HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 1 chain
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 24–206 | 未记录 | HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain × 1 (Q5Y7D3) T-CELL RECEPTOR, JR5.1 ALPHA CHAIN × 1 T-CELL RECEPTOR, JR5.1 BETA CHAIN × 1 deamidated Gliadin-alpha2 peptide × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;Mother liquor: 0.15 - 0.25M CaOAc, 0.1M Tris/HCl, 12-18% PEG3350, Additives:2-3 mM reduced and oxidised Glutathione | 分辨率 2.70 Å R-free 0.238 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 4OZF | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1S9V Crystal structure of HLA-DQ2 complexed with deamidated gliadin peptide 提交 2004-02-05 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
24–216(193 aa)
片段:residues (-1)-191
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.5;300 K;sodium acetate, ammonium acetate, ammonium sulfate, ethylene glycol, PEG 3350, pH 3.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
|
分辨率 2.22 Å R-free 0.283 |
| 1S9V Crystal structure of HLA-DQ2 complexed with deamidated gliadin peptide 提交 2004-02-05 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
24–216(193 aa)
片段:residues (-1)-191
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.5;300 K;sodium acetate, ammonium acetate, ammonium sulfate, ethylene glycol, PEG 3350, pH 3.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
|
分辨率 2.22 Å R-free 0.283 |
| 4GG6 Protein complex 提交 2012-08-06 | 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
24–206(183 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAINS, UNP RESIDUES 24-206
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;294 K;0.2M SODIUM ACETATE, 0.1M MES PH 6.5, 17% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.285 |
| 4GG6 Protein complex 提交 2012-08-06 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 C
24–206(183 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAINS, UNP RESIDUES 24-206
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;294 K;0.2M SODIUM ACETATE, 0.1M MES PH 6.5, 17% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.285 |
| 4OZG D2 protein complex 提交 2014-02-16 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
24–206(183 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;Mother liquor: 0.15- 0.25M CaOAc, 0.1 M Tris/HCl, 12-18% PEG3350, Additives: 2-3 mM reduced and oxidised Glutathione
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.241 |
| 4OZG D2 protein complex 提交 2014-02-16 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 C
24–206(183 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;Mother liquor: 0.15- 0.25M CaOAc, 0.1 M Tris/HCl, 12-18% PEG3350, Additives: 2-3 mM reduced and oxidised Glutathione
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.241 |
| 4OZH S16 protein complex 提交 2014-02-16 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
24–206(183 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;Mother liquor: 0.15- 0.25M CaOAc, 0.1 M Tris/HCl, 12-18% PEG3350, Additives: 2-3 mM reduced and oxidised Glutathione
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.243 |
| 4OZH S16 protein complex 提交 2014-02-16 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 C
24–206(183 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;Mother liquor: 0.15- 0.25M CaOAc, 0.1 M Tris/HCl, 12-18% PEG3350, Additives: 2-3 mM reduced and oxidised Glutathione
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.243 |
| 4OZI S2 protein complex 提交 2014-02-16 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
24–206(183 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;Mother liquor: 0.15- 0.25M CaOAc, 0.1 M Tris/HCl, 12-18% PEG3350, Additives: 2-3 mM reduced and oxidised Glutathione
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.243 |
| 4OZI S2 protein complex 提交 2014-02-16 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 C
24–206(183 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;Mother liquor: 0.15- 0.25M CaOAc, 0.1 M Tris/HCl, 12-18% PEG3350, Additives: 2-3 mM reduced and oxidised Glutathione
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.243 |
| 5KSA Bel602-DQ8.5-glia-gamma1 complex 提交 2016-07-08 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
24–206(183 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;0.1 M Ca-Acetate, 21 % PEG3350, Tris pH 8.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.206 |
| 5KSB T15-DQ8.5-glia-gamma1 complex 提交 2016-07-08 | 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
24–206(183 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;8% Tacsimate pH 7.5, 20% PEG3350
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.254 |
| 5KSB T15-DQ8.5-glia-gamma1 complex 提交 2016-07-08 | 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 C
24–206(183 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;8% Tacsimate pH 7.5, 20% PEG3350
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.254 |
| 5KSU Crystal structure of HLA-DQ2.5-CLIP1 at 2.73 resolution 提交 2016-07-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
24–216(193 aa)
片段:UNP residues 1-193
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;PEG 8000, ammonium sulphate, sodium cacodylate, glycerol
|
分辨率 2.73 Å R-free 0.249 |
| 5KSU Crystal structure of HLA-DQ2.5-CLIP1 at 2.73 resolution 提交 2016-07-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
24–216(193 aa)
片段:UNP residues 1-193
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;PEG 8000, ammonium sulphate, sodium cacodylate, glycerol
|
分辨率 2.73 Å R-free 0.249 |
| 6MFF HLA-DQ2-glia-omega1 提交 2018-09-10 | 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
24–206(183 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;23% PEG3350 and 0.1 M NaH2PO4, pH 6
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.250 |
| 6MFG HLA-DQ2-glia-alpha1 提交 2018-09-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
24–206(183 aa)
链 C
24–206(183 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;23% PEG3350 and 0.1 M NaH2PO4, pH 6
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.222 |
| 6U3M DQ2-P.fluor-alpha1a 提交 2019-08-22 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 C
24–206(183 aa)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;18% PEG3350 and 0.15M NH4H2PO4
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.220 |
| 6U3M DQ2-P.fluor-alpha1a 提交 2019-08-22 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
24–206(183 aa)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;18% PEG3350 and 0.15M NH4H2PO4
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.220 |
| 7SG0 W316 TCR in complex with HLA-DQ2-omega1 提交 2021-10-04 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
24–206(183 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;24% PEG3350, 0.25 M (NH4)2SO4 and 0.1 M Tris/HCl at pH 8.0
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.230 |
| 7SG1 XPA5 TCR in complex with HLA-DQ2-alpha1 提交 2021-10-04 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
24–206(183 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;Mother liquor: 16-18% PEG3350, 0.12-0.14 M CaOAc, 0.1 M Tris/HCl at pH 8.0, Additives: 2 mM reduced and oxidised Glutathione
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.258 |
| 7SG1 XPA5 TCR in complex with HLA-DQ2-alpha1 提交 2021-10-04 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 F
24–206(183 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;Mother liquor: 16-18% PEG3350, 0.12-0.14 M CaOAc, 0.1 M Tris/HCl at pH 8.0, Additives: 2 mM reduced and oxidised Glutathione
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.258 |
| 7SG2 XPA5 TCR in complex with HLA-DQ2-omega1 提交 2021-10-04 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
24–206(183 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;Mother liquor: 16-18% PEG3350, 0.12-0.14 M CaOAc, 0.1 M Tris/HCl at pH 8.0, Additives: 2 mM reduced and oxidised Glutathione
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.259 |
| 7SG2 XPA5 TCR in complex with HLA-DQ2-omega1 提交 2021-10-04 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 F
24–206(183 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;Mother liquor: 16-18% PEG3350, 0.12-0.14 M CaOAc, 0.1 M Tris/HCl at pH 8.0, Additives: 2 mM reduced and oxidised Glutathione
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.259 |
| 8VSP Cryo-EM structure of human invariant chain in complex with HLA-DQ 提交 2024-01-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 A
1–254(254 aa)
链 D
1–254(254 aa)
链 G
1–254(254 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.12 Å |
| 8W83 HLA-DQ2.5-alpha1 gliadin peptide in complex with DQN0344AE02 提交 2023-08-31 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 C
24–206(183 aa)
|
突变:C47S | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;294 K;0.1 M HEPES (pH7.5), 25.0 %w/v Polyethylene glycol 1,000, and 20 %v/v Glycerol as cryoprotectant
|
分辨率 2.82 Å R-free 0.321 |
| 8W83 HLA-DQ2.5-alpha1 gliadin peptide in complex with DQN0344AE02 提交 2023-08-31 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 G
24–206(183 aa)
|
突变:C47S | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;294 K;0.1 M HEPES (pH7.5), 25.0 %w/v Polyethylene glycol 1,000, and 20 %v/v Glycerol as cryoprotectant
|
分辨率 2.82 Å R-free 0.321 |
| 8W83 HLA-DQ2.5-alpha1 gliadin peptide in complex with DQN0344AE02 提交 2023-08-31 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 K
24–206(183 aa)
|
突变:C47S | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;294 K;0.1 M HEPES (pH7.5), 25.0 %w/v Polyethylene glycol 1,000, and 20 %v/v Glycerol as cryoprotectant
|
分辨率 2.82 Å R-free 0.321 |
| 8W83 HLA-DQ2.5-alpha1 gliadin peptide in complex with DQN0344AE02 提交 2023-08-31 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 O
24–206(183 aa)
|
突变:C47S | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;294 K;0.1 M HEPES (pH7.5), 25.0 %w/v Polyethylene glycol 1,000, and 20 %v/v Glycerol as cryoprotectant
|
分辨率 2.82 Å R-free 0.321 |
| 8W84 HLA-DQ2.5-alpha2 gliadin peptide in complex with DQN0344AE02 提交 2023-08-31 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 C
24–206(183 aa)
|
突变:C47S | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4;293 K;80 mM di-Sodium malonate (pH4.0), 9.6 %w/v Polyethylene glycol 3,350, and 25 %v/v Ethylene glycol as cryoprotectant
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.325 |
| 8W85 HLA-DQ2.5-gamma2 gliadin peptide in complex with DQN0385AE01 提交 2023-08-31 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 C
24–206(183 aa)
|
突变:C47S | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;294 K;0.1 M Ammonium sulfate,
10.0 %w/v Polyethylene glycol 3,350, and 30 %v/v Ethylene glycol as cryoprotectant
|
分辨率 2.77 Å R-free 0.300 |
| 8W85 HLA-DQ2.5-gamma2 gliadin peptide in complex with DQN0385AE01 提交 2023-08-31 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 G
24–206(183 aa)
|
突变:C47S | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;294 K;0.1 M Ammonium sulfate,
10.0 %w/v Polyethylene glycol 3,350, and 30 %v/v Ethylene glycol as cryoprotectant
|
分辨率 2.77 Å R-free 0.300 |
| 8W86 HLA-DQ2.5-B/C hordein peptide in complex with DQN0385AE02 提交 2023-08-31 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 C
24–206(183 aa)
|
突变:C47S | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;294 K;0.1 M MES monohydrate (pH5.5), 12.0 %w/v Polyethylene glycol 8,000, 0.1 M Calcium acetate hydrate, and 30 %v/v Ethylene glycol as cryoprotectant
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分辨率 2.24 Å R-free 0.280 |
| 8W86 HLA-DQ2.5-B/C hordein peptide in complex with DQN0385AE02 提交 2023-08-31 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 G
24–206(183 aa)
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突变:C47S | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;294 K;0.1 M MES monohydrate (pH5.5), 12.0 %w/v Polyethylene glycol 8,000, 0.1 M Calcium acetate hydrate, and 30 %v/v Ethylene glycol as cryoprotectant
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分辨率 2.24 Å R-free 0.280 |
| 9EJG Peptide-independent T cell receptor recognition of HLA-DQ2 提交 2024-11-27 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
24–206(183 aa)
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 FMT FORMIC ACID × 5 GOL GLYCEROL × 2 ACT ACETATE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;8% Tacsimate, pH 8.0, 20-24% w/v PEG3350
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分辨率 2.20 Å R-free 0.225 |
| 9EJH Peptide-independent T cell receptor recognition of HLA-DQ2 提交 2024-11-27 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
24–206(183 aa)
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ACT ACETATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;8% Tacsimate, pH 8.0, 20-24% w/v PEG3350
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分辨率 2.45 Å R-free 0.232 |
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| UniProt名称 | DQA1_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–183; UniProt 24–206 |