SAXSdb — 4bws

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

THIOREDOXIN-LIKE PROTEIN 4A

HOMO SAPIENS

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	POLYGLUTAMINE-BINDING PROTEIN 1 × 1 （O60828） CD2 ANTIGEN CYTOPLASMIC TAIL-BINDING PROTEIN 2 × 1 （O95400） water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	POLYGLUTAMINE-BINDING PROTEIN 1 × 1 （O60828） CD2 ANTIGEN CYTOPLASMIC TAIL-BINDING PROTEIN 2 × 1 （O95400） water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TXN4A_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 9–142； UniProt 4–137 作者链 D； PDB构建体 9–142； UniProt 4–137

POLYGLUTAMINE-BINDING PROTEIN 1

HOMO SAPIENS

UniProt O60828

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	THIOREDOXIN-LIKE PROTEIN 4A × 1 （P83876） CD2 ANTIGEN CYTOPLASMIC TAIL-BINDING PROTEIN 2 × 1 （O95400） water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	THIOREDOXIN-LIKE PROTEIN 4A × 1 （P83876） CD2 ANTIGEN CYTOPLASMIC TAIL-BINDING PROTEIN 2 × 1 （O95400） water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PQBP1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–37； UniProt 229–265 作者链 E； PDB构建体 1–37； UniProt 229–265

CD2 ANTIGEN CYTOPLASMIC TAIL-BINDING PROTEIN 2

HOMO SAPIENS

UniProt O95400

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	THIOREDOXIN-LIKE PROTEIN 4A × 1 （P83876） POLYGLUTAMINE-BINDING PROTEIN 1 × 1 （O60828） water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	THIOREDOXIN-LIKE PROTEIN 4A × 1 （P83876） POLYGLUTAMINE-BINDING PROTEIN 1 × 1 （O60828） water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CD2B2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 10–71； UniProt 280–341 作者链 F； PDB构建体 10–71； UniProt 280–341

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4bws
沉积日期 deposition_date	2013-07-04
结构标题 title	Crystal structure of the heterotrimer of PQBP1, U5-15kD and U5-52kD.
关键词 keywords	TRANSCRIPTION, NEURODEGENERATIVE DISORDERS; TRANSCRIPTION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4bws__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4bws__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4bws__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	19.83 Å
Rg（电子密度）	18.82 Å
总 Rg	19.58 Å
原子数	1815
残基数	221
排除体积	32139 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4bws__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`4bws__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	THIOREDOXIN-LIKE PROTEIN 4A
分子量 formula_weight	16743.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,D
原子数 atom_count	3667

MAHHHHHHMLPHLHNGWQVDQAILSEEDRVVVIRFGHDWDPTCMKMDEVLYSIAEKVKNFAVIYLVDITEVPDFNKMYELYDPCTVMFFFRNKHIMIDLGTGNNNKINWAMEDKQEMVDIIETVYRGARKGRGLVVSPKDYS

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	POLYGLUTAMINE-BINDING PROTEIN 1
分子量 formula_weight	3876.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,E

TGADTTAAGPLFQQRPYPSPGAVLRANAEASRTKQQD

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	CD2 ANTIGEN CYTOPLASMIC TAIL-BINDING PROTEIN 2
分子量 formula_weight	8482.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,F

MAHHHHHHMDVMWEYKWENTGDAELYGPFTSAQMQTWVSEGYFPDGVYCRKLDPPGGQFYNSKRIDFDLYT

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	16

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_id	d4bwsa_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.47 — Thioredoxin fold
超家族 Superfamily superfamily	c.47.1 — Thioredoxin-like
家族 Family family	c.47.1.8 — spliceosomal protein U5-15Kd

结构域编号 domain_id	d4bwsc1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.76 — GYF/BRK domain-like
超家族 Superfamily superfamily	d.76.1 — GYF domain
家族 Family family	d.76.1.1 — GYF domain

结构域编号 domain_id	d4bwsc2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d4bwsd_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.47 — Thioredoxin fold
超家族 Superfamily superfamily	c.47.1 — Thioredoxin-like
家族 Family family	c.47.1.8 — spliceosomal protein U5-15Kd

结构域编号 domain_id	d4bwsf1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.76 — GYF/BRK domain-like
超家族 Superfamily superfamily	d.76.1 — GYF domain
家族 Family family	d.76.1.1 — GYF domain

结构域编号 domain_id	d4bwsf2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	4bwsA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	30 — Glutaredoxin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Glutaredoxin

结构域编号 domain_id	4bwsC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1490 — Dna Ligase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — GYF domain

结构域编号 domain_id	4bwsD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	30 — Glutaredoxin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Glutaredoxin

结构域编号 domain_id	4bwsF00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1490 — Dna Ligase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — GYF domain

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晶胞边长 a length_a	144.180 Å
晶胞边长 b length_b	40.470 Å
晶胞边长 c length_c	168.171 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	95.92 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	I 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.500 Å
最低分辨率 resolution_low	41.818 Å
R 因子 r_factor	0.2399
R_work r_work	0.2379
R_free r_free	0.2770

Crystal structure of the heterotrimer of PQBP1, U5-15kD and U5-52kD.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

THIOREDOXIN-LIKE PROTEIN 4A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

POLYGLUTAMINE-BINDING PROTEIN 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

CD2 ANTIGEN CYTOPLASMIC TAIL-BINDING PROTEIN 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4bws__assembly_1__model_1

4bws__assembly_1__model_1 | I(q)

4bws__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of the heterotrimer of PQBP1, U5-15kD and U5-52kD.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

THIOREDOXIN-LIKE PROTEIN 4A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

POLYGLUTAMINE-BINDING PROTEIN 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

CD2 ANTIGEN CYTOPLASMIC TAIL-BINDING PROTEIN 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4bws__assembly_1__model_1

4bws__assembly_1__model_1 | I(q)

4bws__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)