3tez

Crystal Structure of Anthrax Protective Antigen Mutant S337C N664C and dithiolacetone modified to 1.8-A resolution

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 114.1 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protective antigen

Bacillus anthracis

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 30–764	突变：S337C,N664C	CA CALCIUM ION × 2 MXE 2-METHOXYETHANOL × 2 ACN ACETONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；20% PEG-ME 2000, 0.1M Tris-Cl, 0.2M Trimethylamine-N-oxide, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.83 Å R-free 0.226

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3TEZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1ACC ANTHRAX PROTECTIVE ANTIGEN 提交 1997-02-05	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–764（735 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；277 K；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 12-18% PEG 8K AND 50 MM CITRATE, PH 6.0 AT 4 DEGREES C. CRYSTAL FORM ""2"" (NEEDLE-LIKE CRYSTALS)., temperature 277K	分辨率 2.10 Å R-free 0.296
1T6B Crystal structure of B. anthracis Protective Antigen complexed with human Anthrax toxin receptor 提交 2004-05-05	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 X 30–764（735 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；300 K；CHES buffer, PEG400, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 300K	分辨率 2.50 Å R-free 0.266
1TZN Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor 提交 2004-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 B 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 C 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 D 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 E 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 F 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 O 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain	未记录	CA CALCIUM ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, sodium chloride, Tris, magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 4.30 Å R-free 0.330
1TZN Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor 提交 2004-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 G 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 H 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 I 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 J 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 K 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 L 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 M 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain	未记录	CA CALCIUM ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, sodium chloride, Tris, magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 4.30 Å R-free 0.330
1TZN Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor 提交 2004-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric	链 A 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 B 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 C 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 D 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 E 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 F 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 G 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 H 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 I 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 J 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 K 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 L 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 M 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 O 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain	未记录	CA CALCIUM ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, sodium chloride, Tris, magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 4.30 Å R-free 0.330
1TZN Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor 提交 2004-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric	链 A 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 B 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 C 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 D 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 E 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 F 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 G 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 H 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 I 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 J 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 K 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 L 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 M 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 O 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain	未记录	CA CALCIUM ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, sodium chloride, Tris, magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 4.30 Å R-free 0.330
1TZN Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor 提交 2004-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric	链 A 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 B 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 C 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 D 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 E 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 F 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 G 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 H 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 I 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 J 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 K 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 L 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 M 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 O 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain	未记录	CA CALCIUM ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, sodium chloride, Tris, magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 4.30 Å R-free 0.330
1TZO Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore 提交 2004-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 B 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 C 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 D 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 E 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 F 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 O 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain	未记录	CA CALCIUM ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.25；298 K；HEPES, sodium chloride, b-octylglucoside, spermine, pH 8.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.60 Å R-free 0.317
1TZO Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore 提交 2004-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 G 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 H 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 I 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 J 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 K 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 L 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain 链 M 203–764（562 aa）片段：63-kDa domain	未记录	CA CALCIUM ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.25；298 K；HEPES, sodium chloride, b-octylglucoside, spermine, pH 8.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.60 Å R-free 0.317
25PV Structure of the anthrax protective antigen in complex with a potent neutralizing antibody 提交 2026-04-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 200–626（427 aa）	突变：F231S	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.03 Å
3ETB Crystal structure of the engineered neutralizing antibody M18 complexed with anthrax protective antigen domain 4 提交 2008-10-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 621–764（144 aa）片段：Domain 4 of protective antigen PA-63: UNP residues 621-764	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；10% PEG 20000, 0.05 M Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 3.80 Å R-free 0.276
3ETB Crystal structure of the engineered neutralizing antibody M18 complexed with anthrax protective antigen domain 4 提交 2008-10-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 K 621–764（144 aa）片段：Domain 4 of protective antigen PA-63: UNP residues 621-764	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；10% PEG 20000, 0.05 M Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 3.80 Å R-free 0.276
3ETB Crystal structure of the engineered neutralizing antibody M18 complexed with anthrax protective antigen domain 4 提交 2008-10-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 621–764（144 aa）片段：Domain 4 of protective antigen PA-63: UNP residues 621-764	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；10% PEG 20000, 0.05 M Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 3.80 Å R-free 0.276
3ETB Crystal structure of the engineered neutralizing antibody M18 complexed with anthrax protective antigen domain 4 提交 2008-10-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 M 621–764（144 aa）片段：Domain 4 of protective antigen PA-63: UNP residues 621-764	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；10% PEG 20000, 0.05 M Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 3.80 Å R-free 0.276
3INO 1.95A Resolution Structure of Protective Antigen Domain 4 提交 2009-08-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 624–764（141 aa）片段：Domain 4 链 B 624–764（141 aa）片段：Domain 4	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；20% PEG 8000, 100mM imidazole, 3% MPD, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 277K	分辨率 1.95 Å R-free 0.258
3INO 1.95A Resolution Structure of Protective Antigen Domain 4 提交 2009-08-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 624–764（141 aa）片段：Domain 4	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；20% PEG 8000, 100mM imidazole, 3% MPD, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 277K	分辨率 1.95 Å R-free 0.258
3INO 1.95A Resolution Structure of Protective Antigen Domain 4 提交 2009-08-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 624–764（141 aa）片段：Domain 4	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；20% PEG 8000, 100mM imidazole, 3% MPD, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 277K	分辨率 1.95 Å R-free 0.258
3J9C CryoEM single particle reconstruction of anthrax toxin protective antigen pore at 2.9 Angstrom resolution 提交 2014-12-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：7-MERIC	链 A 203–764（562 aa）片段：C-terminal 63-kDa fragment (UNP residues 203-764)	未记录	CA CALCIUM ION × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 50 mM NaOAc, pH 5.0, 0.05% Igepal CA-630；pH 5；50 mM NaOAc, pH 5.0, 0.05% Igepal CA-630 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Plunged into liguid nitrogen (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 2.90 Å
3J9C CryoEM single particle reconstruction of anthrax toxin protective antigen pore at 2.9 Angstrom resolution 提交 2014-12-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 203–764（562 aa）片段：C-terminal 63-kDa fragment (UNP residues 203-764)	未记录	CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 50 mM NaOAc, pH 5.0, 0.05% Igepal CA-630；pH 5；50 mM NaOAc, pH 5.0, 0.05% Igepal CA-630 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Plunged into liguid nitrogen (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 2.90 Å
3J9C CryoEM single particle reconstruction of anthrax toxin protective antigen pore at 2.9 Angstrom resolution 提交 2014-12-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 203–764（562 aa）片段：C-terminal 63-kDa fragment (UNP residues 203-764)	未记录	CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 50 mM NaOAc, pH 5.0, 0.05% Igepal CA-630；pH 5；50 mM NaOAc, pH 5.0, 0.05% Igepal CA-630 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Plunged into liguid nitrogen (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 2.90 Å
3KWV Structural basis for the unfolding of anthrax lethal factor by protective antigen oligomers 提交 2009-12-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 197–764（568 aa）片段：UNP residues 197-764 链 B 197–764（568 aa）片段：UNP residues 197-764	突变：V303P, H304G 突变：V303P, H304G	CA CALCIUM ION × 16	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；291 K；16% PEG 3000, 0.1M cacodylic acid, 0.2M magnesium chloride, 10 mM Tris-Cl, 75 mM sodium chloride, 10 mM adenosine-5'-triphosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.10 Å R-free 0.281
3KWV Structural basis for the unfolding of anthrax lethal factor by protective antigen oligomers 提交 2009-12-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 D 197–764（568 aa）片段：UNP residues 197-764 链 E 197–764（568 aa）片段：UNP residues 197-764	突变：V303P, H304G 突变：V303P, H304G	CA CALCIUM ION × 16	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；291 K；16% PEG 3000, 0.1M cacodylic acid, 0.2M magnesium chloride, 10 mM Tris-Cl, 75 mM sodium chloride, 10 mM adenosine-5'-triphosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.10 Å R-free 0.281
3MHZ 1.7A structure of 2-fluorohistidine labeled Protective Antigen 提交 2010-04-09	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–764（735 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.2；293 K；30% PEG 400, 0.1M Tris, pH 8.2, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 1.70 Å R-free 0.222
3Q8A Crystal structure of WT Protective Antigen (pH 5.5) 提交 2011-01-06	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–764（735 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；25 %(w/v) PEG 1500, 100 mM SPG Buffer, pH 5.5, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 3.13 Å R-free 0.279
3Q8B Crystal structure of WT Protective Antigen (pH 9.0) 提交 2011-01-06	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–764（735 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 9；293 K；25 %(w/v) PEG 1500, 100 mM MMT Buffer, pH 9.0, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.258
3Q8C Crystal structure of Protective Antigen W346F (pH 5.5) 提交 2011-01-06	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–764（735 aa）	突变：W346F	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；25%(w/v) PEG 1500, 100mM SPG Buffer, pH 5.5, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 2.85 Å R-free 0.271
3Q8E Crystal structure of Protective Antigen W346F (pH 8.5) 提交 2011-01-06	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–764（735 aa）	突变：W346F	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；25%(w/v) PEG 1500, 100mM SPG Buffer, pH 8.5, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.248
3Q8F Crystal structure of 2-Fluorohistine labeled Protective Antigen (pH 5.8) 提交 2011-01-06	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–764（735 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；30% PEG 400, 100mM MES, pH 7.0, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.267
4EE2 Crystal Structure of Anthrax Protective Antigen K446M Mutant to 1.91-A Resolution 提交 2012-03-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–764（735 aa）片段：Protective antigen	突变：K446M	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；0.1M tris, 20% peg2k-MME, 0.2M TMAO, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.91 Å R-free 0.265
4H2A Crystal structure of wild type protective antigen to 1.62 A (pH 7.5) 提交 2012-09-12	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–764（735 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；280 K；protein crystallised from 0.1 M HEPES pH 7.5, 10 % PEG 8000, 8 % ethylene glycol by sitting drop vapour diffusion at temperature 280 K., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 1.62 Å R-free 0.219
4NAM 1.7A structure of 5-Fluoro Tryptophan Labeled Protective Antigen (W206Y) 提交 2013-10-22	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–764（735 aa）	突变：W206Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；35% (v/v) Pentaerythritol propoxylate (5/4 PO/OH), 0.05 M HEPES, 0.2 M Potassium chloride, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 1.70 Å R-free 0.208
5FR3 X-ray crystal structure of aggregation-resistant protective antigen of Bacillus anthracis (mutant S559L T576E) 提交 2015-12-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 43–764（722 aa）	突变：YES	CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 20 MM MGCL2, 100 MM HEPES PH 7.5, 22% POLY(ACRYLIC ACID SODIUM SALT) 5100	分辨率 1.94 Å R-free 0.227
6PSN Anthrax toxin protective antigen channels bound to lethal factor 提交 2019-07-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 197–764（568 aa）链 B 197–764（568 aa）链 C 197–764（568 aa）链 D 197–764（568 aa）链 E 197–764（568 aa）链 F 197–764（568 aa）链 G 197–764（568 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å
6UJI Low resolution crystal structure (5.5 A) of the anthrax toxin protective antigen heptamer prepore D425A mutant 提交 2019-10-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 197–764（568 aa）链 B 197–764（568 aa）链 C 197–764（568 aa）链 D 197–764（568 aa）链 E 197–764（568 aa）链 F 197–764（568 aa）链 G 197–764（568 aa）	突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；10% (v/v) ethanol, 0.1 M Tris	分辨率 5.50 Å R-free 0.278
6UJI Low resolution crystal structure (5.5 A) of the anthrax toxin protective antigen heptamer prepore D425A mutant 提交 2019-10-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 H 197–764（568 aa）链 I 197–764（568 aa）链 J 197–764（568 aa）链 K 197–764（568 aa）链 L 197–764（568 aa）链 M 197–764（568 aa）链 N 197–764（568 aa）	突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；10% (v/v) ethanol, 0.1 M Tris	分辨率 5.50 Å R-free 0.278
6UZB Anthrax toxin protective antigen channels bound to edema factor 提交 2019-11-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 30–764（735 aa）链 B 30–764（735 aa）链 C 30–764（735 aa）链 D 30–764（735 aa）链 E 30–764（735 aa）链 F 30–764（735 aa）链 G 30–764（735 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6UZD Anthrax toxin protective antigen channels bound to edema factor 提交 2019-11-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 A 30–764（735 aa）链 B 30–764（735 aa）链 C 30–764（735 aa）链 D 30–764（735 aa）链 E 30–764（735 aa）链 F 30–764（735 aa）链 G 30–764（735 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
6UZE Anthrax toxin protective antigen channels bound to edema factor 提交 2019-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 A 30–764（735 aa）链 B 30–764（735 aa）链 C 30–764（735 aa）链 D 30–764（735 aa）链 E 30–764（735 aa）链 F 30–764（735 aa）链 G 30–764（735 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
6VRA Anthrax octamer prechannel bound to full-length edema factor 提交 2020-02-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 33–764（732 aa）链 B 33–764（732 aa）链 C 33–764（732 aa）链 D 33–764（732 aa）链 E 33–764（732 aa）链 F 33–764（732 aa）链 G 33–764（732 aa）链 H 33–764（732 aa）	突变：K245G, R252N 突变：D512K 突变：K245G, R252N 突变：D512K 突变：K245G, R252N 突变：D512K 突变：K245G, R252N 突变：D512K	CA CALCIUM ION × 16	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
6WJJ Anthrax octamer prechannel bound to full-length lethal factor 提交 2020-04-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 33–764（732 aa）链 B 33–764（732 aa）链 C 33–764（732 aa）链 D 33–764（732 aa）链 E 33–764（732 aa）链 F 33–764（732 aa）链 G 33–764（732 aa）链 H 33–764（732 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 16 SO4 SULFATE ION × 4 ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
7KXR Protective antigen pore translocating lethal factor N-terminal domain 提交 2020-12-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 203–764（562 aa）片段：UNP Residues 203-764 链 B 203–764（562 aa）片段：UNP Residues 203-764 链 C 203–764（562 aa）片段：UNP Residues 203-764 链 D 203–764（562 aa）片段：UNP Residues 203-764 链 E 203–764（562 aa）片段：UNP Residues 203-764 链 F 203–764（562 aa）片段：UNP Residues 203-764 链 G 203–764（562 aa）片段：UNP Residues 203-764	未记录	CA CALCIUM ION × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 5.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7O85 Anthrax toxin prepore in complex with the neutralizing Fab cAb29 提交 2021-04-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 A 203–643（441 aa）链 D 203–643（441 aa）链 G 203–643（441 aa）链 J 203–643（441 aa）链 M 203–643（441 aa）链 P 203–643（441 aa）链 S 203–643（441 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å

共 28 个其他 PDB 条目、42 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PAG_BACAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–735； UniProt 30–764

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3tez
沉积日期 deposition_date	2011-08-15
结构标题 title	Crystal Structure of Anthrax Protective Antigen Mutant S337C N664C and dithiolacetone modified to 1.8-A resolution
关键词 keywords	Translocase, PROTEIN TRANSPORT, TOXIN; PROTEIN TRANSPORT, TOXIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	33.28 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	33.01 Å
零角强度 I(0) i0	101327000.00
分子量 molecular_weight	79179.0 kDa
排除体积 excluded_volume	98727 Å³
包络体积 envelope_volume	128910 Å³
水化壳体积 shell_volume	34330 Å³
包络直径 envelope_diameter	119.4 Å
壳层 Rg shell_rg	37.61 Å
包络 Rg envelope_rg	33.20 Å
形状 Rg shape_rg	33.01 Å
总 Rg total_rg	33.36 Å
总原子数 total_atoms	5576
残基数 n_residues	700
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	114.1 Å
Rg (实空间) rg_real	33.58 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.38 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.0130e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.9400e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	33.46 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	101300000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8470
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	30.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.501
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.337
角度范围 angular_range	— – 0.2400 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	32870000.0000
实空间数据点数 n_real_points	49
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.793; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.784; Smooth: 0.844

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Protective antigen
分子量 formula_weight	82773.9 kDa
突变 mutation	S337C,N664C
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	6022

EVKQENRLLNESESSSQGLLGYYFSDLNFQAPMVVTSSTTGDLSIPSSELENIPSENQYFQSAIWSGFIKVKKSDEYTFATSADNHVTMWVDDQEVINKASNSNKIRLEKGRLYQIKIQYQRENPTEKGLDFKLYWTDSQNKKEVISSDNLQLPELKQKSSNSRKKRSTSAGPTVPDRDNDGIPDSLEVEGYTVDVKNKRTFLSPWISNIHEKKGLTKYKSSPEKWSTASDPYSDFEKVTGRIDKNVSPEARHPLVAAYPIVHVDMENIILSKNEDQSTQNTDSQTRTISKNTSTSRTHTSEVHGNAEVHASFFDIGGSVSAGFSNSNSSTVAIDHCLSLAGERTWAETMGLNTADTARLNANIRYVNTGTAPIYNVLPTTSLVLGKNQTLATIKAKENQLSQILAPNNYYPSKNLAPIALNAQDDFSSTPITMNYNQFLELEKTKQLRLDTDQVYGNIATYNFENGRVRVDTGSNWSEVLPQIQETTARIIFNGKDLNLVERRIAAVNPSDPLETTKPDMTLKEALKIAFGFNEPNGNLQYQGKDITEFDFNFDQQTSQNIKNQLAELNATNIYTVLDKIKLNAKMNILIRDKRFHYDRNNIAVGADESVVKEAHREVINSSTEGLLLNIDKDIRKILSGYIVEIEDTEGLKEVINDRYDMLCISSLRQDGKTFIDFKKYNDKLPLYISNPNYKVNVYAVTKENTIINPSENGDTSTNGIKKILIFSKKGYEIG

来源 Source

来源生物 organism	Bacillus anthracis
通用名 common_name	anthrax,anthrax bacterium
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1392
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	2-METHOXYETHANOL
分子量 formula_weight	76.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ACETONE
分子量 formula_weight	58.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	422

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d3teza1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.60 — Anthrax protective antigen C-terminal-like
超家族 Superfamily superfamily	f.60.1 — Anthrax protective antigen C-terminal-like
家族 Family family	f.60.1.1 — Anthrax protective antigen C-terminal-like

结构域编号 domain_id	d3teza2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.179 — Anthrax protective antigen N-terminal-like
超家族 Superfamily superfamily	b.179.1 — PA14-like
家族 Family family	b.179.1.1 — PA14

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	3tezA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	182 — Toxin - Anthrax Protective Antigen; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Toxin - Anthrax Protective Antigen;domain 1

结构域编号 domain_id	3tezA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	240 — Protective antigen, heptamerisation domain

结构域编号 domain_id	3tezA03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	110 —

结构域编号 domain_id	3tezA04
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	810 —

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	71.293 Å
晶胞边长 b length_b	93.686 Å
晶胞边长 c length_c	117.851 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.830 Å
最低分辨率 resolution_low	24.900 Å
R 因子 r_factor	0.1935
R_work r_work	0.1926
R_free r_free	0.2262

fit	/app/data/saxs_computation/te/3tez/3tez.fit
pddf	/app/data/pr_computation/te/3tez/3tez.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/te/3tez/3tez.dat