3kfd

Ternary complex of TGF-b1 reveals isoform-specific ligand recognition and receptor recruitment in the superfamily

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 151.0 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transforming growth factor beta-1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 279–390 链 B； UniProt 279–390	未记录	TGF-beta receptor type-2 × 2 （P37173） TGF-beta receptor type-1 × 2 （P36897）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7；298 K；8-15% Peg 4000-8000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.268
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 279–390 链 D； UniProt 279–390	未记录	TGF-beta receptor type-2 × 2 （P37173） TGF-beta receptor type-1 × 2 （P36897）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7；298 K；8-15% Peg 4000-8000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.268
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 279–390 链 B； UniProt 279–390 链 C； UniProt 279–390 链 D； UniProt 279–390	未记录	TGF-beta receptor type-2 × 4 （P37173） TGF-beta receptor type-1 × 4 （P36897）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7；298 K；8-15% Peg 4000-8000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.268

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3KFD	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1KLA SOLUTION STRUCTURE OF TGF-B1, NMR, MODELS 1-17 OF 33 STRUCTURES 提交 1996-01-16	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 279–390（112 aa）链 B 279–390（112 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 4.2	分辨率未提供
1KLC SOLUTION STRUCTURE OF TGF-B1, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1996-01-16	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 279–390（112 aa）链 B 279–390（112 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 4.2	分辨率未提供
1KLD SOLUTION STRUCTURE OF TGF-B1, NMR, MODELS 18-33 OF 33 STRUCTURES 提交 1996-01-16	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 279–390（112 aa）链 B 279–390（112 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 4.2	分辨率未提供
4KV5 scFv GC1009 in complex with TGF-beta1. 提交 2013-05-22	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 279–390（112 aa）片段：unp residues 279-390 链 D 279–390（112 aa）片段：unp residues 279-390	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5；294 K；16% PEG 4K, 0.1 M citrate, 4% 2-propanol , pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 3.00 Å R-free 0.300
4KV5 scFv GC1009 in complex with TGF-beta1. 提交 2013-05-22	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 279–390（112 aa）片段：unp residues 279-390 链 B 279–390（112 aa）片段：unp residues 279-390	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5；294 K；16% PEG 4K, 0.1 M citrate, 4% 2-propanol , pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 3.00 Å R-free 0.300
5FFO Integrin alpha V beta 6 in complex with pro-TGF-beta 提交 2015-12-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 34–390（357 aa）片段：UNP residues 34-390 链 D 34–390（357 aa）片段：UNP residues 34-390 链 G 34–390（357 aa）片段：UNP residues 34-390 链 H 34–390（357 aa）片段：UNP residues 34-390	未记录	CA CALCIUM ION × 8 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 MN MANGANESE (II) ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；8% PEG8000 0.1M Immidazole	分辨率 3.49 Å R-free 0.277
5VQP Crystal structure of human pro-TGF-beta1 提交 2017-05-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 30–390（361 aa）	突变：C4S,N107Q,N147Q	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；289 K；100 mM MES pH6.3, 1.68 M Ammonium Sulfate, 11% Dioxane	分辨率 2.90 Å R-free 0.293
6GFF Structure of GARP (LRRC32) in complex with latent TGF-beta1 and MHG-8 Fab 提交 2018-04-30	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 30–278（249 aa）片段：LAP 链 B 279–390（112 aa）片段：Mature 链 C 30–278（249 aa）片段：LAP 链 D 279–390（112 aa）片段：Mature	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；15% (w/v) PEG4000, 0.1 M HEPES pH 6.75	分辨率 3.10 Å R-free 0.268
6GFF Structure of GARP (LRRC32) in complex with latent TGF-beta1 and MHG-8 Fab 提交 2018-04-30	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 E 30–278（249 aa）片段：LAP 链 F 279–390（112 aa）片段：Mature 链 G 30–278（249 aa）片段：LAP 链 H 279–390（112 aa）片段：Mature	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；15% (w/v) PEG4000, 0.1 M HEPES pH 6.75	分辨率 3.10 Å R-free 0.268
6P7J Crystal structure of Latency Associated Peptide unbound to TGF-beta1 提交 2019-06-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 30–278（249 aa）	突变：R249A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；pH 4.6；293 K；Reservoir composition: 20% PEG3350, 300 mM NaAc pH 4.6	分辨率 3.50 Å R-free 0.322
7Y1R Human L-TGF-beta1 in complex with the anchor protein LRRC33 提交 2022-06-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 30–390（361 aa）链 B 30–390（361 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.01 Å
7Y1T Complex of integrin alphaV/beta8 and L-TGF-beta1 at a ratio of 1:2 提交 2022-06-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 30–390（361 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 CA CALCIUM ION × 5 MN MANGANESE (II) ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.24 Å
8C7H Cryo-EM Map of the latTGF-beta LHG-10 Fab complex 提交 2023-01-16	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 30–278（249 aa）片段：LAP 链 B 279–390（112 aa）片段：Mature 链 C 30–278（249 aa）片段：LAP 链 D 279–390（112 aa）片段：Mature	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8REW CryoEM structure of human GARP-lTGFbeta1 in complex with a Fab fragment derived from an activating antibody. 提交 2023-12-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 A 1–390（390 aa）片段：LAP 链 B 1–390（390 aa）片段：LAP 链 C 1–390（390 aa）片段：LAP 链 D 1–390（390 aa）片段：LAP	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.98 Å
8UDZ The Structure of LTBP-49247 Fab Bound to TGFbeta1 Small Latent Complex 提交 2023-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 30–390（361 aa）链 B 30–390（361 aa）	突变：C33S, R278A 突变：C33S, R278A	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；15% PEG 3350, 12% Tacsimate (pH 4.0), 10 mM Magnesium Chloride	分辨率 2.21 Å R-free 0.264
8VSC L-TGF-b1/GARP 提交 2024-01-23	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–390（390 aa）链 B 1–390（390 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9FDY Betaglycan Orphan Domain (ratBGo) in complex with TGF-b1 and extracellular domain of TGFBRII 提交 2024-05-17	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 279–390（112 aa）片段：Mature 链 B 279–390（112 aa）片段：Mature	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9FKP Zebrafish Betaglycan Orphan Domain (zfBGo) in complex with TGF-b1 and extracellular domain of TGFBRII 提交 2024-06-03	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 279–390（112 aa）片段：Mature 链 B 279–390（112 aa）片段：Mature	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.72 Å
9VJJ Crystal Structure of human Latent TGF-beta1 in complex with SOF10 提交 2025-06-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 30–390（361 aa）链 B 30–390（361 aa）	突变：C33S 突变：C33S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2M Sodium acetate trihydrate, 0.1M Imidazole hydrochloride (pH 8.0), 10.0% w/v Polyethylene glycol 8000	分辨率 2.48 Å R-free 0.310

共 17 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TGFB1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–112； UniProt 279–390 作者链 B； PDB构建体 1–112； UniProt 279–390 作者链 C； PDB构建体 1–112； UniProt 279–390 作者链 D； PDB构建体 1–112； UniProt 279–390

TGF-beta receptor type-2

Homo sapiens

UniProt P37173

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 38–153 链 F； UniProt 38–153	片段：extracellular domain	Transforming growth factor beta-1 × 2 （P01137） TGF-beta receptor type-1 × 2 （P36897）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7；298 K；8-15% Peg 4000-8000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.268
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 38–153 链 H； UniProt 38–153	片段：extracellular domain	Transforming growth factor beta-1 × 2 （P01137） TGF-beta receptor type-1 × 2 （P36897）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7；298 K；8-15% Peg 4000-8000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.268
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 38–153 链 F； UniProt 38–153 链 G； UniProt 38–153 链 H； UniProt 38–153	片段：extracellular domain	Transforming growth factor beta-1 × 4 （P01137） TGF-beta receptor type-1 × 4 （P36897）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7；298 K；8-15% Peg 4000-8000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.268

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3KFD	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1KTZ Crystal Structure of the Human TGF-beta Type II Receptor Extracellular Domain in Complex with TGF-beta3 提交 2002-01-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 38–159（122 aa）片段：Extracellular Domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 HANGING DROP VAPOR DIFFUSION USING A WELL SOLUTION CONTAINING 20% (V/V) 2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL AND 0.1 M CITRATE PH 4.0	分辨率 2.15 Å R-free 0.215
1M9Z CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TGF-BETA TYPE II RECEPTOR LIGAND BINDING DOMAIN 提交 2002-07-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 49–159（111 aa）片段：Extracellular	突变：Q26A,K97T	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；PEG 2000, sodium citrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 1.05 Å R-free 0.166
1PLO TRANSFORMING GROWTH FACTOR-BETA TYPE II RECEPTOR EXTRACELLULAR DOMAIN 提交 2003-06-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 38–159（122 aa）	突变：N19A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）25mM sodium acetate, 25mM NaCl, pH 5.5；压力 ambient NMR测量条件 pH 5.1；300 K；离子强度（mmCIF原始值）25mM sodium acetate, 25mM NaCl；压力 ambient NMR测量条件 pH 5.5；313 K；离子强度（mmCIF原始值）25mM sodium acetate, 25mM NaCl；压力 ambient NMR样品组成 1mM ecTbR2 U-15N, 25mM sodium acetate, 25mM NaCl, 95% H2O, 5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1mM ecTbR2 U-15N, 13C, 25mM sodium acetate, 25mM NaCl, 95% H2O, 5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1mM ecTbR2 U-15N, 13C, 25mM sodium acetate, 25mM NaCl, 99.99% D2O \| 99.99% D2O NMR样品组成 1mM ecTbR2 U-15N, 25mM sodium acetate, 25mM NaCl, 4% (w/v) 1,2-di-O-hexyl-sn-glycero-3-phosphocholine (6-O-PC) and 1,2-di-O-tetradecyl-sn-glycero-3-phosphocholine (14-O-PC) mixed in a molar ratio of 1:3, 95% H2O, 5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1mM ecTbR2 U-15N, 13C, 25mM sodium acetate, 25mM NaCl, 4% (w/v) 1,2-di-O-hexyl-sn-glycero-3-phosphocholine (6-O-PC) and 1,2-di-O-tetradecyl-sn-glycero-3-phosphocholine (14-O-PC) mixed in a molar ratio of 1:3, 95% H2O, 5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
2PJY Structural basis for cooperative assembly of the TGF-beta signaling complex 提交 2007-04-16	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 42–149（108 aa）片段：extracellular domain	突变：N42A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；10-20% PEG 3350, 0.4-0.65 M calcium acetate, 0.1-0.25M NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.297
4P7U Extracellular domain of type II Transforming Growth Factor Beta receptor in complex with NDSB-201 提交 2014-03-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 75–184（110 aa）片段：extracellular domain, UNP residues 74-175	突变：Q26A K97T	1PS 3-PYRIDINIUM-1-YLPROPANE-1-SULFONATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；100 mM sodium citrate, 30% PEG 2000	分辨率 1.50 Å R-free 0.206
4XJJ Extracellular domain of type II Transforming Growth Factor Beta receptor in complex with 2-(2-Hydroxyethyl)NDSB-201 提交 2015-01-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 50–159（110 aa）片段：ligand binding domain (UNP reisudes 50-159)	突变：K97T	41D 3-[2-(2-hydroxyethyl)pyridinium-1-yl]propane-1-sulfonate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；100 mM sodium citrate, 30% PEG 2000	分辨率 1.40 Å R-free 0.185
5E8V TGF-BETA RECEPTOR TYPE 2 KINASE DOMAIN (E431A,R433A,E485A,K488A,R493A,R495A) 提交 2015-10-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 237–549（313 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 237-549	突变：E431A,R433A,E485A,K488A,R493A,R495A	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100 mm TRIS-HCl, PH 8.5, 150 mm MgCl2, 24%(w/v) PEG4000, 20%(v/v) glcyerol	分辨率 1.69 Å R-free 0.219
5E8Y TGF-BETA RECEPTOR TYPE 2 KINASE DOMAIN (E431A,R433A,E485A,K488A,R493A,R495A) IN COMPLEX WITH STAUROSPORINE 提交 2015-10-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 237–549（313 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 237-549	突变：E431A,R433A,E485A,K488A,R493A,R495A	STU STAUROSPORINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100 mm TRIS-HCl, PH 8.5, 150 mm MgCl2, 24%(w/v) PEG4000, 20%(v/v) glcyerol	分辨率 2.05 Å R-free 0.227
5E91 TGF-BETA RECEPTOR TYPE 2 KINASE DOMAIN (E431A,R433A,E485A,K488A,R493A,R495A) IN COMPLEX WITH 3-AMINO-6-[4-(2- HYDROXYETHYL)PHENYL]-N-[4-(MORPHOLIN-4-YL)PYRIDIN-3-YL] PYRAZINE-2-CARBOXAMIDE 提交 2015-10-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 237–549（313 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 237-549	突变：E431A,R433A,E485A,K488A,R493A,R495A	5L4 3-amino-6-[4-(2-hydroxyethyl)phenyl]-N-[4-(morpholin-4-yl)pyridin-3-yl]pyrazine-2-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100 mm TRIS-HCl, PH 8.5, 150 mm MgCl2, 24%(w/v) PEG4000, 20%(v/v) glcyerol	分辨率 2.42 Å R-free 0.242
5E92 TGF-BETA RECEPTOR TYPE 2 KINASE DOMAIN (E431A,R433A,E485A,K488A,R493A,R495A) IN COMPLEX WITH AMPPNP 提交 2015-10-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 237–549（313 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 237-549	突变：E431A,R433A,E485A,K488A,R493A,R495A	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100 mm TRIS-HCl, PH 8.5, 150 mm MgCl2, 24%(w/v) PEG4000, 20%(v/v) glcyerol	分辨率 2.08 Å R-free 0.231
5QIN TGF-BETA RECEPTOR TYPE 2 KINASE DOMAIN IN COMPLEX WITH N- {4-[3-(6-METHOXYPYRIDIN-3-YL)-1H-PYRROLO[3,2-B]PYRIDIN-2- YL]PYRIDIN-2-YL}ACETAMIDE 提交 2018-08-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 237–549（313 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 237-549	未记录	J2V N-{4-[3-(6-methoxypyridin-3-yl)-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-2-yl]pyridin-2-yl}acetamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol	分辨率 1.57 Å R-free 0.203
5TX4 Derivative of mouse TGF-beta2, with a deletion of residues 52-71 and K25R, R26K, L51R, A74K, C77S, L89V, I92V, K94R T95K, I98V single amino acid substitutions, bound to human TGF-beta type II receptor ectodomain residues 15-130 提交 2016-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 38–153（116 aa）片段：UNP residues 38-153	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M Hepes, pH 7.5, 60 % v/v (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol	分辨率 1.88 Å R-free 0.222
5TY4 MicroED structure of a complex between monomeric TGF-b and its receptor, TbRII, at 2.9 A resolution 提交 2016-11-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 72–174（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.5 ul 20 mg/mL protein + 0.25 ul mother liquor + 0.2 ul seed stock in 100 mM HEPES/NaOH pH 7.5, 45% MPD	分辨率 2.90 Å R-free 0.328
7DV6 Discovery of Functionally Selective Transforming Growth Factor beta Type II Receptor (TGF-beta RII) Inhibitors as Anti-Fibrosis Agents 提交 2021-01-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 237–549（313 aa）	突变：E431A,R433A,E485A,K488A,R493A,R495A	HJF 5-[(3S)-5,5-dimethyloxolan-3-yl]-6-methoxy-3-(2-methoxypyridin-4-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；12-22% PEG4000,3% Ethylene Glycol,16% glycerol, 160 mM MgCl2, 80 mM TrisHCl at pH 7.5-9.3,The 9.2 mg/mL of TGFbetaRII protein was incubated with 1mM compound at 277K for 1-2 hr	分辨率 2.39 Å R-free 0.224
8G4K Complex of TbRII mini protein binder bound to the TbRII ECD 提交 2023-02-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 46–155（110 aa）片段：ECD (UNP residues 46-155)	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；300 K；20% PEG5000 MME, 0.2-0.4 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris, pH 7.4, 16-32% glycerol	分辨率 1.24 Å R-free 0.196
8YGZ The Crystal Structure of TGF beta R2 kinase domain from Biortus. 提交 2024-02-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 237–549（313 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M Li2SO4, 0.1M Tris-HCl pH8.5, 30% PEG4,000	分辨率 2.10 Å R-free 0.254
9B9F Zebrafish Betaglycan Orphan Domain (zfBGo) in complex with TGF-B3 and extracellular domains of TGFBRI and TGFBRII 提交 2024-04-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 42–153（112 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M tris pH 8.5, 30 %(w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 3.00 Å R-free 0.278
9B9F Zebrafish Betaglycan Orphan Domain (zfBGo) in complex with TGF-B3 and extracellular domains of TGFBRI and TGFBRII 提交 2024-04-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 I 42–153（112 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M tris pH 8.5, 30 %(w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 3.00 Å R-free 0.278
9E9G Heligmosomoides polygyrus TGF-beta Mimic 6 Domain 3 (TGM6-D3) Bound to Human TGF-beta Type II Receptor Extracellular Domain 提交 2024-11-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 38–154（117 aa）片段：UNP residues 38-154	未记录	GOL GLYCEROL × 8 CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 5 CAC CACODYLATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M sodium cacodylate, 25% w/v PEG4000, pH 6.5	分辨率 1.40 Å R-free 0.182
9FDY Betaglycan Orphan Domain (ratBGo) in complex with TGF-b1 and extracellular domain of TGFBRII 提交 2024-05-17	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 42–153（112 aa）链 E 42–153（112 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9FK5 Zebrafish Betaglycan Orphan Domain (zfBGo) in complex with TGF-B3 and extracellular domains of TGFBRI and TGFBRII 提交 2024-06-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 42–153（112 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
9FKP Zebrafish Betaglycan Orphan Domain (zfBGo) in complex with TGF-b1 and extracellular domain of TGFBRII 提交 2024-06-03	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 42–153（112 aa）链 E 42–153（112 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.72 Å

共 21 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TGFR2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–116； UniProt 38–153 作者链 F； PDB构建体 1–116； UniProt 38–153 作者链 G； PDB构建体 1–116； UniProt 38–153 作者链 H； PDB构建体 1–116； UniProt 38–153

TGF-beta receptor type-1

Homo sapiens

UniProt P36897

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 I； UniProt 31–115 链 J； UniProt 31–115	片段：extracellular domain	Transforming growth factor beta-1 × 2 （P01137） TGF-beta receptor type-2 × 2 （P37173）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7；298 K；8-15% Peg 4000-8000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.268
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 K； UniProt 31–115 链 L； UniProt 31–115	片段：extracellular domain	Transforming growth factor beta-1 × 2 （P01137） TGF-beta receptor type-2 × 2 （P37173）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7；298 K；8-15% Peg 4000-8000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.268
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 I； UniProt 31–115 链 J； UniProt 31–115 链 K； UniProt 31–115 链 L； UniProt 31–115	片段：extracellular domain	Transforming growth factor beta-1 × 4 （P01137） TGF-beta receptor type-2 × 4 （P37173）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7；298 K；8-15% Peg 4000-8000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.268

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3KFD	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1B6C CRYSTAL STRUCTURE OF THE CYTOPLASMIC DOMAIN OF THE TYPE I TGF-BETA RECEPTOR IN COMPLEX WITH FKBP12 提交 1999-01-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC PORTION	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；pH 8.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.269
1B6C CRYSTAL STRUCTURE OF THE CYTOPLASMIC DOMAIN OF THE TYPE I TGF-BETA RECEPTOR IN COMPLEX WITH FKBP12 提交 1999-01-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC PORTION	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；pH 8.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.269
1B6C CRYSTAL STRUCTURE OF THE CYTOPLASMIC DOMAIN OF THE TYPE I TGF-BETA RECEPTOR IN COMPLEX WITH FKBP12 提交 1999-01-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC PORTION	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；pH 8.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.269
1B6C CRYSTAL STRUCTURE OF THE CYTOPLASMIC DOMAIN OF THE TYPE I TGF-BETA RECEPTOR IN COMPLEX WITH FKBP12 提交 1999-01-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC PORTION	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；pH 8.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.269
1B6C CRYSTAL STRUCTURE OF THE CYTOPLASMIC DOMAIN OF THE TYPE I TGF-BETA RECEPTOR IN COMPLEX WITH FKBP12 提交 1999-01-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC PORTION 链 D 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC PORTION 链 F 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC PORTION 链 H 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC PORTION	未记录	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；pH 8.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.269
1IAS CYTOPLASMIC DOMAIN OF UNPHOSPHORYLATED TYPE I TGF-BETA RECEPTOR CRYSTALLIZED WITHOUT FKBP12 提交 2001-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC DOMAIN (RESIDUES 162-503) 链 B 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC DOMAIN (RESIDUES 162-503) 链 C 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC DOMAIN (RESIDUES 162-503) 链 D 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC DOMAIN (RESIDUES 162-503) 链 E 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC DOMAIN (RESIDUES 162-503)	未记录	SO4 SULFATE ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；277 K；100 mM MES pH 5.8, 2.4 M ammonium sulfate, 10 % glycerol v/v, 150 mM NaCl, 1 mM NPC-30345, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.90 Å R-free 0.284
1PY5 Crystal Structure of TGF-beta receptor I kinase with inhibitor 提交 2003-07-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 175–500（326 aa）片段：Truncated kinase domain, residues 175-500	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 PY1 4-(3-PYRIDIN-2-YL-1H-PYRAZOL-4-YL)QUINOLINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；298 K；Tris, ATP, MgCl2, DTT, Hexanediol, PEG4000, LiSO4, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 2.30 Å R-free 0.292
1RW8 Crystal Structure of TGF-beta receptor I kinase with ATP site inhibitor 提交 2003-12-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–500（301 aa）片段：Truncated kinase domain (residues 200-500)	未记录	580 3-(4-FLUOROPHENYL)-2-(6-METHYLPYRIDIN-2-YL)-5,6-DIHYDRO-4H-PYRROLO[1,2-B]PYRAZOLE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；Tris, ATP, MgCl2, DTT, Hexanediol, PEG 4000, LiSo4, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.40 Å R-free 0.291
1VJY Crystal Structure of a Naphthyridine Inhibitor of Human TGF-beta Type I Receptor 提交 2004-04-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–303（303 aa）片段：protein kinase	未记录	460 2-[5-(6-METHYLPYRIDIN-2-YL)-2,3-DIHYDRO-1H-PYRAZOL-4-YL]-1,5-NAPHTHYRIDINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；278 K；20% PEG 4000, 0.1M Tris HCl, 0.2 M magnesium chloride, pH 8.0, vapor diffusion/sitting drop, temperature 278K, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 2.00 Å R-free 0.275
2L5S Solution structure of the extracellular domain of the TGF-beta type I receptor 提交 2010-11-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–115（85 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.2；300 K；离子强度（mmCIF原始值）0.025；压力 ambient NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TbRI-1, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
2PJY Structural basis for cooperative assembly of the TGF-beta signaling complex 提交 2007-04-16	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 33–111（79 aa）片段：extracellular domain	突变：M70S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；10-20% PEG 3350, 0.4-0.65 M calcium acetate, 0.1-0.25M NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.297
2WOT ALK5 IN COMPLEX WITH 4-((5,6-dimethyl-2-(2-pyridyl)-3-pyridyl)oxy)-N-(3,4,5-trimethoxyphenyl)pyridin-2-amine 提交 2009-07-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 200-503	未记录	ZZG 4-[(5,6-DIMETHYL-2,2'-BIPYRIDIN-3-YL)OXY]-N-(3,4,5-TRIMETHOXYPHENYL)PYRIDIN-2-AMINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；SITTING DROP METHOD. DROPS PROTEIN-PRECIPITANT 1-1, PROTEIN: 10MG/ML ALK5, PRECIPITANT: 20-30% PEG8K, 100 MM PCTP BUFFER PH 8.5-9.2, 0.2 M NAAC	分辨率 1.85 Å R-free 0.221
2WOU ALK5 IN COMPLEX WITH 4-((4-((2,6-dimethyl-3-pyridyl)oxy)-2-pyridyl) amino)benzenesulfonamide 提交 2009-07-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 200-503	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZZF 4-({4-[(2,6-DIMETHYLPYRIDIN-3-YL)OXY]PYRIDIN-2-YL}AMINO)BENZENESULFONAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；SITTING DROP METHOD. DROPS PROTEIN-PRECIPITANT 1-1, PROTEIN: 10MG/ML ALK5, PRECIPITANT: 20-30% PEG8K, 100 MM PCTP BUFFER PH 8.5-9.2, 0.2 M NAAC	分辨率 2.30 Å R-free 0.302
2X7O Crystal structure of TGFbRI complexed with an indolinone inhibitor 提交 2010-03-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC DOMAIN, RESIDUES 162-503	未记录	ZOP (3Z)-N-ETHYL-N-METHYL-2-OXO-3-(PHENYL{[4-(PIPERIDIN-1-YLMETHYL)PHENYL]AMINO}METHYLIDENE)-2,3-DIHYDRO-1H-INDOLE-6-CARBOXAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.2；1.5 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M GLYCINE PH 7.25	分辨率 3.70 Å R-free 0.273
2X7O Crystal structure of TGFbRI complexed with an indolinone inhibitor 提交 2010-03-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC DOMAIN, RESIDUES 162-503	未记录	ZOP (3Z)-N-ETHYL-N-METHYL-2-OXO-3-(PHENYL{[4-(PIPERIDIN-1-YLMETHYL)PHENYL]AMINO}METHYLIDENE)-2,3-DIHYDRO-1H-INDOLE-6-CARBOXAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.2；1.5 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M GLYCINE PH 7.25	分辨率 3.70 Å R-free 0.273
2X7O Crystal structure of TGFbRI complexed with an indolinone inhibitor 提交 2010-03-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC DOMAIN, RESIDUES 162-503	未记录	ZOP (3Z)-N-ETHYL-N-METHYL-2-OXO-3-(PHENYL{[4-(PIPERIDIN-1-YLMETHYL)PHENYL]AMINO}METHYLIDENE)-2,3-DIHYDRO-1H-INDOLE-6-CARBOXAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.2；1.5 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M GLYCINE PH 7.25	分辨率 3.70 Å R-free 0.273
2X7O Crystal structure of TGFbRI complexed with an indolinone inhibitor 提交 2010-03-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC DOMAIN, RESIDUES 162-503	未记录	ZOP (3Z)-N-ETHYL-N-METHYL-2-OXO-3-(PHENYL{[4-(PIPERIDIN-1-YLMETHYL)PHENYL]AMINO}METHYLIDENE)-2,3-DIHYDRO-1H-INDOLE-6-CARBOXAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.2；1.5 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M GLYCINE PH 7.25	分辨率 3.70 Å R-free 0.273
2X7O Crystal structure of TGFbRI complexed with an indolinone inhibitor 提交 2010-03-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 162–503（342 aa）片段：CYTOPLASMIC DOMAIN, RESIDUES 162-503	未记录	ZOP (3Z)-N-ETHYL-N-METHYL-2-OXO-3-(PHENYL{[4-(PIPERIDIN-1-YLMETHYL)PHENYL]AMINO}METHYLIDENE)-2,3-DIHYDRO-1H-INDOLE-6-CARBOXAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.2；1.5 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M GLYCINE PH 7.25	分辨率 3.70 Å R-free 0.273
3FAA Crystal structure of TGFbRI complexed with a 2-aminoimidazole inhibitor 提交 2008-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 162–503（342 aa）片段：GS and Kinase domains: UNP residues 162-503	未记录	55F N-[4-(5-fluoro-6-methylpyridin-2-yl)-5-quinoxalin-6-yl-1H-imidazol-2-yl]acetamide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；Na/K phosphate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.35 Å R-free 0.271
3FAA Crystal structure of TGFbRI complexed with a 2-aminoimidazole inhibitor 提交 2008-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 162–503（342 aa）片段：GS and Kinase domains: UNP residues 162-503	未记录	55F N-[4-(5-fluoro-6-methylpyridin-2-yl)-5-quinoxalin-6-yl-1H-imidazol-2-yl]acetamide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；Na/K phosphate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.35 Å R-free 0.271
3FAA Crystal structure of TGFbRI complexed with a 2-aminoimidazole inhibitor 提交 2008-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 162–503（342 aa）片段：GS and Kinase domains: UNP residues 162-503	未记录	55F N-[4-(5-fluoro-6-methylpyridin-2-yl)-5-quinoxalin-6-yl-1H-imidazol-2-yl]acetamide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；Na/K phosphate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.35 Å R-free 0.271
3FAA Crystal structure of TGFbRI complexed with a 2-aminoimidazole inhibitor 提交 2008-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 162–503（342 aa）片段：GS and Kinase domains: UNP residues 162-503	未记录	55F N-[4-(5-fluoro-6-methylpyridin-2-yl)-5-quinoxalin-6-yl-1H-imidazol-2-yl]acetamide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；Na/K phosphate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.35 Å R-free 0.271
3FAA Crystal structure of TGFbRI complexed with a 2-aminoimidazole inhibitor 提交 2008-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 162–503（342 aa）片段：GS and Kinase domains: UNP residues 162-503	未记录	55F N-[4-(5-fluoro-6-methylpyridin-2-yl)-5-quinoxalin-6-yl-1H-imidazol-2-yl]acetamide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；Na/K phosphate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.35 Å R-free 0.271
3GXL ALK-5 kinase complex with GW857175 提交 2009-04-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 201–503（303 aa）片段：kinase domain, residues 201-503	未记录	QIG N-1H-indazol-5-yl-2-(6-methylpyridin-2-yl)quinazolin-4-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；vapor diffusion	分辨率 1.80 Å R-free 0.263
3HMM Structure of Alk5 + GW855857 提交 2009-05-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 201–503（303 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 201-503	未记录	855 2-(6-methylpyridin-2-yl)-N-pyridin-4-ylquinazolin-4-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；VAPOR DIFFUSION	分辨率 1.70 Å R-free 0.241
3KCF Crystal structure of TGFbRI complexed with a pyrazolone inhibitor 提交 2009-10-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 162–503（342 aa）片段：UNP residues 162-503, GS AND KINASE DOMAINS	未记录	JZO 4-[3-(methoxymethyl)phenyl]-1,2-dimethyl-5-quinoxalin-6-yl-1,2-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；Sodium potassium phosphate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.278
3KCF Crystal structure of TGFbRI complexed with a pyrazolone inhibitor 提交 2009-10-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 162–503（342 aa）片段：UNP residues 162-503, GS AND KINASE DOMAINS	未记录	JZO 4-[3-(methoxymethyl)phenyl]-1,2-dimethyl-5-quinoxalin-6-yl-1,2-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；Sodium potassium phosphate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.278
3KCF Crystal structure of TGFbRI complexed with a pyrazolone inhibitor 提交 2009-10-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 162–503（342 aa）片段：UNP residues 162-503, GS AND KINASE DOMAINS	未记录	JZO 4-[3-(methoxymethyl)phenyl]-1,2-dimethyl-5-quinoxalin-6-yl-1,2-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；Sodium potassium phosphate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.278
3KCF Crystal structure of TGFbRI complexed with a pyrazolone inhibitor 提交 2009-10-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 162–503（342 aa）片段：UNP residues 162-503, GS AND KINASE DOMAINS	未记录	JZO 4-[3-(methoxymethyl)phenyl]-1,2-dimethyl-5-quinoxalin-6-yl-1,2-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；Sodium potassium phosphate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.278
3KCF Crystal structure of TGFbRI complexed with a pyrazolone inhibitor 提交 2009-10-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 162–503（342 aa）片段：UNP residues 162-503, GS AND KINASE DOMAINS	未记录	JZO 4-[3-(methoxymethyl)phenyl]-1,2-dimethyl-5-quinoxalin-6-yl-1,2-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；Sodium potassium phosphate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.278
3TZM TGF-beta Receptor type 1 in complex with SB431542 提交 2011-09-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：kinase domain, UNP residues 200-503	未记录	085 4-[5-(1,3-benzodioxol-5-yl)-4-(pyridin-2-yl)-1H-imidazol-2-yl]benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 mM Imidazole 10% PEG 8000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.70 Å R-free 0.205
4X0M Selection of fragments for kinase inhibitor design: decoration is key 提交 2014-11-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：UNP residues 200-503	未记录	3WA 4-aminopyrido[2,3-d]pyrimidin-5(8H)-one × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Tris-HCl, 240 mM Li2SO4, 24% PEG 4000, pH 7.5	分辨率 1.68 Å R-free 0.239
4X2F Selection of fragments for kinase inhibitor design: decoration is key 提交 2014-11-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：UNP residues 200-503	未记录	3WJ 4-amino-8-(4-aminophenyl)pyrido[2,3-d]pyrimidin-5(8H)-one × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Tris-HCl, 240 mM Li2SO4, 24% PEG 4000, pH 7.5	分辨率 1.49 Å R-free 0.191
4X2G Selection of fragments for kinase inhibitor design: decoration is key 提交 2014-11-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：UNP residues 200-503	未记录	3WK 4-[(4-aminophenyl)amino]pyrido[2,3-d]pyrimidin-5(6H)-one × 1 SO4 SULFATE ION × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Tris-HCl, 240 mM Li2SO4, 24% PEG 4000, pH 7.5	分辨率 1.51 Å R-free 0.185
4X2J Selection of fragments for kinase inhibitor design: decoration is key 提交 2014-11-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）	未记录	3WN 4-[(3-aminophenyl)amino]pyrido[2,3-d]pyrimidin-5(8H)-one × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Tris-HCl, 240 mM Li2SO4, 24% PEG 4000, pH 7.5	分辨率 1.69 Å R-free 0.184
4X2K Selection of fragments for kinase inhibitor design: decoration is key 提交 2014-11-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：MONOMERIC	链 A 200–503（304 aa）	未记录	3WO 4-[(3-aminophenyl)amino]pyrido[2,3-d]pyrimidin-5(6H)-one × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Tris-HCl, 240 mM Li2SO4, 24% PEG 4000, pH 7.5	分辨率 1.69 Å R-free 0.184
4X2N Selection of fragments for kinase inhibitor design: decoration is key 提交 2014-11-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：UNP residues 200-503	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Tris-HCl, 240 mM Li2SO4, 24% PEG 4000, pH 7.5	分辨率 1.80 Å R-free 0.201
5E8S TGF-BETA RECEPTOR TYPE 1 KINASE DOMAIN (WT) 提交 2015-10-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 200-503	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol	分辨率 1.45 Å R-free 0.188
5E8T TGF-BETA RECEPTOR TYPE 1 KINASE DOMAIN (T204D) 提交 2015-10-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 200-503	突变：T204D	GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol	分辨率 1.70 Å R-free 0.190
5E8U TGF-BETA RECEPTOR TYPE 1 KINASE DOMAIN (T204D,I211V,Y249F,S280T, Y282F,S287N,A350C,L352F) 提交 2015-10-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 200-503	突变：T204D,I211V,Y249F,S280T,Y282F,S287N,A350C,L352F	GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol	分辨率 2.03 Å R-free 0.223
5E8W TGF-BETA RECEPTOR TYPE 1 KINASE DOMAIN (T204D) IN COMPLEX WITH STAUROSPORINE 提交 2015-10-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 200-503	突变：T204D	STU STAUROSPORINE × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol	分辨率 1.86 Å R-free 0.186
5E8X TGF-BETA RECEPTOR TYPE 1 KINASE DOMAIN (T204D,I211V,Y249F,S280T, Y282F,S287N,A350C,L352F) IN COMPLEX WITH STAUROSPORINE 提交 2015-10-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 200-503	突变：T204D,I211V,Y249F,S280T, Y282F,S287N,A350C,L352F	STU STAUROSPORINE × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol	分辨率 1.45 Å R-free 0.210
5E8Z TGF-BETA RECEPTOR TYPE 1 KINASE DOMAIN (T204D) IN COMPLEX WITH 3-AMINO-6-[4-(2-HYDROXYETHYL)PHENYL]-N-[4-(MORPHOLIN-4-YL)PYRIDIN-3-YL]PYRAZINE-2-CARBOXAMIDE 提交 2015-10-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 200-503	突变：T204D	5L4 3-amino-6-[4-(2-hydroxyethyl)phenyl]-N-[4-(morpholin-4-yl)pyridin-3-yl]pyrazine-2-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol	分辨率 1.51 Å R-free 0.207
5E90 TGF-BETA RECEPTOR TYPE 1 KINASE DOMAIN (T204D,I211V,Y249F, S280T,Y282F,S287N,A350C,L352F) IN COMPLEX WITH 3-AMINO-6- [4-(2-HYDROXYETHYL)PHENYL]-N-[4-(MORPHOLIN-4-YL)PYRIDIN-3-YL]PYRAZINE-2-CARBOXAMIDE 提交 2015-10-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 200-503	突变：T204D,I211V,Y249F,S280T,Y282F,S287N,A350C,L352F	5L4 3-amino-6-[4-(2-hydroxyethyl)phenyl]-N-[4-(morpholin-4-yl)pyridin-3-yl]pyrazine-2-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol	分辨率 2.05 Å R-free 0.218
5FRI ALK5 in complex witha an N-(4-anilino-2-pyridyl)acetamide inhibitor. 提交 2015-12-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–498（299 aa）片段：UNP RESIDUES 200-498	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ZUQ N-[4-[(6-chloro-[1,3]dioxolo[4,5-b]pyridin-7-yl)amino]-2-pyridyl]cyclopropanecarboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；SITTING DROP METHOD. DROPS PROTEIN-PRECIPITANT 1-1, PROTEIN: 10MG/ML ALK5, PRECIPITANT: 20-30% PEG8K, 100 MM PCTP BUFFER PH 8.5-9.2, 0.2 M NAAC	分辨率 2.00 Å R-free 0.193
5QIK TGF-BETA RECEPTOR TYPE 1 KINASE DOMAIN (T204D) IN COMPLEX WITH N-{4-[3-(6-fluoropyridin-3-yl)-4-oxo-4,5,6,7-tetrahydro-1H-pyrrolo[3,2-c]pyridin-2-yl]pyridin-2-yl}acetamide 提交 2018-08-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 200-503	突变：T204D	J2M N-{4-[3-(6-fluoropyridin-3-yl)-4-oxo-4,5,6,7-tetrahydro-1H-pyrrolo[3,2-c]pyridin-2-yl]pyridin-2-yl}acetamide × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol	分辨率 1.58 Å R-free 0.190
5QIL TGF-BETA RECEPTOR TYPE 1 KINASE DOMAIN (T204D) IN COMPLEX WITH N-{4-[3-(6-METHOXYPYRIDIN-3-YL)-1H-PYRROLO[3,2-B]PYRIDIN-2-YL]PYRIDIN-2-YL}ACETAMIDE 提交 2018-08-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 200-503	突变：T204D	J2V N-{4-[3-(6-methoxypyridin-3-yl)-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-2-yl]pyridin-2-yl}acetamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol	分辨率 1.98 Å R-free 0.210
5QIM TGF-BETA RECEPTOR TYPE 1 KINASE DOMAIN (T204D) IN COMPLEX WITH N-{4-[3-(5-METHOXYPYRIDIN-2-YL)-1H-PYRROLO[3,2-B] PYRIDIN-2-YL]PYRIDIN-2-YL}ACETAMIDE 提交 2018-08-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 200-503	未记录	J2Y N-{4-[3-(5-methoxypyridin-2-yl)-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-2-yl]pyridin-2-yl}acetamide × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol	分辨率 1.75 Å R-free 0.188
5QTZ TGF-BETA RECEPTOR TYPE 1 KINASE DOMAIN (T204D) IN COMPLEX WITH 6-[1-(2,2-DIFLUOROETHYL)-4-(6-METHYLPYRIDIN-2-YL)-1H-IMIDAZOL-5-YL]IMIDAZO[1,2-A]PYRIDINE 提交 2019-11-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 200-503	突变：T204D	QMY 6-[1-(2,2-difluoroethyl)-4-(6-methylpyridin-2-yl)-1H-imidazol-5-yl]imidazo[1,2-a]pyridine × 1 GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol	分辨率 1.83 Å R-free 0.200
5QU0 TGF-BETA RECEPTOR TYPE 1 KINASE DOMAIN (T204D) IN COMPLEX WITH 6-[4-(3-CHLORO-4-FLUOROPHENYL)-1-(2-HYDROXYETHYL)-1H-IMIDAZOL-5-YL]IMIDAZO[1,2-B]PYRIDAZINE-3-CARBONITRILE 提交 2019-11-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 200-503	突变：YES	QMV 6-[4-(3-chloro-4-fluorophenyl)-1-(2-hydroxyethyl)-1H-imidazol-5-yl]imidazo[1,2-b]pyridazine-3-carbonitrile × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol	分辨率 1.67 Å R-free 0.206
5USQ ALK-5 kinase inhibitor complex 提交 2017-02-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 123–421（299 aa）片段：UNP residues 123-421	未记录	8LY N-[2-(5-chloro-2-fluorophenyl)pyridin-4-yl]-2-[(piperidin-4-yl)methyl]-2H-pyrazolo[4,3-b]pyridin-7-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.2；293 K；16 % PEG 8000 100mM CHES pH 9.2	分辨率 2.55 Å R-free 0.231
6B8Y TGF-BETA RECEPTOR TYPE 1 KINASE DOMAIN (T204D) IN COMPLEX WITH N-(3-fluoropyridin-4-yl)-2-[6-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine 提交 2017-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）片段：kinase domain	突变：T204D	D0A N-(3-fluoropyridin-4-yl)-2-[6-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol	分辨率 1.65 Å R-free 0.208
6MAC Ternary structure of GDF11 bound to ActRIIB-ECD and Alk5-ECD 提交 2018-08-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 K 33–112（80 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；.05-.15M sodium acetate 12-24% polyethylene glycol 8000 .05-.15M sodium thiocyanate	分辨率 2.34 Å R-free 0.267
8YHF The Crystal Structure of the Type I TGF beta receptor from Biortus. 提交 2024-02-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 162–503（342 aa）	未记录	A1D6I Vactosertib × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.02M K/Na PO4, 0.1M Bis-Tris propane pH6.5, 20% PEG3350	分辨率 1.40 Å R-free 0.192
8YHL The Crystal Structure of Tgf-Beta Type I Receptor (Alk5) from Biortus 提交 2024-02-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）	未记录	A1D6I Vactosertib × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ACY ACETIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M MgAC2, 0.1M MES pH6.5, 10% PEG10,000	分辨率 1.47 Å R-free 0.193
9B9F Zebrafish Betaglycan Orphan Domain (zfBGo) in complex with TGF-B3 and extracellular domains of TGFBRI and TGFBRII 提交 2024-04-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 31–115（85 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M tris pH 8.5, 30 %(w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 3.00 Å R-free 0.278
9B9F Zebrafish Betaglycan Orphan Domain (zfBGo) in complex with TGF-B3 and extracellular domains of TGFBRI and TGFBRII 提交 2024-04-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 H 31–115（85 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M tris pH 8.5, 30 %(w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 3.00 Å R-free 0.278
9F6X Human transforming growth factor b type I receptor in complex with kinase inhibitor SB505124 提交 2024-05-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–500（301 aa）	未记录	A1IAZ 2-[5-(1,3-benzodioxol-5-yl)-2-~{tert}-butyl-1~{H}-imidazol-4-yl]-6-methyl-pyridine × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；291 K；23%(w/v) PEG 3350, 3%(v/v) glycerol at pH 5.6	分辨率 2.68 Å R-free 0.248
9FK5 Zebrafish Betaglycan Orphan Domain (zfBGo) in complex with TGF-B3 and extracellular domains of TGFBRI and TGFBRII 提交 2024-06-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 30–115（86 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
9J9D Crystal structure of ALK5 kinase domain in complex with inhibitor HM-279 提交 2024-08-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）	未记录	A1L30 2-((1-(but-2-yn-1-yl)-1H-pyrazol-4-yl)(cyclopropylmethyl)amino)-5-(4-(dimethylcarbamoyl)-1H-pyrrol-2-yl)thiazole-4-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；20-25% PEG8000, 0.2 M Na acetate, 0.1 M Tris-HCl pH8.5	分辨率 1.34 Å R-free 0.209
9SUV Structure of an inhibitor of Human TGF-beta Type I Receptor 提交 2025-09-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 200–503（304 aa）	未记录	A1JQO ~{N}-[4-[[6-(5-chloranyl-2-fluoranyl-phenyl)-3-(2-hydroxyethylsulfanyl)pyridazin-4-yl]amino]pyridin-2-yl]-3-(4-methylpiperazin-1-yl)propanamide × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2 M potassium thiocyanate 20 % w/v PEG 3350	分辨率 1.50 Å R-free 0.211

共 44 个其他 PDB 条目、61 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TGFR1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–85； UniProt 31–115 作者链 J； PDB构建体 1–85； UniProt 31–115 作者链 K； PDB构建体 1–85； UniProt 31–115 作者链 L； PDB构建体 1–85； UniProt 31–115

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3kfd
沉积日期 deposition_date	2009-10-27
结构标题 title	Ternary complex of TGF-b1 reveals isoform-specific ligand recognition and receptor recruitment in the superfamily
关键词 keywords	;TGF-beta, TGF-b1, TGF-beta receptor type-1, TGF-beta receptor type-2, TbRII, TbRI, Growth factor, Receptor, Serine/threonine-protein kinase, CYTOKINE-CYTOKINE RECEPTOR complex ;; CYTOKINE/CYTOKINE RECEPTOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	41.94 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	42.05 Å
零角强度 I(0) i0	271462000.00
分子量 molecular_weight	130350.0 kDa
排除体积 excluded_volume	161370 Å³
包络体积 envelope_volume	228380 Å³
水化壳体积 shell_volume	47627 Å³
包络直径 envelope_diameter	160.0 Å
壳层 Rg shell_rg	44.62 Å
包络 Rg envelope_rg	41.84 Å
形状 Rg shape_rg	42.07 Å
总 Rg total_rg	42.09 Å
总原子数 total_atoms	9058
残基数 n_residues	1149
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	151.0 Å
Rg (实空间) rg_real	42.12 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	2.12 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.7150e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.7120e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	41.94 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	271400000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8565
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	51.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.442
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.119
角度范围 angular_range	— – 0.1900 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	12770000.0000
实空间数据点数 n_real_points	39
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.780; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.939; Smooth: 0.853

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Transforming growth factor beta-1
分子量 formula_weight	12809.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	9151

ALDTNYCFSSTEKNCCVRQLYIDFRKDLGWKWIHEPKGYHANFCLGPCPYIWSLDTQYSKVLALYNQHNPGASAAPCCVPQALEPLPIVYYVGRKPKVEQLSNMIVRSCKCS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Cricetulus griseus

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	TGF-beta receptor type-2
分子量 formula_weight	13225.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F,G,H

VTDNNGAVKFPQLCKFCDVRFSTCDNQKSCMSNCSITSICEKPQEVCVAVWRKNDENITLETVCHDPKLPYHDFILEDAASPKCIMKEKKKPGETFFMCSCSSDECNDNIIFSEEY

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	TGF-beta receptor type-1
分子量 formula_weight	9330.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,J,K,L

ATALQCFCHLCTKDNFTCVTDGLCFVSVTETTDKVIHNSMCIAEIDLIPRDRPFVCAPSSKTGSVTTTYCCNQDHCNKIELPTTV

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	93

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 20 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

结构域编号 domain_id	d3kfda_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.17 — Cystine-knot cytokines
超家族 Superfamily superfamily	g.17.1 — Cystine-knot cytokines
家族 Family family	g.17.1.2 — Transforming growth factor (TGF)-beta

结构域编号 domain_id	d3kfdb_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.17 — Cystine-knot cytokines
超家族 Superfamily superfamily	g.17.1 — Cystine-knot cytokines
家族 Family family	g.17.1.2 — Transforming growth factor (TGF)-beta

结构域编号 domain_id	d3kfdc_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.17 — Cystine-knot cytokines
超家族 Superfamily superfamily	g.17.1 — Cystine-knot cytokines
家族 Family family	g.17.1.2 — Transforming growth factor (TGF)-beta

结构域编号 domain_id	d3kfdd_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.17 — Cystine-knot cytokines
超家族 Superfamily superfamily	g.17.1 — Cystine-knot cytokines
家族 Family family	g.17.1.2 — Transforming growth factor (TGF)-beta

结构域编号 domain_id	d3kfde_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.7 — Snake toxin-like
超家族 Superfamily superfamily	g.7.1 — Snake toxin-like
家族 Family family	g.7.1.3 — Extracellular domain of cell surface receptors

结构域编号 domain_id	d3kfdf_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.7 — Snake toxin-like
超家族 Superfamily superfamily	g.7.1 — Snake toxin-like
家族 Family family	g.7.1.3 — Extracellular domain of cell surface receptors

结构域编号 domain_id	d3kfdg_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.7 — Snake toxin-like
超家族 Superfamily superfamily	g.7.1 — Snake toxin-like
家族 Family family	g.7.1.3 — Extracellular domain of cell surface receptors

结构域编号 domain_id	d3kfdh_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.7 — Snake toxin-like
超家族 Superfamily superfamily	g.7.1 — Snake toxin-like
家族 Family family	g.7.1.3 — Extracellular domain of cell surface receptors

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id	3kfdA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	90 — Cystine Knot Cytokines, subunit B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cystine-knot cytokines

结构域编号 domain_id	3kfdB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	90 — Cystine Knot Cytokines, subunit B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cystine-knot cytokines

结构域编号 domain_id	3kfdC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	90 — Cystine Knot Cytokines, subunit B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cystine-knot cytokines

结构域编号 domain_id	3kfdD00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	90 — Cystine Knot Cytokines, subunit B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cystine-knot cytokines

结构域编号 domain_id	3kfdE00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — CD59

结构域编号 domain_id	3kfdF00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — CD59

结构域编号 domain_id	3kfdG00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — CD59

结构域编号 domain_id	3kfdH00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — CD59

结构域编号 domain_id	3kfdI00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — CD59

结构域编号 domain_id	3kfdJ00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — CD59

结构域编号 domain_id	3kfdK00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — CD59

结构域编号 domain_id	3kfdL00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — CD59

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	37.700 Å
晶胞边长 b length_b	99.350 Å
晶胞边长 c length_c	102.700 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	64.01 °
晶胞夹角 β angle_beta	84.47 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	84.34 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.995 Å
最低分辨率 resolution_low	46.080 Å
R 因子 r_factor	0.2200
R_work r_work	0.2170
R_free r_free	0.2680

fit	/app/data/saxs_computation/kf/3kfd/3kfd.fit
pddf	/app/data/pr_computation/kf/3kfd/3kfd.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/kf/3kfd/3kfd.dat

Ternary complex of TGF-b1 reveals isoform-specific ligand recognition and receptor recruitment in the superfamily

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transforming growth factor beta-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

TGF-beta receptor type-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

TGF-beta receptor type-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 20 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

CATH v4.4 (12 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)