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3jap

Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 201.8 Å Quality: EXCELLENT
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

uS2

物种未注明

UniProt Q6CN12

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 A； UniProt 1–254 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 A 1–254（254 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 A 1–254（254 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 A 1–254（254 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 A 2–207（206 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 A 2–207（206 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 A 1–254（254 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 A 1–254（254 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 A 2–209（208 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 A 2–220（219 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 A 1–254（254 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 A 1–254（254 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 A 1–254（254 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 A 1–254（254 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 A 1–254（254 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 A 1–254（254 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 A 1–254（254 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 A 1–254（254 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 A 1–254（254 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 A 1–254（254 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 A 1–254（254 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RSSA_KLULA
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–254； UniProt 1–254

eS1

物种未注明

UniProt Q6CWD0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 B； UniProt 1–255 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 B 1–255（255 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 B 1–255（255 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 B 1–255（255 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 B 20–233（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 B 20–233（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 B 1–255（255 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 B 1–255（255 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 B 3–233（231 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 B 3–233（231 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 B 1–255（255 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 B 1–255（255 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 B 1–255（255 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 B 1–255（255 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 B 1–255（255 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 B 1–255（255 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 B 1–255（255 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 B 1–255（255 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 B 1–255（255 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 B 1–255（255 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 B 1–255（255 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RS3A_KLULA
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–255； UniProt 1–255

uS5

物种未注明

UniProt Q6CKL3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 C； UniProt 1–259 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 C 1–259（259 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 C 1–259（259 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 C 1–259（259 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 C 39–255（217 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 C 39–255（217 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 C 1–259（259 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 C 1–259（259 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 C 39–255（217 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 C 39–255（217 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 C 1–259（259 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 C 1–259（259 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 C 1–259（259 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 C 1–259（259 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 C 1–259（259 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 C 1–259（259 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 C 1–259（259 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 C 1–259（259 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 C 1–259（259 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 C 1–259（259 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 C 1–259（259 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 Q6CKL3_KLULA
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–259； UniProt 1–259

uS3

物种未注明

UniProt Q6CRK7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 D； UniProt 1–237 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 D 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 D 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 D 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 D 3–225（223 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 D 3–225（223 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 D 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 D 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 D 3–225（223 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 D 3–225（223 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 D 1–237（237 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 D 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 D 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 D 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 D 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 D 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 D 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 D 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 D 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 D 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 D 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 Q6CRK7_KLULA
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 1–237； UniProt 1–237

eS4

物种未注明

UniProt Q6CWJ2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 E； UniProt 1–261 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 E 1–261（261 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 E 1–261（261 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 E 1–261（261 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 E 2–261（260 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 E 2–261（260 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 E 1–261（261 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 E 1–261（261 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 E 2–261（260 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 E 2–261（260 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 E 1–261（261 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 E 1–261（261 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 E 1–261（261 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 E 1–261（261 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 E 1–261（261 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 E 1–261（261 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 E 1–261（261 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 E 1–261（261 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 E 1–261（261 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 E 1–261（261 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 E 1–261（261 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q6CWJ2_KLULA
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 E； PDB构建体 1–261； UniProt 1–261

uS7

物种未注明

UniProt Q6CRA3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 F； UniProt 1–227 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 F 1–227（227 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 F 1–227（227 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 F 1–227（227 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 F 22–227（206 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 F 22–227（206 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 F 1–227（227 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 F 1–227（227 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 F 22–227（206 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 F 22–227（206 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 F 1–227（227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 F 1–227（227 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 F 1–227（227 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 F 1–227（227 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 F 1–227（227 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 F 1–227（227 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 F 1–227（227 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 F 1–227（227 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 F 1–227（227 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 F 1–227（227 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 F 1–227（227 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 Q6CRA3_KLULA
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 F； PDB构建体 1–227； UniProt 1–227

eS6

物种未注明

UniProt Q6CM04

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 G； UniProt 1–236 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 G 1–236（236 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 G 1–236（236 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 G 1–236（236 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 G 1–226（226 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 G 1–226（226 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 G 1–236（236 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 G 1–236（236 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 G 1–226（226 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 G 1–226（226 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 G 1–236（236 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 G 1–236（236 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 G 1–236（236 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 G 1–236（236 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 G 1–236（236 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 G 1–236（236 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 G 1–236（236 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 G 1–236（236 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 G 1–236（236 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 G 1–236（236 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 G 1–236（236 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 RS6_KLULA
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 G； PDB构建体 1–236； UniProt 1–236

eS7

物种未注明

UniProt Q6CTD6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 H； UniProt 1–190 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 H 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 H 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 H 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 H 4–187（184 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 H 4–187（184 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 H 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 H 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 H 4–187（184 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 H 4–187（184 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 H 1–190（190 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 H 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 H 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 H 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 H 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 H 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 H 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 H 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 H 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 H 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 H 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q6CTD6_KLULA
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 H； PDB构建体 1–190； UniProt 1–190

eS8

物种未注明

UniProt Q6CMG3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 I； UniProt 1–201 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 I 1–201（201 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 I 1–201（201 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 I 1–201（201 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 I 2–201（200 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 I 2–201（200 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 I 1–201（201 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 I 1–201（201 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 I 2–201（200 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 I 2–201（200 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 I 1–201（201 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 I 1–201（201 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 I 1–201（201 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 I 1–201（201 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 I 1–201（201 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 I 1–201（201 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 I 1–201（201 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 I 1–201（201 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 I 1–201（201 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 I 1–201（201 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 I 1–201（201 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q6CMG3_KLULA
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 I； PDB构建体 1–201； UniProt 1–201

uS4

物种未注明

UniProt Q6CM18

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 J； UniProt 1–188 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 J 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 J 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 J 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 J 2–183（182 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 J 2–183（182 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 J 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 J 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 J 2–183（182 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 J 2–183（182 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 J 1–188（188 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 J 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 J 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 J 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 J 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 J 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 J 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 J 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 J 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 J 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 J 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 Q6CM18_KLULA
Isoform —
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 J； PDB构建体 1–188； UniProt 1–188

eS10

物种未注明

UniProt Q6CVZ5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 K； UniProt 1–106 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 K 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 K 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 K 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 K 1–96（96 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 K 1–96（96 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 K 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 K 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 K 1–96（96 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 K 1–96（96 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 K 1–106（106 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 K 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 K 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 K 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 K 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 K 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 K 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 K 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 K 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 K 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 K 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q6CVZ5_KLULA
Isoform —
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 K； PDB构建体 1–106； UniProt 1–106

uS17

物种未注明

UniProt Q6CX80

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 L； UniProt 1–156 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 L 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 L 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 L 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 L 2–156（155 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 L 2–156（155 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 L 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 L 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 L 2–156（155 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 L 2–156（155 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 L 1–156（156 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 L 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 L 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 L 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 L 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 L 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 L 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 L 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 L 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 L 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 L 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 Q6CX80_KLULA
Isoform —
PDB实体 15
链与序列区间 作者链 L； PDB构建体 1–156； UniProt 1–156

eS12

物种未注明

UniProt Q6CLU4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 M； UniProt 1–134 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 M 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 M 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 M 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 M 13–134（122 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 M 13–134（122 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 M 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 M 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 M 17–134（118 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 M 17–134（118 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 M 1–134（134 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 M 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 M 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 M 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 M 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 M 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 M 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 M 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 M 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 M 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 M 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 Q6CLU4_KLULA
Isoform —
PDB实体 16
链与序列区间 作者链 M； PDB构建体 1–134； UniProt 1–134

uS15

物种未注明

UniProt Q6CJK0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 N； UniProt 1–151 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 N 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 N 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 N 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 N 2–151（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 N 2–151（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 N 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 N 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 N 2–151（150 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 N 2–151（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 N 1–151（151 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 N 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 N 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 N 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 N 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 N 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 N 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 N 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 N 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 N 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 N 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q6CJK0_KLULA
Isoform —
PDB实体 17
链与序列区间 作者链 N； PDB构建体 1–151； UniProt 1–151

uS11

物种未注明

UniProt P27069

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 O； UniProt 1–137 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 O 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 O 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 O 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 O 11–137（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 O 11–137（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 O 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 O 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 O 11–137（127 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 O 11–137（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 O 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 O 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 O 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 O 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 O 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 O 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 O 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 O 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 O 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 O 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 O 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 RS14_KLULA
Isoform —
PDB实体 18
链与序列区间 作者链 O； PDB构建体 1–137； UniProt 1–137

uS19

物种未注明

UniProt Q6CKV4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 P； UniProt 1–142 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 P 3–142（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 P 3–142（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 P 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 P 8–129（122 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 P 8–130（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 P 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 P 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 P 13–131（119 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 P 13–129（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 P 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 P 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 P 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 P 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 P 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 P 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 P 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 P 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 P 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 P 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 P 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 Q6CKV4_KLULA
Isoform —
PDB实体 19
链与序列区间 作者链 P； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142

uS9

物种未注明

UniProt Q875N2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 Q； UniProt 1–143 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 Q 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 Q 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 Q 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 Q 3–143（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 Q 3–143（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 Q 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 Q 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 Q 3–143（141 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 Q 3–143（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 Q 1–143（143 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 Q 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 Q 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 Q 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 Q 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 Q 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 Q 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 Q 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 Q 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 Q 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 Q 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RS16_KLULA
Isoform —
PDB实体 20
链与序列区间 作者链 Q； PDB构建体 1–143； UniProt 1–143

eS17

物种未注明

UniProt Q6CWU3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 R； UniProt 1–136 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 R 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 R 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 R 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 R 2–130（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 R 2–130（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 R 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 R 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 R 2–126（125 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 R 2–131（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 R 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 R 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 R 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 R 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 R 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 R 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 R 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 R 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 R 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 R 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 R 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 Q6CWU3_KLULA
Isoform —
PDB实体 21
链与序列区间 作者链 R； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136

uS13

物种未注明

UniProt Q6CWT9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 S； UniProt 1–146 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 S 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 S 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 S 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 S 2–146（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 S 2–146（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 S 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 S 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 S 2–146（145 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 S 2–146（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 S 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 S 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 S 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 S 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 S 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 S 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 S 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 S 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 S 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 S 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 S 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q6CWT9_KLULA
Isoform —
PDB实体 22
链与序列区间 作者链 S； PDB构建体 1–146； UniProt 1–146

eS19

物种未注明

UniProt Q6CXM0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 T； UniProt 1–144 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 T 1–144（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 T 1–144（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 T 1–144（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 T 2–144（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 T 2–144（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 T 1–144（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 T 1–144（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 T 2–144（143 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 T 2–144（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 T 1–144（144 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 T 1–144（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 T 1–144（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 T 1–144（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 T 1–144（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 T 1–144（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 T 1–144（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 T 1–144（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 T 1–144（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 T 1–144（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 T 1–144（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q6CXM0_KLULA
Isoform —
PDB实体 23
链与序列区间 作者链 T； PDB构建体 1–144； UniProt 1–144

uS10

物种未注明

UniProt Q6CIM1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 U； UniProt 1–117 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 U 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 U 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 U 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 U 12–117（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 U 12–117（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 U 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 U 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 U 12–117（106 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 U 12–117（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 U 1–117（117 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 U 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 U 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 U 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 U 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 U 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 U 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 U 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 U 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 U 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 U 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q6CIM1_KLULA
Isoform —
PDB实体 24
链与序列区间 作者链 U； PDB构建体 1–117； UniProt 1–117

eS21

物种未注明

UniProt Q6CXT6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 V； UniProt 1–87 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 V 1–87（87 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 V 1–87（87 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 V 1–87（87 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 V 1–87（87 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 V 1–87（87 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 V 1–87（87 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 V 1–87（87 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 V 1–87（87 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 V 1–87（87 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 V 1–87（87 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 V 1–87（87 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 V 1–87（87 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 V 1–87（87 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 V 1–87（87 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 V 1–87（87 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 V 1–87（87 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 V 1–87（87 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 V 1–87（87 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 V 1–87（87 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 V 1–87（87 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RS21_KLULA
Isoform —
PDB实体 25
链与序列区间 作者链 V； PDB构建体 1–87； UniProt 1–87

uS8

物种未注明

UniProt Q6CW21

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 W； UniProt 1–130 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 W 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 W 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 W 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 W 2–130（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 W 2–130（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 W 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 W 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 W 2–130（129 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 W 2–130（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 W 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 W 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 W 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 W 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 W 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 W 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 W 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 W 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 W 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 W 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 19 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RS22_KLULA
Isoform —
PDB实体 26
链与序列区间 作者链 W； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130

uS12

物种未注明

UniProt F2Z602

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 X； UniProt 1–145 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 X 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 X 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 X 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 X 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 X 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 X 2–145（144 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 X 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 X 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 X 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 X 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 X 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 X 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 X 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 X 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 X 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 X 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 F2Z602_KLULA
Isoform —
PDB实体 27
链与序列区间 作者链 X； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145

eS24

物种未注明

UniProt Q6CU44

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 Y； UniProt 1–135 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 Y 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 Y 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 Y 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 Y 2–135（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 Y 2–135（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 Y 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 Y 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 Y 2–135（134 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 Y 2–135（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 Y 1–135（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 Y 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 Y 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 Y 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 Y 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 Y 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 Y 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 Y 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 Y 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 Y 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 Y 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q6CU44_KLULA
Isoform —
PDB实体 28
链与序列区间 作者链 Y； PDB构建体 1–135； UniProt 1–135

eS25

物种未注明

UniProt Q6CW78

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 Z； UniProt 1–108 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 Z 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 Z 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 Z 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 Z 36–105（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 Z 36–105（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 Z 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 Z 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 Z 36–105（70 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 Z 36–105（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 Z 1–108（108 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 Z 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 Z 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 Z 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 Z 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 Z 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 Z 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 Z 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 Z 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 Z 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 Z 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q6CW78_KLULA
Isoform —
PDB实体 29
链与序列区间 作者链 Z； PDB构建体 1–108； UniProt 1–108

eS26

物种未注明

UniProt Q6CS01

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 a； UniProt 1–119 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 a 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 a 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 a 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 a 1–100（100 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 a 1–100（100 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 a 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 a 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 a 2–99（98 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 a 2–99（98 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 a 1–119（119 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 a 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 a 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 a 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 a 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 a 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 a 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 a 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 a 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 a 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 a 1–103（103 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q6CS01_KLULA
Isoform —
PDB实体 30
链与序列区间 作者链 a； PDB构建体 1–119； UniProt 1–119

eS27

物种未注明

UniProt Q6CNL2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 b； UniProt 1–82 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 b 1–82（82 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 b 1–82（82 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 b 1–82（82 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 b 1–82（82 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 b 1–82（82 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 b 1–82（82 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 b 1–82（82 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 b 2–82（81 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 b 2–82（81 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 b 1–82（82 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 b 1–82（82 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 b 1–82（82 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 b 1–82（82 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 b 1–82（82 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 b 1–82（82 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 b 1–82（82 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 b 1–82（82 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 b 1–82（82 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 b 1–82（82 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 b 1–82（82 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q6CNL2_KLULA
Isoform —
PDB实体 31
链与序列区间 作者链 b； PDB构建体 1–82； UniProt 1–82

eS28

物种未注明

UniProt P33285

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 c； UniProt 1–67 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 c 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 c 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 c 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 c 5–67（63 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 c 5–67（63 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 c 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 c 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 c 6–67（62 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 c 6–67（62 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 c 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 c 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 c 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 c 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 c 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 c 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 c 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 c 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 c 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 c 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 c 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RS28_KLULA
Isoform —
PDB实体 32
链与序列区间 作者链 c； PDB构建体 1–67； UniProt 1–67

uS14

物种未注明

UniProt Q6CPG3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 d； UniProt 1–56 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 d 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 d 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 d 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 d 4–56（53 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 d 4–56（53 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 d 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 d 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 d 4–56（53 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 d 4–56（53 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 d 1–56（56 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 d 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 d 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 d 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 d 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 d 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 d 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 d 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 d 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 d 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 d 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RS29_KLULA
Isoform —
PDB实体 33
链与序列区间 作者链 d； PDB构建体 1–56； UniProt 1–56

eS30

物种未注明

UniProt Q6CUH5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 e； UniProt 1–63 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 e 1–63（63 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 e 1–63（63 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 e 1–63（63 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 e 9–63（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 e 9–63（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 e 1–63（63 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 e 1–63（63 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 e 4–61（58 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 e 4–61（58 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 e 1–63（63 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 e 1–63（63 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 e 1–63（63 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 e 1–63（63 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 e 1–63（63 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 e 1–63（63 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 e 1–63（63 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 e 1–63（63 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 e 1–63（63 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 e 1–63（63 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 e 1–63（63 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q6CUH5_KLULA
Isoform —
PDB实体 34
链与序列区间 作者链 e； PDB构建体 1–63； UniProt 1–63

eS31

物种未注明

UniProt P69061

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 f； UniProt 1–150 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 f 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 f 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 f 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 f 82–150（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 f 82–150（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 f 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 f 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 f 82–150（69 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 f 82–150（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 f 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 f 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 f 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 f 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 f 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 f 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 f 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 f 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 f 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 f 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 f 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RS27A_KLULA
Isoform —
PDB实体 35
链与序列区间 作者链 f； PDB构建体 1–150； UniProt 1–150

RACK1

物种未注明

UniProt Q6CNI7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 g； UniProt 1–326 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 g 1–326（326 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 g 1–326（326 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 g 1–326（326 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 g 3–326（324 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5IT9 Structure of the yeast Kluyveromyces lactis small ribosomal subunit in complex with the cricket paralysis virus IRES. 提交 2016-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 g 3–326（324 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 g 1–326（326 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 g 1–326（326 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 g 3–326（324 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 g 3–326（324 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6UZ7 K.lactis 80S ribosome with p/PE tRNA and eIF5B 提交 2019-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 g 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 g 1–326（326 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 g 1–326（326 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 g 1–326（326 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 g 1–326（326 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 g 1–326（326 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 g 1–326（326 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 g 1–326（326 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 g 1–326（326 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 g 1–326（326 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 g 1–326（326 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

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UniProt名称 Q6CNI7_KLULA
Isoform —
PDB实体 36
链与序列区间 作者链 g； PDB构建体 1–326； UniProt 1–326

eL41

物种未注明

UniProt P0CX86

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 h； UniProt 1–25 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J6X S. cerevisiae 80S ribosome bound with Taura syndrome virus (TSV) IRES, 5 degree rotation (Class II) 提交 2014-04-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：80-meric
链 81 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 45 mM HEPES/KOH, 10 mM MgCl2, 100 mM KCl, 2.5 mM spermine, 2 mM BME, 0.5 U/uL RNasin；pH 7.5；45 mM HEPES/KOH, 10 mM MgCl2, 100 mM KCl, 2.5 mM spermine, 2 mM BME, 0.5 U/uL RNasin
cryo-EM玻璃化条件 Fresh glow discharge, 7 second blot；冷冻剂 ETHANE；Fresh glow discharge, 7 second blot before plunging into liquid ehtane (FEI VITROBOT MARK II).
分辨率 6.10 Å
3J6Y S. cerevisiae 80S ribosome bound with Taura syndrome virus (TSV) IRES, 2 degree rotation (Class I) 提交 2014-04-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：80-meric
链 81 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 45 mM HEPES/KOH, 10 mM MgCl2, 100 mM KCl, 2.5 mM spermine, 2 mM BME, 0.5 U/uL RNasin；pH 7.5；45 mM HEPES/KOH, 10 mM MgCl2, 100 mM KCl, 2.5 mM spermine, 2 mM BME, 0.5 U/uL RNasin
cryo-EM玻璃化条件 Fresh glow discharge, 7 second blot；冷冻剂 ETHANE；Fresh glow discharge, 7 second blot before plunging into liquid ehtane (FEI VITROBOT MARK II).
分辨率 6.10 Å
3J77 Structures of yeast 80S ribosome-tRNA complexes in the rotated and non-rotated conformations (Class II - rotated ribosome with 1 tRNA) 提交 2014-05-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 91 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris-HCl, 50 mM NH4Cl, 20 mM MgCl2；pH 7.5；20 mM Tris-HCl, 50 mM NH4Cl, 20 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II)
分辨率 6.20 Å
3J78 Structures of yeast 80S ribosome-tRNA complexes in the rotated and non-rotated conformations (Class I - non-rotated ribosome with 2 tRNAs) 提交 2014-05-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：84-meric
链 91 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris-HCl, 50 mM NH4Cl, 20 mM MgCl2；pH 7.5；20 mM Tris-HCl, 50 mM NH4Cl, 20 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II)
分辨率 6.30 Å
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 h 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 h 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 h 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
4U3M Crystal structure of Anisomycin bound to the yeast 80S ribosome 提交 2014-07-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：79-meric
链 Q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 678 OHX osmium (III) hexammine × 558 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.00 Å R-free 0.245
4U3M Crystal structure of Anisomycin bound to the yeast 80S ribosome 提交 2014-07-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 732 OHX osmium (III) hexammine × 575 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.00 Å R-free 0.245
4U3N Crystal structure of CCA trinucleotide bound to the yeast 80S ribosome 提交 2014-07-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：80-meric
链 Q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 677 OHX osmium (III) hexammine × 558 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.20 Å R-free 0.237
4U3N Crystal structure of CCA trinucleotide bound to the yeast 80S ribosome 提交 2014-07-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 731 OHX osmium (III) hexammine × 575 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.20 Å R-free 0.237
4U3U Crystal structure of Cycloheximide bound to the yeast 80S ribosome 提交 2014-07-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：79-meric
链 Q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 678 OHX osmium (III) hexammine × 558 ZN ZINC ION × 8 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 2.90 Å R-free 0.245
4U3U Crystal structure of Cycloheximide bound to the yeast 80S ribosome 提交 2014-07-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 730 OHX osmium (III) hexammine × 575 ZN ZINC ION × 8 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 2.90 Å R-free 0.245
4U4N Crystal structure of Edeine bound to the yeast 80S ribosome 提交 2014-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：79-meric
链 Q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 676 OHX osmium (III) hexammine × 557 EDE EDEINE B × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.10 Å R-free 0.252
4U4N Crystal structure of Edeine bound to the yeast 80S ribosome 提交 2014-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 730 OHX osmium (III) hexammine × 574 EDE EDEINE B × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.10 Å R-free 0.252
4U4O Crystal structure of Geneticin bound to the yeast 80S ribosome 提交 2014-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：79-meric
链 Q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 678 OHX osmium (III) hexammine × 556 GET GENETICIN × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.60 Å R-free 0.267
4U4O Crystal structure of Geneticin bound to the yeast 80S ribosome 提交 2014-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 732 OHX osmium (III) hexammine × 575 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.60 Å R-free 0.267
4U4Q Crystal structure of Homoharringtonine bound to the yeast 80S ribosome 提交 2014-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：79-meric
链 Q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 678 OHX osmium (III) hexammine × 558 ZN ZINC ION × 8 HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.00 Å R-free 0.255
4U4Q Crystal structure of Homoharringtonine bound to the yeast 80S ribosome 提交 2014-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 733 OHX osmium (III) hexammine × 575 ZN ZINC ION × 8 HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.00 Å R-free 0.255
4U4R Crystal structure of Lactimidomycin bound to the yeast 80S ribosome 提交 2014-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：79-meric
链 Q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 678 OHX osmium (III) hexammine × 558 ZN ZINC ION × 8 3H3 4-{(2R,5S,6E)-2-hydroxy-5-methyl-7-[(2R,3S,4E,6Z,10E)-3-methyl-12-oxooxacyclododeca-4,6,10-trien-2-yl]-4-oxooct-6-en-1-yl}piperidine-2,6-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 2.80 Å R-free 0.246
4U4R Crystal structure of Lactimidomycin bound to the yeast 80S ribosome 提交 2014-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 730 OHX osmium (III) hexammine × 575 ZN ZINC ION × 8 3H3 4-{(2R,5S,6E)-2-hydroxy-5-methyl-7-[(2R,3S,4E,6Z,10E)-3-methyl-12-oxooxacyclododeca-4,6,10-trien-2-yl]-4-oxooct-6-en-1-yl}piperidine-2,6-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 2.80 Å R-free 0.246
4U4U Crystal structure of Lycorine bound to the yeast 80S ribosome 提交 2014-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：79-MERIC
链 Q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 679 OHX osmium (III) hexammine × 557 ZN ZINC ION × 8 3KD (1S,2S,12bS,12cS)-2,4,5,7,12b,12c-hexahydro-1H-[1,3]dioxolo[4,5-j]pyrrolo[3,2,1-de]phenanthridine-1,2-diol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.00 Å R-free 0.259
4U4U Crystal structure of Lycorine bound to the yeast 80S ribosome 提交 2014-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-MERIC
链 q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 733 OHX osmium (III) hexammine × 576 ZN ZINC ION × 8 3KD (1S,2S,12bS,12cS)-2,4,5,7,12b,12c-hexahydro-1H-[1,3]dioxolo[4,5-j]pyrrolo[3,2,1-de]phenanthridine-1,2-diol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.00 Å R-free 0.259
4U4Y Crystal structure of Pactamycin bound to the yeast 80S ribosome 提交 2014-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：79-meric
链 Q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 678 OHX osmium (III) hexammine × 556 PCY Pactamycin × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.20 Å R-free 0.245
4U4Y Crystal structure of Pactamycin bound to the yeast 80S ribosome 提交 2014-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 732 OHX osmium (III) hexammine × 574 PCY Pactamycin × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.20 Å R-free 0.245
4U4Z Crystal structure of Phyllanthoside bound to the yeast 80S ribosome 提交 2014-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：80-meric
链 Q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 677 OHX osmium (III) hexammine × 558 ZN ZINC ION × 8 3K5 3-O-acetyl-2-O-(3-O-acetyl-6-deoxy-beta-D-glucopyranosyl)-6-deoxy-1-O-{[(2R,2'S,3a'R,4''S,5''R,6'S,7a'S)-5''-methyl-4''-{[(2E)-3-phenylprop-2-enoyl]oxy}decahydrodispiro[oxirane-2,3'-[1]benzofuran-2',2''-pyran]-6'-yl]carbonyl}-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.10 Å R-free 0.252
4U4Z Crystal structure of Phyllanthoside bound to the yeast 80S ribosome 提交 2014-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：95-meric
链 q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 731 OHX osmium (III) hexammine × 575 ZN ZINC ION × 8 3K5 3-O-acetyl-2-O-(3-O-acetyl-6-deoxy-beta-D-glucopyranosyl)-6-deoxy-1-O-{[(2R,2'S,3a'R,4''S,5''R,6'S,7a'S)-5''-methyl-4''-{[(2E)-3-phenylprop-2-enoyl]oxy}decahydrodispiro[oxirane-2,3'-[1]benzofuran-2',2''-pyran]-6'-yl]carbonyl}-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.10 Å R-free 0.252
4U53 Crystal structure of Deoxynivalenol bound to the yeast 80S ribosome 提交 2014-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：79-meric
链 Q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 676 OHX osmium (III) hexammine × 556 ZN ZINC ION × 8 3J6 (3beta,7alpha)-3,7,15-trihydroxy-12,13-epoxytrichothec-9-en-8-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.30 Å R-free 0.255
4U53 Crystal structure of Deoxynivalenol bound to the yeast 80S ribosome 提交 2014-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 730 OHX osmium (III) hexammine × 574 ZN ZINC ION × 8 3J6 (3beta,7alpha)-3,7,15-trihydroxy-12,13-epoxytrichothec-9-en-8-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.30 Å R-free 0.255
4U55 Crystal structure of Cryptopleurine bound to the yeast 80S ribosome 提交 2014-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：79-MERIC
链 Q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 678 OHX osmium (III) hexammine × 557 3K8 (14aR)-2,3,6-trimethoxy-11,12,13,14,14a,15-hexahydro-9H-dibenzo[f,h]pyrido[1,2-b]isoquinoline × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.20 Å R-free 0.246
4U55 Crystal structure of Cryptopleurine bound to the yeast 80S ribosome 提交 2014-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-MERIC
链 q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 732 OHX osmium (III) hexammine × 574 3K8 (14aR)-2,3,6-trimethoxy-11,12,13,14,14a,15-hexahydro-9H-dibenzo[f,h]pyrido[1,2-b]isoquinoline × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.20 Å R-free 0.246
4U56 Crystal structure of Blasticidin S bound to the yeast 80S ribosome 提交 2014-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：80-meric
链 Q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 675 OHX osmium (III) hexammine × 558 ZN ZINC ION × 8 BLS BLASTICIDIN S × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.45 Å R-free 0.260
4U56 Crystal structure of Blasticidin S bound to the yeast 80S ribosome 提交 2014-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 732 OHX osmium (III) hexammine × 574 ZN ZINC ION × 8 BLS BLASTICIDIN S × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.45 Å R-free 0.260
4V88 The structure of the eukaryotic ribosome at 3.0 A resolution. 提交 2011-10-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：79-meric
链 Bn 1–25（25 aa）
未记录 OHX osmium (III) hexammine × 657 MG MAGNESIUM ION × 1035 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.00 Å R-free 0.229
4V88 The structure of the eukaryotic ribosome at 3.0 A resolution. 提交 2011-10-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 Dn 1–25（25 aa）
未记录 OHX osmium (III) hexammine × 688 MG MAGNESIUM ION × 1170 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.00 Å R-free 0.229
4V8T Cryo-EM Structure of the 60S Ribosomal Subunit in Complex with Arx1 and Rei1 提交 2012-08-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：50-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES-NAOH PH 8.0, 50 MM NACL, 5 MM BETA- MERCAPTOETHANOL, 5 MM MGCL2；pH 8；20 MM HEPES-NAOH PH 8.0, 50 MM NACL, 5 MM BETA- MERCAPTOETHANOL, 5 MM MGCL2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；PLUNGE FREEZING IN LIQUID ETHANE AFTER MANUAL BLOTTING USING A MANUAL PLUNGE FREEZING DEVICE
分辨率 8.10 Å
5DAT Complex of yeast 80S ribosome with hypusine-containing eIF5A 提交 2015-08-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-MERIC
链 q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 580 OHX osmium (III) hexammine × 601 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；Tris-acetate pH7.0, potassium thiocyanate, magnesium acetate, glycerol, spermidine, PEG 20000
分辨率 3.15 Å R-free 0.252
5DAT Complex of yeast 80S ribosome with hypusine-containing eIF5A 提交 2015-08-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：86-MERIC
链 Q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 528 OHX osmium (III) hexammine × 565 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；Tris-acetate pH7.0, potassium thiocyanate, magnesium acetate, glycerol, spermidine, PEG 20000
分辨率 3.15 Å R-free 0.252
5DC3 Complex of yeast 80S ribosome with non-modified eIF5A 提交 2015-08-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 Q1 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；Tris-acetate pH7.0, potassium thiocyanate, magnesium acetate, glycerol, spermidine, PEG 20000
分辨率 3.25 Å R-free 0.301
5DC3 Complex of yeast 80S ribosome with non-modified eIF5A 提交 2015-08-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：81-meric
链 q1 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；Tris-acetate pH7.0, potassium thiocyanate, magnesium acetate, glycerol, spermidine, PEG 20000
分辨率 3.25 Å R-free 0.301
5DGE Coping with proline stalling: structural basis of hypusine-induced protein synthesis by the eukaryotic ribosome 提交 2015-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 155 PDB 声明：165-meric
链 Q1 1–25（25 aa）
链 q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1093 OHX osmium (III) hexammine × 1169 ZN ZINC ION × 16 SPS SPARSOMYCIN × 2 PRO PROLINE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；Tris-acetate pH7.0, potassium thiocyanate, magnesium acetate, glycerol, spermidine, PEG 20000
分辨率 3.45 Å R-free 0.263
5DGF Complex of yeast 80S ribosome with hypusine-containing/non-modified eIF5A and/or a peptidyl-tRNA analog 提交 2015-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：TRIMERIC
链 Q1 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 SPS SPARSOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 OHX osmium (III) hexammine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；Tris-acetate pH7.0, potassium thiocyanate, magnesium acetate, glycerol, spermidine, PEG 20000
分辨率 3.30 Å R-free 0.310
5DGF Complex of yeast 80S ribosome with hypusine-containing/non-modified eIF5A and/or a peptidyl-tRNA analog 提交 2015-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：TRIMERIC
链 q1 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 SPS SPARSOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 8 OHX osmium (III) hexammine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；Tris-acetate pH7.0, potassium thiocyanate, magnesium acetate, glycerol, spermidine, PEG 20000
分辨率 3.30 Å R-free 0.310
5DGV Complex of yeast 80S ribosome with hypusine-containing/non-modified eIF5A and/or a peptidyl-tRNA analog 提交 2015-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：81-MERIC
链 q1 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 SPS SPARSOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；Tris-acetate pH7.0, potassium thiocyanate, magnesium acetate, glycerol, spermidine, PEG 20000
分辨率 3.10 Å R-free 0.284
5DGV Complex of yeast 80S ribosome with hypusine-containing/non-modified eIF5A and/or a peptidyl-tRNA analog 提交 2015-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-MERIC
链 Q1 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 SPS SPARSOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；Tris-acetate pH7.0, potassium thiocyanate, magnesium acetate, glycerol, spermidine, PEG 20000
分辨率 3.10 Å R-free 0.284
5FCI Structure of the vacant uL3 W255C mutant 80S yeast ribosome 提交 2015-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：79-meric
链 Q1 1–25（25 aa）
未记录 OHX osmium (III) hexammine × 874 MG MAGNESIUM ION × 994 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；Tris-Acetate pH 7.0, KSCN, Mg-Acetate, Glycerol, Spermidine, PEG20000
分辨率 3.40 Å R-free 0.284
5FCI Structure of the vacant uL3 W255C mutant 80S yeast ribosome 提交 2015-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 q1 1–25（25 aa）
未记录 OHX osmium (III) hexammine × 561 MG MAGNESIUM ION × 626 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；Tris-Acetate pH 7.0, KSCN, Mg-Acetate, Glycerol, Spermidine, PEG20000
分辨率 3.40 Å R-free 0.284
5FCJ Structure of the anisomycin-containing uL3 W255C mutant 80S yeast ribosome 提交 2015-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：82-meric
链 q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 517 OHX osmium (III) hexammine × 534 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；Tris-Acetate pH7.0, KSCN, Mg-Acetate, Glycerol, Spermidine, PEG20000
分辨率 3.10 Å R-free 0.291
5FCJ Structure of the anisomycin-containing uL3 W255C mutant 80S yeast ribosome 提交 2015-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：79-meric
链 Q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 462 OHX osmium (III) hexammine × 500 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；Tris-Acetate pH7.0, KSCN, Mg-Acetate, Glycerol, Spermidine, PEG20000
分辨率 3.10 Å R-free 0.291
5GAK Yeast 60S ribosomal subunit with A-site tRNA, P-site tRNA and eIF-5A 提交 2015-12-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：49-meric
链 p 1–25（25 aa）
未记录 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Details can be retrieved from EMD-3227
分辨率 3.88 Å
5I4L Crystal structure of Amicoumacin A bound to the yeast 80S ribosome 提交 2016-02-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：79-meric
链 Q1 1–25（25 aa）
未记录 OHX osmium (III) hexammine × 481 MG MAGNESIUM ION × 493 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.10 Å R-free 0.251
5I4L Crystal structure of Amicoumacin A bound to the yeast 80S ribosome 提交 2016-02-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 q1 1–25（25 aa）
未记录 OHX osmium (III) hexammine × 512 MG MAGNESIUM ION × 526 ZN ZINC ION × 8 UAM Amicoumacin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.10 Å R-free 0.251
5IT7 Structure of the Kluyveromyces lactis 80S ribosome in complex with the cricket paralysis virus IRES and eEF2 提交 2016-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 nn 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 6EM (2S)-1-amino-N,N,N-trimethyl-1-oxobutan-2-aminium × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5JUO Saccharomyces cerevisiae 80S ribosome bound with elongation factor eEF2-GDP-sordarin and Taura Syndrome Virus IRES, Structure I (fully rotated 40S subunit) 提交 2016-05-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 SA 1–25（25 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO1 [1R-(1.ALPHA.,3A.BETA.,4.BETA.,4A.BETA.,7.BETA.,7A.ALPHA.,8A.BETA.)]8A-[(6-DEOXY-4-O-METHYL-BETA-D-ALTROPYRANOSYLOXY)METHYL]-4-FORMYL-4,4A,5,6,7,7A,8,8A-OCTAHYDRO-7-METHYL-3-(1-METHYLETHYL)-1,4-METHANO-S-INDACENE-3A(1H)-CARBOXYLIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
5JUP Saccharomyces cerevisiae 80S ribosome bound with elongation factor eEF2-GDP-sordarin and Taura Syndrome Virus IRES, Structure II (mid-rotated 40S subunit) 提交 2016-05-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 SA 1–25（25 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO1 [1R-(1.ALPHA.,3A.BETA.,4.BETA.,4A.BETA.,7.BETA.,7A.ALPHA.,8A.BETA.)]8A-[(6-DEOXY-4-O-METHYL-BETA-D-ALTROPYRANOSYLOXY)METHYL]-4-FORMYL-4,4A,5,6,7,7A,8,8A-OCTAHYDRO-7-METHYL-3-(1-METHYLETHYL)-1,4-METHANO-S-INDACENE-3A(1H)-CARBOXYLIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
5JUS Saccharomyces cerevisiae 80S ribosome bound with elongation factor eEF2-GDP-sordarin and Taura Syndrome Virus IRES, Structure III (mid-rotated 40S subunit) 提交 2016-05-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 SA 1–25（25 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO1 [1R-(1.ALPHA.,3A.BETA.,4.BETA.,4A.BETA.,7.BETA.,7A.ALPHA.,8A.BETA.)]8A-[(6-DEOXY-4-O-METHYL-BETA-D-ALTROPYRANOSYLOXY)METHYL]-4-FORMYL-4,4A,5,6,7,7A,8,8A-OCTAHYDRO-7-METHYL-3-(1-METHYLETHYL)-1,4-METHANO-S-INDACENE-3A(1H)-CARBOXYLIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
分辨率 4.20 Å
5JUT Saccharomyces cerevisiae 80S ribosome bound with elongation factor eEF2-GDP-sordarin and Taura Syndrome Virus IRES, Structure IV (almost non-rotated 40S subunit) 提交 2016-05-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 SA 1–25（25 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO1 [1R-(1.ALPHA.,3A.BETA.,4.BETA.,4A.BETA.,7.BETA.,7A.ALPHA.,8A.BETA.)]8A-[(6-DEOXY-4-O-METHYL-BETA-D-ALTROPYRANOSYLOXY)METHYL]-4-FORMYL-4,4A,5,6,7,7A,8,8A-OCTAHYDRO-7-METHYL-3-(1-METHYLETHYL)-1,4-METHANO-S-INDACENE-3A(1H)-CARBOXYLIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
5JUU Saccharomyces cerevisiae 80S ribosome bound with elongation factor eEF2-GDP-sordarin and Taura Syndrome Virus IRES, Structure V (least rotated 40S subunit) 提交 2016-05-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：83-meric
链 SA 1–25（25 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO1 [1R-(1.ALPHA.,3A.BETA.,4.BETA.,4A.BETA.,7.BETA.,7A.ALPHA.,8A.BETA.)]8A-[(6-DEOXY-4-O-METHYL-BETA-D-ALTROPYRANOSYLOXY)METHYL]-4-FORMYL-4,4A,5,6,7,7A,8,8A-OCTAHYDRO-7-METHYL-3-(1-METHYLETHYL)-1,4-METHANO-S-INDACENE-3A(1H)-CARBOXYLIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
5LYB Crystal structure of the S.cerevisiae 80S ribosome in complex with the A-site bound aminoacyl-tRNA analog ACCPmn 提交 2016-09-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：80-meric
链 Q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1026 OHX osmium (III) hexammine × 659 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；277 K；Tris-Acetate pH 7.0, KSCN, MgOAc2, glycerol, spermidine, PEG20K
分辨率 3.25 Å R-free 0.249
5LYB Crystal structure of the S.cerevisiae 80S ribosome in complex with the A-site bound aminoacyl-tRNA analog ACCPmn 提交 2016-09-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1166 OHX osmium (III) hexammine × 686 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；277 K；Tris-Acetate pH 7.0, KSCN, MgOAc2, glycerol, spermidine, PEG20K
分辨率 3.25 Å R-free 0.249
5MC6 Cryo-EM structure of a native ribosome-Ski2-Ski3-Ski8 complex from S. cerevisiae 提交 2016-11-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 AS 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
5NDG Crystal structure of geneticin (G418) bound to the yeast 80S ribosome 提交 2017-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：79-meric
链 Q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 597 GET GENETICIN × 9 ZN ZINC ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.70 Å R-free 0.253
5NDG Crystal structure of geneticin (G418) bound to the yeast 80S ribosome 提交 2017-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：80-meric
链 q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 624 GET GENETICIN × 12 ZN ZINC ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.70 Å R-free 0.253
5NDW Crystal structure of aminoglycoside TC007 bound to the yeast 80S ribosome 提交 2017-03-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：79-meric
链 q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 671 8UZ TC007 × 10 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.70 Å R-free 0.235
5NDW Crystal structure of aminoglycoside TC007 bound to the yeast 80S ribosome 提交 2017-03-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：79-meric
链 Q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 694 8UZ TC007 × 15 ZN ZINC ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.70 Å R-free 0.235
5OBM Crystal structure of Gentamicin bound to the yeast 80S ribosome 提交 2017-06-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：79-MERIC
链 Q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 855 LLL (2R,3R,4R,5R)-2-((1S,2S,3R,4S,6R)-4,6-DIAMINO-3-((2R,3R,6S)-3-AMINO-6-(AMINOMETHYL)-TETRAHYDRO-2H-PYRAN-2-YLOXY)-2-HYDR OXYCYCLOHEXYLOXY)-5-METHYL-4-(METHYLAMINO)-TETRAHYDRO-2H-PYRAN-3,5-DIOL × 22 ZN ZINC ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.40 Å R-free 0.238
5OBM Crystal structure of Gentamicin bound to the yeast 80S ribosome 提交 2017-06-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：82-MERIC
链 q1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1211 LLL (2R,3R,4R,5R)-2-((1S,2S,3R,4S,6R)-4,6-DIAMINO-3-((2R,3R,6S)-3-AMINO-6-(AMINOMETHYL)-TETRAHYDRO-2H-PYRAN-2-YLOXY)-2-HYDR OXYCYCLOHEXYLOXY)-5-METHYL-4-(METHYLAMINO)-TETRAHYDRO-2H-PYRAN-3,5-DIOL × 47 ZN ZINC ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 20K, KSCN, Mg Acetate, Tris-Acetate, Glycerol, Spermidine
分辨率 3.40 Å R-free 0.238
5TBW Crystal structure of chlorolissoclimide bound to the yeast 80S ribosome 提交 2016-09-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：79-meric
链 AO 1–25（25 aa）
未记录 OHX osmium (III) hexammine × 518 MG MAGNESIUM ION × 666 7AL Chlorolissoclimide × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；Tris-acetate pH7.0, potassium thiocyanate, magnesium acetate, glycerol, spermidine, PEG 20000
分辨率 3.00 Å R-free 0.227
5TBW Crystal structure of chlorolissoclimide bound to the yeast 80S ribosome 提交 2016-09-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：80-meric
链 DP 1–25（25 aa）
未记录 OHX osmium (III) hexammine × 556 MG MAGNESIUM ION × 728 7AL Chlorolissoclimide × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；Tris-acetate pH7.0, potassium thiocyanate, magnesium acetate, glycerol, spermidine, PEG 20000
分辨率 3.00 Å R-free 0.227
5TGM Crystal structure of the S.cerevisiae 80S ribosome in complex with the A-site bound aminoacyl-tRNA analog ACCA-Pro 提交 2016-09-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 154 PDB 声明：164-meric
链 Q1 1–25（25 aa）
链 q1 1–25（25 aa）
未记录 OHX osmium (III) hexammine × 1095 MG MAGNESIUM ION × 1191 ZN ZINC ION × 16 PHE PHENYLALANINE × 2 LEU LEUCINE × 2 SPS SPARSOMYCIN × 2 8AN 3'-amino-3'-deoxyadenosine 5'-(dihydrogen phosphate) × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG20000
分辨率 3.50 Å R-free 0.312
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 h 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 h 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 h 1–25（25 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 h 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6Z6K Cryo-EM structure of yeast reconstituted Lso2 bound to 80S ribosomes 提交 2020-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：79-meric
链 Ln 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7MPI Stm1 bound vacant 80S structure isolated from cbf5-D95A 提交 2021-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：79-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 366 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
7MPJ Stm1 bound vacant 80S structure isolated from wild-type 提交 2021-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：79-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 745 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7N8B Cycloheximide bound vacant 80S structure isolated from cbf5-D95A 提交 2021-06-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：79-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 MG MAGNESIUM ION × 374 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
7NRC Structure of the yeast Gcn1 bound to a leading stalled 80S ribosome with Rbg2, Gir2, A- and P-tRNA and eIF5A 提交 2021-03-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Lp 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
7OLC Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at idle POST state 提交 2021-05-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 Ln 1–25（25 aa）
链 Lr 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 571 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7OLD Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at pe/E (TI)-POST state 提交 2021-05-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 Ln 1–25（25 aa）
链 Lr 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7RR5 Structure of ribosomal complex bound with Rbg1/Tma46 提交 2021-08-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Ln 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 286 ASP ASPARTIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
7TOO Yeast 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：48-meric
链 AL41 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7TOP Yeast 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein PR20 提交 2022-01-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：48-meric
链 AL41 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
7ZUX Collided ribosome in a disome unit from S. cerevisiae 提交 2022-05-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：80-meric
链 Em 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 86 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
7ZW0 FAP-80S Complex - Rotated state 提交 2022-05-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Lq 1–25（25 aa）
链 Lt 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 324 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 34 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
8AAF Yeast RQC complex in state G 提交 2022-07-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric
链 d 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 13 ZN ZINC ION × 7 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8AGT Yeast RQC complex in state F 提交 2022-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric
链 d 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 13 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8AGV Yeast RQC complex in state H 提交 2022-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric
链 d 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 13 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8AGW Yeast RQC complex in state D 提交 2022-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：53-meric
链 d 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 13 ZN ZINC ION × 7 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8AGX Yeast RQC complex in state with the RING domain of Ltn1 in the IN position 提交 2022-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 d 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 13 ZN ZINC ION × 7 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
8AGZ Yeast RQC complex in state with the RING domain of Ltn1 in the OUT position 提交 2022-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric
链 d 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 13 ZN ZINC ION × 7 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8BIP Structure of a yeast 80S ribosome-bound N-Acetyltransferase B complex 提交 2022-11-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 Ln 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 206 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BJQ Structure of a yeast 80S ribosome-bound N-Acetyltransferase B complex 提交 2022-11-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric
链 Ln 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 206 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8BQX Yeast 80S ribosome in complex with Map1 (conformation 2) 提交 2022-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：80-meric
链 AS 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8CAH Cryo-EM structure of native Otu2-bound ubiquitinated 43S pre-initiation complex 提交 2023-01-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：48-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8CAS Cryo-EM structure of native Otu2-bound ubiquitinated 48S initiation complex (partial) 提交 2023-01-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8CCS 80S S. cerevisiae ribosome with ligands in hybrid-1 pre-translocation (PRE-H1) complex 提交 2023-01-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 Z 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 K POTASSIUM ION × 22 SPD SPERMIDINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 1.97 Å
8CDL 80S S. cerevisiae ribosome with ligands in hybrid-2 pre-translocation (PRE-H2) complex 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 Z 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 258 K POTASSIUM ION × 21 SPD SPERMIDINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.72 Å
8CDR Translocation intermediate 2 (TI-2) of 80S S. cerevisiae ribosome with ligands and eEF2 in the presence of sordarin 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：84-meric
链 Z 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 267 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 21 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO1 [1R-(1.ALPHA.,3A.BETA.,4.BETA.,4A.BETA.,7.BETA.,7A.ALPHA.,8A.BETA.)]8A-[(6-DEOXY-4-O-METHYL-BETA-D-ALTROPYRANOSYLOXY)METHYL]-4-FORMYL-4,4A,5,6,7,7A,8,8A-OCTAHYDRO-7-METHYL-3-(1-METHYLETHYL)-1,4-METHANO-S-INDACENE-3A(1H)-CARBOXYLIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.04 Å
8EUB Hypopseudouridylated yeast 80S bound with Taura syndrome virus (TSV) internal ribosome entry site (IRES), eEF2 and GDP, Structure I 提交 2022-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 255 ZN ZINC ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.52 Å
8EVP Hypopseudouridylated yeast 80S bound with Taura syndrome virus (TSV) internal ribosome entry site (IRES), Structure I 提交 2022-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：80-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 256 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å
8EVQ Hypopseudouridylated Ribosome bound with TSV IRES, eEF2, GDP, and sordarin, Structure I 提交 2022-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 241 ZN ZINC ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO1 [1R-(1.ALPHA.,3A.BETA.,4.BETA.,4A.BETA.,7.BETA.,7A.ALPHA.,8A.BETA.)]8A-[(6-DEOXY-4-O-METHYL-BETA-D-ALTROPYRANOSYLOXY)METHYL]-4-FORMYL-4,4A,5,6,7,7A,8,8A-OCTAHYDRO-7-METHYL-3-(1-METHYLETHYL)-1,4-METHANO-S-INDACENE-3A(1H)-CARBOXYLIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.72 Å
8EVR Hypopseudouridylated yeast 80S bound with Taura syndrome virus (TSV) internal ribosome entry site (IRES), eEF2, GDP, and sordarin, Structure II 提交 2022-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 217 ZN ZINC ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 W9C (1S,3S,3aR,4S,4aR,7R,7aR,8aS)-8a-{[(6-deoxy-4-O-methyl-alpha-D-altropyranosyl)oxy]methyl}-4-formyl-7-methyl-3-(propan-2-yl)decahydro-1,4-methano-s-indacene-3a(1H)-carboxylate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.87 Å
8EVS Hypopseudouridylated yeast 80S bound with Taura syndrome virus (TSV) internal ribosome entry site (IRES), eEF2 and GDP, Structure II 提交 2022-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 254 ZN ZINC ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.62 Å
8EVT Hypopseudouridylated yeast 80S bound with Taura syndrome virus (TSV) internal ribosome entry site (IRES) refined against a composite map 提交 2022-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：80-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 272 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.20 Å
8EWB Hypopseudouridylated yeast 80S bound with Taura syndrome virus (TSV) internal ribosome entry site (IRES), eEF2 and GDP, Structure III 提交 2022-10-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 242 ZN ZINC ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.87 Å
8EWC Hypopseudouridylated yeast 80S bound with Taura syndrome virus (TSV) internal ribosome entry site (IRES), Structure II 提交 2022-10-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：80-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 247 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.45 Å
8I7J Yeast 40S-eIF4B - partially open conformation of the 40S head 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 h 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH7.4, 100 mM potassium acetate pH7.6, 2.5 mM Magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in nitrogen atmosphere.
分辨率 4.60 Å
8K2D Cryo-EM structure of the yeast 80S ribosome with tigecycline, eEF2, Stm1 and eIF5A 提交 2023-07-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 Ln 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 T1C TIGECYCLINE × 6 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8K82 Cryo-EM structure of the yeast 80S ribosome with tigecycline, Not5 and P-site tRNA 提交 2023-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 L2 1–25（25 aa）
链 Ln 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 316 T1C TIGECYCLINE × 6 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8OO0 Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 autoproteolysis product at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：85-meric
链 Ln 1–25（25 aa）
链 Lr 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8P4V 80S yeast ribosome in complex with HaterumaimideQ 提交 2023-05-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：79-meric
链 AO 1–25（25 aa）
未记录 OHX osmium (III) hexammine × 461 MG MAGNESIUM ION × 711 K POTASSIUM ION × 2 SPD SPERMIDINE × 1 X1K (3~{R})-3-[(1~{S})-2-[(1~{R},3~{S},4~{a}~{S},8~{a}~{S})-5,5,8~{a}-trimethyl-2-methylidene-3-oxidanyl-3,4,4~{a},6,7,8-hexahydro-1~{H}-naphthalen-1-yl]-1-oxidanyl-ethyl]pyrrolidine-2,5-dione × 1 ZN ZINC ION × 8 OS OSMIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；ll lissoclimides/80S complexes were formed in 5.5 mM Tris-acetate at pH 7.0, 3 mM K(OAc) at pH 7.2, 5.5 mM NH4(OAc), 2 mM Mg(OAc)2, 1.3 mM DTT by incubation of 80S ribosomes (1.5 uM) with 30-fold molar excess of lissoclimide congeners for 15 min at 30 C. Crystals were grown at 4 C by hanging-drop vapor diffusion
分辨率 3.16 Å R-free 0.251
8P4V 80S yeast ribosome in complex with HaterumaimideQ 提交 2023-05-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：80-meric
链 DP 1–25（25 aa）
未记录 OHX osmium (III) hexammine × 492 MG MAGNESIUM ION × 766 K POTASSIUM ION × 5 SPD SPERMIDINE × 1 X1K (3~{R})-3-[(1~{S})-2-[(1~{R},3~{S},4~{a}~{S},8~{a}~{S})-5,5,8~{a}-trimethyl-2-methylidene-3-oxidanyl-3,4,4~{a},6,7,8-hexahydro-1~{H}-naphthalen-1-yl]-1-oxidanyl-ethyl]pyrrolidine-2,5-dione × 1 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；ll lissoclimides/80S complexes were formed in 5.5 mM Tris-acetate at pH 7.0, 3 mM K(OAc) at pH 7.2, 5.5 mM NH4(OAc), 2 mM Mg(OAc)2, 1.3 mM DTT by incubation of 80S ribosomes (1.5 uM) with 30-fold molar excess of lissoclimide congeners for 15 min at 30 C. Crystals were grown at 4 C by hanging-drop vapor diffusion
分辨率 3.16 Å R-free 0.251
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 Lr 1–25（25 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 h 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8T2X Hypomethylated yeast 80S bound with cycloheximide, P-site tRNA, A-site tRNA, messenger RNA and eIF5A, PRE 提交 2023-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 181 K POTASSIUM ION × 23 SPD SPERMIDINE × 1 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.46 Å
8T2Y Hypomethylated yeast 80S bound with cycloheximide, P-site tRNA, and A-site tRNA, messenger RNA, PRE 提交 2023-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：81-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 197 SPD SPERMIDINE × 1 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.20 Å
8T2Z Hypomethylated yeast 80S bound with cycloheximide, P-site tRNA, and A-site tRNA, messenger RNA, POST 提交 2023-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：81-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
8T30 Hypomethylated yeast 80S bound with cycloheximide, unmodified U2921, mid rotated 提交 2023-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：78-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.88 Å
8T3A Hypomethylated yeast 80S bound with Taura syndrome virus (TSV) internal ribosome entry site (IRES), eEF2, GDP, sordarin, and hibernating factor Los2 提交 2023-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO1 [1R-(1.ALPHA.,3A.BETA.,4.BETA.,4A.BETA.,7.BETA.,7A.ALPHA.,8A.BETA.)]8A-[(6-DEOXY-4-O-METHYL-BETA-D-ALTROPYRANOSYLOXY)METHYL]-4-FORMYL-4,4A,5,6,7,7A,8,8A-OCTAHYDRO-7-METHYL-3-(1-METHYLETHYL)-1,4-METHANO-S-INDACENE-3A(1H)-CARBOXYLIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8T3B Hypomethylated yeast 80S bound with Taura syndrome virus (TSV) internal ribosome entry site (IRES), eEF2, GDP, and sordarin, Structure I 提交 2023-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO1 [1R-(1.ALPHA.,3A.BETA.,4.BETA.,4A.BETA.,7.BETA.,7A.ALPHA.,8A.BETA.)]8A-[(6-DEOXY-4-O-METHYL-BETA-D-ALTROPYRANOSYLOXY)METHYL]-4-FORMYL-4,4A,5,6,7,7A,8,8A-OCTAHYDRO-7-METHYL-3-(1-METHYLETHYL)-1,4-METHANO-S-INDACENE-3A(1H)-CARBOXYLIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.08 Å
8T3C Hypomethylated yeast 80S bound with Taura syndrome virus (TSV) internal ribosome entry site (IRES), eEF2, GDP, and sordarin, Structure II 提交 2023-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO1 [1R-(1.ALPHA.,3A.BETA.,4.BETA.,4A.BETA.,7.BETA.,7A.ALPHA.,8A.BETA.)]8A-[(6-DEOXY-4-O-METHYL-BETA-D-ALTROPYRANOSYLOXY)METHYL]-4-FORMYL-4,4A,5,6,7,7A,8,8A-OCTAHYDRO-7-METHYL-3-(1-METHYLETHYL)-1,4-METHANO-S-INDACENE-3A(1H)-CARBOXYLIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.86 Å
8T3D Hypomethylated yeast 80S bound with Taura syndrome virus (TSV) internal ribosome entry site (IRES), eEF2, GDP, and sordarin, Structure III 提交 2023-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO1 [1R-(1.ALPHA.,3A.BETA.,4.BETA.,4A.BETA.,7.BETA.,7A.ALPHA.,8A.BETA.)]8A-[(6-DEOXY-4-O-METHYL-BETA-D-ALTROPYRANOSYLOXY)METHYL]-4-FORMYL-4,4A,5,6,7,7A,8,8A-OCTAHYDRO-7-METHYL-3-(1-METHYLETHYL)-1,4-METHANO-S-INDACENE-3A(1H)-CARBOXYLIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.95 Å
8T3E Hypomethylated yeast 80S bound with Taura syndrome virus (TSV) internal ribosome entry site (IRES), eEF2, GDP, and sordarin, Structure IV 提交 2023-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO1 [1R-(1.ALPHA.,3A.BETA.,4.BETA.,4A.BETA.,7.BETA.,7A.ALPHA.,8A.BETA.)]8A-[(6-DEOXY-4-O-METHYL-BETA-D-ALTROPYRANOSYLOXY)METHYL]-4-FORMYL-4,4A,5,6,7,7A,8,8A-OCTAHYDRO-7-METHYL-3-(1-METHYLETHYL)-1,4-METHANO-S-INDACENE-3A(1H)-CARBOXYLIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8T3F Hypomethylated yeast 80S bound with Taura syndrome virus (TSV) internal ribosome entry site (IRES), eEF2, GDP, and sordarin, Structure V 提交 2023-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO1 [1R-(1.ALPHA.,3A.BETA.,4.BETA.,4A.BETA.,7.BETA.,7A.ALPHA.,8A.BETA.)]8A-[(6-DEOXY-4-O-METHYL-BETA-D-ALTROPYRANOSYLOXY)METHYL]-4-FORMYL-4,4A,5,6,7,7A,8,8A-OCTAHYDRO-7-METHYL-3-(1-METHYLETHYL)-1,4-METHANO-S-INDACENE-3A(1H)-CARBOXYLIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.09 Å
8UT0 Eukaryotic 80S ribosome with Reh1, eIF5A and A/P site tRNA 提交 2023-10-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：84-meric
链 Lp 1–25（25 aa）
未记录 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.22 Å
8UTI Eukaryotic 80S ribosome with Reh1 and A/P site tRNA 提交 2023-10-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 Lp 1–25（25 aa）
未记录 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
8XU8 State 2c(S2c) of yeast 80S ribosome bound to compact eEF2 and 2 tRNAs during peptidyl transferation 提交 2024-01-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 p 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 4.5；YPD
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8Y0U dormant ribosome with STM1 提交 2024-01-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：77-meric
链 Ln 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50mM HEPES, pH7.5, 100mM KOAc, 5mM Mg(OAc)2, 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
8YLD State 4a (S4a) of yeast 80S ribosome bound to 2 tRNAs and open eEF3 and eEF2 during translocation 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：82-meric
链 p 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 4.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8YLR State 6 (S6) of yeast 80S ribosome bound to 2 tRNAs and eEF2 and eEF3 during tranlocation 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：82-meric
链 p 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 4.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8Z70 State 1 (S1) of yeast 80S ribosome bound to 2 tRNAs during mRNA decoding 提交 2024-04-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 p 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 4.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8Z71 State 1a (S1a) of yeast 80S ribosome bound to open eEF3 and 2 tRNAs and eEF1A during mRNA decoding 提交 2024-04-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：82-meric
链 p 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 4.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8ZGR 80S ribosome with A/A tRNA and mRNA of WNV 提交 2024-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：79-meric
链 Lp 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8ZGY 80S ribosome with P/E tRNA and mRNA of WNV 提交 2024-05-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：80-meric
链 Lp 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8ZH3 80S ribosome with A/P-P/E tRNA and mRNA of WNV 提交 2024-05-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：81-meric
链 Lp 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8ZHB 80S ribosome with A/A P/E tRNA and mRNA of WNV 提交 2024-05-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：81-meric
链 Lp 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8ZHC pre-frameshift complex of yeast 80S ribosome with eRF1 and mRNA of WNV 提交 2024-05-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：82-meric
链 Lp 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
9DOV Hypopseudouridylated yeast 80S bound with Taura syndrome virus (TSV) internal ribosome entry site (IRES) and hygromycin B 提交 2024-09-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：80-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 257 HYG HYGROMYCIN B × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.49 Å
9DP7 Hypopseudouridylated yeast 80S bound with Taura syndrome virus (TSV) internal ribosome entry site (IRES) and hygromycin B, Class II 提交 2024-09-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：80-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 247 HYG HYGROMYCIN B × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å
9F9S Yeast SDD1 Disome with Mbf1 提交 2024-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 152 PDB 声明：164-meric
链 Ld 1–25（25 aa）
链 Md 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 295 ZN ZINC ION × 13 K POTASSIUM ION × 16 SPD SPERMIDINE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9I1W High resolution structure of the thermophilic 60S ribosomal subunit of Chaetomium thermophilum 提交 2025-01-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 Ln 1–25（25 aa）
链 Lr 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 2 SPM SPERMINE × 2 MG MAGNESIUM ION × 239 K POTASSIUM ION × 188 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å
9I78 Cryo-EM structure of Chaetomium thermophilum ribosome-bound SND3 translocon 提交 2025-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 Ln 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 379 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；waiting time: 15 s blot force: 0
分辨率 2.20 Å
9OFV Consensus reconstruction of the eukaryotic Ribosome-associated Quality Control complex 提交 2025-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：64-meric
链 d 1–25（25 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 12 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.16 Å
9PN5 Composite map of hypomethylated 80S ribosome treated with hygromycin B 提交 2025-07-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：78-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 174 K POTASSIUM ION × 27 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 1.75 Å

共 119 个其他 PDB 条目、146 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL41A_YEAST
Isoform —
PDB实体 37
链与序列区间 作者链 h； PDB构建体 1–25； UniProt 1–25

eIF1A

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P38912

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 i； UniProt 1–153 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 i 1–153（153 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 i 1–153（153 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 i 1–153（153 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
3WBK crystal structure analysis of eukaryotic translation initiation factor 5B and 1A complex 提交 2013-05-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 27–153（127 aa） 片段：UNP residues 27-153
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；293 K；100mM Tris-HCl pH 8.2, 12.5%(w/v) PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.317
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 i 1–153（153 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 i 1–153（153 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 i 21–115（95 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 i 5–115（111 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6ZCE Structure of a yeast ABCE1-bound 43S pre-initiation complex 提交 2020-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：45-meric
链 i 1–153（153 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
6ZU9 Structure of a yeast ABCE1-bound 48S initiation complex 提交 2020-07-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：44-meric
链 A 1–153（153 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.20 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 i 1–153（153 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 i 1–153（153 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 i 1–153（153 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 i 1–153（153 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 i 1–153（153 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 i 1–153（153 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 i 1–153（153 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 i 1–153（153 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 i 1–153（153 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 19 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 IF1A_YEAST
Isoform —
PDB实体 38
链与序列区间 作者链 i； PDB构建体 1–153； UniProt 1–153

eIF2 alpha

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P20459

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 j； UniProt 1–304 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1Q46 crystal structure of the eIF2 alpha subunit from saccharomyces cerevisia 提交 2003-08-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–176（175 aa） 片段：N-terminal two thirds of eIF2a
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；0.1 M sodium acetate (pH=4.6), 1.8-2.5 M sodium formate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.86 Å R-free 0.236
2A19 PKR kinase domain- eIF2alpha- AMP-PNP complex. 提交 2005-06-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 4–176（173 aa） 片段：eIF2alpha
突变：residues 4-175 MG MAGNESIUM ION × 4 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å R-free 0.286
2A1A PKR kinase domain-eIF2alpha Complex 提交 2005-06-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 4–176（173 aa）
突变：residue 258-551 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；pH 8
分辨率 2.80 Å R-free 0.268
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 j 1–300（300 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 j 1–304（304 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 j 1–304（304 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 j 3–265（263 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 j 3–265（263 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6I3M eIF2B:eIF2 complex, phosphorylated on eIF2 alpha serine 52. 提交 2018-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 K 1–304（304 aa）
链 L 1–304（304 aa）
突变：serine 52 to SEP 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：serine 52 to SEP 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solutions for sample preparation were made fresh, filter sterilized, and degassed.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 2 seconds before plunging
分辨率 3.93 Å
6I7T eIF2B:eIF2 complex 提交 2018-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 K 1–304（304 aa）
链 L 1–304（304 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solutions for sample preparation were made fresh, filter sterilized, and degassed.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 1 second before plunging
分辨率 4.61 Å
6JLY eIF2a - eIF2B complex 提交 2019-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–304（304 aa）
链 M 1–304（304 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；sodium acetate, sodium citrate, PEG 4000, glycerol
分辨率 3.50 Å R-free 0.260
6JLZ P-eIF2a - eIF2B complex 提交 2019-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–304（304 aa）
链 M 1–304（304 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） PO4 PHOSPHATE ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；sodium acetate, sodium citrate, PEG 4000, glycerol
分辨率 3.35 Å R-free 0.253
6QG0 Structure of eIF2B-eIF2 (phosphorylated at Ser51) complex (model 1) 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 K 1–304（304 aa）
链 L 1–304（304 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.15 Å
6QG1 Structure of eIF2B-eIF2 (phosphorylated at Ser51) complex (model 2) 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 K 1–304（304 aa）
链 L 1–304（304 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6QG2 Structure of eIF2B-eIF2 (phosphorylated at Ser51) complex (model A) 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 K 1–304（304 aa）
链 L 1–304（304 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.55 Å
6QG3 Structure of eIF2B-eIF2 (phosphorylated at Ser51) complex (model B) 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 K 1–304（304 aa）
链 L 1–304（304 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.40 Å
6QG5 Structure of eIF2B-eIF2 (phosphorylated at Ser51) complex (model C) 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 K 1–304（304 aa）
链 L 1–304（304 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.10 Å
6QG6 Structure of eIF2B-eIF2 (phosphorylated at Ser51) complex (model D) 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 K 1–304（304 aa）
链 L 1–304（304 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.40 Å
8QEL PKR kinase domain- eIF2alpha in complex with compound 提交 2023-08-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 4–176（173 aa）
未记录 UH3 (3~{Z})-3-[(4-methyl-1~{H}-imidazol-5-yl)methylidene]-2-oxidanylidene-1~{H}-indole-5-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MOPS pH 7.5, 10% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate
分辨率 2.45 Å R-free 0.278
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 j 1–304（304 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 j 1–304（304 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 j 1–304（304 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 j 1–304（304 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 j 1–304（304 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 j 1–304（304 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 j 1–304（304 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 j 1–304（304 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 j 1–304（304 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 28 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 IF2A_YEAST
Isoform —
PDB实体 39
链与序列区间 作者链 j； PDB构建体 1–304； UniProt 1–304

eIF2 gamma

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P32481

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 k； UniProt 1–527 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 k 1–527（527 aa）
突变：U31:A39 double mutation MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
4ZGN Structure Cdc123 complexed with the C-terminal domain of eIF2gamma 提交 2015-04-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 410–527（118 aa） 片段：residues 410-527
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；25%PEG3350, 0.2MLiSO4, 0.1M TrispH8.0
分辨率 2.90 Å R-free 0.262
4ZGQ Structure of Cdc123 bound to eIF2-gammaDIII domain 提交 2015-04-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 410–527（118 aa） 片段：UNP residues 410-527
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；25%PEG3350, 0.2M LISO4, 0.1M Tris pH 8.0
分辨率 3.00 Å R-free 0.252
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 k 1–527（527 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 k 1–527（527 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 k 90–519（430 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 k 90–519（430 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6I3M eIF2B:eIF2 complex, phosphorylated on eIF2 alpha serine 52. 提交 2018-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 O 1–527（527 aa）
链 P 1–527（527 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solutions for sample preparation were made fresh, filter sterilized, and degassed.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 2 seconds before plunging
分辨率 3.93 Å
6I7T eIF2B:eIF2 complex 提交 2018-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 O 1–527（527 aa）
链 P 1–527（527 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solutions for sample preparation were made fresh, filter sterilized, and degassed.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 1 second before plunging
分辨率 4.61 Å
6QG0 Structure of eIF2B-eIF2 (phosphorylated at Ser51) complex (model 1) 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 M 1–527（527 aa）
链 N 1–527（527 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.15 Å
6QG1 Structure of eIF2B-eIF2 (phosphorylated at Ser51) complex (model 2) 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 M 1–527（527 aa）
链 N 1–527（527 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6QG2 Structure of eIF2B-eIF2 (phosphorylated at Ser51) complex (model A) 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 M 1–527（527 aa）
链 N 1–527（527 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.55 Å
6QG3 Structure of eIF2B-eIF2 (phosphorylated at Ser51) complex (model B) 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 M 1–527（527 aa）
链 N 1–527（527 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.40 Å
6QG5 Structure of eIF2B-eIF2 (phosphorylated at Ser51) complex (model C) 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 M 1–527（527 aa）
链 N 1–527（527 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.10 Å
6QG6 Structure of eIF2B-eIF2 (phosphorylated at Ser51) complex (model D) 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 M 1–527（527 aa）
链 N 1–527（527 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.40 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 k 1–527（527 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 k 1–527（527 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 k 1–527（527 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 k 1–519（519 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 k 1–527（527 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 k 1–527（527 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 k 1–527（527 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 k 1–527（527 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 k 1–527（527 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 24 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 IF2G_YEAST
Isoform —
PDB实体 40
链与序列区间 作者链 k； PDB构建体 1–527； UniProt 1–527

eIF2 beta

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P09064

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 l； UniProt 1–285 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 l 1–285（285 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 l 1–285（285 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 l 1–285（285 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 l 127–270（144 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 l 127–270（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6I3M eIF2B:eIF2 complex, phosphorylated on eIF2 alpha serine 52. 提交 2018-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 M 1–285（285 aa）
链 N 1–285（285 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solutions for sample preparation were made fresh, filter sterilized, and degassed.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 2 seconds before plunging
分辨率 3.93 Å
6I7T eIF2B:eIF2 complex 提交 2018-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 M 1–285（285 aa）
链 N 1–285（285 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solutions for sample preparation were made fresh, filter sterilized, and degassed.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 1 second before plunging
分辨率 4.61 Å
6QG0 Structure of eIF2B-eIF2 (phosphorylated at Ser51) complex (model 1) 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 O 1–285（285 aa）
链 P 1–285（285 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.15 Å
6QG1 Structure of eIF2B-eIF2 (phosphorylated at Ser51) complex (model 2) 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 O 1–285（285 aa）
链 P 1–285（285 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6QG2 Structure of eIF2B-eIF2 (phosphorylated at Ser51) complex (model A) 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 O 1–285（285 aa）
链 P 1–285（285 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.55 Å
6QG3 Structure of eIF2B-eIF2 (phosphorylated at Ser51) complex (model B) 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 O 1–285（285 aa）
链 P 1–285（285 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.40 Å
6QG5 Structure of eIF2B-eIF2 (phosphorylated at Ser51) complex (model C) 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 O 1–285（285 aa）
链 P 1–285（285 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.10 Å
6QG6 Structure of eIF2B-eIF2 (phosphorylated at Ser51) complex (model D) 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 O 1–285（285 aa）
链 P 1–285（285 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.40 Å
8RW1 Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation 提交 2024-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 l 1–285（285 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8S8D Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 l 1–285（285 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 l 1–285（285 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 l 1–285（285 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8G Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 l 1–285（285 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8H Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-2.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 l 1–285（285 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 l 1–285（285 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8J Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF5) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 l 1–285（285 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 115 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 l 1–270（270 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9F79 Crystal structure of the S. cerevisiae eIF2beta N-terminal tail bound to the C-terminal domain of eIF5 提交 2024-05-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 39–106（68 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；283 K；0.4 M (NH4)2SO4, 0.08 M Li2SO4
分辨率 2.00 Å R-free 0.228

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 IF2B_YEAST
Isoform —
PDB实体 41
链与序列区间 作者链 l； PDB构建体 1–285； UniProt 1–285

eIF1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P32911

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 m； UniProt 1–108 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2OGH Solution structure of yeast eIF1 提交 2007-01-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–108（108 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）300mM NaCl；压力 1
NMR样品组成 50mM sodium phosphate, 300mM NaCl, 5mM bME, pH 7.2, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
2RVH NMR structure of eIF1 提交 2015-10-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–108（108 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）170；压力 ambient
NMR样品组成 0.4 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity-1, 20 mM sodium phosphate-2, 150 mM sodium chloride-3, 1 mM DTT-4, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
3J80 CryoEM structure of 40S-eIF1-eIF1A preinitiation complex 提交 2014-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 j 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 67 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 3.75 Å
3J81 CryoEM structure of a partial yeast 48S preinitiation complex 提交 2014-08-29 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 m 1–108（108 aa）
突变：S264Y MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 3 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I)
分辨率 4.00 Å
3JAM CryoEM structure of 40S-eIF1A-eIF1 complex from yeast 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：37-meric
链 j 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).
分辨率 3.46 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 m 13–108（96 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 m 19–108（90 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6ZCE Structure of a yeast ABCE1-bound 43S pre-initiation complex 提交 2020-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：45-meric
链 m 1–108（108 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
8S8F Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.2) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 m 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8S8I Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 m 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 m 1–108（108 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 11 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SUI1_YEAST
Isoform —
PDB实体 42
链与序列区间 作者链 m； PDB构建体 1–108； UniProt 1–108

eIF3a

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P38249

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 o； UniProt 1–495 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4K51 Crystal Structure of the PCI domain of eIF3a 提交 2013-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 276–494（219 aa） 片段：PCI, UNP residues 276-494
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；PEG, buffer, salt, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.65 Å R-free 0.286
4K51 Crystal Structure of the PCI domain of eIF3a 提交 2013-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 276–494（219 aa） 片段：PCI, UNP residues 276-494
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；PEG, buffer, salt, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.65 Å R-free 0.286
4U1C Crystal structure of the eIF3a/eIF3c PCI-domain heterodimer 提交 2014-07-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：Dimeric
链 A 225–495（271 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；PEG 6000, KSCN, Bis-Tris-propane
分辨率 3.50 Å R-free 0.293
4U1D Structure of the PCI domain of translation initiation factor eIF3a 提交 2014-07-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：Monomeric
链 C 1–494（494 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；PEG 3350, KSCN, Bis-Tris-propane
分辨率 3.30 Å R-free 0.204
4U1D Structure of the PCI domain of translation initiation factor eIF3a 提交 2014-07-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：Monomeric
链 B 1–494（494 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；PEG 3350, KSCN, Bis-Tris-propane
分辨率 3.30 Å R-free 0.204
4U1D Structure of the PCI domain of translation initiation factor eIF3a 提交 2014-07-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：Monomeric
链 A 1–494（494 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；PEG 3350, KSCN, Bis-Tris-propane
分辨率 3.30 Å R-free 0.204
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 o 1–964（964 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 o 1–964（964 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 o 5–492（488 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 o 5–492（488 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6ZCE Structure of a yeast ABCE1-bound 43S pre-initiation complex 提交 2020-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：45-meric
链 o 1–964（964 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
6ZU9 Structure of a yeast ABCE1-bound 48S initiation complex 提交 2020-07-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：44-meric
链 o 1–964（964 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.20 Å
8CAH Cryo-EM structure of native Otu2-bound ubiquitinated 43S pre-initiation complex 提交 2023-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：48-meric
链 o 1–964（964 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 80 ZN ZINC ION × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8CAS Cryo-EM structure of native Otu2-bound ubiquitinated 48S initiation complex (partial) 提交 2023-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 o 1–964（964 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 o 1–964（964 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å

共 12 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 EIF3A_YEAST
Isoform —
PDB实体 43
链与序列区间 作者链 o； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495

eIF3c

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P32497

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 p； UniProt 193–206 链 p； UniProt 251–812 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4U1C Crystal structure of the eIF3a/eIF3c PCI-domain heterodimer 提交 2014-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：Dimeric
链 C 247–812（566 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；PEG 6000, KSCN, Bis-Tris-propane
分辨率 3.50 Å R-free 0.293
5H7U NMR structure of eIF3 36-163 提交 2016-11-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 36–163（128 aa） 片段：UNP RESIDUES 36-163
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）170；压力 1
NMR样品组成 0.4 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] eIF3c 36-163, 20 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 q 251–812（562 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 q 251–812（562 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 q 96–794（699 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 q 96–794（699 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6ZCE Structure of a yeast ABCE1-bound 43S pre-initiation complex 提交 2020-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：45-meric
链 q 1–812（812 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
6ZU9 Structure of a yeast ABCE1-bound 48S initiation complex 提交 2020-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：44-meric
链 q 1–812（812 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.20 Å
8S8E Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in closed conformation (model py48S-AUC-3.1) 提交 2024-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 p 1–812（812 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 116 ZN ZINC ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
8S8K Structure of a yeast 48S-AUC preinitiation complex in swivelled conformation (model py48S-AUC-swiv-eIF1) 提交 2024-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：43-meric
链 n 1–812（812 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 96 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 10 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 EIF3C_YEAST
Isoform —
PDB实体 44
链与序列区间 作者链 p； PDB构建体 69–82； UniProt 193–206 作者链 p； PDB构建体 91–652； UniProt 251–812

eIF3i

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P40217

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 q； UniProt 1–347 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3b × 1 （P06103） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3ZWL Structure of eukaryotic translation initiation factor eIF3i complex with eIF3b C-terminus (655-700) 提交 2011-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–347（347 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.8；0.1 M TRIS PH 8.8, 0.1 M LI2SO4, 30% PEG4000, 8% DIAMINOPENTANE
分辨率 2.20 Å R-free 0.247
3ZWL Structure of eukaryotic translation initiation factor eIF3i complex with eIF3b C-terminus (655-700) 提交 2011-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–347（347 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.8；0.1 M TRIS PH 8.8, 0.1 M LI2SO4, 30% PEG4000, 8% DIAMINOPENTANE
分辨率 2.20 Å R-free 0.247
5A5U Structure of mammalian eIF3 in the context of the 43S preinitiation complex 提交 2015-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 1–347（347 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 100, TEMPERATURE- 120, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK IV,
分辨率 9.00 Å
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 s 1–347（347 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 s 1–342（342 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6ZCE Structure of a yeast ABCE1-bound 43S pre-initiation complex 提交 2020-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：45-meric
链 l 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
6ZU9 Structure of a yeast ABCE1-bound 48S initiation complex 提交 2020-07-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：44-meric
链 l 1–347（347 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.20 Å

共 6 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 EIF3I_YEAST
Isoform —
PDB实体 45
链与序列区间 作者链 q； PDB构建体 1–347； UniProt 1–347

eIF3b

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P06103

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 r； UniProt 704–734 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3g × 1 （A6ZZ25） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3NS5 Crystal structure of the RNA recognition motif of yeast eIF3b residues 76-161 提交 2010-07-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 76–161（86 aa） 片段：residues 76-161
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；33% PEG4000 and 0.1 M Na-citrate (pH 5.6) in a sitting drop plate at 20 degrees. 1uL of protein at the concentration of 17 mg/mL was mixed with 1 uL of reservoir, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 2.60 Å R-free 0.273
3NS5 Crystal structure of the RNA recognition motif of yeast eIF3b residues 76-161 提交 2010-07-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 76–161（86 aa） 片段：residues 76-161
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；33% PEG4000 and 0.1 M Na-citrate (pH 5.6) in a sitting drop plate at 20 degrees. 1uL of protein at the concentration of 17 mg/mL was mixed with 1 uL of reservoir, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 2.60 Å R-free 0.273
3NS6 Crystal structure of hte RNA recognition motif of yeast eIF3b residues 76-170 提交 2010-07-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 76–170（95 aa） 片段：residues 76-170
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；30% PEG4000, 200 mM Li2SO4 and 100 mM Hepes pH 8. The crystals were grown in a sitting drop at 20 degrees by mixing 1uL of protein (11 mg/mL) with 1uL of reservoir, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 1.25 Å R-free 0.168
3NS6 Crystal structure of hte RNA recognition motif of yeast eIF3b residues 76-170 提交 2010-07-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 76–170（95 aa） 片段：residues 76-170
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；30% PEG4000, 200 mM Li2SO4 and 100 mM Hepes pH 8. The crystals were grown in a sitting drop at 20 degrees by mixing 1uL of protein (11 mg/mL) with 1uL of reservoir, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 1.25 Å R-free 0.168
3NS6 Crystal structure of hte RNA recognition motif of yeast eIF3b residues 76-170 提交 2010-07-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 76–170（95 aa） 片段：residues 76-170
链 B 76–170（95 aa） 片段：residues 76-170
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；30% PEG4000, 200 mM Li2SO4 and 100 mM Hepes pH 8. The crystals were grown in a sitting drop at 20 degrees by mixing 1uL of protein (11 mg/mL) with 1uL of reservoir, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 1.25 Å R-free 0.168
3ZWL Structure of eukaryotic translation initiation factor eIF3i complex with eIF3b C-terminus (655-700) 提交 2011-08-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 693–739（47 aa） 片段：RESIDUES 693-739
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.8；0.1 M TRIS PH 8.8, 0.1 M LI2SO4, 30% PEG4000, 8% DIAMINOPENTANE
分辨率 2.20 Å R-free 0.247
3ZWL Structure of eukaryotic translation initiation factor eIF3i complex with eIF3b C-terminus (655-700) 提交 2011-08-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 693–739（47 aa） 片段：RESIDUES 693-739
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.8；0.1 M TRIS PH 8.8, 0.1 M LI2SO4, 30% PEG4000, 8% DIAMINOPENTANE
分辨率 2.20 Å R-free 0.247
4U1E Crystal structure of the eIF3b-CTD/eIF3i/eIF3g-NTD translation initiation complex 提交 2014-07-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 B 694–737（44 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；292 K；PEG 20000, PEG MME 550, imidazole, MES
分辨率 2.00 Å R-free 0.216
4U1F Crystal structure of middle domain of eukaryotic translation initiation factor eIF3b 提交 2014-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 172–665（494 aa）
链 B 172–665（494 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；PEG MME 5000, potassium thiocyanate, CHES
分辨率 2.20 Å R-free 0.226
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 p 1–763（763 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 p 1–763（763 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSM Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation. 提交 2018-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 p 77–737（661 aa）
未记录 7NO [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 82 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.15 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 p 72–737（666 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6ZCE Structure of a yeast ABCE1-bound 43S pre-initiation complex 提交 2020-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：45-meric
链 p 1–763（763 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
6ZU9 Structure of a yeast ABCE1-bound 48S initiation complex 提交 2020-07-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：44-meric
链 p 1–763（763 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.20 Å

共 11 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 EIF3B_YEAST
Isoform —
PDB实体 46
链与序列区间 作者链 r； PDB构建体 1–31； UniProt 704–734

eIF3g

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A6ZZ25

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 44 RNA 3 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物数一致 链 s； UniProt 45–96 未记录 Met-tRNAi (U31:A39 variant) × 1 18S rRNA × 1 mRNA × 1 uS2 × 1 （Q6CN12） eS1 × 1 （Q6CWD0） uS5 × 1 （Q6CKL3） uS3 × 1 （Q6CRK7） eS4 × 1 （Q6CWJ2） uS7 × 1 （Q6CRA3） eS6 × 1 （Q6CM04） eS7 × 1 （Q6CTD6） eS8 × 1 （Q6CMG3） uS4 × 1 （Q6CM18） eS10 × 1 （Q6CVZ5） uS17 × 1 （Q6CX80） eS12 × 1 （Q6CLU4） uS15 × 1 （Q6CJK0） uS11 × 1 （P27069） uS19 × 1 （Q6CKV4） uS9 × 1 （Q875N2） eS17 × 1 （Q6CWU3） uS13 × 1 （Q6CWT9） eS19 × 1 （Q6CXM0） uS10 × 1 （Q6CIM1） eS21 × 1 （Q6CXT6） uS8 × 1 （Q6CW21） uS12 × 1 （F2Z602） eS24 × 1 （Q6CU44） eS25 × 1 （Q6CW78） eS26 × 1 （Q6CS01） eS27 × 1 （Q6CNL2） eS28 × 1 （P33285） uS14 × 1 （Q6CPG3） eS30 × 1 （Q6CUH5） eS31 × 1 （P69061） RACK1 × 1 （Q6CNI7） eL41 × 1 （P0CX86） eIF1A × 1 （P38912） eIF2 alpha × 1 （P20459） eIF2 gamma × 1 （P32481） eIF2 beta × 1 （P09064） eIF1 × 1 （P32911） eIF3a × 1 （P38249） eIF3c × 1 （P32497） eIF3i × 1 （P40217） eIF3b × 1 （P06103） MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT；pH 6.5；20 mM MES-KOH, 40 mM potassium acetate, 10 mM ammonium acetate, 8 mM magnesium acetate, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件：Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging；120 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 to 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I). 分辨率 4.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3JAP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6FYX Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C1) 提交 2018-03-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 r 1–274（274 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6FYY Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex with eIF5 N-terminal domain (model C2) 提交 2018-03-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 r 1–274（274 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 5 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6GSN Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation 提交 2018-06-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 r 48–96（49 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 EIF3G_YEAS7
Isoform —
PDB实体 47
链与序列区间 作者链 s； PDB构建体 1–52； UniProt 45–96

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 3jap

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 3jap
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3jap
沉积日期 deposition_date2015-06-18
结构标题 titleStructure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation
关键词 keywordsEukaryotic translation initiation, 48S, small ribosome subunit, 40S, 43S, TRANSLATION; TRANSLATION
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier77.60 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron79.75 Å
零角强度 I(0) i048994900000.00
分子量 molecular_weight1435400.0 kDa
排除体积 excluded_volume1610900 ų
包络体积 envelope_volume2703700 ų
水化壳体积 shell_volume267880 ų
包络直径 envelope_diameter271.5 Å
壳层 Rg shell_rg85.47 Å
包络 Rg envelope_rg79.57 Å
形状 Rg shape_rg79.85 Å
总 Rg total_rg79.55 Å
总原子数 total_atoms98333
残基数 n_residues9309
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax201.8 Å
Rg (实空间) rg_real75.08 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.52 Å
I(0) (实空间) i0_real4.7500e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error8.6700e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal77.66 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal49000000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9007
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary90.8 Å
偏度 Skewness skewness0.224
峰度 Kurtosis kurtosis-0.591
角度范围 angular_range— – 0.1000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.1729
最高正则化参数 α highest_alpha2965000000.0000
实空间数据点数 n_real_points21
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.975; Stabil: 0.983; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.996; Smooth: 0.003
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (51)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)