3aae

Crystal structure of Actin capping protein in complex with CARMIL fragment

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

F-actin-capping protein subunit alpha-1

Gallus gallus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315） 32mer peptide from Leucine-rich repeat-containing protein 16A × 1 （Q6EDY6）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315） 32mer peptide from Leucine-rich repeat-containing protein 16A × 1 （Q6EDY6）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315） 32mer peptide from Leucine-rich repeat-containing protein 16A × 1 （Q6EDY6）	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315） 32mer peptide from Leucine-rich repeat-containing protein 16A × 1 （Q6EDY6）	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315） 32mer peptide from Leucine-rich repeat-containing protein 16A × 1 （Q6EDY6）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CAZA1_CHICK
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–286； UniProt 1–286 作者链 C； PDB构建体 1–286； UniProt 1–286 作者链 E； PDB构建体 1–286； UniProt 1–286 作者链 G； PDB构建体 1–286； UniProt 1–286 作者链 I； PDB构建体 1–286； UniProt 1–286

F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2

Gallus gallus

UniProt P14315

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） 32mer peptide from Leucine-rich repeat-containing protein 16A × 1 （Q6EDY6）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） 32mer peptide from Leucine-rich repeat-containing protein 16A × 1 （Q6EDY6）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） 32mer peptide from Leucine-rich repeat-containing protein 16A × 1 （Q6EDY6）	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） 32mer peptide from Leucine-rich repeat-containing protein 16A × 1 （Q6EDY6）	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） 32mer peptide from Leucine-rich repeat-containing protein 16A × 1 （Q6EDY6）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CAPZB_CHICK
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–277； UniProt 1–277 作者链 D； PDB构建体 1–277； UniProt 1–277 作者链 F； PDB构建体 1–277； UniProt 1–277 作者链 H； PDB构建体 1–277； UniProt 1–277 作者链 J； PDB构建体 1–277； UniProt 1–277

32mer peptide from Leucine-rich repeat-containing protein 16A

Mus musculus

UniProt Q6EDY6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315）	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315）	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P13127） F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 × 1 （P14315）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	LR16A_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 V； PDB构建体 6–37； UniProt 971–1002 作者链 W； PDB构建体 6–37； UniProt 971–1002 作者链 X； PDB构建体 6–37； UniProt 971–1002 作者链 Y； PDB构建体 6–37； UniProt 971–1002 作者链 Z； PDB构建体 6–37； UniProt 971–1002

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3aae
沉积日期 deposition_date	2009-11-16
结构标题 title	Crystal structure of Actin capping protein in complex with CARMIL fragment
关键词 keywords	;ACTIN CAPPING PROTEIN, BARBED END REGULATION, CARMIL FAMILY PROTEIN, CONFORMATIONAL CHANGE, CELL MOTILITY, Actin capping, Actin-binding, Cytoskeleton, Isopeptide bond, Leucine-rich repeat, PROTEIN BINDING ;; PROTEIN BINDING
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3aae__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3aae__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3aae__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	28.06 Å
Rg（电子密度）	27.28 Å
总 Rg	28.03 Å
原子数	4533
残基数	563
排除体积	80043 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3aae__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`3aae__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`3aae__assembly_3__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`3aae__assembly_4__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
5	1	`3aae__assembly_5__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	F-actin-capping protein subunit alpha-1
分子量 formula_weight	33001.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	5

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,G,I
原子数 atom_count	22177

MADFEDRVSDEEKVRIAAKFITHAPPGEFNEVFNDVRLLLNNDNLLREGAAHAFAQYNMDQFTPVKIEGYDDQVLITEHGDLGNGRFLDPRNKISFKFDHLRKEASDPQPEDTESALKQWRDACDSALRAYVKDHYPNGFCTVYGKSIDGQQTIIACIESHQFQPKNFWNGRWRSEWKFTITPPTAQVAAVLKIQVHYYEDGNVQLVSHKDIQDSVQVSSDVQTAKEFIKIIENAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA

来源 Source

来源生物 organism	Gallus gallus
通用名 common_name	Chicken
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9031
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2
分子量 formula_weight	31403.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	5

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F,H,J

MSDQQLDCALDLMRRLPPQQIEKNLSDLIDLVPSLCEDLLSSVDQPLKIARDKVVGKDYLLCDYNRDGDSYRSPWSNKYDPPLEDGAMPSARLRKLEVEANNAFDQYRDLYFEGGVSSVYLWDLDHGFAGVILIKKAGDGSKKIKGCWDSIHVVEVQEKSSGRTAHYKLTSTVMLWLQTNKTGSGTMNLGGSLTRQMEKDETVSDSSPHIANIGRLVEDMENKIRSTLNEIYFGKTKDIVNGLRSIDAIPDNQKYKQLQRELSQVLTQRQIYIQPDN

来源 Source

来源生物 organism	Gallus gallus
通用名 common_name	Chicken
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9031
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	32mer peptide from Leucine-rich repeat-containing protein 16A
分子量 formula_weight	4167.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	5

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X,Y,Z,W,V

GPLGSSSGLISELPSEEGRRLEHFTKLRPKRNKKQQP

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 20 domains

CATH v4.4 (20 domains)

结构域编号 domain_id	3aaeA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1140 — Ribosomal protein S3 C-terminal domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — F-actin capping protein, alpha subunit

结构域编号 domain_id	3aaeA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3aaeB01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	570 — F-actin capping protein, alpha/beta subunit, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3aaeB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3aaeC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1140 — Ribosomal protein S3 C-terminal domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — F-actin capping protein, alpha subunit

结构域编号 domain_id	3aaeC02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3aaeD01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	570 — F-actin capping protein, alpha/beta subunit, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3aaeD02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3aaeE01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1140 — Ribosomal protein S3 C-terminal domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — F-actin capping protein, alpha subunit

结构域编号 domain_id	3aaeE02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3aaeF01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	570 — F-actin capping protein, alpha/beta subunit, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3aaeF02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3aaeG01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1140 — Ribosomal protein S3 C-terminal domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — F-actin capping protein, alpha subunit

结构域编号 domain_id	3aaeG02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3aaeH01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	570 — F-actin capping protein, alpha/beta subunit, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3aaeH02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3aaeI01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1140 — Ribosomal protein S3 C-terminal domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — F-actin capping protein, alpha subunit

结构域编号 domain_id	3aaeI02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	3aaeJ01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	570 — F-actin capping protein, alpha/beta subunit, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3aaeJ02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

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晶胞边长 a length_a	231.153 Å
晶胞边长 b length_b	104.358 Å
晶胞边长 c length_c	186.633 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	119.09 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	20

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.300 Å
最低分辨率 resolution_low	49.700 Å
R 因子 r_factor	0.2447
R_work r_work	0.2433
R_free r_free	0.2709

Crystal structure of Actin capping protein in complex with CARMIL fragment

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

F-actin-capping protein subunit alpha-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

32mer peptide from Leucine-rich repeat-containing protein 16A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3aae__assembly_1__model_1

3aae__assembly_1__model_1 | I(q)

3aae__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 20 domains

CATH v4.4 (20 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of Actin capping protein in complex with CARMIL fragment

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

F-actin-capping protein subunit alpha-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

32mer peptide from Leucine-rich repeat-containing protein 16A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3aae__assembly_1__model_1

3aae__assembly_1__model_1 | I(q)

3aae__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 20 domains

CATH v4.4 (20 domains)

7. 引用文献 (1)