5dpi

sfGFP double mutant - 133/149 p-cyano-L-phenylalanine

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 124.5 Å Quality: EXCELLENT

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Green fluorescent protein

Aequorea victoria

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–238	突变：M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, A206V, D133(4CF), N149(4CF) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.2 M potassium sodium formate, 30% PEG 3350	分辨率 2.54 Å R-free 0.243
2	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–238	突变：M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, A206V, D133(4CF), N149(4CF) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.2 M potassium sodium formate, 30% PEG 3350	分辨率 2.54 Å R-free 0.243
3	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–238	突变：M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, A206V, D133(4CF), N149(4CF) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.2 M potassium sodium formate, 30% PEG 3350	分辨率 2.54 Å R-free 0.243
4	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 1–238	突变：M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, A206V, D133(4CF), N149(4CF) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.2 M potassium sodium formate, 30% PEG 3350	分辨率 2.54 Å R-free 0.243
5	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 1–238	突变：M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, A206V, D133(4CF), N149(4CF) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.2 M potassium sodium formate, 30% PEG 3350	分辨率 2.54 Å R-free 0.243
6	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 1–238	突变：M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, A206V, D133(4CF), N149(4CF) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.2 M potassium sodium formate, 30% PEG 3350	分辨率 2.54 Å R-free 0.243

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5DPI	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
28QL GFP bound to distal DARPin (AHIR dodecamer scaffold system) 提交 2026-02-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 3–229（227 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å
5BT0 Switching GFP fluorescence using genetically encoded phenyl azide chemistry through two different non-native post-translational modifications routes at the same position. 提交 2015-06-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–234（232 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；297 K；50 mM MMT, 2.5 M (NH4)2SO4	分辨率 2.03 Å R-free 0.204
5BT0 Switching GFP fluorescence using genetically encoded phenyl azide chemistry through two different non-native post-translational modifications routes at the same position. 提交 2015-06-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 3–234（232 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；297 K；50 mM MMT, 2.5 M (NH4)2SO4	分辨率 2.03 Å R-free 0.204
5BTT Switching GFP fluorescence using genetically encoded phenyl azide chemistry through two different non-native post-translational modifications routes at the same position. 提交 2015-06-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–231（229 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；297 K；50 mM MMT, 2.5 M (NH4)2SO4	分辨率 2.14 Å R-free 0.207
5BTT Switching GFP fluorescence using genetically encoded phenyl azide chemistry through two different non-native post-translational modifications routes at the same position. 提交 2015-06-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 3–231（229 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；297 K；50 mM MMT, 2.5 M (NH4)2SO4	分辨率 2.14 Å R-free 0.207
5DPG sfGFP mutant - 133 p-cyano-L-phenylalanine 提交 2015-09-12	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–238（238 aa）	突变：M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, D133(4CF), A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；22% PEG 3350, 2% Tacsimate pH 6, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 1.85 Å R-free 0.192
5DPH sfGFP mutant - 149 p-cyano-L-phenylalanine 提交 2015-09-12	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–238（238 aa）	突变：M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, A206V, N149(4CF) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CO2 CARBON DIOXIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.1 M Tris pH 8.5, 20% PEG 4000, 0.21 M MgCl2-6H2O	分辨率 1.42 Å R-free 0.208
5DPH sfGFP mutant - 149 p-cyano-L-phenylalanine 提交 2015-09-12	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–238（238 aa）	突变：M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, A206V, N149(4CF) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CO2 CARBON DIOXIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.1 M Tris pH 8.5, 20% PEG 4000, 0.21 M MgCl2-6H2O	分辨率 1.42 Å R-free 0.208
5DPJ sfGFP double mutant - 133/149 p-ethynyl-L-phenylalanine 提交 2015-09-12	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–238（238 aa）	突变：M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, D133(5DW), N149(5DW), A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；22% PEG 3350 and 0.20 M sodium citrate tribasic, pH 7	分辨率 2.50 Å R-free 0.244
5DPJ sfGFP double mutant - 133/149 p-ethynyl-L-phenylalanine 提交 2015-09-12	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–238（238 aa）	突变：M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, D133(5DW), N149(5DW), A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；22% PEG 3350 and 0.20 M sodium citrate tribasic, pH 7	分辨率 2.50 Å R-free 0.244
5DPJ sfGFP double mutant - 133/149 p-ethynyl-L-phenylalanine 提交 2015-09-12	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–238（238 aa）	突变：M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, D133(5DW), N149(5DW), A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；22% PEG 3350 and 0.20 M sodium citrate tribasic, pH 7	分辨率 2.50 Å R-free 0.244
5DPJ sfGFP double mutant - 133/149 p-ethynyl-L-phenylalanine 提交 2015-09-12	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–238（238 aa）	突变：M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, D133(5DW), N149(5DW), A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；22% PEG 3350 and 0.20 M sodium citrate tribasic, pH 7	分辨率 2.50 Å R-free 0.244
5DY6 Enhanced superfolder GFP with DBCO at 148 提交 2015-09-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 5–232（228 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；294 K；0.1 M PCTP Buffer, 15% PEG 1500	分辨率 2.66 Å R-free 0.290
5DY6 Enhanced superfolder GFP with DBCO at 148 提交 2015-09-24	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 5–232（228 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；294 K；0.1 M PCTP Buffer, 15% PEG 1500	分辨率 2.66 Å R-free 0.290
5EHU sfGFP mutant with unnatural amino acid 4-azidoethoxy-L-phenylalanine incorporated at the 149 site 提交 2015-10-28	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–238（237 aa）	突变：S30R, A72S, Q80R, N149(4LZ), A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；A 40 mg/mL solution of sfGFP-149-AePhe in a 20 mM Hepes buffer pH 7.5 was combined with a precipitation solution (20% PEG 8000, 100 mM Hepes pH 7.5) in a 1:1 ratio to form crystals in a sitting drop well at room temperature	分辨率 1.45 Å R-free 0.208
5EHU sfGFP mutant with unnatural amino acid 4-azidoethoxy-L-phenylalanine incorporated at the 149 site 提交 2015-10-28	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2–238（237 aa）	突变：S30R, A72S, Q80R, N149(4LZ), A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；A 40 mg/mL solution of sfGFP-149-AePhe in a 20 mM Hepes buffer pH 7.5 was combined with a precipitation solution (20% PEG 8000, 100 mM Hepes pH 7.5) in a 1:1 ratio to form crystals in a sitting drop well at room temperature	分辨率 1.45 Å R-free 0.208
5JZK The Structure of Ultra Stable Green Fluorescent Protein 提交 2016-05-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 3–238（236 aa）片段：UNP residues 3-238 链 B 3–238（236 aa）片段：UNP residues 3-238	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NO3 NITRATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；20 % w/v PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris propane pH 6.5, 0.2 M Sodium nitrate	分辨率 1.90 Å R-free 0.176
5JZL The Structure of Monomeric Ultra Stable Green Fluorescent Protein 提交 2016-05-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）片段：UNP residues 3-238	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；22% w/v PEG 8000, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M phosphate-citrate buffer pH 3.7, 4% v/v acetone	分辨率 1.80 Å R-free 0.217
5JZL The Structure of Monomeric Ultra Stable Green Fluorescent Protein 提交 2016-05-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 3–238（236 aa）片段：UNP residues 3-238	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；22% w/v PEG 8000, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M phosphate-citrate buffer pH 3.7, 4% v/v acetone	分辨率 1.80 Å R-free 0.217
5MFC Designed armadillo repeat protein YIIIM5AII in complex with (KR)4-GFP 提交 2016-11-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；277 K；8% w/v PEG 4000, 0.1M Na acetate trihydrate pH 4.6,	分辨率 2.40 Å R-free 0.240
5MFC Designed armadillo repeat protein YIIIM5AII in complex with (KR)4-GFP 提交 2016-11-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；277 K；8% w/v PEG 4000, 0.1M Na acetate trihydrate pH 4.6,	分辨率 2.40 Å R-free 0.240
5NHN Super-Folder Green Fluorescent Protein Artificiall dimer linked via 148 position 提交 2017-03-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 3–231（229 aa）链 B 3–231（229 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	DB5 [(4~{S})-4,5,6,7,8,9-hexahydro-1~{H}-cycloocta[d][1,2,3]triazol-4-yl] hydrogen carbonate × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；300 K；Condition C6 of the PACT Premier screen: 0.1 M PCTP Buffer, pH 9.0, 25% PEG 1500	分辨率 1.96 Å R-free 0.209
5NI3 sfGFP 204-204 mutant dimer 提交 2017-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 3–229（227 aa）链 D 3–233（231 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NA SODIUM ION × 6 DB5 [(4~{S})-4,5,6,7,8,9-hexahydro-1~{H}-cycloocta[d][1,2,3]triazol-4-yl] hydrogen carbonate × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；PACT condition C6: 0.1M PCTP Buffer, pH 9.0, 25% PEG 1500	分辨率 1.28 Å R-free 0.191
5NI3 sfGFP 204-204 mutant dimer 提交 2017-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 3–233（231 aa）链 C 3–233（231 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NA SODIUM ION × 4 DB5 [(4~{S})-4,5,6,7,8,9-hexahydro-1~{H}-cycloocta[d][1,2,3]triazol-4-yl] hydrogen carbonate × 1 GOL GLYCEROL × 4 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；PACT condition C6: 0.1M PCTP Buffer, pH 9.0, 25% PEG 1500	分辨率 1.28 Å R-free 0.191
5YR2 Structure of cpGFP66BPA 提交 2017-11-08	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 146–235（90 aa）链 A 3–144（142 aa）	突变：Y163(BPA) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：Y163(BPA) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；289.15 K；PEG 3350 25%, 0.2M MgCl2,0.1M Bis-Tris pH 5.5	分辨率 1.80 Å R-free 0.215
5YR2 Structure of cpGFP66BPA 提交 2017-11-08	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 146–235（90 aa）链 B 3–144（142 aa）	突变：Y163(BPA) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：Y163(BPA) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；289.15 K；PEG 3350 25%, 0.2M MgCl2,0.1M Bis-Tris pH 5.5	分辨率 1.80 Å R-free 0.215
5Z6Y Structure of sfYFP48S95C66BPA 提交 2018-01-25	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–230（228 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；289 K；0.1M sodium malonate pH 4.0, 12% PEG 3350	分辨率 1.87 Å R-free 0.236
6B9C Superfolder Green Fluorescent Protein with 4-nitro-L-phenylalanine at the chromophore (position 66) 提交 2017-10-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	突变：S30R, A72S, Q80R, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CO2 CARBON DIOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；1.4 M DL-Malic acid	分辨率 1.70 Å R-free 0.195
6B9C Superfolder Green Fluorescent Protein with 4-nitro-L-phenylalanine at the chromophore (position 66) 提交 2017-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 3–238（236 aa）	突变：S30R, A72S, Q80R, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CO2 CARBON DIOXIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；1.4 M DL-Malic acid	分辨率 1.70 Å R-free 0.195
6H01 Crystal structure of a domain-swapped dark-state sfGFP containing the unnatural amino acid ortho-nitrobenzyl-tyrosine (ONBY) at residue 66 提交 2018-07-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 3–238（236 aa）链 C 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；1.1 M tri-Na-citrate 0.1 M Na-HEPES	分辨率 2.78 Å R-free 0.239
6H01 Crystal structure of a domain-swapped dark-state sfGFP containing the unnatural amino acid ortho-nitrobenzyl-tyrosine (ONBY) at residue 66 提交 2018-07-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 3–238（236 aa）链 D 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；1.1 M tri-Na-citrate 0.1 M Na-HEPES	分辨率 2.78 Å R-free 0.239
6HUT GFP8 - a stabilized variant of cycle-3 GFP 提交 2018-10-09	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–245（245 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；200 mM HEPES, 10% v/v isopropanol, 200 mM NaCl	分辨率 1.29 Å R-free 0.203
6KRG Crystal structure of sfGFP Y182TMSiPhe 提交 2019-08-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–236（236 aa）	突变：Y182T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 3 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；PEG 6000, SODIUM CHLORIDE	分辨率 1.40 Å R-free 0.173
6OA8 Superfolder Green Fluorescent Protein with 4-cyano-L-phenylalanine at the chromophore (position 66) 提交 2019-03-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 SO4 SULFATE ION × 8 NA SODIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；0.1 M Tris-HCl, 2.0 M ammonium sulfate, pH 8.5	分辨率 1.37 Å R-free 0.189
6UN5 Crystal structure of green fluorescent protein (GFP); S65T, Y66(2,3,5-F3Y); ih circular permutant (50-51) 提交 2019-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 51–237（187 aa）链 B 51–237（187 aa）	突变：;A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V, S232R, Y241I, C250S,A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V ; 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：;A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V, S232R, Y241I, C250S,A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V ; 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.15 M ammonium acetate, 31% PEG 3350	分辨率 1.36 Å R-free 0.205
6UN6 Crystal structure of green fluorescent protein (GFP); S65T, Y66(3-NO2Y); ih circular permutant (50-51) 提交 2019-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 51–237（187 aa）链 B 51–237（187 aa）	突变：A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V, S232R, Y241I, C250S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V, S232R, Y241I, C250S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.15 M ammonium acetate, 34% PEG 3350	分辨率 1.50 Å R-free 0.181
6UN7 Crystal structure of green fluorescent protein (GFP); S65T, Y66(3-OMeY); ih circular permutant (50-51) 提交 2019-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 51–237（187 aa）链 B 51–237（187 aa）	突变：A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V, S232R, Y241I, C250S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V, S232R, Y241I, C250S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.15 M ammonium acetate, 34% PEG 3350	分辨率 1.50 Å R-free 0.191
6WV3 Human VKOR with warfarin 提交 2020-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–144（144 aa）片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231) 链 A 146–231（86 aa）片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 3 SWF S-WARFARIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.5；295 K；37% PEG400, 0.1 M MES, pH 6.5	分辨率 2.20 Å R-free 0.223
6WV4 Human VKOR C43S with warfarin 提交 2020-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–144（144 aa）片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231) 链 A 146–231（86 aa）片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)	突变：C43S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C43S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SWF S-WARFARIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.5；295 K；25-33% PEG400, 185-220 mM potassium formate, 0.1 M MES, pH 6.5	分辨率 3.01 Å R-free 0.292
6WV5 Human VKOR C43S mutant with vitamin K1 epoxide 提交 2020-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–144（144 aa）片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231) 链 A 146–231（86 aa）片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)	突变：C43S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C43S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	UAV (2R,3R)-2-hydroxy-3-methyl-2-[(2E,7S)-3,7,11,15-tetramethylhexadec-2-en-1-yl]-2,3-dihydronaphthalene-1,4-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.5；295 K；25% PEG400, 0.1 M ammonium citrate dibasic, 0.1 M MES, pH 6.5	分辨率 2.80 Å R-free 0.270
6WV6 Human VKOR with phenindione 提交 2020-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–144（144 aa）片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231) 链 A 146–231（86 aa）片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 UAS Phenindione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.5；295 K；34% PEG400, 80 mM lithium sulfate, 0.1 M MES, pH 6.5	分辨率 2.70 Å R-free 0.268
6WV7 Human VKOR with Chlorophacinone 提交 2020-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–144（144 aa）片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231) 链 A 146–231（86 aa）片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	UAJ Chlorophacinone × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.5；295 K；33% PEG400, 5% DMSO, 0.1 M sodium acetate, 0.1 M MES, pH 6.5	分辨率 2.48 Å R-free 0.245
6WV7 Human VKOR with Chlorophacinone 提交 2020-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–144（144 aa）片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231) 链 B 146–231（86 aa）片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	UAJ Chlorophacinone × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.5；295 K；33% PEG400, 5% DMSO, 0.1 M sodium acetate, 0.1 M MES, pH 6.5	分辨率 2.48 Å R-free 0.245
6WV8 Takifugu rubripes VKOR-like C138S mutant with vitamin K1 提交 2020-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 146–238（93 aa）	突变：C138S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PQN PHYLLOQUINONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；295 K；25% PEG 400, 300 mM ammonium fluoride, 0.1 M MES pH 6.0	分辨率 3.01 Å R-free 0.293
6WVB Takifugu rubripes VKOR-like with warfarin 提交 2020-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 146–238（93 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SWF S-WARFARIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；295 K；23% PEG400, 0.1 M Sodium nitrate, 0.1 M MES pH 5.5	分辨率 2.87 Å R-free 0.286
6WVH Human VKOR with Brodifacoum 提交 2020-05-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–144（144 aa）片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231) 链 A 146–231（86 aa）片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	UA7 Brodifacoum × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.5；295 K；32% PEG400, 0.1 M ammonium acetate, 1% 1,2,3-heptanetriol, 0.1 M MES, pH 6.5	分辨率 1.99 Å R-free 0.215
6WVH Human VKOR with Brodifacoum 提交 2020-05-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–144（144 aa）片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231) 链 B 146–231（86 aa）片段：GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	UA7 Brodifacoum × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.5；295 K；32% PEG400, 0.1 M ammonium acetate, 1% 1,2,3-heptanetriol, 0.1 M MES, pH 6.5	分辨率 1.99 Å R-free 0.215
7A7M rsGreen0.7b in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；150 mM KBr 30 % PEG 2000 mme	分辨率 1.60 Å R-free 0.198
7A7N rsGreen0.7b in the green-off state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MMT pH 5.0 25 % PEG 1500	分辨率 1.20 Å R-free 0.170
7A7O rsGreen0.7-K206A in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200 mM Ammonium acetate 100 mM Bis-tris pH 5.5 25 % PEG 3350	分辨率 1.80 Å R-free 0.241
7A7P rsGreen0.7-K206A partially in the green-off state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NO3 NITRATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；22 % PEG 4000 140 mM Mg(NO3)2	分辨率 1.48 Å R-free 0.197
7A7Q rsGreenF-K206A in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200 mM NaCl 100 mM MES pH 6.0 20 % PEG 6000	分辨率 2.00 Å R-free 0.218
7A7R rsGreenF-K206A in the green-off state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200 mM NaCl 100 mM MES pH 6.0 20 % PEG 6000	分辨率 2.35 Å R-free 0.243
7A7S rsGreenF in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MIB pH 4.0 25 % PEG 1500	分辨率 1.73 Å R-free 0.235
7A7T rsGreenF partially in the green-off state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MIB pH 4.0 25 % PEG 1500	分辨率 1.58 Å R-free 0.197
7A7U rsGreen1 in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.0 M (NH4)2SO4 200 mM NaCl 100 mM Na-cacodylate pH 6.5	分辨率 2.15 Å R-free 0.201
7A7V rsGreen1-K206A partially in the green-off state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Bis-tris pH 5.5 200 mM (NH4)2SO4 16 % PEG 8000	分辨率 2.00 Å R-free 0.194
7A7W rsGreen0.7-F145M partially in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200 mM NH4HCO2 20 % PEG 4000	分辨率 1.30 Å R-free 0.165
7A7X rsGreen0.7-F145M in the green-off state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MMT pH 8.0 25 % PEG 1500	分辨率 1.85 Å R-free 0.207
7A7Y rsGreen0.7-F145Q in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；200 mM KNO3 20 % PEG 3350	分辨率 0.97 Å R-free 0.142
7A7Z rsGreen0.7-K206A-E222G in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200 mM (Li)2SO4 100 mM Tris pH 8.5 40 % PEG 400	分辨率 1.10 Å R-free 0.142
7A80 rsGreen0.7-K206A-E222V in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；26 % PEG 4000 500 mM Mg(NO3) 50 mM HEPES pH 7.5	分辨率 2.05 Å R-free 0.234
7A80 rsGreen0.7-K206A-E222V in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；26 % PEG 4000 500 mM Mg(NO3) 50 mM HEPES pH 7.5	分辨率 2.05 Å R-free 0.234
7A80 rsGreen0.7-K206A-E222V in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；26 % PEG 4000 500 mM Mg(NO3) 50 mM HEPES pH 7.5	分辨率 2.05 Å R-free 0.234
7A80 rsGreen0.7-K206A-E222V in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；26 % PEG 4000 500 mM Mg(NO3) 50 mM HEPES pH 7.5	分辨率 2.05 Å R-free 0.234
7A81 rsGreen0.7-K206A-F145A partially in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200 mM NaCl 100 mM MES pH 6.0 20 % PEG 6000 4% 2,2,2-trifluoroethanol	分辨率 1.70 Å R-free 0.248
7A82 rsGreen0.7-K206A-F145A partially in the green-off state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200 mM NaCl 100 mM MES pH 6.0 20 % PEG 6000 200 mM NDSB-211	分辨率 1.90 Å R-free 0.250
7A83 rsGreen0.7-K206A-F145H in the green-on-state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；125 mM MES pH 6.0 9 % PEG 4000	分辨率 1.73 Å R-free 0.192
7A84 rsGreen0.7-K206A-F145H partially in the green-off state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MES pH 6.0 14 % PEG 400 300 mM NGSB-195	分辨率 2.10 Å R-free 0.269
7A85 rsGreen0.7-K206A-F145L in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MES pH 6.5 12 % PEG 20 000 10 mM NaBr	分辨率 1.52 Å R-free 0.237
7A86 rsGreen0.7-K206A-F145L partially in the green-off state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MES pH 6.5 12 % PEG 20 000 4 % Pentaerythritol ethoxylate	分辨率 1.90 Å R-free 0.210
7A86 rsGreen0.7-K206A-F145L partially in the green-off state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MES pH 6.5 12 % PEG 20 000 4 % Pentaerythritol ethoxylate	分辨率 1.90 Å R-free 0.210
7A87 rsGreen0.7-K206A-F145M in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Bis-tris pH 6.5 20 % PEG 1500	分辨率 1.75 Å R-free 0.228
7A88 rsGreen0.7-K206A-F145M in the green-off state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MMT 25 % PEG 1500	分辨率 1.95 Å R-free 0.226
7A89 rsGreen0.7-K206A-F145Q in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；22 % PEG 4000 140 mM Mg(NO3)2	分辨率 2.50 Å R-free 0.234
7A89 rsGreen0.7-K206A-F145Q in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；22 % PEG 4000 140 mM Mg(NO3)2	分辨率 2.50 Å R-free 0.234
7A8A rsGreen0.7-K206A-F145Q partially in the green-off state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200 mM NaCl 100 mM MES pH 6.0 20 % PEG 6000	分辨率 1.93 Å R-free 0.254
7A8B rsGreen0.7-K206A-F145S partially in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MES pH 6.0 14 % PEG 4000	分辨率 1.55 Å R-free 0.232
7A8C rsGreen0.7-K206A-F145S in the green-off state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MES pH 6.5 25 % PEG 4000 400 mM D-galactose	分辨率 2.13 Å R-free 0.253
7A8D rsGreen0.7-K206A-F165W partially in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；200 mM NH4F 20 % PEG 3350	分辨率 1.65 Å R-free 0.219
7A8E rsGreen0.7-K206A-F165W partially in the green-off state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM HEPES pH 7.5 25 % PEG 4000	分辨率 2.20 Å R-free 0.261
7A8F rsGreen0.7-K206A-F165L in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM HEPES pH 7.5 25 % PEG 4000	分辨率 2.27 Å R-free 0.257
7A8G rsGreen0.7-K206A-H148G in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200 mM TMAO 100mM Tris pH 8.5 20 % Peg 2000 mme	分辨率 2.00 Å R-free 0.217
7A8G rsGreen0.7-K206A-H148G in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200 mM TMAO 100mM Tris pH 8.5 20 % Peg 2000 mme	分辨率 2.00 Å R-free 0.217
7A8H rsGreen0.7-K206A-H148S in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Bis-tris pH 6.5 20 % PEG 5000 mme	分辨率 1.70 Å R-free 0.209
7A8H rsGreen0.7-K206A-H148S in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Bis-tris pH 6.5 20 % PEG 5000 mme	分辨率 1.70 Å R-free 0.209
7A8H rsGreen0.7-K206A-H148S in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Bis-tris pH 6.5 20 % PEG 5000 mme	分辨率 1.70 Å R-free 0.209
7A8H rsGreen0.7-K206A-H148S in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Bis-tris pH 6.5 20 % PEG 5000 mme	分辨率 1.70 Å R-free 0.209
7A8I rsGreen0.7-K206A-H148S partially in the green-off state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Bis-tris pH 6.5 20 % PEG 5000 mme	分辨率 2.00 Å R-free 0.228
7A8I rsGreen0.7-K206A-H148S partially in the green-off state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Bis-tris pH 6.5 20 % PEG 5000 mme	分辨率 2.00 Å R-free 0.228
7A8I rsGreen0.7-K206A-H148S partially in the green-off state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Bis-tris pH 6.5 20 % PEG 5000 mme	分辨率 2.00 Å R-free 0.228
7A8I rsGreen0.7-K206A-H148S partially in the green-off state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Bis-tris pH 6.5 20 % PEG 5000 mme	分辨率 2.00 Å R-free 0.228
7A8J rsGreen0.7-K206A-H148V in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MES pH 6.5 25 % PEG 550 mme 10 mM ZnSO4	分辨率 1.85 Å R-free 0.232
7A8K rsGreen0.7-K206A-H148V partially in the green-off state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；50 mM HEPES pH 7.5 12 % PEG 4000 1% tryptone	分辨率 2.25 Å R-free 0.263
7A8L rsGreen0.7-K206A-N205C in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MES pH 6.5 25 % PEG 3000	分辨率 1.75 Å R-free 0.225
7A8M rsGreen0.7-K206A-N205G in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MES pH 6.0 20 % PEG 2000 mme 10 mM BaCl2	分辨率 1.60 Å R-free 0.245
7A8N rsGreen0.7-K206A-N205L in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM HEPES pH 7.5 25 % PEG 8000	分辨率 2.10 Å R-free 0.258
7A8O rsGreen0.7-K206A-N205S in the green-on state 提交 2020-08-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200 mM Maic acid pH 7.0 20 % PEG 3350	分辨率 1.60 Å R-free 0.201
7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–238（238 aa）	突变：R2S,S30R,A72S,Q80R,A206V,M340E,L344K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298.15 K；Bis-Tris, (NH4)2SO4	分辨率 2.40 Å R-free 0.239
7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–238（238 aa）	突变：R2S,S30R,A72S,Q80R,A206V,M340E,L344K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298.15 K；Bis-Tris, (NH4)2SO4	分辨率 2.40 Å R-free 0.239
7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–238（238 aa）	突变：R2S,S30R,A72S,Q80R,A206V,M340E,L344K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298.15 K；Bis-Tris, (NH4)2SO4	分辨率 2.40 Å R-free 0.239
7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1–238（238 aa）	突变：R2S,S30R,A72S,Q80R,A206V,M340E,L344K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298.15 K；Bis-Tris, (NH4)2SO4	分辨率 2.40 Å R-free 0.239
7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–238（238 aa）	突变：R2S,S30R,A72S,Q80R,A206V,M340E,L344K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298.15 K；Bis-Tris, (NH4)2SO4	分辨率 2.40 Å R-free 0.239
7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 1–238（238 aa）	突变：R2S,S30R,A72S,Q80R,A206V,M340E,L344K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298.15 K；Bis-Tris, (NH4)2SO4	分辨率 2.40 Å R-free 0.239
7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 M 1–238（238 aa）	突变：R2S,S30R,A72S,Q80R,A206V,M340E,L344K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298.15 K；Bis-Tris, (NH4)2SO4	分辨率 2.40 Å R-free 0.239
7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 O 1–238（238 aa）	突变：R2S,S30R,A72S,Q80R,A206V,M340E,L344K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298.15 K；Bis-Tris, (NH4)2SO4	分辨率 2.40 Å R-free 0.239
7E53 Crystal structure of sfGFP complexed with the nanobody nb2 at 2.2 Angstron resolution 提交 2021-02-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 3–232（230 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% (w/v) Polyethylene glycol 400, 100mM CAPS/ Sodium hydroxide, pH 10.5	分辨率 2.21 Å R-free 0.258
8DHY N-terminal fragment of MsbA fused to GFP in complex with copper(II) 提交 2022-06-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–239（237 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；70% Tacsimate pH 7.0	分辨率 2.15 Å R-free 0.228
8GW6 AtSLAC1 6D mutant in closed state 提交 2022-09-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–240（240 aa）链 B 1–240（240 aa）链 C 1–240（240 aa）	突变：T62D,S65D,S107D,S124D,S146D,T152D 突变：T62D,S65D,S107D,S124D,S146D,T152D 突变：T62D,S65D,S107D,S124D,S146D,T152D	CL CHLORIDE ION × 3 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8GW7 AtSLAC1 6D mutant in open state 提交 2022-09-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–240（240 aa）链 B 1–240（240 aa）链 C 1–240（240 aa）	突变：T62D,S65D,S107D,S124D,S146D,T152D 突变：T62D,S65D,S107D,S124D,S146D,T152D 突变：T62D,S65D,S107D,S124D,S146D,T152D	CL CHLORIDE ION × 6 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8J6M SIDT1 protein 提交 2023-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 3–236（234 aa）链 B 3–236（234 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 8 ZN ZINC ION × 2 NA SODIUM ION × 1 OLA OLEIC ACID × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.77 Å
8J6O transport T2 提交 2023-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 3–236（234 aa）链 B 3–236（234 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.25 Å
8J7M ion channel 提交 2023-04-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 3–235（233 aa）链 B 3–235（233 aa）链 C 3–235（233 aa）链 D 3–235（233 aa）	未记录	POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 4 CLR CHOLESTEROL × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8RL9 RECQL5:sfGFP hetero dimer assembled by Di-Gluebody 提交 2024-01-02	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–238（238 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.22 Å
8RLB RECQL5:sfGFP hetero dimer assembled by Di-Gluebody - sfGFP local refinement 提交 2024-01-02	突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–238（238 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.99 Å
8RLC SPNS2:sfGFP hetero dimer assembled by Di-Gluebody 提交 2024-01-02	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–238（238 aa）	未记录	LMT DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8RLE SPNS2:sfGFP hetero dimer assembled by Di-Gluebody - sfGFP local refinement 提交 2024-01-02	突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–238（238 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.75 Å
8UBG DpHF19 filament 提交 2023-09-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：20-meric	链 A 3–238（236 aa）链 B 3–238（236 aa）链 C 3–238（236 aa）链 D 3–238（236 aa）链 E 3–238（236 aa）链 F 3–238（236 aa）链 G 3–238（236 aa）链 H 3–238（236 aa）链 I 3–238（236 aa）链 J 3–238（236 aa）链 K 3–238（236 aa）链 L 3–238（236 aa）链 M 3–238（236 aa）链 N 3–238（236 aa）链 O 3–238（236 aa）链 P 3–238（236 aa）链 Q 3–238（236 aa）链 R 3–238（236 aa）链 S 3–238（236 aa）链 T 3–238（236 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8XAL Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-BQ.1 in complex with ACE2 提交 2023-12-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 I 3–238（236 aa）链 J 3–238（236 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4	分辨率 3.20 Å
9BCF Chimeric protein of crocodile allergen Cro p 1.0101 and GFP 提交 2024-04-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2 M calcium acetate, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 40% v/v PEG 300	分辨率 3.20 Å R-free 0.238
9BCF Chimeric protein of crocodile allergen Cro p 1.0101 and GFP 提交 2024-04-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2 M calcium acetate, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 40% v/v PEG 300	分辨率 3.20 Å R-free 0.238
9BCF Chimeric protein of crocodile allergen Cro p 1.0101 and GFP 提交 2024-04-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2 M calcium acetate, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 40% v/v PEG 300	分辨率 3.20 Å R-free 0.238
9C74 superfolder Green Fluorescent Protein with meta-nitro-tyrosine incorporated at position 66 提交 2024-06-10	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–238（238 aa）	突变：Y66mNO2Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NA SODIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；1% tryptone, 0.001 M NaN3, 0.05 M Hepes pH 7.0, 20% w/v PEG350	分辨率 1.51 Å R-free 0.220
9IRV MultiBody Refinement of dimeric DARPin and its bound GFP on a symmetric scaffold 提交 2024-07-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–231（231 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.47 Å
9J48 GFP bound to 24-mer DARPin-apoferritin model 6c 提交 2024-08-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric	链 a 1–231（231 aa）链 b 1–231（231 aa）链 c 1–231（231 aa）链 d 1–231（231 aa）链 e 1–231（231 aa）链 f 1–231（231 aa）链 g 1–231（231 aa）链 h 1–231（231 aa）链 i 1–231（231 aa）链 j 1–231（231 aa）链 k 1–231（231 aa）链 l 1–231（231 aa）链 m 1–231（231 aa）链 n 1–231（231 aa）链 o 1–231（231 aa）链 p 1–231（231 aa）链 q 1–231（231 aa）链 r 1–231（231 aa）链 s 1–231（231 aa）链 t 1–231（231 aa）链 v 1–231（231 aa）链 w 1–231（231 aa）链 x 1–231（231 aa）链 y 1–231（231 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.04 Å
9N6A GP23 C-termimal receptor binding domain from TM4 phage 提交 2025-02-05	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–238（238 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；289 K；0.2 M Lithium Sulfate 0.1 M MES: NaOH, pH 6 20 % (v/v) 1,4-Butanediol	分辨率 2.91 Å R-free 0.280
9V85 Superfolder GFP fused gp38 receptor binding domain of bacteriophage PP01 提交 2025-05-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；10% (w/v) PEG8000, 0.1M Na-HEPES-MOPS, pH7.5, 3mM CaCl2, 3mM MgCl2, 20 % (v/v) ethylene glycol	分辨率 2.10 Å R-free 0.208
9V85 Superfolder GFP fused gp38 receptor binding domain of bacteriophage PP01 提交 2025-05-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 3–238（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；10% (w/v) PEG8000, 0.1M Na-HEPES-MOPS, pH7.5, 3mM CaCl2, 3mM MgCl2, 20 % (v/v) ethylene glycol	分辨率 2.10 Å R-free 0.208
9ZG5 Structure of superfolder GFP bound to nanobody 15 提交 2025-12-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 3–239（237 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.40 Å R-free 0.331
9ZG5 Structure of superfolder GFP bound to nanobody 15 提交 2025-12-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 3–239（237 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.40 Å R-free 0.331
9ZG5 Structure of superfolder GFP bound to nanobody 15 提交 2025-12-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 3–239（237 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.40 Å R-free 0.331
9ZG5 Structure of superfolder GFP bound to nanobody 15 提交 2025-12-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 3–239（237 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.40 Å R-free 0.331

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A059PIQ0_AEQVI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–237； UniProt 1–238 作者链 B； PDB构建体 2–237； UniProt 1–238 作者链 C； PDB构建体 2–237； UniProt 1–238 作者链 D； PDB构建体 2–237； UniProt 1–238 作者链 E； PDB构建体 2–237； UniProt 1–238 作者链 F； PDB构建体 2–237； UniProt 1–238

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5dpi
沉积日期 deposition_date	2015-09-12
结构标题 title	sfGFP double mutant - 133/149 p-cyano-L-phenylalanine
关键词 keywords	GFP, unnatural amino acid, cyanophenylalanine, FLUORESCENT PROTEIN; FLUORESCENT PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	39.55 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	38.94 Å
零角强度 I(0) i0	352581000.00
分子量 molecular_weight	152920.0 kDa
排除体积 excluded_volume	191120 Å³
包络体积 envelope_volume	253050 Å³
水化壳体积 shell_volume	54102 Å³
包络直径 envelope_diameter	123.9 Å
壳层 Rg shell_rg	44.70 Å
包络 Rg envelope_rg	38.20 Å
形状 Rg shape_rg	38.93 Å
总 Rg total_rg	39.30 Å
总原子数 total_atoms	10813
残基数 n_residues	1335
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	124.5 Å
Rg (实空间) rg_real	39.39 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.01 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.5260e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	6.3040e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	39.49 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	352600000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9098
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	49.8 Å
偏度 Skewness skewness	0.113
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.732
角度范围 angular_range	— – 0.2000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	42250000.0000
实空间数据点数 n_real_points	41
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.957; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.955

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_id	d5dpia_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.22 — GFP-like
超家族 Superfamily superfamily	d.22.1 — GFP-like
家族 Family family	d.22.1.1 — Fluorescent proteins

结构域编号 domain_id	d5dpib_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.22 — GFP-like
超家族 Superfamily superfamily	d.22.1 — GFP-like
家族 Family family	d.22.1.1 — Fluorescent proteins

结构域编号 domain_id	d5dpic_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.22 — GFP-like
超家族 Superfamily superfamily	d.22.1 — GFP-like
家族 Family family	d.22.1.1 — Fluorescent proteins

结构域编号 domain_id	d5dpid_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.22 — GFP-like
超家族 Superfamily superfamily	d.22.1 — GFP-like
家族 Family family	d.22.1.1 — Fluorescent proteins

结构域编号 domain_id	d5dpie_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.22 — GFP-like
超家族 Superfamily superfamily	d.22.1 — GFP-like
家族 Family family	d.22.1.1 — Fluorescent proteins

结构域编号 domain_id	d5dpif_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.22 — GFP-like
超家族 Superfamily superfamily	d.22.1 — GFP-like
家族 Family family	d.22.1.1 — Fluorescent proteins

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	5dpiA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	155 — Green Fluorescent Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Green fluorescent protein

结构域编号 domain_id	5dpiB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	155 — Green Fluorescent Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Green fluorescent protein

结构域编号 domain_id	5dpiC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	155 — Green Fluorescent Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Green fluorescent protein

结构域编号 domain_id	5dpiD00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	155 — Green Fluorescent Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Green fluorescent protein

结构域编号 domain_id	5dpiE00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	155 — Green Fluorescent Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Green fluorescent protein

结构域编号 domain_id	5dpiF00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	155 — Green Fluorescent Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Green fluorescent protein

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	118.945 Å
晶胞边长 b length_b	59.067 Å
晶胞边长 c length_c	131.761 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	108.78 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.540 Å
最低分辨率 resolution_low	43.865 Å
R 因子 r_factor	0.1908
R_work r_work	0.1889
R_free r_free	0.2435

描述 description	Green fluorescent protein
分子量 formula_weight	27013.5 kDa
突变 mutation	M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, A206V, D133(4CF), N149(4CF)
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F
原子数 atom_count	11017

sfGFP double mutant - 133/149 p-cyano-L-phenylalanine

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Green fluorescent protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

来源生物 organism	Aequorea victoria
通用名 common_name	Jellyfish
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	6100
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	168

fit	/app/data/saxs_computation/dp/5dpi/5dpi.fit
pddf	/app/data/pr_computation/dp/5dpi/5dpi.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/dp/5dpi/5dpi.dat