3b4v

X-Ray structure of Activin in complex with FSTL3

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Inhibin beta A chain

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	follistatin-like 3 × 2 （O95633） 1,2-ETHANEDIOL × 2 SULFATE ION × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 water × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	follistatin-like 3 × 2 （O95633） 1,2-ETHANEDIOL × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	INHBA_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–116； UniProt 311–426 作者链 B； PDB构建体 1–116； UniProt 311–426 作者链 E； PDB构建体 1–116； UniProt 311–426 作者链 F； PDB构建体 1–116； UniProt 311–426

follistatin-like 3

Homo sapiens

UniProt O95633

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Inhibin beta A chain × 2 （P08476） 1,2-ETHANEDIOL × 2 SULFATE ION × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 water × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Inhibin beta A chain × 2 （P08476） 1,2-ETHANEDIOL × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FSTL3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–237； UniProt 27–263 作者链 D； PDB构建体 1–237； UniProt 27–263 作者链 G； PDB构建体 1–237； UniProt 27–263 作者链 H； PDB构建体 1–237； UniProt 27–263

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3b4v
沉积日期 deposition_date	2007-10-24
结构标题 title	X-Ray structure of Activin in complex with FSTL3
关键词 keywords	;Ligand-inhibitor signalling complex, Cleavage on pair of basic residues, Glycoprotein, Growth factor, Hormone, Secreted, Nucleus, Proto-oncogene, HORMONE REGULATOR COMPLEX ;; HORMONE REGULATOR COMPLEX
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3b4v__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3b4v__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3b4v__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	30.25 Å
Rg（电子密度）	29.39 Å
总 Rg	30.05 Å
原子数	4795
残基数	642
排除体积	84013 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3b4v__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`3b4v__assembly_2__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Inhibin beta A chain
分子量 formula_weight	12991.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,E,F
原子数 atom_count	9726

GLECDGKVNICCKKQFFVSFKDIGWNDWIIAPSGYHANYCEGECPSHIAGTSGSSLSFHSTVINHYRMRGHSPFANLKSCCVPTKLRPMSMLYYDDGQNIIKKDIQNMIVEECGCS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	follistatin-like 3
分子量 formula_weight	24988.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D,G,H

MGSGNPAPGGVCWLQQGQEATCSLVLQTDVTRAECCASGNIDTAWSNLTHPGNKINLLGFLGLVHCLPCKDSCDGVECGPGKACRMLGGRPRCECAPDCSGLPARLQVCGSDGATYRDECELRAARCRGHPDLSVMYRGRCRKSCEHVVCPRPQSCVVDQTGSAHCVVCRAAPCPVPSSPGQELCGNNNVTYISSCHMRQATCFLGRSIGVRHAGSCAGTPEEPPGGESAEEEENFV

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	177

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 20 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d3b4va_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.17 — Cystine-knot cytokines
超家族 Superfamily superfamily	g.17.1 — Cystine-knot cytokines
家族 Family family	g.17.1.2 — Transforming growth factor (TGF)-beta

结构域编号 domain_id	d3b4vb_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.17 — Cystine-knot cytokines
超家族 Superfamily superfamily	g.17.1 — Cystine-knot cytokines
家族 Family family	g.17.1.2 — Transforming growth factor (TGF)-beta

结构域编号 domain_id	d3b4ve_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.17 — Cystine-knot cytokines
超家族 Superfamily superfamily	g.17.1 — Cystine-knot cytokines
家族 Family family	g.17.1.2 — Transforming growth factor (TGF)-beta

结构域编号 domain_id	d3b4vf_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.17 — Cystine-knot cytokines
超家族 Superfamily superfamily	g.17.1 — Cystine-knot cytokines
家族 Family family	g.17.1.2 — Transforming growth factor (TGF)-beta

CATH v4.4 (16 domains)

结构域编号 domain_id	3b4vA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	90 — Cystine Knot Cytokines, subunit B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cystine-knot cytokines

结构域编号 domain_id	3b4vB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	90 — Cystine Knot Cytokines, subunit B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cystine-knot cytokines

结构域编号 domain_id	3b4vC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	290 — Extracellular Matrix Fibrillin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — TGF-beta binding (TB) domain

结构域编号 domain_id	3b4vC02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	60 — Wheat Germ Agglutinin (Isolectin 2); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 —

结构域编号 domain_id	3b4vC03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	60 — Wheat Germ Agglutinin (Isolectin 2); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 —

结构域编号 domain_id	3b4vD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	290 — Extracellular Matrix Fibrillin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — TGF-beta binding (TB) domain

结构域编号 domain_id	3b4vD02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	60 — Wheat Germ Agglutinin (Isolectin 2); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 —

结构域编号 domain_id	3b4vD03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	60 — Wheat Germ Agglutinin (Isolectin 2); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 —

结构域编号 domain_id	3b4vE00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	90 — Cystine Knot Cytokines, subunit B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cystine-knot cytokines

结构域编号 domain_id	3b4vF00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	90 — Cystine Knot Cytokines, subunit B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cystine-knot cytokines

结构域编号 domain_id	3b4vG01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	290 — Extracellular Matrix Fibrillin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — TGF-beta binding (TB) domain

结构域编号 domain_id	3b4vG02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	60 — Wheat Germ Agglutinin (Isolectin 2); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 —

结构域编号 domain_id	3b4vG03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	60 — Wheat Germ Agglutinin (Isolectin 2); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 —

结构域编号 domain_id	3b4vH01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	290 — Extracellular Matrix Fibrillin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — TGF-beta binding (TB) domain

结构域编号 domain_id	3b4vH02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	60 — Wheat Germ Agglutinin (Isolectin 2); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 —

结构域编号 domain_id	3b4vH03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	60 — Wheat Germ Agglutinin (Isolectin 2); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 —

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晶胞边长 a length_a	63.613 Å
晶胞边长 b length_b	71.384 Å
晶胞边长 c length_c	100.203 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	98.55 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.64 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.11 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.480 Å
最低分辨率 resolution_low	31.780 Å
R 因子 r_factor	0.2293
R_work r_work	0.2266
R_free r_free	0.2788

X-Ray structure of Activin in complex with FSTL3

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Inhibin beta A chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

follistatin-like 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3b4v__assembly_1__model_1

3b4v__assembly_1__model_1 | I(q)

3b4v__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 20 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (16 domains)

7. 引用文献 (1)

X-Ray structure of Activin in complex with FSTL3

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Inhibin beta A chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

follistatin-like 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3b4v__assembly_1__model_1

3b4v__assembly_1__model_1 | I(q)

3b4v__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 20 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (16 domains)

7. 引用文献 (1)