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Yeast Cytochrome BC1 Complex with Stigmatellin

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 179.7 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex core protein 1

物种未注明

UniProt P07256

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 27–457 未记录 Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex core protein 2 × 1 （P07257） Cytochrome b × 1 （P00163） Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial precursor × 1 （P07143） Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit, mitochondrial precursor × 1 （P08067） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 17 kDa protein × 1 （P00127） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 14 kDa protein × 1 （P00128） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex ubiquinone-binding protein QP-C × 1 （P08525） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 7.3 kDa protein × 1 （P22289） Variable Heavy chain of antibody fragment × 1 Variable Light chain of antibody fragment × 1 HEC HEME C × 3 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 1 SMA STIGMATELLIN A × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；precipitant PEG4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K 分辨率 2.30 Å R-free 0.256

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 2IBZ Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1EZV STRUCTURE OF THE YEAST CYTOCHROME BC1 COMPLEX CO-CRYSTALLIZED WITH AN ANTIBODY FV-FRAGMENT 提交 2000-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 A 27–457（431 aa） 片段：RESIDUES 24-457
未记录 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 SMA STIGMATELLIN A × 2 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 microseeding；pH 8；277 K；5 % PEG 4000, 100 mM Tris, 0.05 % Undecyl-maltoside, 1 micromolar stigmatellin, pH 8.0, microseeding, temperature 277K
分辨率 2.30 Å R-free 0.254
1KB9 YEAST CYTOCHROME BC1 COMPLEX 提交 2001-11-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 A 24–454（431 aa） 片段：RESIDUES 27-457
未记录 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 1 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 3 SMA STIGMATELLIN A × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 1 PIE 1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphoinositol × 1 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 2 CDL CARDIOLIPIN × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；PEG4000, pH 8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
1KYO YEAST CYTOCHROME BC1 COMPLEX WITH BOUND SUBSTRATE CYTOCHROME C 提交 2002-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 A 27–457（431 aa） 片段：RESIDUES 27-457
链 L 27–457（431 aa） 片段：RESIDUES 27-457
未记录 HEC HEME C × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG4000, 20 mM Tris, 0.05 % Undecyl-maltopyranoside, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.97 Å R-free 0.268
1P84 HDBT inhibited Yeast Cytochrome bc1 Complex 提交 2003-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 A 27–457（431 aa）
未记录 3PH 1,2-DIACYL-GLYCEROL-3-SN-PHOSPHATE × 4 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 HEC HEME C × 6 DBT 5-HEPTYL-6-HYDROXY-1,3-BENZOTHIAZOLE-4,7-DIONE × 2 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 4 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 CDL CARDIOLIPIN × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；PEG4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.252
3CX5 Structure of complex III with bound cytochrome c in reduced state and definition of a minimal core interface for electron transfer. 提交 2008-04-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 A 27–457（431 aa）
链 L 27–457（431 aa）
未记录 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Microbatch (paraffin oil)；pH 7.5；277 K；1M Sucrose, 10% DMSO, 20mM Tris pH 7.5, 80mM NaCl, 0.05 % UM, 1 M stigmatellin, 5% PEG 4000, Microbatch (paraffin oil), temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.263
3CXH Structure of yeast complex III with isoform-2 cytochrome c bound and definition of a minimal core interface for electron transfer. 提交 2008-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 A 27–457（431 aa）
链 L 27–457（431 aa）
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CN6 (2R,5R,11S,14R)-2-(butanoyloxy)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Microbatch (Paraffin oil)；pH 7.5；277 K；1M Sucrose, 10% DMSO, 20mM Tris pH 7.5, 80mM NaCl, 0.05 % UM, 1 M stigmatellin, 5% PEG 4000, Microbatch (Paraffin oil), temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.256
4PD4 Structural analysis of atovaquone-inhibited cytochrome bc1 complex reveals the molecular basis of antimalarial drug action 提交 2014-04-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric
链 A 27–457（431 aa） 片段：UNP residues 27-457
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 3PH 1,2-DIACYL-GLYCEROL-3-SN-PHOSPHATE × 6 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 AOQ 2-[trans-4-(4-chlorophenyl)cyclohexyl]-3-hydroxynaphthalene-1,4-dione × 2 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277.2 K；polyethylene glycol 4000, DMSO, Sucrose, Potassium phosphate, n-undecyl-?-D-maltopyranoside, atovaquone
分辨率 3.04 Å R-free 0.297
6HU9 III2-IV2 mitochondrial respiratory supercomplex from S. cerevisiae 提交 2018-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：44-meric
链 A 27–457（431 aa）
链 L 27–457（431 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 28 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 1 CDL CARDIOLIPIN × 8 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 8 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 2 HEA HEME-A × 4 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 4 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microL of sample applied to negatively glow discharged grid, blot force -10; blotting time 8.5 sec
分辨率 3.35 Å
6T0B The III2-IV(5B)2 respiratory supercomplex from S. cerevisiae 提交 2019-10-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric
链 A 27–457（431 aa）
链 L 27–457（431 aa）
未记录 CDL CARDIOLIPIN × 8 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 26 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 7 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 2 HEA HEME-A × 4 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliter of sample applied to negatively glow discharged grid, blot force -10; blotting time 8.5 s
分辨率 2.80 Å
6T15 The III2-IV(5B)1 respiratory supercomplex from S. cerevisiae 提交 2019-10-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 A 27–457（431 aa）
链 L 27–457（431 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 18 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CDL CARDIOLIPIN × 7 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 6 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliter of sample applied to negatively glow discharged grid, blot force -10; blotting time 8.5 s
分辨率 3.29 Å
6YMX CIII2/CIV respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2020-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 A 27–457（431 aa）
链 L 27–457（431 aa）
未记录 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 7 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 5 ZN ZINC ION × 1 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
8E7S III2IV2 respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae with 4 bound UQ6 提交 2022-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：44-meric
链 A 1–457（457 aa）
链 a 1–457（457 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 24 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CDL CARDIOLIPIN × 10 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 6 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 4 HEA HEME-A × 4 CU COPPER (II) ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8EC0 III2IV respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae cardiolipin-lacking mutant 提交 2022-08-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 A 1–457（457 aa）
链 a 1–457（457 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 15 PGT (1S)-2-{[{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 4 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9BPB Tethered respiratory III2IV2 supercomplex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2024-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric
链 A 1–457（457 aa）
链 K 1–457（457 aa）
未记录 CDL CARDIOLIPIN × 8 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 4 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 6 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 8 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 10 HEA HEME-A × 4 CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 uL of sample, 5 s blot time, 30 s hold time, 0 blot force.
分辨率 2.57 Å
9ETZ III2IV respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2024-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 A 27–457（431 aa）
链 L 27–457（431 aa）
未记录 CDL CARDIOLIPIN × 11 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 26 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 6 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å

共 15 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 UQCR1_YEAST
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–431； UniProt 27–457

Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex core protein 2

物种未注明

UniProt P07257

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 17–368 未记录 Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex core protein 1 × 1 （P07256） Cytochrome b × 1 （P00163） Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial precursor × 1 （P07143） Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit, mitochondrial precursor × 1 （P08067） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 17 kDa protein × 1 （P00127） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 14 kDa protein × 1 （P00128） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex ubiquinone-binding protein QP-C × 1 （P08525） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 7.3 kDa protein × 1 （P22289） Variable Heavy chain of antibody fragment × 1 Variable Light chain of antibody fragment × 1 HEC HEME C × 3 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 1 SMA STIGMATELLIN A × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；precipitant PEG4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K 分辨率 2.30 Å R-free 0.256

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 2IBZ Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1KB9 YEAST CYTOCHROME BC1 COMPLEX 提交 2001-11-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 B 17–368（352 aa） 片段：RESIDUES 17-368
未记录 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 1 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 3 SMA STIGMATELLIN A × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 1 PIE 1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphoinositol × 1 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 2 CDL CARDIOLIPIN × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；PEG4000, pH 8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
1KYO YEAST CYTOCHROME BC1 COMPLEX WITH BOUND SUBSTRATE CYTOCHROME C 提交 2002-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 B 17–368（352 aa） 片段：RESIDUES 17-368
链 M 17–368（352 aa） 片段：RESIDUES 17-368
未记录 HEC HEME C × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG4000, 20 mM Tris, 0.05 % Undecyl-maltopyranoside, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.97 Å R-free 0.268
1P84 HDBT inhibited Yeast Cytochrome bc1 Complex 提交 2003-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 B 17–368（352 aa）
未记录 3PH 1,2-DIACYL-GLYCEROL-3-SN-PHOSPHATE × 4 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 HEC HEME C × 6 DBT 5-HEPTYL-6-HYDROXY-1,3-BENZOTHIAZOLE-4,7-DIONE × 2 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 4 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 CDL CARDIOLIPIN × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；PEG4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.252
3CX5 Structure of complex III with bound cytochrome c in reduced state and definition of a minimal core interface for electron transfer. 提交 2008-04-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 B 17–368（352 aa）
链 M 17–368（352 aa）
未记录 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Microbatch (paraffin oil)；pH 7.5；277 K；1M Sucrose, 10% DMSO, 20mM Tris pH 7.5, 80mM NaCl, 0.05 % UM, 1 M stigmatellin, 5% PEG 4000, Microbatch (paraffin oil), temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.263
3CXH Structure of yeast complex III with isoform-2 cytochrome c bound and definition of a minimal core interface for electron transfer. 提交 2008-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 B 17–368（352 aa）
链 M 17–368（352 aa）
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CN6 (2R,5R,11S,14R)-2-(butanoyloxy)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Microbatch (Paraffin oil)；pH 7.5；277 K；1M Sucrose, 10% DMSO, 20mM Tris pH 7.5, 80mM NaCl, 0.05 % UM, 1 M stigmatellin, 5% PEG 4000, Microbatch (Paraffin oil), temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.256
4PD4 Structural analysis of atovaquone-inhibited cytochrome bc1 complex reveals the molecular basis of antimalarial drug action 提交 2014-04-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric
链 B 17–368（352 aa） 片段：UNP residues 17-368
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 3PH 1,2-DIACYL-GLYCEROL-3-SN-PHOSPHATE × 6 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 AOQ 2-[trans-4-(4-chlorophenyl)cyclohexyl]-3-hydroxynaphthalene-1,4-dione × 2 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277.2 K；polyethylene glycol 4000, DMSO, Sucrose, Potassium phosphate, n-undecyl-?-D-maltopyranoside, atovaquone
分辨率 3.04 Å R-free 0.297
6HU9 III2-IV2 mitochondrial respiratory supercomplex from S. cerevisiae 提交 2018-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：44-meric
链 B 17–368（352 aa）
链 M 17–368（352 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 28 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 1 CDL CARDIOLIPIN × 8 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 8 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 2 HEA HEME-A × 4 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 4 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microL of sample applied to negatively glow discharged grid, blot force -10; blotting time 8.5 sec
分辨率 3.35 Å
6T0B The III2-IV(5B)2 respiratory supercomplex from S. cerevisiae 提交 2019-10-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric
链 B 17–368（352 aa）
链 M 17–368（352 aa）
未记录 CDL CARDIOLIPIN × 8 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 26 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 7 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 2 HEA HEME-A × 4 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliter of sample applied to negatively glow discharged grid, blot force -10; blotting time 8.5 s
分辨率 2.80 Å
6T15 The III2-IV(5B)1 respiratory supercomplex from S. cerevisiae 提交 2019-10-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 B 17–368（352 aa）
链 M 17–368（352 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 18 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CDL CARDIOLIPIN × 7 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 6 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliter of sample applied to negatively glow discharged grid, blot force -10; blotting time 8.5 s
分辨率 3.29 Å
6YMX CIII2/CIV respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2020-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 B 17–368（352 aa）
链 M 17–368（352 aa）
未记录 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 7 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 5 ZN ZINC ION × 1 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
8E7S III2IV2 respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae with 4 bound UQ6 提交 2022-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：44-meric
链 B 1–368（368 aa）
链 b 1–368（368 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 24 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CDL CARDIOLIPIN × 10 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 6 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 4 HEA HEME-A × 4 CU COPPER (II) ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8EC0 III2IV respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae cardiolipin-lacking mutant 提交 2022-08-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 B 1–368（368 aa）
链 b 1–368（368 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 15 PGT (1S)-2-{[{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 4 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9BPB Tethered respiratory III2IV2 supercomplex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2024-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric
链 B 1–368（368 aa）
链 L 1–368（368 aa）
未记录 CDL CARDIOLIPIN × 8 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 4 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 6 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 8 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 10 HEA HEME-A × 4 CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 uL of sample, 5 s blot time, 30 s hold time, 0 blot force.
分辨率 2.57 Å
9ETZ III2IV respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2024-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 B 17–368（352 aa）
链 M 17–368（352 aa）
未记录 CDL CARDIOLIPIN × 11 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 26 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 6 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å

共 14 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 UQCR2_YEAST
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–352； UniProt 17–368

Cytochrome b

物种未注明

UniProt P00163

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 1–385 未记录 Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex core protein 1 × 1 （P07256） Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex core protein 2 × 1 （P07257） Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial precursor × 1 （P07143） Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit, mitochondrial precursor × 1 （P08067） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 17 kDa protein × 1 （P00127） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 14 kDa protein × 1 （P00128） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex ubiquinone-binding protein QP-C × 1 （P08525） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 7.3 kDa protein × 1 （P22289） Variable Heavy chain of antibody fragment × 1 Variable Light chain of antibody fragment × 1 HEC HEME C × 3 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 1 SMA STIGMATELLIN A × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；precipitant PEG4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K 分辨率 2.30 Å R-free 0.256

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 2IBZ Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1KB9 YEAST CYTOCHROME BC1 COMPLEX 提交 2001-11-05 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 C 1–385（385 aa）
未记录 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 1 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 3 SMA STIGMATELLIN A × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 1 PIE 1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphoinositol × 1 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 2 CDL CARDIOLIPIN × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；PEG4000, pH 8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
1KYO YEAST CYTOCHROME BC1 COMPLEX WITH BOUND SUBSTRATE CYTOCHROME C 提交 2002-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 C 1–385（385 aa）
链 N 1–385（385 aa）
未记录 HEC HEME C × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG4000, 20 mM Tris, 0.05 % Undecyl-maltopyranoside, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.97 Å R-free 0.268
1P84 HDBT inhibited Yeast Cytochrome bc1 Complex 提交 2003-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 C 1–385（385 aa）
未记录 3PH 1,2-DIACYL-GLYCEROL-3-SN-PHOSPHATE × 4 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 HEC HEME C × 6 DBT 5-HEPTYL-6-HYDROXY-1,3-BENZOTHIAZOLE-4,7-DIONE × 2 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 4 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 CDL CARDIOLIPIN × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；PEG4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.252
3CX5 Structure of complex III with bound cytochrome c in reduced state and definition of a minimal core interface for electron transfer. 提交 2008-04-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 C 1–385（385 aa）
链 N 1–385（385 aa）
未记录 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Microbatch (paraffin oil)；pH 7.5；277 K；1M Sucrose, 10% DMSO, 20mM Tris pH 7.5, 80mM NaCl, 0.05 % UM, 1 M stigmatellin, 5% PEG 4000, Microbatch (paraffin oil), temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.263
3CXH Structure of yeast complex III with isoform-2 cytochrome c bound and definition of a minimal core interface for electron transfer. 提交 2008-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 C 1–385（385 aa）
链 N 1–385（385 aa）
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CN6 (2R,5R,11S,14R)-2-(butanoyloxy)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Microbatch (Paraffin oil)；pH 7.5；277 K；1M Sucrose, 10% DMSO, 20mM Tris pH 7.5, 80mM NaCl, 0.05 % UM, 1 M stigmatellin, 5% PEG 4000, Microbatch (Paraffin oil), temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.256
4PD4 Structural analysis of atovaquone-inhibited cytochrome bc1 complex reveals the molecular basis of antimalarial drug action 提交 2014-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric
链 C 1–385（385 aa）
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 3PH 1,2-DIACYL-GLYCEROL-3-SN-PHOSPHATE × 6 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 AOQ 2-[trans-4-(4-chlorophenyl)cyclohexyl]-3-hydroxynaphthalene-1,4-dione × 2 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277.2 K；polyethylene glycol 4000, DMSO, Sucrose, Potassium phosphate, n-undecyl-?-D-maltopyranoside, atovaquone
分辨率 3.04 Å R-free 0.297
6HU9 III2-IV2 mitochondrial respiratory supercomplex from S. cerevisiae 提交 2018-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：44-meric
链 C 1–385（385 aa）
链 N 1–385（385 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 28 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 1 CDL CARDIOLIPIN × 8 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 8 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 2 HEA HEME-A × 4 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 4 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microL of sample applied to negatively glow discharged grid, blot force -10; blotting time 8.5 sec
分辨率 3.35 Å
6T0B The III2-IV(5B)2 respiratory supercomplex from S. cerevisiae 提交 2019-10-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric
链 C 1–385（385 aa）
链 N 1–385（385 aa）
未记录 CDL CARDIOLIPIN × 8 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 26 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 7 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 2 HEA HEME-A × 4 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliter of sample applied to negatively glow discharged grid, blot force -10; blotting time 8.5 s
分辨率 2.80 Å
6T15 The III2-IV(5B)1 respiratory supercomplex from S. cerevisiae 提交 2019-10-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 C 1–385（385 aa）
链 N 1–385（385 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 18 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CDL CARDIOLIPIN × 7 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 6 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliter of sample applied to negatively glow discharged grid, blot force -10; blotting time 8.5 s
分辨率 3.29 Å
6YMX CIII2/CIV respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2020-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 C 1–385（385 aa）
链 N 1–385（385 aa）
未记录 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 7 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 5 ZN ZINC ION × 1 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
8E7S III2IV2 respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae with 4 bound UQ6 提交 2022-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：44-meric
链 J 1–385（385 aa）
链 j 1–385（385 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 24 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CDL CARDIOLIPIN × 10 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 6 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 4 HEA HEME-A × 4 CU COPPER (II) ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8EC0 III2IV respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae cardiolipin-lacking mutant 提交 2022-08-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 J 1–385（385 aa）
链 j 1–385（385 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 15 PGT (1S)-2-{[{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 4 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9BPB Tethered respiratory III2IV2 supercomplex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2024-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric
链 C 1–385（385 aa）
链 M 1–385（385 aa）
未记录 CDL CARDIOLIPIN × 8 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 4 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 6 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 8 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 10 HEA HEME-A × 4 CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 uL of sample, 5 s blot time, 30 s hold time, 0 blot force.
分辨率 2.57 Å
9ETZ III2IV respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2024-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 C 1–385（385 aa）
链 N 1–385（385 aa）
未记录 CDL CARDIOLIPIN × 11 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 26 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 6 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å

共 14 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CYB_YEAST
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–385； UniProt 1–385

Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial precursor

物种未注明

UniProt P07143

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白拷贝数一致 链 D； UniProt 62–309 未记录 Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex core protein 1 × 1 （P07256） Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex core protein 2 × 1 （P07257） Cytochrome b × 1 （P00163） Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit, mitochondrial precursor × 1 （P08067） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 17 kDa protein × 1 （P00127） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 14 kDa protein × 1 （P00128） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex ubiquinone-binding protein QP-C × 1 （P08525） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 7.3 kDa protein × 1 （P22289） Variable Heavy chain of antibody fragment × 1 Variable Light chain of antibody fragment × 1 HEC HEME C × 3 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 1 SMA STIGMATELLIN A × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；precipitant PEG4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K 分辨率 2.30 Å R-free 0.256

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 2IBZ Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1KB9 YEAST CYTOCHROME BC1 COMPLEX 提交 2001-11-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 D 62–307（246 aa） 片段：RESIDUES 62-307
未记录 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 1 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 3 SMA STIGMATELLIN A × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 1 PIE 1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphoinositol × 1 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 2 CDL CARDIOLIPIN × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；PEG4000, pH 8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
1KYO YEAST CYTOCHROME BC1 COMPLEX WITH BOUND SUBSTRATE CYTOCHROME C 提交 2002-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 D 62–309（248 aa） 片段：RESIDUES 62-309
链 O 62–309（248 aa） 片段：RESIDUES 62-309
未记录 HEC HEME C × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG4000, 20 mM Tris, 0.05 % Undecyl-maltopyranoside, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.97 Å R-free 0.268
1P84 HDBT inhibited Yeast Cytochrome bc1 Complex 提交 2003-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 D 62–307（246 aa）
未记录 3PH 1,2-DIACYL-GLYCEROL-3-SN-PHOSPHATE × 4 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 HEC HEME C × 6 DBT 5-HEPTYL-6-HYDROXY-1,3-BENZOTHIAZOLE-4,7-DIONE × 2 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 4 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 CDL CARDIOLIPIN × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；PEG4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.252
3CX5 Structure of complex III with bound cytochrome c in reduced state and definition of a minimal core interface for electron transfer. 提交 2008-04-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 D 62–309（248 aa）
链 O 62–309（248 aa）
未记录 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Microbatch (paraffin oil)；pH 7.5；277 K；1M Sucrose, 10% DMSO, 20mM Tris pH 7.5, 80mM NaCl, 0.05 % UM, 1 M stigmatellin, 5% PEG 4000, Microbatch (paraffin oil), temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.263
3CXH Structure of yeast complex III with isoform-2 cytochrome c bound and definition of a minimal core interface for electron transfer. 提交 2008-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 D 62–309（248 aa）
链 O 62–309（248 aa）
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CN6 (2R,5R,11S,14R)-2-(butanoyloxy)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Microbatch (Paraffin oil)；pH 7.5；277 K；1M Sucrose, 10% DMSO, 20mM Tris pH 7.5, 80mM NaCl, 0.05 % UM, 1 M stigmatellin, 5% PEG 4000, Microbatch (Paraffin oil), temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.256
4PD4 Structural analysis of atovaquone-inhibited cytochrome bc1 complex reveals the molecular basis of antimalarial drug action 提交 2014-04-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric
链 D 62–309（248 aa） 片段：UNP residues 62-309
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 3PH 1,2-DIACYL-GLYCEROL-3-SN-PHOSPHATE × 6 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 AOQ 2-[trans-4-(4-chlorophenyl)cyclohexyl]-3-hydroxynaphthalene-1,4-dione × 2 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277.2 K；polyethylene glycol 4000, DMSO, Sucrose, Potassium phosphate, n-undecyl-?-D-maltopyranoside, atovaquone
分辨率 3.04 Å R-free 0.297
6HU9 III2-IV2 mitochondrial respiratory supercomplex from S. cerevisiae 提交 2018-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：44-meric
链 D 62–309（248 aa）
链 O 62–309（248 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 28 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 1 CDL CARDIOLIPIN × 8 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 8 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 2 HEA HEME-A × 4 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 4 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microL of sample applied to negatively glow discharged grid, blot force -10; blotting time 8.5 sec
分辨率 3.35 Å
6T0B The III2-IV(5B)2 respiratory supercomplex from S. cerevisiae 提交 2019-10-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric
链 D 62–309（248 aa）
链 O 62–309（248 aa）
未记录 CDL CARDIOLIPIN × 8 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 26 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 7 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 2 HEA HEME-A × 4 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliter of sample applied to negatively glow discharged grid, blot force -10; blotting time 8.5 s
分辨率 2.80 Å
6T15 The III2-IV(5B)1 respiratory supercomplex from S. cerevisiae 提交 2019-10-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 D 62–309（248 aa）
链 O 62–309（248 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 18 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CDL CARDIOLIPIN × 7 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 6 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliter of sample applied to negatively glow discharged grid, blot force -10; blotting time 8.5 s
分辨率 3.29 Å
6YMX CIII2/CIV respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2020-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 D 62–309（248 aa）
链 O 62–309（248 aa）
未记录 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 7 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 5 ZN ZINC ION × 1 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
8E7S III2IV2 respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae with 4 bound UQ6 提交 2022-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：44-meric
链 L 1–309（309 aa）
链 l 1–309（309 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 24 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CDL CARDIOLIPIN × 10 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 6 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 4 HEA HEME-A × 4 CU COPPER (II) ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8EC0 III2IV respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae cardiolipin-lacking mutant 提交 2022-08-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 L 1–309（309 aa）
链 l 1–309（309 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 15 PGT (1S)-2-{[{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 4 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9BPB Tethered respiratory III2IV2 supercomplex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2024-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric
链 D 1–309（309 aa）
链 N 1–309（309 aa）
未记录 CDL CARDIOLIPIN × 8 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 4 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 6 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 8 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 10 HEA HEME-A × 4 CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 uL of sample, 5 s blot time, 30 s hold time, 0 blot force.
分辨率 2.57 Å
9ETZ III2IV respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2024-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 D 62–308（247 aa）
链 O 62–308（247 aa）
未记录 CDL CARDIOLIPIN × 11 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 26 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 6 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å

共 14 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CY1_YEAST
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 1–248； UniProt 62–309

Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit, mitochondrial precursor

物种未注明

UniProt P08067

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白拷贝数一致 链 E； UniProt 31–215 未记录 Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex core protein 1 × 1 （P07256） Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex core protein 2 × 1 （P07257） Cytochrome b × 1 （P00163） Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial precursor × 1 （P07143） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 17 kDa protein × 1 （P00127） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 14 kDa protein × 1 （P00128） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex ubiquinone-binding protein QP-C × 1 （P08525） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 7.3 kDa protein × 1 （P22289） Variable Heavy chain of antibody fragment × 1 Variable Light chain of antibody fragment × 1 HEC HEME C × 3 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 1 SMA STIGMATELLIN A × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；precipitant PEG4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K 分辨率 2.30 Å R-free 0.256

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 2IBZ Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1KB9 YEAST CYTOCHROME BC1 COMPLEX 提交 2001-11-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 E 31–215（185 aa） 片段：RESIDUES 31-215
未记录 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 1 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 3 SMA STIGMATELLIN A × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 1 PIE 1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphoinositol × 1 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 2 CDL CARDIOLIPIN × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；PEG4000, pH 8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
1KYO YEAST CYTOCHROME BC1 COMPLEX WITH BOUND SUBSTRATE CYTOCHROME C 提交 2002-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 E 31–215（185 aa） 片段：RESIDUES 31-215
链 P 31–215（185 aa） 片段：RESIDUES 31-215
未记录 HEC HEME C × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG4000, 20 mM Tris, 0.05 % Undecyl-maltopyranoside, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.97 Å R-free 0.268
1P84 HDBT inhibited Yeast Cytochrome bc1 Complex 提交 2003-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 E 31–215（185 aa）
未记录 3PH 1,2-DIACYL-GLYCEROL-3-SN-PHOSPHATE × 4 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 HEC HEME C × 6 DBT 5-HEPTYL-6-HYDROXY-1,3-BENZOTHIAZOLE-4,7-DIONE × 2 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 4 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 CDL CARDIOLIPIN × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；PEG4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.252
3CX5 Structure of complex III with bound cytochrome c in reduced state and definition of a minimal core interface for electron transfer. 提交 2008-04-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 E 31–215（185 aa）
链 P 31–215（185 aa）
未记录 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Microbatch (paraffin oil)；pH 7.5；277 K；1M Sucrose, 10% DMSO, 20mM Tris pH 7.5, 80mM NaCl, 0.05 % UM, 1 M stigmatellin, 5% PEG 4000, Microbatch (paraffin oil), temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.263
3CXH Structure of yeast complex III with isoform-2 cytochrome c bound and definition of a minimal core interface for electron transfer. 提交 2008-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 E 31–215（185 aa）
链 P 31–215（185 aa）
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CN6 (2R,5R,11S,14R)-2-(butanoyloxy)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Microbatch (Paraffin oil)；pH 7.5；277 K；1M Sucrose, 10% DMSO, 20mM Tris pH 7.5, 80mM NaCl, 0.05 % UM, 1 M stigmatellin, 5% PEG 4000, Microbatch (Paraffin oil), temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.256
4PD4 Structural analysis of atovaquone-inhibited cytochrome bc1 complex reveals the molecular basis of antimalarial drug action 提交 2014-04-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric
链 E 31–215（185 aa） 片段：UNP residues 31-215
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 3PH 1,2-DIACYL-GLYCEROL-3-SN-PHOSPHATE × 6 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 AOQ 2-[trans-4-(4-chlorophenyl)cyclohexyl]-3-hydroxynaphthalene-1,4-dione × 2 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277.2 K；polyethylene glycol 4000, DMSO, Sucrose, Potassium phosphate, n-undecyl-?-D-maltopyranoside, atovaquone
分辨率 3.04 Å R-free 0.297
6HU9 III2-IV2 mitochondrial respiratory supercomplex from S. cerevisiae 提交 2018-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：44-meric
链 E 31–215（185 aa）
链 P 31–215（185 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 28 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 1 CDL CARDIOLIPIN × 8 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 8 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 2 HEA HEME-A × 4 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 4 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microL of sample applied to negatively glow discharged grid, blot force -10; blotting time 8.5 sec
分辨率 3.35 Å
6T0B The III2-IV(5B)2 respiratory supercomplex from S. cerevisiae 提交 2019-10-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric
链 E 31–215（185 aa）
链 P 31–215（185 aa）
未记录 CDL CARDIOLIPIN × 8 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 26 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 7 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 2 HEA HEME-A × 4 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliter of sample applied to negatively glow discharged grid, blot force -10; blotting time 8.5 s
分辨率 2.80 Å
6T15 The III2-IV(5B)1 respiratory supercomplex from S. cerevisiae 提交 2019-10-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 E 31–215（185 aa）
链 P 31–215（185 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 18 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CDL CARDIOLIPIN × 7 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 6 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliter of sample applied to negatively glow discharged grid, blot force -10; blotting time 8.5 s
分辨率 3.29 Å
6YMX CIII2/CIV respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2020-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 E 31–215（185 aa）
链 P 31–215（185 aa）
未记录 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 7 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 5 ZN ZINC ION × 1 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
8E7S III2IV2 respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae with 4 bound UQ6 提交 2022-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：44-meric
链 C 1–215（215 aa）
链 c 1–215（215 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 24 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CDL CARDIOLIPIN × 10 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 6 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 4 HEA HEME-A × 4 CU COPPER (II) ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8EC0 III2IV respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae cardiolipin-lacking mutant 提交 2022-08-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 C 1–215（215 aa）
链 c 1–215（215 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 15 PGT (1S)-2-{[{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 4 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9BPB Tethered respiratory III2IV2 supercomplex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2024-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric
链 E 1–215（215 aa）
链 O 1–215（215 aa）
未记录 CDL CARDIOLIPIN × 8 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 4 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 6 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 8 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 10 HEA HEME-A × 4 CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 uL of sample, 5 s blot time, 30 s hold time, 0 blot force.
分辨率 2.57 Å
9ETZ III2IV respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2024-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 E 31–215（185 aa）
链 P 31–215（185 aa）
未记录 CDL CARDIOLIPIN × 11 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 26 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 6 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
9GS2 Structure of the Rieske bound Apo1 state of the heptameric Bcs1 AAA-ATPase 提交 2024-09-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 H 92–215（124 aa）
未记录 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.46 Å

共 15 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 UCRI_YEAST
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 E； PDB构建体 1–185； UniProt 31–215

Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 17 kDa protein

物种未注明

UniProt P00127

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白拷贝数一致 链 H； UniProt 74–147 未记录 Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex core protein 1 × 1 （P07256） Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex core protein 2 × 1 （P07257） Cytochrome b × 1 （P00163） Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial precursor × 1 （P07143） Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit, mitochondrial precursor × 1 （P08067） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 14 kDa protein × 1 （P00128） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex ubiquinone-binding protein QP-C × 1 （P08525） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 7.3 kDa protein × 1 （P22289） Variable Heavy chain of antibody fragment × 1 Variable Light chain of antibody fragment × 1 HEC HEME C × 3 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 1 SMA STIGMATELLIN A × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；precipitant PEG4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K 分辨率 2.30 Å R-free 0.256

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 2IBZ Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1KB9 YEAST CYTOCHROME BC1 COMPLEX 提交 2001-11-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 F 74–147（74 aa） 片段：RESIDUES 74-147
未记录 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 1 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 3 SMA STIGMATELLIN A × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 1 PIE 1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphoinositol × 1 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 2 CDL CARDIOLIPIN × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；PEG4000, pH 8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
1KYO YEAST CYTOCHROME BC1 COMPLEX WITH BOUND SUBSTRATE CYTOCHROME C 提交 2002-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 F 75–147（73 aa） 片段：RESIDUES 74-147
链 Q 75–147（73 aa） 片段：RESIDUES 74-147
未记录 HEC HEME C × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG4000, 20 mM Tris, 0.05 % Undecyl-maltopyranoside, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.97 Å R-free 0.268
1P84 HDBT inhibited Yeast Cytochrome bc1 Complex 提交 2003-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 F 74–147（74 aa）
未记录 3PH 1,2-DIACYL-GLYCEROL-3-SN-PHOSPHATE × 4 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 HEC HEME C × 6 DBT 5-HEPTYL-6-HYDROXY-1,3-BENZOTHIAZOLE-4,7-DIONE × 2 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 4 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 CDL CARDIOLIPIN × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；PEG4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.252
3CX5 Structure of complex III with bound cytochrome c in reduced state and definition of a minimal core interface for electron transfer. 提交 2008-04-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 F 2–147（146 aa） 片段：RESIDUES 2-147
链 Q 2–147（146 aa） 片段：RESIDUES 2-147
未记录 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Microbatch (paraffin oil)；pH 7.5；277 K；1M Sucrose, 10% DMSO, 20mM Tris pH 7.5, 80mM NaCl, 0.05 % UM, 1 M stigmatellin, 5% PEG 4000, Microbatch (paraffin oil), temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.263
3CXH Structure of yeast complex III with isoform-2 cytochrome c bound and definition of a minimal core interface for electron transfer. 提交 2008-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 F 2–147（146 aa） 片段：RESIDUES 2-147
链 Q 2–147（146 aa） 片段：RESIDUES 2-147
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CN6 (2R,5R,11S,14R)-2-(butanoyloxy)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Microbatch (Paraffin oil)；pH 7.5；277 K；1M Sucrose, 10% DMSO, 20mM Tris pH 7.5, 80mM NaCl, 0.05 % UM, 1 M stigmatellin, 5% PEG 4000, Microbatch (Paraffin oil), temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.256
4PD4 Structural analysis of atovaquone-inhibited cytochrome bc1 complex reveals the molecular basis of antimalarial drug action 提交 2014-04-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric
链 F 74–147（74 aa） 片段：UNP residues 74-147
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 3PH 1,2-DIACYL-GLYCEROL-3-SN-PHOSPHATE × 6 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 AOQ 2-[trans-4-(4-chlorophenyl)cyclohexyl]-3-hydroxynaphthalene-1,4-dione × 2 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277.2 K；polyethylene glycol 4000, DMSO, Sucrose, Potassium phosphate, n-undecyl-?-D-maltopyranoside, atovaquone
分辨率 3.04 Å R-free 0.297
6HU9 III2-IV2 mitochondrial respiratory supercomplex from S. cerevisiae 提交 2018-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：44-meric
链 F 1–147（147 aa）
链 Q 1–147（147 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 28 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 1 CDL CARDIOLIPIN × 8 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 8 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 2 HEA HEME-A × 4 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 4 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microL of sample applied to negatively glow discharged grid, blot force -10; blotting time 8.5 sec
分辨率 3.35 Å
6T0B The III2-IV(5B)2 respiratory supercomplex from S. cerevisiae 提交 2019-10-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric
链 F 1–147（147 aa）
链 Q 1–147（147 aa）
未记录 CDL CARDIOLIPIN × 8 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 26 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 7 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 2 HEA HEME-A × 4 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliter of sample applied to negatively glow discharged grid, blot force -10; blotting time 8.5 s
分辨率 2.80 Å
6T15 The III2-IV(5B)1 respiratory supercomplex from S. cerevisiae 提交 2019-10-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 F 1–147（147 aa）
链 Q 1–147（147 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 18 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CDL CARDIOLIPIN × 7 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 6 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliter of sample applied to negatively glow discharged grid, blot force -10; blotting time 8.5 s
分辨率 3.29 Å
6YMX CIII2/CIV respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2020-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 F 74–147（74 aa）
链 Q 73–147（75 aa）
未记录 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 7 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 5 ZN ZINC ION × 1 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
8E7S III2IV2 respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae with 4 bound UQ6 提交 2022-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：44-meric
链 G 1–147（147 aa）
链 g 1–147（147 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 24 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CDL CARDIOLIPIN × 10 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 6 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 4 HEA HEME-A × 4 CU COPPER (II) ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8EC0 III2IV respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae cardiolipin-lacking mutant 提交 2022-08-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 G 1–147（147 aa）
链 g 1–147（147 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 15 PGT (1S)-2-{[{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 4 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8ZJC Cryo-EM structure of Saccharomyces cerevisiae bc1 complex 提交 2024-05-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 F 73–147（75 aa）
链 Q 73–147（75 aa）
未记录 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS,0.1%DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8ZMT Cryo-EM structure of Saccharomyces cerevisiae bc1 complex in Metyltetraprole-bound state 提交 2024-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 F 73–147（75 aa）
链 Q 73–147（75 aa）
未记录 A1D6P 1-[2-[[1-(4-chlorophenyl)pyrazol-3-yl]oxymethyl]-3-methyl-phenyl]-4-methyl-1,2,3,4-tetrazol-5-one × 2 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS, 0.1% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.52 Å
9BPB Tethered respiratory III2IV2 supercomplex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2024-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric
链 F 1–147（147 aa）
链 P 1–147（147 aa）
未记录 CDL CARDIOLIPIN × 8 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 4 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 6 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 8 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 10 HEA HEME-A × 4 CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 uL of sample, 5 s blot time, 30 s hold time, 0 blot force.
分辨率 2.57 Å
9ETZ III2IV respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2024-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 F 73–147（75 aa）
链 Q 73–147（75 aa）
未记录 CDL CARDIOLIPIN × 11 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 26 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 6 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 UCRH_YEAST
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 H； PDB构建体 1–74； UniProt 74–147

Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 14 kDa protein

物种未注明

UniProt P00128

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白拷贝数一致 链 F； UniProt 1–127 未记录 Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex core protein 1 × 1 （P07256） Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex core protein 2 × 1 （P07257） Cytochrome b × 1 （P00163） Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial precursor × 1 （P07143） Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit, mitochondrial precursor × 1 （P08067） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 17 kDa protein × 1 （P00127） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex ubiquinone-binding protein QP-C × 1 （P08525） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 7.3 kDa protein × 1 （P22289） Variable Heavy chain of antibody fragment × 1 Variable Light chain of antibody fragment × 1 HEC HEME C × 3 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 1 SMA STIGMATELLIN A × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；precipitant PEG4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K 分辨率 2.30 Å R-free 0.256

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 2IBZ Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1KB9 YEAST CYTOCHROME BC1 COMPLEX 提交 2001-11-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 G 3–127（125 aa） 片段：RESIDUES 3-127
未记录 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 1 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 3 SMA STIGMATELLIN A × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 1 PIE 1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphoinositol × 1 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 2 CDL CARDIOLIPIN × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；PEG4000, pH 8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
1KYO YEAST CYTOCHROME BC1 COMPLEX WITH BOUND SUBSTRATE CYTOCHROME C 提交 2002-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 G 2–127（126 aa） 片段：RESIDUES 2-127
链 R 2–127（126 aa） 片段：RESIDUES 2-127
未记录 HEC HEME C × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG4000, 20 mM Tris, 0.05 % Undecyl-maltopyranoside, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.97 Å R-free 0.268
1P84 HDBT inhibited Yeast Cytochrome bc1 Complex 提交 2003-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 G 3–127（125 aa）
未记录 3PH 1,2-DIACYL-GLYCEROL-3-SN-PHOSPHATE × 4 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 HEC HEME C × 6 DBT 5-HEPTYL-6-HYDROXY-1,3-BENZOTHIAZOLE-4,7-DIONE × 2 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 4 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 CDL CARDIOLIPIN × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；PEG4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.252
3CX5 Structure of complex III with bound cytochrome c in reduced state and definition of a minimal core interface for electron transfer. 提交 2008-04-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 G 2–127（126 aa） 片段：RESIDUES 2-127
链 R 2–127（126 aa） 片段：RESIDUES 2-127
未记录 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Microbatch (paraffin oil)；pH 7.5；277 K；1M Sucrose, 10% DMSO, 20mM Tris pH 7.5, 80mM NaCl, 0.05 % UM, 1 M stigmatellin, 5% PEG 4000, Microbatch (paraffin oil), temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.263
3CXH Structure of yeast complex III with isoform-2 cytochrome c bound and definition of a minimal core interface for electron transfer. 提交 2008-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 G 2–127（126 aa） 片段：RESIDUES 2-127
链 R 2–127（126 aa） 片段：RESIDUES 2-127
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CN6 (2R,5R,11S,14R)-2-(butanoyloxy)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Microbatch (Paraffin oil)；pH 7.5；277 K；1M Sucrose, 10% DMSO, 20mM Tris pH 7.5, 80mM NaCl, 0.05 % UM, 1 M stigmatellin, 5% PEG 4000, Microbatch (Paraffin oil), temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.256
4PD4 Structural analysis of atovaquone-inhibited cytochrome bc1 complex reveals the molecular basis of antimalarial drug action 提交 2014-04-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric
链 G 2–127（126 aa）
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 3PH 1,2-DIACYL-GLYCEROL-3-SN-PHOSPHATE × 6 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 AOQ 2-[trans-4-(4-chlorophenyl)cyclohexyl]-3-hydroxynaphthalene-1,4-dione × 2 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277.2 K；polyethylene glycol 4000, DMSO, Sucrose, Potassium phosphate, n-undecyl-?-D-maltopyranoside, atovaquone
分辨率 3.04 Å R-free 0.297
6HU9 III2-IV2 mitochondrial respiratory supercomplex from S. cerevisiae 提交 2018-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：44-meric
链 G 1–127（127 aa）
链 R 1–127（127 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 28 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 1 CDL CARDIOLIPIN × 8 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 8 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 2 HEA HEME-A × 4 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 4 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microL of sample applied to negatively glow discharged grid, blot force -10; blotting time 8.5 sec
分辨率 3.35 Å
6T0B The III2-IV(5B)2 respiratory supercomplex from S. cerevisiae 提交 2019-10-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric
链 G 1–127（127 aa）
链 R 1–127（127 aa）
未记录 CDL CARDIOLIPIN × 8 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 26 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 7 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 2 HEA HEME-A × 4 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliter of sample applied to negatively glow discharged grid, blot force -10; blotting time 8.5 s
分辨率 2.80 Å
6T15 The III2-IV(5B)1 respiratory supercomplex from S. cerevisiae 提交 2019-10-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 G 1–127（127 aa）
链 R 1–127（127 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 18 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CDL CARDIOLIPIN × 7 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 6 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliter of sample applied to negatively glow discharged grid, blot force -10; blotting time 8.5 s
分辨率 3.29 Å
6YMX CIII2/CIV respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2020-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 G 2–127（126 aa）
链 R 2–127（126 aa）
未记录 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 7 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 5 ZN ZINC ION × 1 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
8E7S III2IV2 respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae with 4 bound UQ6 提交 2022-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：44-meric
链 F 1–127（127 aa）
链 f 1–127（127 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 24 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CDL CARDIOLIPIN × 10 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 6 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 4 HEA HEME-A × 4 CU COPPER (II) ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8EC0 III2IV respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae cardiolipin-lacking mutant 提交 2022-08-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 F 1–127（127 aa）
链 f 1–127（127 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 15 PGT (1S)-2-{[{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 4 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9BPB Tethered respiratory III2IV2 supercomplex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2024-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric
链 G 1–127（127 aa）
链 Q 1–127（127 aa）
未记录 CDL CARDIOLIPIN × 8 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 4 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 6 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 8 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 10 HEA HEME-A × 4 CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 uL of sample, 5 s blot time, 30 s hold time, 0 blot force.
分辨率 2.57 Å
9ETZ III2IV respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2024-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 G 2–127（126 aa）
链 R 2–127（126 aa）
未记录 CDL CARDIOLIPIN × 11 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 26 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 6 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å

共 14 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 UCR7_YEAST
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 F； PDB构建体 1–127； UniProt 1–127

Ubiquinol-cytochrome c reductase complex ubiquinone-binding protein QP-C

物种未注明

UniProt P08525

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白拷贝数一致 链 G； UniProt 1–94 未记录 Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex core protein 1 × 1 （P07256） Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex core protein 2 × 1 （P07257） Cytochrome b × 1 （P00163） Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial precursor × 1 （P07143） Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit, mitochondrial precursor × 1 （P08067） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 17 kDa protein × 1 （P00127） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 14 kDa protein × 1 （P00128） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 7.3 kDa protein × 1 （P22289） Variable Heavy chain of antibody fragment × 1 Variable Light chain of antibody fragment × 1 HEC HEME C × 3 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 1 SMA STIGMATELLIN A × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；precipitant PEG4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K 分辨率 2.30 Å R-free 0.256

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 2IBZ Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1KB9 YEAST CYTOCHROME BC1 COMPLEX 提交 2001-11-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 H 2–94（93 aa） 片段：RESIDUES 2-94
未记录 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 1 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 3 SMA STIGMATELLIN A × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 1 PIE 1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphoinositol × 1 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 2 CDL CARDIOLIPIN × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；PEG4000, pH 8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
1KYO YEAST CYTOCHROME BC1 COMPLEX WITH BOUND SUBSTRATE CYTOCHROME C 提交 2002-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 H 2–94（93 aa） 片段：RESIDUES 2-94
链 S 2–94（93 aa） 片段：RESIDUES 2-94
未记录 HEC HEME C × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG4000, 20 mM Tris, 0.05 % Undecyl-maltopyranoside, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.97 Å R-free 0.268
1P84 HDBT inhibited Yeast Cytochrome bc1 Complex 提交 2003-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 H 2–94（93 aa）
未记录 3PH 1,2-DIACYL-GLYCEROL-3-SN-PHOSPHATE × 4 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 HEC HEME C × 6 DBT 5-HEPTYL-6-HYDROXY-1,3-BENZOTHIAZOLE-4,7-DIONE × 2 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 4 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 CDL CARDIOLIPIN × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；PEG4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.252
3CX5 Structure of complex III with bound cytochrome c in reduced state and definition of a minimal core interface for electron transfer. 提交 2008-04-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 H 2–94（93 aa）
链 S 2–94（93 aa）
未记录 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Microbatch (paraffin oil)；pH 7.5；277 K；1M Sucrose, 10% DMSO, 20mM Tris pH 7.5, 80mM NaCl, 0.05 % UM, 1 M stigmatellin, 5% PEG 4000, Microbatch (paraffin oil), temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.263
3CXH Structure of yeast complex III with isoform-2 cytochrome c bound and definition of a minimal core interface for electron transfer. 提交 2008-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 H 2–94（93 aa）
链 S 2–94（93 aa）
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CN6 (2R,5R,11S,14R)-2-(butanoyloxy)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Microbatch (Paraffin oil)；pH 7.5；277 K；1M Sucrose, 10% DMSO, 20mM Tris pH 7.5, 80mM NaCl, 0.05 % UM, 1 M stigmatellin, 5% PEG 4000, Microbatch (Paraffin oil), temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.256
4PD4 Structural analysis of atovaquone-inhibited cytochrome bc1 complex reveals the molecular basis of antimalarial drug action 提交 2014-04-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric
链 H 2–94（93 aa）
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 3PH 1,2-DIACYL-GLYCEROL-3-SN-PHOSPHATE × 6 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 AOQ 2-[trans-4-(4-chlorophenyl)cyclohexyl]-3-hydroxynaphthalene-1,4-dione × 2 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277.2 K；polyethylene glycol 4000, DMSO, Sucrose, Potassium phosphate, n-undecyl-?-D-maltopyranoside, atovaquone
分辨率 3.04 Å R-free 0.297
6HU9 III2-IV2 mitochondrial respiratory supercomplex from S. cerevisiae 提交 2018-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：44-meric
链 H 2–94（93 aa）
链 S 2–94（93 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 28 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 1 CDL CARDIOLIPIN × 8 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 8 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 2 HEA HEME-A × 4 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 4 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microL of sample applied to negatively glow discharged grid, blot force -10; blotting time 8.5 sec
分辨率 3.35 Å
6T0B The III2-IV(5B)2 respiratory supercomplex from S. cerevisiae 提交 2019-10-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric
链 H 1–94（94 aa）
链 S 1–94（94 aa）
未记录 CDL CARDIOLIPIN × 8 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 26 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 7 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 2 HEA HEME-A × 4 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliter of sample applied to negatively glow discharged grid, blot force -10; blotting time 8.5 s
分辨率 2.80 Å
6T15 The III2-IV(5B)1 respiratory supercomplex from S. cerevisiae 提交 2019-10-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 H 1–94（94 aa）
链 S 1–94（94 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 18 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CDL CARDIOLIPIN × 7 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 6 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliter of sample applied to negatively glow discharged grid, blot force -10; blotting time 8.5 s
分辨率 3.29 Å
6YMX CIII2/CIV respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2020-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 H 2–94（93 aa）
链 S 2–94（93 aa）
未记录 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 7 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 5 ZN ZINC ION × 1 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
8E7S III2IV2 respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae with 4 bound UQ6 提交 2022-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：44-meric
链 H 1–94（94 aa）
链 h 1–94（94 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 24 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CDL CARDIOLIPIN × 10 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 6 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 4 HEA HEME-A × 4 CU COPPER (II) ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8EC0 III2IV respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae cardiolipin-lacking mutant 提交 2022-08-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 H 1–94（94 aa）
链 h 1–94（94 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 15 PGT (1S)-2-{[{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 4 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9BPB Tethered respiratory III2IV2 supercomplex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2024-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric
链 H 1–94（94 aa）
链 R 1–94（94 aa）
未记录 CDL CARDIOLIPIN × 8 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 4 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 6 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 8 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 10 HEA HEME-A × 4 CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 uL of sample, 5 s blot time, 30 s hold time, 0 blot force.
分辨率 2.57 Å
9ETZ III2IV respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2024-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 H 2–94（93 aa）
链 S 2–94（93 aa）
未记录 CDL CARDIOLIPIN × 11 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 26 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 6 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å

共 14 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 UCRQ_YEAST
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 G； PDB构建体 1–94； UniProt 1–94

Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 7.3 kDa protein

物种未注明

UniProt P22289

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白拷贝数一致 链 I； UniProt 0–65 未记录 Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex core protein 1 × 1 （P07256） Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex core protein 2 × 1 （P07257） Cytochrome b × 1 （P00163） Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial precursor × 1 （P07143） Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit, mitochondrial precursor × 1 （P08067） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 17 kDa protein × 1 （P00127） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 14 kDa protein × 1 （P00128） Ubiquinol-cytochrome c reductase complex ubiquinone-binding protein QP-C × 1 （P08525） Variable Heavy chain of antibody fragment × 1 Variable Light chain of antibody fragment × 1 HEC HEME C × 3 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 1 SMA STIGMATELLIN A × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；precipitant PEG4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K 分辨率 2.30 Å R-free 0.256

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 2IBZ Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1EZV STRUCTURE OF THE YEAST CYTOCHROME BC1 COMPLEX CO-CRYSTALLIZED WITH AN ANTIBODY FV-FRAGMENT 提交 2000-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 I 4–58（55 aa） 片段：RESIDUES 4-58
未记录 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 SMA STIGMATELLIN A × 2 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 microseeding；pH 8；277 K；5 % PEG 4000, 100 mM Tris, 0.05 % Undecyl-maltoside, 1 micromolar stigmatellin, pH 8.0, microseeding, temperature 277K
分辨率 2.30 Å R-free 0.254
1KB9 YEAST CYTOCHROME BC1 COMPLEX 提交 2001-11-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 I 4–58（55 aa） 片段：RESIDUES 4-58
未记录 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 1 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 3 SMA STIGMATELLIN A × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 1 PIE 1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphoinositol × 1 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 2 CDL CARDIOLIPIN × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；PEG4000, pH 8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
1KYO YEAST CYTOCHROME BC1 COMPLEX WITH BOUND SUBSTRATE CYTOCHROME C 提交 2002-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 I 1–57（57 aa） 片段：RESIDUES 1-57
链 T 1–57（57 aa） 片段：RESIDUES 1-57
未记录 HEC HEME C × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG4000, 20 mM Tris, 0.05 % Undecyl-maltopyranoside, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.97 Å R-free 0.268
1P84 HDBT inhibited Yeast Cytochrome bc1 Complex 提交 2003-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 I 3–57（55 aa）
未记录 3PH 1,2-DIACYL-GLYCEROL-3-SN-PHOSPHATE × 4 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 HEC HEME C × 6 DBT 5-HEPTYL-6-HYDROXY-1,3-BENZOTHIAZOLE-4,7-DIONE × 2 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 4 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 CDL CARDIOLIPIN × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；PEG4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.252
3CX5 Structure of complex III with bound cytochrome c in reduced state and definition of a minimal core interface for electron transfer. 提交 2008-04-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 I 2–66（65 aa） 片段：RESIDUES 2-66
链 T 2–66（65 aa） 片段：RESIDUES 2-66
未记录 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Microbatch (paraffin oil)；pH 7.5；277 K；1M Sucrose, 10% DMSO, 20mM Tris pH 7.5, 80mM NaCl, 0.05 % UM, 1 M stigmatellin, 5% PEG 4000, Microbatch (paraffin oil), temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.263
3CXH Structure of yeast complex III with isoform-2 cytochrome c bound and definition of a minimal core interface for electron transfer. 提交 2008-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 I 2–66（65 aa） 片段：RESIDUES 2-66
链 T 2–66（65 aa） 片段：RESIDUES 2-66
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 7 SMA STIGMATELLIN A × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CN6 (2R,5R,11S,14R)-2-(butanoyloxy)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Microbatch (Paraffin oil)；pH 7.5；277 K；1M Sucrose, 10% DMSO, 20mM Tris pH 7.5, 80mM NaCl, 0.05 % UM, 1 M stigmatellin, 5% PEG 4000, Microbatch (Paraffin oil), temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.256
4PD4 Structural analysis of atovaquone-inhibited cytochrome bc1 complex reveals the molecular basis of antimalarial drug action 提交 2014-04-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric
链 I 2–58（57 aa） 片段：UNP residues 2-58
未记录 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 2 3PH 1,2-DIACYL-GLYCEROL-3-SN-PHOSPHATE × 6 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 AOQ 2-[trans-4-(4-chlorophenyl)cyclohexyl]-3-hydroxynaphthalene-1,4-dione × 2 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277.2 K；polyethylene glycol 4000, DMSO, Sucrose, Potassium phosphate, n-undecyl-?-D-maltopyranoside, atovaquone
分辨率 3.04 Å R-free 0.297
6HU9 III2-IV2 mitochondrial respiratory supercomplex from S. cerevisiae 提交 2018-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：44-meric
链 I 1–66（66 aa）
链 T 1–66（66 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 28 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 1 CDL CARDIOLIPIN × 8 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 8 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 2 HEA HEME-A × 4 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 4 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microL of sample applied to negatively glow discharged grid, blot force -10; blotting time 8.5 sec
分辨率 3.35 Å
6T0B The III2-IV(5B)2 respiratory supercomplex from S. cerevisiae 提交 2019-10-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric
链 I 1–66（66 aa）
链 T 1–66（66 aa）
未记录 CDL CARDIOLIPIN × 8 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 26 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 7 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 2 HEA HEME-A × 4 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliter of sample applied to negatively glow discharged grid, blot force -10; blotting time 8.5 s
分辨率 2.80 Å
6T15 The III2-IV(5B)1 respiratory supercomplex from S. cerevisiae 提交 2019-10-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 I 1–66（66 aa）
链 T 1–66（66 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 18 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CDL CARDIOLIPIN × 7 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 6 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliter of sample applied to negatively glow discharged grid, blot force -10; blotting time 8.5 s
分辨率 3.29 Å
6YMX CIII2/CIV respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2020-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 I 5–58（54 aa）
链 T 4–57（54 aa）
未记录 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 7 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 5 ZN ZINC ION × 1 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
8E7S III2IV2 respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae with 4 bound UQ6 提交 2022-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：44-meric
链 E 1–66（66 aa）
链 e 1–66（66 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 24 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CDL CARDIOLIPIN × 10 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 6 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 4 HEA HEME-A × 4 CU COPPER (II) ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8EC0 III2IV respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae cardiolipin-lacking mutant 提交 2022-08-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 E 1–66（66 aa）
链 e 1–66（66 aa）
未记录 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 15 PGT (1S)-2-{[{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 4 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8YHQ Cryo-EM structure of Saccharomyces cerevisiae bc1 complex in pyraclostrobin-bound state 提交 2024-02-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 I 4–58（55 aa）
链 R 4–58（55 aa）
未记录 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 A1D6K methyl ~{N}-[2-[[1-(4-chlorophenyl)pyrazol-3-yl]oxymethyl]phenyl]-~{N}-methoxy-carbamate × 2 7PH (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 2 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS,0.1%DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.42 Å
8YIL Cryo-EM structure of Saccharomyces cerevisiae bc1 complex in YF24228-bound state 提交 2024-02-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 I 4–58（55 aa）
链 T 4–58（55 aa）
未记录 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 86T metyltetraprole × 2 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS,0.1%DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.58 Å
8YIN Cryo-EM structure of Saccharomyces cerevisiae bc1 complex in YF23694-bound state 提交 2024-02-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 I 4–58（55 aa）
链 T 4–58（55 aa）
未记录 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 A1D6O 1-[2-[(4,6-dimethyl-1,3-benzothiazol-2-yl)sulfanylmethyl]-3-methyl-phenyl]-4-methyl-1,2,3,4-tetrazol-5-one × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS, 0.1% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 2.74 Å
8YIO Cryo-EM structure of Saccharomyces cerevisiae bc1 complex in azoxystrobin-bound state 提交 2024-02-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 I 4–58（55 aa）
链 T 4–58（55 aa）
未记录 AZO METHYL (2Z)-2-(2-{[6-(2-CYANOPHENOXY)PYRIMIDIN-4-YL]OXY}PHENYL)-3-METHOXYACRYLATE × 2 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS,0.1%DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.35 Å
8ZJC Cryo-EM structure of Saccharomyces cerevisiae bc1 complex 提交 2024-05-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 I 4–58（55 aa）
链 T 4–58（55 aa）
未记录 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS,0.1%DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8ZMT Cryo-EM structure of Saccharomyces cerevisiae bc1 complex in Metyltetraprole-bound state 提交 2024-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 I 4–58（55 aa）
链 T 4–58（55 aa）
未记录 A1D6P 1-[2-[[1-(4-chlorophenyl)pyrazol-3-yl]oxymethyl]-3-methyl-phenyl]-4-methyl-1,2,3,4-tetrazol-5-one × 2 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS, 0.1% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.52 Å
9BPB Tethered respiratory III2IV2 supercomplex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2024-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric
链 I 1–66（66 aa）
链 S 1–66（66 aa）
未记录 CDL CARDIOLIPIN × 8 6PH (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CN5 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 4 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 9PE (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 6 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 8 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 10 HEA HEME-A × 4 CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 CN3 (2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 uL of sample, 5 s blot time, 30 s hold time, 0 blot force.
分辨率 2.57 Å
9ETZ III2IV respiratory supercomplex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2024-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 I 2–58（57 aa）
链 T 2–58（57 aa）
未记录 CDL CARDIOLIPIN × 11 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 26 PCF 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 6 UQ6 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 HEC HEME C × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å

共 21 个其他 PDB 条目、21 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 UCR9_YEAST
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 I； PDB构建体 1–66； UniProt 0–65

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 2ibz

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 2ibz
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2ibz
沉积日期 deposition_date2006-09-12
结构标题 titleYeast Cytochrome BC1 Complex with Stigmatellin
关键词 keywordsmultisubunit membrane protein complex, OXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier55.13 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron54.75 Å
零角强度 I(0) i0814585000.00
分子量 molecular_weight246910.0 kDa
排除体积 excluded_volume312290 ų
包络体积 envelope_volume465770 ų
水化壳体积 shell_volume73790 ų
包络直径 envelope_diameter188.1 Å
壳层 Rg shell_rg54.48 Å
包络 Rg envelope_rg53.86 Å
形状 Rg shape_rg54.74 Å
总 Rg total_rg54.77 Å
总原子数 total_atoms17439
残基数 n_residues2179
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax179.7 Å
Rg (实空间) rg_real55.30 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.80 Å
I(0) (实空间) i0_real8.1460e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.7430e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal54.96 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal814100000.0000
解质量估计 total_estimate0.8478
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary43.4 Å
偏度 Skewness skewness0.273
峰度 Kurtosis kurtosis-0.791
角度范围 angular_range— – 0.1450 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha59410000.0000
实空间数据点数 n_real_points30
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.888; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.951; Smooth: 0.402
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (16)

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 31 domains

SCOP 2.08 (16 domains)

结构域编号 domain_idd2ibza1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.185 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
超家族 Superfamily superfamilyd.185.1 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
家族 Family familyd.185.1.1 — MPP-like
结构域编号 domain_idd2ibza2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.185 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
超家族 Superfamily superfamilyd.185.1 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
家族 Family familyd.185.1.1 — MPP-like
结构域编号 domain_idd2ibzb1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.185 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
超家族 Superfamily superfamilyd.185.1 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
家族 Family familyd.185.1.1 — MPP-like
结构域编号 domain_idd2ibzb2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.185 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
超家族 Superfamily superfamilyd.185.1 — LuxS/MPP-like metallohydrolase
家族 Family familyd.185.1.1 — MPP-like
结构域编号 domain_idd2ibzc1
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.32 — a domain/subunit of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase)
超家族 Superfamily superfamilyf.32.1 — a domain/subunit of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase)
家族 Family familyf.32.1.1 — a domain/subunit of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase)
结构域编号 domain_idd2ibzc2
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.21 — Heme-binding four-helical bundle
超家族 Superfamily superfamilyf.21.1 — Transmembrane di-heme cytochromes
家族 Family familyf.21.1.2 — Cytochrome b of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase)
结构域编号 domain_idd2ibzd1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.3 — Cytochrome c
超家族 Superfamily superfamilya.3.1 — Cytochrome c
家族 Family familya.3.1.3 — Cytochrome bc1 domain
结构域编号 domain_idd2ibzd2
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamilyf.23.11 — Cytochrome c1 subunit of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase), transmembrane anchor
家族 Family familyf.23.11.1 — Cytochrome c1 subunit of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase), transmembrane anchor
结构域编号 domain_idd2ibze1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.33 — ISP domain
超家族 Superfamily superfamilyb.33.1 — ISP domain
家族 Family familyb.33.1.1 — Rieske iron-sulfur protein (ISP)
结构域编号 domain_idd2ibze2
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamilyf.23.12 — ISP transmembrane anchor
家族 Family familyf.23.12.1 — ISP transmembrane anchor
结构域编号 domain_idd2ibzf_
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.27 — 14 kDa protein of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase)
超家族 Superfamily superfamilyf.27.1 — 14 kDa protein of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase)
家族 Family familyf.27.1.1 — 14 kDa protein of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase)
结构域编号 domain_idd2ibzg_
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamilyf.23.13 — Ubiquinone-binding protein QP-C of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase)
家族 Family familyf.23.13.1 — Ubiquinone-binding protein QP-C of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase)
结构域编号 domain_idd2ibzh_
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.28 — Non-heme 11 kDa protein of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase)
超家族 Superfamily superfamilyf.28.1 — Non-heme 11 kDa protein of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase)
家族 Family familyf.28.1.1 — Non-heme 11 kDa protein of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase)
结构域编号 domain_idd2ibzi_
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamilyf.23.14 — Subunit X (non-heme 7 kDa protein) of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase)
家族 Family familyf.23.14.1 — Subunit X (non-heme 7 kDa protein) of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase)
结构域编号 domain_idd2ibzx_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family familyb.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)
结构域编号 domain_idd2ibzy_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family familyb.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

CATH v4.4 (15 domains)

结构域编号 domain_id2ibzA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology830 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like
结构域编号 domain_id2ibzA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology830 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like
结构域编号 domain_id2ibzB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology830 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like
结构域编号 domain_id2ibzB02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology830 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like
结构域编号 domain_id2ibzC00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology810 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain C
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain C
结构域编号 domain_id2ibzD01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology760 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain D, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cytochrome c-like domain
结构域编号 domain_id2ibzD02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100 — Cytochrome c1, transmembrane anchor, C-terminal
结构域编号 domain_id2ibzE01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — Ubiquinol cytochrome reductase, transmembrane domain
结构域编号 domain_id2ibzE02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture102 — 3-layer Sandwich
拓扑 Topology topology10 — Rieske Iron-sulfur Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Rieske [2Fe-2S] iron-sulphur domain
结构域编号 domain_id2ibzF00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1090 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain F
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cytochrome b-c1 complex subunit 7
结构域编号 domain_id2ibzG00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily210 — Cytochrome b-c1 complex subunit 8
结构域编号 domain_id2ibzH00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain
结构域编号 domain_id2ibzI00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily260 — Cytochrome b-c1 complex subunit 9
结构域编号 domain_id2ibzX00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id2ibzY00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)