SAXSdb — 4ric

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fanconi-associated nuclease 1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 单体蛋白 × 1 DNA 3 PDB 声明：tetrameric（4）与全部聚合物数一致	链 A； UniProt 370–1009	片段：unp residues 370-1009	;DNA (5'-D(TPTPAPGPCPCPAPCPGPCPCPTPAPGPAPCPTPCPCPTPC)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(GPCPTPGPAPGPGPAPGPTPCPT)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(TPTPTPTPTPTPGPAPGPGPCPGPTP*G)-3') ; × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG 3350, NaCl , pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.80 Å R-free 0.257
2	蛋白–DNA 单体蛋白 × 1 DNA 3 PDB 声明：tetrameric（4）与全部聚合物数一致	链 B； UniProt 370–1009	片段：unp residues 370-1009	;DNA (5'-D(TPTPAPGPCPCPAPCPGPCPCPTPAPGPAPCPTPCPCPTPC)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(GPCPTPGPAPGPGPAPGPTPCPT)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(TPTPTPTPTPTPGPAPGPGPCPGPTP*G)-3') ; × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG 3350, NaCl , pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.80 Å R-free 0.257

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4RIC	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4REA A Nuclease DNA complex 提交 2014-09-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：pentameric	链 A 373–1017（645 aa）片段：UNP residues 373-1017 链 B 373–1017（645 aa）片段：UNP residues 373-1017	突变：D960A 突变：D960A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 micro-batch under oil；300 K；0.1-0.2M KSCN, 18-22% PEG 3350, 0.1M BisTris-propane, micro-batch under oil, temperature 300K	分辨率 3.81 Å R-free 0.277
4REB Structural Insights into 5' Flap DNA Unwinding and Incision by the Human FAN1 Dimer 提交 2014-09-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：pentameric	链 A 373–1017（645 aa）片段：UNP residues 373-1017 链 H 373–1017（645 aa）片段：UNP residues 373-1017	突变：D960A 突变：D960A	SM SAMARIUM (III) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 micro-batch under oil；300 K；0.1mM spermidine, 1% 1,6-Hexanediol, 22-24% PEG 3350, 0.1M BisTris Propane, micro-batch under oil, temperature 300K	分辨率 4.20 Å R-free 0.262
4REC A nuclease-DNA complex form 3 提交 2014-09-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric	链 A 373–1017（645 aa）片段：UNP residues 373-1017	突变：D960A	IOD IODIDE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 micro-batch under oil；300 K；0.1M potassium iodide, 0.1mM spermidine, 18% PEG3350, 0.1M BisTris propane, micro-batch under oil, temperature 300K	分辨率 2.20 Å R-free 0.254
4RI8 FAN1 Nuclease bound to 5' phosphorylated p(dG)/3'(dT-dT-dT-dT) double flap DNA 提交 2014-10-05	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric	链 A 370–1017（648 aa）片段：unp residues 370-1017	突变：V487A	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG 3350, NaCl, pH 7.0, hanging drop vapor diffusion, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.90 Å R-free 0.255
4RI8 FAN1 Nuclease bound to 5' phosphorylated p(dG)/3'(dT-dT-dT-dT) double flap DNA 提交 2014-10-05	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric	链 B 370–1017（648 aa）片段：unp residues 370-1017	突变：V487A	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG 3350, NaCl, pH 7.0, hanging drop vapor diffusion, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.90 Å R-free 0.255
4RI9 FAN1 Nuclease bound to 5' phosphorylated p(dT)/3'(dT-dT-dT-dT-dT-dT-dT-dT) double flap DNA 提交 2014-10-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：pentameric	链 A 370–1017（648 aa）片段：unp residues 370-1017	突变：V487A	BA BARIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG 3350, NaCl, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.90 Å R-free 0.266
4RI9 FAN1 Nuclease bound to 5' phosphorylated p(dT)/3'(dT-dT-dT-dT-dT-dT-dT-dT) double flap DNA 提交 2014-10-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：pentameric	链 B 370–1017（648 aa）片段：unp residues 370-1017	突变：V487A	BA BARIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG 3350, NaCl, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.90 Å R-free 0.266
4RIA FAN1 Nuclease bound to 5' phosphorylated nicked DNA 提交 2014-10-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：pentameric	链 A 370–1017（648 aa）片段：unp residues 370-1017	未记录	BA BARIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG 3350, NaCl , pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.00 Å R-free 0.267
4RIA FAN1 Nuclease bound to 5' phosphorylated nicked DNA 提交 2014-10-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：pentameric	链 B 370–1017（648 aa）片段：unp residues 370-1017	未记录	BA BARIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG 3350, NaCl , pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.00 Å R-free 0.267
4RIB FAN1 Nuclease bound to 5' phosphorylated p(dT) single flap DNA 提交 2014-10-05	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric	链 A 364–1017（654 aa）片段：unp residues 364-1017	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 hanging drop vapor diffusion；pH 7；277 K；PEG 3350, NaCl, pH 7.0, hanging drop vapor diffusion, temperature 277K	分辨率 3.25 Å R-free 0.265
4RIB FAN1 Nuclease bound to 5' phosphorylated p(dT) single flap DNA 提交 2014-10-05	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric	链 B 364–1017（654 aa）片段：unp residues 364-1017	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 hanging drop vapor diffusion；pH 7；277 K；PEG 3350, NaCl, pH 7.0, hanging drop vapor diffusion, temperature 277K	分辨率 3.25 Å R-free 0.265
4RID Human FAN1 nuclease 提交 2014-10-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 370–1009（640 aa）片段：unp residues 370-1009	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG 3350, NaCl, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.30 Å R-free 0.288
4RID Human FAN1 nuclease 提交 2014-10-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 370–1009（640 aa）片段：unp residues 370-1009	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG 3350, NaCl, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.30 Å R-free 0.288
4RID Human FAN1 nuclease 提交 2014-10-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 370–1009（640 aa）片段：unp residues 370-1009 链 B 370–1009（640 aa）片段：unp residues 370-1009	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG 3350, NaCl, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.30 Å R-free 0.288
4RY3 Crystal structure of human Fanconi-associated nuclease 1 提交 2014-12-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 371–1010（640 aa）片段：UNP residues 371-1010	未记录	PT PLATINUM (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；277 K；2.5M sodium acetate, 0.1M Bis-Tris propane, 10% glycerol, pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.80 Å R-free 0.243
4RY3 Crystal structure of human Fanconi-associated nuclease 1 提交 2014-12-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 371–1010（640 aa）片段：UNP residues 371-1010	未记录	PT PLATINUM (II) ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；277 K；2.5M sodium acetate, 0.1M Bis-Tris propane, 10% glycerol, pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.80 Å R-free 0.243
8S5A The crystal structure of FAN1 Nuclease bound to 5' phosphorylated p(dG)/3'(dT-dT-dT-dT) double flap DNA 提交 2024-02-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric	链 A 364–1017（654 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M Hepes/MOPS pH: 7.25, 0.1M Sodium formate 0.1M Ammonium acetate 0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate 0.1M Potassium sodium tartrate tetrahydrate 0.1M Sodium oxamate 21% v/v Ethylene glycol 21 % w/v PEG 8000	分辨率 2.65 Å R-free 0.273
9CG4 Cryo-EM structure of FAN1, PCNA and DNA substrate with (CAG)2 extrusion in intermediate state 提交 2024-06-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 E 372–554（183 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.37 Å
9CHM Cryo-EM structure of FAN1 R507H and PCNA in intermediate state 提交 2024-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 372–555（184 aa）	突变：R507H	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.47 Å
9CL7 Cryo-EM structure of FAN1-PCNA-DNA in final state 提交 2024-07-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 E 372–1010（639 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.83 Å
9CMA Cryo-EM structure of FAN1 R507H-PCNA-DNA in final state 提交 2024-07-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 A 372–1017（646 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.97 Å
9EO1 Cryo_EM structure of human FAN1 in complex with 5' flap DNA substrate 提交 2024-03-14	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric	链 A 372–1007（636 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.20 Å
9EOA Cryo_EM structure of human FAN1 in complex with 5' flap DNA substrate and PCNA 提交 2024-03-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：heptameric	链 A 372–1007（636 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.27 Å
9GY0 Cryo_EM structure of human FAN1 R507H mutant in complex with 5' flap DNA substrate and PCNA 提交 2024-10-01	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：heptameric	链 A 1–1017（1017 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.42 Å

共 17 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FAN1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–631； UniProt 370–1009 作者链 B； PDB构建体 1–631； UniProt 370–1009

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4ric
沉积日期 deposition_date	2014-10-05
结构标题 title	FAN1 Nuclease bound to 5' hydroxyl (dT-dT) single flap DNA
关键词 keywords	nuclease, hydrolase-dna complex; hydrolase/dna
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	45.81 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	46.48 Å
零角强度 I(0) i0	483377000.00
分子量 molecular_weight	165900.0 kDa
排除体积 excluded_volume	201370 Å³
包络体积 envelope_volume	311620 Å³
水化壳体积 shell_volume	58125 Å³
包络直径 envelope_diameter	149.4 Å
壳层 Rg shell_rg	48.61 Å
包络 Rg envelope_rg	44.99 Å
形状 Rg shape_rg	46.51 Å
总 Rg total_rg	46.49 Å
总原子数 total_atoms	11571
残基数 n_residues	1321
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	153.3 Å
Rg (实空间) rg_real	46.04 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.78 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.8340e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	9.6850e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	45.81 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	483200000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8131
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	45.1 Å
偏度 Skewness skewness	0.381
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.607
角度范围 angular_range	— – 0.1700 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	39610000.0000
实空间数据点数 n_real_points	35
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.868; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.961; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Fanconi-associated nuclease 1
分子量 formula_weight	71983.9 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.21.-, 3.1.4.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	11571

TGHPYYLRSFLVVLKTVLENEDDMLLFDEQEKGIVTKFYQLSATGQKLYVRLFQRKLSWIKMTKLEYEEIALDLTPVIEELTNAGFLQTESELQELSEVLELLSAPELKSLAKTFHLVNPNGQKQQLVDAFLKLAKQRSVIGAVILKRAKALAGQSVRICKGPRAVFSRILLLFSLTDSMEDEDAACGGQGQLSTVLLVNLGRMEFPSYTINRKTHIFQDRDDLIRYAAATHMLSDISSAMANGNWEEAKELAQCAKRDWNRLKNHPSLRCHEDLPLFLRCFTVGWIYTRILSRFVEILQRLHMYEEAVRELESLLSQRIYCPDSRGRWWDRLALNLHQHLKRLEPTIKCITEGLADPEVRTGHRLSLYQRAVRLRESPSCKKFKHLFQQLPEMAVQDVKHVTITGRLCPQRGMCKSVFVMEAGEAADPTTVLCSVEELALAHYRRSGFDQGIHGEGSTFSTLYGLLLWDIIFMDGIPDVFRNACQAFPLDLCTDSFFTSRRPALEARLQLIHDAPEESLRAWVAATWHEQEGRVASLVSWDRFTSLQQAQDLVSCLGGPVLSGVCRHLAADFRHCRGGLPDLVVWNSQSRHFKLVEVKGPNDRLSHKQMIWLAELQKLGAEVEVCHVVAV

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	;DNA (5'-D(TPTPAPGPCPCPAPCPGPCPCPTPAPGPAPCPTPCPCPTP*C)-3') ;
分子量 formula_weight	6319.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	X,U

TTAGCCACGCCTAGACTCCTC

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	;DNA (5'-D(GPCPTPGPAPGPGPAPGPTPCPT)-3') ;
分子量 formula_weight	3718.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	Y,V

GCTGAGGAGTCT

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	;DNA (5'-D(TPTPTPTPTPTPGPAPGPGPCPGPTPG)-3') ;
分子量 formula_weight	4332.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	W,T

TTTTTTGAGGCGTG

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	97.697 Å
晶胞边长 b length_b	110.989 Å
晶胞边长 c length_c	105.427 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	103.75 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.800 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	0.2239
R_work r_work	0.2225
R_free r_free	0.2571

fit	/app/data/saxs_computation/ri/4ric/4ric.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ri/4ric/4ric.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ri/4ric/4ric.dat

FAN1 Nuclease bound to 5' hydroxyl (dT-dT) single flap DNA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fanconi-associated nuclease 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)