4hr7

Crystal Structure of Biotin Carboxyl Carrier Protein-Biotin Carboxylase Complex from E.coli

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 132.0 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Biotin carboxylase

Escherichia coli

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–449 链 C； UniProt 1–449 链 E； UniProt 1–449 链 F； UniProt 1–449	未记录	Biotin carboxyl carrier protein of acetyl-CoA carboxylase × 4 （P0ABD8） SO4 SULFATE ION × 12 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295.15 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, 25% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.15K	分辨率 2.50 Å R-free 0.229

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4HR7	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1BNC THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE BIOTIN CARBOXYLASE SUBUNIT OF ACETYL-COA CARBOXYLASE 提交 1994-07-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–449（449 aa）链 B 1–449（449 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.40 Å
1DV1 STRUCTURE OF BIOTIN CARBOXYLASE (APO) 提交 2000-01-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–449（449 aa）链 B 1–449（449 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICRODIALYSIS；pH 7；298 K；10mM potassium phosphate 1mM EDTA 2mM DTT, pH 7.0, MICRODIALYSIS, temperature 298.0K	分辨率 1.90 Å R-free 0.238
1DV2 The structure of biotin carboxylase, mutant E288K, complexed with ATP 提交 2000-01-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–449（449 aa）片段：BIOTIN CARBOXYLASE	突变：E288K	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；PEG-8000 ATP magnesium chloride HEPPS potassium chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.203
1DV2 The structure of biotin carboxylase, mutant E288K, complexed with ATP 提交 2000-01-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–449（449 aa）片段：BIOTIN CARBOXYLASE	突变：E288K	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；PEG-8000 ATP magnesium chloride HEPPS potassium chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.203
2GPS Crystal Structure of the Biotin Carboxylase Subunit, E23R mutant, of Acetyl-CoA Carboxylase from Escherichia coli. 提交 2006-04-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–449（449 aa）	突变：E23R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；294 K；0.1 M magnesium formate, 14% (w/v) PEG3350, 8% (v/v) glycerol, and 20 mM calcium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 2.80 Å R-free 0.260
2GPS Crystal Structure of the Biotin Carboxylase Subunit, E23R mutant, of Acetyl-CoA Carboxylase from Escherichia coli. 提交 2006-04-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–449（449 aa）	突变：E23R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；294 K；0.1 M magnesium formate, 14% (w/v) PEG3350, 8% (v/v) glycerol, and 20 mM calcium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 2.80 Å R-free 0.260
2GPW Crystal Structure of the Biotin Carboxylase Subunit, F363A Mutant, of Acetyl-CoA Carboxylase from Escherichia coli. 提交 2006-04-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–449（449 aa）	突变：F363A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；0.1 M Bis-Tris (pH 7.5), 100 mM NaCl, 200 mM trimethylamine N-oxide, 8% (v/v) PEG2000 MME, 4% (v/v) glycerol, 5 mM magnesium chloride, and 2.5 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 2.20 Å R-free 0.250
2GPW Crystal Structure of the Biotin Carboxylase Subunit, F363A Mutant, of Acetyl-CoA Carboxylase from Escherichia coli. 提交 2006-04-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–449（449 aa）	突变：F363A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；0.1 M Bis-Tris (pH 7.5), 100 mM NaCl, 200 mM trimethylamine N-oxide, 8% (v/v) PEG2000 MME, 4% (v/v) glycerol, 5 mM magnesium chloride, and 2.5 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 2.20 Å R-free 0.250
2GPW Crystal Structure of the Biotin Carboxylase Subunit, F363A Mutant, of Acetyl-CoA Carboxylase from Escherichia coli. 提交 2006-04-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–449（449 aa）	突变：F363A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；0.1 M Bis-Tris (pH 7.5), 100 mM NaCl, 200 mM trimethylamine N-oxide, 8% (v/v) PEG2000 MME, 4% (v/v) glycerol, 5 mM magnesium chloride, and 2.5 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 2.20 Å R-free 0.250
2GPW Crystal Structure of the Biotin Carboxylase Subunit, F363A Mutant, of Acetyl-CoA Carboxylase from Escherichia coli. 提交 2006-04-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–449（449 aa）	突变：F363A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；0.1 M Bis-Tris (pH 7.5), 100 mM NaCl, 200 mM trimethylamine N-oxide, 8% (v/v) PEG2000 MME, 4% (v/v) glycerol, 5 mM magnesium chloride, and 2.5 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 2.20 Å R-free 0.250
2J9G Crystal structure of Biotin carboxylase from E. coli in complex with AMPPNP and ADP 提交 2008-03-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–449（449 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1M BIS-TRIS PH 6.5, 0.2M CACL2, 45% MPD	分辨率 2.05 Å R-free 0.236
2J9G Crystal structure of Biotin carboxylase from E. coli in complex with AMPPNP and ADP 提交 2008-03-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–449（449 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1M BIS-TRIS PH 6.5, 0.2M CACL2, 45% MPD	分辨率 2.05 Å R-free 0.236
2V58 CRYSTAL STRUCTURE OF BIOTIN CARBOXYLASE FROM E.COLI IN COMPLEX WITH POTENT INHIBITOR 1 提交 2008-10-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–449（449 aa）	未记录	LZJ 6-(2,6-dibromophenyl)pyrido[2,3-d]pyrimidine-2,7-diamine × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 PROTEIN: 12 MG/ML, (250 MM POTASSIUM CHLORIDE, 10 MM HEPES, PH 7.2) WELL: 0.1 M POTASSIUM CHLORIDE AND 4% (W/V) PEG 8000	分辨率 2.10 Å R-free 0.219
2V58 CRYSTAL STRUCTURE OF BIOTIN CARBOXYLASE FROM E.COLI IN COMPLEX WITH POTENT INHIBITOR 1 提交 2008-10-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–449（449 aa）	未记录	LZJ 6-(2,6-dibromophenyl)pyrido[2,3-d]pyrimidine-2,7-diamine × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 PROTEIN: 12 MG/ML, (250 MM POTASSIUM CHLORIDE, 10 MM HEPES, PH 7.2) WELL: 0.1 M POTASSIUM CHLORIDE AND 4% (W/V) PEG 8000	分辨率 2.10 Å R-free 0.219
2V59 CRYSTAL STRUCTURE OF BIOTIN CARBOXYLASE FROM E.COLI IN COMPLEX WITH POTENT INHIBITOR 2 提交 2008-10-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–449（449 aa）	未记录	LZK 6-(2,6-DIMETHOXYPHENYL)PYRIDO[2,3-D]PYRIMIDINE-2,7-DIAMINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 WELL: 0.1 M POTASSIUM CHLORIDE, 4% (W/V) PEG 8000 PROTEIN: 12 MG/ML, 250 MM POTASSIUM CHLORIDE, 10 MM HEPES, PH 7.2	分辨率 2.40 Å R-free 0.248
2V59 CRYSTAL STRUCTURE OF BIOTIN CARBOXYLASE FROM E.COLI IN COMPLEX WITH POTENT INHIBITOR 2 提交 2008-10-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–449（449 aa）	未记录	LZK 6-(2,6-DIMETHOXYPHENYL)PYRIDO[2,3-D]PYRIMIDINE-2,7-DIAMINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 WELL: 0.1 M POTASSIUM CHLORIDE, 4% (W/V) PEG 8000 PROTEIN: 12 MG/ML, 250 MM POTASSIUM CHLORIDE, 10 MM HEPES, PH 7.2	分辨率 2.40 Å R-free 0.248
2V5A CRYSTAL STRUCTURE OF BIOTIN CARBOXYLASE FROM E.COLI IN COMPLEX WITH POTENT INHIBITOR 3 提交 2008-10-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–449（449 aa）	未记录	LZL 7-(2,5-dihydropyrrol-1-yl)-6-phenyl-pyrido[6,5-d]pyrimidin-2-amine × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1 M POTASSIUM CHLORIDE, 4% (W/V) PEG 8000	分辨率 2.31 Å R-free 0.237
2V5A CRYSTAL STRUCTURE OF BIOTIN CARBOXYLASE FROM E.COLI IN COMPLEX WITH POTENT INHIBITOR 3 提交 2008-10-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–449（449 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1 M POTASSIUM CHLORIDE, 4% (W/V) PEG 8000	分辨率 2.31 Å R-free 0.237
2VR1 Crystal structure of Biotin carboxylase from E. coli in complex with ATP analog, ADPCF2P. 提交 2008-03-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–449（449 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 ATF PHOSPHODIFLUOROMETHYLPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1M KCL, 3-8% PEG 8000	分辨率 2.60 Å R-free 0.247
2VR1 Crystal structure of Biotin carboxylase from E. coli in complex with ATP analog, ADPCF2P. 提交 2008-03-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–449（449 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1M KCL, 3-8% PEG 8000	分辨率 2.60 Å R-free 0.247
2W6M Crystal structure of Biotin carboxylase from E. coli in complex with amino-oxazole fragment series 提交 2008-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–449（449 aa）	未记录	OA1 (2-AMINO-1,3-OXAZOL-5-YL)-(3-BROMOPHENYL)METHANONE × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.208
2W6M Crystal structure of Biotin carboxylase from E. coli in complex with amino-oxazole fragment series 提交 2008-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–449（449 aa）	未记录	OA1 (2-AMINO-1,3-OXAZOL-5-YL)-(3-BROMOPHENYL)METHANONE × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.208
2W6N Crystal structure of Biotin carboxylase from E. coli in complex with amino-oxazole fragment series 提交 2008-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–449（449 aa）	未记录	OA2 2-AMINO-N,N-BIS(PHENYLMETHYL)-1,3-OXAZOLE-5-CARBOXAMIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1 M KCL AND 2-8% PEG-800	分辨率 1.87 Å R-free 0.217
2W6N Crystal structure of Biotin carboxylase from E. coli in complex with amino-oxazole fragment series 提交 2008-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–449（449 aa）	未记录	OA2 2-AMINO-N,N-BIS(PHENYLMETHYL)-1,3-OXAZOLE-5-CARBOXAMIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1 M KCL AND 2-8% PEG-800	分辨率 1.87 Å R-free 0.217
2W6O Crystal structure of Biotin carboxylase from E. coli in complex with 4-Amino-7,7-dimethyl-7,8-dihydro-quinazolinone fragment 提交 2008-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–449（449 aa）	未记录	OA3 4-amino-7,7-dimethyl-7,8-dihydroquinazolin-5(6H)-one × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å R-free 0.308
2W6O Crystal structure of Biotin carboxylase from E. coli in complex with 4-Amino-7,7-dimethyl-7,8-dihydro-quinazolinone fragment 提交 2008-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–449（449 aa）	未记录	OA3 4-amino-7,7-dimethyl-7,8-dihydroquinazolin-5(6H)-one × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å R-free 0.308
2W6P Crystal structure of Biotin carboxylase from E. coli in complex with 5-Methyl-6-phenyl-quinazoline-2,4-diamine 提交 2008-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–449（449 aa）	未记录	OA4 5-methyl-6-phenylquinazoline-2,4-diamine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1 M KCL AND 2-8% PEG-800	分辨率 1.85 Å R-free 0.216
2W6P Crystal structure of Biotin carboxylase from E. coli in complex with 5-Methyl-6-phenyl-quinazoline-2,4-diamine 提交 2008-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–449（449 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1 M KCL AND 2-8% PEG-800	分辨率 1.85 Å R-free 0.216
2W6Q Crystal structure of Biotin carboxylase from E. coli in complex with the triazine-2,4-diamine fragment 提交 2008-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–449（449 aa）	未记录	OA5 6-(2-phenoxyethoxy)-1,3,5-triazine-2,4-diamine × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1M KCL AND 2-8% PEG-800	分辨率 2.05 Å R-free 0.224
2W6Q Crystal structure of Biotin carboxylase from E. coli in complex with the triazine-2,4-diamine fragment 提交 2008-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–449（449 aa）	未记录	OA5 6-(2-phenoxyethoxy)-1,3,5-triazine-2,4-diamine × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1M KCL AND 2-8% PEG-800	分辨率 2.05 Å R-free 0.224
2W6Z Crystal structure of Biotin carboxylase from E. coli in complex with the 3-(3-Methyl-but-2-enyl)-3H-purin-6-ylamine fragment 提交 2008-12-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–449（449 aa）	未记录	L21 3-(3-methylbut-2-en-1-yl)-3H-purin-6-amine × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1M KCL AND 2-8% PEG 800	分辨率 1.90 Å R-free 0.220
2W6Z Crystal structure of Biotin carboxylase from E. coli in complex with the 3-(3-Methyl-but-2-enyl)-3H-purin-6-ylamine fragment 提交 2008-12-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–449（449 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1M KCL AND 2-8% PEG 800	分辨率 1.90 Å R-free 0.220
2W70 Crystal structure of Biotin carboxylase from E. coli in complex with the amino-thiazole-pyrimidine fragment 提交 2008-12-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–449（449 aa）	未记录	L22 4-(2-amino-1,3-thiazol-4-yl)pyrimidin-2-amine × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.77 Å R-free 0.202
2W70 Crystal structure of Biotin carboxylase from E. coli in complex with the amino-thiazole-pyrimidine fragment 提交 2008-12-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–449（449 aa）	未记录	L22 4-(2-amino-1,3-thiazol-4-yl)pyrimidin-2-amine × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.77 Å R-free 0.202
2W71 Crystal structure of Biotin carboxylase from E. coli in complex with the imidazole-pyrimidine inhibitor 提交 2008-12-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–449（449 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 L23 4-[1-(2,6-dichlorobenzyl)-2-methyl-1H-imidazol-4-yl]pyrimidin-2-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.99 Å R-free 0.229
2W71 Crystal structure of Biotin carboxylase from E. coli in complex with the imidazole-pyrimidine inhibitor 提交 2008-12-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–449（449 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 L23 4-[1-(2,6-dichlorobenzyl)-2-methyl-1H-imidazol-4-yl]pyrimidin-2-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.99 Å R-free 0.229
3G8C Crystal Structure of Biotin Carboxylase in Complex with Biotin, Bicarbonate, ADP and Mg Ion 提交 2009-02-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–444（444 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BTN BIOTIN × 1 BCT BICARBONATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；23% PEG3350, 0.12M Li2SO4, 3.9% SORBITOL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.216
3G8C Crystal Structure of Biotin Carboxylase in Complex with Biotin, Bicarbonate, ADP and Mg Ion 提交 2009-02-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–444（444 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BTN BIOTIN × 1 BCT BICARBONATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；23% PEG3350, 0.12M Li2SO4, 3.9% SORBITOL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.216
3G8D Crystal structure of the biotin carboxylase subunit, E296A mutant, of acetyl-COA carboxylase from Escherichia coli 提交 2009-02-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–444（444 aa）	突变：E296A	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；23% PEG3350, 0.12M Li2SO4, 3.9% SORBITOL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.90 Å R-free 0.226
3G8D Crystal structure of the biotin carboxylase subunit, E296A mutant, of acetyl-COA carboxylase from Escherichia coli 提交 2009-02-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–444（444 aa）	突变：E296A	SO4 SULFATE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；23% PEG3350, 0.12M Li2SO4, 3.9% SORBITOL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.90 Å R-free 0.226
3JZF Crystal structure of biotin carboxylase from E. Coli in complex with benzimidazoles series 提交 2009-09-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–449（449 aa）链 B 1–449（449 aa）	未记录	CO3 CARBONATE ION × 1 JZK 2-[(2-chlorobenzyl)amino]-1-(cyclohexylmethyl)-1H-benzimidazole-5-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；Co-crystallzation. 8-10% PEG 6000, Tris-HCl pH 8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.13 Å R-free 0.236
3JZI Crystal structure of biotin carboxylase from E. Coli in complex with benzimidazole series 提交 2009-09-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–449（449 aa）链 B 1–449（449 aa）	未记录	JZL 7-amino-2-[(2-chlorobenzyl)amino]-1-{[(1S,2S)-2-hydroxycycloheptyl]methyl}-1H-benzimidazole-5-carboxamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；Co-crystallization. 8-10% PEG6000, 100mM Tris-HCl., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.31 Å R-free 0.223
3RUP Crystal structure of E.coli biotin carboxylase in complex with two ADP and two Ca ions 提交 2011-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–449（449 aa）链 B 1–449（449 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；PEG3350, CaCl2, pH 8.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 295K	分辨率 1.99 Å R-free 0.227
3RV3 Crystal structure of E.coli biotin carboxylase in complex with two ADP and one Mg ion 提交 2011-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–449（449 aa）链 B 1–449（449 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；295 K；Bis-Tris, PEG3350, NH4Cl, n-octyl-beta-D-glucose, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.91 Å R-free 0.263
3RV4 Crystal structure of E.coli biotin carboxylase R16E mutant in complex with Mg-ADP and bicarbonate 提交 2011-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–449（449 aa）	突变：R16E	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 BCT BICARBONATE ION × 2 CS CESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 4 NA SODIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 MOH METHANOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；PEG3350, CsCl, methanol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.98 Å R-free 0.219
8UXZ E. coli acetyl-CoA carboxylase, wide stacked local reconstruction, 3.20 Angstrom 提交 2023-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 C 1–446（446 aa）链 G 1–446（446 aa）	未记录	BTN BIOTIN × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ACO ACETYL COENZYME *A × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；2.5 mg/ml ACC complex in 50 mM HEPES pH 7.5, 100 mM bicarbonate, 7.5 mM ATP, 20 mM MgCl2 and 1 mM acetyl-CoA cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8UZ2 E. coli acetyl-CoA carboxylase, narrow helical local reconstruction, 3.18 Angstrom 提交 2023-11-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 C 1–446（446 aa）链 G 1–446（446 aa）	未记录	BTN BIOTIN × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ACO ACETYL COENZYME *A × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；2.5 mg/ml ACC complex in 50 mM HEPES pH 7.5, 100 mM bicarbonate, 7.5 mM ATP, 20 mM MgCl2 and 1 mM acetyl-CoA cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.18 Å
9E4N E. coli acetyl-CoA carboxylase, narrow helical tube, 4.04 Angstrom 提交 2024-10-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 152 PDB 声明：152-meric	链 C 1–449（449 aa）	未记录	BTN BIOTIN × 38 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 38 MG MAGNESIUM ION × 38 ZN ZINC ION × 38 ACO ACETYL COENZYME *A × 38	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；2.5 mg/ml ACC complex in 50 mM HEPES pH 7.5, 100 mM bicarbonate, 7.5 mM ATP, 20 mM MgCl2 and 1 mM acetyl-CoA cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.04 Å
9E4O E. coli acetyl-CoA carboxylase, wide stacked tube, 3.98 Angstrom 提交 2024-10-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 160 PDB 声明：160-meric	链 C 1–449（449 aa）	未记录	BTN BIOTIN × 40 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 40 MG MAGNESIUM ION × 40 ZN ZINC ION × 40 ACO ACETYL COENZYME *A × 40	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；2.5 mg/ml ACC complex in 50 mM HEPES pH 7.5, 100 mM bicarbonate, 7.5 mM ATP, 20 mM MgCl2 and 1 mM acetyl-CoA cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.98 Å

共 29 个其他 PDB 条目、49 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ACCC_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449 作者链 C； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449 作者链 E； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449 作者链 F； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449

Biotin carboxyl carrier protein of acetyl-CoA carboxylase

Escherichia coli

UniProt P0ABD8

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–156 链 D； UniProt 1–156 链 G； UniProt 1–156 链 I； UniProt 1–156	未记录	Biotin carboxylase × 4 （P24182） SO4 SULFATE ION × 12 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295.15 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, 25% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.15K	分辨率 2.50 Å R-free 0.229

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 4HR7	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1A6X STRUCTURE OF THE APO-BIOTIN CARBOXYL CARRIER PROTEIN (APO-BCCP87) OF ESCHERICHIA COLI ACETYL-COA CARBOXYLASE, NMR, 49 STRUCTURES 提交 1998-03-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 70–156（87 aa）片段：CARBOXYL-TERMINAL FRAGMENT, RESIDUES 70 - 156	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.5；298 K NMR样品组成 PHOSPHATE BUFFER	分辨率未提供
1BDO STRUCTURE OF THE BIOTINYL DOMAIN OF ACETYL-COENZYME A CARBOXYLASE DETERMINED BY MAD PHASING 提交 1995-11-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 77–156（80 aa）片段：BIOTINYL DOMAIN, RESIDUES 77 - 156	未记录	BTN BIOTIN × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.80 Å
2BDO SOLUTION STRUCTURE OF HOLO-BIOTINYL DOMAIN FROM ACETYL COENZYME A CARBOXYLASE OF ESCHERICHIA COLI DETERMINED BY TRIPLE-RESONANCE NMR SPECTROSCOPY 提交 1999-03-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 77–156（80 aa）片段：BIOTINYL DOMAIN, RESIDUES 77 - 156	未记录	BTN BIOTIN × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；303 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM SODIUM PHOSPHATE；压力 1	分辨率未提供
3BDO SOLUTION STRUCTURE OF APO-BIOTINYL DOMAIN FROM ACETYL COENZYME A CARBOXYLASE OF ESCHERICHIA COLI DETERMINED BY TRIPLE-RESONANCE NMR SPECTROSCOPY 提交 1999-03-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 75–156（82 aa）片段：BIOTINYL DOMAIN, RESIDUES 77 - 156	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；303 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM SODIUM PHOSPHATE；压力 1 NMR样品组成 90% WATER/10% D2O	分辨率未提供
8UXZ E. coli acetyl-CoA carboxylase, wide stacked local reconstruction, 3.20 Angstrom 提交 2023-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 B 80–156（77 aa）链 F 80–156（77 aa）	未记录	BTN BIOTIN × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ACO ACETYL COENZYME *A × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；2.5 mg/ml ACC complex in 50 mM HEPES pH 7.5, 100 mM bicarbonate, 7.5 mM ATP, 20 mM MgCl2 and 1 mM acetyl-CoA cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8UZ2 E. coli acetyl-CoA carboxylase, narrow helical local reconstruction, 3.18 Angstrom 提交 2023-11-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 B 80–156（77 aa）链 F 80–156（77 aa）	未记录	BTN BIOTIN × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ACO ACETYL COENZYME *A × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；2.5 mg/ml ACC complex in 50 mM HEPES pH 7.5, 100 mM bicarbonate, 7.5 mM ATP, 20 mM MgCl2 and 1 mM acetyl-CoA cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.18 Å
9E4N E. coli acetyl-CoA carboxylase, narrow helical tube, 4.04 Angstrom 提交 2024-10-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 152 PDB 声明：152-meric	链 B 80–156（77 aa）	未记录	BTN BIOTIN × 38 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 38 MG MAGNESIUM ION × 38 ZN ZINC ION × 38 ACO ACETYL COENZYME *A × 38	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；2.5 mg/ml ACC complex in 50 mM HEPES pH 7.5, 100 mM bicarbonate, 7.5 mM ATP, 20 mM MgCl2 and 1 mM acetyl-CoA cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.04 Å
9E4O E. coli acetyl-CoA carboxylase, wide stacked tube, 3.98 Angstrom 提交 2024-10-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 160 PDB 声明：160-meric	链 B 80–156（77 aa）	未记录	BTN BIOTIN × 40 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 40 MG MAGNESIUM ION × 40 ZN ZINC ION × 40 ACO ACETYL COENZYME *A × 40	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；2.5 mg/ml ACC complex in 50 mM HEPES pH 7.5, 100 mM bicarbonate, 7.5 mM ATP, 20 mM MgCl2 and 1 mM acetyl-CoA cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.98 Å

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BCCP_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 21–176； UniProt 1–156 作者链 D； PDB构建体 21–176； UniProt 1–156 作者链 G； PDB构建体 21–176； UniProt 1–156 作者链 I； PDB构建体 21–176； UniProt 1–156

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4hr7
沉积日期 deposition_date	2012-10-26
结构标题 title	Crystal Structure of Biotin Carboxyl Carrier Protein-Biotin Carboxylase Complex from E.coli
关键词 keywords	;biotin carboxylase, biotin carboxyl carrier protein, acetyl-CoA carboxylase, protein-protein interaction, protein complex, protein interface, antibiotic target, ATP grasp, biotin-dependent carboxylase, fatty acid synthesis, LIGASE-BIOTIN BINDING PROTEIN complex ;; LIGASE/BIOTIN BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	41.93 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	41.25 Å
零角强度 I(0) i0	749200000.00
分子量 molecular_weight	223780.0 kDa
排除体积 excluded_volume	279790 Å³
包络体积 envelope_volume	371800 Å³
水化壳体积 shell_volume	71926 Å³
包络直径 envelope_diameter	136.3 Å
壳层 Rg shell_rg	48.63 Å
包络 Rg envelope_rg	41.60 Å
形状 Rg shape_rg	41.23 Å
总 Rg total_rg	41.68 Å
总原子数 total_atoms	15682
残基数 n_residues	2030
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	132.0 Å
Rg (实空间) rg_real	41.80 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.84 Å
I(0) (实空间) i0_real	7.4920e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.3130e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	41.93 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	749300000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8919
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	48.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.192
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.548
角度范围 angular_range	— – 0.1900 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	119300000.0000
实空间数据点数 n_real_points	39
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.942; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.989; Smooth: 0.775

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Biotin carboxylase
分子量 formula_weight	49386.7 kDa
EC 编号 ec_number	6.3.4.14, 6.4.1.2
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,F
原子数 atom_count	16162

MLDKIVIANRGEIALRILRACKELGIKTVAVHSSADRDLKHVLLADETVCIGPAPSVKSYLNIPAIISAAEITGAVAIHPGYGFLSENANFAEQVERSGFIFIGPKAETIRLMGDKVSAIAAMKKAGVPCVPGSDGPLGDDMDKNRAIAKRIGYPVIIKASGGGGGRGMRVVRGDAELAQSISMTRAEAKAAFSNDMVYMEKYLENPRHVEIQVLADGQGNAIYLAERDCSMQRRHQKVVEEAPAPGITPELRRYIGERCAKACVDIGYRGAGTFEFLFENGEFYFIEMNTRIQVEHPVTEMITGVDLIKEQLRIAAGQPLSIKQEEVHVRGHAVECRINAEDPNTFLPSPGKITRFHAPGGFGVRWESHIYAGYTVPPYYDSMIGKLICYGENRDVAIARMKNALQELIIDGIKTNVDLQIRIMNDENFQHGGTNIHYLEKKLGLQEK

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Biotin carboxyl carrier protein of acetyl-CoA carboxylase
分子量 formula_weight	18872.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,G,I

MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMDIRKIKKLIELVEESGISELEISEGEESVRISRAAPAASFPVMQQAYAAPMMQQPAQSNAAAPATVPSMEAPAAAEISGHIVRSPMVGTFYRTPSPDAKAFIEVGQKVNVGDTLCIVEAMKMMNQIEADKSGTVKAILVESGQPVEFDEPLVVIE

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	12

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	455

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 32 domains

SCOP 2.08 (16 domains)

结构域编号 domain_id	d4hr7a1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.30 — PreATP-grasp domain
超家族 Superfamily superfamily	c.30.1 — PreATP-grasp domain
家族 Family family	c.30.1.1 — BC N-terminal domain-like

结构域编号 domain_id	d4hr7a2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.142 — ATP-grasp
超家族 Superfamily superfamily	d.142.1 — Glutathione synthetase ATP-binding domain-like
家族 Family family	d.142.1.2 — BC ATP-binding domain-like

结构域编号 domain_id	d4hr7a3
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.84 — Barrel-sandwich hybrid
超家族 Superfamily superfamily	b.84.2 — Rudiment single hybrid motif
家族 Family family	b.84.2.1 — BC C-terminal domain-like

结构域编号 domain_id	d4hr7b_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.84 — Barrel-sandwich hybrid
超家族 Superfamily superfamily	b.84.1 — Single hybrid motif
家族 Family family	b.84.1.1 — Biotinyl/lipoyl-carrier proteins and domains

结构域编号 domain_id	d4hr7c1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.30 — PreATP-grasp domain
超家族 Superfamily superfamily	c.30.1 — PreATP-grasp domain
家族 Family family	c.30.1.1 — BC N-terminal domain-like

结构域编号 domain_id	d4hr7c2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.142 — ATP-grasp
超家族 Superfamily superfamily	d.142.1 — Glutathione synthetase ATP-binding domain-like
家族 Family family	d.142.1.2 — BC ATP-binding domain-like

结构域编号 domain_id	d4hr7c3
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.84 — Barrel-sandwich hybrid
超家族 Superfamily superfamily	b.84.2 — Rudiment single hybrid motif
家族 Family family	b.84.2.1 — BC C-terminal domain-like

结构域编号 domain_id	d4hr7d_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.84 — Barrel-sandwich hybrid
超家族 Superfamily superfamily	b.84.1 — Single hybrid motif
家族 Family family	b.84.1.1 — Biotinyl/lipoyl-carrier proteins and domains

结构域编号 domain_id	d4hr7e1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.30 — PreATP-grasp domain
超家族 Superfamily superfamily	c.30.1 — PreATP-grasp domain
家族 Family family	c.30.1.1 — BC N-terminal domain-like

结构域编号 domain_id	d4hr7e2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.142 — ATP-grasp
超家族 Superfamily superfamily	d.142.1 — Glutathione synthetase ATP-binding domain-like
家族 Family family	d.142.1.2 — BC ATP-binding domain-like

结构域编号 domain_id	d4hr7e3
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.84 — Barrel-sandwich hybrid
超家族 Superfamily superfamily	b.84.2 — Rudiment single hybrid motif
家族 Family family	b.84.2.1 — BC C-terminal domain-like

结构域编号 domain_id	d4hr7f1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.30 — PreATP-grasp domain
超家族 Superfamily superfamily	c.30.1 — PreATP-grasp domain
家族 Family family	c.30.1.1 — BC N-terminal domain-like

结构域编号 domain_id	d4hr7f2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.142 — ATP-grasp
超家族 Superfamily superfamily	d.142.1 — Glutathione synthetase ATP-binding domain-like
家族 Family family	d.142.1.2 — BC ATP-binding domain-like

结构域编号 domain_id	d4hr7f3
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.84 — Barrel-sandwich hybrid
超家族 Superfamily superfamily	b.84.2 — Rudiment single hybrid motif
家族 Family family	b.84.2.1 — BC C-terminal domain-like

结构域编号 domain_id	d4hr7g_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.84 — Barrel-sandwich hybrid
超家族 Superfamily superfamily	b.84.1 — Single hybrid motif
家族 Family family	b.84.1.1 — Biotinyl/lipoyl-carrier proteins and domains

结构域编号 domain_id	d4hr7i_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.84 — Barrel-sandwich hybrid
超家族 Superfamily superfamily	b.84.1 — Single hybrid motif
家族 Family family	b.84.1.1 — Biotinyl/lipoyl-carrier proteins and domains

CATH v4.4 (16 domains)

结构域编号 domain_id	4hr7A01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	4hr7A02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	470 — D-amino Acid Aminotransferase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — ATP-grasp fold, B domain

结构域编号 domain_id	4hr7A03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1490 — Dna Ligase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — ATP-grasp fold, A domain

结构域编号 domain_id	4hr7B00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain

结构域编号 domain_id	4hr7C01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	4hr7C02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	470 — D-amino Acid Aminotransferase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — ATP-grasp fold, B domain

结构域编号 domain_id	4hr7C03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1490 — Dna Ligase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — ATP-grasp fold, A domain

结构域编号 domain_id	4hr7D00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain

结构域编号 domain_id	4hr7E01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	4hr7E02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	470 — D-amino Acid Aminotransferase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — ATP-grasp fold, B domain

结构域编号 domain_id	4hr7E03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1490 — Dna Ligase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — ATP-grasp fold, A domain

结构域编号 domain_id	4hr7F01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	4hr7F02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	470 — D-amino Acid Aminotransferase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — ATP-grasp fold, B domain

结构域编号 domain_id	4hr7F03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1490 — Dna Ligase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — ATP-grasp fold, A domain

结构域编号 domain_id	4hr7G00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain

结构域编号 domain_id	4hr7I00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	232.995 Å
晶胞边长 b length_b	96.385 Å
晶胞边长 c length_c	120.573 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	120.15 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.495 Å
最低分辨率 resolution_low	104.260 Å
R 因子 r_factor	0.1968
R_work r_work	0.1950
R_free r_free	0.2291

Crystal Structure of Biotin Carboxyl Carrier Protein-Biotin Carboxylase Complex from E.coli

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Biotin carboxylase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Biotin carboxyl carrier protein of acetyl-CoA carboxylase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 32 domains

SCOP 2.08 (16 domains)

CATH v4.4 (16 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

fit	/app/data/saxs_computation/hr/4hr7/4hr7.fit
pddf	/app/data/pr_computation/hr/4hr7/4hr7.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/hr/4hr7/4hr7.dat