Myocyte-specific enhancer factor 2A
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 7 DNA 6 PDB 声明:tridecameric(13) 与全部聚合物数一致 | 链 A; UniProt 2–91 链 B; UniProt 2–91 链 C; UniProt 2–91 链 D; UniProt 2–91 链 I; UniProt 2–91 链 J; UniProt 2–91 | 片段:N terminal domain (UNP residues 2-91) | ;DNA (5'-D(*A*AP*AP*CP*TP*AP*TP*TP*TP*AP*TP*AP*AP*GP*A)-3') ; × 3 ;DNA (5'-D(*TP*TP*CP*TP*TP*AP*TP*AP*AP*AP*TP*AP*GP*TP*T)-3') ; × 3 Histone acetyltransferase p300 × 1 (Q09472) ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.8;288 K;16% PEG 1000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K | 分辨率 2.19 Å R-free 0.272 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 3P57 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1C7U Complex of the DNA binding core domain of the transcription factor MEF2A with a 20mer oligonucleotide 提交 2000-03-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 A
2–86(85 aa)
片段:RESIDUES 2-86
链 B
2–86(85 aa)
片段:RESIDUES 2-86
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.6;308 K
|
分辨率未提供 |
| 1EGW CRYSTAL STRUCTURE OF MEF2A CORE BOUND TO DNA 提交 2000-02-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 A
2–78(77 aa)
片段:N-TERMINUS, RESIDUES 2-78
链 B
2–78(77 aa)
片段:N-TERMINUS, RESIDUES 2-78
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;PEG 6000, NaCl, Ba(NO3)2, sodium Acetate, Bis-tris buffer, DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.229 |
| 1EGW CRYSTAL STRUCTURE OF MEF2A CORE BOUND TO DNA 提交 2000-02-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 C
2–78(77 aa)
片段:N-TERMINUS, RESIDUES 2-78
链 D
2–78(77 aa)
片段:N-TERMINUS, RESIDUES 2-78
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;PEG 6000, NaCl, Ba(NO3)2, sodium Acetate, Bis-tris buffer, DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.229 |
| 1LEW CRYSTAL STRUCTURE OF MAP KINASE P38 COMPLEXED TO THE DOCKING SITE ON ITS NUCLEAR SUBSTRATE MEF2A 提交 2002-04-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
269–280(12 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;289 K;PEG 8000, HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 289K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.257 |
| 3KOV Structure of MEF2A bound to DNA reveals a completely folded MADS-box/MEF2 domain that recognizes DNA and recruits transcription co-factors 提交 2009-11-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 A
2–91(90 aa)
链 B
2–91(90 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
hanging drop;pH 4.7;291 K;50 mM acetic acid, 142mM NaCl, 5mM MgCl2, 10mM CaCl2, 3.3% Glycerol, 22.5% 3K PEG, pH 4.7, hanging drop, temperature 291K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.279 |
| 3KOV Structure of MEF2A bound to DNA reveals a completely folded MADS-box/MEF2 domain that recognizes DNA and recruits transcription co-factors 提交 2009-11-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 I
2–91(90 aa)
链 J
2–91(90 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
hanging drop;pH 4.7;291 K;50 mM acetic acid, 142mM NaCl, 5mM MgCl2, 10mM CaCl2, 3.3% Glycerol, 22.5% 3K PEG, pH 4.7, hanging drop, temperature 291K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.279 |
| 3MU6 Inhibiting the Binding of Class IIa Histone Deacetylases to Myocyte Enhancer Factor-2 by Small Molecules 提交 2010-05-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 A
2–72(71 aa)
链 B
2–72(71 aa)
|
突变:E71A 突变:E71A | BXL (3E)-N~8~-(2-aminophenyl)-N~1~-phenyloct-3-enediamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
hanging drop;pH 4.7;291 K;50 mM acetic acid, 142mM NaCl, 5mM MgCl2, 10mM CaCl2, 3.3% Glycerol, 22.5% 3K PEG, pH 4.7, hanging drop, temperature 291K
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.251 |
| 3MU6 Inhibiting the Binding of Class IIa Histone Deacetylases to Myocyte Enhancer Factor-2 by Small Molecules 提交 2010-05-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 C
2–72(71 aa)
链 D
2–72(71 aa)
|
突变:E71A 突变:E71A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
hanging drop;pH 4.7;291 K;50 mM acetic acid, 142mM NaCl, 5mM MgCl2, 10mM CaCl2, 3.3% Glycerol, 22.5% 3K PEG, pH 4.7, hanging drop, temperature 291K
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.251 |
| 6BYY MEF2 CHIMERA/DNA Complex 提交 2017-12-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–64(64 aa)
链 A
92–95(4 aa)
链 B
1–64(64 aa)
链 B
92–95(4 aa)
|
未记录 | 1PG 2-(2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHOXY)-ETHANOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;0.1 M HAc pH 4.7, 150 mM NaCl, 10 mM CaCl2, 5 mM MgCl2 and 28% PEG 400
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.266 |
| 6BYY MEF2 CHIMERA/DNA Complex 提交 2017-12-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 C
1–64(64 aa)
链 C
92–95(4 aa)
链 D
1–64(64 aa)
链 D
92–95(4 aa)
|
未记录 | TCE 3,3',3''-phosphanetriyltripropanoic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;0.1 M HAc pH 4.7, 150 mM NaCl, 10 mM CaCl2, 5 mM MgCl2 and 28% PEG 400
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.266 |
| 6BZ1 MEF2 Chimera D83V mutant/DNA complex 提交 2017-12-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 C
1–64(64 aa)
链 C
92–95(4 aa)
链 D
1–64(64 aa)
链 D
92–95(4 aa)
|
突变:D83V 突变:D83V 突变:D83V 突变:D83V | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;292 K;0.1M MES pH 5.94, 0.2 M NaCl and 18% PEG2000MME
|
分辨率 2.97 Å R-free 0.190 |
| 6BZ1 MEF2 Chimera D83V mutant/DNA complex 提交 2017-12-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–64(64 aa)
链 A
92–95(4 aa)
链 B
1–64(64 aa)
链 B
92–95(4 aa)
|
突变:D83V 突变:D83V 突变:D83V 突变:D83V | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;292 K;0.1M MES pH 5.94, 0.2 M NaCl and 18% PEG2000MME
|
分辨率 2.97 Å R-free 0.190 |
| 6WC2 Crystal Structure of a Ternary MEF2 Chimera/NKX2-5/myocardin enhancer DNA Complex 提交 2020-03-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric |
链 A
1–72(72 aa)
链 A
92–95(4 aa)
链 B
1–72(72 aa)
链 B
92–95(4 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;291 K;0.15 M DL-Malic acid pH 7.0, 20% Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.225 |
| 6WC2 Crystal Structure of a Ternary MEF2 Chimera/NKX2-5/myocardin enhancer DNA Complex 提交 2020-03-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric |
链 C
1–72(72 aa)
链 C
92–95(4 aa)
链 D
1–72(72 aa)
链 D
92–95(4 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;291 K;0.15 M DL-Malic acid pH 7.0, 20% Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.225 |
| 6WC2 Crystal Structure of a Ternary MEF2 Chimera/NKX2-5/myocardin enhancer DNA Complex 提交 2020-03-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric |
链 I
1–72(72 aa)
链 I
92–95(4 aa)
链 J
1–72(72 aa)
链 J
92–95(4 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;291 K;0.15 M DL-Malic acid pH 7.0, 20% Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.225 |
共 8 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | MEF2A_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–90; UniProt 2–91 作者链 B; PDB构建体 1–90; UniProt 2–91 作者链 C; PDB构建体 1–90; UniProt 2–91 作者链 D; PDB构建体 1–90; UniProt 2–91 作者链 I; PDB构建体 1–90; UniProt 2–91 作者链 J; PDB构建体 1–90; UniProt 2–91 |