Trp57 is hydroxylated at C7 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：Trp57 is hydroxylated at C7 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 HEC HEME C × 4 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；0.1M MES pH 6.4, 0.1M sodium acetate, 24-30 % w/v PEG 8000, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K	分辨率 2.02 Å R-free 0.189
3L4O Crystal Structure of the MauG/pre-Methylamine Dehydrogenase Complex After Treatment with Hydrogen Peroxide 提交 2009-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 58–188（131 aa）片段：Beta chain of immature methylamine dehydrogenase (preMADH) 链 E 58–188（131 aa）片段：Beta chain of immature methylamine dehydrogenase (preMADH)	突变：Hydroxylated Trp57 has been converted to the full-quinone form due to hydrogen peroxide-assisted catalysis by MauG in the crystal. 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：Hydroxylated Trp57 has been converted to the full-quinone form due to hydrogen peroxide-assisted catalysis by MauG in the crystal. 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 HEC HEME C × 4 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；0.1M MES pH 6.4, 0.1M sodium acetate, 24-30 % w/v PEG 8000; followed by reaction of the crystal with hydrogen peroxide immediately prior to flash cooling., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.05 Å R-free 0.194
3ORV Crystal Structure of the Y294H-MauG/pre-Methylamine Dehydrogenase Complex 提交 2010-09-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 58–188（131 aa）片段：UNP residues 58-188 链 E 58–188（131 aa）片段：UNP residues 58-188	突变：Trp57 is hydroxylated at C7 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：Trp57 is hydroxylated at C7 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 HEC HEME C × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.4；293 K；Drops contained 1uL protein with 2uL reservoir solution. Protein solution: 100uM Y294H-MauG and 50uM preMADH in 10mM potassium phosphate pH 7.5. Reservoir solution contained: 24-26 % w/v PEG 8000, 0.1 M sodium acetate, 0.1 M MES pH 6.4., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.91 Å R-free 0.187
3PXS Crystal Structure of Diferrous MauG in Complex with Pre-Methylamine Dehydrogenase: 提交 2010-12-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 58–188（131 aa）片段：UNP residues 58-188 链 E 58–188（131 aa）片段：UNP residues 58-188	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NA SODIUM ION × 4 HEC HEME C × 4 CA CALCIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.4；293 K；0.1M MES pH 6.4, 0.1M sodium acetate, 23-25 % w/v PEG 8000, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.22 Å R-free 0.229
3PXT Crystal Structure of Ferrous CO Adduct of MauG in Complex with Pre-Methylamine Dehydrogenase 提交 2010-12-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 58–188（131 aa）片段：UNP residues 58-188 链 E 58–188（131 aa）片段：UNP residues 58-188	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NA SODIUM ION × 3 CMO CARBON MONOXIDE × 2 HEC HEME C × 4 CA CALCIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 3 PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.4；293 K；0.1M MES pH 6.4, 0.1M sodium acetate, 23-25 % w/v PEG 8000, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.16 Å R-free 0.226
3PXW Crystal Structure of Ferrous NO Adduct of MauG in Complex with Pre-Methylamine Dehydrogenase 提交 2010-12-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 58–188（131 aa）片段：UNP residues 58-188 链 E 58–188（131 aa）片段：UNP residues 58-188	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NA SODIUM ION × 2 NO NITRIC OXIDE × 2 HEC HEME C × 4 CA CALCIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 PG6 1-(2-METHOXY-ETHOXY)-2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.4；293 K；0.1M MES pH 6.4, 0.1M sodium acetate, 23-35 % w/v PEG 8000, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.11 Å R-free 0.242
3SJL Crystal Structure of the P107S-MauG/pre-Methylamine Dehydrogenase Complex 提交 2011-06-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 58–188（131 aa）片段：UNP residues 58-188 链 E 58–188（131 aa）片段：UNP residues 58-188	突变：Trp57 is hydroxylated at C7 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：Trp57 is hydroxylated at C7 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 4 HEC HEME C × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；Drops contained 1uL protein with 3uL reservoir solution. Protein solution: 100uM P107S-MauG and 50uM preMADH in 10mM potassium phosphate pH 7.5. Reservoir solution contained: 22% w/v PEG 8000, 0.1M sodium acetate, 0.1M MES pH 6.4., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.63 Å R-free 0.180
3SLE Crystal Structure of the P107C-MauG/pre-Methylamine Dehydrogenase Complex 提交 2011-06-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 58–188（131 aa）片段：UNP residues 58-188 链 E 58–188（131 aa）片段：UNP residues 58-188	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 HEC HEME C × 4 ACT ACETATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；0.1M MES pH 6.4, 0.1M sodium acetate, 24-30 % w/v PEG 8000, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.52 Å R-free 0.243
3SVW Crystal Structure of the P107V-MauG/pre-Methylamine Dehydrogenase Complex 提交 2011-07-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 58–188（131 aa）片段：UNP residues 58-188 链 E 58–188（131 aa）片段：UNP residues 58-188	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 4 HEC HEME C × 4 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 ACT ACETATE ION × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；Drops contained 1uL protein with 3uL reservoir solution. Protein solution: 100uM P107V-MauG and 50uM preMADH in 10mM potassium phosphate pH 7.5. Reservoir solution contained: 23% w/v PEG 8000, 0.1M sodium acetate, 0.1M MES pH 6.4., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.86 Å R-free 0.174
3SWS Crystal Structure of the Quinone Form of Methylamine Dehydrogenase in Complex with the Diferric Form of MauG 提交 2011-07-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 58–188（131 aa）片段：UNP residues 58-188 链 E 58–188（131 aa）片段：UNP residues 58-188	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 4 HEC HEME C × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ACT ACETATE ION × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；Drops contained 1uL protein with 3uL reservoir solution. Protein solution: 100uM WT-MauG and 50uM MADH in 10mM potassium phosphate pH 7.5. Reservoir solution contained: 25% w/v PEG 8000, 0.1M sodium acetate, 0.1M MES pH 6.2., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.86 Å R-free 0.178
3SXT Crystal Structure of the Quinol Form of Methylamine Dehydrogenase in Complex with the Diferrous Form of MauG 提交 2011-07-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 58–188（131 aa）片段：UNP residues 58-188 链 E 58–188（131 aa）片段：UNP residues 58-188	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 4 HEC HEME C × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.4；293 K；Drops contained 1uL protein with 3uL reservoir solution. WT-MauG and MADH were each reduced in an anaerobic glove box prior to preparing the protein mixture for crystallization. Protein mixture: 100uM reduced WT-MauG and 50uM reduced MADH in 10mM potassium phosphate pH7.5 with 2mM sodium dithionite. Reservoir solution contained: 22% w/v PEG 8000, 0.1M sodium acetate, 0.1M MES pH 6.4 and 2mM sodium dithionite. Crystallization was carried out in an anaerobic glove box at ambient temperature., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.81 Å R-free 0.187
4FA1 Crystal Structure of WT MauG in Complex with Pre-Methylamine Dehydrogenase Aged 130 Days. 提交 2012-05-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 58–188（131 aa）链 E 58–188（131 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 HEC HEME C × 4 NA SODIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ACT ACETATE ION × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；0.1M MES pH 6.4, 0.1M sodium acetate, 22-26 % w/v PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.18 Å R-free 0.227
4FA4 Crystal Structure of WT MauG in Complex with Pre-Methylamine Dehydrogenase Aged 10 Days 提交 2012-05-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 58–188（131 aa）片段：unp residues 58-188 链 E 58–188（131 aa）片段：unp residues 58-188	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 HEC HEME C × 4 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NA SODIUM ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；0.1M MES pH 6.4, 0.1M sodium acetate, 22-26 % w/v PEG 8000, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.14 Å R-free 0.227
4FA5 Crystal Structure of WT MauG in Complex with Pre-Methylamine Dehydrogenase Aged 20 Days 提交 2012-05-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 58–188（131 aa）片段：unp residues 58-188 链 E 58–188（131 aa）片段：unp residues 58-188	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 HEC HEME C × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 NA SODIUM ION × 3 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；0.1M MES pH 6.4, 0.1M sodium acetate, 22-26 % w/v PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.94 Å R-free 0.204
4FA9 Crystal Structure of WT MauG in Complex with Pre-Methylamine Dehydrogenase Aged 30 Days 提交 2012-05-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 58–188（131 aa）片段：unp residues 58-188 链 E 58–188（131 aa）片段：unp residues 58-188	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 HEC HEME C × 4 ACT ACETATE ION × 5 NA SODIUM ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；0.1M MES pH 6.4, 0.1M sodium acetate, 22-26 % w/v PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.09 Å R-free 0.214
4FAN Crystal Structure of WT MauG in Complex with Pre-Methylamine Dehydrogenase Aged 40 Days 提交 2012-05-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 58–188（131 aa）片段：unp residues 58-188 链 E 58–188（131 aa）片段：unp residues 58-188	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 HEC HEME C × 4 ACT ACETATE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；0.1M MES pH 6.4, 0.1M sodium acetate, 22-26 % w/v PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.08 Å R-free 0.234
4FAV Crystal Structure of WT MauG in Complex with Pre-Methylamine Dehydrogenase Aged 50 Days 提交 2012-05-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 58–188（131 aa）片段：unp residues 58-188 链 E 58–188（131 aa）片段：unp residues 58-188	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 HEC HEME C × 4 NA SODIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；0.1M MES pH 6.4, 0.1M sodium acetate, 22-26 % w/v PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.08 Å R-free 0.224
4FB1 Crystal Structure of WT MauG in Complex with Pre-Methylamine Dehydrogenase Aged 60 Days 提交 2012-05-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 58–188（131 aa）片段：unp residues 58-188 链 E 58–188（131 aa）片段：unp residues 58-188	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 HEC HEME C × 4 NA SODIUM ION × 3 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；0.1M MES pH 6.4, 0.1M sodium acetate, 22-26 % w/v PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.15 Å R-free 0.222
4K3I Crystal Structure of the Quinol Form of Methylamine Dehydrogenase in Complex with the Diferrous Form of MauG, C2 Space Group 提交 2013-04-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 58–188（131 aa）片段：UNP residues 58-188 链 E 58–188（131 aa）片段：UNP residues 58-188	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 HEC HEME C × 4 NA SODIUM ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；Drops contained 1uL protein with 3uL reservoir solution. WT-MauG and MADH were each reduced in an anaerobic glove box prior to preparing the protein mixture for crystallization. Protein mixture: 100uM reduced WT-MauG and 50uM reduced MADH in 10mM potassium phosphate pH7.5 with 2mM sodium dithionite. Reservoir solution contained: 24% w/v PEG 8000, 0.1M sodium acetate, 0.1M MES pH 6.4 and 2mM sodium dithionite. Crystallization was carried out in an anaerobic glove box at ambient temperature., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.190
4Y5R Crystal Structure of a T67A MauG/pre-Methylamine Dehydrogenase Complex 提交 2015-02-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 64–188（125 aa）片段：UNP RESIDUES 64-188 链 E 64–188（125 aa）片段：UNP RESIDUES 64-188	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 HEC HEME C × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；292 K；25-30% PEG 8000, 0,1 M sodium Acetate, 0.1 M MES pH 6.4	分辨率 2.80 Å R-free 0.256

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	DHML_PARDE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–131； UniProt 58–188 作者链 F； PDB构建体 1–131； UniProt 58–188 作者链 J； PDB构建体 1–131； UniProt 58–188 作者链 N； PDB构建体 1–131； UniProt 58–188

Amicyanin

物种未注明

UniProt P22364

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 27–131	未记录	Methylamine dehydrogenase heavy chain × 1 （P29894） Methylamine dehydrogenase light chain × 1 （P22619） Cytochrome c-L × 1 （P29899） CU COPPER (II) ION × 1 NA SODIUM ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.3-2.6M Sodium/potassium phosphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.197
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 27–131	未记录	Methylamine dehydrogenase heavy chain × 1 （P29894） Methylamine dehydrogenase light chain × 1 （P22619） Cytochrome c-L × 1 （P29899） CU COPPER (II) ION × 1 NA SODIUM ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.3-2.6M Sodium/potassium phosphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.197
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 K； UniProt 27–131	未记录	Methylamine dehydrogenase heavy chain × 1 （P29894） Methylamine dehydrogenase light chain × 1 （P22619） Cytochrome c-L × 1 （P29899） CU COPPER (II) ION × 1 NA SODIUM ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.3-2.6M Sodium/potassium phosphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.197
4	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 O； UniProt 27–131	未记录	Methylamine dehydrogenase heavy chain × 1 （P29894） Methylamine dehydrogenase light chain × 1 （P22619） Cytochrome c-L × 1 （P29899） CU COPPER (II) ION × 1 NA SODIUM ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.3-2.6M Sodium/potassium phosphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.197

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 2GC4	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AAC AMICYANIN OXIDIZED, 1.31 ANGSTROMS 提交 1995-09-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–131（105 aa）	未记录	CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.31 Å
1AAJ CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF AMICYANIN AND APOAMICYANIN FROM PARACOCCUS DENITRIFICANS AT 2.0 ANGSTROMS AND 1.8 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1992-04-09	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–131（105 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.80 Å
1AAN CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF AMICYANIN AND APOAMICYANIN FROM PARACOCCUS DENITRIFICANS AT 2.0 ANGSTROMS AND 1.8 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1992-04-09	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–131（105 aa）	未记录	CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å
1BXA AMICYANIN REDUCED, PH 4.4, 1.3 ANGSTROMS 提交 1998-10-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–131（105 aa）	未记录	CU1 COPPER (I) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.38；pH 4.38	分辨率 1.30 Å R-free 0.195
1MDA CRYSTAL STRUCTURE OF AN ELECTRON-TRANSFER COMPLEX BETWEEN METHYLAMINE DEHYDROGENASE AND AMICYANIN 提交 1992-03-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 29–131（103 aa）链 B 29–131（103 aa）	未记录	CU COPPER (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å
1MG2 MUTATION OF ALPHA PHE55 OF METHYLAMINE DEHYDROGENASE ALTERS THE REORGANIZATION ENERGY AND ELECTRONIC COUPLING FOR ITS ELECTRON TRANSFER REACTION WITH AMICYANIN 提交 2002-08-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 27–131（105 aa）链 G 27–131（105 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 4 CU COPPER (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 2 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；phosphate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.25 Å R-free 0.210
1MG2 MUTATION OF ALPHA PHE55 OF METHYLAMINE DEHYDROGENASE ALTERS THE REORGANIZATION ENERGY AND ELECTRONIC COUPLING FOR ITS ELECTRON TRANSFER REACTION WITH AMICYANIN 提交 2002-08-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 K 27–131（105 aa）链 O 27–131（105 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 4 CU COPPER (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 2 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；phosphate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.25 Å R-free 0.210
1MG3 MUTATION OF ALPHA PHE55 OF METHYLAMINE DEHYDROGENASE ALTERS THE REORGANIZATION ENERGY AND ELECTRONIC COUPLING FOR ITS ELECTRON TRANSFER REACTION WITH AMICYANIN 提交 2002-08-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 27–131（105 aa）链 G 27–131（105 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 4 CU COPPER (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 2 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；phosphate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.40 Å R-free 0.246
1MG3 MUTATION OF ALPHA PHE55 OF METHYLAMINE DEHYDROGENASE ALTERS THE REORGANIZATION ENERGY AND ELECTRONIC COUPLING FOR ITS ELECTRON TRANSFER REACTION WITH AMICYANIN 提交 2002-08-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 K 27–131（105 aa）链 O 27–131（105 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 4 CU COPPER (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 2 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；phosphate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.40 Å R-free 0.246
1SF3 Structure of the reduced form of the P94A mutant of amicyanin 提交 2004-02-19	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–131（105 aa）	突变：P94A	CU1 COPPER (I) ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5；293 K；3.6 M monobasic sodium phosphate, 0.4 M dibasic potassium phosphate, pH 5.0, EVAPORATION, temperature 293.0K	分辨率 1.05 Å R-free 0.147
1SF5 Structure of oxidized state of the P94A mutant of amicyanin 提交 2004-02-19	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–131（105 aa）	突变：P94A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5；293 K；3.6 M monobasic sodium phosphate, 0.4 M dibasic potassium phosphate, pH 5.0, EVAPORATION, temperature 293.0K	分辨率 1.10 Å R-free 0.166
1SFD oxidized form of amicyanin mutant P94F 提交 2004-02-19	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–131（105 aa）	突变：P94F	CU COPPER (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；100 mM sodium citrate, 2.25 M ammonium sulfate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.0K	分辨率 0.99 Å R-free 0.147
1SFD oxidized form of amicyanin mutant P94F 提交 2004-02-19	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 27–131（105 aa）	突变：P94F	CU COPPER (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；100 mM sodium citrate, 2.25 M ammonium sulfate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.0K	分辨率 0.99 Å R-free 0.147
1SFH Reduced state of amicyanin mutant P94F 提交 2004-02-19	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–131（105 aa）	突变：P94F	CU1 COPPER (I) ION × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；293 K；80% 2.5 M monobasic sodium phosphate, 20% 2.5 M dibasic potassium phosphate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293.0K	分辨率 1.05 Å R-free 0.153
1SFH Reduced state of amicyanin mutant P94F 提交 2004-02-19	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 27–131（105 aa）	突变：P94F	CU1 COPPER (I) ION × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；293 K；80% 2.5 M monobasic sodium phosphate, 20% 2.5 M dibasic potassium phosphate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293.0K	分辨率 1.05 Å R-free 0.153
1T5K Crystal structure of amicyanin substituted with cobalt 提交 2004-05-04	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–131（105 aa）	未记录	CO COBALT (II) ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；293 K；3.6 M monobasic sodium phosphate, 0.4 M dibasic potassium phosphate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293.0K	分辨率 1.40 Å R-free 0.210
1T5K Crystal structure of amicyanin substituted with cobalt 提交 2004-05-04	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 27–131（105 aa）	未记录	CO COBALT (II) ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；293 K；3.6 M monobasic sodium phosphate, 0.4 M dibasic potassium phosphate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293.0K	分辨率 1.40 Å R-free 0.210
1T5K Crystal structure of amicyanin substituted with cobalt 提交 2004-05-04	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 27–131（105 aa）	未记录	CO COBALT (II) ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；293 K；3.6 M monobasic sodium phosphate, 0.4 M dibasic potassium phosphate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293.0K	分辨率 1.40 Å R-free 0.210
1T5K Crystal structure of amicyanin substituted with cobalt 提交 2004-05-04	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 27–131（105 aa）	未记录	CO COBALT (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；293 K；3.6 M monobasic sodium phosphate, 0.4 M dibasic potassium phosphate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293.0K	分辨率 1.40 Å R-free 0.210
2GB2 The P52G mutant of amicyanin in the Cu(II) state. 提交 2006-03-09	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–131（105 aa）	突变：P52G	CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 4.3；293 K；2.67 M sodium phosphate, 80:20 monobasic:dibasic, covered with mineral oil, pH 4.3, EVAPORATION, temperature 293K	分辨率 1.25 Å R-free 0.184
2GBA Reduced Cu(I) form at pH 4 of P52G mutant of amicyanin 提交 2006-03-10	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–131（105 aa）	突变：P52G	CU1 COPPER (I) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 4.3；293 K；3.0 M sodium phosphate 90:10 monobasic:dibasic covered drop in mineral oil, pH 4.3, EVAPORATION, temperature 293K	分辨率 0.92 Å R-free 0.147
2GC7 Substrate reduced, copper free complex of methylamine dehydrogenase, amicyanin and cytochrome c551i from Paracoccus denitrificans. 提交 2006-03-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 27–131（105 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.3-2.6M sodium/potassium phosphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.198
2GC7 Substrate reduced, copper free complex of methylamine dehydrogenase, amicyanin and cytochrome c551i from Paracoccus denitrificans. 提交 2006-03-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 27–131（105 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.3-2.6M sodium/potassium phosphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.198
2GC7 Substrate reduced, copper free complex of methylamine dehydrogenase, amicyanin and cytochrome c551i from Paracoccus denitrificans. 提交 2006-03-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 K 27–131（105 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.3-2.6M sodium/potassium phosphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.198
2GC7 Substrate reduced, copper free complex of methylamine dehydrogenase, amicyanin and cytochrome c551i from Paracoccus denitrificans. 提交 2006-03-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 O 27–131（105 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.3-2.6M sodium/potassium phosphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.198
2IDQ Structure of M98A mutant of amicyanin, Cu(II) 提交 2006-09-15	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–131（105 aa）	突变：M98A	CU COPPER (II) ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；293 K；10 mg/ml amicyanin in 3.0 M phosphate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K	分辨率 0.90 Å R-free 0.130
2IDS Structure of M98A mutant of amicyanin, Cu(I) 提交 2006-09-15	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–131（105 aa）	突变：M98A	CU1 COPPER (I) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；293 K；3.0 M phosphate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K	分辨率 1.00 Å R-free 0.170
2IDT Structure of M98Q mutant of amicyanin, Cu(II) 提交 2006-09-15	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–131（105 aa）	突变：M98Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；293 K；2.6 M phosphate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K	分辨率 1.00 Å R-free 0.158
2IDU Structure of M98Q mutant of amicyanin, Cu(I) 提交 2006-09-15	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–131（105 aa）	突变：M98Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CU1 COPPER (I) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；293 K；2.6 M phosphate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K	分辨率 0.95 Å R-free 0.162
2J55 X-ray reduced Paraccocus denitrificans methylamine dehydrogenase O- quinone in complex with amicyanin. 提交 2006-09-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 27–131（105 aa）链 B 27–131（105 aa）	未记录	CU COPPER (II) ION × 2 GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；pH 5.60	分辨率 2.15 Å R-free 0.245
2J56 X-ray reduced Paraccocus denitrificans methylamine dehydrogenase N- semiquinone in complex with amicyanin. 提交 2006-09-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 27–131（105 aa）链 B 27–131（105 aa）	未记录	CU COPPER (II) ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9；pH 9.00	分辨率 2.10 Å R-free 0.207
2J57 X-ray reduced Paraccocus denitrificans methylamine dehydrogenase N- quinol in complex with amicyanin. 提交 2006-09-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 27–131（105 aa）链 B 27–131（105 aa）	未记录	CU COPPER (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；pH 5.60	分辨率 2.25 Å R-free 0.241
2J57 X-ray reduced Paraccocus denitrificans methylamine dehydrogenase N- quinol in complex with amicyanin. 提交 2006-09-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 27–131（105 aa）链 D 27–131（105 aa）	未记录	CU COPPER (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；pH 5.60	分辨率 2.25 Å R-free 0.241
2MTA CRYSTAL STRUCTURE OF A TERNARY ELECTRON TRANSFER COMPLEX BETWEEN METHYLAMINE DEHYDROGENASE, AMICYANIN AND A C-TYPE CYTOCHROME 提交 1993-10-26	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 27–131（105 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 2 CU COPPER (II) ION × 2 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.40 Å
2OV0 Structure of the blue copper protein Amicyanin to 0.75 A resolution 提交 2007-02-12	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–131（105 aa）	未记录	CU COPPER (II) ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；293 K；3 M sodium phosphate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K	分辨率 0.75 Å R-free 0.142
2QDV Structure of the Cu(II) form of the M51A mutant of amicyanin 提交 2007-06-21	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–131（105 aa）	突变：M51A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CU COPPER (II) ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；293 K；2.5-3 M phosphate, 10 mg/ml amicyanin, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K	分辨率 0.89 Å R-free 0.135
2QDW Structure of Cu(I) form of the M51A mutant of amicyanin 提交 2007-06-21	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–131（105 aa）	突变：M51A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CU1 COPPER (I) ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；293 K；2.5-3.0 M phosphate 10 mg/ml amicyanin, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K	分辨率 0.92 Å R-free 0.147
2RAC AMICYANIN REDUCED, PH 7.7, 1.3 ANGSTROMS 提交 1998-10-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–131（105 aa）	未记录	CU1 COPPER (I) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.7；pH 7.70	分辨率 1.30 Å R-free 0.210
3IE9 Structure of oxidized M98L mutant of amicyanin 提交 2009-07-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–131（105 aa）片段：residues 27-131	突变：M98L	PO4 PHOSPHATE ION × 1 CU COPPER (II) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；3.2M Ammonium sulfate, 90mM Tris PH 8.0, 10mM NaCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.10 Å R-free 0.214
3IE9 Structure of oxidized M98L mutant of amicyanin 提交 2009-07-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 27–131（105 aa）片段：residues 27-131	突变：M98L	PO4 PHOSPHATE ION × 6 CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 6 CL CHLORIDE ION × 6 ACT ACETATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；3.2M Ammonium sulfate, 90mM Tris PH 8.0, 10mM NaCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.10 Å R-free 0.214
3IE9 Structure of oxidized M98L mutant of amicyanin 提交 2009-07-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 27–131（105 aa）片段：residues 27-131	突变：M98L	PO4 PHOSPHATE ION × 3 CU COPPER (II) ION × 3 ZN ZINC ION × 3 CL CHLORIDE ION × 3 ACT ACETATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；3.2M Ammonium sulfate, 90mM Tris PH 8.0, 10mM NaCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.10 Å R-free 0.214
3IEA Structure of reduced M98L mutant of amicyanin 提交 2009-07-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–131（105 aa）片段：residues 27-131	突变：M124L	PO4 PHOSPHATE ION × 1 CU COPPER (II) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；3.2M Ammonium sulfate, 90mM Tris PH 8.0, 10mM NaCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.20 Å R-free 0.200
3IEA Structure of reduced M98L mutant of amicyanin 提交 2009-07-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 27–131（105 aa）片段：residues 27-131	突变：M124L	PO4 PHOSPHATE ION × 6 CU COPPER (II) ION × 6 ZN ZINC ION × 6 CL CHLORIDE ION × 6 ACT ACETATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；3.2M Ammonium sulfate, 90mM Tris PH 8.0, 10mM NaCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.20 Å R-free 0.200
3L45 A Joint Neutron and X-ray structure of Oxidized Amicyanin 提交 2009-12-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–131（105 aa）片段：UNP residues 27-131	未记录	CU COPPER (II) ION × 1	实验方法未声明 X-ray结晶条件 291 K；2.4M ammonium sulfate, 100mM citric acid pH5 and 3M sodium monobasic/potassium dibasic phosphate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 1.80 Å
3PLY Structure of Oxidized P96G Mutant of Amicyanin 提交 2010-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–131（105 aa）片段：UNP residues 27-131	突变：P96G	CU COPPER (II) ION × 1 NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；1.8M sodium/potassium phosphate pH 7.5, 40mM ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.20 Å R-free 0.291
3PLY Structure of Oxidized P96G Mutant of Amicyanin 提交 2010-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 27–131（105 aa）片段：UNP residues 27-131	突变：P96G	CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；1.8M sodium/potassium phosphate pH 7.5, 40mM ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.20 Å R-free 0.291
3PLY Structure of Oxidized P96G Mutant of Amicyanin 提交 2010-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 27–131（105 aa）片段：UNP residues 27-131	突变：P96G	CU COPPER (II) ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；1.8M sodium/potassium phosphate pH 7.5, 40mM ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.20 Å R-free 0.291
3PLY Structure of Oxidized P96G Mutant of Amicyanin 提交 2010-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 27–131（105 aa）片段：UNP residues 27-131	突变：P96G	CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；1.8M sodium/potassium phosphate pH 7.5, 40mM ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.20 Å R-free 0.291
3RYM Structure of Oxidized M98K mutant of Amicyanin 提交 2011-05-11	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–131（105 aa）	突变：M98K	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.01M zinc sulphate heptahydrate, 0.1M MES pH 6.5, 25% w/v PEG monomethylether 550, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 1.70 Å R-free 0.215
3RYM Structure of Oxidized M98K mutant of Amicyanin 提交 2011-05-11	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 27–131（105 aa）	突变：M98K	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.01M zinc sulphate heptahydrate, 0.1M MES pH 6.5, 25% w/v PEG monomethylether 550, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 1.70 Å R-free 0.215
3RYM Structure of Oxidized M98K mutant of Amicyanin 提交 2011-05-11	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 27–131（105 aa）	突变：M98K	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.01M zinc sulphate heptahydrate, 0.1M MES pH 6.5, 25% w/v PEG monomethylether 550, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 1.70 Å R-free 0.215
3RYM Structure of Oxidized M98K mutant of Amicyanin 提交 2011-05-11	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 27–131（105 aa）	突变：M98K	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.01M zinc sulphate heptahydrate, 0.1M MES pH 6.5, 25% w/v PEG monomethylether 550, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 1.70 Å R-free 0.215
4P5R Structure of oxidized W45Y mutant of amicyanin 提交 2014-03-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–131（105 aa）片段：UNP residues 27-131	突变：W45Y	CU COPPER (II) ION × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Initial crystals were obtained from Hampton research ammonium sulfate screen (HR2-211). Bigger crystals grown by macro-seeding using 3.2M Na/K phosphate solution.	分辨率 1.09 Å R-free 0.153
4P5S Structure of reduced W45Y mutant of amicyanin 提交 2014-03-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–131（105 aa）片段：UNP residues 27-131	突变：W45Y	CU1 COPPER (I) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Initial crystals were obtained from Hampton research ammonium sulfate screen (HR2-211). Bigger crystals grown by macro-seeding using 3.2M Na/K phosphate solution.	分辨率 1.02 Å R-free 0.150

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	AMCY_PARDE
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–105； UniProt 27–131 作者链 G； PDB构建体 1–105； UniProt 27–131 作者链 K； PDB构建体 1–105； UniProt 27–131 作者链 O； PDB构建体 1–105； UniProt 27–131

Cytochrome c-L

物种未注明

UniProt P29899

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 23–169	未记录	Methylamine dehydrogenase heavy chain × 1 （P29894） Methylamine dehydrogenase light chain × 1 （P22619） Amicyanin × 1 （P22364） CU COPPER (II) ION × 1 NA SODIUM ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.3-2.6M Sodium/potassium phosphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.197
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 H； UniProt 23–169	未记录	Methylamine dehydrogenase heavy chain × 1 （P29894） Methylamine dehydrogenase light chain × 1 （P22619） Amicyanin × 1 （P22364） CU COPPER (II) ION × 1 NA SODIUM ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.3-2.6M Sodium/potassium phosphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.197
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 L； UniProt 23–169	未记录	Methylamine dehydrogenase heavy chain × 1 （P29894） Methylamine dehydrogenase light chain × 1 （P22619） Amicyanin × 1 （P22364） CU COPPER (II) ION × 1 NA SODIUM ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.3-2.6M Sodium/potassium phosphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.197
4	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 P； UniProt 23–169	未记录	Methylamine dehydrogenase heavy chain × 1 （P29894） Methylamine dehydrogenase light chain × 1 （P22619） Amicyanin × 1 （P22364） CU COPPER (II) ION × 1 NA SODIUM ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.3-2.6M Sodium/potassium phosphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.197

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 2GC4	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2GC7 Substrate reduced, copper free complex of methylamine dehydrogenase, amicyanin and cytochrome c551i from Paracoccus denitrificans. 提交 2006-03-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 23–169（147 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.3-2.6M sodium/potassium phosphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.198
2GC7 Substrate reduced, copper free complex of methylamine dehydrogenase, amicyanin and cytochrome c551i from Paracoccus denitrificans. 提交 2006-03-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 23–169（147 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.3-2.6M sodium/potassium phosphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.198
2GC7 Substrate reduced, copper free complex of methylamine dehydrogenase, amicyanin and cytochrome c551i from Paracoccus denitrificans. 提交 2006-03-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 L 23–169（147 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.3-2.6M sodium/potassium phosphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.198
2GC7 Substrate reduced, copper free complex of methylamine dehydrogenase, amicyanin and cytochrome c551i from Paracoccus denitrificans. 提交 2006-03-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 P 23–169（147 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 1 HEC HEME C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；2.3-2.6M sodium/potassium phosphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.198
2MTA CRYSTAL STRUCTURE OF A TERNARY ELECTRON TRANSFER COMPLEX BETWEEN METHYLAMINE DEHYDROGENASE, AMICYANIN AND A C-TYPE CYTOCHROME 提交 1993-10-26	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 23–169（147 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 2 CU COPPER (II) ION × 2 HEC HEME C × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.40 Å

共 2 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CYCL_PARDE
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–147； UniProt 23–169 作者链 H； PDB构建体 1–147； UniProt 23–169 作者链 L； PDB构建体 1–147； UniProt 23–169 作者链 P； PDB构建体 1–147； UniProt 23–169

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2gc4
沉积日期 deposition_date	2006-03-13
结构标题 title	Structural comparison of the oxidized ternary electron transfer complex of methylamine dehydrogenase, amicyanin and cytochrome c551i from Paracoccus denitrificans with the substrate-reduced, copper free complex at 1.9 A resolution.
关键词 keywords	Electron transfer, Methylamine dehydrogenase, Cytochrome, Blue copper protein, Oxidoreductase, Electron transport; Oxidoreductase, Electron transport
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	57.94 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	57.79 Å
零角强度 I(0) i0	1662870000.00
分子量 molecular_weight	336460.0 kDa
排除体积 excluded_volume	416820 Å³
包络体积 envelope_volume	606350 Å³
水化壳体积 shell_volume	84878 Å³
包络直径 envelope_diameter	212.0 Å
壳层 Rg shell_rg	64.44 Å
包络 Rg envelope_rg	56.06 Å
形状 Rg shape_rg	57.80 Å
总 Rg total_rg	57.90 Å
总原子数 total_atoms	23680
残基数 n_residues	3032
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	192.4 Å
Rg (实空间) rg_real	57.90 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.77 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.6630e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.4520e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	57.93 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	1663000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8521
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	3
主峰位置 r_peak_primary	92.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.157
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.586
角度范围 angular_range	— – 0.1350 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	152200000.0000
实空间数据点数 n_real_points	28
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.777; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.963; Smooth: 0.778

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Methylamine dehydrogenase heavy chain
分子量 formula_weight	42449.3 kDa
EC 编号 ec_number	1.4.99.3
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,E,I,M
原子数 atom_count	24820

QDAPEAETQAQETQGQAAARAAAADLAAGQDDEPRILEAPAPDARRVYVNDPAHFAAVTQQFVIDGEAGRVIGMIDGGFLPNPVVADDGSFIAHASTVFSRIARGERTDYVEVFDPVTLLPTADIELPDAPRFLVGTYPWMTSLTPDGKTLLFYQFSPAPAVGVVDLEGKAFKRMLDVPDCYHIFPTAPDTFFMHCRDGSLAKVAFGTEGTPEITHTEVFHPEDEFLINHPAYSQKAGRLVWPTYTGKIHQIDLSSGDAKFLPAVEALTEAERADGWRPGGWQQVAYHRALDRIYLLVDQRDEWRHKTASRFVVVLDAKTGERLAKFEMGHEIDSINVSQDEKPLLYALSTGDKTLYIHDAESGEELRSVNQLGHGPQVITTADMG

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Methylamine dehydrogenase light chain
分子量 formula_weight	14210.7 kDa
EC 编号 ec_number	1.4.99.3
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,F,J,N

ADAPAGTDPRAKWVPQDNDIQACDYWRHCSIDGNICDCSGGSLTNCPPGTKLATASWVASCYNPTDGQSYLIAYRDCCGYNVSGRCPCLNTEGELPVYRPEFANDIIWCFGAEDDAMTYHCTISPIVGKAS

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Amicyanin
分子量 formula_weight	11505.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,G,K,O

DKATIPSESPFAAAEVADGAIVVDIAKMKYETPELHVKVGDTVTWINREAMPHNVHFVAGVLGEAALKGPMMKKEQAYSLTFTEAGTYDYHCTPHPFMRGKVVVE

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Cytochrome c-L
分子量 formula_weight	16274.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,H,L,P

APQFFNIIDGSPLNFDDAMEEGRDTEAVKHFLETGENVYNEDPEILPEAEELYAGMCSGCHGHYAEGKIGPGLNDAYWTYPGNETDVGLFSTLYGGATGQMGPMWGSLTLDEMLRTMAWVRHLYTGDPKDASWLTDEQKAGFTPFQP

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	COPPER (II) ION
分子量 formula_weight	63.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	HEME C
分子量 formula_weight	618.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 8 Entity 8 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1140

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 32 domains

SCOP 2.08 (16 domains)

结构域编号 domain_id	d2gc4a_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.69 — 7-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamily	b.69.2 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase
家族 Family family	b.69.2.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2gc4b_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.21 — Methylamine dehydrogenase, L chain
超家族 Superfamily superfamily	g.21.1 — Methylamine dehydrogenase, L chain
家族 Family family	g.21.1.1 — Methylamine dehydrogenase, L chain

结构域编号 domain_id	d2gc4c_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.6 — Cupredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	b.6.1 — Cupredoxins
家族 Family family	b.6.1.1 — Plastocyanin/azurin-like

结构域编号 domain_id	d2gc4d_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.3 — Cytochrome c
超家族 Superfamily superfamily	a.3.1 — Cytochrome c
家族 Family family	a.3.1.1 — monodomain cytochrome c

结构域编号 domain_id	d2gc4e_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.69 — 7-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamily	b.69.2 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase
家族 Family family	b.69.2.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2gc4f_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.21 — Methylamine dehydrogenase, L chain
超家族 Superfamily superfamily	g.21.1 — Methylamine dehydrogenase, L chain
家族 Family family	g.21.1.1 — Methylamine dehydrogenase, L chain

结构域编号 domain_id	d2gc4g_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.6 — Cupredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	b.6.1 — Cupredoxins
家族 Family family	b.6.1.1 — Plastocyanin/azurin-like

结构域编号 domain_id	d2gc4h_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.3 — Cytochrome c
超家族 Superfamily superfamily	a.3.1 — Cytochrome c
家族 Family family	a.3.1.1 — monodomain cytochrome c

结构域编号 domain_id	d2gc4i_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.69 — 7-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamily	b.69.2 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase
家族 Family family	b.69.2.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2gc4j_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.21 — Methylamine dehydrogenase, L chain
超家族 Superfamily superfamily	g.21.1 — Methylamine dehydrogenase, L chain
家族 Family family	g.21.1.1 — Methylamine dehydrogenase, L chain

结构域编号 domain_id	d2gc4k_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.6 — Cupredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	b.6.1 — Cupredoxins
家族 Family family	b.6.1.1 — Plastocyanin/azurin-like

结构域编号 domain_id	d2gc4l_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.3 — Cytochrome c
超家族 Superfamily superfamily	a.3.1 — Cytochrome c
家族 Family family	a.3.1.1 — monodomain cytochrome c

结构域编号 domain_id	d2gc4m_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.69 — 7-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamily	b.69.2 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase
家族 Family family	b.69.2.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d2gc4n_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.21 — Methylamine dehydrogenase, L chain
超家族 Superfamily superfamily	g.21.1 — Methylamine dehydrogenase, L chain
家族 Family family	g.21.1.1 — Methylamine dehydrogenase, L chain

结构域编号 domain_id	d2gc4o_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.6 — Cupredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	b.6.1 — Cupredoxins
家族 Family family	b.6.1.1 — Plastocyanin/azurin-like

结构域编号 domain_id	d2gc4p_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.3 — Cytochrome c
超家族 Superfamily superfamily	a.3.1 — Cytochrome c
家族 Family family	a.3.1.1 — monodomain cytochrome c

CATH v4.4 (16 domains)

结构域编号 domain_id	2gc4A00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology	10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase

结构域编号 domain_id	2gc4B00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	30 — Electron Transport Ethylamine Dehydrogenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Methylamine/Aralkylamine dehydrogenase light chain

结构域编号 domain_id	2gc4C00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	420 — Cupredoxins - blue copper proteins

结构域编号 domain_id	2gc4D00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	760 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain D, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c-like domain

结构域编号 domain_id	2gc4E00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology	10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase

结构域编号 domain_id	2gc4F00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	30 — Electron Transport Ethylamine Dehydrogenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Methylamine/Aralkylamine dehydrogenase light chain

结构域编号 domain_id	2gc4G00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	420 — Cupredoxins - blue copper proteins

结构域编号 domain_id	2gc4H00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	760 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain D, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c-like domain

结构域编号 domain_id	2gc4I00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology	10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase

结构域编号 domain_id	2gc4J00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	30 — Electron Transport Ethylamine Dehydrogenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Methylamine/Aralkylamine dehydrogenase light chain

结构域编号 domain_id	2gc4K00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	420 — Cupredoxins - blue copper proteins

结构域编号 domain_id	2gc4L00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	760 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain D, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c-like domain

结构域编号 domain_id	2gc4M00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology	10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase

结构域编号 domain_id	2gc4N00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	30 — Electron Transport Ethylamine Dehydrogenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Methylamine/Aralkylamine dehydrogenase light chain

结构域编号 domain_id	2gc4O00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	420 — Cupredoxins - blue copper proteins

结构域编号 domain_id	2gc4P00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	760 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain D, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c-like domain

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8. 引用文献 (2)

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晶胞边长 a length_a	81.368 Å
晶胞边长 b length_b	188.979 Å
晶胞边长 c length_c	128.836 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	99.74 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.900 Å
最低分辨率 resolution_low	29.950 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.1730
R_free r_free	0.1970

fit	/app/data/saxs_computation/gc/2gc4/2gc4.fit
pddf	/app/data/pr_computation/gc/2gc4/2gc4.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/gc/2gc4/2gc4.dat

Structural comparison of the oxidized ternary electron transfer complex of methylamine dehydrogenase, amicyanin and cytochrome c551i from Paracoccus denitrificans with the substrate-reduced, copper free complex at 1.9 A resolution.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Methylamine dehydrogenase heavy chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Methylamine dehydrogenase light chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Amicyanin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Cytochrome c-L

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 32 domains

SCOP 2.08 (16 domains)

CATH v4.4 (16 domains)

8. 引用文献 (2)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)