Vitamin B12 transporter btuB
Escherichia coli
当前结构中的状态
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Colicin-E2 × 1 （P04419） | 与蛋白数一致 |
数据库中的同蛋白其他状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | BTUB_ECOLI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–594； UniProt 21–614 |
2ysu
Structure of the complex between BtuB and Colicin E2 receptor binding domain
1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures
Colicin-E2
Escherichia coli
当前结构中的状态
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Vitamin B12 transporter btuB × 1 （P06129） | 与蛋白数一致 |
数据库中的同蛋白其他状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | CEA2_ECOLI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 B； PDB构建体 1–135； UniProt 313–447 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
2. 结构基本信息 2. Structure Basics
| 条目编号 entry_id | 2ysu |
| 沉积日期 deposition_date | 2007-04-04 |
| 结构标题 title | Structure of the complex between BtuB and Colicin E2 receptor binding domain |
| 关键词 keywords | BETA-BARREL, COILED-COIL, TRANSPORT PROTEIN-HYDROLASE COMPLEX; TRANSPORT PROTEIN/HYDROLASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
2ysu__assembly_1__model_1
Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
2ysu__assembly_1__model_1 | I(q)
2ysu__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending
| Rg（Guinier） | 32.03 Å |
| Rg（电子密度） | 32.69 Å |
| 总 Rg | 33.01 Å |
| 原子数 | 5537 |
| 残基数 | 699 |
| 排除体积 | 96497 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment
5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)
6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains
SCOP 2.08 (2 domains)
| 结构域编号 domain_id | d2ysua1 |
| 类 Class class | f — Membrane and cell surface proteins and peptides |
| 折叠类型 Fold fold | f.4 — Transmembrane beta-barrels |
| 超家族 Superfamily superfamily | f.4.3 — Porins |
| 家族 Family family | f.4.3.3 — Ligand-gated protein channel |
| 结构域编号 domain_id | d2ysub1 |
| 类 Class class | h — Coiled coil proteins |
| 折叠类型 Fold fold | h.4 — Antiparallel coiled-coil |
| 超家族 Superfamily superfamily | h.4.9 — Colicin E3 receptor domain |
| 家族 Family family | h.4.9.1 — Colicin E3 receptor domain |
CATH v4.4 (3 domains)
| 结构域编号 domain_id | 2ysuA01 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 170 — Beta Complex |
| 拓扑 Topology topology | 130 — Ferric Hydroxamate Uptake Protein; Chain A, domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — TonB-dependent receptor, plug domain |
| 结构域编号 domain_id | 2ysuA02 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 170 — Maltoporin; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 20 — TonB-dependent receptor, beta-barrel domain |
| 结构域编号 domain_id | 2ysuB00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 287 — Helix Hairpins |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 620 — Helix Hairpins |