3vdd

Structure of HRV2 capsid complexed with antiviral compound BTA798

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 93.1 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein VP1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 240 PDB 声明：240-MERIC（240）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 568–850 链 B； UniProt 70–330 链 C； UniProt 331–567 链 D； UniProt 1–69	片段：UNP residues 568-850 片段：UNP residues 70-330 片段：UNP residues 331-567 片段：UNP residues 1-69	BT8 3-ethoxy-6-{2-[1-(6-methylpyridazin-3-yl)piperidin-4-yl]ethoxy}-1,2-benzoxazole × 60	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.5；298 K；0.4-0.7 M ammonium sulfate, pH 7.5, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.20 Å R-free 0.273
2	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 568–850 链 B； UniProt 70–330 链 C； UniProt 331–567 链 D； UniProt 1–69	片段：UNP residues 568-850 片段：UNP residues 70-330 片段：UNP residues 331-567 片段：UNP residues 1-69	BT8 3-ethoxy-6-{2-[1-(6-methylpyridazin-3-yl)piperidin-4-yl]ethoxy}-1,2-benzoxazole × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.5；298 K；0.4-0.7 M ammonium sulfate, pH 7.5, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.20 Å R-free 0.273
3	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric（20）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 568–850 链 B； UniProt 70–330 链 C； UniProt 331–567 链 D； UniProt 1–69	片段：UNP residues 568-850 片段：UNP residues 70-330 片段：UNP residues 331-567 片段：UNP residues 1-69	BT8 3-ethoxy-6-{2-[1-(6-methylpyridazin-3-yl)piperidin-4-yl]ethoxy}-1,2-benzoxazole × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.5；298 K；0.4-0.7 M ammonium sulfate, pH 7.5, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.20 Å R-free 0.273
4	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 568–850 链 B； UniProt 70–330 链 C； UniProt 331–567 链 D； UniProt 1–69	片段：UNP residues 568-850 片段：UNP residues 70-330 片段：UNP residues 331-567 片段：UNP residues 1-69	BT8 3-ethoxy-6-{2-[1-(6-methylpyridazin-3-yl)piperidin-4-yl]ethoxy}-1,2-benzoxazole × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.5；298 K；0.4-0.7 M ammonium sulfate, pH 7.5, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.20 Å R-free 0.273
5	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 568–850 链 B； UniProt 70–330 链 C； UniProt 331–567 链 D； UniProt 1–69	片段：UNP residues 568-850 片段：UNP residues 70-330 片段：UNP residues 331-567 片段：UNP residues 1-69	BT8 3-ethoxy-6-{2-[1-(6-methylpyridazin-3-yl)piperidin-4-yl]ethoxy}-1,2-benzoxazole × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.5；298 K；0.4-0.7 M ammonium sulfate, pH 7.5, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.20 Å R-free 0.273
6	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 120 PDB 声明：120-meric（120）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 568–850 链 B； UniProt 70–330 链 C； UniProt 331–567 链 D； UniProt 1–69	片段：UNP residues 568-850 片段：UNP residues 70-330 片段：UNP residues 331-567 片段：UNP residues 1-69	BT8 3-ethoxy-6-{2-[1-(6-methylpyridazin-3-yl)piperidin-4-yl]ethoxy}-1,2-benzoxazole × 30	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.5；298 K；0.4-0.7 M ammonium sulfate, pH 7.5, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.20 Å R-free 0.273

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3VDD	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1A3R FAB FRAGMENT (ANTIBODY 8F5) COMPLEXED WITH PEPTIDE FROM HUMAN RHINOVIRUS (SEROTYPE 2) VIRAL CAPSID PROTEIN VP2 (RESIDUES 156-170) 提交 1998-01-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 P 225–239（15 aa）片段：RESIDUES 156 - 170	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；FAB-PEPTIDE COMPLEX WAS CRYSTALLIZED FROM 0.9 M SODIUM CITRATE, 25 MM SODIUM CHLORIDE, 50 MM TRIS-HCL, PH 7.75, pH 7.5	分辨率 2.10 Å
1CQQ TYPE 2 RHINOVIRUS 3C PROTEASE WITH AG7088 INHIBITOR 提交 1999-08-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1508–1687（180 aa）	未记录	AG7 4-{2-(4-FLUORO-BENZYL)-6-METHYL-5-[(5-METHYL-ISOXAZOLE-3-CARBONYL)-AMINO]-4-OXO-HEPTANOYLAMINO}-5-(2-OXO-PYRROLIDIN-3-YL)-PENTANOIC ACID ETHYL ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；286 K；20% PEG10K, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 13K	分辨率 1.85 Å
1FPN HUMAN RHINOVIRUS SEROTYPE 2 (HRV2) 提交 2000-08-31	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 240 PDB 声明：240-MERIC	链 1 568–856（289 aa）链 2 70–330（261 aa）链 3 331–567（237 aa）链 4 2–69（68 aa）	未记录	DAO LAURIC ACID × 60	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；ammonium sulphate, potassium phosphate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.60 Å
1FPN HUMAN RHINOVIRUS SEROTYPE 2 (HRV2) 提交 2000-08-31	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 1 568–856（289 aa）链 2 70–330（261 aa）链 3 331–567（237 aa）链 4 2–69（68 aa）	未记录	DAO LAURIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；ammonium sulphate, potassium phosphate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.60 Å
1FPN HUMAN RHINOVIRUS SEROTYPE 2 (HRV2) 提交 2000-08-31	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 1 568–856（289 aa）链 2 70–330（261 aa）链 3 331–567（237 aa）链 4 2–69（68 aa）	未记录	DAO LAURIC ACID × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；ammonium sulphate, potassium phosphate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.60 Å
1FPN HUMAN RHINOVIRUS SEROTYPE 2 (HRV2) 提交 2000-08-31	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 1 568–856（289 aa）链 2 70–330（261 aa）链 3 331–567（237 aa）链 4 2–69（68 aa）	未记录	DAO LAURIC ACID × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；ammonium sulphate, potassium phosphate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.60 Å
1FPN HUMAN RHINOVIRUS SEROTYPE 2 (HRV2) 提交 2000-08-31	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 1 568–856（289 aa）链 2 70–330（261 aa）链 3 331–567（237 aa）链 4 2–69（68 aa）	未记录	DAO LAURIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；ammonium sulphate, potassium phosphate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.60 Å
1FPN HUMAN RHINOVIRUS SEROTYPE 2 (HRV2) 提交 2000-08-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric	链 1 568–856（289 aa）链 2 70–330（261 aa）链 3 331–567（237 aa）链 4 2–69（68 aa）	未记录	DAO LAURIC ACID × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；ammonium sulphate, potassium phosphate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.60 Å
1V9U Human Rhinovirus 2 bound to a fragment of its cellular receptor protein 提交 2004-02-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 300 PDB 声明：complete icosahedral assembly	链 1 568–856（289 aa）链 2 70–330（261 aa）链 3 331–567（237 aa）链 4 2–69（68 aa）	未记录	DAO LAURIC ACID × 60 CA CALCIUM ION × 60	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；Ammonim sulfate, sodium/potassium phosphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.60 Å R-free 0.295
1V9U Human Rhinovirus 2 bound to a fragment of its cellular receptor protein 提交 2004-02-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 1 568–856（289 aa）链 2 70–330（261 aa）链 3 331–567（237 aa）链 4 2–69（68 aa）	未记录	DAO LAURIC ACID × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；Ammonim sulfate, sodium/potassium phosphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.60 Å R-free 0.295
1V9U Human Rhinovirus 2 bound to a fragment of its cellular receptor protein 提交 2004-02-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric	链 1 568–856（289 aa）链 2 70–330（261 aa）链 3 331–567（237 aa）链 4 2–69（68 aa）	未记录	DAO LAURIC ACID × 5 CA CALCIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；Ammonim sulfate, sodium/potassium phosphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.60 Å R-free 0.295
1V9U Human Rhinovirus 2 bound to a fragment of its cellular receptor protein 提交 2004-02-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric	链 1 568–856（289 aa）链 2 70–330（261 aa）链 3 331–567（237 aa）链 4 2–69（68 aa）	未记录	DAO LAURIC ACID × 6 CA CALCIUM ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；Ammonim sulfate, sodium/potassium phosphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.60 Å R-free 0.295
1V9U Human Rhinovirus 2 bound to a fragment of its cellular receptor protein 提交 2004-02-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 1 568–856（289 aa）链 2 70–330（261 aa）链 3 331–567（237 aa）链 4 2–69（68 aa）	未记录	DAO LAURIC ACID × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；Ammonim sulfate, sodium/potassium phosphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.60 Å R-free 0.295
1V9U Human Rhinovirus 2 bound to a fragment of its cellular receptor protein 提交 2004-02-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 150 PDB 声明：150-meric	链 1 568–856（289 aa）链 2 70–330（261 aa）链 3 331–567（237 aa）链 4 2–69（68 aa）	未记录	DAO LAURIC ACID × 30 CA CALCIUM ION × 30	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；Ammonim sulfate, sodium/potassium phosphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.60 Å R-free 0.295
2HRV 2A CYSTEINE PROTEINASE FROM HUMAN RHINOVIRUS 2 提交 1999-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 851–992（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；pH 8.00	分辨率 1.95 Å R-free 0.250
2HRV 2A CYSTEINE PROTEINASE FROM HUMAN RHINOVIRUS 2 提交 1999-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 851–992（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；pH 8.00	分辨率 1.95 Å R-free 0.250
2XYA Non-covalent inhibtors of rhinovirus 3C protease. 提交 2010-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1508–1687（180 aa）	未记录	7L4 2-PHENYLQUINOLIN-4-OL × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.40 Å R-free 0.288
3DPR Human rhinovirus 2 bound to a concatamer of the VLDL receptor module V3 提交 2008-07-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 300 PDB 声明：300-MERIC	链 A 568–856（289 aa）链 B 70–330（261 aa）链 C 331–567（237 aa）链 D 2–69（68 aa）	未记录	DAO LAURIC ACID × 60 CA CALCIUM ION × 60	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；Ammonium sulphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.50 Å R-free 0.441
3DPR Human rhinovirus 2 bound to a concatamer of the VLDL receptor module V3 提交 2008-07-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 568–856（289 aa）链 B 70–330（261 aa）链 C 331–567（237 aa）链 D 2–69（68 aa）	未记录	DAO LAURIC ACID × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；Ammonium sulphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.50 Å R-free 0.441
3DPR Human rhinovirus 2 bound to a concatamer of the VLDL receptor module V3 提交 2008-07-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric	链 A 568–856（289 aa）链 B 70–330（261 aa）链 C 331–567（237 aa）链 D 2–69（68 aa）	未记录	DAO LAURIC ACID × 5 CA CALCIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；Ammonium sulphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.50 Å R-free 0.441
3DPR Human rhinovirus 2 bound to a concatamer of the VLDL receptor module V3 提交 2008-07-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric	链 A 568–856（289 aa）链 B 70–330（261 aa）链 C 331–567（237 aa）链 D 2–69（68 aa）	未记录	DAO LAURIC ACID × 6 CA CALCIUM ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；Ammonium sulphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.50 Å R-free 0.441
3DPR Human rhinovirus 2 bound to a concatamer of the VLDL receptor module V3 提交 2008-07-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 568–856（289 aa）链 B 70–330（261 aa）链 C 331–567（237 aa）链 D 2–69（68 aa）	未记录	DAO LAURIC ACID × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；Ammonium sulphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.50 Å R-free 0.441
3DPR Human rhinovirus 2 bound to a concatamer of the VLDL receptor module V3 提交 2008-07-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 300 PDB 声明：300-meric	链 A 568–856（289 aa）链 B 70–330（261 aa）链 C 331–567（237 aa）链 D 2–69（68 aa）	未记录	DAO LAURIC ACID × 60 CA CALCIUM ION × 60	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；Ammonium sulphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.50 Å R-free 0.441
3TN9 X-ray structure of the HRV2 empty capsid (B-particle) 提交 2011-09-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 180 PDB 声明：180-MERIC	链 1 568–856（289 aa）链 2 70–330（261 aa）链 3 331–567（237 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M sodium acetate pH 6.5 - 8.0, 5% glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.00 Å R-free 0.265
3TN9 X-ray structure of the HRV2 empty capsid (B-particle) 提交 2011-09-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 1 568–856（289 aa）链 2 70–330（261 aa）链 3 331–567（237 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M sodium acetate pH 6.5 - 8.0, 5% glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.00 Å R-free 0.265
3TN9 X-ray structure of the HRV2 empty capsid (B-particle) 提交 2011-09-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 1 568–856（289 aa）链 2 70–330（261 aa）链 3 331–567（237 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M sodium acetate pH 6.5 - 8.0, 5% glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.00 Å R-free 0.265
3TN9 X-ray structure of the HRV2 empty capsid (B-particle) 提交 2011-09-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 1 568–856（289 aa）链 2 70–330（261 aa）链 3 331–567（237 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M sodium acetate pH 6.5 - 8.0, 5% glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.00 Å R-free 0.265
3TN9 X-ray structure of the HRV2 empty capsid (B-particle) 提交 2011-09-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 1 568–856（289 aa）链 2 70–330（261 aa）链 3 331–567（237 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M sodium acetate pH 6.5 - 8.0, 5% glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.00 Å R-free 0.265
3TN9 X-ray structure of the HRV2 empty capsid (B-particle) 提交 2011-09-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 45 PDB 声明：45-meric	链 1 568–856（289 aa）链 2 70–330（261 aa）链 3 331–567（237 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M sodium acetate pH 6.5 - 8.0, 5% glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.00 Å R-free 0.265
4L3B X-ray structure of the HRV2 A particle uncoating intermediate 提交 2013-06-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 180 PDB 声明：180-meric	链 A 568–856（289 aa）片段：UNP residues 568-856 链 B 70–330（261 aa）片段：UNP residues 70-330 链 C 331–567（237 aa）片段：UNP residues 331-567	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.5 M ammonium sulfate, 1 M sodium/potassium phosphate, 5% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 6.50 Å R-free 0.320
4L3B X-ray structure of the HRV2 A particle uncoating intermediate 提交 2013-06-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 568–856（289 aa）片段：UNP residues 568-856 链 B 70–330（261 aa）片段：UNP residues 70-330 链 C 331–567（237 aa）片段：UNP residues 331-567	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.5 M ammonium sulfate, 1 M sodium/potassium phosphate, 5% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 6.50 Å R-free 0.320
4L3B X-ray structure of the HRV2 A particle uncoating intermediate 提交 2013-06-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 A 568–856（289 aa）片段：UNP residues 568-856 链 B 70–330（261 aa）片段：UNP residues 70-330 链 C 331–567（237 aa）片段：UNP residues 331-567	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.5 M ammonium sulfate, 1 M sodium/potassium phosphate, 5% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 6.50 Å R-free 0.320
4L3B X-ray structure of the HRV2 A particle uncoating intermediate 提交 2013-06-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 A 568–856（289 aa）片段：UNP residues 568-856 链 B 70–330（261 aa）片段：UNP residues 70-330 链 C 331–567（237 aa）片段：UNP residues 331-567	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.5 M ammonium sulfate, 1 M sodium/potassium phosphate, 5% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 6.50 Å R-free 0.320
4L3B X-ray structure of the HRV2 A particle uncoating intermediate 提交 2013-06-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 568–856（289 aa）片段：UNP residues 568-856 链 B 70–330（261 aa）片段：UNP residues 70-330 链 C 331–567（237 aa）片段：UNP residues 331-567	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.5 M ammonium sulfate, 1 M sodium/potassium phosphate, 5% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 6.50 Å R-free 0.320
4L3B X-ray structure of the HRV2 A particle uncoating intermediate 提交 2013-06-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 45 PDB 声明：45-meric	链 A 568–856（289 aa）片段：UNP residues 568-856 链 B 70–330（261 aa）片段：UNP residues 70-330 链 C 331–567（237 aa）片段：UNP residues 331-567	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.5 M ammonium sulfate, 1 M sodium/potassium phosphate, 5% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 6.50 Å R-free 0.320
5FX5 Novel inhibitors of human rhinovirus 3C protease 提交 2016-02-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1508–1687（180 aa）片段：3C PROTEASE, RESIDUES 1508-1687	未记录	GOL GLYCEROL × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 HOV ethyl (4R)-4-[[(2S,3R)-1-[(2S)-3-methyl-2-[(5-methyl-1,2-oxazol-3-yl)carbonylamino]butanoyl]-3-phenyl-pyrrolidin-2-yl]carbonylamino]-5-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]pentanoate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 30% PEG400, 100 MM TRIS-HCL PH 8.5, 200 MM MGCL2	分辨率 1.70 Å R-free 0.211
5FX6 Novel inhibitors of human rhinovirus 3C protease 提交 2016-02-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1508–1687（180 aa）片段：3C PROTEASE, RESIDUES 1508-1687	未记录	6OY ethyl (4R)-4-[[(2S,4S)-1-[(2S)-3-methyl-2-[(5-methyl-1,2-oxazol-3-yl)carbonylamino]butanoyl]-4-phenyl-pyrrolidin-2-yl]carbonylamino]-5-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]pentanoate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.2 M CACL2, 0,1 M TRIS PH 8.5, 25% PEG4000	分辨率 1.45 Å R-free 0.186
6FFN Structure-based design and synthesis of macrocyclic human rhinovirus 3C protease inhibitors 提交 2018-01-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1508–1687（180 aa）	未记录	D8K ~{N}-[(5~{S},8~{S},11~{S},15~{R})-8-[(4-fluorophenyl)methyl]-5-(hydroxymethyl)-2,7,10,14-tetrakis(oxidanylidene)-1,6,9,13-tetrazabicyclo[13.3.0]octadecan-11-yl]-5-methyl-1,2-oxazole-3-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；2.0 M Ammonium Sulfate 0.1 M Na Acetate, pH 4.5,	分辨率 1.75 Å R-free 0.170
6FFS Structure-based design and synthesis of macrocyclic human rhinovirus 3C protease inhibitors 提交 2018-01-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1508–1687（180 aa）	未记录	D8E ~{N}-[(2~{S},5~{S},14~{S})-2-[(4-fluorophenyl)methyl]-5-(hydroxymethyl)-9-methyl-3,8,15-tris(oxidanylidene)-1,4,9-triazacyclopentadec-14-yl]-5-methyl-1,2-oxazole-3-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；2.0 M Ammonium Sulfate 0.1 M Na Acetate, pH 4.5	分辨率 1.86 Å R-free 0.172
7ARA Rhinovirus A2 2A protease in complex with zVAM.fmk 提交 2020-10-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 851–992（142 aa）链 B 851–992（142 aa）	未记录	S7N (phenylmethyl) ~{N}-[(2~{R})-3-methyl-1-[[(2~{S})-1-[[(3~{S})-1-methylsulfanyl-4-oxidanylidene-pentan-3-yl]amino]-1-oxidanylidene-propan-2-yl]amino]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamate × 1 ZN ZINC ION × 2 S7Q (phenylmethyl) ~{N}-[(2~{S})-3-methyl-1-[[(2~{R})-1-[[(3~{R})-1-methylsulfanyl-4-oxidanylidene-pentan-3-yl]amino]-1-oxidanylidene-propan-2-yl]amino]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；7.5 % PEG8000, 0.3 M KCNS, 5 % 2-methyl-2-butanol, 10 % glycerol, 10 mM b-mercaptoethanol and 50 mM sodium-potassium phosphate buffer pH 8.0	分辨率 2.24 Å R-free 0.257
8AY4 Human rhinovirus 2 virion in situ 提交 2022-09-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 240 PDB 声明：240-meric	链 A 582–850（269 aa）链 B 81–330（250 aa）链 C 331–567（237 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.70 Å
8AY5 Human rhinovirus 2 empty particle in situ 提交 2022-09-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 180 PDB 声明：180-meric	链 A 600–850（251 aa）链 B 81–330（250 aa）链 C 331–567（237 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.10 Å
9G0B Rhinovirus A2 uncoating intermediate revealing the natural pocket factor (pH 5.8 and 4 degrees Celsius) 提交 2024-07-07	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 240 PDB 声明：240-meric	链 A 568–850（283 aa）链 B 70–330（261 aa）链 C 331–567（237 aa）链 D 2–69（68 aa）	未记录	DAO LAURIC ACID × 60	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 5.8；0.1 M phosphate buffer, pH 5.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

共 17 个其他 PDB 条目、43 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	POLG_HRV2
Isoform	—
PDB实体	1, 2, 3, 4
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–283； UniProt 568–850 作者链 B； PDB构建体 1–261； UniProt 70–330 作者链 C； PDB构建体 1–237； UniProt 331–567 作者链 D； PDB构建体 1–69； UniProt 1–69

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3vdd
沉积日期 deposition_date	2012-01-05
结构标题 title	Structure of HRV2 capsid complexed with antiviral compound BTA798
关键词 keywords	viral capsid, virus-drug complex, VIRUS; VIRUS
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	29.12 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	28.30 Å
零角强度 I(0) i0	131447000.00
分子量 molecular_weight	90342.0 kDa
排除体积 excluded_volume	112790 Å³
包络体积 envelope_volume	138670 Å³
水化壳体积 shell_volume	39857 Å³
包络直径 envelope_diameter	101.2 Å
壳层 Rg shell_rg	36.36 Å
包络 Rg envelope_rg	28.89 Å
形状 Rg shape_rg	28.29 Å
总 Rg total_rg	29.08 Å
总原子数 total_atoms	6368
残基数 n_residues	804
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	93.1 Å
Rg (实空间) rg_real	29.06 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.61 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.3140e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.0570e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	29.09 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	131400000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8883
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	34.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.319
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.271
角度范围 angular_range	— – 0.2700 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	30110000.0000
实空间数据点数 n_real_points	55
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.891; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.996; Smooth: 0.875

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Protein VP1
分子量 formula_weight	32274.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	6380

NPVENYIDEVLNEVLVVPNINSSNPTTSNSAPALDAAETGHTSSVQPEDVIETRYVQTSQTRDEMSLESFLGRSGCIHESKLEVTLANYNKENFTVWAINLQEMAQIRRKFELFTYTRFDSEITLVPCISALSQDIGHITMQYMYVPPGAPVPNSRDDYAWQSGTNASVFWQHGQAYPRFSLPFLSVASAYYMFYDGYDEQDQNYGTANTNNMGSLCSRIVTEKHIHKVHIMTRIYHKAKHVKAWCPRPPRALEYTRAHRTNFKIEDRSIQTAIVTRPIITTA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Protein VP2
分子量 formula_weight	29009.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

SPTVEACGYSDRIIQITRGDSTITSQDVANAIVAYGVWPHYLSSKDASAIDKPSQPDTSSNRFYTLRSVTWSSSSKGWWWKLPDALKDMGIFGENMFYHYLGRSGYTIHVQCNASKFHQGTLIVALIPEHQIASALHGNVNVGYNYTHPGETGREVKAETRLNPDLQPTEEYWLNFDGTLLGNITIFPHQFINLRSNNSATIIAPYVNAVPMDSMRSHNNWSLVIIPICPLETSSAINTIPITISISPMCAEFSGARAKRQ

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Protein VP3
分子量 formula_weight	26107.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

GLPVFITPGSGQFLTTDDFQSPCALPWYHPTKEISIPGEVKNLVEICQVDSLVPINNTDTYINSENMYSVVLQSSINAPDKIFSIRTDVASQPLATTLIGEISSYFTHWTGSLRFSFMFCGTANTTVKLLLAYTPPGIAEPTTRKDAMLGTHVIWDVGLQSTISMVVPWISASHYRNTSPGRSTSGYITCWYQTRLVIPPQTPPTARLLCFVSGCKDFCLRMARDTNLHLQSGAIAQ

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Protein VP4
分子量 formula_weight	7488.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MGAQVSRQNVGTHSTQNSVSNGSSLNYFNINYFKDAASNGASKLEFTQDPSKFTDPVKDVLEKGIPTLQ

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	3-ethoxy-6-{2-[1-(6-methylpyridazin-3-yl)piperidin-4-yl]ethoxy}-1,2-benzoxazole
分子量 formula_weight	382.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	12

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	3vddA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	3vddB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	3vddC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	310.490 Å
晶胞边长 b length_b	345.680 Å
晶胞边长 c length_c	378.390 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	120

空间群 space_group	P 21 2 21
空间群编号 int_tables_number	18
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.200 Å
最低分辨率 resolution_low	24.942 Å
R 因子 r_factor	0.2317
R_work r_work	0.2295
R_free r_free	0.2727

fit	/app/data/saxs_computation/vd/3vdd/3vdd.fit
pddf	/app/data/pr_computation/vd/3vdd/3vdd.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/vd/3vdd/3vdd.dat

Structure of HRV2 capsid complexed with antiviral compound BTA798

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein VP1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)