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3J8X
High-resolution structure of no-nucleotide kinesin on microtubules
提交 2014-11-20
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配体/离子不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 A
1–451(451 aa)
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未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
25 mM PIPES, 25 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA;pH 6.8;25 mM PIPES, 25 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA
cryo-EM玻璃化条件
No glow discharge was applied. After sample application to grid, liquid was mostly 'wicked' away by edgewise application of filter paper. Subsequently, blotting and plunge freezing were performed with ~0.5 second delay after blotting but prior to plunging.;冷冻剂 ETHANE;No glow discharge was applied. After sample application to grid, liquid was mostly 'wicked' away by edgewise application of filter paper. Subsequently, blotting and plunge freezing were performed with ~0.5 second delay after blotting but prior to plunging into liquid ethane.
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分辨率 5.00 Å
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3JAK
Cryo-EM structure of GTPgammaS-microtubule co-polymerized with EB3 (merged dataset with and without kinesin bound)
提交 2015-06-16
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 14
PDB 声明:tetradecameric
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链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 6
GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 6
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
BRB80;pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
Blot once for 4 seconds before plunging.;90.4 K;冷冻剂 ETHANE;Blot once for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
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分辨率 3.30 Å
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3JAL
Cryo-EM structure of GMPCPP-microtubule co-polymerized with EB3
提交 2015-06-16
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 14
PDB 声明:tetradecameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 6
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 6
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
BRB80;pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
Blot once for 4 seconds before plunging;90.4 K;冷冻剂 ETHANE;Blot once for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
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分辨率 3.50 Å
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3JAR
Cryo-EM structure of GDP-microtubule co-polymerized with EB3
提交 2015-06-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 14
PDB 声明:tetradecameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 6
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
BRB80;pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
Blot once for 4 seconds before plunging/;90.4 K;冷冻剂 ETHANE;Blot once for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 3.40 Å
|
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3JAS
Cryo-EM structure of dynamic GDP-microtubule (14 protofilaments) decorated with kinesin
提交 2015-06-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 6
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
BRB80;pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
Blot once for 4 seconds before plunging.;90.4 K;冷冻剂 ETHANE;Blot once for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 3.50 Å
|
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3JAT
Cryo-EM structure of GMPCPP-microtubule (14 protofilaments) decorated with kinesin
提交 2015-06-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 12
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
BRB80;pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
Blot once for 4 seconds before plunging.;90.4 K;冷冻剂 ETHANE;Blot once for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 3.50 Å
|
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3JAW
Atomic model of a microtubule seam based on a cryo-EM reconstruction of the EB3-bound microtubule (merged dataset containing tubulin bound to GTPgammaS, GMPCPP, and GDP)
提交 2015-06-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
BRB80;pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
Blot once for 4 seconds before plunging.;90.4 K;冷冻剂 ETHANE;Blot once for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 3.90 Å
|
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4ZHQ
Crystal structure of Tubulin-Stathmin-TTL-MMAE Complex
提交 2015-04-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 3
GOL GLYCEROL × 8
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
4Q5 N-methyl-L-valyl-N-[(3R,4S,5S)-1-{(2S)-2-[(1R,2R)-3-{[(1S,2R)-1-hydroxy-1-phenylpropan-2-yl]amino}-1-methoxy-2-methyl-3-oxopropyl]pyrrolidin-1-yl}-3-methoxy-5-methyl-1-oxoheptan-4-yl]-N-methyl-L-valinamide × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.7;293 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.55 Å
R-free 0.245
|
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4ZI7
CRYSTAL STRUCTURE OF TUBULIN-STATHMIN-TTL-HTI286 COMPLEX
提交 2015-04-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 4
GOL GLYCEROL × 8
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
4SL N,beta,beta-trimethyl-L-phenylalanyl-N-[(3S,4Z)-5-carboxy-2-methylhex-4-en-3-yl]-N,3-dimethyl-L-valinamide × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;PEG, glycerol, MES, CaCl2, MgCl2
|
分辨率 2.51 Å
R-free 0.239
|
|
4ZOL
Crystal Structure of Tubulin-Stathmin-TTL-Tubulysin M Complex
提交 2015-05-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 2
GOL GLYCEROL × 7
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
55Q (2R,4R)-4-{[(2-{(1R,3R)-1-(acetyloxy)-4-methyl-3-[methyl(N-{[(2S)-1-methylpiperidin-2-yl]carbonyl}-D-isoleucyl)amino]pentyl}-1,3-thiazol-4-yl)carbonyl]amino}-2-methyl-5-phenylpentanoic acid × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.7;293 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.232
|
|
5CA0
Crystal structure of T2R-TTL-Lexibulin complex
提交 2015-06-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
CA CALCIUM ION × 2
GOL GLYCEROL × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
LXL 1-ethyl-3-[2-methoxy-4-(5-methyl-4-{[(1S)-1-(pyridin-3-yl)butyl]amino}pyrimidin-2-yl)phenyl]urea × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;6% polyethylene glycol 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.237
|
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5EZY
Crystal structure of T2R-TTL-taccalonolide AJ complex
提交 2015-11-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
TAJ taccalonolide AJ × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;6% polyethylene glycol 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.208
|
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5FNV
a new complex structure of tubulin with an alpha-beta unsaturated lactone
提交 2015-11-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
X3H PIRONETIN × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.7;0.1M MES PH6.7;6% PEG4000 ;5% GLYCEROL;30MM CACL2;30MM MGCL2
|
分辨率 2.61 Å
R-free 0.226
|
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5H74
Crystal structure of T2R-TTL-14b complex
提交 2016-11-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
片段:UNP residues 1-450
链 C
1–450(450 aa)
片段:UNP residues 1-450
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3
7LG (2~{S},4~{R})-4-[[2-[(1~{R},3~{R})-1-acetyloxy-3-[hexyl-[(2~{S},3~{S})-3-methyl-2-[[(2~{R})-1-methylpiperidin-2-yl]carbonylamino]pentanoyl]amino]-4-methyl-pentyl]-1,3-thiazol-4-yl]carbonylamino]-5-(4-fluorophenyl)-2-methyl-pentanoic acid × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.248
|
|
5H7O
Crystal structure of DJ-101 in complex with tubulin protein
提交 2016-11-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 2
GOL GLYCEROL × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
7Q7 2-(1H-indol-4-yl)-4-(3,4,5-trimethoxyphenyl)-1H-imidazo[4,5-c]pyridine × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol,
0.1 M Mes, 30 mM CaCl2 and 30 mM MgCl2 (pH 6.7)
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.256
|
|
5JCB
Microtubule depolymerizing agent podophyllotoxin derivative YJTSF1
提交 2016-04-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 7
GOL GLYCEROL × 8
IMD IMIDAZOLE × 2
CA CALCIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
NA SODIUM ION × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
NV4 (5R,5aR,8aS,9R)-9-[(4H-1,2,4-triazol-3-yl)sulfanyl]-5-(3,4,5-trimethoxyphenyl)-5,8,8a,9-tetrahydro-2H-furo[3',4':6,7]naphtho[2,3-d][1,3]dioxol-6(5aH)-one × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;PEG 4000, Glycerol, Magnesium chloride, Calcium chloride
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.200
|
|
5JQG
An apo tubulin-RB-TTL complex structure used for side-by-side comparison
提交 2016-05-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 3
CL CHLORIDE ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.7;293 K;0.1M MES, 6% PEG4000, 5% Glycerol, 30mM CaCl2, 30mM MgCl2
|
分辨率 2.24 Å
R-free 0.212
|
|
5KMG
Near-atomic cryo-EM structure of PRC1 bound to the microtubule
提交 2016-06-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 42
PDB 声明:42-meric
|
链 A
1–441(441 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14
MG MAGNESIUM ION × 14
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14
POU Peloruside A × 14
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot for 4 seconds, blot force 10
|
分辨率 3.50 Å
|
|
5KMG
Near-atomic cryo-EM structure of PRC1 bound to the microtubule
提交 2016-06-27
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–441(441 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
POU Peloruside A × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot for 4 seconds, blot force 10
|
分辨率 3.50 Å
|
|
5KMG
Near-atomic cryo-EM structure of PRC1 bound to the microtubule
提交 2016-06-27
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–441(441 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
POU Peloruside A × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot for 4 seconds, blot force 10
|
分辨率 3.50 Å
|
|
5XIW
Crystal structure of T2R-TTL-Colchicine complex
提交 2017-04-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 2
GOL GLYCEROL × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
LOC N-[(7S)-1,2,3,10-tetramethoxy-9-oxo-6,7-dihydro-5H-benzo[d]heptalen-7-yl]ethanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;6% polyethylene glycol 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.253
|
|
5XKE
Crystal structure of T2R-TTL-Demecolcine complex
提交 2017-05-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 2
GOL GLYCEROL × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
LON (7S)-1,2,3,10-tetramethoxy-7-(methylamino)-6,7-dihydro-5H-benzo[a]heptalen-9-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;6% polyethylene glycol 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.264
|
|
5XKF
Crystal structure of T2R-TTL-MPC6827 complex
提交 2017-05-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 2
GOL GLYCEROL × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
88U N-(4-methoxyphenyl)-N,2-dimethyl-quinazolin-4-amine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;6% polyethylene glycol 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.259
|
|
5XKG
Crystal structure of T2R-TTL-CH1 complex
提交 2017-05-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 2
GOL GLYCEROL × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
890 4-[(3-azanyl-4-methoxy-phenyl)-methyl-amino]chromen-2-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;6% polyethylene glycol 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.240
|
|
5XKH
Crystal structure of T2R-TTL-CF1 complex
提交 2017-05-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 2
GOL GLYCEROL × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
89C 4-[(4-methoxy-3-oxidanyl-phenyl)-methyl-amino]chromen-2-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;6% polyethylene glycol 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.25 Å
R-free 0.240
|
|
5XP3
Crystal structure of apo T2R-TTL
提交 2017-05-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 2
GOL GLYCEROL × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;6% polyethylene glycol 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.240
|
|
5YL2
Crystal structure of T2R-TTL-Y28 complex
提交 2017-10-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 2
GOL GLYCEROL × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
8WU (E)-1-(5-methoxy-2,2-dimethyl-chromen-8-yl)-3-(4-methoxy-3-oxidanyl-phenyl)prop-2-en-1-one × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;6% polyethylene glycol 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.09 Å
R-free 0.254
|
|
5YLJ
Crystal structure of T2R-TTL-Millepachine complex
提交 2017-10-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 2
GOL GLYCEROL × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
8X0 (E)-1-(5-methoxy-2,2-dimethyl-chromen-8-yl)-3-(4-methoxyphenyl)prop-2-en-1-one × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;6% polyethylene glycol 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.255
|
|
5YLS
Crystal structure of T2R-TTL-Y50 complex
提交 2017-10-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 2
GOL GLYCEROL × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
Y50 E-3-(3-azanyl-4-methoxy-phenyl)-1-(5-methoxy-2,2-dimethyl-chromen-8-yl)prop-2-en-1-one × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;6% polyethylene glycol 4000, 8% glycerol, 0.1M MES, 30mM CaCl2, 30mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 3.00 Å
R-free 0.253
|
|
5Z4U
Crystal Structure of T2R-TTL complex with 7a3
提交 2018-01-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
96C 4-(4-ethoxyphenyl)-1-methyl-3-(3,4,5-trimethoxyphenyl)-1H-pyrazole × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;293 K;6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M Mes, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2 (pH 6.7)
|
分辨率 3.18 Å
R-free 0.235
|
|
5ZXH
The structure of MT189-tubulin complex
提交 2018-05-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
9LX 2-(6-fluoro-3-{[(4-methoxyphenyl)methyl]amino}imidazo[1,2-a]pyridin-2-yl)phenol × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;293 K;6% POLY(ETHYLENE GLYCOL) 4000, 8% GLYCEROL, 0.1 M MES, 30 MM CACL2, 30 MM MGCL2 (pH 6.7)
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.259
|
|
6AGK
The structure of CH-II-77-tubulin complex
提交 2018-08-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 3
CA CALCIUM ION × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
9WR [6-(3-hydroxy-4-methylphenyl)pyridin-2-yl](3,4,5-trimethoxyphenyl)methanone × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;6% POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 8% GLYCEROL, 0.1M MES, 30MM CACL2, 30MM MGCL2, PH 6.7,
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.264
|
|
6B0C
KLP10A-AMPPNP in complex with curved tubulin and a microtubule
提交 2017-09-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 175
PDB 声明:175-meric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 70
MG MAGNESIUM ION × 105
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 70
TA1 TAXOL × 35
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 35
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.51 Å
|
|
6B0C
KLP10A-AMPPNP in complex with curved tubulin and a microtubule
提交 2017-09-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
TA1 TAXOL × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.51 Å
|
|
6B0C
KLP10A-AMPPNP in complex with curved tubulin and a microtubule
提交 2017-09-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
TA1 TAXOL × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.51 Å
|
|
6B0I
Apo KLP10A in complex with a microtubule
提交 2017-09-14
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 105
PDB 声明:105-meric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 35
MG MAGNESIUM ION × 35
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 35
TA1 TAXOL × 35
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;with 20.10^(-3) unit of potato apyrase (Sigma-Aldrich, MO)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.78 Å
|
|
6B0I
Apo KLP10A in complex with a microtubule
提交 2017-09-14
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;with 20.10^(-3) unit of potato apyrase (Sigma-Aldrich, MO)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.78 Å
|
|
6B0I
Apo KLP10A in complex with a microtubule
提交 2017-09-14
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;with 20.10^(-3) unit of potato apyrase (Sigma-Aldrich, MO)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.78 Å
|
|
6B0L
KLP10A-AMPPNP in complex with a microtubule
提交 2017-09-14
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 105
PDB 声明:105-meric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 35
MG MAGNESIUM ION × 70
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 35
TA1 TAXOL × 35
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 35
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.98 Å
|
|
6B0L
KLP10A-AMPPNP in complex with a microtubule
提交 2017-09-14
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.98 Å
|
|
6B0L
KLP10A-AMPPNP in complex with a microtubule
提交 2017-09-14
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.98 Å
|
|
6BJC
TPX2_mini decorated GMPCPP-microtubule
提交 2017-11-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 14
PDB 声明:tetradecameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 12
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB80
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot for 4 seconds before plunging
|
分辨率 3.30 Å
|
|
6BR1
Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with heterocyclic pyrimidine compound 4a
提交 2017-11-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
CA CALCIUM ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
E3Y 2-chloro-4-(6-methoxy-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)pyrido[2,3-d]pyrimidine × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.235
|
|
6BRF
Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with heterocyclic pyrimidine compound 4b
提交 2017-11-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
CA CALCIUM ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
E44 2-chloro-4-(6-methoxy-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)pyrido[3,2-d]pyrimidine × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.237
|
|
6BRY
Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with heterocyclic pyrimidine compound 6a
提交 2017-12-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3
GK9 1-(2-chlorofuro[3,2-d]pyrimidin-4-yl)-6-methoxy-1,2,3,4-tetrahydroquinoline × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.236
|
|
6BS2
Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with heterocyclic pyrimidine compound 8b
提交 2017-12-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
CA CALCIUM ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3
E9Y 1-(3,6-dimethyl[1,2]oxazolo[5,4-d]pyrimidin-4-yl)-6-methoxy-1,2,3,4-tetrahydroquinoline × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.65 Å
R-free 0.234
|
|
6CVJ
Model of synthetic tau (four tandem repeats of first repeat sequence) bound to the microtubule
提交 2018-03-28
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 120
PDB 声明:120-meric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 30
MG MAGNESIUM ION × 30
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 60
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot force 10 pN, 6 second blot time. used C-flat 1.2/1.3 holey grids. First 2 uL of microtubules were adhered to grid for 30 seconds, followed by 2 4 uL washes of tau with 30 second incubation for each wash
|
分辨率 3.20 Å
|
|
6CVJ
Model of synthetic tau (four tandem repeats of first repeat sequence) bound to the microtubule
提交 2018-03-28
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot force 10 pN, 6 second blot time. used C-flat 1.2/1.3 holey grids. First 2 uL of microtubules were adhered to grid for 30 seconds, followed by 2 4 uL washes of tau with 30 second incubation for each wash
|
分辨率 3.20 Å
|
|
6CVJ
Model of synthetic tau (four tandem repeats of first repeat sequence) bound to the microtubule
提交 2018-03-28
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot force 10 pN, 6 second blot time. used C-flat 1.2/1.3 holey grids. First 2 uL of microtubules were adhered to grid for 30 seconds, followed by 2 4 uL washes of tau with 30 second incubation for each wash
|
分辨率 3.20 Å
|
|
6CVN
Model of synthetic tau (R2x4) bound to the microtubule
提交 2018-03-28
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 120
PDB 声明:120-meric
|
链 B
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 60
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 30
MG MAGNESIUM ION × 30
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot force 10 pN, 6 second blot time. used C-flat 1.2/1.3 holey grids. First 2 uL of microtubules were adhered to grid for 30 seconds, followed by 2 4 uL washes of tau with 30 second incubation for each wash.
|
分辨率 3.90 Å
|
|
6CVN
Model of synthetic tau (R2x4) bound to the microtubule
提交 2018-03-28
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot force 10 pN, 6 second blot time. used C-flat 1.2/1.3 holey grids. First 2 uL of microtubules were adhered to grid for 30 seconds, followed by 2 4 uL washes of tau with 30 second incubation for each wash.
|
分辨率 3.90 Å
|
|
6CVN
Model of synthetic tau (R2x4) bound to the microtubule
提交 2018-03-28
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot force 10 pN, 6 second blot time. used C-flat 1.2/1.3 holey grids. First 2 uL of microtubules were adhered to grid for 30 seconds, followed by 2 4 uL washes of tau with 30 second incubation for each wash.
|
分辨率 3.90 Å
|
|
6D88
Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with compound 13f
提交 2018-04-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
CA CALCIUM ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
G9K [2-(1H-indol-3-yl)-1H-imidazol-4-yl](8-methoxy-1,4-benzodioxin-6-yl)methanone × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.85 Å
R-free 0.246
|
|
6DPU
Undecorated GMPCPP microtubule
提交 2018-06-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 12
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB80 buffer (80 mM PIPES, pH 6.8, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2) supplemented with 1 mM GMPCPP, 1 mM DTT, and 0.05% Nonident P-40
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds before plunging.
|
分辨率 3.10 Å
|
|
6DPV
Undecorated GDP microtubule
提交 2018-06-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 6
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB80 buffer (80 mM PIPES pH 6.8, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2) supplemented with 1 mM GTP, 1 mM DTT, and 0.05% Nonident P-40
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds before plunging.
|
分辨率 3.30 Å
|
|
6DPW
Undecorated GTPgammaS microtubule
提交 2018-06-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 6
GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;Modified BRB80 buffer (80 mM PIPES, pH 6.8, 1 mM EGTA, 0.2 mM MgCl2) supplemented with 1 mM GTPgammaS, 1 mM DTT, and 0.05% Nonident P-40
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds before plunging.
|
分辨率 3.50 Å
|
|
6EG5
The structure of SB-1-202-tubulin complex
提交 2018-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 6
CA CALCIUM ION × 4
CL CHLORIDE ION × 1
GOL GLYCEROL × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
J7S 4-(2-chloropyrido[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-7-methoxy-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;6% POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 8% GLYCEROL, 0.1 M MES, 30 MM CACL2, 30 MM MGCL2, PH 6.7
|
分辨率 2.45 Å
R-free 0.236
|
|
6EVW
Cryo-EM structure of GMPCPP-microtubule co-polymerised with doublecortin
提交 2017-11-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 A
1–438(438 aa)
链 C
1–438(438 aa)
链 E
1–438(438 aa)
链 J
1–438(438 aa)
链 K
1–438(438 aa)
链 L
1–438(438 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 12
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å
|
|
6EVX
Cryo-EM structure of GDP.Pi-microtubule rapidly co-polymerised with doublecortin
提交 2017-11-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 6
PO4 PHOSPHATE ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å
|
|
6EVY
Cryo-EM structure of GTPgammaS-microtubule co-polymerised with doublecortin
提交 2017-11-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 6
GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å
|
|
6EVZ
Cryo-EM structure of GDP-microtubule co-polymerised with doublecortin
提交 2017-11-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
6EW0
Cryo-EM structure of GDP-microtubule co-polymerised with doublecortin and supplemented with Taxol
提交 2017-11-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 6
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
TA1 TAXOL × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
6JCJ
Structure of crolibulin in complex with tubulin
提交 2019-01-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 3
CA CALCIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
BG0 (4R)-2,7,8-triamino-4-(3-bromo-4,5-dimethoxyphenyl)-4H-1-benzopyran-3-carbonitrile × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;6% POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 8% GLYCEROL, 0.1 M MES, 30 MM CACL2, 30 MM MGCL2, PH 6.7
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.282
|
|
6KPP
BNC105 in complex with tubulin
提交 2019-08-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 2
DO6 (6-methoxy-2-methyl-7-oxidanyl-1-benzofuran-3-yl)-(3,4,5-trimethoxyphenyl)methanone × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;277 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.75 Å
R-free 0.235
|
|
6LS4
A novel anti-tumor agent S-40 in complex with tubulin
提交 2020-01-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 6
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
GOL GLYCEROL × 1
S40 3-[(4-cyclopropylphenyl)sulfonylamino]-4-methyl-N-(pyridin-3-ylmethyl)benzamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;6% PEG 4000, 6% GLYCEROL, 30mM MAGNESIUM CHLORIDE, 30mM CALCIUM CHLORIDE, 3.3% Jeffamin M-600, 100mM MES
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.240
|
|
6LSM
Tubulin Polymerization Inhibitors
提交 2020-01-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 6
CA CALCIUM ION × 4
CL CHLORIDE ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
ERX 2-(4-methylphenyl)-7-(3,4,5-trimethoxyphenyl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidine × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;277 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.75 Å
R-free 0.227
|
|
6LSN
Crystal structure of tubulin-inhibitor complex
提交 2020-01-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 6
CA CALCIUM ION × 4
CL CHLORIDE ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
ERR 2-(1-methylindol-5-yl)-7-(3,4,5-trimethoxyphenyl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidine × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;277 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.44 Å
R-free 0.220
|
|
6N47
The structure of SB-2-204-tubulin complex
提交 2018-11-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
CA CALCIUM ION × 4
CL CHLORIDE ION × 1
MG MAGNESIUM ION × 4
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
KB4 4-(2-chloropyrido[3,2-d]pyrimidin-4-yl)-7-methoxy-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;6% POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 8% GLYCEROL, 0.1 M MES, 30 MM CACL2, 30 MM MGCL2, PH 6.7
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.246
|
|
6NNG
Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with compound DJ95
提交 2019-01-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
DJ9 2-(1H-indol-6-yl)-4-(3,4,5-trimethoxyphenyl)-1H-imidazo[4,5-c]pyridine × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.227
|
|
6O2Q
Acetylated Microtubules
提交 2019-02-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 6
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;Contains 80 mM PIPES, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, pH 6.8 with KOH (stored at 4 degrees Celsius).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 4 seconds at blot force 10.
|
分辨率 3.70 Å
|
|
6O2R
Deacetylated Microtubules
提交 2019-02-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 6
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;Contains 80 mM PIPES, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, pH 6.8 with KOH (stored at 4 degrees Celsius).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 4 seconds at blot force 10.
|
分辨率 3.30 Å
|
|
6O2S
Deacetylated Microtubules
提交 2019-02-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 104
PDB 声明:104-meric
|
链 1A
1–451(451 aa)
链 1B
1–451(451 aa)
链 1C
1–451(451 aa)
链 1D
1–451(451 aa)
链 1E
1–451(451 aa)
链 1F
1–451(451 aa)
链 1G
1–451(451 aa)
链 1I
1–451(451 aa)
链 1J
1–451(451 aa)
链 1K
1–451(451 aa)
链 1L
1–451(451 aa)
链 1M
1–451(451 aa)
链 1N
1–451(451 aa)
链 2A
1–451(451 aa)
链 2B
1–451(451 aa)
链 2C
1–451(451 aa)
链 2D
1–451(451 aa)
链 2E
1–451(451 aa)
链 2F
1–451(451 aa)
链 2G
1–451(451 aa)
链 2I
1–451(451 aa)
链 2J
1–451(451 aa)
链 2K
1–451(451 aa)
链 2L
1–451(451 aa)
链 2M
1–451(451 aa)
链 2N
1–451(451 aa)
链 3A
1–451(451 aa)
链 3B
1–451(451 aa)
链 3C
1–451(451 aa)
链 3D
1–451(451 aa)
链 3E
1–451(451 aa)
链 3F
1–451(451 aa)
链 3G
1–451(451 aa)
链 3I
1–451(451 aa)
链 3J
1–451(451 aa)
链 3K
1–451(451 aa)
链 3L
1–451(451 aa)
链 3M
1–451(451 aa)
链 3N
1–451(451 aa)
链 4A
1–451(451 aa)
链 4B
1–451(451 aa)
链 4C
1–451(451 aa)
链 4D
1–451(451 aa)
链 4E
1–451(451 aa)
链 4F
1–451(451 aa)
链 4G
1–451(451 aa)
链 4I
1–451(451 aa)
链 4J
1–451(451 aa)
链 4K
1–451(451 aa)
链 4L
1–451(451 aa)
链 4M
1–451(451 aa)
链 4N
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 52
MG MAGNESIUM ION × 52
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 52
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;Contains 80 mM PIPES, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, pH 6.8 with KOH (stored at 4 degrees Celsius).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 4 seconds at blot force 10.
|
分辨率 4.00 Å
|
|
6O2T
Acetylated Microtubules
提交 2019-02-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 104
PDB 声明:104-meric
|
链 1A
1–451(451 aa)
链 1B
1–451(451 aa)
链 1C
1–451(451 aa)
链 1D
1–451(451 aa)
链 1E
1–451(451 aa)
链 1F
1–451(451 aa)
链 1G
1–451(451 aa)
链 1I
1–451(451 aa)
链 1J
1–451(451 aa)
链 1K
1–451(451 aa)
链 1L
1–451(451 aa)
链 1M
1–451(451 aa)
链 1N
1–451(451 aa)
链 2A
1–451(451 aa)
链 2B
1–451(451 aa)
链 2C
1–451(451 aa)
链 2D
1–451(451 aa)
链 2E
1–451(451 aa)
链 2F
1–451(451 aa)
链 2G
1–451(451 aa)
链 2I
1–451(451 aa)
链 2J
1–451(451 aa)
链 2K
1–451(451 aa)
链 2L
1–451(451 aa)
链 2M
1–451(451 aa)
链 2N
1–451(451 aa)
链 3A
1–451(451 aa)
链 3B
1–451(451 aa)
链 3C
1–451(451 aa)
链 3D
1–451(451 aa)
链 3E
1–451(451 aa)
链 3F
1–451(451 aa)
链 3G
1–451(451 aa)
链 3I
1–451(451 aa)
链 3J
1–451(451 aa)
链 3K
1–451(451 aa)
链 3L
1–451(451 aa)
链 3M
1–451(451 aa)
链 3N
1–451(451 aa)
链 4A
1–451(451 aa)
链 4B
1–451(451 aa)
链 4C
1–451(451 aa)
链 4D
1–451(451 aa)
链 4E
1–451(451 aa)
链 4F
1–451(451 aa)
链 4G
1–451(451 aa)
链 4I
1–451(451 aa)
链 4J
1–451(451 aa)
链 4K
1–451(451 aa)
链 4L
1–451(451 aa)
链 4M
1–451(451 aa)
链 4N
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 52
MG MAGNESIUM ION × 52
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 52
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;Contains 80 mM PIPES, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, pH 6.8 with KOH (stored at 4 degrees Celsius).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 4 seconds at blot force 10.
|
分辨率 4.10 Å
|
|
6O5M
Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with compound 10bb
提交 2019-03-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
CA CALCIUM ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
GOL GLYCEROL × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
G8K [2-(1H-indol-4-yl)-1H-imidazol-4-yl](3,4,5-trimethoxyphenyl)methanone × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.223
|
|
6O5N
Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with compound 10ab
提交 2019-03-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
CA CALCIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
QW9 [2-(4-methyl-1H-indol-3-yl)-1H-imidazol-5-yl](3,4,5-trimethoxyphenyl)methanone × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 3.00 Å
R-free 0.245
|
|
6O61
Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with compound ABI-231
提交 2019-03-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
CA CALCIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
KUM [2-(1H-indol-3-yl)-1H-imidazol-5-yl](3,4,5-trimethoxyphenyl)methanone × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.243
|
|
6PC4
Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with compound ABI-274
提交 2019-06-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
CA CALCIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
O91 [2-(4-methylphenyl)-1H-imidazol-4-yl](3,4,5-trimethoxyphenyl)methanone × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.234
|
|
6RZA
Cryo-EM structure of the human inner arm dynein DNAH7 microtubule binding domain bound to microtubules
提交 2019-06-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 A
1–437(437 aa)
链 C
1–437(437 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
TA1 TAXOL × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å
|
|
6RZB
Cryo-EM structure of mouse cytoplasmic dynein-1 microtubule binding domain bound to microtubules
提交 2019-06-13
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–437(437 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å
|
|
6TA3
Human kinesin-5 motor domain in the GSK-1 state bound to microtubules (Conformation 1)
提交 2019-10-29
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–438(438 aa)
|
未记录
|
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
MZK 6-[4-(trifluoromethyl)phenyl]-3,4-dihydro-1~{H}-quinolin-2-one × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
6TA4
Human kinesin-5 motor domain in the AMPPNP state bound to microtubules
提交 2019-10-29
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–438(438 aa)
|
未记录
|
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 3
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.10 Å
|
|
6TIW
Human kinesin-5 motor domain in the GSK state bound to microtubules (Conformation 2)
提交 2019-11-22
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–438(438 aa)
|
未记录
|
MZK 6-[4-(trifluoromethyl)phenyl]-3,4-dihydro-1~{H}-quinolin-2-one × 1
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
6WWE
Apo KIF14[391-772] in complex with a microtubule
提交 2020-05-09
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å
|
|
6WWF
KIF14[391-772] - ADP in complex with a microtubule
提交 2020-05-09
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
6WWG
KIF14[391-772] dimer two-heads-bound state - ADP-AlFx in complex with a microtubule
提交 2020-05-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
|
未记录
|
AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
TA1 TAXOL × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
6WWH
KIF14[391-772] dimer two-heads-bound state - AMP-PNP in complex with a microtubule
提交 2020-05-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 4
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
TA1 TAXOL × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
6WWI
Apo KIF14[391-755] in complex with a microtubule
提交 2020-05-09
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
|
|
6WWJ
KIF14[391-755] - ADP in complex with a microtubule
提交 2020-05-09
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å
|
|
6WWK
KIF14[391-755] dimer two-heads-bound state - ADP-AlFx in complex with a microtubule
提交 2020-05-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
TA1 TAXOL × 2
AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
6WWL
KIF14[391-755] dimer two-heads-bound state - AMP-PNP in complex with a microtubule
提交 2020-05-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
TA1 TAXOL × 2
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
6WWM
KIF14[391-748] - ADP in complex with a microtubule
提交 2020-05-09
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å
|
|
6WWN
KIF14[391-748] - ADP-AlFx in complex with a microtubule
提交 2020-05-09
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å
|
|
6WWO
KIF14[391-748] - AMP-PNP in complex with a microtubule
提交 2020-05-09
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å
|
|
6WWP
Apo KIF14[391-743] in complex with a microtubule
提交 2020-05-09
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
6WWQ
KIF14[391-743] - ADP in complex with a microtubule
提交 2020-05-09
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
6WWR
Kif14[391-743] - ADP-AlFx open state class in complex with a microtubule
提交 2020-05-09
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å
|
|
6WWS
Kif14[391-743] - AMP-PNP open state class in complex with a microtubule
提交 2020-05-09
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å
|
|
6WWT
Apo KIF14[391-735] in complex with a microtubule
提交 2020-05-09
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
6WWU
KIF14[391-735] - ADP-AlFx in complex with a microtubule
提交 2020-05-09
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å
|
|
6WWV
KIF14[391-735] - ANP-PNP in complex with a microtubule
提交 2020-05-09
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
6X1C
Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with compound 5j
提交 2020-05-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
CA CALCIUM ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 5
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
Y5J 4-(2-chlorofuro[3,2-d]pyrimidin-4-yl)-7-methoxy-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;6% PEG 4000, 5% glycerol, 0.1M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.216
|
|
6X1E
Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with compound 5l
提交 2020-05-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
CA CALCIUM ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 5
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
Y5L 4-(2-chloro-6,7-dihydro-5H-cyclopenta[d]pyrimidin-4-yl)-7-methoxy-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;6% PEG 4000, 5% glycerol, 0.1M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.224
|
|
6X1F
Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with compound 5m
提交 2020-05-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
CA CALCIUM ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
Y5M 7-methoxy-4-(2-methyl-6,7-dihydro-5H-cyclopenta[d]pyrimidin-4-yl)-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;6% PEG 4000, 5% glycerol, 0.1M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.241
|
|
6XER
Tubulin-RB3_SLD in complex with colchicine
提交 2020-06-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 A
1–438(438 aa)
链 C
1–438(438 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 2
SO4 SULFATE ION × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
LOC N-[(7S)-1,2,3,10-tetramethoxy-9-oxo-6,7-dihydro-5H-benzo[d]heptalen-7-yl]ethanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.6;293 K;PEG 4000, ammonium sulfate, tri-sodium citrate
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.223
|
|
6XES
Tubulin-RB3_SLD in complex with compound 40a
提交 2020-06-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 A
1–438(438 aa)
链 C
1–438(438 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
SO4 SULFATE ION × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TU3 [6-(3-hydroxy-4-methylphenyl)pyrazin-2-yl](3,4,5-trimethoxyphenyl)methanone × 2
MG MAGNESIUM ION × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;PEG 4000, ammonium sulfate, tri-sodium citrate
|
分辨率 2.32 Å
R-free 0.226
|
|
6XET
Tubulin-RB3_SLD in complex with compound 60c
提交 2020-06-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 A
1–438(438 aa)
链 C
1–438(438 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
SO4 SULFATE ION × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TU2 [3-fluoro-6-(3-hydroxy-4-methylphenyl)pyridin-2-yl](3,4,5-trimethoxyphenyl)methanone × 2
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;PEG 4000, ammonium sulfate, tri-sodium citrate
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.231
|
|
6Y4M
Structure of Tubulin Tyrosine Ligase in Complex with Tb111
提交 2020-02-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
O9B (2~{R})-1-methylpiperidine-2-carboxylic acid × 1
O9H [(1~{R},3~{R})-1-acetyloxy-1-[4-methanoyl-5-(2-phenylmethoxyethyl)-2,3-dihydro-1,3-thiazol-2-yl]-4-methyl-pentan-3-yl]-methyl-azanium × 1
OH5 (2~{S},4~{R})-4-azanyl-2-methyl-5-phenyl-pentanoic acid × 1
PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1
VAL VALINE × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.03 M calcium chloride, 0.03 M magnesium chloride, 0.10 M MES pH 6.50, 3.20% w/v
PEG 4000, 5.00% w/v glycerol
|
分辨率 3.34 Å
R-free 0.234
|
|
6Y4N
Structure of Tubulin Tyrosine Ligase in Complex with Tb116
提交 2020-02-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 5
CA CALCIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
O9B (2~{R})-1-methylpiperidine-2-carboxylic acid × 1
O9K [(1~{R},3~{R})-1-(4-methanoyl-1,3-thiazol-2-yl)-4-methyl-3-(methylamino)pentyl] ethanoate × 1
O9N methyl (2~{S},4~{S})-2,4-bis(azanyl)-5-phenyl-pentanoate × 1
PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1
VAL VALINE × 1
P6S benzyl hydrogen carbonate × 1
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;30 mM calcium chloride, 30 mM magnesium chloride, 0.10 M MES pH 6.0, 2.0% w/v PEG 4000, 5.0% w/v glycerol
|
分辨率 2.85 Å
R-free 0.220
|
|
6ZPI
Microtubule complexed with Kif15 motor domain. Symmetrised asymmetric unit
提交 2020-07-08
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–437(437 aa)
|
未记录
|
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å
|
|
7CBZ
Crystal structure of T2R-TTL-A31 complex
提交 2020-06-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 5
CA CALCIUM ION × 6
FUO 2-[5-[4-[2-[4-(2-cyclopropylethanoyl)piperazin-1-yl]ethoxy]phenyl]pyridin-2-yl]-N-(phenylmethyl)ethanamide × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;6% PEG4000, 8% glycerol, 0.1 M
MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2, and 30 mM MgCl2.
|
分辨率 2.61 Å
R-free 0.255
|
|
7CDA
Crystal structure of T2R-TTL-PAC complex
提交 2020-06-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 2
GOL GLYCEROL × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
AEU N-[(3-phenoxyphenyl)methyl]-9H-beta-carbolin-3-amine × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2 and 30 mM MgCl2.
|
分辨率 2.66 Å
R-free 0.257
|
|
7CE6
Crystal structure of T2R-TTL-Compound9 complex
提交 2020-06-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 2
GOL GLYCEROL × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
AF6 N-benzyl-9H-beta-carbolin-3-amine × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2 and 30 mM MgCl2.
|
分辨率 2.69 Å
R-free 0.248
|
|
7CE8
Crystal structure of T2R-TTL-Compound11 complex
提交 2020-06-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 2
GOL GLYCEROL × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
AEX N-butyl-9H-beta-carbolin-3-amine × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2 and 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.73 Å
R-free 0.242
|
|
7CEK
Crystal structure of T2R-TTL-BML-284 complex
提交 2020-06-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 5
CA CALCIUM ION × 6
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
FW9 N4-(1,3-benzodioxol-5-ylmethyl)-6-(3-methoxyphenyl)pyrimidine-2,4-diamine × 2
CL CHLORIDE ION × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2 and 30 mM MgCl2.
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.271
|
|
7CLD
Crystal structure of T2R-TTL-Cevipabulin complex
提交 2020-07-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 5
CA CALCIUM ION × 7
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
G2X 6-[2,6-bis(fluoranyl)-4-[3-(methylamino)propoxy]phenyl]-5-chloranyl-N-[(2S)-1,1,1-tris(fluoranyl)propan-2-yl]-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-amine × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2 and 30 mM MgCl2.
|
分辨率 2.61 Å
R-free 0.258
|
|
7CNM
YDX in complex with tubulin
提交 2020-08-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
CA CALCIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3
G70 (2~{S},4~{S})-4-[[2-[(1~{R},3~{R})-1-acetyloxy-4-methyl-3-[[(2~{S},3~{S})-3-methyl-2-[[(2~{R})-1-methylpiperidin-2-yl]carbonylamino]pentanoyl]amino]pentyl]-1,3-thiazol-4-yl]carbonylamino]-5-cyclohexyl-2-methyl-pentanoic acid × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;277 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.44 Å
R-free 0.237
|
|
7CNN
vinorelbine in complex with tubulin
提交 2020-08-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 5
CA CALCIUM ION × 4
CL CHLORIDE ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
GDF Vinorelbine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;277 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.229
|
|
7CNO
Phomopsin A in complex with tubulin
提交 2020-08-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 4
CL CHLORIDE ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
HOS Phomopsin A × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;277 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCL2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.239
|
|
7DAD
EPD in complex with tubulin
提交 2020-10-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 5
CA CALCIUM ION × 4
CL CHLORIDE ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
EPD EPOTHILONE D × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;277 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCL2, pH 6.7
|
分辨率 2.85 Å
R-free 0.226
|
|
7DAE
EPB in complex with tubulin
提交 2020-10-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 4
CL CHLORIDE ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
EPB 7,11-DIHYDROXY-8,8,10,12,16-PENTAMETHYL-3-[1-METHYL-2-(2-METHYL-THIAZOL-4-YL)VINYL]-4,17-DIOXABICYCLO[14.1.0]HEPTADECANE-5,9-DIONE × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;277 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCL2, pH 6.7
|
分辨率 2.39 Å
R-free 0.222
|
|
7DAF
IXA in complex with tubulin
提交 2020-10-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 6
CA CALCIUM ION × 4
CL CHLORIDE ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
GZX (1~{S},3~{S},7~{S},10~{R},11~{S},12~{S},16~{R})-8,8,10,12,16-pentamethyl-3-[(~{E})-1-(2-methyl-1,3-thiazol-4-yl)prop-1-en-2-yl]-7,11-bis(oxidanyl)-17-oxa-4-azabicyclo[14.1.0]heptadecane-5,9-dione × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;277 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCL2, pH 6.7
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.222
|
|
7DB9
IC1 in complex with tubulin
提交 2020-10-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 5
CA CALCIUM ION × 4
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
IC1 3-[(2,4,6-TRIMETHOXY-PHENYL)-METHYLENE]-INDOLIN-2-ONE × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;277 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCL2, pH 6.7
|
分辨率 2.85 Å
R-free 0.233
|
|
7DBA
RYX in complex with tubulin
提交 2020-10-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 2
CL CHLORIDE ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
H1O 2-(1-methylindol-4-yl)-7-(3,4,5-trimethoxyphenyl)-1~{H}-benzimidazole × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;277 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCL2, pH 6.7
|
分辨率 2.46 Å
R-free 0.228
|
|
7DBB
SSE in complex with tubulin
提交 2020-10-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 5
CA CALCIUM ION × 4
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
H1F 5-phenyl-3-(3,4,5-trimethoxyphenyl)-3,4-dihydropyrazole-2-carbothioamide × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;277 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCL2, pH 6.7
|
分辨率 2.81 Å
R-free 0.230
|
|
7DBC
PRA in complex with tubulin
提交 2020-10-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 5
CA CALCIUM ION × 2
H1C methyl ~{N}-(5-butyl-1~{H}-benzimidazol-2-yl)carbamate × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;277 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCL2, pH 6.7
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.234
|
|
7DBD
444 in complex with tubulin
提交 2020-10-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 2
H0U ~{N}-[5-(5-cyanothiophen-2-yl)-2-methyl-phenyl]-4-methyl-benzenesulfonamide × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;277 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCL2, pH 6.7
|
分辨率 3.09 Å
R-free 0.244
|
|
7DMZ
GMPCPP microtubule complex
提交 2020-12-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 B
1–451(451 aa)
链 D
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 2
TAJ taccalonolide AJ × 3
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å
|
|
7DN0
AJ-GMPCPP-MT-non-seam
提交 2020-12-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 B
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 D
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
MG MAGNESIUM ION × 4
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2
TAJ taccalonolide AJ × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å
|
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7DP8
Crystal structure of T2R-TTL-Cevipabulin-eribulin complex
提交 2020-12-18
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
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链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
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未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 5
CA CALCIUM ION × 6
GOL GLYCEROL × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
G2X 6-[2,6-bis(fluoranyl)-4-[3-(methylamino)propoxy]phenyl]-5-chloranyl-N-[(2S)-1,1,1-tris(fluoranyl)propan-2-yl]-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-amine × 2
6K9 (1S,3S,6S,9S,12S,14R,16R,18S,20R,21R,22S,26R,29S,31R,32S,33R,35R,36S)-20-[(2S)-3-amino-2-hydroxypropyl]-21-methoxy-14-methyl-8,15-dimethylidene-2,19,30,34,37,39,40,41-octaoxanonacyclo[24.9.2.1~3,32~.1~3,33~.1~6,9~.1~12,16~.0~18,22~.0~29,36~.0~31,35~]hentetracontan-24-one (non-preferred name) × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2 and 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.45 Å
R-free 0.264
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7EMJ
Crystal structure of T2R-TTL-Barbigerone complex
提交 2021-04-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 5
CA CALCIUM ION × 6
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
J6L 8,8-dimethyl-3-(2,4,5-trimethoxyphenyl)pyrano[2,3-f]chromen-4-one × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;6% PEG 4000, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2 and 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.33 Å
R-free 0.241
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7EN3
Crystal structure of tubulin in complex with Tubulysin analogue TGL
提交 2021-04-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
CA CALCIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3
J6R (2S,4R)-5-(4-fluorophenyl)-2-methyl-4-[[2-[(1R,3R)-4-methyl-3-[5-methylhexyl-[(2S,3S)-3-methyl-2-[[(2R)-1-methylpiperidin-2-yl]carbonylamino]pentanoyl]amino]-1-oxidanyl-pentyl]-1,3-thiazol-4-yl]carbonylamino]pentanoic acid × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;293 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.64 Å
R-free 0.239
|
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7EXC
Crystal structure of T2R-TTL-1129A2 complex
提交 2021-05-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
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链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 2
GOL GLYCEROL × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
JEL N-[[3-(1,3-benzodioxol-5-yloxy)phenyl]methyl]-9H-pyrido[3,4-b]indol-3-amine × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
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分辨率 2.39 Å
R-free 0.264
|
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7L05
Complex of novel maytansinoid M24 bound to T2R-TTL (two tubulin alpha/beta heterodimers, RB3 stathmin-like domain, and tubulin tyrosine ligase)
提交 2020-12-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
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链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 5
CA CALCIUM ION × 4
CL CHLORIDE ION × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
XQ4 (1S,2R,3S,5S,6S,16E,18E,20R,21S)-11-chloro-21-hydroxy-12,20-dimethoxy-2,5,9,16-tetramethyl-8,23-dioxo-4,24-dioxa-9,22-diazatetracyclo[19.3.1.1~10,14~.0~3,5~]hexacosa-10(26),11,13,16,18-pentaen-6-yl (2S)-2-{methyl[3-(methylamino)propanoyl]amino}propanoate (non-preferred name) × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;PEG 3350, MES, CaCl2, MgCl2, glycerol
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分辨率 2.21 Å
R-free 0.217
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7LVQ
KIF14[391-743] - AMP-PNP closed state class in complex with a microtubule
提交 2021-02-26
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
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7LVR
KIF14[391-743] - ADP-AlFx closed state class in complex with a microtubule
提交 2021-02-26
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
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7LZ7
Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with compound 5k
提交 2021-03-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
CA CALCIUM ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 5
YJ7 4-(3,6-dimethyl[1,2]oxazolo[5,4-d]pyrimidin-4-yl)-7-methoxy-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;PEG 4000, glycerol, MES, CaCl2, MgCl2
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.211
|
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7LZ8
Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with compound 5t
提交 2021-03-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
CA CALCIUM ION × 4
MG MAGNESIUM ION × 4
CL CHLORIDE ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
YJ4 4-[2-(ethylamino)pyrido[3,2-d]pyrimidin-4-yl]-7-methoxy-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;PEG 4000, MES, glycerol, CaCl2, MgCl2, ethyl acetate
|
分辨率 2.92 Å
R-free 0.228
|
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7NB8
Plasmodium falciparum kinesin-5 motor domain without nucleotide, complexed with 14 protofilament microtubule.
提交 2021-01-25
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;3.5 uM microtubules were incubated to the grid and incubated for 30 seconds. The grid was blotted, then 40 uM kinesin motor domain added and incubated for 30 seconds. The grid was again blotted and 40 uM kinesin motor domain added for 30 seconds. Then the grid was blotted and plunge frozen.
|
分辨率 4.40 Å
|
|
7NBA
Plasmodium falciparum kinesin-5 motor domain bound to AMPPNP, complexed with 14 protofilament microtubule.
提交 2021-01-25
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 3
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;5 uM microtubules were applied to the grid and incubated for 30 seconds. The grid was blotted, then 40 uM kinesin motor domain added, incubated for 30 seconds, then blotted. 40 uM Kinesin motor domain was again added, incubated for 40 seconds, blotted, then plunge frozen.
|
分辨率 4.00 Å
|
|
7PQC
tau-microtubule structural ensemble based on CryoEM data
提交 2021-09-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 15
PDB 声明:pentadecameric
|
链 B
1–451(451 aa)
链 D
1–451(451 aa)
链 F
1–451(451 aa)
链 H
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
链 N
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7
MG MAGNESIUM ION × 7
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å
|
|
7PQP
tau-microtubule structural ensemble based on CryoEM data
提交 2021-09-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 15
PDB 声明:pentadecameric
|
链 B
1–451(451 aa)
链 D
1–451(451 aa)
链 F
1–451(451 aa)
链 H
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
链 N
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7
MG MAGNESIUM ION × 7
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å
|
|
7RS6
Cryo-EM structure of Kip3 (AMPPNP) bound to GMPCPP-Stabilized Microtubules
提交 2021-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 27
PDB 声明:27-meric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 G
1–451(451 aa)
链 I
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
链 N
1–451(451 aa)
链 P
1–451(451 aa)
链 R
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9
MG MAGNESIUM ION × 27
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 9
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 9
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB80 buffer (80 mM PIPES-KOH, pH 6.8; 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 1 mM DTT)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å
|
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7SGS
Cryo-EM structure of full-length MAP7 bound to the microtubule
提交 2021-10-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
1–451(451 aa)
链 D
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
7TQX
CaKip3[2-482] - AMP-PNP in complex with a microtubule
提交 2022-01-27
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å
|
|
7TQY
CaKip3[2-482] - ADP-AlFx in complex with a microtubule
提交 2022-01-27
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å
|
|
7TQZ
Apo CaKip3[2-482] in complex with a microtubule
提交 2022-01-27
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å
|
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7TR0
CaKip3[2-436] - AMP-PNP in complex with a microtubule
提交 2022-01-27
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å
|
|
7TR1
CaKip3[2-436]-L2-mutant(HsKHC) - AMP-PNP in complex with a microtubule
提交 2022-01-27
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 2
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
7TR2
Apo CaKip3[2-436]-L2-mutant(HsKHC) in complex with a microtubule
提交 2022-01-27
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
7TR3
CaKip3[2-482] - AMP-PNP in complex with a dolastatin-10-stabilized tubulin ring
提交 2022-01-27
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
SR6 dolastatin-10 × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å
|
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7TTD
Tubulin-RB3_SLD in complex with compound 12e
提交 2022-02-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 A
1–438(438 aa)
链 C
1–438(438 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
SO4 SULFATE ION × 4
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
JUL 7-methoxy-4-[2-(morpholin-4-yl)-6,7-dihydro-5H-cyclopenta[d]pyrimidin-4-yl]-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 2
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.6;293 K;0.2M ammonium sulfate, 0.1 M tri-sodium citrate, pH 5.6, 12 ~14 % PEG 4K
|
分辨率 2.27 Å
R-free 0.224
|
|
7TTE
Tubulin-RB3_SLD in complex with compound 12j
提交 2022-02-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 A
1–438(438 aa)
链 C
1–438(438 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
SO4 SULFATE ION × 4
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
JVR 4-[2-(cyclopropylamino)-6,7-dihydro-5H-cyclopenta[d]pyrimidin-4-yl]-7-methoxy-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 2
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.6;293 K;0.2M ammonium sulfate, 0.1 M tri-sodium citrate, pH 5.6, 14 % PEG 4K
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.239
|
|
7TTF
Tubulin-RB3_SLD in complex with compound 12k
提交 2022-02-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 A
1–438(438 aa)
链 C
1–438(438 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
SO4 SULFATE ION × 7
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
JV9 7-methoxy-4-[2-(methylamino)-6,7-dihydro-5H-cyclopenta[d]pyrimidin-4-yl]-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 2
GOL GLYCEROL × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.6;293 K;0.2M ammonium sulfate, 0.1 M tri-sodium citrate, pH 5.6, 14 % PEG 4K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.238
|
|
7XQX
Crystal structure of T2R-TTL-27a complex
提交 2022-05-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
CA CALCIUM ION × 2
CL CHLORIDE ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
GXI 2-chloranyl-7-fluoranyl-N-(4-methoxyphenyl)-N-methyl-quinazolin-4-amine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 3.36 Å
R-free 0.245
|
|
7XQY
Crystal structure of T2R-TTL-15 complex
提交 2022-05-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
CA CALCIUM ION × 2
CL CHLORIDE ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
GX5 2-chloranyl-N-(4-methoxyphenyl)-N-methyl-pyrido[3,2-d]pyrimidin-4-amine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.35 Å
R-free 0.236
|
|
7XR0
Crystal structure of T2R-TTL-27a complex
提交 2022-05-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
CA CALCIUM ION × 2
CL CHLORIDE ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
GWC 2-chloranyl-5-fluoranyl-N-(4-methoxyphenyl)-N-methyl-quinazolin-4-amine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.246
|
|
7XR1
Crystal structure of T2R-TTL-3a complex
提交 2022-05-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
CA CALCIUM ION × 2
CL CHLORIDE ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
GY2 2-chloranyl-6-fluoranyl-N-(4-methoxyphenyl)-N-methyl-quinazolin-4-amine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.81 Å
R-free 0.246
|
|
7YHN
ANTI-TUMOR AGENT Y48 IN COMPLEX WITH TUBULIN
提交 2022-07-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 6
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
IUK 4-methyl-3-[(4-methylphenyl)sulfonylamino]-~{N}-[(6-methylpyridin-3-yl)methyl]benzamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;6% PEG 4000, 8% GLYCEROL, 30MM MAGNESIUM CHLORIDE, 30MM CALCIUM CHLORIDE, 100MM MES
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.272
|
|
7YSN
Tubulin heterodimer structure of GMPCPP state in solution
提交 2022-08-12
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å
|
|
7YSO
Tubulin heterodimer structure of GDP-1 state in solution
提交 2022-08-12
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
|
|
7YSP
Tubulin heterodimer structure of GDP-2 state in solution
提交 2022-08-12
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å
|
|
7Z2A
P. berghei kinesin-8B motor domain in no nucleotide state bound to tubulin dimer
提交 2022-02-26
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–437(437 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å
|
|
7Z2B
P. berghei kinesin-8B motor domain in AMPPNP state bound to tubulin dimer
提交 2022-02-26
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–437(437 aa)
|
未记录
|
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 3
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
7Z2C
P. falciparum kinesin-8B motor domain in no nucleotide bound to tubulin dimer
提交 2022-02-26
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–437(437 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å
|
|
8DIQ
Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with SB226
提交 2022-06-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
CA CALCIUM ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 5
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
JVI 4-[2-(ethylamino)-6,7-dihydro-5H-cyclopenta[d]pyrimidin-4-yl]-7-methoxy-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 2
GOL GLYCEROL × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;PEG4K, MES, Glycerol, CaCl2, MgCl2
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.209
|
|
8F18
Apo KIF20A[1-565] class-2 in complex with a microtubule
提交 2022-11-04
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
8F1A
Apo KIF20A[1-565] class-1 in complex with a microtubule
提交 2022-11-04
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
8JJB
Crystal structure of T2R-TTL-Y61 complex
提交 2023-05-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 5
CA CALCIUM ION × 6
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
USI ~{N}4-(1~{H}-indol-5-ylmethyl)-6-(3-methoxyphenyl)pyrimidine-2,4-diamine × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
CL CHLORIDE ION × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.68 Å
R-free 0.260
|
|
8JJC
Tubulin-Y62
提交 2023-05-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 5
CA CALCIUM ION × 6
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
UPO 4-(6,7-dimethoxy-3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-yl)-6-(3-methoxyphenyl)pyrimidin-2-amine × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
CL CHLORIDE ION × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.76 Å
R-free 0.264
|
|
8RC1
MAP7 MTBD (microtubule binding domain) decorated microtubule protofilament
提交 2023-12-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.5;80mM PIPES, 2mM MgCl2, 1mM EGTA
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Microtubules stabilised by MAP7 MTBD were applied to a glow discharged grid, incubated for 30 seconds at room temperature following which excess sample was wicked off and MAP7 MTBD was immediately added to the grid. After incubation for 60 seconds in a Vitrobot, excess liquid was blotted off and the grid was plunge frozen in liquid ethane.
|
分辨率 3.70 Å
|
|
8RHB
Microtubule-associated kinesin-1 tail complex bound to AMPPNP, single-headed state
提交 2023-12-15
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB80 + 5mM AMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
8RHH
Microtubule-associated kinesin-1 tail complex bound to AMPPNP, two-headed state
提交 2023-12-15
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:pentameric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB80 + 5mM AMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
8RIK
Microtubule-associated kinesin-1 tail complex bound to ADP, single-headed state
提交 2023-12-18
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB80 + 5 mM ADP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
|
|
8RIZ
Microtubule-associated kinesin-1 tail complex bound to ADP, two-headed state
提交 2023-12-19
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB80 + 5mM ADP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
|
|
8UTN
KIF1A[1-393] AMP-PNP bound two-heads-bound state in complex with a microtubule (class T23L1)
提交 2023-10-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 7
PDB 声明:heptameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 S
1–451(451 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 4
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
TA1 TAXOL × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
8UTO
KIF1A[1-393] AMP-PNP bound two-heads-bound state in complex with a microtubule - class T2L1
提交 2023-10-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 7
PDB 声明:heptameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 S
1–451(451 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 4
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
TA1 TAXOL × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
8UTP
KIF1A[1-393] - AMP-PNP two-heads-bound state in complex with a microtubule - class T3L1
提交 2023-10-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 7
PDB 声明:heptameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 S
1–451(451 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 4
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
TA1 TAXOL × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
8UTQ
KIF1A[1-393] AMP-PNP bound one-head-bound state in complex with a microtubule - class T1L02*
提交 2023-10-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 3
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
TA1 TAXOL × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
8UTR
KIF1A[1-393] ADP bound in complex with a microtubule
提交 2023-10-31
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
8UTS
KIF1A[1-393] APO in complex with a microtubule
提交 2023-10-31
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å
|
|
8UTT
KIF1A[1-393] P305L mutant AMP-PNP bound two-heads-bound state in complex with a microtubule
提交 2023-10-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 7
PDB 声明:heptameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 S
1–451(451 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 4
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
TA1 TAXOL × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
8UTU
KIF1A[1-393] P305L mutant AMP-PNP bound one and two heads bound states merged, in complex with a microtubule
提交 2023-10-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 3
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
8UTV
KIF1A[1-393] P305L mutant ADP bound in complex with a microtubule
提交 2023-10-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
8UTW
KIF1A[1-393] P305L mutant APO in complex with a microtubule
提交 2023-10-31
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å
|
|
8UTY
KIF1A[1-393] P364L mutant AMP-PNP bound two-heads-bound state in complex with a microtubule
提交 2023-10-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 7
PDB 声明:heptameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 S
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
TA1 TAXOL × 2
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
8V4K
CCP5 in complex with microtubules class1
提交 2023-11-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 4
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2
ZN ZINC ION × 1
GLU GLUTAMIC ACID × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
8V4L
CCP5 in complex with microtubules class2
提交 2023-11-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 4
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2
GLU GLUTAMIC ACID × 1
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
8V4M
CCP5 in complex with microtubules class3
提交 2023-11-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 4
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2
GLU GLUTAMIC ACID × 1
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
8WMO
Crystal structure analysis of tubulin and heterocyclic podophyllotoxins complex for anticancer agents
提交 2023-10-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–440(440 aa)
链 C
1–440(440 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
WIW (5~{S},5~{a}~{R},8~{a}~{R},9~{R})-5-pyrimidin-2-ylsulfanyl-9-(3,4,5-trimethoxyphenyl)-5~{a},6,8~{a},9-tetrahydro-5~{H}-[2]benzofuro[5,6-f][1,3]benzodioxol-8-one × 1
CA CALCIUM ION × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;277 K;6% glycerol, 6% PEG4000, 30 mM MgCl2, 30 mM CaCl2, 100 mM MES-Na
|
分辨率 2.89 Å
R-free 0.266
|
|
8WMU
Structural basis of tubulin and heterocyclic podophyllotoxins complex for anticancer agents with dual-binding sites
提交 2023-10-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–440(440 aa)
链 C
1–440(440 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 3
CA CALCIUM ION × 2
GOL GLYCEROL × 1
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
A1D55 (5~{S},5~{a}~{S},8~{a}~{R},9~{R})-5-(quinolin-6-ylamino)-9-(3,4,5-trimethoxyphenyl)-5~{a},6,8~{a},9-tetrahydro-5~{H}-[2]benzofuro[6,5-f][1,3]benzodioxol-8-one × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;277 K;6% PEG4000, 6% glycerol, 30 mM MgCl2, 30 mM CaCl2, 100 mM MES-Na
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.245
|
|
8YEM
Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with compound 9
提交 2024-02-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–440(440 aa)
链 C
1–440(440 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
CA CALCIUM ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
A1D6D 4-(2-chloranyl-6-fluoranyl-quinazolin-4-yl)-7-methoxy-1,3-dihydroquinoxalin-2-one × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.74 Å
R-free 0.284
|
|
8YER
Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with compound 4
提交 2024-02-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–440(440 aa)
链 C
1–440(440 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
CA CALCIUM ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
A1D6E 6-fluoranyl-4-(6-methoxy-3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)-~{N}-methyl-quinazolin-2-amine × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.71 Å
R-free 0.286
|
|
8YEU
Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with compound 2NH2
提交 2024-02-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–440(440 aa)
链 C
1–440(440 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
CA CALCIUM ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
A1D6L 6-fluoranyl-4-(6-methoxy-3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)quinazolin-2-amine × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 3.05 Å
R-free 0.268
|
|
8YRK
Tubulin-Compound KY216: stathmin-like domain complex
提交 2024-03-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 2
CL CHLORIDE ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
GOL GLYCEROL × 1
A1D62 (11R,16S)-11-(3,5-dichloro-4-methoxyphenyl)-4,7-dioxa-12,14-diazatetracyclo[8.7.0.03,8.012,16]heptadeca-1,3(8),9-triene-13,15-dione × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291.15 K;PEG,magnesium choride,calcium chloride,Ethylene glycol,MES
|
分辨率 2.74 Å
R-free 0.226
|
|
8YTX
Tubulin-RB3-TTL in complex with compound SI9
提交 2024-03-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–440(440 aa)
链 C
1–440(440 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
CA CALCIUM ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
A1D68 2-chloranyl-~{N}-(4-methoxyphenyl)-~{N}-methyl-thieno[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.53 Å
R-free 0.266
|
|
8YU9
Tubulin-RB3-TTL in complex with compound SI10
提交 2024-03-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–440(440 aa)
链 C
1–440(440 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
CA CALCIUM ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
A1D7A 4-(2-chloranylthieno[3,2-d]pyrimidin-4-yl)-7-methoxy-1,3-dihydroquinoxalin-2-one × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 3.25 Å
R-free 0.286
|
|
8YUA
Tubulin-RB3-TTL in complex with compound SI10
提交 2024-03-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–440(440 aa)
链 C
1–440(440 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
CA CALCIUM ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
A1D69 2-chloranyl-~{N}-(4-methoxyphenyl)-~{N}-methyl-thieno[3,2-d]pyrimidin-4-amine × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.37 Å
R-free 0.254
|
|
8YY2
Kinesin-14 in nucleotide-free state bound to 13 PF Microtubule
提交 2024-04-03
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;100 mM PIPES pH 6.8, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, and 1 mM GTP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
|
|
8YY3
Kinesin-14 in nucleotide-free state bound to 14 PF Microtubule
提交 2024-04-03
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;100 mM PIPES pH 6.8, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, and 1 mM GTP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.24 Å
|
|
8YY4
Kinesin-14 with AlF3 bound to 13 PF Microtubule
提交 2024-04-03
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;100 mM PIPES pH 6.8, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 1 mM GTP, 2 mM ADP, 2 mM AlCl3, and 8 mM NaF
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.02 Å
|
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8YY5
Kinesin-14 with AlF3 bound to 14 PF Microtubule
提交 2024-04-03
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;100 mM PIPES pH 6.8, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 1 mM GTP, 2 mM ADP, 2 mM AlCl3, and 8 mM NaF
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.99 Å
|
|
8ZB8
Crystal structure of T2R-TTL-DPP21 complex
提交 2024-04-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
CA CALCIUM ION × 2
GOL GLYCEROL × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
A1D8I ~{N},2-dimethyl-~{N}-(1-methylindol-5-yl)thieno[3,2-d]pyrimidin-4-amine × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;6% polyethylene glycol 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.94 Å
R-free 0.259
|
|
9DA8
Tau-Microtubule structure in the presence of ATP
提交 2024-08-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 B
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4
TA1 TAXOL × 4
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.94 Å
|
|
9DHZ
Cryo-EM structure of HURP bound to a microtubule
提交 2024-09-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 B
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
|
未记录
|
TA1 TAXOL × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
9DI0
Cryo-EM structure of Kif18A bound to a microtubule
提交 2024-09-04
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 L
1–451(451 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
TA1 TAXOL × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
9DUQ
HURP(65-174) bound to GMPCPP-stabilized microtubule
提交 2024-10-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 27
PDB 声明:27-meric
|
链 A
1–439(439 aa)
链 C
1–439(439 aa)
链 E
1–439(439 aa)
链 G
1–439(439 aa)
链 I
1–439(439 aa)
链 K
1–439(439 aa)
链 M
1–439(439 aa)
链 O
1–439(439 aa)
链 Q
1–439(439 aa)
|
未记录
|
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 9
MG MAGNESIUM ION × 18
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB80 (1X): 80 mM PIPES, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, pH 6.8 with KOH
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å
|
|
9DXC
Model of tubulin dimers used for determining the dimer rise in a taxol-stabilized microtubule-HURP complex
提交 2024-10-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
9DXE
Model of tubulin dimers used for determining the dimer rise in a taxol-stabilized microtubule
提交 2024-10-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
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9GNQ
Microtubule-associated Kif5B IAK tail mutant bound to ADP
提交 2024-09-03
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB80 + 5mM AMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
9IM5
Tubulin-RB3(MUT)-TTL-Y12
提交 2024-07-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 3
CL CHLORIDE ION × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
A1L2T ~{N}4-(1,3-benzodioxol-5-ylmethyl)-6-(1~{H}-indol-4-yl)pyrimidine-2,4-diamine × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;6% PEG 4000, 5% glycerol, 0.1M MES, 30mM CaCl2, 30mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.86 Å
R-free 0.246
|
|
9IMO
Crystal structure of Tubulin-RB3-TTL-Y12
提交 2024-07-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 5
CA CALCIUM ION × 3
A1L2T ~{N}4-(1,3-benzodioxol-5-ylmethyl)-6-(1~{H}-indol-4-yl)pyrimidine-2,4-diamine × 4
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;6% PEG 4000, 5% glycerol, 0.1M MES, 30mM CaCl2, 30mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.75 Å
R-free 0.255
|
|
9IXB
Structure of tubulin and nitrogen-containing heterocyclic substituted podophyllotoxin derivatives complex
提交 2024-07-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–440(440 aa)
链 C
1–440(440 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
MG MAGNESIUM ION × 3
CA CALCIUM ION × 1
NA SODIUM ION × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
A1ECQ (5~{S},5~{a}~{S},8~{a}~{R},9~{R})-5-(1~{H}-indazol-5-ylamino)-9-(3,4,5-trimethoxyphenyl)-5~{a},6,8~{a},9-tetrahydro-5~{H}-[2]benzofuro[6,5-f][1,3]benzodioxol-8-one × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
IMD IMIDAZOLE × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;277 K;6% PEG4000, 6% glycerol, 30 mM MgCl2, 30 mM CaCl2, 100 mM MES-Na
|
分辨率 3.48 Å
R-free 0.267
|
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9K7E
Crystal structure of T2R-TTL-taccalonolide Y8 complex
提交 2024-10-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–440(440 aa)
链 C
1–440(440 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
CA CALCIUM ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
A1EE1 (4~{R})-5-(4-hydroxyphenyl)-3-(4-methylphenyl)-4-phenyl-2,4-dihydropyrrolo[3,4-c]pyrazol-6-one × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.45 Å
R-free 0.267
|
|
9KBL
Crystal structure of T2R-TTL-IKP104
提交 2024-10-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 5
CA CALCIUM ION × 7
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
W4Q 1-(2-chloranyl-3,5-dimethoxy-phenyl)-2-(4-fluorophenyl)-3-methyl-6-phenyl-pyridin-4-one × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2 and 30 mM MgCl2.
|
分辨率 3.14 Å
R-free 0.238
|
|
9KBN
Crystal structure of T2R-TTL-IKP104-Colchicine
提交 2024-10-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 5
CA CALCIUM ION × 7
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
W4Q 1-(2-chloranyl-3,5-dimethoxy-phenyl)-2-(4-fluorophenyl)-3-methyl-6-phenyl-pyridin-4-one × 1
LOC N-[(7S)-1,2,3,10-tetramethoxy-9-oxo-6,7-dihydro-5H-benzo[d]heptalen-7-yl]ethanamide × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2 and 30 mM MgCl2.
|
分辨率 2.56 Å
R-free 0.262
|
|
9KBW
CryoEM structure of microtubule bound with GAS2-GAR domain.
提交 2024-10-31
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 C
1–439(439 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;80 mM PIPES, pH 6.8, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
9L7M
Nucleotide-free kinesin-1 motor domain bound to the microtubule
提交 2024-12-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
MG MAGNESIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.48 Å
|
|
9LNL
Crystal structure of T2R-TTL-YQVB15 complex
提交 2025-01-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
CA CALCIUM ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
A1EPQ 10',11'-difluoro-12'-methoxyvinblastine × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.85 Å
R-free 0.277
|
|
9LNV
Crystal structure of T2R-TTL-YQVB6 Complex
提交 2025-01-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
CA CALCIUM ION × 2
A1EPR 10'-fluorovinblastine × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.67 Å
R-free 0.288
|
|
9LNW
Crystal structure of T2R-TTL-YQVB8 Complex
提交 2025-01-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
CA CALCIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
A1EPS 10'-bromovinblastine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.55 Å
R-free 0.292
|
|
9LNX
Crystal structure of T2R-TTL-YQVB9 Complex
提交 2025-01-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–450(450 aa)
链 C
1–450(450 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
CA CALCIUM ION × 2
A1EPT 10'-methoxyvinblastine × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.59 Å
R-free 0.296
|
|
9M1L
Cryo-EM structure of the TBC-DE-Arl2-alpha-beta-tubulin complex with GTP
提交 2025-02-26
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 a
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.55 Å
|
|
9M1M
Cryo-EM structure of the TBC-DEC-Arl2-alpha-beta-tubulin complex with GDP-AlFx
提交 2025-02-26
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 a
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1
MG MAGNESIUM ION × 3
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.21 Å
|
|
9M1N
Cryo-EM structure of the TBC-DC-Arl2-alpha-beta-tubulin complex with GDP-AlFx
提交 2025-02-26
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聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
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链 a
1–451(451 aa)
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未记录
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GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1
MG MAGNESIUM ION × 3
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.24 Å
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9MLF
TUBULIN-RB3_SLD IN COMPLEX WITH COMPOUND QW-4-183-llb
提交 2024-12-19
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
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链 A
1–438(438 aa)
链 C
1–438(438 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
A1BMG [(4M)-4-(1H-indol-4-yl)-1H-imidazol-2-yl](3,4,5-trimethoxyphenyl)methanone × 2
SO4 SULFATE ION × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293.15 K;0.1 M trisodium citrate, pH 5.6, 0.2 M ammonium sulfate, 12.2% PEG 4000
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分辨率 2.40 Å
R-free 0.233
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9N9E
Cryo-EM structure of the SAH domain of Caenorhabditis elegans ICP-1 bound to the paclitaxel-stabilized microtubule
提交 2025-02-10
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
ZN ZINC ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.60 Å
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9N9F
Cryo-EM structure of the SAH domain of human INCENP bound to the paclitaxel-stabilized microtubule
提交 2025-02-10
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
ZN ZINC ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.91 Å
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9N9G
Cryo-EM structure of the human Hec1-Nuf2 dimer bound to the paclitaxel-stabilized microtubule
提交 2025-02-10
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 9
PDB 声明:nonameric
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链 A
1–451(451 aa)
链 a
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
TA1 TAXOL × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.00 Å
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9N9H
Cryo-EM structure of the Xenopus laevis mitotic centromere-associated kinesin (MCAK) bound to the paclitaxel-stabilized microtubule
提交 2025-02-10
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
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链 A
1–451(451 aa)
链 a
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
TA1 TAXOL × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.31 Å
|
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9N9I
Cryo-EM structure of the Xenopus laevis mitotic centromere-associated kinesin (MCAK) bound to the paclitaxel-stabilized microtubule
提交 2025-02-10
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 9
PDB 声明:nonameric
|
链 1
1–451(451 aa)
链 4
1–451(451 aa)
链 A
1–451(451 aa)
链 a
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
MG MAGNESIUM ION × 8
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4
TA1 TAXOL × 4
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
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9NNL
Bordetella filamentous hemagglutinin (FhaB) C-terminal domain bound to microtubules
提交 2025-03-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
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链 A
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
|
未记录
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GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4
TA1 TAXOL × 4
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.42 Å
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9O6I
TUBULIN-RB3_SLD IN COMPLEX WITH COMPOUND QW-5-70
提交 2025-04-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 A
1–438(438 aa)
链 C
1–438(438 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
A1B97 [(4M)-4-(1H-indazol-4-yl)-1H-imidazol-2-yl](3,4,5-trimethoxyphenyl)methanone × 2
SO4 SULFATE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293.15 K;0.1 M trisodium citrate, pH 5.6, 0.2 M ammonium sulfate, 12.2% PEG 4000
|
分辨率 2.51 Å
R-free 0.244
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9U6A
Tubulin-DARPin D1 in complex with a flavone
提交 2025-03-22
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配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
A1L8X 3-methoxy-2-(4-methoxy-3-oxidanyl-phenyl)-5,7-bis(oxidanyl)chromen-4-one × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;PEG 3000, ammonium sulfate, bis-tris methane
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分辨率 1.92 Å
R-free 0.224
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9U6D
Crystal structure of tubulin-RB3-TTL in complex with X8
提交 2025-03-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
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链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 5
CA CALCIUM ION × 6
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
A1L8Z 2-[2-fluoranyl-4-[4-[2-[4-[(1~{R},2~{S})-2-fluoranylcyclopropyl]carbonylpiperazin-1-yl]ethoxy]phenyl]phenyl]-~{N}-(phenylmethyl)ethanamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;6% PEG 4000, 5% glycerol, 0.1M MES, 30mM CaCl2, 30mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.54 Å
R-free 0.238
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9U9Q
Tubulin-RB3-TTL in complex with C38
提交 2025-03-29
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
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链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 5
CA CALCIUM ION × 7
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
A1L80 2-(1-benzofuran-5-yl)-6-[2,6-bis(fluoranyl)-4-[3-(methylamino)propoxy]phenyl]-5-chloranyl-~{N}-[(2~{S})-1,1,1-tris(fluoranyl)propan-2-yl]-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-amine × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;6% PEG 4000, 5% glycerol, 0.1M MES, 30mM CaCl2, 30mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.93 Å
R-free 0.269
|
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9UMU
Giraffe KIF5A motor domain in nucleotide free state bound to microtubule
提交 2025-04-23
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.40 Å
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9YA5
KIF1A R350G bound to microtubules in two-heads-bound state with AMP-PNP
提交 2025-09-15
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
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链 A
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
TA1 TAXOL × 2
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB80 buffer composed of 80 mM
PIPES, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, PH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;4uL of a 6uM MT solution in BRB80 (80mM PIPES, 2mM MgCl2, 1mM EGTA pH 6.8) along with 20uM paclitaxel was added onto a plasma-cleaned grid. The MTs were incubated for 1 minute at room temperature, and then the excess liquid was removed from the grid using Whatman #1 paper. Next, 4uL of a solution containing 20uM KIF1A-R350G in BRB80 supplemented with 20uM paclitaxel and 5mM AMP-PNP was added to the grid. The grid with the MT and kinesin mixture was then mounted into a Vitrobot, incubated for 1 minute at room temperature, and plunge-frozen into liquid nitrogen-cooled ethane.
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分辨率 2.95 Å
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9YA7
KIF1A R350G bound to microtubules in the apo state
提交 2025-09-15
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配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB80 buffer composed of 80 mM
PIPES, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, PH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;4uL of a 6uM MT solution in BRB80 (80mM PIPES, 2mM MgCl2, 1mM EGTA pH 6.8) along with 20uM paclitaxel was added onto a plasma-cleaned grid. The MTs were incubated for 1 minute at room temperature, and then the excess liquid was removed from the grid using Whatman #1 paper. Next, 4uL of a solution containing 20uM KIF1A-R350G in BRB80 supplemented with 20uM paclitaxel and 0.005 units per uL apyrase was added to the grid. The grid with the MT and kinesin mixture was then mounted into a Vitrobot, incubated for 1 minute at room temperature, and plunge-frozen into liquid nitrogen-cooled ethane.
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分辨率 3.29 Å
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9YAB
KIF1A R350W bound to microtubules in the apo state
提交 2025-09-15
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配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB80 buffer composed of 80 mM
PIPES, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, PH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;4uL of a 6uM MT solution in BRB80 (80mM PIPES, 2mM MgCl2, 1mM EGTA pH 6.8) along with 20uM paclitaxel was added onto a plasma-cleaned grid. The MTs were incubated for 1 minute at room temperature, and then the excess liquid was removed from the grid using Whatman #1 paper. Next, 4uL of a solution containing 17.5uM KIF1A-R350W in BRB80 supplemented with 20uM paclitaxel and 0.005 units per uL apyrase was added to the grid. The grid with the MT and kinesin mixture was then mounted into a Vitrobot, incubated for 1 minute at room temperature, and plunge-frozen into liquid nitrogen-cooled ethane.
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分辨率 3.21 Å
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9YAI
KIF1A R350W bound to microtubules in two-heads-bound state with AMP-PNP
提交 2025-09-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
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链 A
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
|
未记录
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MG MAGNESIUM ION × 3
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
TA1 TAXOL × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB80 buffer composed of 80 mM
PIPES, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, PH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;4uL of a 6uM MT solution in BRB80 (80mM PIPES, 2mM MgCl2, 1mM EGTA pH 6.8) along with 20uM paclitaxel was added onto a plasma-cleaned grid. The MTs were incubated for 1 minute at room temperature, and then the excess liquid was removed from the grid using Whatman #1 paper. Next, 4uL of a solution containing 17.5uM KIF1A-R350W in BRB80 supplemented with 20uM paclitaxel and 5mM AMP-PNP was added to the grid. The grid with the MT and kinesin mixture was then mounted into a Vitrobot, incubated for 1 minute at room temperature, and plunge-frozen into liquid nitrogen-cooled ethane.
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分辨率 3.12 Å
|
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9YMG
Human KIF18A-DARPin fusion protein bound to AMP-PNP and tubulin
提交 2025-10-09
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配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 3
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.2 M ammonium nitrate, 0.1 M sodium acetate pH 5.6, 20% (w/v) PEG Smear Low (5% PEG 400, 5% PEG 500 MME, 5% PEG 600, 5% PEG 1000), 5% (v/v) ethylene glycol
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分辨率 2.41 Å
R-free 0.238
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9YMG
Human KIF18A-DARPin fusion protein bound to AMP-PNP and tubulin
提交 2025-10-09
|
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 D
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.2 M ammonium nitrate, 0.1 M sodium acetate pH 5.6, 20% (w/v) PEG Smear Low (5% PEG 400, 5% PEG 500 MME, 5% PEG 600, 5% PEG 1000), 5% (v/v) ethylene glycol
|
分辨率 2.41 Å
R-free 0.238
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9YXQ
Cryo-EM structure of the Xenopus laevis mitotic centromere-associated kinesin (MCAK) bound to the paclitaxel-stabilized microtubule
提交 2025-10-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 14
PDB 声明:14-meric
|
链 1
1–451(451 aa)
链 3
1–451(451 aa)
链 6
1–451(451 aa)
链 8
1–451(451 aa)
链 A
1–451(451 aa)
链 a
1–451(451 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 11
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
TA1 TAXOL × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.39 Å
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