← 返回搜索
5c67

Human Mesotrypsin in complex with amyloid precursor protein inhibitor variant APPI-M17G/I18F/F34V

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 93.9 Å Quality: GOOD
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Trypsin-3

Homo sapiens

UniProt P35030

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 81–304 突变：S257A Amyloid beta A4 protein × 1 （P05067） X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 7.5, and 20% PEG-1000 分辨率 1.83 Å R-free 0.267
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 81–304 突变：S257A Amyloid beta A4 protein × 1 （P05067） X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 7.5, and 20% PEG-1000 分辨率 1.83 Å R-free 0.267

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5C67 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1H4W Structure of human trypsin IV (brain trypsin) 提交 2001-05-15 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 81–304（224 aa）
未记录 BEN BENZAMIDINE × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.7；298 K；HANGING DROP VAPOUR DIFFUSION 3.3 MG/ML PROTEIN, 2% PEG 4000, 0.05M TRIS PH7.7, 2.5MM CACL2, 2.5 MG/ML BENZAMIDINE/HCL, 25 C, pH 7.70
分辨率 1.70 Å R-free 0.203
2R9P Human mesotrypsin complexed with bovine pancreatic trypsin inhibitor(BPTI) 提交 2007-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 81–304（224 aa）
链 C 81–304（224 aa）
突变：S195A 突变：S195A SO4 SULFATE ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.3；298 K；1.6M ammonium sulfate, pH 5.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 1.40 Å R-free 0.224
2R9P Human mesotrypsin complexed with bovine pancreatic trypsin inhibitor(BPTI) 提交 2007-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 81–304（224 aa）
链 D 81–304（224 aa）
突变：S195A 突变：S195A SO4 SULFATE ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.3；298 K；1.6M ammonium sulfate, pH 5.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 1.40 Å R-free 0.224
3L33 Human mesotrypsin complexed with amyloid precursor protein inhibitor(APPI) 提交 2009-12-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 81–304（224 aa） 片段：Trypsin-3
突变：S195A FMT FORMIC ACID × 9 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；4M sodium formate solution, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.48 Å R-free 0.256
3L33 Human mesotrypsin complexed with amyloid precursor protein inhibitor(APPI) 提交 2009-12-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 81–304（224 aa） 片段：Trypsin-3
突变：S195A FMT FORMIC ACID × 6 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；4M sodium formate solution, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.48 Å R-free 0.256
3L33 Human mesotrypsin complexed with amyloid precursor protein inhibitor(APPI) 提交 2009-12-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 81–304（224 aa） 片段：Trypsin-3
突变：S195A FMT FORMIC ACID × 3 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；4M sodium formate solution, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.48 Å R-free 0.256
3L33 Human mesotrypsin complexed with amyloid precursor protein inhibitor(APPI) 提交 2009-12-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 81–304（224 aa） 片段：Trypsin-3
突变：S195A FMT FORMIC ACID × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；4M sodium formate solution, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.48 Å R-free 0.256
4U30 Human mesotrypsin complexed with bikunin Kunitz domain 2 提交 2014-07-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 81–304（224 aa）
突变：S195A CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M HEPES pH 7.0 and 1 M sodium citrate
分辨率 2.50 Å R-free 0.223
4U30 Human mesotrypsin complexed with bikunin Kunitz domain 2 提交 2014-07-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 81–304（224 aa）
突变：S195A CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M HEPES pH 7.0 and 1 M sodium citrate
分辨率 2.50 Å R-free 0.223
4U30 Human mesotrypsin complexed with bikunin Kunitz domain 2 提交 2014-07-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 81–304（224 aa）
突变：S195A CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M HEPES pH 7.0 and 1 M sodium citrate
分辨率 2.50 Å R-free 0.223
4U30 Human mesotrypsin complexed with bikunin Kunitz domain 2 提交 2014-07-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 81–304（224 aa）
突变：S195A CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M HEPES pH 7.0 and 1 M sodium citrate
分辨率 2.50 Å R-free 0.223
4U32 Human mesotrypsin complexed with HAI-2 Kunitz domain 1 提交 2014-07-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 81–304（224 aa）
突变：S195A NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；0.1 M trisodium citrate pH 5.5, 10% (w/v) PEG 4000, and 0.2 M sodium acetate
分辨率 1.65 Å R-free 0.213
5TP0 Human mesotrypsin in complex with diminazene 提交 2016-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 81–304（224 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4 BRN BERENIL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M HEPES 2 M Ammonium Sulfate 2 % PEG-400
分辨率 1.25 Å R-free 0.137
6BX8 Human Mesotrypsin (PRSS3) Complexed with Tissue Factor Pathway Inhibitor Variant (TFPI1-KD1-K15R-I17C-I34C) 提交 2017-12-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 81–304（224 aa）
突变：S257A SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；0.2M Lithium Sulfate, 0.1M BIS-Tris-HCl pH 4.6, 25% v/v PEG 3350 (Anatrace Top96-27)
分辨率 1.98 Å R-free 0.221
6BX8 Human Mesotrypsin (PRSS3) Complexed with Tissue Factor Pathway Inhibitor Variant (TFPI1-KD1-K15R-I17C-I34C) 提交 2017-12-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 81–304（224 aa）
突变：S257A SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；0.2M Lithium Sulfate, 0.1M BIS-Tris-HCl pH 4.6, 25% v/v PEG 3350 (Anatrace Top96-27)
分辨率 1.98 Å R-free 0.221
6BX8 Human Mesotrypsin (PRSS3) Complexed with Tissue Factor Pathway Inhibitor Variant (TFPI1-KD1-K15R-I17C-I34C) 提交 2017-12-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 81–304（224 aa）
突变：S257A SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；0.2M Lithium Sulfate, 0.1M BIS-Tris-HCl pH 4.6, 25% v/v PEG 3350 (Anatrace Top96-27)
分辨率 1.98 Å R-free 0.221
6BX8 Human Mesotrypsin (PRSS3) Complexed with Tissue Factor Pathway Inhibitor Variant (TFPI1-KD1-K15R-I17C-I34C) 提交 2017-12-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 81–304（224 aa）
突变：S257A SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；0.2M Lithium Sulfate, 0.1M BIS-Tris-HCl pH 4.6, 25% v/v PEG 3350 (Anatrace Top96-27)
分辨率 1.98 Å R-free 0.221
9BOS Human mesotrypsin (PRSS3) unliganded and in an active (E) conformation 提交 2024-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 81–304（224 aa）
突变：S195A CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 2F2 dimethyl ether × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M MES pH 6.5, 15% PEG 20000
分辨率 1.70 Å R-free 0.262
9BOT Human mesotrypsin (PRSS3) unliganded and in autoinhibited (E*) conformation 提交 2024-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 81–304（224 aa）
突变：S195A SO4 SULFATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；1.8M ammonium sulfate, 0.1M Bis-Tris pH 5.5
分辨率 1.60 Å R-free 0.195

共 9 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TRY3_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–224； UniProt 81–304 作者链 B； PDB构建体 1–224； UniProt 81–304

Amyloid beta A4 protein

Homo sapiens

UniProt P05067

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 E； UniProt 294–346 突变：M15G, I16F, F32V Trypsin-3 × 1 （P35030） X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 7.5, and 20% PEG-1000 分辨率 1.83 Å R-free 0.267
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 294–346 突变：M15G, I16F, F32V Trypsin-3 × 1 （P35030） X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 7.5, and 20% PEG-1000 分辨率 1.83 Å R-free 0.267

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5C67 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
11EN Structure of Rapidly twisting Amyloid-beta 40 fibril , RT-Ab40(2_1) 提交 2026-02-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 672–711（40 aa）
链 B 672–711（40 aa）
链 C 672–711（40 aa）
链 D 672–711（40 aa）
链 E 672–711（40 aa）
链 F 672–711（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
11EO Structure of Rapidly twisting Amyloid-beta 40 fibril , RT-Ab40(C2) 提交 2026-02-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 672–711（40 aa）
链 B 672–711（40 aa）
链 C 672–711（40 aa）
链 D 672–711（40 aa）
链 E 672–711（40 aa）
链 F 672–711（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.73 Å
11EP Structure of Rapidly twisting Amyloid-beta 40 fibril , RT-Ab40(C1) 提交 2026-02-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 672–711（40 aa）
链 B 672–711（40 aa）
链 C 672–711（40 aa）
链 D 672–711（40 aa）
链 E 672–711（40 aa）
链 F 672–711（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.75 Å
12GB High Resolution Structure of Monomorphic AB1-40 Fibrils 提交 2026-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：20-meric
链 A 672–711（40 aa）
链 B 672–711（40 aa）
链 C 672–711（40 aa）
链 D 672–711（40 aa）
链 E 672–711（40 aa）
链 F 672–711（40 aa）
链 G 672–711（40 aa）
链 H 672–711（40 aa）
链 I 672–711（40 aa）
链 J 672–711（40 aa）
链 K 672–711（40 aa）
链 L 672–711（40 aa）
链 M 672–711（40 aa）
链 N 672–711（40 aa）
链 O 672–711（40 aa）
链 P 672–711（40 aa）
链 Q 672–711（40 aa）
链 R 672–711（40 aa）
链 S 672–711（40 aa）
链 T 672–711（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLID-STATE NMR
NMR测量条件 pH 7.4；277 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1
NMR样品组成 350 uM [U-13C; U-15N] Amyloid-beta 1-40 fibrils, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
1AAP X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTEASE INHIBITOR DOMAIN OF ALZHEIMER'S AMYLOID BETA-PROTEIN PRECURSOR 提交 1990-09-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 287–344（58 aa） 片段：INHIBITOR DOMAIN
链 B 287–344（58 aa） 片段：INHIBITOR DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.50 Å
1AMB SOLUTION STRUCTURE OF RESIDUES 1-28 OF THE AMYLOID BETA-PEPTIDE 提交 1994-10-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 672–699（28 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1AMC SOLUTION STRUCTURE OF RESIDUES 1-28 OF THE AMYLOID BETA-PEPTIDE 提交 1994-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 672–699（28 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1AML THE ALZHEIMER`S DISEASE AMYLOID A4 PEPTIDE (RESIDUES 1-40) 提交 1995-02-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 672–711（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1BA4 THE SOLUTION STRUCTURE OF AMYLOID BETA-PEPTIDE (1-40) IN A WATER-MICELLE ENVIRONMENT. IS THE MEMBRANE-SPANNING DOMAIN WHERE WE THINK IT IS? NMR, 10 STRUCTURES 提交 1998-04-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 672–711（40 aa） 片段：ABETA
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.1；298 K
分辨率未提供
1BA6 SOLUTION STRUCTURE OF THE METHIONINE-OXIDIZED AMYLOID BETA-PEPTIDE (1-40). DOES OXIDATION AFFECT CONFORMATIONAL SWITCHING? NMR, 10 STRUCTURES 提交 1998-04-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 672–711（40 aa） 片段：ABETA
突变：INS(MO) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.3；298 K
分辨率未提供
1BJB SOLUTION NMR STRUCTURE OF AMYLOID BETA[E16], RESIDUES 1-28, 14 STRUCTURES 提交 1998-06-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 672–699（28 aa） 片段：ABETA [F16], RESIDUES 1-28
突变：K16E 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.6；296 K；压力 1
NMR样品组成 SDS MICELLES (100MM)/D2O, H2O
分辨率未提供
1BJC SOLUTION NMR STRUCTURE OF AMYLOID BETA[F16], RESIDUES 1-28, 15 STRUCTURES 提交 1998-06-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 672–699（28 aa） 片段：ABETA [F16], RESIDUES 1-28
突变：K16F 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.8；296 K；压力 1
NMR样品组成 SDS MICELLES (100MM)/D2O, H2O
分辨率未提供
1BRC RELOCATING A NEGATIVE CHARGE IN THE BINDING POCKET OF TRYPSIN 提交 1992-12-17 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 287–342（56 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1CA0 BOVINE CHYMOTRYPSIN COMPLEXED TO APPI 提交 1997-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 289–342（54 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.5；pH 4.5
分辨率 2.10 Å R-free 0.323
1CA0 BOVINE CHYMOTRYPSIN COMPLEXED TO APPI 提交 1997-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 I 289–342（54 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.5；pH 4.5
分辨率 2.10 Å R-free 0.323
1HZ3 ALZHEIMER'S DISEASE AMYLOID-BETA PEPTIDE (RESIDUES 10-35) 提交 2001-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 681–706（26 aa） 片段：RESIDUES 10-35
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.6；283 K；离子强度（mmCIF原始值）<1mM；压力 ambient
NMR样品组成 300uM A-Beta(10-35); 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 300uM A-Beta(1-40) U-15N; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 300 uM A-Beta(10-35) 2H-Val12, -Leu17, -Val18, -Phe19, -Ile32 and -Leu34; 15N-Phe19, -Val24, -Gly25 and -Gly29; 13C-Val24; 13C-Ala21 Beta Methyl; 13C-Ala30 Beta Methyl; 13C-Met35 Delta Methyl | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 300 uM A-Beta(10-35) 2H-Val12, -Leu17, -Phe19, -Val24, -Ile31 and -Leu34; 15N-Val 18, -Phe20, -Gly25, -Gly29 and -Gly33; 13C-Val24; 13C-Ala21 Beta Methyl; 13C-Ala30 Beta Methyl; 13C-Met35 Delta Methyl | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
1IYT Solution structure of the Alzheimer's disease amyloid beta-peptide (1-42) 提交 2002-09-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 672–713（42 aa） 片段：beta-peptide
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 300 K；压力 ambient
NMR样品组成 2mM amyloid beta-peptide (TFA pretreated); 20% H2O, 80% hexafluoroisopropanol-d2 | 20% H2O, 80% hexafluoroisopropanol-d2 (v/v)
NMR样品组成 2.5mM amyloid beta-peptide (TFA pretreated); 20% D2O, 80% hexafluoroisopropanol-d2 | 20% D2O, 80% hexafluoroisopropanol-d2 (v/v)
分辨率未提供
1MWP N-TERMINAL DOMAIN OF THE AMYLOID PRECURSOR PROTEIN 提交 1999-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 28–123（96 aa） 片段：HEPARIN BINDING DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.242
1OWT Structure of the Alzheimer's disease amyloid precursor protein copper binding domain 提交 2003-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 124–189（66 aa） 片段：Copper binding domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.9；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.3；压力 1
NMR样品组成 0.5mM CuBD U-15N,13C; 20mM phosphate buffer | 90% H2O, 10% D20
分辨率未提供
1QCM AMYLOID BETA PEPTIDE (25-35), NMR, 20 STRUCTURES 提交 1996-07-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 696–706（11 aa） 片段：RESIDUES 25 - 35
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1QWP NMR analysis of 25-35 fragment of beta amyloid peptide 提交 2003-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 696–706（11 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 4.5；300 K；压力 ambient
NMR样品组成 2mM abeta(25-35) peptide | hexafluoroisopropanol/water mixture 80/20 v:v
分辨率未提供
1QXC NMR structure of the fragment 25-35 of beta amyloid peptide in 20/80 v:v hexafluoroisopropanol/water mixture 提交 2003-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 696–706（11 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 4.5；300 K；压力 ambient
NMR样品组成 2mM abeta(25-35) peptide | hexafluoroisopropanol/water 20/80 v:v mixture
分辨率未提供
1QYT Solution structure of fragment (25-35) of beta amyloid peptide in SDS micellar solution 提交 2003-09-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 696–706（11 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 4.15；300 K；压力 ambient
NMR样品组成 2mM abeta(25-35) peptide | 100mM SDS solution
分辨率未提供
1TAW BOVINE TRYPSIN COMPLEXED TO APPI 提交 1996-12-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 287–344（58 aa） 片段：;RESIDUES 289 - 342 OF ALZHEIMER'S AMYLOID BETA-PROTEIN PRECURSOR ;
未记录 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5
分辨率 1.80 Å
1TKN Solution structure of CAPPD*, an independently folded extracellular domain of human Amyloid-beta Precursor Protein 提交 2004-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 460–569（110 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.4；300 K；离子强度（mmCIF原始值）250 mM NaCl, 300 mM guanidinium chloride；压力 1
NMR样品组成 0.85 mM U-15N CAPPD*, 50mM sodium phosphate, 250 mM NaCl, 300 mM guanidinium chloride | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.85 mM U-15N,13C CAPPD*, 50mM sodium phosphate, 250 mM NaCl, 300 mM guanidinium chloride | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.8 mM 10% 13C CAPPD*, 50mM sodium phosphate, 250 mM NaCl, 300 mM guanidinium chloride | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
1X11 X11 PTB DOMAIN 提交 1997-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 754–766（13 aa）
链 D 754–766（13 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.304
1X11 X11 PTB DOMAIN 提交 1997-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 754–766（13 aa）
链 D 754–766（13 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.304
1X11 X11 PTB DOMAIN 提交 1997-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 754–766（13 aa）
链 D 754–766（13 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.304
1Z0Q Aqueous Solution Structure of the Alzheimer's Disease Abeta Peptide (1-42) 提交 2005-03-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 672–713（42 aa） 片段：Beta-peptide
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 300 K；压力 ambient
NMR样品组成 2mM beta peptide (TFA pretreated); 70% H2O, 30% hexafluoroisopropanol-d2 | 70% H2O, 30% hexafluoroisopropanol-d2
分辨率未提供
1ZE7 Zinc-binding domain of Alzheimer's disease amyloid beta-peptide in water solution at pH 6.5 提交 2005-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 672–687（16 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；278 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient
NMR样品组成 2.8mM in 50mM sodium phosphate buffer | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
1ZE9 Zinc-binding domain of Alzheimer's disease amyloid beta-peptide complexed with a zinc (II) cation 提交 2005-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 672–687（16 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；278 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient
NMR样品组成 2.8mM in 50mM sodium phosphate buffer | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
1ZJD Crystal Structure of the Catalytic Domain of Coagulation Factor XI in Complex with Kunitz Protease Inhibitor Domain of Protease Nexin II 提交 2005-04-28 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 289–345（57 aa） 片段：Inhibitory Domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；283 K；Sodium Formate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K
分辨率 2.60 Å R-free 0.255
21FB Structure of minor species of Abeta fibrils from AppNL-FPsen1P117L mice 提交 2025-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 672–713（42 aa）
链 B 672–713（42 aa）
链 C 672–713（42 aa）
链 D 672–713（42 aa）
链 E 672–713（42 aa）
链 F 672–713（42 aa）
链 G 672–713（42 aa）
链 H 672–713（42 aa）
链 I 672–713（42 aa）
链 J 672–713（42 aa）
链 K 672–713（42 aa）
链 L 672–713（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
2BEG 3D Structure of Alzheimer's Abeta(1-42) fibrils 提交 2005-10-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 672–713（42 aa） 片段：Beta-amyloid protein 42
链 B 672–713（42 aa） 片段：Beta-amyloid protein 42
链 C 672–713（42 aa） 片段：Beta-amyloid protein 42
链 D 672–713（42 aa） 片段：Beta-amyloid protein 42
链 E 672–713（42 aa） 片段：Beta-amyloid protein 42
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
2BP4 Zinc-binding domain of Alzheimer's disease amyloid beta-peptide in TFE-water (80-20) solution 提交 2005-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 672–687（16 aa） 片段：;16-MER FRAGMENT BETWEEN THE BETA AND ALPHA SECRETASES CLEAVAGE SITES OF ALZHEIMER'S DISEASE AMYLOID A4 PROTEIN, RESIDUES 672-687 ;
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 3；298 K；压力 1.0
NMR样品组成 80 % TFE-D2OH / 20 % H2O
分辨率未提供
2FJZ Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) copper binding domain (residues 133 to 189) in 'small unit cell' form, metal-free 提交 2006-01-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 133–189（57 aa） 片段：Residues 133 to 189
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；28 - 32 % (w/v) PEG 10000, 0.1 M HEPES pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.61 Å R-free 0.209
2FK1 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'small unit cell' form, Cu(II)-bound 提交 2006-01-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 133–189（57 aa） 片段：Residues 133 to 189
未记录 CU COPPER (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；0.1 M HEPES pH 8.0, 28 - 32 % (w/v) PEG 10000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.60 Å R-free 0.232
2FK2 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'small unit cell' form, Cu(I)-bound 提交 2006-01-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 133–189（57 aa） 片段：Residues 133 to 189
未记录 CU1 COPPER (I) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；0.1 M HEPES pH 8.0, 28 - 32 % (w/v) PEG 10000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.65 Å R-free 0.249
2FK3 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'large unit cell' form 提交 2006-01-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 133–189（57 aa） 片段：Residues 133 to 189
未记录 CU COPPER (II) ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；0.1 M MES pH 5.4 - 5.6, 0.4 M NaCOOH, 10 - 15 % (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.40 Å R-free 0.248
2FK3 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'large unit cell' form 提交 2006-01-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 133–189（57 aa） 片段：Residues 133 to 189
未记录 CU COPPER (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；0.1 M MES pH 5.4 - 5.6, 0.4 M NaCOOH, 10 - 15 % (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.40 Å R-free 0.248
2FK3 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'large unit cell' form 提交 2006-01-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 133–189（57 aa） 片段：Residues 133 to 189
未记录 CU COPPER (II) ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；0.1 M MES pH 5.4 - 5.6, 0.4 M NaCOOH, 10 - 15 % (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.40 Å R-free 0.248
2FK3 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'large unit cell' form 提交 2006-01-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 133–189（57 aa） 片段：Residues 133 to 189
未记录 CU COPPER (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；0.1 M MES pH 5.4 - 5.6, 0.4 M NaCOOH, 10 - 15 % (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.40 Å R-free 0.248
2FK3 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'large unit cell' form 提交 2006-01-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 133–189（57 aa） 片段：Residues 133 to 189
未记录 CU COPPER (II) ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；0.1 M MES pH 5.4 - 5.6, 0.4 M NaCOOH, 10 - 15 % (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.40 Å R-free 0.248
2FK3 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'large unit cell' form 提交 2006-01-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 133–189（57 aa） 片段：Residues 133 to 189
未记录 CU COPPER (II) ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；0.1 M MES pH 5.4 - 5.6, 0.4 M NaCOOH, 10 - 15 % (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.40 Å R-free 0.248
2FK3 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'large unit cell' form 提交 2006-01-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 G 133–189（57 aa） 片段：Residues 133 to 189
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；0.1 M MES pH 5.4 - 5.6, 0.4 M NaCOOH, 10 - 15 % (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.40 Å R-free 0.248
2FK3 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'large unit cell' form 提交 2006-01-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 H 133–189（57 aa） 片段：Residues 133 to 189
未记录 CU COPPER (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；0.1 M MES pH 5.4 - 5.6, 0.4 M NaCOOH, 10 - 15 % (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.40 Å R-free 0.248
2FKL Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain (Residues 126- 189 of APP) 提交 2006-01-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 124–189（66 aa） 片段：Residues 124 to 189
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.05；295 K；1.5 M (NH4)H2PO4, pH 4.05, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.50 Å R-free 0.263
2FKL Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain (Residues 126- 189 of APP) 提交 2006-01-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 124–189（66 aa） 片段：Residues 124 to 189
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.05；295 K；1.5 M (NH4)H2PO4, pH 4.05, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.50 Å R-free 0.263
2FMA Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'small unit cell' form, atomic resolution 提交 2006-01-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 133–189（57 aa） 片段：Copper Binding Domain(residues 133-189)
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；0.1M HEPES pH 8.0, 28-32% (w/v) PEG 10000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 0.85 Å R-free 0.150
2LFM A partially folded structure of amyloid-beta(1 40) in an aqueous environment 提交 2011-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 672–711（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.3；15 K；离子强度（mmCIF原始值）0.07；压力 ambient
NMR样品组成 20 mM potassium phosphate, 50 mM sodium chloride, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
分辨率未提供
2LLM Structure of amyloid precursor protein's transmembrane domain 提交 2011-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 686–726（41 aa） 片段：UNP residues 686-726
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 4.6；318 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 ambient
NMR样品组成 0.3-1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] APPjmtm, 21-70 mM [U-100% 2H] DPC, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.3-1 mM [U-100% 15N] APPjmtm, 21-70 mM DPC, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
2LMN Structural Model for a 40-Residue Beta-Amyloid Fibril with Two-Fold Symmetry, Positive Stagger 提交 2011-12-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 672–711（40 aa）
链 B 672–711（40 aa）
链 C 672–711（40 aa）
链 D 672–711（40 aa）
链 E 672–711（40 aa）
链 F 672–711（40 aa）
链 G 672–711（40 aa）
链 H 672–711（40 aa）
链 I 672–711（40 aa）
链 J 672–711（40 aa）
链 K 672–711（40 aa）
链 L 672–711（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLID-STATE NMR
NMR测量条件 pH 7.4；300 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 ambient
NMR样品组成 selective 13C and 15N beta-amyloid, 10 mM phosphate buffer | 10 mM phosphate buffer
分辨率未提供
2LMO Structural Model for a 40-Residue Beta-Amyloid Fibril with Two-Fold Symmetry, Negative Stagger 提交 2011-12-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 672–711（40 aa）
链 B 672–711（40 aa）
链 C 672–711（40 aa）
链 D 672–711（40 aa）
链 E 672–711（40 aa）
链 F 672–711（40 aa）
链 G 672–711（40 aa）
链 H 672–711（40 aa）
链 I 672–711（40 aa）
链 J 672–711（40 aa）
链 K 672–711（40 aa）
链 L 672–711（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLID-STATE NMR
NMR测量条件 pH 7.4；300 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 ambient
NMR样品组成 selective 13C and 15N beta-amyloid, 10 mM phosphate buffer | 10 mM phosphate buffer
分辨率未提供
2LMP Structural Model for a 40-residue Beta-Amyloid Fibril with Three-Fold Symmetry, Positive Stagger 提交 2011-12-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 A 672–711（40 aa）
链 B 672–711（40 aa）
链 C 672–711（40 aa）
链 D 672–711（40 aa）
链 E 672–711（40 aa）
链 F 672–711（40 aa）
链 G 672–711（40 aa）
链 H 672–711（40 aa）
链 I 672–711（40 aa）
链 J 672–711（40 aa）
链 K 672–711（40 aa）
链 L 672–711（40 aa）
链 M 672–711（40 aa）
链 N 672–711（40 aa）
链 O 672–711（40 aa）
链 P 672–711（40 aa）
链 Q 672–711（40 aa）
链 R 672–711（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLID-STATE NMR
NMR测量条件 pH 7.4；300 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 ambient
NMR样品组成 selective 13C and 15N beta-amyloid, 10 mM phosphate buffer | 10 mM phosphate buffer
分辨率未提供
2LMQ Structural Model for a 40-residue Beta-Amyloid Fibril with Three-Fold Symmetry, Negative Stagger 提交 2011-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 A 672–711（40 aa）
链 B 672–711（40 aa）
链 C 672–711（40 aa）
链 D 672–711（40 aa）
链 E 672–711（40 aa）
链 F 672–711（40 aa）
链 G 672–711（40 aa）
链 H 672–711（40 aa）
链 I 672–711（40 aa）
链 J 672–711（40 aa）
链 K 672–711（40 aa）
链 L 672–711（40 aa）
链 M 672–711（40 aa）
链 N 672–711（40 aa）
链 O 672–711（40 aa）
链 P 672–711（40 aa）
链 Q 672–711（40 aa）
链 R 672–711（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLID-STATE NMR
NMR测量条件 pH 7.4；300 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 ambient
NMR样品组成 selective 13C and 15N beta-amyloid, 10 mM phosphate buffer | 10 mM phosphate buffer
分辨率未提供
2LNQ 40-residue D23N beta amyloid fibril 提交 2012-01-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 672–711（40 aa）
链 B 672–711（40 aa）
链 C 672–711（40 aa）
链 D 672–711（40 aa）
链 E 672–711（40 aa）
链 F 672–711（40 aa）
链 G 672–711（40 aa）
链 H 672–711（40 aa）
突变：D23N 突变：D23N 突变：D23N 突变：D23N 突变：D23N 突变：D23N 突变：D23N 突变：D23N 未记录非水小分子 SOLID-STATE NMR
NMR测量条件 pH 7.4；279 K；压力 ambient
NMR样品组成 25 uM [U-13C] protein, H2O | H2O
分辨率未提供
2LOH Dimeric structure of transmembrane domain of amyloid precursor protein in micellar environment 提交 2012-01-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 686–726（41 aa） 片段：UNP residues 686-726
链 B 686–726（41 aa） 片段：UNP residues 686-726
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.2；318 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 ambient
NMR样品组成 0.9 mM [U-100% 15N] APPjmtm, 36 mM DPC, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.75 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] APPjmtm, 0.75 mM APPjmtm, 60 mM [U-98% 2H] DPC, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2LP1 The solution NMR structure of the transmembrane C-terminal domain of the amyloid precursor protein (C99) 提交 2012-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 671–770（100 aa） 片段：UNP residues 683-728
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；318 K；压力 ambient
NMR样品组成 10 % lyso myristoyl phosphatidylglycerol, 10 % [U-2H] D2O, 100 mM imidazole, 250 uM [U-100% 15N] APP_C99, 1 mM EDTA, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2LZ3 Solution NMR structure of transmembrane domain of amyloid precursor protein WT 提交 2012-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 699–726（28 aa）
链 B 699–726（28 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.2；313 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] peptide, sodium phosphate, 10% D2O | 10% D2O
NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] peptide, sodium phosphate, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 0.5 mM [U-99% 15N] peptide, sodium phosphate, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2LZ4 Solution NMR structure of transmembrane domain of amyloid precursor protein V44M 提交 2012-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 699–726（28 aa）
链 B 699–726（28 aa）
突变：V21M 突变：V21M 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.2；313 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] peptide, sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] peptide, sodium phosphate, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 0.5 mM [U-99% 15N] peptide, sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2M4J 40-residue beta-amyloid fibril derived from Alzheimer's disease brain 提交 2013-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 672–711（40 aa） 片段：UNP residues 672-711
链 B 672–711（40 aa） 片段：UNP residues 672-711
链 C 672–711（40 aa） 片段：UNP residues 672-711
链 D 672–711（40 aa） 片段：UNP residues 672-711
链 E 672–711（40 aa） 片段：UNP residues 672-711
链 F 672–711（40 aa） 片段：UNP residues 672-711
链 G 672–711（40 aa） 片段：UNP residues 672-711
链 H 672–711（40 aa） 片段：UNP residues 672-711
链 I 672–711（40 aa） 片段：UNP residues 672-711
未记录 未记录非水小分子 SOLID-STATE NMR
NMR测量条件 pH 7.4；288 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 ambient
NMR样品组成 1-2 mg selectively and uniformly labeled samples beta-amyloid peptide | none
分辨率未提供
2M9R 3D NMR structure of a complex between the amyloid beta peptide (1-40) and the polyphenol epsilon-viniferin glucoside 提交 2013-06-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 672–711（40 aa） 片段：UNP residues 672-711
未记录 23Y (2S,3S)-3-(3,5-dihydroxyphenyl)-2-(4-hydroxyphenyl)-4-[(E)-2-(4-hydroxyphenyl)ethenyl]-2,3-dihydro-1-benzofuran-6-yl beta-D-glucopyranoside × 2 SOLUTION NMR
NMR测量条件 300 K；压力 ambient
NMR样品组成 1 mM amyloid peptide, 100% DMSO-d6 | 100% DMSO-d6
分辨率未提供
2M9S 3D NMR structure of a complex between the amyloid beta peptide (1-40) and the polyphenol epsilon-viniferin glucoside 提交 2013-06-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 672–711（40 aa） 片段：UNP residues 672-711
未记录 23Y (2S,3S)-3-(3,5-dihydroxyphenyl)-2-(4-hydroxyphenyl)-4-[(E)-2-(4-hydroxyphenyl)ethenyl]-2,3-dihydro-1-benzofuran-6-yl beta-D-glucopyranoside × 2 SOLUTION NMR
NMR测量条件 300 K；压力 ambient
NMR样品组成 1 mM amyloid peptide, 100% DMSO-d6 | 100% DMSO-d6
分辨率未提供
2MGT Zinc induced dimer of the metal binding domain 1-16 of human amyloid beta-peptide with Alzheimer's disease pathogenic English mutation H6R 提交 2013-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 672–687（16 aa） 片段：metal binding domain, UNP residues 672-687
链 B 672–687（16 aa） 片段：metal binding domain, UNP residues 672-687
突变：H6R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：H6R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；274 K；压力 ambient
NMR测量条件 278 K；压力 ambient
NMR样品组成 2 mM protein_1-1, 20 mM [U-99% 2H] bis-Tris-2, 40 uM d4 (100%) TSP-3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 2 mM protein_1-4, 20 mM [U-99% 2H] bis-Tris-5, 40 uM d4 (100%) TSP-6, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 2 mM protein_1-7, 1 mM zinc cloride-8, 20 mM [U-99% 2H] bis-Tris-9, 40 uM d4 (100%) TSP-10, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 2 mM protein_1-11, 1 mM zinc cloride-12, 20 mM [U-99% 2H] bis-Tris-13, 40 uM d4 (100%) TSP-14, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2MJ1 NMR structure of the soluble A beta 17-34 peptide 提交 2013-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 688–705（18 aa） 片段：UNP RESIDUES 688-705
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；278 K；离子强度（mmCIF原始值）0.12；压力 ambient
NMR样品组成 50 mM sodium phosphate-1, 0.2 uM sodium azide-2, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
2MPZ Atomic model of the Abeta D23N "Iowa" mutant using solid-state NMR, EM and Rosetta modeling 提交 2014-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric
链 A 686–711（26 aa）
链 B 686–711（26 aa）
链 C 686–711（26 aa）
链 D 686–711（26 aa）
链 E 686–711（26 aa）
链 F 686–711（26 aa）
链 G 686–711（26 aa）
链 H 686–711（26 aa）
链 I 686–711（26 aa）
链 J 686–711（26 aa）
链 K 686–711（26 aa）
链 L 686–711（26 aa）
链 M 686–711（26 aa）
链 N 686–711（26 aa）
链 O 686–711（26 aa）
链 P 686–711（26 aa）
链 Q 686–711（26 aa）
链 R 686–711（26 aa）
链 S 686–711（26 aa）
链 T 686–711（26 aa）
链 U 686–711（26 aa）
链 V 686–711（26 aa）
链 W 686–711（26 aa）
链 X 686–711（26 aa）
链 Y 686–711（26 aa）
链 Z 686–711（26 aa）
链 a 686–711（26 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLID-STATE NMR
NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 ambient
NMR样品组成 25 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] Abeta D23N, solid
分辨率未提供
2MVX Atomic-resolution 3D structure of amyloid-beta fibrils: the Osaka mutation 提交 2014-10-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 672–711（40 aa） 片段：UNP residues 672-711
链 B 672–711（40 aa） 片段：UNP residues 672-711
链 C 672–711（40 aa） 片段：UNP residues 672-711
链 D 672–711（40 aa） 片段：UNP residues 672-711
链 E 672–711（40 aa） 片段：UNP residues 672-711
链 F 672–711（40 aa） 片段：UNP residues 672-711
链 G 672–711（40 aa） 片段：UNP residues 672-711
链 H 672–711（40 aa） 片段：UNP residues 672-711
链 I 672–711（40 aa） 片段：UNP residues 672-711
链 J 672–711（40 aa） 片段：UNP residues 672-711
突变：E22Delta 突变：E22Delta 突变：E22Delta 突变：E22Delta 突变：E22Delta 突变：E22Delta 突变：E22Delta 突变：E22Delta 突变：E22Delta 突变：E22Delta 未记录非水小分子 SOLID-STATE NMR
NMR测量条件 pH 7；283 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成 15 mg/mL [U-100% 13C; U-100% 15N] amyloid beta, 100% H2O | 100% H2O
NMR样品组成 15 mg/mL [U-100% 13C] amyloid beta, 100% H2O | 100% H2O
NMR样品组成 15 mg/mL [U-100% 13C]/[U-100% 15N] amyloid beta, 100% H2O | 100% H2O
NMR样品组成 15 mg/mL [U-100% 2-13C-glucose; U-100% 15N] amyloid beta, 100% H2O | 100% H2O
NMR样品组成 15 mg/mL [U-100% 13C; U-100% 15N]/natural abundance amyloid beta, 100% H2O | 100% H2O
分辨率未提供
2MXU 42-Residue Beta Amyloid Fibril 提交 2015-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 B 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 C 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 D 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 E 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 F 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 G 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 H 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 I 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 J 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 K 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 L 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
未记录 未记录非水小分子 SOLID-STATE NMR
NMR测量条件 pH 7.4；283 K；压力 ambient
NMR样品组成 50 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] AB42, 10 mM sodium phosphate, 100% H2O | 100% H2O
分辨率未提供
2NAO Atomic resolution structure of a disease-relevant Abeta(1-42) amyloid fibril 提交 2016-01-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 672–713（42 aa）
链 B 672–713（42 aa）
链 C 672–713（42 aa）
链 D 672–713（42 aa）
链 E 672–713（42 aa）
链 F 672–713（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；277 K；压力 ambient
NMR样品组成 100 mM sodium chloride, 100 mM sodium phosphate, 100 uM zinc chloride, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
2OTK Structure of Alzheimer Ab peptide in complex with an engineered binding protein 提交 2007-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 672–711（40 aa） 片段：residues 672-711
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM sodium phophate；压力 ambient
NMR测量条件 pH 7.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM sodium phosphate；压力 ambient
NMR样品组成 400 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Abeta peptide, 400 uM ZAb3 dimers, 20 mM Na-phosphate buffer, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 400 uM Abeta peptide, 400 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] ZAb3 dimers, 20 mM Na-phosphate buffer, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2R0W PFA2 FAB complexed with Abeta1-8 提交 2007-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 Q 672–679（8 aa） 片段：octapeptide
未记录 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.3；295 K；25% PEG-MME 5000, 0.1 M OAc, pH 5.3, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
分辨率 2.50 Å R-free 0.277
2WK3 Crystal structure of human insulin-degrading enzyme in complex with amyloid-beta (1-42) 提交 2009-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 672–713（42 aa） 片段：BETA-AMYLOID PROTEIN 42, RESIDUES 672-713
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.59 Å R-free 0.232
2WK3 Crystal structure of human insulin-degrading enzyme in complex with amyloid-beta (1-42) 提交 2009-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 672–713（42 aa） 片段：BETA-AMYLOID PROTEIN 42, RESIDUES 672-713
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.59 Å R-free 0.232
2Y29 Structure of segment KLVFFA from the amyloid-beta peptide (Ab, residues 16-21), alternate polymorph III 提交 2010-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 687–692（6 aa） 片段：SEGMENT KLVFFA, RESIDUES 687-692
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；AB16-21 FORM III CRYSTALS WERE OBTAINED AFTER THE SEGMENT WAS DISSOLVED IN WATER AT 5 MG/ML AND MIXED WITH 0.2M AMMONIUM ACETATE, 0.1 M TRIS BUFFER PH 8.5 AND 30% ISOPROPANOL.
分辨率 2.30 Å R-free 0.260
2Y2A Structure of segment KLVFFA from the amyloid-beta peptide (Ab, residues 16-21), alternate polymorph I 提交 2010-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 687–692（6 aa） 片段：SEGMENT KLVFFA, RESIDUES 687-692
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5；AB16-21 FORM I CRYSTALS WERE OBTAINED AFTER THE SEGMENT WAS DISSOLVED IN WATER AT 5 MG/ML AND MIXED WITH 0.2 M AMMONIUM ACETATE, 0.1 M BIS-TRIS PH 5.5, 45 % V/V MPD
分辨率 1.91 Å R-free 0.248
2Y3J Structure of segment AIIGLM from the amyloid-beta peptide (Ab, residues 30-35) 提交 2010-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 701–706（6 aa） 片段：RESIDUES 701-706
链 B 701–706（6 aa） 片段：RESIDUES 701-706
链 C 701–706（6 aa） 片段：RESIDUES 701-706
链 D 701–706（6 aa） 片段：RESIDUES 701-706
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；AB3035 WAS DISSOLVED IN WATER AT 1MG/ML AND MIXED WITH 2 M SODIUM CHLORIDE, pH 7
分辨率 1.99 Å R-free 0.267
2Y3J Structure of segment AIIGLM from the amyloid-beta peptide (Ab, residues 30-35) 提交 2010-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 701–706（6 aa） 片段：RESIDUES 701-706
链 F 701–706（6 aa） 片段：RESIDUES 701-706
链 G 701–706（6 aa） 片段：RESIDUES 701-706
链 H 701–706（6 aa） 片段：RESIDUES 701-706
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；AB3035 WAS DISSOLVED IN WATER AT 1MG/ML AND MIXED WITH 2 M SODIUM CHLORIDE, pH 7
分辨率 1.99 Å R-free 0.267
2Y3K Structure of segment MVGGVVIA from the amyloid-beta peptide (Ab, residues 35-42), alternate polymorph 1 提交 2010-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 706–713（8 aa） 片段：RESIDUES 706-713
链 B 706–713（8 aa） 片段：RESIDUES 706-713
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.6；AB3542 CRYSTALS (FIRST DISSOLVED IN WATER) WERE FOUND IN 1.5-YEAR-OLD TRAYS SET AT 0.5 MG/ML IN 1.26 M NA PHOSPHATE MONOBASIC MONOHYDRATE, 0.14 M K PHOSPHATE DIBASIC, PH 5.6 (CRYSTAL FORM I)
分辨率 1.90 Å R-free 0.231
2Y3K Structure of segment MVGGVVIA from the amyloid-beta peptide (Ab, residues 35-42), alternate polymorph 1 提交 2010-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 706–713（8 aa） 片段：RESIDUES 706-713
链 D 706–713（8 aa） 片段：RESIDUES 706-713
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.6；AB3542 CRYSTALS (FIRST DISSOLVED IN WATER) WERE FOUND IN 1.5-YEAR-OLD TRAYS SET AT 0.5 MG/ML IN 1.26 M NA PHOSPHATE MONOBASIC MONOHYDRATE, 0.14 M K PHOSPHATE DIBASIC, PH 5.6 (CRYSTAL FORM I)
分辨率 1.90 Å R-free 0.231
2Y3K Structure of segment MVGGVVIA from the amyloid-beta peptide (Ab, residues 35-42), alternate polymorph 1 提交 2010-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 706–713（8 aa） 片段：RESIDUES 706-713
链 F 706–713（8 aa） 片段：RESIDUES 706-713
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.6；AB3542 CRYSTALS (FIRST DISSOLVED IN WATER) WERE FOUND IN 1.5-YEAR-OLD TRAYS SET AT 0.5 MG/ML IN 1.26 M NA PHOSPHATE MONOBASIC MONOHYDRATE, 0.14 M K PHOSPHATE DIBASIC, PH 5.6 (CRYSTAL FORM I)
分辨率 1.90 Å R-free 0.231
2Y3K Structure of segment MVGGVVIA from the amyloid-beta peptide (Ab, residues 35-42), alternate polymorph 1 提交 2010-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 706–713（8 aa） 片段：RESIDUES 706-713
链 H 706–713（8 aa） 片段：RESIDUES 706-713
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.6；AB3542 CRYSTALS (FIRST DISSOLVED IN WATER) WERE FOUND IN 1.5-YEAR-OLD TRAYS SET AT 0.5 MG/ML IN 1.26 M NA PHOSPHATE MONOBASIC MONOHYDRATE, 0.14 M K PHOSPHATE DIBASIC, PH 5.6 (CRYSTAL FORM I)
分辨率 1.90 Å R-free 0.231
2Y3L Structure of segment MVGGVVIA from the amyloid-beta peptide (Ab, residues 35-42), alternate polymorph 2 提交 2010-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 706–713（8 aa） 片段：RESIDUES 706-713
链 B 706–713（8 aa） 片段：RESIDUES 706-713
链 C 706–713（8 aa） 片段：RESIDUES 706-713
链 G 706–713（8 aa） 片段：RESIDUES 706-713
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；AB3542 CRYSTALS (FIRST DISSOLVED IN WATER) WERE FOUND IN 1.5-YEAR-OLD TRAYS SET AT 0.5 MG/ML IN 0.1 M HEPES PH 7.5, 0.5 M MG FORMATE (CRYSTAL FORM II)
分辨率 2.10 Å R-free 0.247
3AYU Crystal structure of MMP-2 active site mutant in complex with APP-drived decapeptide inhibitor 提交 2011-05-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 586–595（10 aa） 片段：UNP residues 586-595
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å R-free 0.205
3DXC Crystal structure of the intracellular domain of human APP in complex with Fe65-PTB2 提交 2008-07-24 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 739–770（32 aa） 片段：APP intracellular domain, UNP residues 739-770
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；293 K；3.2 M NaCl,0.1 M sodium acetate , pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.238
3DXC Crystal structure of the intracellular domain of human APP in complex with Fe65-PTB2 提交 2008-07-24 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 739–770（32 aa） 片段：APP intracellular domain, UNP residues 739-770
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；293 K；3.2 M NaCl,0.1 M sodium acetate , pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.238
3DXD Crystal structure of the intracellular domain of human APP (T668E mutant) in complex with Fe65-PTB2 提交 2008-07-24 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 739–770（32 aa） 片段：APP intracellular domain, UNP residues 739-770
突变：T668E 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；293 K；3.2 M NaCl, 0.1 M sodium acetate , pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.247
3DXD Crystal structure of the intracellular domain of human APP (T668E mutant) in complex with Fe65-PTB2 提交 2008-07-24 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 739–770（32 aa） 片段：APP intracellular domain, UNP residues 739-770
突变：T668E 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；293 K；3.2 M NaCl, 0.1 M sodium acetate , pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.247
3DXE Crystal structure of the intracellular domain of human APP (T668A mutant) in complex with Fe65-PTB2 提交 2008-07-24 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 739–770（32 aa） 片段：APP intracellular domain, UNP residues 739-770
突变：T668A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；293 K；3.2 M NaCl, 0.1 M sodium acetate , pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.241
3DXE Crystal structure of the intracellular domain of human APP (T668A mutant) in complex with Fe65-PTB2 提交 2008-07-24 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 739–770（32 aa） 片段：APP intracellular domain, UNP residues 739-770
突变：T668A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；293 K；3.2 M NaCl, 0.1 M sodium acetate , pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.241
3GCI Crystal Structure of the Complex Formed Between a New Isoform of Phospholipase A2 with C-terminal Amyloid Beta Heptapeptide at 2 A Resolution 提交 2009-02-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 P 707–713（7 aa） 片段：UNP residues 707-713
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；290 K；10mM Sodium phosphate, pH 6.0, 1mM CaCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.04 Å R-free 0.221
3IFL X-ray structure of amyloid beta peptide:antibody (Abeta1-7:12A11) complex 提交 2009-07-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 P 672–678（7 aa） 片段：residues 672-678
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；295 K；Protein: 15 mg/ml, 10 mM Hepes, pH 7.5, 75 mM NaCl. Protein:peptide molar ratio: 1:1.1. Reservoir: 32% PEG400, 0.1M Tris pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.50 Å R-free 0.206
3IFN X-ray structure of amyloid beta peptide:antibody (Abeta1-40:12A11) complex 提交 2009-07-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 P 672–711（40 aa） 片段：residues 672-711
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；Protein: 5.3 mg/ml, 10 mM Hepes, pH 7.5, 75 mM NaCl. Protein:peptide molar ratio: 1:4.5. Reservoir: 0.2M NaCl, 25% Peg 4K, 0.1M Hepes pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 1.50 Å R-free 0.212
3IFO X-ray structure of amyloid beta peptide:antibody (Abeta1-7:10D5) complex 提交 2009-07-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 P 672–678（7 aa） 片段：residues 672-678
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；Protein: 15 mg/ml, 10 mM Hepes pH 7.5, 75 mM NaCl. Protein:peptide molar ratio: 1:2. Reservoir: 30% PEG4K, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.15 Å R-free 0.218
3IFO X-ray structure of amyloid beta peptide:antibody (Abeta1-7:10D5) complex 提交 2009-07-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 Q 672–678（7 aa） 片段：residues 672-678
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；Protein: 15 mg/ml, 10 mM Hepes pH 7.5, 75 mM NaCl. Protein:peptide molar ratio: 1:2. Reservoir: 30% PEG4K, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.15 Å R-free 0.218
3IFP X-ray structure of amyloid beta peptide:antibody (Abeta1-7:12B4) complex 提交 2009-07-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 P 672–678（7 aa） 片段：residues 672-678
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；Protein: 4.1 mg/ml, 10 mM Hepes pH 7.5, 75 mM NaCl. Protein:peptide molar ratio: 1:1.8. Reservoir: 30%PEG8K, 0.1M Hepes pH 7.0, 0.2M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.95 Å R-free 0.269
3IFP X-ray structure of amyloid beta peptide:antibody (Abeta1-7:12B4) complex 提交 2009-07-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 Q 672–678（7 aa） 片段：residues 672-678
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；Protein: 4.1 mg/ml, 10 mM Hepes pH 7.5, 75 mM NaCl. Protein:peptide molar ratio: 1:1.8. Reservoir: 30%PEG8K, 0.1M Hepes pH 7.0, 0.2M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.95 Å R-free 0.269
3IFP X-ray structure of amyloid beta peptide:antibody (Abeta1-7:12B4) complex 提交 2009-07-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 672–678（7 aa） 片段：residues 672-678
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；Protein: 4.1 mg/ml, 10 mM Hepes pH 7.5, 75 mM NaCl. Protein:peptide molar ratio: 1:1.8. Reservoir: 30%PEG8K, 0.1M Hepes pH 7.0, 0.2M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.95 Å R-free 0.269
3IFP X-ray structure of amyloid beta peptide:antibody (Abeta1-7:12B4) complex 提交 2009-07-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 S 672–678（7 aa） 片段：residues 672-678
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；Protein: 4.1 mg/ml, 10 mM Hepes pH 7.5, 75 mM NaCl. Protein:peptide molar ratio: 1:1.8. Reservoir: 30%PEG8K, 0.1M Hepes pH 7.0, 0.2M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.95 Å R-free 0.269
3JTI Crystal structure of the complex formed between Phospholipase A2 with beta-amyloid fragment, Lys-Gly-Ala-Ile-Ile-Gly-Leu-Met at 1.8 A resolution 提交 2009-09-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 699–706（8 aa） 片段：UNP residues 699-706
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；290 K；10MM SODIUM PHOSPHATE, 1mM CACL2, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 1.80 Å R-free 0.210
3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 18–190（173 aa） 片段：UNP residues 18-190
链 C 18–190（173 aa） 片段：UNP residues 18-190
未记录 BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 2 SO4 SULFATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.250
3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 18–190（173 aa） 片段：UNP residues 18-190
未记录 BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.250
3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 11 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 G 18–190（173 aa） 片段：UNP residues 18-190
未记录 BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.250
3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 12 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 H 18–190（173 aa） 片段：UNP residues 18-190
未记录 BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.250
3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 18–190（173 aa） 片段：UNP residues 18-190
链 D 18–190（173 aa） 片段：UNP residues 18-190
未记录 BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 2 SO4 SULFATE ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.250
3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 18–190（173 aa） 片段：UNP residues 18-190
链 H 18–190（173 aa） 片段：UNP residues 18-190
未记录 BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 2 SO4 SULFATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.250
3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 18–190（173 aa） 片段：UNP residues 18-190
链 G 18–190（173 aa） 片段：UNP residues 18-190
未记录 BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 2 SO4 SULFATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.250
3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 18–190（173 aa） 片段：UNP residues 18-190
未记录 BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.250
3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 18–190（173 aa） 片段：UNP residues 18-190
未记录 BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.250
3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 18–190（173 aa） 片段：UNP residues 18-190
未记录 BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.250
3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 18–190（173 aa） 片段：UNP residues 18-190
未记录 BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.250
3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 18–190（173 aa） 片段：UNP residues 18-190
未记录 BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.250
3L33 Human mesotrypsin complexed with amyloid precursor protein inhibitor(APPI) 提交 2009-12-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 290–341（52 aa） 片段：UNP residues 290-341
未记录 FMT FORMIC ACID × 9 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；4M sodium formate solution, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.48 Å R-free 0.256
3L33 Human mesotrypsin complexed with amyloid precursor protein inhibitor(APPI) 提交 2009-12-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 290–341（52 aa） 片段：UNP residues 290-341
未记录 FMT FORMIC ACID × 6 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；4M sodium formate solution, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.48 Å R-free 0.256
3L33 Human mesotrypsin complexed with amyloid precursor protein inhibitor(APPI) 提交 2009-12-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 290–341（52 aa） 片段：UNP residues 290-341
未记录 FMT FORMIC ACID × 3 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；4M sodium formate solution, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.48 Å R-free 0.256
3L33 Human mesotrypsin complexed with amyloid precursor protein inhibitor(APPI) 提交 2009-12-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 290–341（52 aa） 片段：UNP residues 290-341
未记录 FMT FORMIC ACID × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；4M sodium formate solution, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.48 Å R-free 0.256
3L81 Crystal structure of adaptor protein complex 4 (AP-4) mu4 subunit C-terminal domain, in complex with a sorting peptide from the amyloid precursor protein (APP) 提交 2009-12-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 761–767（7 aa） 片段：C-terminus, residues 761-767
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；10% PEG 3350, 10mM magnesium chloride, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；15% PEG 6000, 3% trimethylamine N-oxide dihydrate, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.60 Å R-free 0.252
3MOQ Amyloid beta(18-41) peptide fusion with new antigen receptor variable domain from sharks 提交 2010-04-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 689–712（24 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；20% PEG 6000, 0.2M AMMONIUM CHLORIDE, 0.1M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.05 Å R-free 0.249
3MOQ Amyloid beta(18-41) peptide fusion with new antigen receptor variable domain from sharks 提交 2010-04-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 689–712（24 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；20% PEG 6000, 0.2M AMMONIUM CHLORIDE, 0.1M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.05 Å R-free 0.249
3MOQ Amyloid beta(18-41) peptide fusion with new antigen receptor variable domain from sharks 提交 2010-04-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 689–712（24 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；20% PEG 6000, 0.2M AMMONIUM CHLORIDE, 0.1M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.05 Å R-free 0.249
3MOQ Amyloid beta(18-41) peptide fusion with new antigen receptor variable domain from sharks 提交 2010-04-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 689–712（24 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；20% PEG 6000, 0.2M AMMONIUM CHLORIDE, 0.1M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.05 Å R-free 0.249
3MOQ Amyloid beta(18-41) peptide fusion with new antigen receptor variable domain from sharks 提交 2010-04-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 689–712（24 aa）
链 B 689–712（24 aa）
链 C 689–712（24 aa）
链 D 689–712（24 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；20% PEG 6000, 0.2M AMMONIUM CHLORIDE, 0.1M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.05 Å R-free 0.249
3NYJ Crystal Structure Analysis of APP E2 domain 提交 2010-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 365–567（203 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） OS OSMIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；298 K；20% PEG 4000, 20% isopropanol, 0.1M Na Citrate, pH 5.6, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 3.20 Å R-free 0.380
3OVJ Structure of an amyloid forming peptide KLVFFA from amyloid beta in complex with orange G 提交 2010-09-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 687–692（6 aa） 片段：KLVFFA (UNP residues 687-692)
链 B 687–692（6 aa） 片段：KLVFFA (UNP residues 687-692)
链 C 687–692（6 aa） 片段：KLVFFA (UNP residues 687-692)
链 D 687–692（6 aa） 片段：KLVFFA (UNP residues 687-692)
未记录 ORA 7-hydroxy-8-[(E)-phenyldiazenyl]naphthalene-1,3-disulfonic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；reservoir contained 30% w/v Polyethylene glycol 1,500, 20% v/v Glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；reservoir contained 10% w/v Polyethylene glycol 1,500, 30% v/v Glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 1.80 Å R-free 0.220
3OW9 Structure of an amyloid forming peptide KLVFFA from amyloid beta, alternate polymorph II 提交 2010-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 687–692（6 aa） 片段：KLVFFA (UNP residues 687-692)
链 B 687–692（6 aa） 片段：KLVFFA (UNP residues 687-692)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；reservoir contained 30% (v/v) Jeffamine M-600, 0.1M Mes pH 6.5 ; 0.05M CsCl, 1mM FDDNP, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 1.80 Å R-free 0.258
3PZZ Structure of an amyloid forming peptide GAIIGL (29-34) from amyloid beta 提交 2010-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 700–705（6 aa） 片段：GAIIGL hexapeptide segment (UNP residues 700-705)
链 B 700–705（6 aa） 片段：GAIIGL hexapeptide segment (UNP residues 700-705)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；reservoir contained 14.4% PEG 8000, 0.08 M Na Cacodylate pH 6.5, 0.16 M Calcium Acetate, 20% v/v Glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 1.29 Å R-free 0.196
3Q2X Structure of an amyloid forming peptide NKGAII (residues 27-32) from amyloid beta 提交 2010-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 698–703（6 aa） 片段：NKGAII hexapeptide segment (UNP residues 698-703)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；reservoir contained 2.4M Sodium Malonate, 15% v/v Glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 1.45 Å R-free 0.259
3SV1 Crystal structure of APP peptide bound rat Mint2 PARM 提交 2011-07-12 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 754–767（14 aa） 片段：C-terminal peptide, residues 754-767
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES, 36% PEG200, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.301
3SV1 Crystal structure of APP peptide bound rat Mint2 PARM 提交 2011-07-12 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 754–767（14 aa） 片段：C-terminal peptide, residues 754-767
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES, 36% PEG200, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.301
3SV1 Crystal structure of APP peptide bound rat Mint2 PARM 提交 2011-07-12 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 754–767（14 aa） 片段：C-terminal peptide, residues 754-767
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES, 36% PEG200, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.301
3U0T Fab-antibody complex 提交 2011-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 701–711（11 aa） 片段：UNP residues 701-711
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å R-free 0.268
3U0T Fab-antibody complex 提交 2011-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 701–711（11 aa） 片段：UNP residues 701-711
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å R-free 0.268
3UMH X-ray structure of the E2 domain of the human amyloid precursor protein (APP) in complex with cadmium 提交 2011-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 370–575（206 aa） 片段：HUMAN AMYLOID PRECURSOR PROTEIN E2 DOMAIN
未记录 ACT ACETATE ION × 2 CD CADMIUM ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；293 K；0.1 mM HEPES, 1 M sodium acetate, 10 mM MgCl2, 50 mM CdSO4, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.240
3UMI X-ray structure of the E2 domain of the human amyloid precursor protein (APP) in complex with zinc 提交 2011-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 370–575（206 aa） 片段：HUMAN AMYLOID PRECURSOR PROTEIN E2 DOMAIN
未记录 ACT ACETATE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 CD CADMIUM ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；293 K；0.1 mM HEPES, 1 M sodium acetate, 10 mM MgCl2, 50 mM CdSO4, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.245
3UMK X-ray structure of the E2 domain of the human amyloid precursor protein (APP) in complex with copper 提交 2011-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 370–575（206 aa） 片段：HUMAN AMYLOID PRECURSOR PROTEIN E2 DOMAIN
未记录 ACT ACETATE ION × 1 CU COPPER (II) ION × 2 CD CADMIUM ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；293 K；0.1 mM HEPES, 1 M sodium acetate, 10 mM MgCl2, 50 mM CdSO4, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.239
4HIX Crystal structure of a humanised 3D6 Fab bound to amyloid beta peptide 提交 2012-10-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 672–699（28 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；sodium formate, PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.20 Å R-free 0.220
4JFN Crystal structure of the N-terminal, growth factor-like domain of the amyloid precursor protein bound to copper 提交 2013-02-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 23–185（163 aa） 片段：growth factor-like domain (GFLD), UNP residues 23-185
未记录 CU COPPER (II) ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；6% (w/v) PEG 3350, 0.1 M Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.75 Å R-free 0.230
4M1C Crystal Structure Analysis of Fab-Bound Human Insulin Degrading Enzyme (IDE) in Complex with Amyloid-Beta (1-40) 提交 2013-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 672–711（40 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291.15 K；0.1M Sodium cacodylate, pH6.5, 0.2M MgCl2, 10% PEG-3000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.15K
分辨率 3.50 Å R-free 0.270
4M1C Crystal Structure Analysis of Fab-Bound Human Insulin Degrading Enzyme (IDE) in Complex with Amyloid-Beta (1-40) 提交 2013-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 672–711（40 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291.15 K；0.1M Sodium cacodylate, pH6.5, 0.2M MgCl2, 10% PEG-3000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.15K
分辨率 3.50 Å R-free 0.270
4MDR Crystal structure of adaptor protein complex 4 (AP-4) mu4 subunit C-terminal domain D190A mutant, in complex with a sorting peptide from the amyloid precursor protein (APP) 提交 2013-08-23 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 758–767（10 aa） 片段：C-terminus, residues 761-767
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；15% PEG 6000, 3% trimethylamine N-oxide dihydrate, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
分辨率 1.85 Å R-free 0.260
4MVI Crystal structure of an engineered lipocalin (Anticalin US7) in complex with the Alzheimer amyloid peptide Abeta(1-40) 提交 2013-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 672–711（40 aa） 片段：UNP residues 672-711
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.25；293 K；30 % (w/v) PEG 4000, 100 mM sodium acetate, pH 5.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.212
4MVK Crystal structure of an engineered lipocalin (Anticalin US7) in complex with the Alzheimer amyloid peptide fragment VFFAED 提交 2013-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 689–694（6 aa） 片段：UNP residues 689-694
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；27 % (w/v) PEG 8000, 100 mM MES, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.50 Å R-free 0.186
4MVL Crystal structure of an engineered lipocalin (Anticalin H1GA) in complex with the Alzheimer amyloid peptide Abeta1-40 提交 2013-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 672–711（40 aa） 片段：UNP residues 672-711
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；24 % (w/v) PEG 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.279
4MVL Crystal structure of an engineered lipocalin (Anticalin H1GA) in complex with the Alzheimer amyloid peptide Abeta1-40 提交 2013-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 672–711（40 aa） 片段：UNP residues 672-711
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；24 % (w/v) PEG 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.279
4MVL Crystal structure of an engineered lipocalin (Anticalin H1GA) in complex with the Alzheimer amyloid peptide Abeta1-40 提交 2013-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 672–711（40 aa） 片段：UNP residues 672-711
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；24 % (w/v) PEG 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.279
4MVL Crystal structure of an engineered lipocalin (Anticalin H1GA) in complex with the Alzheimer amyloid peptide Abeta1-40 提交 2013-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 672–711（40 aa） 片段：UNP residues 672-711
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；24 % (w/v) PEG 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.279
4NGE Crystal Structure of Human Presequence Protease in Complex with Amyloid-beta (1-40) 提交 2013-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 672–711（40 aa） 片段：UNP residues 572-711
未记录 ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291.15 K；15.2% w/v PEG8000, 15 mM TCEP, 80 mM sodium cacodylate, pH 6.5, 160 mM calcium acetate, 20% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.15K
分辨率 2.70 Å R-free 0.232
4NGE Crystal Structure of Human Presequence Protease in Complex with Amyloid-beta (1-40) 提交 2013-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 672–711（40 aa） 片段：UNP residues 572-711
未记录 ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291.15 K；15.2% w/v PEG8000, 15 mM TCEP, 80 mM sodium cacodylate, pH 6.5, 160 mM calcium acetate, 20% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.15K
分辨率 2.70 Å R-free 0.232
4OJF Humanised 3D6 Fab complexed to amyloid beta 1-8 提交 2014-01-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 672–679（8 aa） 片段：UNP residues 672-679
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES, 25%(w/v) PEG 6000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.215
4ONF Fab fragment of 3D6 in complex with amyloid beta 1-7 提交 2014-01-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 P 672–678（7 aa） 片段：unp residues 672-678
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；295 K；30% Peg400, 0.1 M Tris, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.00 Å R-free 0.203
4ONG Fab fragment of 3D6 in complex with amyloid beta 1-40 提交 2014-01-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 P 672–711（40 aa） 片段：unp residues 672-711
未记录 ZN ZINC ION × 27 IMD IMIDAZOLE × 3 CL CHLORIDE ION × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；2.5 M NaCl, 0.1 Imidazole pH 8.0, 0.2 ZnAc2., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.20 Å R-free 0.227
4PQD The longer crystal structure of the grow factor like domain from Beta amypoid precusor protein (APP22-126) 提交 2014-03-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–126（105 aa） 片段：the N-terminal GFLD doamin of APP, UNP residues 22-126
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；288 K；60% v/v TacsimateTM pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
分辨率 1.33 Å R-free 0.186
4PWQ HIGH-RESOLUTION CRYSTAL STRUCTURE OF THE E1-DOMAIN of THE AMYLOID PRECURSOR PROTEIN 提交 2014-03-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 18–190（173 aa） 片段：E1 domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；283 K；0.1M Na-citrate, 20% PEG4000, 11% 2-propanole, 10mM sarcosine, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 283K
分辨率 1.40 Å R-free 0.185
4PWQ HIGH-RESOLUTION CRYSTAL STRUCTURE OF THE E1-DOMAIN of THE AMYLOID PRECURSOR PROTEIN 提交 2014-03-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 18–190（173 aa） 片段：E1 domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；283 K；0.1M Na-citrate, 20% PEG4000, 11% 2-propanole, 10mM sarcosine, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 283K
分辨率 1.40 Å R-free 0.185
4XXD Crystal Structure of mid-region amyloid beta capture by solanezumab 提交 2015-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 683–699（17 aa） 片段：UNP residues 683-699
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；PEG 3350, sodium citrate
分辨率 2.41 Å R-free 0.290
4XXD Crystal Structure of mid-region amyloid beta capture by solanezumab 提交 2015-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 683–699（17 aa） 片段：UNP residues 683-699
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；PEG 3350, sodium citrate
分辨率 2.41 Å R-free 0.290
5AM8 Crystal structure of the Angiotensin-1 converting enzyme N-domain in complex with amyloid-beta 4-10 提交 2015-03-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 R 675–681（7 aa） 片段：FRAGMENT 4-10, UNP RESIDUES 675-681
未记录 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；0.06 M DIVALENT CATIONS, 0.1 M TRIS/BICINE PH 8.5, 30 % PEG550MME/PEG20000
分辨率 1.90 Å R-free 0.224
5AM8 Crystal structure of the Angiotensin-1 converting enzyme N-domain in complex with amyloid-beta 4-10 提交 2015-03-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 P 675–681（7 aa） 片段：FRAGMENT 4-10, UNP RESIDUES 675-681
未记录 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；0.06 M DIVALENT CATIONS, 0.1 M TRIS/BICINE PH 8.5, 30 % PEG550MME/PEG20000
分辨率 1.90 Å R-free 0.224
5AM8 Crystal structure of the Angiotensin-1 converting enzyme N-domain in complex with amyloid-beta 4-10 提交 2015-03-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 S 675–681（7 aa） 片段：FRAGMENT 4-10, UNP RESIDUES 675-681
未记录 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；0.06 M DIVALENT CATIONS, 0.1 M TRIS/BICINE PH 8.5, 30 % PEG550MME/PEG20000
分辨率 1.90 Å R-free 0.224
5AM8 Crystal structure of the Angiotensin-1 converting enzyme N-domain in complex with amyloid-beta 4-10 提交 2015-03-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Q 675–681（7 aa） 片段：FRAGMENT 4-10, UNP RESIDUES 675-681
未记录 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；0.06 M DIVALENT CATIONS, 0.1 M TRIS/BICINE PH 8.5, 30 % PEG550MME/PEG20000
分辨率 1.90 Å R-free 0.224
5AMB Crystal structure of the Angiotensin-1 converting enzyme N-domain in complex with amyloid-beta 35-42 提交 2015-03-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 P 706–713（8 aa） 片段：UNP RESIDUES 706-713
未记录 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；0.06 M DIVALENT CATIONS, 0.1 M TRIS/ BICINE PH 8.5, 30 % PEG550MME/PEG20000
分辨率 1.55 Å R-free 0.181
5AMB Crystal structure of the Angiotensin-1 converting enzyme N-domain in complex with amyloid-beta 35-42 提交 2015-03-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Q 706–713（8 aa） 片段：UNP RESIDUES 706-713
未记录 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；0.06 M DIVALENT CATIONS, 0.1 M TRIS/ BICINE PH 8.5, 30 % PEG550MME/PEG20000
分辨率 1.55 Å R-free 0.181
5BUO A receptor molecule 提交 2015-06-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 351–691（341 aa） 片段：UNP Residues 351-691
链 B 351–691（341 aa） 片段：UNP Residues 351-691
未记录 ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 ACT ACETATE ION × 1 SCN THIOCYANATE ION × 3 SO4 SULFATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350, ammonium acetate, bis-tris, zinc, thiocyanate
分辨率 2.31 Å R-free 0.241
5CSZ CRYSTAL STRUCTURE OF GANTENERUMAB FAB FRAGMENT IN COMPLEX WITH ABETA 1-11 提交 2015-07-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 672–682（11 aa） 片段：UNP residues 672-682
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25 % PEG 3350, 0.1M Bis-Tris 6.5, 0.2 M ammonium sulfate
分辨率 1.80 Å R-free 0.230
5CSZ CRYSTAL STRUCTURE OF GANTENERUMAB FAB FRAGMENT IN COMPLEX WITH ABETA 1-11 提交 2015-07-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 672–682（11 aa） 片段：UNP residues 672-682
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25 % PEG 3350, 0.1M Bis-Tris 6.5, 0.2 M ammonium sulfate
分辨率 1.80 Å R-free 0.230
5HOX X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. Synchrotron data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
链 B 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
链 C 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 29% (v/v) Jeffamine M-600
分辨率 1.90 Å R-free 0.250
5HOX X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. Synchrotron data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
链 B 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
链 C 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 29% (v/v) Jeffamine M-600
分辨率 1.90 Å R-free 0.250
5HOX X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. Synchrotron data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
链 E 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
链 F 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） JEF O-(O-(2-AMINOPROPYL)-O'-(2-METHOXYETHYL)POLYPROPYLENE GLYCOL 500) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 29% (v/v) Jeffamine M-600
分辨率 1.90 Å R-free 0.250
5HOX X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. Synchrotron data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
链 E 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
链 F 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） JEF O-(O-(2-AMINOPROPYL)-O'-(2-METHOXYETHYL)POLYPROPYLENE GLYCOL 500) × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 29% (v/v) Jeffamine M-600
分辨率 1.90 Å R-free 0.250
5HOX X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. Synchrotron data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
链 B 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
链 C 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
链 D 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
链 E 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
链 F 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） JEF O-(O-(2-AMINOPROPYL)-O'-(2-METHOXYETHYL)POLYPROPYLENE GLYCOL 500) × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 29% (v/v) Jeffamine M-600
分辨率 1.90 Å R-free 0.250
5HOY X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. X-ray diffractometer data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
链 B 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
链 C 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
链 D 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
链 E 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
链 F 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） JEF O-(O-(2-AMINOPROPYL)-O'-(2-METHOXYETHYL)POLYPROPYLENE GLYCOL 500) × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 27% (v/v) Jeffamine M-600
分辨率 2.29 Å R-free 0.276
5HOY X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. X-ray diffractometer data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
链 B 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
链 C 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 27% (v/v) Jeffamine M-600
分辨率 2.29 Å R-free 0.276
5HOY X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. X-ray diffractometer data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
链 B 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
链 C 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 27% (v/v) Jeffamine M-600
分辨率 2.29 Å R-free 0.276
5HOY X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. X-ray diffractometer data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
链 E 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
链 F 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） JEF O-(O-(2-AMINOPROPYL)-O'-(2-METHOXYETHYL)POLYPROPYLENE GLYCOL 500) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 27% (v/v) Jeffamine M-600
分辨率 2.29 Å R-free 0.276
5HOY X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. X-ray diffractometer data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
链 E 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
链 F 687–707（21 aa） 片段：UNP residues 687-707
突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） JEF O-(O-(2-AMINOPROPYL)-O'-(2-METHOXYETHYL)POLYPROPYLENE GLYCOL 500) × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 27% (v/v) Jeffamine M-600
分辨率 2.29 Å R-free 0.276
5KK3 Atomic Resolution Structure of Monomorphic AB42 Amyloid Fibrils 提交 2016-06-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 A 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 B 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 C 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 D 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 E 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 F 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 G 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 H 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 I 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 J 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 K 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 L 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 M 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 N 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 O 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 P 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 Q 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 R 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
未记录 未记录非水小分子 SOLID-STATE NMR
NMR测量条件 pH 8；277 K；离子强度（mmCIF原始值）1；压力 1
NMR样品组成 1 mg/uL [U-100% 13C; U-100% 15N] AB42-M01-42, 20 mM sodium phosphate, 0.2 mM EDTA, 0.02 % sodium azide, 100% H2O | 100% H2O
NMR样品组成 1 mg/uL [U-30% 13C; U-30% 15N] AB42-M01-42, 20 mM sodium phosphate, 0.2 mM EDTA, 0.02 % sodium azide, 100% H2O | 100% H2O
NMR样品组成 1 mg/uL [1,6-13C-glucose, U-100% 15N] AB42-M01-42, 20 mM sodium phosphate, 0.2 mM EDTA, 0.02 % sodium azide, 100% H2O | 100% H2O
NMR样品组成 1 mg/uL [2-13C-glycerol, U-100% 15N] AB42-M01-42, 20 mM sodium phosphate, 0.2 mM EDTA, 0.02 % sodium azide, 100% H2O | 100% H2O
分辨率未提供
5MYO Structure of Pyroglutamate-Abeta-specific Fab c#6 in complex with human Abeta-pE3-12-PEGb 提交 2017-01-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 674–683（10 aa） 片段：UNP residues 674-683
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；286 K；25.5% w/v PEG 4000 15% glycerol 170 mM ammonium sulfate
分辨率 1.59 Å R-free 0.215
5NX1 Combinatorial Engineering of Proteolytically Resistant APPI Variants that Selectively Inhibit Human Kallikrein 6 for Cancer Therapy 提交 2017-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 289–301（13 aa） 片段：UNP residues 289-301
链 C 289–346（58 aa） 片段：UNP residues 289-346
链 D 302–346（45 aa） 片段：UNP residues 302-346
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.2M Ammonium Sulfate, 0.1M Bis-Tris pH 5.5, 25% Polyethylene Glycol 3350
分辨率 1.85 Å R-free 0.226
5NX3 Combinatorial Engineering of Proteolytically Resistant APPI Variants that Selectively Inhibit Human Kallikrein 6 for Cancer Therapy 提交 2017-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 289–301（13 aa） 片段：Inhibitor domain, UNP Residues 294-346
链 C 289–346（58 aa） 片段：Inhibitor domain, UNP Residues 289-346
链 D 306–346（41 aa） 片段：Inhibitor domain, UNP Residues 306-346
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M tri-Na Citrate pH 5.6, 20% 2-propanol , 20% Polyethylene Glycol 4000
分辨率 2.30 Å R-free 0.226
5OQV Near-atomic resolution fibril structure of complete amyloid-beta(1-42) by cryo-EM 提交 2017-08-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 672–713（42 aa）
链 B 672–713（42 aa）
链 C 672–713（42 aa）
链 D 672–713（42 aa）
链 E 672–713（42 aa）
链 F 672–713（42 aa）
链 G 672–713（42 aa）
链 H 672–713（42 aa）
链 I 672–713（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 2；in water
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 microL sample was applied to the grid, blotted for 2.5 s before plunging.
分辨率 4.00 Å
5TXD Structure of amyloid-beta derived peptide - NKGAIF 提交 2016-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 Z 698–703（6 aa） 片段：unp residues 698-703
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；reservoir contained 20% PEG 3350, 0.2M Potassium Phosphate dibasic
分辨率 1.45 Å R-free 0.191
5VZY Crystal structure of crenezumab Fab in complex with Abeta 提交 2017-05-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 682–696（15 aa） 片段：UNP residues 682-696
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris hydrochloride pH 8.5, 30% w/v polyethylene glycol 4000
分辨率 2.32 Å R-free 0.249
5W3P ANTIBODY C706 IN COMPLEX WTH BETA-AMYLOID PEPTIDE 1-16 提交 2017-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 P 671–688（18 aa） 片段：RESIDUES 1-16
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；2.0 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M SODIUM ACETATE, PH 4.5
分辨率 1.92 Å R-free 0.236
6GFI Structure of Human Mesotrypsin in complex with APPI variant T11V/M17R/I18F/F34V 提交 2018-04-30 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 294–346（53 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Sodium Chloride, 0.1M Bis-Tris pH 6.8 , 1.42M Ammonium Sulfate
分辨率 2.30 Å R-free 0.301
6GFI Structure of Human Mesotrypsin in complex with APPI variant T11V/M17R/I18F/F34V 提交 2018-04-30 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 294–346（53 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Sodium Chloride, 0.1M Bis-Tris pH 6.8 , 1.42M Ammonium Sulfate
分辨率 2.30 Å R-free 0.301
6IYC Recognition of the Amyloid Precursor Protein by Human gamma-secretase 提交 2018-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 688–770（83 aa） 片段：C83
突变：V8C NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 CLR CHOLESTEROL × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
6NB9 Amyloid-Beta (20-34) with L-isoaspartate 23 提交 2018-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 691–705（15 aa） 片段：residues 20-34
突变：L-isoaspartate 23 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
X-ray结晶条件 BATCH；pH 7.6；310 K；0.05M Tris-HCl, 0.15M NaCl, 1% DMSO
分辨率 1.05 Å R-free 0.246
6O4J Amyloid Beta KLVFFAENVGS 16-26 D23N Iowa mutation 提交 2019-02-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 687–697（11 aa） 片段：UNP residues 687-697
链 B 687–697（11 aa） 片段：UNP residues 687-697
突变：D23N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D23N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
X-ray结晶条件 UNSPECIFIED
分辨率 1.40 Å R-free 0.283
6OC9 S8 phosphorylated beta amyloid 40 fibrils 提交 2019-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 653–692（40 aa） 片段：residues 616-655
链 B 653–692（40 aa） 片段：residues 616-655
链 C 653–692（40 aa） 片段：residues 616-655
链 D 653–692（40 aa） 片段：residues 616-655
链 E 653–692（40 aa） 片段：residues 616-655
链 F 653–692（40 aa） 片段：residues 616-655
链 G 653–692（40 aa） 片段：residues 616-655
链 H 653–692（40 aa） 片段：residues 616-655
链 I 653–692（40 aa） 片段：residues 616-655
链 J 653–692（40 aa） 片段：residues 616-655
未记录 2PO PHOSPHONATE × 10 SOLID-STATE NMR
NMR测量条件 pH 7.4；280 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 1
NMR样品组成 50 uM 13C, 15N-uniformly labeled E3, G9, V18, F20, D23, S26, K28 beta amyloid peptide, 50 uM 13C, 15N-uniformly labeled A2, F4, D7, Y10, V24, G25 beta amyloid peptide, 50 uM 13C, 15N-uniformly labeled Q15, F19, A21, I31, L34, V36, G37 beta amyloid peptide, 50 uM 13C, 15N-uniformly labeled V12, E22, G29, A30, M35 beta amyloid peptide, 50 uM 13C, 15N-uniformly labeled E11, L17, N27, I32, G33, G38, V39 beta amyloid peptide, 50 uM 13C, 15N-uniformly labeled F19, L34 beta amyloid peptide, 50 uM 13C, 15N-uniformly labeled E3, F4, V24, G25, S26 beta amyloid peptide, 50 uM 13C, 15N-uniformly labeled V12, F20, E22 beta amyloid peptide, 50 uM 13C, 15N-uniformly labeled I31, G33, V39 beta amyloid peptide, water | water
NMR样品组成 50 uM 2H labeled L17, 2H-CD3 beta amyloid peptide, 50 uM 2H labeled F19, 2H-ring-D5 beta amyloid peptide, 50 2H labeled uM L34, 2H-CD3 beta amyloid peptide, 50 uM 2H labeled M35, 2H-CD3 beta amyloid peptide, 50 uM 2H labeled V36, 2H-CD3 beta amyloid peptide, water | water
NMR样品组成 50 uM 13C selective labeled A2-CH3, V12-CO beta amyloid peptide, 50 uM 13C selective labeled V18-CO, A21-CH3 beta amyloid peptide, 50 uM 13C selective labeled V24-CO, A30-CH3 beta amyloid peptide, 50 uM 13C selective labeled G33-CO, V39-Ca beta amyloid peptide, 50 uM 13C selective labeled V36-Ca, G38-CO beta amyloid peptide, 50 uM 13C selective labeled G9-CO beta amyloid peptide, water | water
分辨率未提供
6RHY Structure of pore-forming amyloid-beta tetramers 提交 2019-04-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 672–713（42 aa）
链 B 672–713（42 aa）
链 C 672–713（42 aa）
链 D 672–713（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 8.5；310.15 K；压力 1
NMR测量条件 pH 9.5；310.15 K；压力 1
NMR样品组成 1 mM [U-15N] Amyloid-beta A4 protein, 10 mM [U-2H] TRIS-d11, 28.5 mM [U-2H] DPC-d38, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-13C; U-15N; U-2H] Amyloid-beta A4 protein, 10 mM [U-2H] TRIS-d11, 28.5 mM [U-2H] DPC-d38, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-2H,13C,15N]-Ile-[13CH3]d1, Ala-[13CH3], Leu/Val-[13CH3]proR Amyloid-beta A4 protein, 10 mM [U-2H] TRIS-d11, 28.5 mM [U-2H] DPC-d38, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-2H,15N]-Ile-[13CH3]d1, Ala-[13CH3], Leu/Val-[13CH3]proR Amyloid-beta A4 protein, 10 mM [U-2H] TRIS-d11, 28.5 mM [U-2H] DPC-d38, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
6SHS Abeta fibril (Morphology I) 提交 2019-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 616–655（40 aa）
链 B 616–655（40 aa）
链 C 616–655（40 aa）
链 D 616–655（40 aa）
链 E 616–655（40 aa）
链 F 616–655（40 aa）
链 G 616–655（40 aa）
链 H 616–655（40 aa）
链 I 616–655（40 aa）
链 J 616–655（40 aa）
链 K 616–655（40 aa）
链 L 616–655（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
6SZF Solution structure of the amyloid beta-peptide (1-42) 提交 2019-10-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 672–713（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.4；300 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成 0.5 mM Amyloid beta-peptide (1-42), 50% H2O/50% HFIP | 50% H2O/50% HFIP
分辨率未提供
6TI5 A New Structural Model of Abeta(1-40) Fibrils 提交 2019-11-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 A 616–655（40 aa）
链 B 616–655（40 aa）
链 C 616–655（40 aa）
链 D 616–655（40 aa）
链 E 616–655（40 aa）
链 F 616–655（40 aa）
链 G 616–655（40 aa）
链 H 616–655（40 aa）
链 I 616–655（40 aa）
链 J 616–655（40 aa）
链 K 616–655（40 aa）
链 L 616–655（40 aa）
链 M 616–655（40 aa）
链 N 616–655（40 aa）
链 O 616–655（40 aa）
链 P 616–655（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLID-STATE NMR
NMR测量条件 pH 8.5；283 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1
NMR样品组成 100 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Amyloid beta peptide 1-40, 50 mM ammonium acetate, H2O | H2O
分辨率未提供
6TI6 Mixing Abeta(1-40) and Abeta(1-42) peptides generates unique amyloid fibrils 提交 2019-11-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 A 616–655（40 aa）
链 B 598–639（42 aa）
链 C 616–655（40 aa）
链 D 598–639（42 aa）
链 E 616–655（40 aa）
链 F 598–639（42 aa）
链 G 616–655（40 aa）
链 H 598–639（42 aa）
链 I 616–655（40 aa）
链 J 598–639（42 aa）
链 K 616–655（40 aa）
链 L 598–639（42 aa）
链 M 616–655（40 aa）
链 N 598–639（42 aa）
链 O 616–655（40 aa）
链 P 598–639（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLID-STATE NMR
NMR测量条件 pH 8.5；283 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1
NMR样品组成 50 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Amyloid-beta peptide 1-40, 50 uM Amyloid-beta peptide 1-42, 50 mM ammonium acetate, H2O | H2O
NMR样品组成 70 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Amyloid-beta peptide 1-40, 30 uM Amyloid-beta peptide 1-42, 50 mM ammonium acetate, H2O | H2O
NMR样品组成 50 uM Amyloid-beta peptide 1-40, 50 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Amyloid-beta peptide 1-42, 50 mM ammonium acetate, H2O | H2O
NMR样品组成 50 uM [U-100% 13C] Amyloid-beta peptide 1-40, 50 uM [U-100% 15N] Amyloid-beta peptide 1-42, 50 mM ammonium acetate, H2O | H2O
分辨率未提供
6TI7 Mixing Abeta(1-40) and Abeta(1-42) peptides generates unique amyloid fibrils 提交 2019-11-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 A 616–655（40 aa）
链 B 598–639（42 aa）
链 C 616–655（40 aa）
链 D 598–639（42 aa）
链 E 616–655（40 aa）
链 F 598–639（42 aa）
链 G 616–655（40 aa）
链 H 598–639（42 aa）
链 I 598–639（42 aa）
链 J 616–655（40 aa）
链 K 598–639（42 aa）
链 L 616–655（40 aa）
链 M 598–639（42 aa）
链 N 616–655（40 aa）
链 O 598–639（42 aa）
链 P 616–655（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLID-STATE NMR
NMR测量条件 pH 8.5；283 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1
NMR样品组成 50 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Amyloid-beta peptide 1-40, 50 uM Amyloid-beta peptide 1-42, 50 mM ammonium acetate, H2O | H2O
NMR样品组成 70 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Amyloid-beta peptide 1-40, 30 uM Amyloid-beta peptide 1-42, 50 mM ammonium acetate, H2O | H2O
NMR样品组成 50 uM Amyloid-beta peptide 1-40, 50 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Amyloid-beta peptide 1-42, 50 mM ammonium acetate, H2O | H2O
NMR样品组成 50 uM [U-100% 13C] Amyloid-beta peptide 1-40, 50 uM [U-100% 15N] Amyloid-beta peptide 1-42, 50 mM ammonium acetate, H2O | H2O
分辨率未提供
6W0O Amyloid-beta(1-40) fibril derived from Alzheimer's disease cortical tissue 提交 2020-03-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 1 653–692（40 aa） 片段：UNP residues 653-692
链 2 653–692（40 aa） 片段：UNP residues 653-692
链 3 653–692（40 aa） 片段：UNP residues 653-692
链 4 653–692（40 aa） 片段：UNP residues 653-692
链 5 653–692（40 aa） 片段：UNP residues 653-692
链 6 653–692（40 aa） 片段：UNP residues 653-692
未记录 未记录非水小分子 实验方法未声明
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM phosphate buffer with 0.01% NaN3 to avoid microbial contamination. Buffers were filtered to avoid contamination.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The grids were preblotted for 10 seconds and blotted for 6 seconds before plunging.
NMR测量条件 pH 7.4；297 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 1
NMR样品组成 100 uM U-15N,13C amyloid-beta(1-40), phosphate buffer | phosphate buffer
分辨率 2.77 Å
6WXM X-ray crystallographic structure of a beta-hairpin peptide derived from amyloid beta 16-36 提交 2020-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 685–706（22 aa）
链 B 685–706（22 aa）
链 C 685–706（22 aa）
链 D 685–706（22 aa）
链 E 685–706（22 aa）
链 F 685–706（22 aa）
链 G 685–706（22 aa）
链 H 685–706（22 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；296.15 K；0.1 M sodium acetate (pH 5.0), 0.1 M CoCl2, 1.1 M 1,6-hexanediol
分辨率 2.30 Å R-free 0.218
6WXM X-ray crystallographic structure of a beta-hairpin peptide derived from amyloid beta 16-36 提交 2020-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 I 685–706（22 aa）
链 J 685–706（22 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；296.15 K；0.1 M sodium acetate (pH 5.0), 0.1 M CoCl2, 1.1 M 1,6-hexanediol
分辨率 2.30 Å R-free 0.218
6WXM X-ray crystallographic structure of a beta-hairpin peptide derived from amyloid beta 16-36 提交 2020-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 I 685–706（22 aa）
链 J 685–706（22 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；296.15 K；0.1 M sodium acetate (pH 5.0), 0.1 M CoCl2, 1.1 M 1,6-hexanediol
分辨率 2.30 Å R-free 0.218
6WXM X-ray crystallographic structure of a beta-hairpin peptide derived from amyloid beta 16-36 提交 2020-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 K 685–706（22 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；296.15 K；0.1 M sodium acetate (pH 5.0), 0.1 M CoCl2, 1.1 M 1,6-hexanediol
分辨率 2.30 Å R-free 0.218
6XOV CryoEM structure of human presequence protease in partial closed state 1 提交 2020-07-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 653–692（40 aa） 片段：UNP residues 653-692
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7；20 mM Tris, pH 7.7, 150 mM NaCl, 10mM KCl, 20 mM EDTA and 1 mM 2-mercaptoethanol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6YHF Solution NMR Structure of APP TMD 提交 2020-03-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 697–726（30 aa） 片段：Amyloid precursor protein transmembrane domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成 500 uM APP WT, 80% TFE-d2, 20% H2O | 80% TFE-d2, 20% H2O
分辨率未提供
6YHI Solution NMR Structure of APP G38L mutant TMD 提交 2020-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 697–726（30 aa） 片段：Amyloid precursor protein transmembrane domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成 500 uM APP G38L, 80% TFE-d2, 20% H2O | 80% TFE-d2, 20% H2O
分辨率未提供
6YHO Solution NMR Structure of APP G38P mutant TM 提交 2020-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 697–726（30 aa） 片段：Amyloid precursor protein transmembrane domain
突变：G38P 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成 500 uM APP G38P, 80% TFE-d2, 20% H2O | 80% TFE-d2, 20% H2O
分辨率未提供
6YHP Solution NMR Structure of APP V44M mutant TMD 提交 2020-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 697–726（30 aa） 片段：Amyloid precursor protein transmembrane domain
突变：V44M 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成 500 uM APP V44M, 80% TFE-d2, 20% H2O | 80% TFE-d2, 20% H2O
分辨率未提供
6YHX Solution NMR Structure of APP I45T mutant TMD 提交 2020-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 697–726（30 aa） 片段：Amyloid precursor protein transmembrane domain
突变：I45T 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成 500 uM APP I45T, 80% TFE-d2, 20% H2O | 80% TFE-d2, 20% H2O
分辨率未提供
7B3J Dynamic complex between all-D-enantiomeric peptide D3 with wild-type amyloid precursor protein 672-726 fragment (amyloid beta 1-55) 提交 2020-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 579–633（55 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.9；303 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1
NMR样品组成 0.2 mM [U-13C; U-15N] APP672-726, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM [U-13C; U-15N] APP672-726, 0.2 mM D3cys(MTSL), 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM [U-13C; U-15N] APP672-726, 0.2 mM (MTSL)cysD3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
7B3K Dynamic complex between all-D-enantiomeric peptide D3 with L723P mutant of amyloid precursor protein (APP) 672-726 fragment (amyloid beta 1-55) 提交 2020-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 579–633（55 aa）
突变：V52P 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.9；303 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1
NMR样品组成 0.2 mM [U-13C; U-15N] APP_L723P_672-726, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM [U-13C; U-15N] APP_L723P_672-726, 0.2 mM D3cys(MTSL), 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
7JXN Beta hairpin derived from Abeta17-36 with an F20Cha mutation 提交 2020-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 686–706（21 aa）
链 D 686–706（21 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297.15 K；Bis-Tris buffer, ammonium acetate, and methyl-2,4-pentanediol
分辨率 2.00 Å R-free 0.301
7JXN Beta hairpin derived from Abeta17-36 with an F20Cha mutation 提交 2020-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 686–706（21 aa）
链 C 686–706（21 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297.15 K；Bis-Tris buffer, ammonium acetate, and methyl-2,4-pentanediol
分辨率 2.00 Å R-free 0.301
7JXO Triangular trimer of beta-hairpins derived from Abeta17-36 with an F20Cha mutation 提交 2020-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 686–706（21 aa）
链 B 686–706（21 aa）
链 C 686–706（21 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297.15 K；Tris buffer, MgCl2, and 1,6-hexanediol
分辨率 2.81 Å R-free 0.320
7O1Q Amyloid beta oligomer displayed on the alpha hemolysin scaffold 提交 2021-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 672–713（42 aa）
链 B 672–713（42 aa）
链 C 672–713（42 aa）
链 D 672–713（42 aa）
链 E 672–713（42 aa）
链 F 672–713（42 aa）
链 G 672–713（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；50 mM Tris-HCl, pH 8.0, 500 mM NaCl, 250 mM imidazole and 0.38 mM DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7OW1 Crystal Structure of TAP01 in complex with amyloid beta peptide 提交 2021-06-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 674–685（12 aa） 片段：UNP residues 674-683
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） FLC CITRATE ANION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；20% PEG3350 0.2 M ammonium citrate
分辨率 1.40 Å R-free 0.200
7OXN Crystal Structure of TAP01 in complex with cyclised amyloid beta peptide 提交 2021-06-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 672–685（14 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；20% PEG 6K 0.1 M HEPES, pH 7.0 0.01 M zinc chloride
分辨率 2.50 Å R-free 0.265
7Q4B Type I beta-amyloid 42 Filaments from Human Brain 提交 2021-10-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 672–713（42 aa）
链 B 672–713（42 aa）
链 C 672–713（42 aa）
链 D 672–713（42 aa）
链 E 672–713（42 aa）
链 F 672–713（42 aa）
链 G 672–713（42 aa）
链 H 672–713（42 aa）
链 I 672–713（42 aa）
链 R 672–713（42 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
7Q4M Type II beta-amyloid 42 Filaments from Human Brain 提交 2021-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 672–713（42 aa）
链 B 672–713（42 aa）
链 C 672–713（42 aa）
链 D 672–713（42 aa）
链 E 672–713（42 aa）
链 F 672–713（42 aa）
链 G 672–713（42 aa）
链 H 672–713（42 aa）
链 I 672–713（42 aa）
链 J 672–713（42 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7RTZ X-ray crystallographic structure of a beta-hairpin peptide derived from amyloid beta 14-40 提交 2021-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 682–711（30 aa）
链 B 682–711（30 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296.15 K；0.2 M magnesium acetate tetrahydrate, 0.1 M sodium cacodylate trihydrate pH 6.5, and 30% (v/v) 2-methyl-2,4-pentanediol
分辨率 2.10 Å R-free 0.293
7U4P Covalently stabilized triangular trimer composed of Abeta17-36 beta-hairpins 提交 2022-02-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 687–707（21 aa）
链 B 687–707（21 aa）
链 C 687–707（21 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298.15 K；0.1 M Tris at pH 8.3, 0.2 M MgCl2, 2.8 M 1,6-hexanediol
分辨率 1.80 Å R-free 0.247
7Y8Q Amyloid-beta assemblage on GM1-containing membranes 提交 2022-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 672–711（40 aa）
链 B 672–711（40 aa）
链 C 672–711（40 aa）
链 D 672–711（40 aa）
链 E 672–711（40 aa）
链 F 672–711（40 aa）
链 G 672–711（40 aa）
链 H 672–711（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLID-STATE NMR
NMR测量条件 pH 7.4；288 K；离子强度（mmCIF原始值）5；压力 1
NMR样品组成 1 mM [U-13C; U-15N] Amyloid beta(1-40), 8 mM GM1, 2 mM DMPC, none | none
分辨率未提供
8AZS Type I amyloid-beta 42 filaments from high-spin supernatants of aqueous extracts from Alzheimer's disease brains | ABeta42 提交 2022-09-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 H 672–713（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8AZT Type II amyloid-beta 42 filaments from high-spin supernatants of aqueous extracts from Alzheimer's disease brains | ABeta42 提交 2022-09-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 672–713（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8BFA Sarkosyl-extracted AppNL-G-F Abeta42 fibril structure 提交 2022-10-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 672–713（42 aa）
链 B 672–713（42 aa）
链 C 672–713（42 aa）
链 D 672–713（42 aa）
链 E 672–713（42 aa）
链 F 672–713（42 aa）
链 G 672–713（42 aa）
链 H 672–713（42 aa）
链 I 672–713（42 aa）
链 J 672–713（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；6s blot
分辨率 3.00 Å
8BFB Sarkosyl-extracted AppNL-G-F Abeta42 fibril structure (Methoxy-X04-labelled mice) 提交 2022-10-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 672–713（42 aa）
链 B 672–713（42 aa）
链 C 672–713（42 aa）
链 D 672–713（42 aa）
链 E 672–713（42 aa）
链 F 672–713（42 aa）
链 G 672–713（42 aa）
链 H 672–713（42 aa）
链 I 672–713（42 aa）
链 J 672–713（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；6s blot
分辨率 3.20 Å
8BFZ Amyloid-beta 42 filaments extracted from the human brain with Arctic mutation (E22G) of Alzheimer's disease | ABeta42 提交 2022-10-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 672–713（42 aa）
链 B 672–713（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BG0 Amyloid-beta tetrameric filaments with the Arctic mutation (E22G) from Alzheimer's disease brains | ABeta40 提交 2022-10-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 616–655（40 aa）
链 B 616–655（40 aa）
链 C 616–655（40 aa）
链 D 616–655（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 1.99 Å
8C3H Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex a long aspartimide degron peptide 提交 2022-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 763–770（8 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；274 K；0.5 M (NH4)H2PO4
分辨率 1.71 Å R-free 0.210
8C3H Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex a long aspartimide degron peptide 提交 2022-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 763–770（8 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；274 K；0.5 M (NH4)H2PO4
分辨率 1.71 Å R-free 0.210
8EZD Brain-derived 42-residue amyloid-beta fibril type A 提交 2022-10-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 B 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 C 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 D 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 E 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 F 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 G 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 H 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10mM Na-phosphate, 0.1% sodium azide
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Preblot for 12-13 seconds and blot for 2.5-3.0 seconds before plunging
分辨率 2.83 Å
8EZE Brain-derived 42-residue amyloid-beta fibril type B 提交 2022-10-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 B 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 C 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 D 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 E 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 F 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 G 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
链 H 672–713（42 aa） 片段：residues 672-713
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10mM Na-phosphate, 0.1% sodium azide
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Preblot for 12-13 seconds and blot for 2.5-3.0 seconds before plunging
分辨率 2.76 Å
8FF2 Amyloid-beta (1-40) fibrils derived from a CAA patient 提交 2022-12-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 653–692（40 aa） 片段：UNP residues 653-692
链 B 653–692（40 aa） 片段：UNP residues 653-692
链 C 653–692（40 aa） 片段：UNP residues 653-692
链 D 653–692（40 aa） 片段：UNP residues 653-692
链 E 653–692（40 aa） 片段：UNP residues 653-692
链 F 653–692（40 aa） 片段：UNP residues 653-692
链 G 653–692（40 aa） 片段：UNP residues 653-692
链 I 653–692（40 aa） 片段：UNP residues 653-692
链 J 653–692（40 aa） 片段：UNP residues 653-692
链 K 653–692（40 aa） 片段：UNP residues 653-692
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.87 Å
8FF3 Amyloid-beta (1-40) fibrils derived from familial Dutch-type CAA patient (population B) 提交 2022-12-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 653–692（40 aa） 片段：UNP residues 653-692
链 B 653–692（40 aa） 片段：UNP residues 653-692
链 C 653–692（40 aa） 片段：UNP residues 653-692
链 a 653–692（40 aa） 片段：UNP residues 653-692
链 b 653–692（40 aa） 片段：UNP residues 653-692
链 c 653–692（40 aa） 片段：UNP residues 653-692
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.09 Å
8KEW The cryo-EM structure of type1 amyloid beta 42 fibril. 提交 2023-08-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–770（770 aa）
链 B 1–770（770 aa）
链 C 1–770（770 aa）
链 D 1–770（770 aa）
链 F 1–770（770 aa）
链 G 1–770（770 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8KF1 The cryo-EM structure of AV-45 bound type1 amyloid beta 42 fibril. 提交 2023-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 A 1–770（770 aa）
链 B 1–770（770 aa）
链 C 1–770（770 aa）
链 D 1–770（770 aa）
链 E 1–770（770 aa）
链 F 1–770（770 aa）
链 G 1–770（770 aa）
链 H 1–770（770 aa）
链 I 1–770（770 aa）
链 J 1–770（770 aa）
链 K 1–770（770 aa）
链 L 1–770（770 aa）
未记录 VW6 4-[2-[6-[2-[2-(2-fluoranylethoxy)ethoxy]ethoxy]pyridin-3-yl]ethyl]-~{N}-methyl-aniline × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8KF3 The cryo-EM structure of type3 amyloid beta 42 fibril. 提交 2023-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–770（770 aa）
链 B 1–770（770 aa）
链 C 1–770（770 aa）
链 D 1–770（770 aa）
链 E 1–770（770 aa）
链 F 1–770（770 aa）
链 G 1–770（770 aa）
链 H 1–770（770 aa）
链 I 1–770（770 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8KF4 The cryo-EM structure of type1 amyloid beta 42 fibril in AD2 patient. 提交 2023-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–770（770 aa）
链 B 1–770（770 aa）
链 C 1–770（770 aa）
链 D 1–770（770 aa）
链 E 1–770（770 aa）
链 F 1–770（770 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8KF5 The cryo-EM structure of type1 amyloid beta 42 fibril in AD3. 提交 2023-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–770（770 aa）
链 B 1–770（770 aa）
链 C 1–770（770 aa）
链 D 1–770（770 aa）
链 E 1–770（770 aa）
链 F 1–770（770 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8KF6 The cryo-EM structure of AV-45 bound type3 amyloid beta 42 fibril. 提交 2023-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–770（770 aa）
链 B 1–770（770 aa）
链 C 1–770（770 aa）
链 D 1–770（770 aa）
链 E 1–770（770 aa）
链 F 1–770（770 aa）
链 G 1–770（770 aa）
链 H 1–770（770 aa）
链 I 1–770（770 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8OL2 Murine type II Abeta fibril from APP23 mouse 提交 2023-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 672–713（42 aa）
链 B 672–713（42 aa）
链 C 672–713（42 aa）
链 D 672–713（42 aa）
链 E 672–713（42 aa）
链 F 672–713（42 aa）
链 G 672–713（42 aa）
链 H 672–713（42 aa）
链 I 672–713（42 aa）
链 J 672–713（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8OL3 Murine type III Abeta fibril from APP/PS1 mouse 提交 2023-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 672–713（42 aa）
链 B 672–713（42 aa）
链 C 672–713（42 aa）
链 D 672–713（42 aa）
链 E 672–713（42 aa）
链 F 672–713（42 aa）
链 G 672–713（42 aa）
链 H 672–713（42 aa）
链 I 672–713（42 aa）
链 J 672–713（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8OL5 Murine type II Abeta fibril from ARTE10 mouse 提交 2023-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 672–713（42 aa）
链 B 672–713（42 aa）
链 C 672–713（42 aa）
链 D 672–713（42 aa）
链 E 672–713（42 aa）
链 F 672–713（42 aa）
链 G 672–713（42 aa）
链 H 672–713（42 aa）
链 I 672–713（42 aa）
链 J 672–713（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OL6 Murine type II Abeta fibril from tgAPPSwe mouse 提交 2023-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 672–713（42 aa）
链 B 672–713（42 aa）
链 C 672–713（42 aa）
链 D 672–713（42 aa）
链 E 672–713（42 aa）
链 F 672–713（42 aa）
链 G 672–713（42 aa）
链 H 672–713（42 aa）
链 I 672–713（42 aa）
链 J 672–713（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8OL7 MurineArc type I Abeta fibril from tg-APPArcSwe mouse 提交 2023-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 672–713（42 aa）
链 B 672–713（42 aa）
链 C 672–713（42 aa）
链 D 672–713（42 aa）
链 E 672–713（42 aa）
链 F 672–713（42 aa）
链 G 672–713（42 aa）
链 H 672–713（42 aa）
链 I 672–713（42 aa）
链 J 672–713（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8OLG DI2 Abeta fibril from tg-SwDI mouse 提交 2023-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 672–713（42 aa）
链 B 672–713（42 aa）
链 C 672–713（42 aa）
链 D 672–713（42 aa）
链 E 672–713（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8OLN DI1 Abeta fibril from tg-SwDI mouse 提交 2023-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 672–713（42 aa）
链 B 672–713（42 aa）
链 C 672–713（42 aa）
链 D 672–713（42 aa）
链 E 672–713（42 aa）
链 F 672–713（42 aa）
链 G 672–713（42 aa）
链 H 672–713（42 aa）
链 I 672–713（42 aa）
链 J 672–713（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8OLO Murine type III Abeta fibril from ARTE10 mouse 提交 2023-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 672–713（42 aa）
链 B 672–713（42 aa）
链 C 672–713（42 aa）
链 D 672–713（42 aa）
链 E 672–713（42 aa）
链 F 672–713（42 aa）
链 G 672–713（42 aa）
链 H 672–713（42 aa）
链 I 672–713（42 aa）
链 J 672–713（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8OLQ DI3 Abeta fibril from tg-SwDI mouse 提交 2023-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 672–713（42 aa）
链 B 672–713（42 aa）
链 C 672–713（42 aa）
链 D 672–713（42 aa）
链 E 672–713（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8OTF Ab typeII filament from Guam ALS/PDC 提交 2023-04-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–770（770 aa）
链 B 1–770（770 aa）
链 C 1–770（770 aa）
链 D 1–770（770 aa）
链 E 1–770（770 aa）
链 F 1–770（770 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8SEJ Type I beta-amyloid 42 Filaments from Down syndrome 提交 2023-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 680–713（34 aa）
链 B 680–713（34 aa）
链 C 680–713（34 aa）
链 D 680–713（34 aa）
链 E 680–713（34 aa）
链 F 680–713（34 aa）
链 G 680–713（34 aa）
链 H 680–713（34 aa）
链 I 680–713（34 aa）
链 J 680–713（34 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
8SEK Type IIIa beta-amyloid 40 Filaments from Down syndrome 提交 2023-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 672–711（40 aa）
链 B 672–711（40 aa）
链 C 672–711（40 aa）
链 D 672–711（40 aa）
链 E 672–711（40 aa）
链 F 672–711（40 aa）
链 G 672–711（40 aa）
链 H 672–711（40 aa）
链 I 672–711（40 aa）
链 J 672–711（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8SEL Type IIIb beta-amyloid 40 Filaments from Down Syndrome 提交 2023-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 A 672–711（40 aa）
链 B 672–711（40 aa）
链 C 672–711（40 aa）
链 D 672–711（40 aa）
链 E 672–711（40 aa）
链 F 672–711（40 aa）
链 G 672–711（40 aa）
链 H 672–711（40 aa）
链 I 672–711（40 aa）
链 J 672–711（40 aa）
链 K 672–711（40 aa）
链 L 672–711（40 aa）
链 M 672–711（40 aa）
链 N 672–711（40 aa）
链 O 672–711（40 aa）
链 P 672–711（40 aa）
链 Q 672–711（40 aa）
链 R 672–711（40 aa）
链 S 672–711（40 aa）
链 T 672–711（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8X52 Cryo-EM structure of human gamma-secretase in complex with Abeta49 提交 2023-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 540–639（100 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 CLR CHOLESTEROL × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8X53 Cryo-EM structure of human gamma-secretase in complex with Abeta46 提交 2023-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 541–586（46 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 3 CLR CHOLESTEROL × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8X54 Cryo-EM structure of human gamma-secretase in complex with APP-C99 提交 2023-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 540–639（100 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 3 CLR CHOLESTEROL × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8Z9V Amyloid beta and TTR 提交 2024-04-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 e 678–713（36 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.82
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 7.84 Å
9CK6 Cryo-EM structure of sarkosyl insoluble amyloid-beta 42 filaments extracted from human brain tissue 提交 2024-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 B 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 C 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 D 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 E 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 F 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 G 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 H 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 I 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 R 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.00 Å
9CKI Cryo-EM structure of the poly(4-styrenesulfonic acid-co-maleic acid) [PSCMA]-extractable amyloid-beta 42 oligomer from human brain tissue (Conformation 2) 提交 2024-07-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 B 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 C 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 D 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 E 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 F 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 G 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 H 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 I 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 J 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.10 Å
9CO4 Cryo-EM structure of the receptor-bound amyloid-beta 42 oligomer from human brain tissue (Conformation 1) 提交 2024-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 B 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 C 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 D 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 E 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 F 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 G 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 H 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 I 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
链 J 672–713（42 aa） 片段：UNP residues 672-713
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 2.80 Å
9CZN Type Ic amyloid-beta 42 filaments in dominantly inherited Alzheimer disease with cotton wool plaques 提交 2024-08-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 A 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 B 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 C 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 D 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 E 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 F 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 G 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 H 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 I 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 J 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 K 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 L 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 M 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 N 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 O 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 P 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 Q 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 R 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 S 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 T 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9CZP Type Id amyloid-beta 42 filaments in dominantly inherited Alzheimer disease with cotton wool plaques 提交 2024-08-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 A 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 B 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 C 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 D 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 E 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 F 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 G 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 H 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 I 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 J 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 K 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 L 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 M 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 N 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 O 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 P 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 Q 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 R 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 S 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
链 T 680–713（34 aa） 片段：UNP residues 680-713
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9FH2 Cryo-EM Structure of Amyloid-beta Fibrils Carrying the Uppsala AbetaUpp(1-42)delta(19-24) Mutation - Polymorph 1 提交 2024-05-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 672–713（42 aa）
链 B 672–713（42 aa）
链 C 672–713（42 aa）
链 D 672–713（42 aa）
链 E 672–713（42 aa）
链 F 672–713（42 aa）
链 G 672–713（42 aa）
链 H 672–713（42 aa）
链 I 672–713（42 aa）
链 J 672–713（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 2；30% (v/v) acetonitrile (AcN), 0.1% (v/v) trifluoroacetic acid (TFA) at pH 2 (~300 uM monomer concentration)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9FH3 Cryo-EM Structure of Amyloid-beta Fibrils Carrying the Uppsala AbetaUpp(1-42)delta(19-24) Mutation - Polymorph 2 提交 2024-05-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 672–713（42 aa）
链 B 672–713（42 aa）
链 C 672–713（42 aa）
链 D 672–713（42 aa）
链 E 672–713（42 aa）
链 F 672–713（42 aa）
链 G 672–713（42 aa）
链 H 672–713（42 aa）
链 I 672–713（42 aa）
链 J 672–713（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 2；30% (v/v) acetonitrile (AcN), 0.1% (v/v) trifluoroacetic acid (TFA) at pH 2 (~300 uM monomer concentration)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9FH4 Cryo-EM Structure of Amyloid-beta Fibrils Carrying the Uppsala AbetaUpp(1-42)delta(19-24) Mutation - Polymorph 3 提交 2024-05-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 672–713（42 aa）
链 B 672–713（42 aa）
链 C 672–713（42 aa）
链 D 672–713（42 aa）
链 E 672–713（42 aa）
链 F 672–713（42 aa）
链 G 672–713（42 aa）
链 H 672–713（42 aa）
链 I 672–713（42 aa）
链 J 672–713（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 2；30% (v/v) acetonitrile (AcN), 0.1% (v/v) trifluoroacetic acid (TFA) at pH 2 (~300 uM monomer concentration)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9FH5 Cryo-EM Structure of Amyloid-beta Fibrils Carrying the Uppsala AbetaUpp(1-42)delta(19-24) Mutation - Polymorph 4 提交 2024-05-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：20-meric
链 A 672–713（42 aa）
链 B 672–713（42 aa）
链 C 672–713（42 aa）
链 D 672–713（42 aa）
链 E 672–713（42 aa）
链 F 672–713（42 aa）
链 G 672–713（42 aa）
链 H 672–713（42 aa）
链 I 672–713（42 aa）
链 J 672–713（42 aa）
链 K 672–713（42 aa）
链 L 672–713（42 aa）
链 M 672–713（42 aa）
链 N 672–713（42 aa）
链 O 672–713（42 aa）
链 P 672–713（42 aa）
链 Q 672–713（42 aa）
链 R 672–713（42 aa）
链 S 672–713（42 aa）
链 T 672–713（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 2；30% (v/v) acetonitrile (AcN), 0.1% (v/v) trifluoroacetic acid (TFA) at pH 2 (~300 uM monomer concentration)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9IIO J-shaped conformer of amyloid beta (1-40) 提交 2024-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 40 PDB 声明：40-meric
链 2 672–711（40 aa）
链 3 672–711（40 aa）
链 4 672–711（40 aa）
链 5 672–711（40 aa）
链 6 672–711（40 aa）
链 A 672–711（40 aa）
链 B 672–711（40 aa）
链 C 672–711（40 aa）
链 D 672–711（40 aa）
链 E 672–711（40 aa）
链 F 672–711（40 aa）
链 G 672–711（40 aa）
链 H 672–711（40 aa）
链 I 672–711（40 aa）
链 J 672–711（40 aa）
链 K 672–711（40 aa）
链 L 672–711（40 aa）
链 M 672–711（40 aa）
链 N 672–711（40 aa）
链 O 672–711（40 aa）
链 P 672–711（40 aa）
链 Q 672–711（40 aa）
链 R 672–711（40 aa）
链 S 672–711（40 aa）
链 T 672–711（40 aa）
链 U 672–711（40 aa）
链 V 672–711（40 aa）
链 W 672–711（40 aa）
链 X 672–711（40 aa）
链 Y 672–711（40 aa）
链 Z 672–711（40 aa）
链 a 672–711（40 aa）
链 b 672–711（40 aa）
链 c 672–711（40 aa）
链 d 672–711（40 aa）
链 e 672–711（40 aa）
链 f 672–711（40 aa）
链 g 672–711（40 aa）
链 h 672–711（40 aa）
链 i 672–711（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9JAZ Cryo-EM structure of the class I amyloid-beta 42 fibril containing a D-Asp at position 23 提交 2024-08-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 672–713（42 aa）
链 AA 672–713（42 aa）
链 B 672–713（42 aa）
链 BB 672–713（42 aa）
链 C 672–713（42 aa）
链 CC 672–713（42 aa）
链 D 672–713（42 aa）
链 DD 672–713（42 aa）
链 E 672–713（42 aa）
链 EE 672–713（42 aa）
链 F 672–713（42 aa）
链 FF 672–713（42 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9JB0 Cryo-EM structure of the class II amyloid-beta 42 fibril containing a D-Asp at position 23 提交 2024-08-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 672–713（42 aa）
链 AA 672–713（42 aa）
链 B 672–713（42 aa）
链 BB 672–713（42 aa）
链 C 672–713（42 aa）
链 CC 672–713（42 aa）
链 D 672–713（42 aa）
链 DD 672–713（42 aa）
链 E 672–713（42 aa）
链 EE 672–713（42 aa）
链 F 672–713（42 aa）
链 FF 672–713（42 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9JB1 Cryo-EM structure of the type I amyloid-beta 42 fibril containing a D-Asp at positions 7 and 23 提交 2024-08-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 FF 672–713（42 aa）
链 FG 672–713（42 aa）
链 FH 672–713（42 aa）
链 FI 672–713（42 aa）
链 FJ 672–713（42 aa）
链 FK 672–713（42 aa）
链 FL 672–713（42 aa）
链 FM 672–713（42 aa）
链 FN 672–713（42 aa）
链 FO 672–713（42 aa）
链 FP 672–713（42 aa）
链 FQ 672–713（42 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
9JB2 Cryo-EM structure of the type II amyloid-beta 42 fibril containing a D-Asp at positions 7 and 23 提交 2024-08-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 672–713（42 aa）
链 B 672–713（42 aa）
链 BA 672–713（42 aa）
链 BB 672–713（42 aa）
链 BC 672–713（42 aa）
链 BD 672–713（42 aa）
链 BE 672–713（42 aa）
链 C 672–713（42 aa）
链 CA 672–713（42 aa）
链 CB 672–713（42 aa）
链 CC 672–713（42 aa）
链 CD 672–713（42 aa）
链 CE 672–713（42 aa）
链 D 672–713（42 aa）
链 E 672–713（42 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9K0D Cryo-EM structure of Amyloid-beta42-4b polymorph 1 提交 2024-10-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：18-meric
链 B 680–692（13 aa）
链 F 680–692（13 aa）
链 K 680–692（13 aa）
链 L 680–692（13 aa）
链 S 680–692（13 aa）
链 T 680–692（13 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9K0E Cryo-EM structure of Amyloid-beta42-4b polymorph 2 提交 2024-10-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 A 680–692（13 aa）
链 D 680–692（13 aa）
链 E 680–692（13 aa）
链 F 680–692（13 aa）
链 L 680–692（13 aa）
链 M 680–692（13 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9K0F Cryo-EM structure of Amyloid-beta42-4b polymorph 3 提交 2024-10-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 K 680–692（13 aa）
链 N 680–692（13 aa）
链 O 680–692（13 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9LLM Structure of C-Terminal of AB40 Peptide containing GXXXG Motif in SDS Micelles 提交 2025-01-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 692–711（20 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1
NMR样品组成 1 mM AV20, 0.1 mM SDS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
9M5P I-type amyloid fibril (40) of Tottori (D7N) mutant 提交 2025-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 1 672–711（40 aa）
链 2 672–711（40 aa）
链 3 672–711（40 aa）
链 4 672–711（40 aa）
链 5 672–711（40 aa）
链 6 672–711（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9M5Q V-type (V1-type) amyloid fibril (40) of Tottori (D7N) mutant 提交 2025-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric
链 AL 672–711（40 aa）
链 AM 672–711（40 aa）
链 AN 672–711（40 aa）
链 AO 672–711（40 aa）
链 AP 672–711（40 aa）
链 AQ 672–711（40 aa）
链 AR 672–711（40 aa）
链 AS 672–711（40 aa）
链 AT 672–711（40 aa）
链 AU 672–711（40 aa）
链 AV 672–711（40 aa）
链 AW 672–711（40 aa）
链 AX 672–711（40 aa）
链 AY 672–711（40 aa）
链 AZ 672–711（40 aa）
链 Aa 672–711（40 aa）
链 Ab 672–711（40 aa）
链 Ac 672–711（40 aa）
链 Ad 672–711（40 aa）
链 Ae 672–711（40 aa）
链 Af 672–711（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9M5R ES-type (short pitch) amyloid fibril (40) of Tottori (D7N) mutant 提交 2025-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 172 PDB 声明：172-meric
链 0 672–711（40 aa）
链 1 672–711（40 aa）
链 2 672–711（40 aa）
链 3 672–711（40 aa）
链 4 672–711（40 aa）
链 5 672–711（40 aa）
链 6 672–711（40 aa）
链 7 672–711（40 aa）
链 8 672–711（40 aa）
链 9 672–711（40 aa）
链 A 672–711（40 aa）
链 A0 672–711（40 aa）
链 A1 672–711（40 aa）
链 A2 672–711（40 aa）
链 A3 672–711（40 aa）
链 A4 672–711（40 aa）
链 A5 672–711（40 aa）
链 A6 672–711（40 aa）
链 A7 672–711（40 aa）
链 A8 672–711（40 aa）
链 A9 672–711（40 aa）
链 AA 672–711（40 aa）
链 AB 672–711（40 aa）
链 AC 672–711（40 aa）
链 AD 672–711（40 aa）
链 AE 672–711（40 aa）
链 AF 672–711（40 aa）
链 AG 672–711（40 aa）
链 AH 672–711（40 aa）
链 AI 672–711（40 aa）
链 AJ 672–711（40 aa）
链 AK 672–711（40 aa）
链 AL 672–711（40 aa）
链 AM 672–711（40 aa）
链 AN 672–711（40 aa）
链 AO 672–711（40 aa）
链 AP 672–711（40 aa）
链 AQ 672–711（40 aa）
链 AR 672–711（40 aa）
链 AS 672–711（40 aa）
链 AT 672–711（40 aa）
链 AU 672–711（40 aa）
链 AV 672–711（40 aa）
链 AW 672–711（40 aa）
链 AX 672–711（40 aa）
链 AY 672–711（40 aa）
链 AZ 672–711（40 aa）
链 Aa 672–711（40 aa）
链 Ab 672–711（40 aa）
链 Ac 672–711（40 aa）
链 Ad 672–711（40 aa）
链 Ae 672–711（40 aa）
链 Af 672–711（40 aa）
链 Ag 672–711（40 aa）
链 Ah 672–711（40 aa）
链 Ai 672–711（40 aa）
链 Aj 672–711（40 aa）
链 Ak 672–711（40 aa）
链 Al 672–711（40 aa）
链 Am 672–711（40 aa）
链 An 672–711（40 aa）
链 Ao 672–711（40 aa）
链 Ap 672–711（40 aa）
链 Aq 672–711（40 aa）
链 Ar 672–711（40 aa）
链 As 672–711（40 aa）
链 At 672–711（40 aa）
链 Au 672–711（40 aa）
链 Av 672–711（40 aa）
链 Aw 672–711（40 aa）
链 Ax 672–711（40 aa）
链 Ay 672–711（40 aa）
链 Az 672–711（40 aa）
链 B 672–711（40 aa）
链 BA 672–711（40 aa）
链 BB 672–711（40 aa）
链 BC 672–711（40 aa）
链 BD 672–711（40 aa）
链 BE 672–711（40 aa）
链 BF 672–711（40 aa）
链 BG 672–711（40 aa）
链 BH 672–711（40 aa）
链 BI 672–711（40 aa）
链 BJ 672–711（40 aa）
链 BK 672–711（40 aa）
链 BL 672–711（40 aa）
链 BM 672–711（40 aa）
链 BN 672–711（40 aa）
链 BO 672–711（40 aa）
链 BP 672–711（40 aa）
链 BQ 672–711（40 aa）
链 BR 672–711（40 aa）
链 BS 672–711（40 aa）
链 BT 672–711（40 aa）
链 BU 672–711（40 aa）
链 BV 672–711（40 aa）
链 BW 672–711（40 aa）
链 BX 672–711（40 aa）
链 BY 672–711（40 aa）
链 BZ 672–711（40 aa）
链 Ba 672–711（40 aa）
链 Bb 672–711（40 aa）
链 Bc 672–711（40 aa）
链 Bd 672–711（40 aa）
链 Be 672–711（40 aa）
链 Bf 672–711（40 aa）
链 Bg 672–711（40 aa）
链 Bh 672–711（40 aa）
链 Bi 672–711（40 aa）
链 Bj 672–711（40 aa）
链 Bk 672–711（40 aa）
链 Bl 672–711（40 aa）
链 Bm 672–711（40 aa）
链 Bn 672–711（40 aa）
链 Bo 672–711（40 aa）
链 Bp 672–711（40 aa）
链 Bq 672–711（40 aa）
链 Br 672–711（40 aa）
链 Bs 672–711（40 aa）
链 Bt 672–711（40 aa）
链 Bu 672–711（40 aa）
链 Bv 672–711（40 aa）
链 C 672–711（40 aa）
链 D 672–711（40 aa）
链 E 672–711（40 aa）
链 F 672–711（40 aa）
链 G 672–711（40 aa）
链 H 672–711（40 aa）
链 I 672–711（40 aa）
链 J 672–711（40 aa）
链 K 672–711（40 aa）
链 L 672–711（40 aa）
链 M 672–711（40 aa）
链 N 672–711（40 aa）
链 O 672–711（40 aa）
链 P 672–711（40 aa）
链 Q 672–711（40 aa）
链 R 672–711（40 aa）
链 S 672–711（40 aa）
链 T 672–711（40 aa）
链 U 672–711（40 aa）
链 V 672–711（40 aa）
链 W 672–711（40 aa）
链 X 672–711（40 aa）
链 Y 672–711（40 aa）
链 Z 672–711（40 aa）
链 a 672–711（40 aa）
链 b 672–711（40 aa）
链 c 672–711（40 aa）
链 d 672–711（40 aa）
链 e 672–711（40 aa）
链 f 672–711（40 aa）
链 g 672–711（40 aa）
链 h 672–711（40 aa）
链 i 672–711（40 aa）
链 j 672–711（40 aa）
链 k 672–711（40 aa）
链 l 672–711（40 aa）
链 m 672–711（40 aa）
链 n 672–711（40 aa）
链 o 672–711（40 aa）
链 p 672–711（40 aa）
链 q 672–711（40 aa）
链 r 672–711（40 aa）
链 s 672–711（40 aa）
链 t 672–711（40 aa）
链 u 672–711（40 aa）
链 v 672–711（40 aa）
链 w 672–711（40 aa）
链 x 672–711（40 aa）
链 y 672–711（40 aa）
链 z 672–711（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9OBK A-beta42-Met-R-SO amyloidal fibril 提交 2025-04-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 685–712（28 aa）
链 B 685–712（28 aa）
链 C 685–712（28 aa）
链 D 685–712（28 aa）
链 E 685–712（28 aa）
链 F 685–712（28 aa）
链 G 685–712（28 aa）
链 H 685–712（28 aa）
链 I 685–712（28 aa）
链 J 685–712（28 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.01 Å
9ONC A-beta42-Met-R-SO amyloidal fibril - class3 提交 2025-05-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 688–713（26 aa）
链 B 688–713（26 aa）
链 C 688–713（26 aa）
链 D 688–713（26 aa）
链 E 688–713（26 aa）
链 F 688–713（26 aa）
链 G 688–713（26 aa）
链 H 688–713（26 aa）
链 I 688–713（26 aa）
链 J 688–713（26 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.64 Å
9RIV Population B fibril generated from the Heterotypic interaction of Abeta40 and Medin. 提交 2025-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 672–711（40 aa）
链 B 672–711（40 aa）
链 C 672–711（40 aa）
链 D 672–711（40 aa）
链 E 672–711（40 aa）
链 F 672–711（40 aa）
链 G 672–711（40 aa）
链 H 672–711（40 aa）
链 I 672–711（40 aa）
链 J 672–711（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
9RIW Population A fibril generated from the Heterotypic interaction of Abeta40 and Medin. 提交 2025-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 672–711（40 aa）
链 B 672–711（40 aa）
链 C 672–711（40 aa）
链 D 672–711（40 aa）
链 E 672–711（40 aa）
链 F 672–711（40 aa）
链 G 672–711（40 aa）
链 H 672–711（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9UMH V-type (V2-type) amyloid fibril (40) of Tottori (D7N) mutant 提交 2025-04-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric
链 AL 672–711（40 aa）
链 AM 672–711（40 aa）
链 AN 672–711（40 aa）
链 AO 672–711（40 aa）
链 AP 672–711（40 aa）
链 AQ 672–711（40 aa）
链 AR 672–711（40 aa）
链 AS 672–711（40 aa）
链 AT 672–711（40 aa）
链 AU 672–711（40 aa）
链 AV 672–711（40 aa）
链 AW 672–711（40 aa）
链 AX 672–711（40 aa）
链 AY 672–711（40 aa）
链 AZ 672–711（40 aa）
链 Aa 672–711（40 aa）
链 Ab 672–711（40 aa）
链 Ac 672–711（40 aa）
链 Ad 672–711（40 aa）
链 Ae 672–711（40 aa）
链 Af 672–711（40 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9WAO Structure of type II Abeta fibrils from 5xFAD mice 提交 2025-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 672–713（42 aa）
链 B 672–713（42 aa）
链 C 672–713（42 aa）
链 D 672–713（42 aa）
链 E 672–713（42 aa）
链 F 672–713（42 aa）
链 G 672–713（42 aa）
链 H 672–713（42 aa）
链 I 672–713（42 aa）
链 J 672–713（42 aa）
链 K 672–713（42 aa）
链 L 672–713（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9WAP Structure of Type II Abeta fibrils from AppNL-FPsen1P117L mice 提交 2025-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 672–713（42 aa）
链 B 672–713（42 aa）
链 C 672–713（42 aa）
链 D 672–713（42 aa）
链 E 672–713（42 aa）
链 F 672–713（42 aa）
链 G 672–713（42 aa）
链 H 672–713（42 aa）
链 I 672–713（42 aa）
链 J 672–713（42 aa）
链 K 672–713（42 aa）
链 L 672–713（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.22 Å

共 211 个其他 PDB 条目、281 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A4_HUMAN
Isoform P05067-8
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 18–70； UniProt 294–346 作者链 E； PDB构建体 18–70； UniProt 294–346

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 5c67

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 5c67
下载 Download
▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5c67
沉积日期 deposition_date2015-06-22
结构标题 titleHuman Mesotrypsin in complex with amyloid precursor protein inhibitor variant APPI-M17G/I18F/F34V
关键词 keywordsAPPI, Kunitz domain, Trypsin, Hyrdolase-Hydrolase inhibitor complex; Hyrdolase/Hydrolase inhibitor
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier28.05 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron27.63 Å
零角强度 I(0) i062250400.00
分子量 molecular_weight59831.0 kDa
排除体积 excluded_volume73928 ų
包络体积 envelope_volume90382 ų
水化壳体积 shell_volume28296 ų
包络直径 envelope_diameter99.5 Å
壳层 Rg shell_rg33.45 Å
包络 Rg envelope_rg28.10 Å
形状 Rg shape_rg27.63 Å
总 Rg total_rg28.21 Å
总原子数 total_atoms4193
残基数 n_residues549
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax93.9 Å
Rg (实空间) rg_real28.27 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.69 Å
I(0) (实空间) i0_real6.2250e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error9.0290e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal28.21 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal62250000.0000
解质量估计 total_estimate0.8525
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary92.2 Å
偏度 Skewness skewness0.505
峰度 Kurtosis kurtosis-0.288
角度范围 angular_range— – 0.2850 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha10730000.0000
实空间数据点数 n_real_points58
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.815; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.877; Smooth: 0.756
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_idd5c67a_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.47 — Trypsin-like serine proteases
超家族 Superfamily superfamilyb.47.1 — Trypsin-like serine proteases
家族 Family familyb.47.1.2 — Eukaryotic proteases
结构域编号 domain_idd5c67b_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.47 — Trypsin-like serine proteases
超家族 Superfamily superfamilyb.47.1 — Trypsin-like serine proteases
家族 Family familyb.47.1.2 — Eukaryotic proteases
结构域编号 domain_idd5c67c1
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.8 — BPTI-like
超家族 Superfamily superfamilyg.8.1 — BPTI-like
家族 Family familyg.8.1.1 — Small Kunitz-type inhibitors & BPTI-like toxins
结构域编号 domain_idd5c67c2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd5c67e1
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.8 — BPTI-like
超家族 Superfamily superfamilyg.8.1 — BPTI-like
家族 Family familyg.8.1.1 — Small Kunitz-type inhibitors & BPTI-like toxins
结构域编号 domain_idd5c67e2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id5c67A01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Trypsin-like serine proteases
结构域编号 domain_id5c67A02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Trypsin-like serine proteases
结构域编号 domain_id5c67B01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Trypsin-like serine proteases
结构域编号 domain_id5c67B02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Trypsin-like serine proteases
结构域编号 domain_id5c67C00
类 Class class4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture10 — Irregular
拓扑 Topology topology410 — Factor Xa Inhibitor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Pancreatic trypsin inhibitor Kunitz domain
结构域编号 domain_id5c67E00
类 Class class4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture10 — Irregular
拓扑 Topology topology410 — Factor Xa Inhibitor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Pancreatic trypsin inhibitor Kunitz domain
▶

8. 引用文献 (1)

▶

9. 文件与曲线 (10)