3gjo

Crystal structure of human EB1 in complex with microtubule Tip localization signal peptide of MACF

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Microtubule-associated protein RP/EB family member 1

Homo sapiens

UniProt Q15691

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Dystonin × 2 (Q5TBT1) water × 3 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Dystonin × 2 (Q5TBT1) water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MARE1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 3–72; UniProt 191–260 作者链 B; PDB构建体 3–72; UniProt 191–260 作者链 C; PDB构建体 3–72; UniProt 191–260 作者链 D; PDB构建体 3–72; UniProt 191–260

Dystonin

Homo sapiens

UniProt Q5TBT1

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Microtubule-associated protein RP/EB family member 1 × 2 (Q15691) water × 3 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Microtubule-associated protein RP/EB family member 1 × 2 (Q15691) water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q5TBT1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–30; UniProt 5428–5457 作者链 F; PDB构建体 1–30; UniProt 5428–5457 作者链 G; PDB构建体 1–30; UniProt 5428–5457 作者链 H; PDB构建体 1–30; UniProt 5428–5457

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3gjo
沉积日期 deposition_date2009-03-09
结构标题 titleCrystal structure of human EB1 in complex with microtubule Tip localization signal peptide of MACF
关键词 keywords;EB1 STRUCTURAL MOTIF, +TIP PROTEIN COMPLEX, SXIP MOTIFF, APC/DYNACTIN BINDING PROTEIN, MICROTUBULE ACTIN CROSS-LINKING FACTOR, CELL CYCLE, CELL DIVISION, MITOSIS, PHOSPHOPROTEIN, ACTIN-BINDING CALCIUM, STRUCTURAL PROTEIN, Microtubule, Actin-binding ;; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3gjo__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3gjo__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3gjo__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)19.56 Å
Rg(电子密度)18.67 Å
总 Rg19.73 Å
原子数1217
残基数150
排除体积21810 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3gjo__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 3gjo__assembly_2__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd3gjoa_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.245 — EB1 dimerisation domain-like
超家族 Superfamily superfamilya.245.1 — EB1 dimerisation domain-like
家族 Family familya.245.1.1 — EB1 dimerisation domain-like
结构域编号 domain_idd3gjob_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.245 — EB1 dimerisation domain-like
超家族 Superfamily superfamilya.245.1 — EB1 dimerisation domain-like
家族 Family familya.245.1.1 — EB1 dimerisation domain-like
结构域编号 domain_idd3gjoc_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.245 — EB1 dimerisation domain-like
超家族 Superfamily superfamilya.245.1 — EB1 dimerisation domain-like
家族 Family familya.245.1.1 — EB1 dimerisation domain-like
结构域编号 domain_idd3gjod_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.245 — EB1 dimerisation domain-like
超家族 Superfamily superfamilya.245.1 — EB1 dimerisation domain-like
家族 Family familya.245.1.1 — EB1 dimerisation domain-like

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id3gjoA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1430 —
结构域编号 domain_id3gjoB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1430 —
结构域编号 domain_id3gjoC00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1430 —
结构域编号 domain_id3gjoD00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1430 —
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7. 引用文献 (1)