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3j7q

Structure of the idle mammalian ribosome-Sec61 complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 207.5 Å Quality: EXCELLENT
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ribosomal protein uL2

物种未注明

UniProt A0A480Q387

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 A； UniProt 49–305 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 A 49–305（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A480Q387_PIG
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–257； UniProt 49–305

Ribosomal protein uL3

物种未注明

UniProt A0A480L253

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 B； UniProt 24–417 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 B 24–417（394 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A480L253_PIG
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–394； UniProt 24–417

Ribosomal protein uL4

物种未注明

UniProt A0A287AE76

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 C； UniProt 2–365 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 C 2–365（364 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A287AE76_PIG
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–367； UniProt 2–365

Ribosomal protein uL18

物种未注明

UniProt A0A287ASD0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 D； UniProt 1–297 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 D 1–297（297 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A287ASD0_PIG
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 1–297； UniProt 1–297

Ribosomal protein eL6

物种未注明

UniProt Q2YGT9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 E； UniProt 38–284 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 E 38–284（247 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL6_PIG
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 E； PDB构建体 1–236； UniProt 38–284

Ribosomal protein uL30

物种未注明

UniProt A0A480W0U3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 F； UniProt 26–250 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 F 26–250（225 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A480W0U3_PIG
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 F； PDB构建体 1–225； UniProt 26–250

Ribosomal protein eL8

物种未注明

UniProt A0A4X1W808

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 G； UniProt 35–300 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 G 35–300（266 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A4X1W808_PIG
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 G； PDB构建体 1–266； UniProt 35–300

Ribosomal protein uL6

物种未注明

UniProt I3LP78

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 H； UniProt 1–192 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7O Structure of the mammalian 60S ribosomal subunit 提交 2014-08-01 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：45-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.40 Å
3J7P Structure of the 80S mammalian ribosome bound to eEF2 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：82-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.50 Å
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 I3LP78_PIG
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 H； PDB构建体 1–192； UniProt 1–192

Ribosomal protein uL16

物种未注明

UniProt Q29195

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 I； UniProt 2–214 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 I 2–214（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL10_PIG
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 I； PDB构建体 1–213； UniProt 2–214

Ribosomal protein uL5

物种未注明

UniProt Q29205

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 J； UniProt 1–178 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7O Structure of the mammalian 60S ribosomal subunit 提交 2014-08-01 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：45-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.40 Å
3J7P Structure of the 80S mammalian ribosome bound to eEF2 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：82-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.50 Å
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL11_PIG
Isoform —
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 J； PDB构建体 1–178； UniProt 1–178

Ribosomal protein eL13

物种未注明

UniProt A0A4X1TBV3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 L； UniProt 218–428 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 L 218–428（211 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A4X1TBV3_PIG
Isoform —
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 L； PDB构建体 1–211； UniProt 218–428

Ribosomal protein eL14

物种未注明

UniProt A1XQU3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 M； UniProt 1–213 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7O Structure of the mammalian 60S ribosomal subunit 提交 2014-08-01 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：45-meric
链 M 1–213（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.40 Å
3J7P Structure of the 80S mammalian ribosome bound to eEF2 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：82-meric
链 M 1–213（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.50 Å
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 M 1–213（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL14_PIG
Isoform —
PDB实体 15
链与序列区间 作者链 M； PDB构建体 1–213； UniProt 1–213

Ribosomal protein eL15

物种未注明

UniProt A0A286ZL65

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 N； UniProt 1–204 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A286ZL65_PIG
Isoform —
PDB实体 16
链与序列区间 作者链 N； PDB构建体 1–204； UniProt 1–204

Ribosomal protein uL13

物种未注明

UniProt A0A481CAM4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 O； UniProt 63–261 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A481CAM4_PIG
Isoform —
PDB实体 17
链与序列区间 作者链 O； PDB构建体 1–201； UniProt 63–261

Ribosomal protein uL22

物种未注明

UniProt A0A287B386

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 P； UniProt 2–154 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 P 2–154（153 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A287B386_PIG
Isoform —
PDB实体 18
链与序列区间 作者链 P； PDB构建体 1–153； UniProt 2–154

Ribosomal protein eL18

物种未注明

UniProt A0A4X1W0N5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 Q； UniProt 1–188 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Q 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A4X1W0N5_PIG
Isoform —
PDB实体 19
链与序列区间 作者链 Q； PDB构建体 1–188； UniProt 1–188

Ribosomal protein eL19

物种未注明

UniProt A0A480VXS3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 R； UniProt 42–236 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 R 42–236（195 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A480VXS3_PIG
Isoform —
PDB实体 20
链与序列区间 作者链 R； PDB构建体 2–196； UniProt 42–236

Ribosomal protein eL20

物种未注明

UniProt A0A287APR1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 S； UniProt 1–224 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 S 1–224（224 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 S 49–224（176 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 S 49–224（176 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 S3 49–224（176 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 S 49–224（176 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 S 49–224（176 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 S 49–224（176 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8RJD Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 2 提交 2023-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 S 49–224（176 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A287APR1_PIG
Isoform —
PDB实体 21
链与序列区间 作者链 S； PDB构建体 1–224； UniProt 1–224

Ribosomal protein eL21

物种未注明

UniProt P49666

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 T； UniProt 1–160 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL21_PIG
Isoform —
PDB实体 22
链与序列区间 作者链 T； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160

Ribosomal protein eL22

物种未注明

UniProt P67985

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 U； UniProt 1–128 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7O Structure of the mammalian 60S ribosomal subunit 提交 2014-08-01 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：45-meric
链 U 1–128（128 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.40 Å
3J7P Structure of the 80S mammalian ribosome bound to eEF2 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：82-meric
链 U 1–128（128 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.50 Å
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 U 1–128（128 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL22_PIG
Isoform —
PDB实体 23
链与序列区间 作者链 U； PDB构建体 1–128； UniProt 1–128

Ribosomal protein uL14

物种未注明

UniProt A0A480VZZ1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 V； UniProt 1–140 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A480VZZ1_PIG
Isoform —
PDB实体 24
链与序列区间 作者链 V； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140

Ribosomal protein eL24

物种未注明

UniProt A0A4X1SH42

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 W； UniProt 1–157 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A4X1SH42_PIG
Isoform —
PDB实体 25
链与序列区间 作者链 W； PDB构建体 1–157； UniProt 1–157

Ribosomal protein uL23

物种未注明

UniProt A0A480KZ98

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 X； UniProt 56–211 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 X 56–211（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A480KZ98_PIG
Isoform —
PDB实体 26
链与序列区间 作者链 X； PDB构建体 1–156； UniProt 56–211

Ribosomal protein uL24

物种未注明

UniProt A0A4X1V977

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 Y； UniProt 1–145 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A4X1V977_PIG
Isoform —
PDB实体 27
链与序列区间 作者链 Y； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145

Ribosomal protein eL27

物种未注明

UniProt A1XQU5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 Z； UniProt 1–136 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7O Structure of the mammalian 60S ribosomal subunit 提交 2014-08-01 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：45-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.40 Å
3J7P Structure of the 80S mammalian ribosome bound to eEF2 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：82-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.50 Å
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL27_PIG
Isoform —
PDB实体 28
链与序列区间 作者链 Z； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136

Ribosomal protein uL15

物种未注明

UniProt A0A4X1SN08

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 a； UniProt 116–263 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 a 116–263（148 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A4X1SN08_PIG
Isoform —
PDB实体 29
链与序列区间 作者链 a； PDB构建体 1–148； UniProt 116–263

Ribosomal protein eL29

物种未注明

UniProt Q95281

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 b； UniProt 1–160 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7O Structure of the mammalian 60S ribosomal subunit 提交 2014-08-01 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：45-meric
链 b 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.40 Å
3J7P Structure of the 80S mammalian ribosome bound to eEF2 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：82-meric
链 b 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.50 Å
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 b 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL29_PIG
Isoform —
PDB实体 30
链与序列区间 作者链 b； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160

Ribosomal protein eL30

物种未注明

UniProt A0A4X1TXJ8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 c； UniProt 1–115 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A4X1TXJ8_PIG
Isoform —
PDB实体 31
链与序列区间 作者链 c； PDB构建体 1–115； UniProt 1–115

Ribosomal protein eL31

物种未注明

UniProt P62901

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 d； UniProt 1–125 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7O Structure of the mammalian 60S ribosomal subunit 提交 2014-08-01 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：45-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.40 Å
3J7P Structure of the 80S mammalian ribosome bound to eEF2 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：82-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.50 Å
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL31_PIG
Isoform —
PDB实体 32
链与序列区间 作者链 d； PDB构建体 1–125； UniProt 1–125

Ribosomal protein eL32

物种未注明

UniProt Q6QAT0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 e； UniProt 1–135 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7O Structure of the mammalian 60S ribosomal subunit 提交 2014-08-01 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：45-meric
链 e 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.40 Å
3J7P Structure of the 80S mammalian ribosome bound to eEF2 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：82-meric
链 e 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.50 Å
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 e 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL32_PIG
Isoform —
PDB实体 33
链与序列区间 作者链 e； PDB构建体 1–135； UniProt 1–135

Ribosomal protein eL33

物种未注明

UniProt A0A480KUB2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 f； UniProt 25–134 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 f 25–134（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A480KUB2_PIG
Isoform —
PDB实体 34
链与序列区间 作者链 f； PDB构建体 1–110； UniProt 25–134

Ribosomal protein eL34

物种未注明

UniProt Q29223

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 g； UniProt 1–117 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 g 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL34_PIG
Isoform —
PDB实体 35
链与序列区间 作者链 g； PDB构建体 1–117； UniProt 1–117

Ribosomal protein uL29

物种未注明

UniProt Q29361

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 h； UniProt 1–123 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7O Structure of the mammalian 60S ribosomal subunit 提交 2014-08-01 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：45-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.40 Å
3J7P Structure of the 80S mammalian ribosome bound to eEF2 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：82-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.50 Å
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL35_PIG
Isoform —
PDB实体 36
链与序列区间 作者链 h； PDB构建体 1–123； UniProt 1–123

Ribosomal protein eL36

物种未注明

UniProt A0A480QBP0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 i； UniProt 103–207 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 i 103–207（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A480QBP0_PIG
Isoform —
PDB实体 37
链与序列区间 作者链 i； PDB构建体 1–105； UniProt 103–207

Ribosomal protein eL37

物种未注明

UniProt A0A480UVT3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 j； UniProt 2–87 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 j 2–87（86 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A480UVT3_PIG
Isoform —
PDB实体 38
链与序列区间 作者链 j； PDB构建体 1–86； UniProt 2–87

Ribosomal protein eL38

物种未注明

UniProt F2Z568

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 k； UniProt 1–70 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7O Structure of the mammalian 60S ribosomal subunit 提交 2014-08-01 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：45-meric
链 k 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.40 Å
3J7P Structure of the 80S mammalian ribosome bound to eEF2 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：82-meric
链 k 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.50 Å
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 k 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 F2Z568_PIG
Isoform —
PDB实体 39
链与序列区间 作者链 k； PDB构建体 1–70； UniProt 1–70

Ribosomal protein eL39

物种未注明

UniProt A0A4X1VIM4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 l； UniProt 1–51 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A4X1VIM4_PIG
Isoform —
PDB实体 40
链与序列区间 作者链 l； PDB构建体 1–51； UniProt 1–51

Ribosomal protein eL40

物种未注明

UniProt P63053

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 m； UniProt 1–128 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7O Structure of the mammalian 60S ribosomal subunit 提交 2014-08-01 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：45-meric
链 m 1–128（128 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.40 Å
3J7P Structure of the 80S mammalian ribosome bound to eEF2 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：82-meric
链 m 1–128（128 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.50 Å
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 m 1–128（128 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL40_PIG
Isoform —
PDB实体 41
链与序列区间 作者链 m； PDB构建体 1–128； UniProt 1–128

Ribosomal protein eL42

物种未注明

UniProt A0A480LCM6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 o； UniProt 37–142 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 o 37–142（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A480LCM6_PIG
Isoform —
PDB实体 43
链与序列区间 作者链 o； PDB构建体 1–106； UniProt 37–142

Ribosomal protein eL43

物种未注明

UniProt A0A480WPS5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 p； UniProt 20–110 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 p 20–110（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A480WPS5_PIG
Isoform —
PDB实体 44
链与序列区间 作者链 p； PDB构建体 1–91； UniProt 20–110

Ribosomal protein eL28

物种未注明

UniProt A0A480YX24

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 r； UniProt 32–156 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 r 32–156（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A480YX24_PIG
Isoform —
PDB实体 45
链与序列区间 作者链 r； PDB构建体 1–125； UniProt 32–156

Sec61 alpha subunit

物种未注明

UniProt A0A480EHF8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 1； UniProt 113–588 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 gamma subunit × 1 （A0A480WFL1） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A480EHF8_PIG
Isoform —
PDB实体 46
链与序列区间 作者链 1； PDB构建体 1–476； UniProt 113–588

Sec61 gamma subunit

物种未注明

UniProt A0A480WFL1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 45 RNA 3 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物数一致 链 2； UniProt 1–68 未记录 28S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 5.8S ribosomal RNA × 1 Ribosomal protein uL2 × 1 （A0A480Q387） Ribosomal protein uL3 × 1 （A0A480L253） Ribosomal protein uL4 × 1 （A0A287AE76） Ribosomal protein uL18 × 1 （A0A287ASD0） Ribosomal protein eL6 × 1 （Q2YGT9） Ribosomal protein uL30 × 1 （A0A480W0U3） Ribosomal protein eL8 × 1 （A0A4X1W808） Ribosomal protein uL6 × 1 （I3LP78） Ribosomal protein uL16 × 1 （Q29195） Ribosomal protein uL5 × 1 （Q29205） Ribosomal protein eL13 × 1 （A0A4X1TBV3） Ribosomal protein eL14 × 1 （A1XQU3） Ribosomal protein eL15 × 1 （A0A286ZL65） Ribosomal protein uL13 × 1 （A0A481CAM4） Ribosomal protein uL22 × 1 （A0A287B386） Ribosomal protein eL18 × 1 （A0A4X1W0N5） Ribosomal protein eL19 × 1 （A0A480VXS3） Ribosomal protein eL20 × 1 （A0A287APR1） Ribosomal protein eL21 × 1 （P49666） Ribosomal protein eL22 × 1 （P67985） Ribosomal protein uL14 × 1 （A0A480VZZ1） Ribosomal protein eL24 × 1 （A0A4X1SH42） Ribosomal protein uL23 × 1 （A0A480KZ98） Ribosomal protein uL24 × 1 （A0A4X1V977） Ribosomal protein eL27 × 1 （A1XQU5） Ribosomal protein uL15 × 1 （A0A4X1SN08） Ribosomal protein eL29 × 1 （Q95281） Ribosomal protein eL30 × 1 （A0A4X1TXJ8） Ribosomal protein eL31 × 1 （P62901） Ribosomal protein eL32 × 1 （Q6QAT0） Ribosomal protein eL33 × 1 （A0A480KUB2） Ribosomal protein eL34 × 1 （Q29223） Ribosomal protein uL29 × 1 （Q29361） Ribosomal protein eL36 × 1 （A0A480QBP0） Ribosomal protein eL37 × 1 （A0A480UVT3） Ribosomal protein eL38 × 1 （F2Z568） Ribosomal protein eL39 × 1 （A0A4X1VIM4） Ribosomal protein eL40 × 1 （P63053） Ribosomal protein eL41 × 1 Ribosomal protein eL42 × 1 （A0A480LCM6） Ribosomal protein eL43 × 1 （A0A480WPS5） Ribosomal protein eL28 × 1 （A0A480YX24） Sec61 alpha subunit × 1 （A0A480EHF8） Sec61 beta subunit × 1 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin cryo-EM玻璃化条件：120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3J7Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 2 1–68（68 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A480WFL1_PIG
Isoform —
PDB实体 47
链与序列区间 作者链 2； PDB构建体 1–68； UniProt 1–68

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 3j7q

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 3j7q
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3j7q
沉积日期 deposition_date2014-08-01
结构标题 titleStructure of the idle mammalian ribosome-Sec61 complex
关键词 keywordsmammalian, Sec61, translocation, translation, RIBOSOME; RIBOSOME
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier79.05 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron79.79 Å
零角强度 I(0) i0128120000000.00
分子量 molecular_weight2079700.0 kDa
排除体积 excluded_volume2201300 ų
包络体积 envelope_volume3531300 ų
水化壳体积 shell_volume332020 ų
包络直径 envelope_diameter287.2 Å
壳层 Rg shell_rg94.95 Å
包络 Rg envelope_rg80.35 Å
形状 Rg shape_rg79.82 Å
总 Rg total_rg79.78 Å
总原子数 total_atoms140540
残基数 n_residues10885
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax207.5 Å
Rg (实空间) rg_real76.69 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.30 Å
I(0) (实空间) i0_real1.2290e+11
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.0930e+09
Rg (倒空间) rg_reciprocal79.89 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal128400000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9154
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary93.4 Å
偏度 Skewness skewness0.161
峰度 Kurtosis kurtosis-0.518
角度范围 angular_range— – 0.1000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.5854
最高正则化参数 α highest_alpha12030000000.0000
实空间数据点数 n_real_points21
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.993; Stabil: 0.981; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.977; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (50)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)