4e0s

Crystal Structure of C5b-6

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 208.2 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Complement C5

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 3 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–1676	未记录	Complement component C6 × 1 （P13671） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 beta-D-glucopyranose-(1-3)-alpha-L-fucopyranose × 1 NA SODIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.6；298 K；0.08M lithium chloride, 0.01M imidazole-HCl, pH 7.6, SMALL TUBES, temperature 298K	分辨率 4.21 Å R-free 0.278

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4E0S	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1CFA SOLUTION STRUCTURE OF A SEMI-SYNTHETIC C5A RECEPTOR ANTAGONIST AT PH 5.2, 303K, NMR, 20 STRUCTURES 提交 1996-09-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 679–747（69 aa）片段：RESIDUES 1 - 71	突变：Q71C	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.2；303 K	分辨率未提供
1KJS NMR SOLUTION STRUCTURE OF C5A AT PH 5.2, 303K, 20 STRUCTURES 提交 1997-01-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 679–751（73 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.2；303 K	分辨率未提供
1XWE NMR Structure of C345C (NTR) domain of C5 of complement 提交 2004-10-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1530–1676（147 aa）片段：C345C domain	突变：F1613A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；303 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM Na phospahte; 100mM NaCl；压力 ambient NMR样品组成 0.5-1.0mM C5-C345C; U-15N,13C; 20mM Na phosphate buffer; 100mM NaCl; 5uM EDTA; pH 6 \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
3CU7 Human Complement Component 5 提交 2008-04-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–1676（1676 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CD CADMIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；100mM NaCl, 1.5-3mM MES pH 5.5, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.10 Å R-free 0.281
3CU7 Human Complement Component 5 提交 2008-04-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–1676（1676 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CD CADMIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；100mM NaCl, 1.5-3mM MES pH 5.5, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.10 Å R-free 0.281
3CU7 Human Complement Component 5 提交 2008-04-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–1676（1676 aa）链 B 1–1676（1676 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CD CADMIUM ION × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；100mM NaCl, 1.5-3mM MES pH 5.5, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.10 Å R-free 0.281
3HQA Crystal structure of human desarg-C5A 提交 2009-06-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 679–750（72 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；298 K；2.4 M sodium chloride, pH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.59 Å R-free 0.253
3HQA Crystal structure of human desarg-C5A 提交 2009-06-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 679–750（72 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；298 K；2.4 M sodium chloride, pH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.59 Å R-free 0.253
3HQA Crystal structure of human desarg-C5A 提交 2009-06-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 679–750（72 aa）链 B 679–750（72 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；298 K；2.4 M sodium chloride, pH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.59 Å R-free 0.253
3HQB Crystal structure of human desarg-C5A 提交 2009-06-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 679–750（72 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；298 K；2.4 M sodium chloride, pH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.30 Å R-free 0.307
3HQB Crystal structure of human desarg-C5A 提交 2009-06-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 679–750（72 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；298 K；2.4 M sodium chloride, pH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.30 Å R-free 0.307
3HQB Crystal structure of human desarg-C5A 提交 2009-06-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 679–750（72 aa）链 B 679–750（72 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；298 K；2.4 M sodium chloride, pH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.30 Å R-free 0.307
3KLS Structure of complement C5 in complex with SSL7 提交 2009-11-09	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–1676（1676 aa）	未记录	CD CADMIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.2；277 K；Reservoir contains 50mM MgAc2, 50 mM MES pH 6.2, mixed 1:1 with protein, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.263
3KLS Structure of complement C5 in complex with SSL7 提交 2009-11-09	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–1676（1676 aa）	未记录	CD CADMIUM ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.2；277 K；Reservoir contains 50mM MgAc2, 50 mM MES pH 6.2, mixed 1:1 with protein, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.263
3KM9 Structure of complement C5 in complex with the C-terminal beta-grasp domain of SSL7 提交 2009-11-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–1676（1676 aa）	未记录	CD CADMIUM ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.2；277 K；Reservoir contains 50mM MgAc2, 50mM MES pH 6.2. Mixed 1:1 with concentrated protein, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 4.20 Å R-free 0.297
3KM9 Structure of complement C5 in complex with the C-terminal beta-grasp domain of SSL7 提交 2009-11-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–1676（1676 aa）	未记录	CD CADMIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.2；277 K；Reservoir contains 50mM MgAc2, 50mM MES pH 6.2. Mixed 1:1 with concentrated protein, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 4.20 Å R-free 0.297
3PRX Structure of Complement C5 in Complex with CVF and SSL7 提交 2010-11-30	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1676（1676 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；292 K；3 M sodium malonate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, temperature 292K	分辨率 4.30 Å R-free 0.261
3PRX Structure of Complement C5 in Complex with CVF and SSL7 提交 2010-11-30	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–1676（1676 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；292 K；3 M sodium malonate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, temperature 292K	分辨率 4.30 Å R-free 0.261
3PVM Structure of Complement C5 in Complex with CVF 提交 2010-12-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–1676（1676 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 4.30 Å R-free 0.262
3PVM Structure of Complement C5 in Complex with CVF 提交 2010-12-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–1676（1676 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 4.30 Å R-free 0.262
4A5W Crystal structure of C5b6 提交 2011-10-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 19–673（655 aa）链 A 752–1676（925 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；167 MM HEPES-NAOH PH7.8	分辨率 3.50 Å R-free 0.270
4P39 Crystal structure of the human C5aR antagonist C5a-A8 提交 2014-03-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 678–747（70 aa）片段：UNP residues 678-743	突变：C704R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；20% 2-propanol, 20% PEG 4000, 0.1 M Na citrate pH 5.6	分辨率 2.40 Å R-free 0.238
4P39 Crystal structure of the human C5aR antagonist C5a-A8 提交 2014-03-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 678–747（70 aa）片段：UNP residues 678-743	突变：C704R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；20% 2-propanol, 20% PEG 4000, 0.1 M Na citrate pH 5.6	分辨率 2.40 Å R-free 0.238
4P39 Crystal structure of the human C5aR antagonist C5a-A8 提交 2014-03-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 678–747（70 aa）片段：UNP residues 678-743	突变：C704R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；20% 2-propanol, 20% PEG 4000, 0.1 M Na citrate pH 5.6	分辨率 2.40 Å R-free 0.238
4P39 Crystal structure of the human C5aR antagonist C5a-A8 提交 2014-03-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 678–747（70 aa）片段：UNP residues 678-743	突变：C704R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；20% 2-propanol, 20% PEG 4000, 0.1 M Na citrate pH 5.6	分辨率 2.40 Å R-free 0.238
4P39 Crystal structure of the human C5aR antagonist C5a-A8 提交 2014-03-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 678–747（70 aa）片段：UNP residues 678-743 链 B 678–747（70 aa）片段：UNP residues 678-743 链 C 678–747（70 aa）片段：UNP residues 678-743 链 D 678–747（70 aa）片段：UNP residues 678-743	突变：C704R 突变：C704R 突变：C704R 突变：C704R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；20% 2-propanol, 20% PEG 4000, 0.1 M Na citrate pH 5.6	分辨率 2.40 Å R-free 0.238
4P39 Crystal structure of the human C5aR antagonist C5a-A8 提交 2014-03-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 678–747（70 aa）片段：UNP residues 678-743 链 D 678–747（70 aa）片段：UNP residues 678-743	突变：C704R 突变：C704R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；20% 2-propanol, 20% PEG 4000, 0.1 M Na citrate pH 5.6	分辨率 2.40 Å R-free 0.238
4P39 Crystal structure of the human C5aR antagonist C5a-A8 提交 2014-03-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 678–747（70 aa）片段：UNP residues 678-743 链 C 678–747（70 aa）片段：UNP residues 678-743	突变：C704R 突变：C704R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；20% 2-propanol, 20% PEG 4000, 0.1 M Na citrate pH 5.6	分辨率 2.40 Å R-free 0.238
4UU9 Crystal structure of the human c5a in complex with MEDI7814 a neutralising antibody 提交 2014-07-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 678–751（74 aa）片段：C5A	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 20% PEG10K, 8% ETHYLENE GLYCOL, 100MM HEPES PH 7.5	分辨率 2.12 Å R-free 0.202
4UU9 Crystal structure of the human c5a in complex with MEDI7814 a neutralising antibody 提交 2014-07-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 678–751（74 aa）片段：C5A	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 20% PEG10K, 8% ETHYLENE GLYCOL, 100MM HEPES PH 7.5	分辨率 2.12 Å R-free 0.202
5B4P Complex structure of human C5a and its binding repebody 提交 2016-04-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 678–751（74 aa）	未记录	1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Sodium acetate, PEG 400, ammonium sulfate	分辨率 2.40 Å R-free 0.310
5B4P Complex structure of human C5a and its binding repebody 提交 2016-04-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 678–751（74 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Sodium acetate, PEG 400, ammonium sulfate	分辨率 2.40 Å R-free 0.310
5B71 Crystal structure of complement C5 in complex with SKY59 提交 2016-06-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 20–124（105 aa）片段：UNP RESIDUES 20-124	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M magnesium formate dehydrate, 15.0% w/v polyethylene glycol 3350, 20% v/v glycerol as cryoprotectant	分辨率 2.11 Å R-free 0.285
5B71 Crystal structure of complement C5 in complex with SKY59 提交 2016-06-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 20–124（105 aa）片段：UNP RESIDUES 20-124	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M magnesium formate dehydrate, 15.0% w/v polyethylene glycol 3350, 20% v/v glycerol as cryoprotectant	分辨率 2.11 Å R-free 0.285
5HCC Ternary complex of human Complement C5 with Ornithodoros moubata OmCI and Dermacentor andersoni RaCI3. 提交 2016-01-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 679–1676（998 aa）片段：UNP Residues 679-1676 链 B 19–674（656 aa）片段：UNP Residues 19-674	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 CYS CYSTEINE × 1 DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；294 K；10% PEG 20K, 2% v/v 1,4 Dioxane, 0.1 M Bicine pH 9.0	分辨率 2.59 Å R-free 0.267
5HCD Ternary complex of human Complement C5 with Ornithodoros moubata OmCI and Rhipicephalus microplus RaCI2 提交 2016-01-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 679–1676（998 aa）片段：UNP Residues 679-1676 链 B 19–674（656 aa）片段：UNP Residues 19-674	未记录	CYS CYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；294 K；10% (w/v) PEG 20K, 2%(v/v)1,4 Dioxane, 0.1M Bicine pH 9.0	分辨率 2.98 Å R-free 0.282
5HCE Ternary complex of human Complement C5 with Ornithodoros moubata OmCI and Rhipicephalus appendiculatus RaCI1 提交 2016-01-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 679–1676（998 aa）片段：UNP Residues 679-1676 链 B 19–674（656 aa）片段：UNP Residues 19-674	未记录	CYS CYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；294 K；10% PEG 6K, 0.1 M Bicine pH 9.0	分辨率 3.12 Å R-free 0.281
5I5K Structure of complement C5 in complex with eculizumab 提交 2016-02-15	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–1676（1676 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Imidazole pH 6.2 4% v/v Tacsimate pH 7 8% PEG 3350	分辨率 4.20 Å R-free 0.244
5I5K Structure of complement C5 in complex with eculizumab 提交 2016-02-15	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1676（1676 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Imidazole pH 6.2 4% v/v Tacsimate pH 7 8% PEG 3350	分辨率 4.20 Å R-free 0.244
6H03 OPEN CONFORMATION OF THE MEMBRANE ATTACK COMPLEX 提交 2018-07-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 19–673（655 aa）链 A 752–1676（925 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 37	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.60 Å
6H04 Closed conformation of the Membrane Attack Complex 提交 2018-07-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 19–673（655 aa）链 A 752–1676（925 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 38	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.60 Å
6RPT Structure of tick complement inhibitor CirpT1 complexed with macroglobubulin domain 4 of human complement C5 提交 2019-05-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 348–460（113 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；284.15 K；0.02 M Na2PO4/K2PO4, 20 % w/v PEG3350	分辨率 2.70 Å R-free 0.272
6RPT Structure of tick complement inhibitor CirpT1 complexed with macroglobubulin domain 4 of human complement C5 提交 2019-05-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 348–460（113 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；284.15 K；0.02 M Na2PO4/K2PO4, 20 % w/v PEG3350	分辨率 2.70 Å R-free 0.272
6RPT Structure of tick complement inhibitor CirpT1 complexed with macroglobubulin domain 4 of human complement C5 提交 2019-05-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 348–460（113 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；284.15 K；0.02 M Na2PO4/K2PO4, 20 % w/v PEG3350	分辨率 2.70 Å R-free 0.272
6RQJ Structure of human complement C5 complexed with tick inhibitors OmCI, RaCI1 and CirpT1 提交 2019-05-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 678–1676（999 aa）链 B 19–673（655 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7AD6 Crystal structure of human complement C5 in complex with the K92 bovine knob domain peptide. 提交 2020-09-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1676（1676 aa）链 B 1–1676（1676 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 CYS CYSTEINE × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；0.1 M bicine/Trizma (pH 8.5), 10 % (w/v) PEG 8000, 20 % (v/v) ethylene glycol, 30 mM sodium fluoride, 30 mM sodium bromide and 30 mM sodium iodide.	分辨率 2.75 Å R-free 0.254
7AD7 Crystal structure of human complement C5 in complex with the K8 bovine knob domain peptide. 提交 2020-09-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1676（1676 aa）链 B 1–1676（1676 aa）	未记录	EOH ETHANOL × 4 MHA (CARBAMOYLMETHYL-CARBOXYMETHYL-AMINO)-ACETIC ACID × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 CYS CYSTEINE × 1 TAM TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；0.1M ADA, 14% ethanol.	分辨率 2.30 Å R-free 0.234
7NYC cryoEM structure of 3C9-sMAC 提交 2021-03-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 A 19–1676（1658 aa）	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 7 CA CALCIUM ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 FUC alpha-L-fucopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.54 Å
7NYD cryoEM structure of 2C9-sMAC 提交 2021-03-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 19–1676（1658 aa）	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 6 CA CALCIUM ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 FUC alpha-L-fucopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.27 Å
7OP0 Crystal structure of complement C5 in complex with chemically synthesized K92 knob domain. 提交 2021-05-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 678–1676（999 aa）链 B 19–675（657 aa）片段：beta chain, UNP residues 1-675	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M bicine/Trizma (pH 8.5), 10 % (w/v) PEG 8000, 20 % (v/v) ethylene glycol, 30 mM sodium fluoride, 30 mM sodium bromide, 30 mM sodium iodide.	分辨率 2.57 Å R-free 0.264
7Y64 Cryo-EM structure of C5a-bound C5aR1 in complex with Gi protein 提交 2022-06-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 678–751（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8AYH Structure of Complement C5 in Complex with small molecule inhibitor and CVF 提交 2022-09-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 678–1676（999 aa）链 C 19–675（657 aa）片段：beta chain, UNP residues 1-675	未记录	H1H 5-methoxy-2-[[(1~{S})-1-(2-methoxyphenyl)ethyl]carbamoylamino]-4-(4-methylpentoxy)benzoic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50mM HEPES pH 7.5 100mM NaCl cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.35 Å
8B0F CryoEM structure of C5b8-CD59 提交 2022-09-07	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–1676（1676 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8B0G 2C9, C5b9-CD59 structure 提交 2022-09-07	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 1–1676（1676 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 120 mM NaCl cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8B0H 2C9, C5b9-CD59 cryoEM structure 提交 2022-09-07	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 A 1–1676（1676 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 120 mM NaCl cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8CML Cryo-EM structure of complement C5 in complex with nanobodies UNbC5-1 and UNbC5-2 提交 2023-02-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 678–1676（999 aa）链 E 19–673（655 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；1x PBS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blot 4 seconds at blot force 1	分辨率 3.60 Å
8COE complement C5 in complex with the LCP0195 nanobody 提交 2023-02-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 678–1676（999 aa）链 C 19–673（655 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；292 K；0.025 M succinic acid pH 7.0 and 3.75% w/v polyethylene glycol 3350.	分辨率 4.20 Å R-free 0.269
8HK5 C5aR1-Gi-C5a protein complex 提交 2022-11-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 678–751（74 aa）	未记录	PLM PALMITIC ACID × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8HQC Structure of a GPCR-G protein in complex with a natural peptide agonist 提交 2022-12-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 D 678–751（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.89 Å
8IA2 Structure of C5a bound human C5aR1 in complex with Go (Composite map) 提交 2023-02-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 D 678–751（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.21 Å
8JZZ Structure of human C5a-desArg bound human C5aR1 in complex with Go 提交 2023-07-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 D 678–751（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.31 Å
9KX6 Structure of human C5a-desArg bound mouse C5aR1 in complex with Go 提交 2024-12-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 D 678–750（73 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.11 Å
9Y6C X-ray structure analysis of human Complement Component 5 TE domain in complex with the peptide Ra30303 提交 2025-09-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 982–1305（324 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1 8VH 1,3-dimethylbenzene × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Proteros	分辨率 2.00 Å R-free 0.253

共 41 个其他 PDB 条目、63 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CO5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1676； UniProt 1–1676

Complement component C6

物种未注明

UniProt P13671

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 3 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 22–934	未记录	Complement C5 × 1 （P01031） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 beta-D-glucopyranose-(1-3)-alpha-L-fucopyranose × 1 NA SODIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.6；298 K；0.08M lithium chloride, 0.01M imidazole-HCl, pH 7.6, SMALL TUBES, temperature 298K	分辨率 4.21 Å R-free 0.278

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 4E0S	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3T5O Crystal Structure of human Complement Component C6 提交 2011-07-27	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 22–934（913 aa）	未记录	CD CADMIUM ION × 1 FUL beta-L-fucopyranose × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.8；284 K；5 mM MES, 89 mM Sodium Chloride, 0.01 mM Cadmium Chloride, pH 5.8, EVAPORATION, temperature 284K	分辨率 2.87 Å R-free 0.276
4A5W Crystal structure of C5b6 提交 2011-10-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 22–934（913 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.8；167 MM HEPES-NAOH PH7.8	分辨率 3.50 Å R-free 0.270
6H03 OPEN CONFORMATION OF THE MEMBRANE ATTACK COMPLEX 提交 2018-07-06	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 B 22–934（913 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 37	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.60 Å
6H04 Closed conformation of the Membrane Attack Complex 提交 2018-07-06	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 B 22–934（913 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 38	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.60 Å
7NYC cryoEM structure of 3C9-sMAC 提交 2021-03-22	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 B 22–934（913 aa）	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 7 CA CALCIUM ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 FUC alpha-L-fucopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.54 Å
7NYD cryoEM structure of 2C9-sMAC 提交 2021-03-22	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 22–934（913 aa）	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 6 CA CALCIUM ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 FUC alpha-L-fucopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.27 Å
7Q6C complement C6 FIM1-2 bound to CP010 antibody 提交 2021-11-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 769–934（166 aa）	未记录	ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.4；291 K；112 mM calcium acetate, 56 mM sodium cacodylate pH 6.4, 8.5% PEG8000 and 16% glycerol	分辨率 2.29 Å R-free 0.233
8B0F CryoEM structure of C5b8-CD59 提交 2022-09-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 B 1–934（934 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8B0G 2C9, C5b9-CD59 structure 提交 2022-09-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 B 1–934（934 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 120 mM NaCl cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8B0H 2C9, C5b9-CD59 cryoEM structure 提交 2022-09-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 B 1–934（934 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 120 mM NaCl cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å

共 10 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CO6_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–913； UniProt 22–934

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4e0s
沉积日期 deposition_date	2012-03-05
结构标题 title	Crystal Structure of C5b-6
关键词 keywords	complement, MAC, immune system; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	56.87 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	56.67 Å
零角强度 I(0) i0	1117750000.00
分子量 molecular_weight	277210.0 kDa
排除体积 excluded_volume	346430 Å³
包络体积 envelope_volume	554380 Å³
水化壳体积 shell_volume	86856 Å³
包络直径 envelope_diameter	225.3 Å
壳层 Rg shell_rg	54.46 Å
包络 Rg envelope_rg	56.10 Å
形状 Rg shape_rg	56.61 Å
总 Rg total_rg	56.82 Å
总原子数 total_atoms	19475
残基数 n_residues	2450
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	208.2 Å
Rg (实空间) rg_real	57.14 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	2.47 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.1180e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.4490e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	56.62 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	1117000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8531
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	59.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.468
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.159
角度范围 angular_range	— – 0.1400 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0002
最高正则化参数 α highest_alpha	77330000.0000
实空间数据点数 n_real_points	29
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.754; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.946; Smooth: 0.878

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Complement C5
分子量 formula_weight	188526.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	19475

MGLLGILCFLIFLGKTWGQEQTYVISAPKIFRVGASENIVIQVYGYTEAFDATISIKSYPDKKFSYSSGHVHLSSENKFQNSAILTIQPKQLPGGQNPVSYVYLEVVSKHFSKSKRMPITYDNGFLFIHTDKPVYTPDQSVKVRVYSLNDDLKPAKRETVLTFIDPEGSEVDMVEEIDHIGIISFPDFKIPSNPRYGMWTIKAKYKEDFSTTGTAYFEVKEYVLPHFSVSIEPEYNFIGYKNFKNFEITIKARYFYNKVVTEADVYITFGIREDLKDDQKEMMQTAMQNTMLINGIAQVTFDSETAVKELSYYSLEDLNNKYLYIAVTVIESTGGFSEEAEIPGIKYVLSPYKLNLVATPLFLKPGIPYPIKVQVKDSLDQLVGGVPVTLNAQTIDVNQETSDLDPSKSVTRVDDGVASFVLNLPSGVTVLEFNVKTDAPDLPEENQAREGYRAIAYSSLSQSYLYIDWTDNHKALLVGEHLNIIVTPKSPYIDKITHYNYLILSKGKIIHFGTREKFSDASYQSINIPVTQNMVPSSRLLVYYIVTGEQTAELVSDSVWLNIEEKCGNQLQVHLSPDADAYSPGQTVSLNMATGMDSWVALAAVDSAVYGVQRGAKKPLERVFQFLEKSDLGCGAGGGLNNANVFHLAGLTFLTNANADDSQENDEPCKEILRPRRTLQKKIEEIAAKYKHSVVKKCCYDGACVNNDETCEQRAARISLGPRCIKAFTECCVVASQLRANISHKDMQLGRLHMKTLLPVSKPEIRSYFPESWLWEVHLVPRRKQLQFALPDSLTTWEIQGIGISNTGICVADTVKAKVFKDVFLEMNIPYSVVRGEQIQLKGTVYNYRTSGMQFCVKMSAVEGICTSESPVIDHQGTKSSKCVRQKVEGSSSHLVTFTVLPLEIGLHNINFSLETWFGKEILVKTLRVVPEGVKRESYSGVTLDPRGIYGTISRRKEFPYRIPLDLVPKTEIKRILSVKGLLVGEILSAVLSQEGINILTHLPKGSAEAELMSVVPVFYVFHYLETGNHWNIFHSDPLIEKQKLKKKLKEGMLSIMSYRNADYSYSVWKGGSASTWLTAFALRVLGQVNKYVEQNQNSICNSLLWLVENYQLDNGSFKENSQYQPIKLQGTLPVEARENSLYLTAFTVIGIRKAFDICPLVKIDTALIKADNFLLENTLPAQSTFTLAISAYALSLGDKTHPQFRSIVSALKREALVKGNPPIYRFWKDNLQHKDSSVPNTGTARMVETTAYALLTSLNLKDINYVNPVIKWLSEEQRYGGGFYSTQDTINAIEGLTEYSLLVKQLRLSMDIDVSYKHKGALHNYKMTDKNFLGRPVEVLLNDDLIVSTGFGSGLATVHVTTVVHKTSTSEEVCSFYLKIDTQDIEASHYRGYGNSDYKRIVACASYKPSREESSSGSSHAVMDISLPTGISANEEDLKALVEGVDQLFTDYQIKDGHVILQLNSIPSSDFLCVRFRIFELFEVGFLSPATFTVYEYHRPDKQCTMFYSTSNIKIQKVCEGAACKCVEADCGQMQEELDLTISAETRKQTACKPEIAYAYKVSITSITVENVFVKYKATLLDIYKTGEAVAEKDSEITFIKKVTCTNAELVKGRQYLIMGKEALQIKYNFSFRYIYPLDSLTWIEYWPRDTTCSSCQAFLANLDEFAEDIFLNGC

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Complement component C6
分子量 formula_weight	102541.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

CFCDHYAWTQWTSCSKTCNSGTQSRHRQIVVDKYYQENFCEQICSKQETRECNWQRCPINCLLGDFGPWSDCDPCIEKQSKVRSVLRPSQFGGQPCTAPLVAFQPCIPSKLCKIEEADCKNKFRCDSGRCIARKLECNGENDCGDNSDERDCGRTKAVCTRKYNPIPSVQLMGNGFHFLAGEPRGEVLDNSFTGGICKTVKSSRTSNPYRVPANLENVGFEVQTAEDDLKTDFYKDLTSLGHNENQQGSFSSQGGSSFSVPIFYSSKRSENINHNSAFKQAIQASHKKDSSFIRIHKVMKVLNFTTKAKDLHLSDVFLKALNHLPLEYNSALYSRIFDDFGTHYFTSGSLGGVYDLLYQFSSEELKNSGLTEEEAKHCVRIETKKRVLFAKKTKVEHRCTTNKLSEKHEGSFIQGAEKSISLIRGGRSEYGAALAWEKGSSGLEEKTFSEWLESVKENPAVIDFELAPIVDLVRNIPCAVTKRNNLRKALQEYAAKFDPCQCAPCPNNGRPTLSGTECLCVCQSGTYGENCEKQSPDYKSNAVDGQWGCWSSWSTCDATYKRSRTRECNNPAPQRGGKRCEGEKRQEEDCTFSIMENNGQPCINDDEEMKEVDLPEIEADSGCPQPVPPENGFIRNEKQLYLVGEDVEISCLTGFETVGYQYFRCLPDGTWRQGDVECQRTECIKPVVQEVLTITPFQRLYRIGESIELTCPKGFVVAGPSRYTCQGNSWTPPISNSLTCEKDTLTKLKGHCQLGQKQSGSECICMSPEEDCSHHSEDLCVFDTDSNDYFTSPACKFLAEKCLNNQQLHFLHIGSCQDGRQLEWGLERTRLSSNSTKKESCGYDTCYDWEKCSASTSKCVCLLPPQCFKGGNQLYCVKMGSSTSEKTLNICEVGTIRCANRKMEILHPGKCLA

实体 3 Entity 3 branched

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	424.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 branched

描述 description	beta-D-glucopyranose-(1-3)-alpha-L-fucopyranose
分子量 formula_weight	326.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	alpha-D-mannopyranose
分子量 formula_weight	180.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	158.949 Å
晶胞边长 b length_b	227.529 Å
晶胞边长 c length_c	278.157 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	I 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	24
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.210 Å
最低分辨率 resolution_low	29.930 Å
R 因子 r_factor	0.2210
R_work r_work	0.2180
R_free r_free	0.2780

fit	/app/data/saxs_computation/e0/4e0s/4e0s.fit
pddf	/app/data/pr_computation/e0/4e0s/4e0s.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/e0/4e0s/4e0s.dat

Crystal Structure of C5b-6

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Complement C5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Complement component C6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 branched

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)