2om1

Structure of human insulin in presence of thiocyanate at pH 6.5

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Insulin A chain

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 12	RESORCINOL × 6 ZINC ION × 2 THIOCYANATE ION × 2 water × 12	与蛋白数一致
2	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 12	RESORCINOL × 6 ZINC ION × 2 THIOCYANATE ION × 2 GLYCEROL × 1 water × 12	与蛋白数一致
3	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 12	RESORCINOL × 6 ZINC ION × 2 THIOCYANATE ION × 2 water × 12	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	INS_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1, 2
链与序列区间	作者链 1； PDB构建体 1–21； UniProt 90–110 作者链 3； PDB构建体 1–21； UniProt 90–110 作者链 A； PDB构建体 1–21； UniProt 90–110 作者链 C； PDB构建体 1–21； UniProt 90–110 作者链 E； PDB构建体 1–21； UniProt 90–110 作者链 G； PDB构建体 1–21； UniProt 90–110 作者链 I； PDB构建体 1–21； UniProt 90–110 作者链 K； PDB构建体 1–21； UniProt 90–110 作者链 Q； PDB构建体 1–21； UniProt 90–110 作者链 S； PDB构建体 1–21； UniProt 90–110 作者链 U； PDB构建体 1–21； UniProt 90–110 作者链 X； PDB构建体 1–21； UniProt 90–110 作者链 a； PDB构建体 1–21； UniProt 90–110 作者链 c； PDB构建体 1–21； UniProt 90–110 作者链 e； PDB构建体 1–21； UniProt 90–110 作者链 g； PDB构建体 1–21； UniProt 90–110 作者链 i； PDB构建体 1–21； UniProt 90–110 作者链 k； PDB构建体 1–21； UniProt 90–110 作者链 2； PDB构建体 1–30； UniProt 25–54 作者链 4； PDB构建体 1–30； UniProt 25–54 作者链 B； PDB构建体 1–30； UniProt 25–54 作者链 D； PDB构建体 1–30； UniProt 25–54 作者链 F； PDB构建体 1–30； UniProt 25–54 作者链 H； PDB构建体 1–30； UniProt 25–54 作者链 J； PDB构建体 1–30； UniProt 25–54 作者链 L； PDB构建体 1–30； UniProt 25–54 作者链 R； PDB构建体 1–30； UniProt 25–54 作者链 T； PDB构建体 1–30； UniProt 25–54 作者链 V； PDB构建体 1–30； UniProt 25–54 作者链 Y； PDB构建体 1–30； UniProt 25–54 作者链 b； PDB构建体 1–30； UniProt 25–54 作者链 d； PDB构建体 1–30； UniProt 25–54 作者链 f； PDB构建体 1–30； UniProt 25–54 作者链 h； PDB构建体 1–30； UniProt 25–54 作者链 j； PDB构建体 1–30； UniProt 25–54 作者链 l； PDB构建体 1–30； UniProt 25–54

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2om1
沉积日期 deposition_date	2007-01-20
结构标题 title	Structure of human insulin in presence of thiocyanate at pH 6.5
关键词 keywords	R6 conformation, hormone; HORMONE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2om1__assembly_3__model_1

Assembly 3 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2om1__assembly_3__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2om1__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	19.16 Å
Rg（电子密度）	18.00 Å
总 Rg	18.89 Å
原子数	2424
残基数	299
排除体积	43212 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2om1__assembly_1__model_1`	dodecameric （12）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2om1__assembly_2__model_1`	dodecameric （12）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`2om1__assembly_3__model_1`	dodecameric （12）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Insulin A chain
分子量 formula_weight	2383.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	18

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,G,I,K,Q,S,U,X,1,3,a,c,e,g,i,k
原子数 atom_count	8076

GIVEQCCTSICSLYQLENYCN

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Insulin B chain
分子量 formula_weight	3434.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	18

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F,H,J,L,R,T,V,Y,2,4,b,d,f,h,j,l

FVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKT

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	RESORCINOL
分子量 formula_weight	110.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	18

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	THIOCYANATE ION
分子量 formula_weight	58.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	755

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

结构域编号 domain_id	d2om121
类 Class class	j — Peptides
折叠类型 Fold fold	j.75 — Isolated insulin B-chain
超家族 Superfamily superfamily	j.75.1 — Isolated insulin B-chain
家族 Family family	j.75.1.1 — Isolated insulin B-chain

结构域编号 domain_id	d2om141
类 Class class	j — Peptides
折叠类型 Fold fold	j.75 — Isolated insulin B-chain
超家族 Superfamily superfamily	j.75.1 — Isolated insulin B-chain
家族 Family family	j.75.1.1 — Isolated insulin B-chain

结构域编号 domain_id	d2om1b1
类 Class class	j — Peptides
折叠类型 Fold fold	j.75 — Isolated insulin B-chain
超家族 Superfamily superfamily	j.75.1 — Isolated insulin B-chain
家族 Family family	j.75.1.1 — Isolated insulin B-chain

结构域编号 domain_id	d2om1d1
类 Class class	j — Peptides
折叠类型 Fold fold	j.75 — Isolated insulin B-chain
超家族 Superfamily superfamily	j.75.1 — Isolated insulin B-chain
家族 Family family	j.75.1.1 — Isolated insulin B-chain

结构域编号 domain_id	d2om1f1
类 Class class	j — Peptides
折叠类型 Fold fold	j.75 — Isolated insulin B-chain
超家族 Superfamily superfamily	j.75.1 — Isolated insulin B-chain
家族 Family family	j.75.1.1 — Isolated insulin B-chain

结构域编号 domain_id	d2om1h1
类 Class class	j — Peptides
折叠类型 Fold fold	j.75 — Isolated insulin B-chain
超家族 Superfamily superfamily	j.75.1 — Isolated insulin B-chain
家族 Family family	j.75.1.1 — Isolated insulin B-chain

结构域编号 domain_id	d2om1j1
类 Class class	j — Peptides
折叠类型 Fold fold	j.75 — Isolated insulin B-chain
超家族 Superfamily superfamily	j.75.1 — Isolated insulin B-chain
家族 Family family	j.75.1.1 — Isolated insulin B-chain

结构域编号 domain_id	d2om1l1
类 Class class	j — Peptides
折叠类型 Fold fold	j.75 — Isolated insulin B-chain
超家族 Superfamily superfamily	j.75.1 — Isolated insulin B-chain
家族 Family family	j.75.1.1 — Isolated insulin B-chain

结构域编号 domain_id	d2om1r1
类 Class class	j — Peptides
折叠类型 Fold fold	j.75 — Isolated insulin B-chain
超家族 Superfamily superfamily	j.75.1 — Isolated insulin B-chain
家族 Family family	j.75.1.1 — Isolated insulin B-chain

结构域编号 domain_id	d2om1t1
类 Class class	j — Peptides
折叠类型 Fold fold	j.75 — Isolated insulin B-chain
超家族 Superfamily superfamily	j.75.1 — Isolated insulin B-chain
家族 Family family	j.75.1.1 — Isolated insulin B-chain

结构域编号 domain_id	d2om1v1
类 Class class	j — Peptides
折叠类型 Fold fold	j.75 — Isolated insulin B-chain
超家族 Superfamily superfamily	j.75.1 — Isolated insulin B-chain
家族 Family family	j.75.1.1 — Isolated insulin B-chain

结构域编号 domain_id	d2om1y1
类 Class class	j — Peptides
折叠类型 Fold fold	j.75 — Isolated insulin B-chain
超家族 Superfamily superfamily	j.75.1 — Isolated insulin B-chain
家族 Family family	j.75.1.1 — Isolated insulin B-chain

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晶胞边长 a length_a	59.000 Å
晶胞边长 b length_b	219.480 Å
晶胞边长 c length_c	224.480 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	144

空间群 space_group	C 2 2 21
空间群编号 int_tables_number	20
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.970 Å
最低分辨率 resolution_low	19.990 Å
R 因子 r_factor	0.1765
R_work r_work	0.1746
R_free r_free	0.2117

Structure of human insulin in presence of thiocyanate at pH 6.5

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Insulin A chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2om1__assembly_3__model_1

2om1__assembly_3__model_1 | I(q)

2om1__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of human insulin in presence of thiocyanate at pH 6.5

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Insulin A chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2om1__assembly_3__model_1

2om1__assembly_3__model_1 | I(q)

2om1__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

7. 引用文献 (1)