SAXSdb — 2hik

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PCNA1 (SSO0397)

Sulfolobus solfataricus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	PCNA2 (SSO1047) × 1 （Q97Z84） PCNA3 (SSO0405) × 1 （P57765）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	PCNA2 (SSO1047) × 1 （Q97Z84） PCNA3 (SSO0405) × 1 （P57765）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	PCNA2 (SSO1047) × 1 （Q97Z84） PCNA3 (SSO0405) × 1 （P57765）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PCNA2_SULSO
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–249； UniProt 1–249 作者链 L； PDB构建体 1–249； UniProt 1–249 作者链 X； PDB构建体 1–249； UniProt 1–249

PCNA2 (SSO1047)

Sulfolobus solfataricus

UniProt Q97Z84

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	PCNA1 (SSO0397) × 1 （P57766） PCNA3 (SSO0405) × 1 （P57765）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	PCNA1 (SSO0397) × 1 （P57766） PCNA3 (SSO0405) × 1 （P57765）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	PCNA1 (SSO0397) × 1 （P57766） PCNA3 (SSO0405) × 1 （P57765）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PCNA3_SULSO
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–245； UniProt 1–245 作者链 M； PDB构建体 1–245； UniProt 1–245 作者链 Y； PDB构建体 1–245； UniProt 1–245

PCNA3 (SSO0405)

Sulfolobus solfataricus

UniProt P57765

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	PCNA1 (SSO0397) × 1 （P57766） PCNA2 (SSO1047) × 1 （Q97Z84）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	PCNA1 (SSO0397) × 1 （P57766） PCNA2 (SSO1047) × 1 （Q97Z84）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	PCNA1 (SSO0397) × 1 （P57766） PCNA2 (SSO1047) × 1 （Q97Z84）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PCNA1_SULSO
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–244； UniProt 1–244 作者链 N； PDB构建体 1–244； UniProt 1–244 作者链 Z； PDB构建体 1–244； UniProt 1–244

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2hik
沉积日期 deposition_date	2006-06-29
结构标题 title	heterotrimeric PCNA sliding clamp
关键词 keywords	PCNA sliding clamp, processivity factor, DNA replication, heterotrimer, REPLICATION; REPLICATION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2hik__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2hik__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2hik__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	32.09 Å
Rg（电子密度）	30.98 Å
总 Rg	31.65 Å
原子数	5777
残基数	720
排除体积	104110 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2hik__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2hik__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`2hik__assembly_3__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	PCNA1 (SSO0397)
分子量 formula_weight	29062.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,L,X
原子数 atom_count	17311

MFKIVYPNAKDFFSFINSITNVTDSIILNFTEDGIFSRHLTEDKVLMAIMRIPKDVLSEYSIDSPTSVKLDVSSVKKILSKASSKKATIELTETDSGLKIIIRDEKSGAKSTIYIKAEKGQVEQLTEPKVNLAVNFTTDESVLNVIAADVTLVGEEMRISTEEDKIKIEAGEEGKRYVAFLMKDKPLKELSIDTSASSSYSAEMFKDAVKGLRGFSAPTMVSFGENLPMKIDVEAVSGGHMIFWIAPRLLEHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Sulfolobus solfataricus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	2287
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	PCNA2 (SSO1047)
分子量 formula_weight	27648.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,M,Y

MKAKVIDAVSFSYILRTVGDFLSEANFIVTKEGIRVSGIDPSRVVFLDIFLPSSYFEGFEVSQEKEIIGFKLEDVNDILKRVLKDDTLILSSNESKLTLTFDGEFTRSFELPLIQVESTQPPSVNLEFPFKAQLLTITFADIIDELSDLGEVLNIHSKENKLYFEVIGDLSTAKVELSTDNGTLLEASGADVSSSYGMEYVANTTKMRRASDSMELYFGSQIPLKLRFKLPQEGYGDFYIAPRAD

来源 Source

来源生物 organism	Sulfolobus solfataricus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	2287
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	PCNA3 (SSO0405)
分子量 formula_weight	28747.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,N,Z

MKVVYDDVRVLKDIIQALARLVDEAVLKFKQDSVELVALDRAHISLISVNLPREMFKEYDVNDEFKFGFNTQYLMKILKVAKRKEAIEIASESPDSVIINIIGSTNREFNVRNLEVSEQEIPEINLQFDISATISSDGFKSAISEVSTVTDNVVVEGHEDRILIKAEGESEVEVEFSKDTGGLQDLEFSKESKNSYSAEYLDDVLSLTKLSDYVKISFGNQKPLQLFFNMEGGGKVTYLLAPKVLEHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Sulfolobus solfataricus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	2287
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 9 domains

CATH v4.4 (9 domains)

结构域编号 domain_id	2hikA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	70 — Box
拓扑 Topology topology	10 — Proliferating Cell Nuclear Antigen
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	2hikB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	70 — Box
拓扑 Topology topology	10 — Proliferating Cell Nuclear Antigen
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	2hikC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	70 — Box
拓扑 Topology topology	10 — Proliferating Cell Nuclear Antigen
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	2hikL01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	70 — Box
拓扑 Topology topology	10 — Proliferating Cell Nuclear Antigen
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	2hikM00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	70 — Box
拓扑 Topology topology	10 — Proliferating Cell Nuclear Antigen
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	2hikN00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	70 — Box
拓扑 Topology topology	10 — Proliferating Cell Nuclear Antigen
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	2hikX01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	70 — Box
拓扑 Topology topology	10 — Proliferating Cell Nuclear Antigen
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	2hikY00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	70 — Box
拓扑 Topology topology	10 — Proliferating Cell Nuclear Antigen
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	2hikZ00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	70 — Box
拓扑 Topology topology	10 — Proliferating Cell Nuclear Antigen
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

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晶胞边长 a length_a	142.275 Å
晶胞边长 b length_b	223.093 Å
晶胞边长 c length_c	79.140 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 21 21 2
空间群编号 int_tables_number	18
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.300 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	0.2390
R_work r_work	0.2360
R_free r_free	0.2990

heterotrimeric PCNA sliding clamp

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PCNA1 (SSO0397)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

PCNA2 (SSO1047)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

PCNA3 (SSO0405)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2hik__assembly_1__model_1

2hik__assembly_1__model_1 | I(q)

2hik__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 9 domains

CATH v4.4 (9 domains)

7. 引用文献 (1)

heterotrimeric PCNA sliding clamp

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PCNA1 (SSO0397)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

PCNA2 (SSO1047)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

PCNA3 (SSO0405)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2hik__assembly_1__model_1

2hik__assembly_1__model_1 | I(q)

2hik__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 9 domains

CATH v4.4 (9 domains)

7. 引用文献 (1)