SAXSdb — 4zpr

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物蛋白 × 2 DNA 2 PDB 声明：tetrameric（4）与全部聚合物数一致	链 A； UniProt 82–464	片段：UNP residues 82-464	Hypoxia-inducible factor 1-alpha × 1 （Q61221） ;DNA (5'-D(GPGPCPTPGPCPGPTPAPCPGPTPGPCPGPGPGPTPCPGPT)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(CPAPCPGPAPCPCPCPGPCPAPCPGPTPAPCPGPCPAPGPC)-3') ; × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；289 K；100 mM MES, pH 6.0, 100 mM calcium acetate, 15% PEG400	分辨率 3.90 Å R-free 0.341

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4ZPR	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4ZP4 Crystal Structure of the Heterodimeric HIF-2a:ARNT Complex 提交 2015-05-07	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 82–464（383 aa）片段：UNP residues 82-464	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；289 K；2% Tacsimate, pH 7.0, 6% PEG3350	分辨率 2.35 Å R-free 0.232
4ZP4 Crystal Structure of the Heterodimeric HIF-2a:ARNT Complex 提交 2015-05-07	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 82–464（383 aa）片段：UNP residues 82-464	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；289 K；2% Tacsimate, pH 7.0, 6% PEG3350	分辨率 2.35 Å R-free 0.232
4ZPH Crystal Structure of the Heterodimeric HIF-2a:ARNT Complex with Proflavine 提交 2015-05-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 82–464（383 aa）片段：UNP residues 82-464	未记录	PRL PROFLAVIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；289 K；2% Tacsimate, pH 7.0, 6% PEG3350	分辨率 2.80 Å R-free 0.221
4ZPH Crystal Structure of the Heterodimeric HIF-2a:ARNT Complex with Proflavine 提交 2015-05-07	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 82–464（383 aa）片段：UNP residues 82-464	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；289 K；2% Tacsimate, pH 7.0, 6% PEG3350	分辨率 2.80 Å R-free 0.221
4ZPK Crystal Structure of the Heterodimeric HIF-2a:ARNT Complex with HRE DNA 提交 2015-05-08	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 82–464（383 aa）片段：UNP residues 82-464	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；289 K；4% Tacsimate, pH 6.0, 10% PEG3350	分辨率 3.60 Å R-free 0.321
4ZQD Crystal Structure of the Heterodimeric HIF-2a:ARNT Complex with the Benzoxadiazole Antagonist 0X3 提交 2015-05-09	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 82–464（383 aa）片段：UNP residues 82-464	未记录	0X3 N-(3-chloro-5-fluorophenyl)-4-nitro-2,1,3-benzoxadiazol-5-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；289 K；2% Tacsimate, pH 7.0, 6% PEG3350	分辨率 2.87 Å R-free 0.254
4ZQD Crystal Structure of the Heterodimeric HIF-2a:ARNT Complex with the Benzoxadiazole Antagonist 0X3 提交 2015-05-09	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 82–464（383 aa）片段：UNP residues 82-464	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；289 K；2% Tacsimate, pH 7.0, 6% PEG3350	分辨率 2.87 Å R-free 0.254
5NJ8 Structural basis for aryl hydrocarbon receptor mediated gene activation 提交 2017-03-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 85–345（261 aa）	突变：C256S	ER3 ERBIUM (III) ION × 7 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；277 K；10 mM HEPES/NaOH pH 6.8, 18% PEG3350, 200 mM ammonium formate	分辨率 3.30 Å R-free 0.333
5NJ8 Structural basis for aryl hydrocarbon receptor mediated gene activation 提交 2017-03-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 D 85–345（261 aa）	突变：C256S	ER3 ERBIUM (III) ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；277 K；10 mM HEPES/NaOH pH 6.8, 18% PEG3350, 200 mM ammonium formate	分辨率 3.30 Å R-free 0.333
5SY5 Crystal Structure of the Heterodimeric NPAS1-ARNT Complex 提交 2016-08-10	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 82–464（383 aa）片段：unp residues 82-464	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；289 K；2% Tacsimate pH 7.0, 3% PEG3350	分辨率 3.20 Å R-free 0.247
5SY5 Crystal Structure of the Heterodimeric NPAS1-ARNT Complex 提交 2016-08-10	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 82–464（383 aa）片段：unp residues 82-464	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；289 K；2% Tacsimate pH 7.0, 3% PEG3350	分辨率 3.20 Å R-free 0.247
5SY5 Crystal Structure of the Heterodimeric NPAS1-ARNT Complex 提交 2016-08-10	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 82–464（383 aa）片段：unp residues 82-464	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；289 K；2% Tacsimate pH 7.0, 3% PEG3350	分辨率 3.20 Å R-free 0.247
5SY5 Crystal Structure of the Heterodimeric NPAS1-ARNT Complex 提交 2016-08-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 82–464（383 aa）片段：unp residues 82-464 链 C 82–464（383 aa）片段：unp residues 82-464 链 E 82–464（383 aa）片段：unp residues 82-464	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；289 K；2% Tacsimate pH 7.0, 3% PEG3350	分辨率 3.20 Å R-free 0.247
5SY7 Crystal Structure of the Heterodimeric NPAS3-ARNT Complex with HRE DNA 提交 2016-08-10	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 82–464（383 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；289 K；100 mM NH4F, 9% PEG 3350	分辨率 4.20 Å R-free 0.361
6E3S Crystal Structure of the Heterodimeric HIF-2 Complex with Antagonist PT2385 提交 2018-07-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 82–464（383 aa）	未记录	79A 3-{[(1S)-2,2-difluoro-1-hydroxy-7-(methylsulfonyl)-2,3-dihydro-1H-inden-4-yl]oxy}-5-fluorobenzonitrile × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；289 K；2% TACSIMATE, PH 7.0, 6% PEG3350	分辨率 3.00 Å R-free 0.249
6E3T Crystal Structure of the Heterodimeric HIF-2 Complex with Antagonist T1001 提交 2018-07-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 82–464（383 aa）	未记录	HO7 (6S)-6-(4-bromophenyl)-2,3,5,6-tetrahydroimidazo[2,1-b][1,3]thiazole × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；289 K；2% TACSIMATE, PH 7.0, 6% PEG3350	分辨率 3.00 Å R-free 0.306
6E3U Crystal Structure of the Heterodimeric HIF-2 Complex with Agonist M1001 提交 2018-07-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 82–464（383 aa）	未记录	HNJ 3-{[2-(pyrrolidin-1-yl)phenyl]amino}-1H-1lambda~6~,2-benzothiazole-1,1-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；2% TACSIMATE, PH 7.0, 6% PEG3350	分辨率 2.85 Å R-free 0.258
7V7L Crystal Structure of the Heterodimeric HIF-3a:ARNT Complex 提交 2021-08-21	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 82–464（383 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；Sodium citrate tribasic dihydrate, 2-Propanol, PEG 4000	分辨率 2.30 Å R-free 0.245
7V7W Crystal Structure of the Heterodimeric HIF-3a:ARNT Complex with oleoylethanolamide (OEA) 提交 2021-08-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 82–464（383 aa）片段：Hydrocarbon receptor nuclear translocator ARNT	未记录	5YM (Z)-N-(2-hydroxyethyl)octadec-9-enamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；Sodium citrate tribasic dihydrate, 2-Propanol, PEG 4000	分辨率 2.51 Å R-free 0.260
7VNI AHR-ARNT PAS-B heterodimer 提交 2021-10-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 358–466（109 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium arsenate (pH 6.5), 0.2 M MgCl2, 2 M (NH4)2SO4	分辨率 2.00 Å R-free 0.219
7VNI AHR-ARNT PAS-B heterodimer 提交 2021-10-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 358–466（109 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium arsenate (pH 6.5), 0.2 M MgCl2, 2 M (NH4)2SO4	分辨率 2.00 Å R-free 0.219
7W80 Crystal Structure of the Heterodimeric HIF-2 in Complex with Antagonist Belzutifan 提交 2021-12-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 82–464（383 aa）	未记录	72Q 3-{[(1S,2S,3R)-2,3-difluoro-1-hydroxy-7-(methylsulfonyl)-2,3-dihydro-1H-inden-4-yl]oxy}-5-fluorobenzonitrile × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；289 K；Tacsimate, PEG3350	分辨率 2.75 Å R-free 0.274
7XHV Crystal Structure of the NPAS4-ARNT heterodimer in complex with DNA 提交 2022-04-10	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 82–360（279 aa）片段：ARNT	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；289 K；ammonium tartrate dibasic, PEG3350	分辨率 4.00 Å R-free 0.331
7XI4 Crystal Structure of the NPAS4-ARNT heterodimer in complex with DNA 提交 2022-04-12	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 82–464（383 aa）片段：ARNT	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；289 K；ammonium tartrate dibasic, PEG3350	分辨率 4.71 Å R-free 0.351
9LJX Crystal Structure of the Heterodimeric HIF-2 Complex with Agonist SD-26 提交 2025-01-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 82–464（383 aa）	未记录	A1EKB 4-fluoranyl-~{N}-(3-fluoranyl-2-pyrrolidin-1-yl-phenyl)-1,1-bis(oxidanylidene)-1,2-benzothiazol-3-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；PEG 3350, Succinic Acid pH 7.0	分辨率 2.80 Å R-free 0.268
9LJY Crystal Structure of the Heterodimeric HIF-2 Complex with Agonist SD-14 提交 2025-01-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 82–464（383 aa）	未记录	A1EJ9 4-chloranyl-1,1-bis(oxidanylidene)-~{N}-(2-pyrrolidin-1-ylphenyl)-1,2-benzothiazol-3-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；PEG 3350, Succinic Acid pH 7.0	分辨率 3.20 Å R-free 0.248
9LOH Crystal Structure of the Heterodimeric HIF-2 Complex with Agonist SD-10 提交 2025-01-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 82–464（383 aa）	未记录	A1EJ8 4-fluoranyl-1,1-bis(oxidanylidene)-~{N}-(2-pyrrolidin-1-ylphenyl)-1,2-benzothiazol-3-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；PEG 3350, Succinic Acid pH 7.0	分辨率 3.02 Å R-free 0.262
9LOI Crystal Structure of the Heterodimeric HIF-2 Complex with Agonist SD-16 提交 2025-01-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 82–464（383 aa）	未记录	A1EKA 6-chloranyl-1,1-bis(oxidanylidene)-~{N}-(2-pyrrolidin-1-ylphenyl)-1,2-benzothiazol-3-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；PEG 3350, Succinic Acid pH 7.0	分辨率 2.78 Å R-free 0.275

共 20 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ARNT_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–384； UniProt 82–464

Hypoxia-inducible factor 1-alpha

Mus musculus

UniProt Q61221

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物蛋白 × 2 DNA 2 PDB 声明：tetrameric（4）与全部聚合物数一致	链 B； UniProt 13–357	片段：UNP residues 13-357	Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator × 1 （P53762） ;DNA (5'-D(GPGPCPTPGPCPGPTPAPCPGPTPGPCPGPGPGPTPCPGPT)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(CPAPCPGPAPCPCPCPGPCPAPCPGPTPAPCPGPCPAPGPC)-3') ; × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；289 K；100 mM MES, pH 6.0, 100 mM calcium acetate, 15% PEG400	分辨率 3.90 Å R-free 0.341

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HIF1A_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–345； UniProt 13–357

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4zpr
沉积日期 deposition_date	2015-05-08
结构标题 title	Crystal Structure of the Heterodimeric HIF-1a:ARNT Complex with HRE DNA
关键词 keywords	ARNT, HIF-1a, HRE, bHLH-PAS, PROTEIN TRANSPORT-TRANSCRIPTION-DNA complex; PROTEIN TRANSPORT/TRANSCRIPTION/DNA
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	34.25 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	33.16 Å
零角强度 I(0) i0	107589000.00
分子量 molecular_weight	72602.0 kDa
排除体积 excluded_volume	86785 Å³
包络体积 envelope_volume	126730 Å³
水化壳体积 shell_volume	34128 Å³
包络直径 envelope_diameter	118.4 Å
壳层 Rg shell_rg	37.30 Å
包络 Rg envelope_rg	33.00 Å
形状 Rg shape_rg	33.12 Å
总 Rg total_rg	33.59 Å
总原子数 total_atoms	5042
残基数 n_residues	556
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	116.1 Å
Rg (实空间) rg_real	34.44 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.26 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.0760e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.8080e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	34.33 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	107600000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8643
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	32.8 Å
偏度 Skewness skewness	0.413
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.541
角度范围 angular_range	— – 0.2300 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	9221000.0000
实空间数据点数 n_real_points	47
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.838; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.862; Smooth: 0.855

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator
分子量 formula_weight	43437.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	5042

MSSADKERLARENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFIVSCETGRVVYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRVLDLKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGTSSVDPVSMNRLSFLRNRCRNGLGSVKEGEPHFVVVHCTGYIKAWPPAGVSLPDDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSSPNCTDMSNICQPTEFISRHNIEGIFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKLKGQVLSVMFRFRSKTREWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNV

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Hypoxia-inducible factor 1-alpha
分子量 formula_weight	39901.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MSSERRKEKSRDAARSRRSKESEVFYELAHQLPLPHNVSSHLDKASVMRLTISYLRVRKLLDAGGLDSEDEMKAQMDCFYLKALDGFVMVLTDDGDMVYISDNVNKYMGLTQFELTGHSVFDFTHPCDHEEMREMLTHRNGPVRKGKELNTQRSFFLRMKCTLTSRGRTMNIKSATWKVLHCTGHIHVYDTNSNQPQCGYKKPPMTCLVLICEPIPHPSNIEIPLDSKTFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELLGRSIYEYYHALDSDHLTKTHHDMFTKGQVTTGQYRMLAKRGGYVWVETQATVIYNTKNSQPQCIVCVNYVVSGIIQHDLIFSLQQT

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	;DNA (5'-D(GPGPCPTPGPCPGPTPAPCPGPTPGPCPGPGPGPTPCPGP*T)-3') ;
分子量 formula_weight	6527.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	C

GGCTGCGTACGTGCGGGTCGT

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	;DNA (5'-D(CPAPCPGPAPCPCPCPGPCPAPCPGPTPAPCPGPCPAPGP*C)-3') ;
分子量 formula_weight	6363.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	D

CACGACCCGCACGTACGCAGC

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	4zprB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	450 — Beta-Lactamase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — PAS domain

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	66.735 Å
晶胞边长 b length_b	66.735 Å
晶胞边长 c length_c	243.644 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 43
空间群编号 int_tables_number	78
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.902 Å
最低分辨率 resolution_low	29.845 Å
R 因子 r_factor	0.2721
R_work r_work	0.2645
R_free r_free	0.3410

fit	/app/data/saxs_computation/zp/4zpr/4zpr.fit
pddf	/app/data/pr_computation/zp/4zpr/4zpr.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/zp/4zpr/4zpr.dat

Crystal Structure of the Heterodimeric HIF-1a:ARNT Complex with HRE DNA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Hypoxia-inducible factor 1-alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)