3vaw

Crystal structure of a smt fusion peptidyl-prolyl cis-trans isomerase with surface mutation v3i from burkholderia pseudomallei complexed with fk506

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ubiquitin-like protein SMT3,Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase

Burkholderia pseudomallei

UniProt Q12306

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 单体 蛋白 1 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SMT3_YEAST
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 11–97; UniProt 13–99

Ubiquitin-like protein SMT3,Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase

Burkholderia pseudomallei

UniProt Q3JK38

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 单体 蛋白 1 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q3JK38_BURP1
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 98–209; UniProt 2–113

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3vaw
沉积日期 deposition_date2011-12-29
结构标题 titleCrystal structure of a smt fusion peptidyl-prolyl cis-trans isomerase with surface mutation v3i from burkholderia pseudomallei complexed with fk506
关键词 keywords;SSGCID, Isomerase, Structural Genomics, Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease, PROTEIN BINDING, PROTEIN BINDING-INHIBITOR complex ;; Isomerase, PROTEIN BINDING/INHIBITOR
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3vaw__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3vaw__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3vaw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)19.10 Å
Rg(电子密度)18.30 Å
总 Rg19.24 Å
原子数1452
残基数185
排除体积25842 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3vaw__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id3vawA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1
结构域编号 domain_id3vawA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology50 — Chitinase A; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 —
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7. 引用文献 (1)